转基因植物产品检测实验室一览
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转基因植物产品检测实验室一览
序号仪器名称用途参考品牌型号与配置大大致预算
1 高速冷冻离心机生物样品的高速分离
(冷冻保持样品生活
活性)。
德国eppendorf;美国
Thermo;德国Sigma;
德国Herolab。
50000 120000
2 定性PCR扩增仪
微量基因片段
(DNA/RNA)的扩增
德国Peqlab、美国ABI、
德国eppendorf、美国
Bio-rad。
50000 110000
定量CR扩增仪
(荧光定量PCR)
扩增的同时对基因片
段做定量检测。
美国ABI、德国
eppendorf、美国
Bio-rad。
250000 780000
3 PCR专用工作台保证PCR时的无污
染。(或建设标准的
PCR层流实验室)
德国Peqlab。
(国产超净台也可替
代。)
10000 34000
4 电泳槽、电泳
仪
基因片段扩增之后跑
凝胶。
德国Peqlab、美国
Bio-rad。或北京六一。
15000 40000
5 凝胶成像系统对凝胶进行分子量、
等定性分析
法国VL,美国Bio-rad、
或国产。
350000 150000
6 紫外透射仪国产6000 15000
7 制冰机国产20000 35000
8 CO2培养箱美国Tehrmo。美国
shellab
20000 50000
9 液氮罐国产。4000 10000
10 超纯水
美国millipore;美国
Tehrmo。
40000 76000 双蒸馏水发生
器
国产
4000 18000
11 分子生物常用耗
材与试剂
5000 10000
12 转基因专用试剂5000 10000
其他设备:
细胞融合仪、核酸提取仪、紫外分光光度计、核酸蛋白检测仪磁力搅拌机杂交仪、-30℃低温冰箱、超低温冰箱、漩涡混合器、超声波细胞粉碎仪、自动恒温酶标。
7 操作步骤
抽样
参照NY/T672 转基因植物及其产品检测通用要求和NY/T673 转基因植物及其产品检测抽样。
制样
参照NY/T672 转基因植物及其产品检测通用要求和NY/T673 转基因植物及其产品检测抽样(按照GB 5491中四分法制备样品进行送检)。
DNA模板的制备
a称取200-400 mg试样,在液氮中磨碎,装入已经用液氮预冷的ml离心管中。
b加入1ml预冷至4 ℃的抽提液,剧烈摇动混匀后,在冰上静置5分钟,用13 000 r/min离心机,4 ℃离心15 min,弃去上清液。
c加入600 μl 预热到65 ℃的抽提裂解液,用玻棒搅拌上下颠倒充分混匀,在65 ℃的水浴锅中裂解40 min。
d用13 000 r/min离心机室温离心10 min,将上清液转至另一离心管中,加入5 μl RNase A (10 mg/ml),
37 ℃水浴30 min。
e分别用等体积苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提一次。
f用13 000 r/min离心机室温离心10 min,将上清转至另一离心管中。加入2/3体积异丙醇,1/10 体积3M乙酸钠(pH ),-20 ℃放置2-3 h,充分沉淀DNA。
g13 000 r/min,4 ℃离心15 min,用70%乙醇洗沉淀一次,倒出乙醇,晾干DNA。加入50 μl TE()溶解DNA。
h把DNA溶液浓度用重蒸馏水调制为100ng/μl,储存于-20 ℃备用。
注意:
I 1 g试样(如棉花种子)提取的DNA量应不小于200 μg。
II DNA的OD260/OD280的比值应在左右,且OD260的值应在曲线的最高峰。
PCR反应
7.4.1 试样的PCR反应
在PCR反应管中按表1依次加入反应试剂, 用手指轻弹混匀,再加约50 μL石蜡油(有热盖设备的PCR仪可以不加石蜡油)。每个试样3次重复。
在台式离心机离心10s后,将PCR管插入PCR仪中。95℃变性5 min;进行35次循环扩增反应(Sad1基因、nos终止子、CaMV35S启动子:94℃,30 s;56℃,30 s;72℃,30s;cry1Ac基因、cry1Ab基因、以及cry1Ac与cry1Ab融合基因:94℃,1 min;56℃, 1 min;72℃, 1 min );然后72℃恒温7 min,取出PCR反应管,对反应产物进行电泳检测或在4℃下保存。
表1 PCR反应体系
试剂终浓度单样品体积
ddH2O
10×PCR 缓冲液1× 5 µl
25 mM MgCl2mM 5 µl
10 mM dNTPs mM 1 µl
10 µM Primer 1 µM µl
10 µM Primer 2 µM µl
5 U/µl Taq 酶U/µl µl
100 ng/µl DNA 模板 5 ng/µl µl
总体积50 µl
7.4.2 对照的PCR反应
在试样PCR反应的同时,应设置阴性对照、阳性对照和空白对照。