pubmed文献检索工具的使用

PubMed检索机制及规则

PubMed检索机制及规则 PubMed的检索功能非常强大，在检索中可实现检索词的自动转换、通配符的使用等功能，也可以进行强制性检索。 1 词汇的自动转换功能在PubMed主页的检索提问框中输入检索词进行检索时，系统将按顺序自动使用如下3种索引，对检索词进行转换后再进行检索。 1.1 Mesh转换表（MeSH Translation Table）包括MeSH词、参见词、副主题词、出版类型、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS）、补充概念（物质）名称表等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词（或其它词表中的词）和Text word词（题名词和文摘词），并用“OR”组配进行检索，同时停止使用其它的索引进行转换。有些词在转换后可能会出现3个词进行检索。例如：键入“blood"，系统将其转换成"("blood"[MeSH Subheading] OR "blood"[MeSH Terms]) OR blood[Text Word]"后进行检索。 1.2 刊名转换表（Journal Tanslation Table）包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其对应到相应的刊名进行检索。此外，该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Engl J Med”后进行检索。 1.3 著者索引（Author Index）如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语，PubMed 即会自动查找著者索引。
如果仍然查不到相匹配的词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到为止。假如仍然不能找到匹配的词，系统将把各单词用“and”连接，在全部字段中进行查找。要查看词汇的转换情况，可点击“Details”进行查看。 2 截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“flavor*”，系统会找到那些前一部分是flavor 的单词（如flavored, flavorful, flavoring等），并对其分别进行检索。如果这类词少于600个，PubMed会逐个词检索，若超过600个（如：ca*）,PubMed将显示警告信息，要求增加词汇的开头字母数量。截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等。注意：使用截词检索功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。 3 强制检索功能如上所述，在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”，系统会用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索；但是，当键入的词语无匹配词时，PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程，若仍然没有匹配词，系统就将短语分解成单词，再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显，这样检索的结果是不符合用户要求的。因此，PubMed允许使用双引号（“”）来强制系统进行短语检索。例如，在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”，并用双引号引起来，然后点击“Go”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。

NCBI之PubMed完全攻略

PubMed完全攻略第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.360docs.net/doc/9713673373.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed 的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能（Automatic Term Mapping）。对于输入检索框中的检索词，将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换，然后再进行检索。其顺序是：MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外，还可进行短语检索，即将短语作为一个词组进行检索，可用双引号将其引起，此时系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏，此外，其左侧栏还提供了几种检索功能：Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式（可直接进行字段限定），点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮，进一步检索。 Limits：限定检索。PubMed限制内容较多，可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History：检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏，结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索，如#1 AND #2。例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献步骤：PubMed主页→点击limits，限定时间2004；语种为English→页面最下端点击go，在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索点击主页左侧栏MeSH Database，或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。输入提问词，点击go。如不是MeSH词，系统则提供相关概念供选择。选择出现的MeSH词，可察看下面对该MeSH词的注释。点击该主题词进入副主题词选择，选中需要的副主题词，也可点击进行加权、不扩展检索。然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式，如要检索，发送到Search Box中，在Search Box中将显示检索表达式，可进行修改和继续添加。最后点击Search PubMed进行检索。

PubMed 文献检索完全攻略

PubMed检索完全攻略第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.360docs.net/doc/9713673373.html,/pubmed/ 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这

PubMed检索

第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.360docs.net/doc/9713673373.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和

部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。这是PubMed的核心部分。大部分工作，我们只要利用这"一框五键"（检索框，Limit键, Preview/Index键, History键，Clipboard键和Details键）即可完成。在主界面的左侧框（如左图），有： · Journal Browser 期刊浏览 · MeS h Browser可以用它来分层流览MeSH表 · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式) 3) Related Resources · Order Docume nts可以使用户在当地得到文献的全文，但这是要收费的，至于如何免费获得文献全文，我将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全攻略----好东西，吐血狂顶！2011-11-21 08:57阅读(4)转载第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.360docs.net/doc/9713673373.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医

Pubmed检索攻略

PUBMED简介一、何为PUBMED？ PUBMED是美国国立卫生研究所（NIH）下属美国国立医学图书馆（NLM）开发的因特网检索系统，建立在国立生物医学信息中心（NCBI）平台上。PUBMED主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务，其中包括医学文献的定购、全文在线阅读的链接、专家信息的查询、期刊检索以及相关书籍的链接等。二、PUBMED与图书馆光盘版本的MEDLINE有何不同？ PUBMED与光盘版本MEDLINE的不同之处在于：由于互联网的及时性，PUBMED的更新速度快于光盘版，光盘版本的更新周期是3个月，而PUBMED的更新周期是1天，PUBMED包含了一些尚未收录入光盘版MEDLINE的最新文献信息，因此PUBMED享有PRE-MEDLINE的美誉。三、如何进入PUBMED检索系统？在浏览器地址栏中输入网址：https://www.360docs.net/doc/9713673373.html,/pubmed/ 四、PUBMED主页的基本组成？ PUBMED的检索系统大致由三个板块组成：页面上方的检索框和功能按钮（Limit、Preview/Index、History、Clipboard、Details）。在检索框"for"后面的空格中输入需要查询的关键词，点击"go"会出现相关的文献。每个功能按钮的具体功能下面会逐项介绍。左面的导航条指向PUBMED的一些其它功能板块，如MeSH Browser、Journal Browser等。剩下的右下方大片空间便是显示检索结果的空间。

五、PUBMED的主要功能按钮组成？ PUBMED的主要功能按钮有五种：Limit按钮、Preview/Index按钮、History按钮、Clipboard按钮和Details按钮。六、LIMIT 按钮的主要功能？当点击Limit按钮，将出现以下界面：各下拉框的基本作用如下： All Field：下拉可选择搜索的范围，如作者名、关键词等 Publication Types:下拉可选择所查文献的类型，如临床试验、荟萃分析等 Ages:下拉可选择所查文献研究对象的不同年龄组 Entrez Date:下拉可选择所查文献距离现在不同时间范围 Publication Date:下拉可选择限定所查文献发表日期 Language:下拉可选择所查文献的语种 Human or Animal:下拉可选择所查文献的研究对象：人或动物 Subset:下拉选择不同的医学网络系统，可查询特殊领域的文献AIDS, TOXICITY 七、Preview/Index按钮的功能？点击Preview按钮，可以预览检索的结果，此预览功能使我们浏览结果前，先知道查询的结果数量，从而可估计是否有必要进一步修改检索式以缩小或扩大检索范围，避免每次因传输大量的无用数据而浪费时间。 Index按钮的功能则使我们在输入一个检索词之后知道这个检索词将导出多少篇文献，同时其特有的允

NCBI应用之PubMed文献查找

NCBI应用之PubMed文献查找来源：easylabs原创,转载请注明发布时间：2009-09-26 查看次数：1288 先给大家一段查询语言：(myocardial[Title/Abstract] AND infarction[T itle/Abstract]) AND ("loattrfull text"[sb] AND "2008/09/26"[PDat] : "2009/09/25"[PDat] AND English[lang] AND Review[ptyp])。能看懂吗，是不太复杂了？其实就是查询近一年的关于心肌梗死的英文综述。所幸的是，我们不需要记这样的查询语言，有了PubMed，我们完全可以简单的操作就可查到想要的目标文献。呵呵，有点像做广告哈。先介绍一下pubmed PubMed包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容。它还包括一些被ME DLINE认为超出范围的文章和杂志，（这些文章或杂志）由于内容或在某一时期不在索引范围内。因此PubMed是比MEDLINE的更大的集合。看一下它所收录的数据库： PubMed现已有19 million文章信息（文章的名称，发布日期杂志，摘要，全文链接以及与要查询内容相关的文章），最早的文章可追塑到1948年。另外，PubMed Central还能提供大概300000篇免费全文。因此，PubMed是科研

过程中文献查找的一个最重要的工具，就我个人而言，一般是先在PubMed中找到全文链接，然后再上相应的数据库查找。下面我们就一步步的教大家如何有效应用该资源。首先，进入PubMed的首页面，网址是https://www.360docs.net/doc/9713673373.html,/pubmed/,如果从NCBI首页进入，Search的地方选择PubMed就可进入了。页面介绍：最上面一行为查询框，在首页的文字部分给出了三种查询方式： 1、topic主题检索。很简单，在查询框输入主题词（如：心肌梗死myocardi al infarction），点右边的“go”就OK了； 2、authors著者检索。注意：这里人名用的是中国人的习惯，即姓＋名字的首字母。如中国作者张海洋为Zhang HY，外国作者Fishman EK，都是姓在前，名在后。 3、journals期刊检索。可以用期刊的全称或缩写。从最简单的开始，比如说我们想要查询一篇心肌梗死的文章，在查询框中输入m yocardial infarction，出现以下页面，注意，在查询由两个以上的单词组成的主题词的时候，我们可以将其加上括号或者双引号，如（myocardial infarction），“myocardial infarction”，这样P