无内毒素质粒小量提取试剂盒(离心柱型)

无内毒素质粒小量提取试剂盒(离心柱型)
无内毒素质粒小量提取试剂盒(离心柱型)

无内毒素质粒小量提取试剂盒(离心柱型)

一、试剂盒组成、储存、稳定性

试剂盒在室温(15-25℃)干燥密闭条件下,可保存12个月,若在4℃条件下,则可保存更长时间;溶液Ⅰ在加入RnaseA 后,应置于4℃保存;RnaseA 在-20℃可稳定保存一年以上;若在4℃条件保存,溶液Ⅱ可能会产生沉淀,请在使用前于42℃加热溶解后使用。

二、原理简介

Sunbiotech 无内毒素质粒小量提取试剂盒采用碱裂解法裂解细胞,粗提物通过独特的内毒素清除剂选择性结合离心除去内毒素,然后离心吸附柱内的硅基质膜在高盐,低PH 值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐,高PH 值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA 从硅基质膜上洗脱。

三、实验准备

1.溶液Ⅰ已加入RnaseA,4℃密闭贮存。

2.第一次使用时,在漂洗液W2中按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇,混合均匀,室温密闭贮

存。

3.使用前注意观察溶液Ⅱ中是否有白色沉淀析出,如有沉淀,请于42℃左右温育溶解并冷却至

室温后再使用。

四、注意事项(实验前必须首先阅读这部分!)

1.所有的离心步骤如未加说明均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机,

如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。

2.溶液Ⅲ和去蛋白液PE 中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。试剂盒组成

保存SP03250次溶液Ⅰ

4℃15ml 溶液Ⅱ

常温15ml 溶液Ⅲ

常温20ml 漂洗液W1

常温30ml 去蛋白液PE

常温27ml 漂洗液W2常温35ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇

内毒素清除剂4℃(1个月)

-20℃(长期)

5ml 洗脱液EB 常温

5ml RnaseA -20℃

150μl (10mg/ml )离心套柱常温

50套产品说明书

常温一份

若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

3.提取的质粒量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。一般高拷贝质粒建议接种单菌落于2-5

毫升加合适抗生素的LB培养基,过夜培养14-16个小时,可提取出多达20μg的纯净质粒。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应适当加大菌体使用量,使用5-10ml过夜培养物,同时按比例增加溶液Ⅰ、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ的用量,其它步骤相同。

4.要知道质粒DNA确切分子大小,必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知道,处于

环状或者超螺旋状态的的质粒泳动位置不确定,是无法通过电泳知道确切大小的。

5.无内毒素清除剂清除内毒素后质粒产量会有损失,根据不同的宿主菌株会损失10%-40%不等的质

粒产量。

五、操作步骤

1.用2ml离心管收集2-5ml在LB培养基中培养过夜的菌液,12000rpm离心30秒,弃尽上请。

*根据菌的浓度来决定沉菌的量,浓度高取2ml菌液离心收集即可以,浓度低在原管子里再加2ml菌液离心收集,提取低拷贝的质粒时,应增加收集菌体的量到10ml;

*细菌过量会影响裂解、中和效率及质粒DNA的率。

2.加入250μl溶液Ⅰ用振荡器充分悬浮细菌。

*确认溶液Ⅰ中已加入RnaseA。

*悬浮需充分,不应留有小的菌块,否则会影响菌体的裂解。

3.加入250μl溶液Ⅱ,温和充分地上下翻转混合4-6次,至溶液变澄清,此步骤不宜超过5分钟。

*避免剧烈混合,否则将导致基因组DNA的污染。若加入溶液Ⅱ后,溶液未

变澄清,请适当按比例增加溶液Ⅱ和溶液Ⅲ的用量;

*溶液Ⅱ使用后应立即盖紧瓶盖,以免空气中的CO2中和溶液Ⅱ中的NaOH,

降低溶菌效率。

4.加入350μ1溶液Ⅲ,温和地上下翻转8-10次,室温静置2分钟。14000rp离心5分钟,或12000rpm离心10分钟。

*避免剧烈混合,否则将导致基因组DNA的污染。

*若离心后凝结块未沉到离心管底部,应再上下翻转混合数次,12000rpm离心3分钟。

5.小心取上清至一个1.5毫升的离心管,冰上预冷,取部分内毒素清除剂均匀预冷(上下翻转)

15分钟备用。

6.加入0.1体积冰预冷的内毒素清除剂到上一步所得上清,颠倒旋转混匀7-10次,冰浴或者冰上

放置20分钟,中间偶尔颠倒混匀几次。

*内毒素清除剂加入上清后,上清可能会变得浑浊,但是冰浴后应恢复清亮。

7.37℃水浴,溶液又会变为浑浊,颠倒混匀后37℃温育20-30分钟或直到溶液明显分为两相。

8.12,000rpm离心5分钟,30°C。离心温度必须至少大于25°C以上。

9.溶液必须分为两相,否则应重复步骤6-7。上层水相含DNA下层油状相含内毒素。

10.将含DNA的上层水相转移到新管(注意不要吸到油状层,含大量内毒素),弃油状层相。

11.将上一步所得上层水相中加入0.5体积漂洗液W1后充分混匀后分两批转入吸附柱AC中(吸附

柱放入收集管中),13,000rpm离心30-60秒,倒掉收集管中的废液。

12.可选步骤:加入500μl去蛋白液PE,13,000rpm离心30-60秒,弃废液。

*此步骤为了去除痕量核酸酶等杂质,如所用菌株为JM系列、HB101等endA菌株或野生型菌株,

核酸酶含量丰富,应加此步骤;如所用菌株为XL-1Blue和DH5α等缺陷型菌株,核酸酶含量

低,则可略过此步骤。

13.弃滤液后将内柱重新置于2ml外柱中,加入600μ1漂洗液W2,12000rpm离心1分钟,再用600μ1漂洗液W2洗涤一次。

*确认在漂洗液W2中已按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇。

14.将吸附柱重新放回到2ml外柱中,12000rpm空离1分钟。

15.取出吸附柱,放入干净的离心管中,在膜中央加30-60μl洗脱液EB或去离子超纯水,室

温静置1分钟,12000rpm离心1分钟,管底溶液即为质粒DNA,将其置于-20℃保存。

*为了增加洗脱效率可在50-60℃预热洗脱液。

*测序时用超纯水代替洗脱液EB更好。

六、疑难解答(Trouble shooting)

常见问题可能的原因建议

得率低由于抗生素失效、培养基pH过低、

氧气供应不充分等原因导致质粒

在宿主菌中未得到有效的增殖。

改进细菌培养条件。

细菌过量,导致菌体未被有效裂

解。

按手册提供的参数操作。

细菌悬浮不充分,存留小菌块,导

致菌体未被有效裂解。

充分悬浮细菌。

溶液Ⅱ长时间暴露于空气中,被

CO2中和,导致菌体未被有效裂解。

溶液Ⅱ使用后立即盖紧瓶盖,以

免空气中的CO2中和其中的

NaOH。

洗脱不完全。按说明书提供的洗脱体积操作。洗脱液W2未加无水乙醇。按指定的体积加入无水乙醇。

基因组DNA污染可能是菌体太多或步骤3、4震荡

过于剧烈,染色体DNA断裂。

严格遵循说明书操作。

质量差的细菌(反复冻融的细菌、

陈旧的细菌、培养条件不合适的细

菌)中有许多断裂、降解而游离的

基因组DNA。

使用生长良好的新鲜细菌。

质粒DNA 出现切口、断裂、降解宿主菌富含核酸内切酶,未及时提

取质粒DNA。

从新鲜培养的细菌中提取质粒

DNA;增加一步洗脱液W1洗涤。质粒DNA在溶液Ⅱ中暴露过久,易

造成质粒DNA的切口断裂。

裂解步骤控制在5分钟内完成。

蛋白污染在步骤5转移上清的过程中,可能

混杂入白色的沉淀物。

请将上清转移至离心管中重新

离心。

高纯度质粒小量快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

杭州昊鑫生物科技股份有限公司 htpp://https://www.360docs.net/doc/9d15804667.html, HighPure Plasmid Mini Kit 高纯质粒小量快速提取试剂盒 目录号:PL03 试剂盒组成、储存、稳定性: 试剂盒组成保存 50次 (PL0301) 100次 (PL0302) 200次 (PL0303) 平衡液室温5ml 10ml 20ml RNaseA(10mg/ml)-20℃150μl 250μl 500μl 溶液P1 4℃15 ml 25 ml 50 ml 溶液P2 室温15 ml 25 ml 50 ml 溶液P3 室温20 ml 35 ml 70 ml 去蛋白液PE 室温16ml 31.5 ml 63 ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 漂洗液WB 室温15 ml 25ml 50ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 洗脱缓冲液EB 室温10ml 15ml 20ml 吸附柱AC 室温50个100个200个 收集管(2ml)室温50个100个200个 本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。 储存事项: 1.第一次使用时,将试剂盒所带的全部RNase A加入溶液P1后(终浓度100ug/ml) 置于2-8℃保存。如果溶液P1中RNase A失活,提取的质粒可能会有微量RNA 残留,在溶液P1中补加RNase A即可。 2.环境温度低时溶液P2中SDS可能会析出浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分 钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。 3.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时 盖紧盖子。 产品介绍:

本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低pH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐、高pH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。 产品特点: 1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附 量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。 2.独有的去蛋白液配方,可以高效去除残留的核酸酶,即使是核酸酶含量丰富的菌 株如JM系列、HB101也可以轻松去除。有效防止了质粒被核酸酶降解。 3.快速、方便,不需要使用有毒的苯酚、氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。获得的 质粒产量高、纯度好,可以直接用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序等各种分子生物学实验。 注意事项 1. 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机, 如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。 2. 提取质粒的量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。一般高拷贝质粒,建议 接种单菌落于1.5-4.5 ml加合适抗生素的LB培养基,过夜培养14-16个小时,可提取出多达20μg的纯净质粒。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应适当加大菌体使用量,使用5-10 ml过夜培养物,同时按比例增加P1、P2、P3的用量,其它步骤相同。 3. 得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260 值为1相当于大约50μg/ml DNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。 4. 质粒DNA确切分子大小,必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知 道。处于环状或者超螺旋状态的的质粒,泳动位置不确定,无法通过电泳知道其确切大小。 5. 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗 脱,但应该确保pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-

质粒DNA的提取及检测实验报告

题目:质粒DNA的提取及检测 一.实验目的: 1.学习碱裂解法提取质粒的原理和方法; 2.学习DNA琼脂糖凝胶电泳的原理和方法。 二.实验原理 1. 质粒 (Plasmid): 一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,常常编码一些对宿主有利的酶的基因,这些基因的表型包括抗生素抗性,产生抗生素、限制酶、修饰酶等。 2.载体(Vector): 要把一个有用的外源基因通过基因工程手段,转化到细胞中去进行繁殖和表达,需要运载工具,携带外源基因进入受体细胞的这种工具就叫载体。目前除了大肠杆菌中的质粒、λ噬菌体、M13噬菌体、噬菌粒外,还有酵母人工染色体载体以及动、植物病毒载体等。 3.分离质粒DNA: (1)培养细菌使质粒扩增; (2)收集和碱裂解细菌; (3)分离和纯化质粒DNA。 4.碱裂解法 (1)溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖,10mmol/EDTA-Na,25mmol/LTris-HCl 作用:分散细胞,螯合金属离子使酶失活,防止DNA的降解

(2)溶液Ⅱ:L NaOH,2% SDS,临用前1:1配制 作用:细胞在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与染色体DNA发生变性 (3)溶液Ⅲ:5mol/L 醋酸钾60ml,冰醋酸,双蒸水 作用:酸性条件上质粒DNA复性,留在上清液。大肠杆菌DNA和蛋白质-SDS复合物等发生沉淀。 5.电泳 带电荷的物质,在电场中的趋向运动称为电泳。DNA的琼脂糖凝胶电泳可以分离长度为200bp至近50kb的DNA分子。DNA的迁移率(U)的对数与凝胶浓度(T)之间存在反平行线 性关系。因此,要有效地分离不同大小的DNA片段,选用适当的琼脂糖凝胶浓度是非常重要的。 6.提取质粒 在质粒提取的过程中,由于操作原因,提取的质粒可能有三种:线性DNA、开环DNA 、 闭环超螺旋DNA 。当提取的质粒DNA电泳时,同一质粒 DNA泳动速度:闭环超螺旋〉线状〉 开环。但有时也有也会出现相反情况,因为与琼脂糖浓度、电流强度、离子强度及核酸染料 含量有关。 三.实验材料及设备 1.实验材料: (1)含质粒pUC18大肠杆菌,塑料离心管,EP管架,微量取液器和取液器吸头,常用玻璃器皿(如三角瓶、量筒、试剂瓶等); (2)提取的pUC18,琼脂糖,锥形瓶,一次性手套,胶铲,封口膜,剪刀,取液器吸头。实验设备:

质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用

细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。 质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。 碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和 SDS 溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。 纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。 一、试剂准备 1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH ,10mM EDTA(pH )。1M Tris-HCl[t1] (pH ),EDTA (pH )10ml,葡萄糖,加ddH2O至500ml。在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。 任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。 50 mM葡萄糖最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。因此,如果溶液I 中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言,几乎没有任何影响。所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。EDTA呢大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,配在分子生物学试剂中的主要作用是:抑制DNase的活性,和抑制微生物生长。在溶液I中加入高达 10 mM 的EDTA,无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。如果不加EDTA,其实也没什么大不了的,只要不磨洋工,只要是在不太长的时间里完成质粒抽提,就不用怕DNA会迅速被降解,因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。如果哪天你手上正好缺了溶液I,可不可以抽提质粒呢实话告诉你,只要用等体积的水,或LB培养基来悬浮菌体就可以了。 NaOH也使DNA变性,但只是个副产物,在溶液3加入后其中的醋酸和NaOH中和,质粒DNA 恢复活性 2. 溶液Ⅱ:NaOH,1% SDS。2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。使用前临时配置[t2] 。这是用新鲜的N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。要新从浓NaOH稀释制备的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。很多人不知道其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向 micelle(微囊)结构的相变化所导致。用了不新鲜的N NaOH,即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下),自然就难高效率抽提得到质粒。如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒,因为 SDS也是碱性的,只是弱了点而已。很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性,以便沉淀,这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。有人不禁要问,既然是NaOH溶解的细胞,那为什么要加SDS呢那是为下一步操作做的铺垫。这一步要记住两点:第一,时间不能过长,千万不要这时候去接电话,因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂;第二,必须温柔混合(象对待女孩子一样),不然基因组DNA也会断裂。基因组 DNA的断裂会带来麻烦。 3. 溶液Ⅲ:醋酸钾(KAc)缓冲液,pH 。5M KAc 300ml,冰醋酸,加ddH2O至500ml。4℃保存备用。 溶液III加入后就会有大量的沉淀,但大部分人却不明白这沉淀的本质。最容易产生的误解是,

质粒提取试剂盒-说明书-翻译

精品文档 。 1欢迎下载 E.Z.N.A.? 质粒小提试剂盒操作规程(英文版译文) (适用于No. D6942, D6943 & D6944) 1. 自新鲜划痕选择培养板中分离单菌落,接种含适当选择性抗生素的1-5ml 的LB 培 养基进行培养。37℃强力摇动(~300rpm )孵育12-16h 。使用10-20ml 培养管或容量至少4倍于培养容积的培养瓶。强烈推荐使用endA 阴性大肠杆菌菌株进行常规质粒分离。此类菌株包括DH5α和JM109。 2. 将1.5-5.0ml 细菌室温10,000 x g 离心1min 。轻轻倒出或吸走培养基并丢弃。 3. 加入250μl 的溶液I/Rnase A 重悬沉淀,涡旋或用移液器反复吹打。充分重悬沉 淀对于获得高质量的DNA 非常重要。 4. 加入250μl 溶液II ,倒置、转动试管数次使之轻轻混匀,得到透明的裂解产物。 可能需要孵育2min 。不要用力混合,以免使染色体DNA 断裂,减低质粒的纯度。该步反应不要超过5min 。溶液II 不用时要拧紧瓶盖,以免试剂被空气中的CO2酸化。 5. 加入350μl 溶液III ,立即倒置试管数次混匀,直至白色絮状沉淀物形成。为避免 形成局部沉淀,加入溶液III 后应立即、充分混匀溶液。 6. 室温≥10,000 x g 离心10分钟。白色沉淀物形成,立即进行下一步操作。 7. 小心翼翼.... 的吸取上清液,加入装配在2ml 收集管中的小量纯化柱I 中。确保离心沉淀未受扰动,确保没有细胞碎片加入到柱子中。室温下10,000 x g 离心1分钟,使裂解液完全通过柱子。 8. 丢弃滤过液,重新使用2ml 收集管;加入500μl HB 缓冲液清洗柱子,室温10,000 x g 离心1分钟,使溶液完成通过柱子。该步操作需确保残余的蛋白质污染被去除,以保证获得高品质的DNA 以适合于下游的应用。 9. 丢弃滤过液,重新使用2ml 收集管;加入700μl 用无水乙醇稀释的DNA 清洗液清 洗柱子,室温10,000 x g 离心1分钟,使溶液完全通过柱子,丢弃滤过液。 注意:DNA 清洗液的浓缩液使用前必须用无水乙醇稀释(5倍稀释),如果DNA 清洗液稀 释液经过冷藏,则使用之前必须置于室温。 10. 可选步骤:重复清洗,加入另外的700μl 用无水乙醇稀释的DNA 清洗液。 11. 将空柱子≥13,000 x g 离心2min ,使柱子的基质干燥。此步骤为关键操作,不可 遗漏。 12. 将柱子放入干净的1.5ml 微量离心管中。将30-50μl (取决于终产物的期望浓度) 洗脱液或无菌去离子水直接加入柱子基质上,使之于室温下静置1-2min 。≥13,000 x g 离心1min 洗脱DNA 。可以进行二次洗脱,以收集残存的DNA 。 13. DNA 的产量和质量:分别在波长260nm 和280nm 处测定样品适当稀释液的吸光度。DNA 的浓度计算如下: DNA 浓度=A 260×50×(稀释倍数)μg/ml A 260/A 280的比率可以反映核酸的纯度。比值大于1.8表明核算的纯度在90%以上。或者,DNA 的产量(及质量)有时可以通过琼脂糖胶/溴乙锭电泳与已知浓度的DNA 样品相比较更好的予以确定。通常情况下洗脱的大部分DNA 是超螺旋单体形式,但也可能存在串联体形式。 张小强 翻译

质粒DNA的提取和纯化实验报告

质粒DNA的提取和纯化实验报告

实验一、质粒DNA的提取和纯化 一、实验目的: 1、学习并掌握碱裂解法小量制备质粒DNA的方法。 2、初步了解DNA纯化的原理。 二、实验原理 1、细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。 2、质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。 3、碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。 4、纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。 三、实验步骤 1、挑取单菌落接种到含Amp的LB液体培养基试管内(3.5ml/管) 2、将试管放入恒温震荡培养箱中,37℃,200r/min培养12-16h。 3、将菌落转入1.5ml离心管中(尽量倒满)1200r/min,离心30s(沉淀菌体) 4、重复一次第三步的过程 5、弃掉上清液并扣干,加入预冷的Solution1 100微升,剧烈震荡打散菌体

omga质粒提取试剂盒_说明书_翻译

omgaE.Z.N.A.质粒试剂盒操作规程说明书(译版) 1. 自新鲜划痕选择培养板中分离单菌落,接种含适当选择性抗生素的2-5ml的LB或YT培养基进行培养。37℃强力摇动(~300rpm)孵育20-24h。使用10-20ml培养管或容量至少4倍于培养容积的培养瓶。强烈推荐使用endA阴性大肠杆菌菌株进行常规质粒分离。此类菌株包括DH5α和JM109。 2. 将1.5-5.0ml细菌菌液室温13,000 g离心3min。轻轻倒出或吸走培养基并丢弃。 3. 加入200μl 的溶液Buffer T 1/Rnase A重悬沉淀,涡旋或用移液器反复吹打。充分重悬沉淀对于获得高质量的DNA非常重要。 4. 加入200μl溶液Buffer T 2,倒置、转动试管5-10次使之轻轻混匀,得到透明的裂解产物。室温孵育5min。不要用力混合,以免使染色体DNA断裂,减低质粒的纯度。该步反应不要超过5min。溶液II不用时要拧紧瓶盖,以免试剂被空气中的CO2酸化。 5. 加入200μl溶液Buffer T 3,立即倒置试管15-20次混匀,直至白色絮状沉淀物形成。冰上孵育5min。为避免形成局部沉淀,加入溶液III后应立即、充分混匀溶液。 6. 4℃13,000 g离心10分钟。白色沉淀物形成,立即进行下一步操作。 7. 小心翼翼的吸取上清液,加入到新的1.5ml离心管(不是试剂盒提供的)中。加入200ul 用异丙醇稀释的BAC 结合液(缓冲液),颠倒3-5次充分混匀。BAC 结合液使用前必须用96%-100%的异丙醇稀释,详细的说明见瓶壁或第三页说明书 8.加入样本DNA(HiBind DNA MicroElute)到提供的2ml收集管中。 9. 室温8000g离心30s,丢弃收集管,将离心柱放入新的收集管中。 10. 将收集柱放回收集管并加入750ul SPM buffer(用乙醇稀释),室温8000g离心30s,丢弃收集管,将离心柱放入新的收集管中。 11. 将空柱子以最大速度离心2min,使柱子的基质干燥。此步骤为关键操作,不可遗漏。 12. 将柱子放入干净的1.5ml微量离心管中。将20-50μl(取决于终产物的期望浓度)洗脱液(Elution Buffer)或无菌去离子水直接加入柱子基质上,使之于室温下静置5min。 13.最大速度离心2min洗脱DNA。可以进行二次洗脱,以收集残存的DNA。 14. -20℃保存洗脱的DNA。 15. DNA的产量和质量:分别在波长260nm和280nm处测定样品适当稀释液的吸光度。DNA的浓度计算如下: DNA浓度=A260×50×(稀释倍数)μg/ml A260/A280的比率可以反映核酸的纯度。比值大于1.8表明核算的纯度在90%以上。或者,DNA的产量(及质量)有时可以通过琼脂糖胶/溴乙锭电泳与已知浓度的DNA样品相比较更好的予以确定。通常情况下洗脱的大部分DNA是超螺旋单体形式,但也可能存在串联体形式。 适用于BACs,PACs,P1s和质粒分离步骤(标准)(D2156-00,D2156-01,D2156-02)彭伟翻译

高纯度质粒小提试剂盒使用说明书

高纯度质粒小提试剂盒 Pure Mini Plasmid Kit (目录号:HS0103) 产品包装 试剂盒成分 50 preps Buffer P1 15 ml Buffer P2 15 ml Buffer P3 20 ml Buffer PD 30 ml RNase A(10 mg/ml) 150 ul Buffer PW 60 ml Buffer EB 10 ml Spin Columns PA 50个 Collection Tubes (2 ml) 50个 (注意:使用前将全部RNase A 溶液加到Buffer P1中混合均匀,2 ~ 8℃保存) 保存条件 本试剂盒在室温(15 ~ 25℃)干燥条件下,可保存12个月;更长时间的保存可置于2 ~ 8℃。若溶液产生沉淀,应在使用前置于37℃下溶解沉淀。单独包装的RNase A 在室温可稳定保存12个月。加入RNase A 后的Buffer P1应置于2 ~ 8℃保存,可稳定保存6个月。 产品简介 本试剂盒用于高纯度质粒DNA 的小量制备与纯化。菌体经碱裂解、高盐、低pH 处理,质粒可从菌体中释放出来,并特异、高效地被离心柱硅胶膜(Spin Columns PA )吸附。通过去蛋白液(Buffer PD )和漂洗液(Buffer PW )的清洗可去除蛋白及其他杂质,在低盐、高pH 条件下洗脱,最后得到高纯度的质粒DNA 。 北京厚生博泰科技有限公司 Beijing Hooseen Biotech Co., Ltd.

使用本试剂盒可从1 ~ 5 ml过夜培养的菌液中纯化得到高达20 ug的高纯度质粒DNA,可在30 min之内完成提取任务。所得质粒可直接用于酶切、转化、PCR、测序、低敏感细胞株的转染等各种常规分子生物学操作。 产品特点 1. 快速:步骤少,操作简便,节约时间。 2. 简便:离心吸附柱不需要预平衡,漂洗液Buffer PW 和去蛋白液Buffer PD不需要另加乙醇,即开即用。 3. 纯度高:所得质粒可直接用于酶切、转化、PCR、测序、低敏感细胞株的转染等各种常规分子生物学操作。 操作步骤 1. 取1 ~ 5 ml过夜培养的菌液,室温12,000 rpm离心1 min,尽量将上清去除干净。 (注意:根据菌液的浓度决定取液量,浓度高时取1 ml菌液离心即可,浓度低时可多收集一次) 2. 加入250 ul Buffer P1,用枪头充分吹打使菌体重悬均匀。 (注意:是否将RNase A溶液加到Buffer P1中并混合均匀;菌体沉淀是否悬浮充分,如有未彻底悬浮的菌块会影响裂解,导致提取的质粒浓度及纯度降低) 3. 加入250 ul Buffer P2,温和颠倒混匀6 ~ 8次,直到溶液变得清亮粘稠。 (注意:不可剧烈震荡,以免造成基因组DNA片段的污染,所用时间不要超过5 min,以免质粒受到破坏,如未完全变得清亮,可能是菌体太多,可增加Buffer P2的用量,在后续的操作中Buffer P3的用量也要相应增加) 4. 加入350 ul Buffer P3,立即温和颠倒混匀6 ~ 8次,可见白色沉淀物产生,室温静置2 min,然后12,000 rpm离心3 ~ 5 min。 (注意:Buffer P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀,如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清) 5. 小心将上清液转移到离心吸附柱Spin Columns PA中,静置2 min,让质粒DNA与吸附柱中的硅胶膜充分结合。12,000 rpm离心0.5 ~ 1 min,弃收集管中的废液。 6. 向吸附柱中加入500 ul去蛋白液,12,000 rpm离心1 min,弃收集管中废液。 (注意:如果宿主菌是endA-,如DH5α若TOP10,此步骤可省略。如果宿主菌是endA+,如TG1、BL21、HB101、JM101等,此步骤不可省略,因这些宿主菌含有大量的核酸酶,易降解质粒。如果提取低拷贝质粒

质粒DNA提取方法与原理

质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用 细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。 质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。 碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA 发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。 纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。 一、试剂准备 1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。1M Tris-HCl (pH 8.0)1 2.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。 任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。50 mM葡萄糖最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。因此,如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言,几乎没有任何影响。所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。EDTA呢?大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,配在分子生物学试剂中的主要作用是:抑制DNase的活性,和抑制微生物生长。在溶液I中加入高达 10 mM 的EDTA,无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。如果不加EDTA,其实也没什么大不了的,只要不磨洋工,只要是在不太长的时间里完成质粒抽提,就不用怕DNA会迅速被降解,因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。如果哪天你手上正好缺了溶液I,可不可以抽提质粒呢?实话告诉你,只要用等体积的水,或LB培养基来悬浮菌体就可以了。 NaOH也使DNA变性,但只是个副产物,在溶液3加入后其中的醋酸和NaOH中和,质粒DNA恢复活性 2. 溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS。2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。使用前临时配置。 这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。很多人不知道其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向 micelle(微囊)结构的相变化所导致。用了不新鲜的0.4 N NaOH,即便是有SDS 也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下),自然就难高效率抽提得到质粒。如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒,因为 SDS也是碱性的,只是弱了点而已。很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性,以便沉淀,这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。有人不禁要问,既然是NaOH溶解的细胞,那为什么要加SDS 呢?那是为下一步操作做的铺垫。这一步要记住两点:第一,时间不能过长,千万不要这时候去接电话,因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂;第二,必须温柔混合(象对待女孩子一样),不然基因组DNA也会断裂。基因组 DNA 的断裂会带来麻烦。 3.溶液Ⅲ:醋酸钾(KAc)缓冲液,pH 4.8。5M KAc 300ml,冰醋酸 57.5ml,加ddH2O至500ml。4℃保存备用。 溶液III加入后就会有大量的沉淀,但大部分人却不明白这沉淀的本质。最容易产生的误解是,当SDS碰到酸性后发生的沉淀。如果你这样怀疑,往1%的 SDS溶液中加如2M的醋酸溶液看看就知道不是这么回事了。大量沉淀的出现,显然与SDS的加入有关系。如果在溶液II中不加SDS会怎样呢,也会有少量的沉淀,但量上要少得多,显然是盐析和酸变性沉淀出来的蛋白质。既然SDS不是遇酸发生的沉淀,那会不会是遇盐发生的沉淀呢?在1%的SDS溶液中慢慢加入5 N的NaCl,你会发现SDS在高盐浓度下是会产生沉淀的。因此高浓度的盐导致了SDS的沉淀。但如果你加入的不是NaCl而是KCl,你会发现沉淀的量要多的多。这其实是十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是水不溶的,因此发生了沉淀。如此看来,溶液III加入后的沉淀实际上是

OMEGA小提试剂盒提取质粒步骤(无内毒)

OMEGA小提试剂盒提取质粒步骤(中文翻译版) 1、将携带目的质粒的大肠杆菌接种于含10~15ul基础培养基/氨苄西林培养介质的50ml培养瓶中。 2、室温下500×g离心10min。 3、弃去上清,剩余沉淀物中加入500ul的SolutionⅠ/RNase A,彻底混匀。 4、将混悬液移至新的2ml离心管中,加入500ul SolutionⅡ,轻柔彻底混匀,可得清亮的细菌裂解物,室温下孵育2min(混匀时用力过大,可破碎出染色体DNA,使目的质粒纯度下降)。 5、向4中液体加入250ul预冷的Buffer N3,轻柔、彻底混匀,直到出现白色絮状沉淀,4℃≥12000×g离心10min(可室温,最好4℃)(Buffer应彻底混匀,若混合物粘稠呈棕色或呈球状,应多混匀几次以中和溶液,溶液的彻底中和对于获得好的产出是必要的)。 6、小心吸取并将上清液转移进新的1.5ml离心管1:0.1的比例向上清液中加入ETR Solution 混匀溶液并于冰上孵育10min,孵育过程中颠倒几次以混匀(加入ETR Solution后,细菌裂解物将出现浑浊,但冰上孵育后将变澄清)(勿用2ml离心管收集上清,因为2ml离心管中有太多液体时,ETR Solution将悬浮于溶液中)。 7、将6中液体于42℃孵育5min,溶液将再次变浑。室温下12000×g离心3min,ETR Solution 将于离心管底部形成蓝色层。 8、将上层水相转移入新的2ml离心管中,按1:0.5的比例加入无水乙醇(室温,96~100%),轻柔混匀,室温下孵育1~2min。 9、将8中的溶液取700ul到柱子中,组装收集管,室温下1000×g离心1min,弃去收集管中通过柱子的液体,柱子和收集管重复利用。 10、重复9中步骤,直到收集的细菌裂解物全部用完。 11、将500ul Buffer HB加入柱子中,室温下1000×g离心1min,弃去收集管中废液(目的:将残存的蛋白污染物除去,是获得高质量DNA所必需的)。 12、向柱子中加入混有乙醇的700ulDNA Wash Buffer,室温下1000×g离心1min,弃去收集管中液体。 13、重复12中的步骤。 14、弃去收集管中液体,空管在最大转速(≥13000×g)离心3min以干燥柱子(对于移除柱子中残留的乙醇是必须的)。 15、将柱子放入新的 1.5ml离心管中,直接向柱子中的白色网状物上加入Endotoxin-Free Elution Buffer 80~100ul(依终产物浓度而定,可每次30ul×2次),室温下放置2min,≥13000×g离心1min,以洗提DNA(将提取约70~85%柱子中收集的DNA,可再重复一次以提取完全,但因再次加入洗提液,会使终产物浓度下降)。 声明:文档为自己翻译后逐字打出来的,有不妥之处望各位同行不吝赐教,以方便大家实验参考,谢谢。

质粒提取试剂盒说明书

质粒提取试剂盒说明书 质粒提取的质量和得率受多种因素影响,既和质粒本身的性质以及拷贝有关,也和菌液的状态及实验操作有关,因此在质粒提取中的一些实验要点显得就极为重要了。质粒提取这看似简单的实验,却暗藏杀机,下面我们来看一下在质粒提取过程中那些习以为常的实验操作中的“误会“。 通常我们会认为越多的菌液或是越浓的菌液提取的质粒会越多,但实际实验中结果并非如此。 良好菌液的标准: 按1:1000的比例将菌液接种至培养基中,摇菌时间在8-12个小时,不超过16个小时。 菌液均匀悬浮于培养基中,无凝块、无沉淀,菌液的OD600吸光值在0.8-1.0之间,不超过1.2。 在提取质粒后进行凝胶电泳,如果在在超螺旋质粒的下方出现弥散条带,则是由于忘记加入RNaseA或RNaseA消化不充分,不完全降解的RNA与质粒共同被提取出来。

加入RNaseA的两个阶段: 在使用试剂盒提取质粒时,菌液重悬时在P1溶液中加入RNaseA 提取质粒后,在质粒溶液中加入RNaseA(试剂盒或溶液法) RNaseA的使用方法: RNaseA在质粒中的使用终浓度为20μg/ml 经RNaseA孵育的质粒,需要进行纯化去除残留的RNaseA 如何判断我们所使用的菌体量是否合适呢?在裂解时经几次颠倒混匀后,裂解液仍然为浑浊状态,说明未被裂解的菌体仍然悬浮在裂解液中,而充分裂解的菌体,溶液于裂解液中,裂解液呈现为澄清,质粒充分释放。 质粒小提试剂盒适合1-5 ml菌体的提取 小提中量试剂盒适合5-15 ml菌液的提取

中量提取试剂盒适合50-100 ml菌液的提取 大量提取试剂盒适合100-200 ml菌液的提取 如果我们想要增加提取的菌体量,也要相应提高所加入的裂解液体积。

OMEGA小提试剂盒提取质粒步骤(中文翻译版)

质粒提取(小提,mini kit) 1、将携带目的质粒的大肠杆菌接种于含10~15ul基础培养基/氨苄西林培养介质的50ml培养瓶中。 2、室温下5000×g离心10min。 3、弃去上清,剩余沉淀物中加入500ul的SolutionⅠ/RNase A,彻底混匀。 4、将混悬液移至新的2ml离心管中,加入500ul SolutionⅡ,轻柔彻底混匀,可得清亮的细菌裂解物,室温下孵育2min(混匀时用力过大,可破碎出染色体DNA,使目的质粒纯度下降)。 5、向4中液体加入250ul预冷的Buffer N3,轻柔、彻底混匀,直到出现白色絮状沉淀,4℃≥12000×g离心10min(可室温,最好4℃)(Buffer应彻底混匀,若混合物粘稠呈棕色或呈球状,应多混匀几次以中和溶液,溶液的彻底中和对于获得好的产出是必要的)。 6、小心吸取并将上清液转移进新的1.5ml离心管1:0.1的比例向上清液中加入ETR Solution 混匀溶液并于冰上孵育10min,孵育过程中颠倒几次以混匀(加入ETR Solution后,细菌裂解物将出现浑浊,但冰上孵育后将变澄清)(勿用2ml离心管收集上清,因为2ml离心管中有太多液体时,ETR Solution将悬浮于溶液中)。 7、将6中液体于42℃孵育5min,溶液将再次变浑。室温下12000×g离心3min,ETR Solution将于离心管底部形成蓝色层。 8、将上层水相转移入新的2ml离心管中,按1:0.5的比例加入无水

乙醇(室温,96~100%),轻柔混匀,室温下孵育1~2min。 9、将8中的溶液取700ul到柱子中,组装收集管,室温下1000×g 离心1min,弃去收集管中通过柱子的液体,柱子和收集管重复利用。 10、重复9中步骤,直到收集的细菌裂解物全部用完。 11、将500ul Buffer HB加入柱子中,室温下10000×g离心1min,弃去收集管中废液(目的:将残存的蛋白污染物除去,是获得高质量DNA所必需的)。 12、向柱子中加入混有乙醇的700ulDNA Wash Buffer,室温下10000×g离心1min,弃去收集管中液体。 13、重复12中的步骤。 14、弃去收集管中液体,空管在最大转速(≥13000×g)离心3min 以干燥柱子(对于移除柱子中残留的乙醇是必须的)。 15、将柱子放入新的1.5ml离心管中,直接向柱子中的白色网状物上加入Endotoxin-Free Elution Buffer 80~100ul(依终产物浓度而定,可每次30ul×2次),室温下放置2min,≥13000×g离心1min,以洗提DNA(将提取约70~85%柱子中收集的DNA,可再重复一次以提取完全,但因再次加入洗提液,会使终产物浓度下降)。 声明:文档为自己翻译后逐字打出来的,有不妥之处望各位同行不吝赐教,以方便大家实验参考,谢谢。

质粒抽提原理和详细操作步骤

质粒抽提,实验室必备技能之一 质粒 质粒存在于许多细菌以及酵母菌等生物中,是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA 分子。 质粒抽提 从细菌中分离质粒DNA的方法包括3个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细菌;分离和纯化质粒DNA。采用强碱液、加热或溶菌酶(主要针对革兰氏阳性细菌)可以破坏菌体细胞壁,十二烷基磺酸钠(SDS)和 TritonX-100(一般很少使用)可使细胞膜裂解。经溶菌酶和SDS或 Triton X-100处理后,细菌染色体DNA会缠绕附着在细胞碎片上,同时由于细菌染色体DNA比质粒大得多,易受机械力和核酸酶等的作用而被切断成不同大小的线性片段。当用强热或酸、碱处理时,细菌的线性染色体DNA变性,而共价闭合环状DNA(Covalently closed circular DNA,简称cccDNA)的两条链不会相互分开。当外界条件恢复正常时,线状染色体DNA片段难以复性,而是与变性的蛋白质和细胞碎片缠绕在一起,而质粒DNA双链又恢复原状,重新形成天然的超螺旋分子,并以溶解状态存在于液相中。 质粒抽提最常用的方法是碱裂解法,它具有得率高、适用面广、快速和纯度高等特点。当然,碱裂解法也有缺陷:容易导致不可逆的变性。要降低不可逆的变性,就要控制好碱裂解的时间。 碱裂解法抽提质粒需要用到以下三种溶液 溶液Ⅰ 50 mmol/L 葡萄糖,25 mmol/L Tris-Cl(pH 8.0),10 mmol/L EDTA(pH 8.0),在15 psi 压力下蒸汽灭菌15 min,4℃保存。 溶液Ⅱ 0.2 mmol/L NaOH(从10 mmol/L 贮存液中现用现稀释),10 g/L SDS(室温保存)。 溶液Ⅲ

质粒提取试剂盒说明书

质粒抽提: 质粒抽提方法即去除RNA,将质粒与细菌基因组DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。 实验原理: 提取质粒DNA的方法有很多种,从提取产量上分可分为微量提取、中量提取、大量提取,从使用仪器上分可分为一般提取和试剂盒方法提取,从具体操作方法分可以分为碱裂解法、煮沸法、牙签法等,各种不同的方法各有其优缺点,根据不同的实验目的可以采用合适的提取方法。详细内容请参考《分子克隆实验指南》。另外,复旦大学生化与分子生物学实验室一篇文章,提供了质粒提取机理的详细解说。 碱裂解法 人们使用碱与SDS裂解法从E. coli(大肠杆菌)中分离制备质粒DNA已有30多年的历史。将细菌悬浮液暴露于高pH值的强阴离子洗涤剂中,会使细胞壁破裂,染色体DNA和蛋白质变性,将质粒DNA释放到上清中。 尽管碱性溶剂使碱基配对完全破坏,闭环的质粒DNA双链仍不会彼此分离,这因为它们在拓扑学上是相互缠绕的。只要OH-处理的强度和时间不要太过,当pH值恢复到中性时,DNA双链就会再次形成。在裂解过程中,细菌蛋白质、破裂的细胞壁和变性的染色体DNA会相互缠绕成大型复合物,后者被十二烷基硫酸盐包盖。当用

K+取代Na+时,复合物会从溶液中有效地沉淀下来,离心除去变性剂后,就可以从上清中回收复性的质粒DNA。 在SDS存在的条件下,碱水解是一项非常灵活的技术,它对E. coli的所有菌株都适用,并且其细菌培养物的体积可以从1-500mL 以上。 煮沸法 煮沸法是将细菌悬浮于含有Triton X-100和能消化细胞壁的溶菌酶的缓冲液中,然后加热到100℃使其裂解。加热除了破坏细菌外壁,还有助于解开DNA链的碱基配对,并使蛋白质和染色体DNA 变性。但是。闭环质粒DNA链彼此不会分离,这是因为它们的磷酸二酯骨架具有互相缠绕的拓扑结构。当温度下降后,闭环DNA的碱基又各就各位,形成超螺旋分子,离心除去变性的染色体DNA和蛋白质,就可从上清中回收质粒DNA。煮沸裂解法对于小于15kb的小质粒很有效,可用于提取少至lmL(小量制备),多至250mL(大量制备)菌液的质粒,并且对大多数的大肠杆菌菌株都适用。但对于那些经变性剂、溶菌酶及加热处理后能释放大量碳水化合物的大肠杆菌菌株,则不推荐使用该法。这是因为碳水化合物很难除去,会抑制限制酶和聚合酶活性。若碳水化合物的量很大,在CsCl-溴化乙锭梯度离心中会使超螺旋质粒DNA带变得模糊不清。大肠杆菌菌株HBl01及其衍生菌株(其中包括TGl)能产生大量的碳水化合物,不适于用煮沸法裂解。 质粒小提试剂盒

QIAGEN最新试剂盒质粒大提操作步骤(翻译版)

QIAGEN EndoFree Plasmid Maxi Kit Catalog numbers 12362 室温下15-25度存放2年。 在开始之前作如下准备 1)按照说明把RNase A加到Buffer P1 中,混匀,放到2-8度储存。选作:按照1:1000的比例把LyseBlue 加到Buffer P1 2)pre-chill Buffer P3 4°C存放。 3)检查Buffer P2 是否有SDS沉淀物,可以放到37℃短暂温热以便溶解分子沉淀物。 4)准备异丙醇。 5)用试剂盒提供的无内毒素的水中加入40ml的96-100%的酒精。 大量质粒提取过程 在LB培养基中种植转化的E.coli菌。使用100ml(高复制数的质粒)或者250ml(低复制数的质粒)过夜培养。 操作步骤如下 1.收获LB培养过夜的细菌,在6000g,4℃条件下离心15min。 2.加入10ml Buffer P1(根据SBI要求加倍,用20ml)重悬细菌。 3. 加10ml Buffer P2(根据SBI要求加倍,用20ml),剧烈晃动离心管4-6次使其彻底混匀,室 温放置5min。如果使用了LyseBlue试剂,溶液应该变成均匀蓝色。 4.在孵育期间,打开针口的密封盖.并把过滤器放到合适的架子上。 5.加入10ml冰浴的Buffer P3(根据SBI要求加倍,用20ml)到此溶菌产物中,剧烈晃动离心管4-6次使其混匀。如果加入了LyseBlue试剂,混匀试剂直到没有颜色。 6.将溶菌产物倒入针口密封的过滤器中,室温放置10min,不要插入活塞。打开针口的密封盖,轻轻挤压活塞将溶菌产物过滤到一新的50ml离心管中。 7. 加2.5ml Buffer ER到过滤的溶菌液中,充分混匀10次后冰上孵育30min。 8.将QIAGEN-tip 500的柱子挂在另一离心管上,加入10ml Buffer QBT,让管中溶液通过重力滴下排空。 9.将第7步冰上孵育的溶菌液加入QIAGEN-tip柱子中让其透过树脂慢慢滴下。 10用2×30ml Buffer QC洗QIAGEN-tip柱。 11再用15ml Buffer QN洗脱DNA,用离心管收集DNA洗脱液。 12加入10.5ml异丙醇到洗脱液中使DNA沉淀下来,混匀。大于15000×g,4℃离心30min,离心后小心倒出上清液。 13 洗DNA用5ml无内毒素-70%乙醇(添加40ml 96%-100%乙醇到试剂盒的无内毒素水中),15000g,4℃离心10min。小心倒出上清液不要碰到质粒。 14烘干离心管底部的质粒5-10min。用合适体积的无内毒素的Buffer TE重新溶解DNA。 15检测DNA质粒的浓度并记录。

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