GenBank数据库格式的详细说明

GenBank数据库格式的详细说明

GenBank数据库格式的详细说明

Posted on 19 四月 2009 by 柳城,阅读 609 简洁版

GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库,汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。这些文件按类别分为几组:有些按照系统发生学划分,另外一些则按照生成这些序列数据的技术方法划分。目前GenBank中所有的记录均来自于最初作者向DNA序列数据库的直接提交。这些作者将序列数据作为论文的一部分来发表,或将数据直接公开。GenBank由位于马里兰州Bethesda的美国国立卫生研究院下属国立生物技术信息中心建立,与日本DNA数据库(DDBJ)以及欧洲生物信息研究院的欧洲分子生物学实验室核苷酸数据库(EMBL)一起,都是国际核苷酸序列数据库合作的成员。所有这三个中心都可以独立地接受数据提交,而三个中心之间则逐日交换信息,并制作相同的充分详细的数据库向公众开放(虽然格式上有细微的差别,并且所使用的信息系统也略有不同)。

GenBank数据库格式的详细说明

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EMBL和GenBank数据库格式的对比

EMBL GenBank含义

ID LOCUS 序列名称

DE DEFINITION 序列简单说明

AC ACCESSION 序列编号

SV VERSION 序列版本号

KW KEYWORDS 与序列相关的关键词

OS SOURCE 序列来源的物种名

OC ORGANISM 序列来源的物种学名和分类学位置

RN REFERENCE 相关文献编号,或递交序列的注册信息

RA AUTHORS 相关文献作者,或递交序列的作者

RT TITLE 相关文献题目

RL JOURNAL 相关文献刊物杂志名,或递交序列的作者单位

RX MEDLINE 相关文献 Medline引文代码

RC REMARK 相关文献注释

RP 相关文献其它注释

CC COMMENT 关于序列的注释信息

DR 相关数据库交叉引用号

FH FEATURES 序列特征表起始

FT 序列特征表子项

SQ BASE COUNT 碱基种类统计数

空格ORIGIN 序列

完整的开发文档数据库设计说明书

变更履历

目录 第一章引言 (1) 1.1编写目的 (1) 1.2背景 (1) 1.3术语定义 (2) 1.4参考资料 (2) 第二章外部设计 (3) 2.1标识符和状态 (3) 2.2使用它的程序 (3) 2.3命名约定 (3) 2.4设计约定 (3) 第三章结构设计 (4) 3.1概念结构设计 (4) 3.2逻辑结构设计 (21) 3.3物理结构设计 (33) 第四章运用设计 (34) 4.1数据字典设计 ............................................... 错误!未定义书签。 4.2安全保密设计 ............................................... 错误!未定义书签。 4.3数据库实施 (34) 4.3.1创建数据库 (34) 4.3.2创建表 (34) 4.3.3添加参照完整性约束 ..................................... 错误!未定义书签。 4.3.4添加用户完整性约束 ..................................... 错误!未定义书签。 4.3.5添加索引 ............................................... 错误!未定义书签。 4.3.6创建视图 ............................................... 错误!未定义书签。 4.3.7插入测试数据 ........................................... 错误!未定义书签。

学校专业数据库设计说明书

××××学院 ××专业数据库设计报告 题目:数据库设计说明书

目录 一、需求分析 (2) 二、概念设计 (3) 三、逻辑结构设计................................................................ 4-12 3-1表设计 ...................................................................... 4-7 3-2建表语句................................................................. 7-12 3-3关系图 .. (13) 四、数据导入 ............................................................... 13-14 五、数据库应用 (13) 5-1登陆模块 (14) 5-2排课模块 (14) 5-3选课模块 (14) 5-4信息查询模块 (14) 5-5功能结构图 (14) 六、总结 (15)

一、需求分析 本数据库为教务管理系统,主要是针对学校教学管理方面而设计的。学校教务处因为工作需要,必须对每个班的信息,学生的信息,教师的信息,专业信息有一定的了解,并以此为基础来安排课程。安排课程必须根据学校的软硬件设施来安排,所以要考虑到每门课程的上课时间、地点、人数,避免上课地点的冲突,还要安排特定的老师上课。学期结束后,还要记录学生的分数,以此作为下个学期的教学安排依据。 根据上述的初始条件和对本学校的调研考察,设计一个教务管理的数据库:记录教师和学生的基本信息,选课,课程安排等信息,方便老师,同学等用户对数据库的查询,修改等操作。尽量使数据库高效,存储简单。 以下为所附数据流图:

数据库设计说明书(文档格式)

数据库设计说明书 1. 引言 1.1 编写目的 阐明编写本数据库设计说明书的目的,指出读者对象。 1.2 项目背景 列出本项目的委托单位、开发单位和主管部门,说明该数据库系统与其他系统的关系。 1.3 定义 列出本文档中所用到的专门术语的定义和缩写词的原意。 1.4 参考资料 列出有关资料的作者、标题、编号、发表日期、出版单位或资料来源。包括本项目经核准的计划任务书、合同或上级机关的批文,项目开发计划,需求规格说明书,本文档需要引用的论文、著作,需要采用的标准、规范。 2. 外部设计 2.1 标识 列出用于标识该数据库的编码、名称、标识符或标号,并给出附加的描述性信息。如果该数据库是在实验中的或是暂时性的,则要说明其暂时性和有效期。 2.2 约定 叙述使用该数据库所必须了解的建立标号、标识的有关约定。例如用于标识库内各个文卷、记录、数据项的命名约定等。

2.3 使用该数据库的软件 列出将要使用或访问该数据库的所有软件。 2.4 支撑软件 叙述与此数据库有关的支撑软件,如数据库管理系统、存储定位程序等。概要说明这些支撑软件的名称、功能及为使用这些支撑软件所需的操作命令。列出这些支撑软件的有关资料。 2.5 专门说明 为此数据库的生成、测试、操作和维护的相关人员提供专门的说明。 3. 结构设计 3.1 概念结构设计 说明数据库的用户视图,即反映现实世界中的实体、属性和它们之间关系的原始数据形式,包括各数据项、记录、文卷的标识符、定义、类型、度量单位和值域。可使用ER图。 3.2 逻辑结构设计 说明把上述原始数据进行分解、合并后重新组织起来的数据库全局逻辑结构,包括记录、段的编排,记录、段之间的关系及存取方法等,形成本数据库的管理员视图。 3.3 物理结构设计 建立系统程序员视图,包括: (1) 数据在内存中的安排,包括索引区、缓冲区的设计。 (2) 所使用的外存设备及外存之间的组织,包括索引区、数据块的组织 与划分。 (3) 访问数据的方式方法。

数据库设计说明书-模版

XXXX项目 数据库设计说明书

变更履历

第1章引言 (1) 1.1 编写目的 (1) 1.2 背景 (1) 1.3 术语定义 (1) 1.4 参考资料 (1) 第2章外部设计 (3) 2.1 标识符和状态 (3) 2.2 使用它的程序 (3) 2.3 约定 (3) 2.3.1数据库设计的范围 (3) 2.3.2 命名的总体规则及注意事项 (3) 2.3.3 数据模型设计工具要求 (4) 2.4 支持软件 (4) 第3章结构设计 (5) 3.1 物理结构设计 (5) 3.1.1 表空间物理存储参数 (5) 3.1.2 表空间SQL规程 (6) 3.1.3 数据库用户创建 (7) 3.1.4 数据库例程创建 (7) 3.1.5 角色授权 (7) 第4章运用设计 (8) 4.1 数据字典设计 (8) 4.1.1 表名的命名规范 (8) 4.1.2 表字段命名规范 (9) 4.2 安全保密设计 (9) 第5章风险评估 (10) 5.1 表汇总列表 (10) 5.2 实体关系图 (10) 5.3 表详细设计 (11) 第6章安全检查 ....................................... 错误!未定义书签。 6.1 表汇总列表 ..........................................错误!未定义书签。 6.1 实体关系图 ..........................................错误!未定义书签。 6.2 表详细设计 ..........................................错误!未定义书签。第7章绩效管理 ....................................... 错误!未定义书签。 7.1 表汇总列表 ..........................................错误!未定义书签。 7.2 实体关系图 ..........................................错误!未定义书签。 7.3 表详细设计 ..........................................错误!未定义书签。第8章安全响应、预警和管理............................. 错误!未定义书签。 8.1 表汇总列表 ..........................................错误!未定义书签。

项目数据库设计说明书

项目全称 数据库设计说明书 承建方全称 文件ISO版本控制 目录 ?简介.......................................................................................................................... 1.1.目的.................................................................................................................. 1.2.范围.................................................................................................................. 1.3.定义、首字母缩写词和缩略语...................................................................... 1.4.参考资料.......................................................................................................... ?数据库环境..............................................................................................................

生物信息学 第二章 GenBank序列数据库

第二章GenBank序列数据库 简介 一级蛋白质和核酸数据库在分子生物学界是如此的司空见惯,以致于我们很少会去考虑这些普遍存在的工具是如何建立的。但是如果我们能够了解这些序列是如何汇集到一起的,这将有助于我们加深对生物学的理解,并且能够更加充分地发掘这些记录中蕴藏的信息。 GenBank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库,汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。这些文件按类别分为几组:有些按照系统发生学划分,另外一些则按照生成这些序列数据的技术方法划分。目前GenBank中所有的记录均来自于最初作者向DNA序列数据库的直接提交。这些作者将序列数据作为论文的一部分来发表,或将数据直接公开。GenBank由位于马里兰州Bethesda的美国国立卫生研究院下属国立生物技术信息中心建立,与日本DNA数据库(DDBJ)以及欧洲生物信息研究院的欧洲分子生物学实验室核苷酸数据库(EMBL)一起,都是国际核苷酸序列数据库合作的成员。所有这三个中心都可 以独立地接受数据提交,而三个中心之间则逐日交换信息,并制作相同的充分详细的数据库向公众开放(虽然格式上有细微的差别,并且所使用的信息系统也略有不同)。 这一章描述GenBank数据库是如何构成的,它如何与蛋白质数据库相衔接,以及如何解释其中的数据成分。关于序列数据库,前人已经作了大量的工作,具体可参见(Schuler et al., 1996; Bairoch and Apweiller, 1997; Benson et al., 1997; George et al., 1997; Stoesser et al., 1997; Tateno et al., 1997)。所有这些论 文都指出了数据库快速增长的趋势,并对如何利用这些生物学资源提出了建议。出于科学研究的考虑,以及由于历史的原因,序列数据被分别存放在核苷酸和蛋白质数据库中。核苷酸序列是查询核苷酸数据库以及蛋白质数据库时的主要出发点,并且目前有一种趋势,将核苷酸数据库介入到蛋白质数据库的管理之中(正如我们下面将要看到的那样)。这并不奇怪,因为数据库维护者与数据提交者之

数据库设计说明书-完整版

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目录 第一章引言 (1) 1.1编写目的 1 1.2背景 1 1.3参考资料 2 第二章外部设计 (3) 2.1标识符和状态 3 2.2命名约定 3 2.3设计约定 3 第三章结构设计 (4) 3.1概念结构设计 4 3.1.1实体和属性的定义 4 3.1.2设计局部ER模式

13 3.1.3设计全局ER模式 20 3.2逻辑结构设计 21 3.2.1模式 21 3.2.2外模式 32 3.3物理结构设计 32 第四章运用设计 (34) 4.1数据字典设计 34 4.2安全保密设计 34 4.3数据库实施 34 4.3.1创建数据库 34 4.3.2创建表 34

第一章引言 1.1编写目的 1、本数据库设计说明书是关于寝室管理系统数据库设计,主要包括数据逻辑结构设计、数据字典以及运行环境、安全设计等。 2、本数据库设计说明书读者:用户、系统设计人员、系统测试人员、系统维护 人员。 3、本数据库设计说明书是根据系统需求分析设计所编写的。 4、本系统说明书为开发软件提供了一定基础。 1.2背景 随着科学技术的不断提高,计算机科学日渐成熟,其强大的功能已为人们深刻认识,它已经进入人类社会的各个领域并发挥着越来越重要的作用,然而在计算机应用普及以前我国大部分高校的学生信息管理仅靠人工进行管理和操作,这种管理方式存在着许多缺点,如:效率低,密保性差,另外时间一长,将产生大量的文件和数据,其中有些是冗余或者针对同一目的的数据不相吻合,这对于查找、更新和维护文件等管理工作带来了不少困难,同时也跟不上信息时代高速、快捷的要求,严重影响了消息的传播速度。然而现今学校的规模不断扩大,学生数量急剧增加,有关学生的各种信息也成倍增长,人工管理信息的缺点日渐突出,面对庞大的学生信息量,如何利用现代信息技术使其拥有快捷、高效的适应能力已成为当务之急。正因为如此,学生宿舍管理系统成为了学生管理不可缺少的部分,它的内容对于学校的管理者来说都至关重要,所以学生宿舍管理系统应该能

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四川省山桐子能源科技有限责任公司 数 据库设计说明书 2013-5-20 第六小组成员 数据库设计说明书 1 引言 1.1 目的 为了有效指导山桐子能源网站系统数据库的设计,特设计此概要设计说明该网站数据库所含有的各数据表及其机构,以作为系统开发实现的依据,本说明书主要阅读对象为业主方、承建方、监理方相关技术人员和项目责任人。 1.2 背景 说明: a.数据库名称shantz 开发软件sql2005 b.任务提出者:山桐子科技能源有限责任公司 c.目负责人:张林鹏 d.者:赵霞、杨露、陈齐瑜、冯明华、张林鹏、胡芸儿 本系统将使用sql server 2005作为数据库存储系统,sql server 2000企业版将由山桐子公司自行购买。 1.3 定义 该文档也需要将本文档中所涉及的所有术语、缩略语进行详细的定义。还有一种可简明的做法,就是维护在一个项目词汇表中,这样就可以避免在每个文档中都重复很多内容。 id编号,u_name 名称,u_pwd 密码, u_realname 确认密码,u_papert 证件,u_address 家庭住址,u_phone 电话号码,u_news 新闻, 1.4 参考资料 a.山桐子网站设计项目分析会议记录。 b.《桐子网站需求分析说明书》 c.国家标准《数据库设计说明书(gb8567----88)》 2 外部设计 2.1 标识符和状态 要求:详细说明用于唯一地标识该数据库的代码、名称或标识符,附加的描述性信息亦要给出。若该数据库属于尚在实验中、尚在测试中或是暂时使用的,则要说明这一特点及其有效时间范围。 1)数据库标示符:shuantongzi 用户名:admin 密码:123 权限:全部有效时间:开发阶段 说明:系统正式发布后,可能更改数据库用户/密码,请在统一位置编写数据库连接字符串,在发行前请予以改正。 2) 数据库标示符:hyzc 用户名:user 密码:456 权限:会员有效时间:开发阶段 说明:系统正式发布后,可能更改数据库用户/密码,请在统一位置编写数据库连接字符串,在发行前请予以改正。 2.2 使用它的程序 dreamweaver8、https://www.360docs.net/doc/e55436388.html,、sql 2005、ps、 2.3 约定 (1) 字符集采用 utf-8,请注意字符的转换。 (2) 所有数据表第一个字段都是系统内部使用主键列,自增字段,不可空,名称为:id,确保不把此字段暴露给最终用户。 (3) 除特别说明外,所有字符串字段都采用varchar(50) 类型,(无论汉字还是英文,都算一个字符)。 (4) 除特别说明外,所有小数的字段都采用 decimal(13,3) 的形式表达。 (5) 除特别说明外,所有日期格式都采用 date 格式,无时间值。 (6) 除特别说明外,所有整形都采用int 格式。 (7) 除特别说明外,所有字段默认都设置为 null 。 2.4 支持软件

数据库详细设计说明书

修正&标记表 文档变更历史 日期作者版本变更描述 2011-05-28 舒睿V01 数据库说明书创建 2011-06-13 舒睿V01.1 数据库各表功能说明创建 2011-06-20 舒睿V02 数据库各项细节功能完成 审核结果 审核人通过版本审核认职位日期 文档属性 项目描述 文档名称功能说明书 作者舒睿 创建日期5/28/2011 最后更新日期 1.1目的 本文为图书馆管理课程设计SQL Server功能规范说明书。本说明书将: ●描述数据库设计的目的 ●说明数据库设计中的主要组成部分 ●说明数据库设计中各功能的实现 1.2内容 本文档主要内容包括对数据库设计结构的总体描述,对数据库中各种对象的描述(包括对象的名称、对象的属性、对象和其他对象直接的关系)。本文档中包含对以下数据库内容的描述: ●数据表 ●视图 ●存储过程 ●触发器

●约束 在数据库主要对象之外,本文还将描述数据库安全性设置、数据库属性设置和数据库备份策略,为数据库管理员维护数据库安全稳定地运行提供参考。 1.3与其他项目的关联 本项目的数据库设计与本项目(Web部分和Windows部分)功能密切相关。本案例项目的数据库将按照项目程序部分的功能需求而设计,数据库设计将配合设计案例的程序部分,以实现一个功能完备的真实环境内的应用。 表 1.4表设计概述 根据设计的系统功能,数据库将以图书信息为中心存储相关数据,配合SQL Server 数据库系统中提供的数据管理,实现图书的借阅、归还、续借及系统设置等业务功能。 数据库设计将以存储读者信息的读者表为基础,连接多张相关表以实现对以下关系的支持: ●读者借书记录 ●读者还书记录 ●读者续借记录 ●读者罚款记录 ●读者对图书的评价 ●读者对图书和图书馆的建议及留言 数据库系统主要的实体关系如图0-1所示。

ISO软件工程数据库设计说明书

ISO软件工程模板(7)数据库设计说明书 1.引言 1.1编写目的 [说明编写这份数据设计说明书的目的,指出预期的读者。] 1.2背景 a.[待开发数据库的名称和使用此数据库的软件系统的名称;] b.[列出本项目的任务提出者、开发者、用户。] 1.3定义 [列出本文件中用到的专门术语的定义和外文首字母组词的原词组。] 1.4参考资料 [列出有关的参考资料。] 2.外部设计 2.1标识符的状态 [联系用途,详细说明用于唯一地标识该数据库的代码、名称或标识符,附加的描述性信息亦要给出。如果该数据库属于尚在实验中、尚在测试中或是暂时使用的,则要说明这一特点及其有效时间范围。] 2.2使用它的程序 [列出将要使用或访问此数据库的所有应用程序,对于这些应用程序的每一个,给出它的名称和版本号。] 2.3约定

[陈述一个程序员或一个系统分析员为了能使用此数据库而需要了解的建立标号、标识的约定。] 2.4专门指导 [向准备从事此数据库的生成、从事此数据库的测试、维护人员提供专门的指导。] 2.5支持软件 [简单介绍同此数据库直接有关的支持软件。说明这些软件的名称、版本号的主要功能特性。列出这些支持软件的技术文件的标题、编号及来源] 3.结构设计 3.1概念结构设计 [说明本数据库将反映的现实世界中的实体、属性和它们之间的关系等的原始数据形式,包括各数据项、记录、系、文卷的标识符、定义、类型、度量单位和值域,建立本数据库的每一幅用户视图。] 3.2逻辑结构设计 [说明把上述原始数据进行分解、合并后重新组织起来的数据库全局逻辑结构。] 3物理结构设计 [建立系统程序员视图。] 4.运用设计 4.1数据字典设计 [对数据库设计中涉及到的各种项目一般要建立起数据字典,以说明它们的标识符、同义名及有关信息。] 4.2安全保密设计 [说明在数据库的设计中,将如何通过区分不同的访问者、不同的访问类型和不同的数据对象,进行分别对待而获得的数据库安全保密的设计考虑。]

数据库设计说明书_完整版

目录 第一章引言 (1) 1.1编写目的 (1) 1.2背景 (1) 1.3参考资料 (2) 第二章外部设计 (3) 2.1标识符和状态 (3) 2.2命名约定 (3) 2.3设计约定 (3) 第三章结构设计 (4) 3.1概念结构设计 (4) 3.1.1实体和属性的定义 (4) 3.1.2设计局部ER模式 (13) 3.1.3设计全局ER模式 (20) 3.2逻辑结构设计 (21) 3.2.1模式 (21) 3.2.2外模式 (32) 3.3物理结构设计 (32) 第四章运用设计 (34) 4.1数据字典设计 (34) 4.2安全保密设计 (34) 4.3数据库实施 (34) 4.3.1创建数据库 (34) 4.3.2创建表 (34)

第一章引言 1.1编写目的 1、本数据库设计说明书是关于寝室管理系统数据库设计,主要包括数据逻辑结构设计、数据字典以及运行环境、安全设计等。 2、本数据库设计说明书读者:用户、系统设计人员、系统测试人员、系统维护人员。 3、本数据库设计说明书是根据系统需求分析设计所编写的。 4、本系统说明书为开发软件提供了一定基础。 1.2背景 随着科学技术的不断提高,计算机科学日渐成熟,其强大的功能已为人们深刻认识,它已经进入人类社会的各个领域并发挥着越来越重要的作用,然而在计算机应用普及以前我国大部分高校的学生信息管理仅靠人工进行管理和操作,这种管理方式存在着许多缺点,如:效率低,密保性差,另外时间一长,将产生大量的文件和数据,其中有些是冗余或者针对同一目的的数据不相吻合,这对于查找、更新和维护文件等管理工作带来了不少困难,同时也跟不上信息时代高速、快捷的要求,严重影响了消息的传播速度。然而现今学校的规模不断扩大,学生数量急剧增加,有关学生的各种信息也成倍增长,人工管理信息的缺点日渐突出,面对庞大的学生信息量,如何利用现代信息技术使其拥有快捷、高效的适应能力已成为当务之急。正因为如此,学生宿舍管理系统成为了学生管理不可缺少的部分,它的内容对于学校的管理者来说都至关重要,所以学生宿舍管理系统应该能

数据库设计说明书

数据库设计说明书

数据库设计说明书 内容管理系统(DWCMS) 版本历史 1.引言 在使用任何数据库之前,都必须设计好数据库,包括将要存储的数据的类型,数据之间的相互关系以及数据的组织形式。数据库设计是指对于一个给定的应用环境,构造最优的数据库模式,建立数据库及其应用系统,使之能够有效地存储数据。为了合理地组织和高效率地存取数据,当前最好的方式,就是建立数据库系统,因此在系统的总体设计阶段,数据库的建立与设计是一项十分重要的内容。由于数据库应用系统的复杂性,为了支持相关程序运行,数据库设计就变得异常复杂,因此最佳设计不可能一蹴而就,而只能是一种“重复探寻,逐步求精”的过程,也就是规划和结构化数据库中的数据对象以及这些数据对象之间关

系的过程。 1.1 编写目的 数据库设计的好坏是一个关键。如果把企业的数据比做生命所必须的血液,那么数据库的设计就是应用中最重要的一部分,是一个系统的根基。用于开发人员进行项目设计,以此作为编码的依据,同时也为后续的数据库维护工作提供了良好的使用说明,也能够作为未来版本升级时的重要参考资料。数据库设计的目标是建立一个合适的数据模型。这个数据模型应当是满足用户要求,既能合理地组织用户需要的所有数据,又能支持用户对数据的的所有处理功能。而且要具有较高的范式,数据完整性好,效益高,便于理解和维护,没有数据冲突。 1.2 背景 1.3 定义 Lmbang:辣妈帮 E-R图:实体关系图

1.4 参考资料 A. 《细说PHP》教程 B. 《DWCMS项目需求分析说明书》 C. 本项目相关的其它参考资料。 2. 外部设计 外部设计是研究和考虑所要建立的数据库的信息环境,对数据库应用领域中各种信息要求和操作要求进行详细地分析,了解应用领域中数据项、数据项之间的关系和所有的数据操作的详细要求,了解哪些因素对响应时间、可用性和可靠性有较大的影响等各方面的因素。 2.1 标识符和状态 数据库表前缀:lmbang_ 用户名:root 密码;020808 权限:全部 有效时间:开发阶段 说明:系统正式发布后,可能更改数据库用户/密码,请在统一位置编写数据库连接字符串,在发行前请予以改正。 2.2 使用它的程序 本系统主要利用PHP作为前端的应用开发工具,使用MySQL

系统数据库设计说明书

期末考核设计报告 课程名称:软件工程 题目:航空订票系统 专业班级:17计科本4班 学号:17401085 学生姓名:刘梅 指导教师:朱婕 2019年11月20日

期末考核任务书 课程名称:软件工程 设计题目:航空订票系统 专业:计算机科学与技术班级:17计科本4班完成时间:2019年11月指导教师:朱婕

期末考核成绩评定表

航空订票系统数据库设计说明书 编写人:刘梅

目录 1引言 (1) 1.1编写目的 (1) 1.2项目背景 (1) 2数据库外部设计 (2) 2.1标识符和状态 (2) 2.2支持软件 (2) 2.3 数据完整性设计 (2) 2.4 数据规范性设计 (2) 3数据库结构设计 (4) 3.1概念结构设计 (4) 3.2逻辑结构设计 (6) 3.3表结构设计 (8) 3.3.1表user (9) 3.3.2 表administrator (9) 3.3.3 表flight (9) 3.3.4 表ticket (9) 参考文献 (10)

1引言 1.1编写目的 本文档说明了航空订票系统项目的数据库设计,用于指导该系统在数据库存储各方面的内容,为系统设计员及开发的程序员作为基准文档。 该文档的预期读者是该项目的系统设计员及程序员。 在下一阶段的详细设计及编码中,程序设计人员可参考此数据库设计说明,在数据模型设计的基础上,对系统进行详细设计和编码。在以后的软件测试以及软件维护阶段也可参考此说明书,以便在修改时找出在本阶段设计的不足或错误。 1.2项目背景 开发软件名称:航空订票系统 委托单位:武汉工商学院 开发单位:205 主管部门:205 信息管理技术作为当今计算机最广泛的应用,已经渗透到软件系统的方方面面,该航空订票系统在社会上运用广泛,航空市场的不断扩大,飞机现已成为大部分人选择的出行工具,航空订票系统也成为了重要的系统。这可以适应现在的快速发展,管理大量的数据,并且具有一定稳定性,实现现代化的信息管理。

数据库设计说明(DBDD)-1.5

文档编号:DBDD-KISS 项目编号:KISS-001 [班级管理系统] 数据库设计说明(DBDD) V [1.5] 拟制人______________________ 审核人______________________ 批准人______________________ 北京师范大学珠海分校 信息技术学院 [2011年7月4日]

数据库设计说明(DBDD) 2 北京师范大学珠海分校信息技术学院

目录 1.引言 (2) 1.1.标识 (2) 1.2.数据库概述 (2) 1.3.文档概述 (2) 2.引用文件 (3) 3.数据库级设计决策 (3) 3.1.1数据库管理系统 (3) 3.1.2数据库分布与数据库文件更新,维护 (4) 3.1.3 数据库备份与恢复 (4) 4数据库详细设计 (5) 4.1数据库概念设计数据库概念设计 (5) 4.2PDM (10) 4.2.1物理数据模型 (10) 4.2.2系统表清单 (11) 4.2.3表的列清单 (12) 4.3数据流图 (19) 5.需求的可追踪性 (21) 北京师范大学珠海分校信息技术学院 1

数据库设计说明(DBDD) 1.引言 1.1.标识 1.2.数据库概述 本说明书说明“班级管理系统”的数据库设计、结构情况,用于开发人员进行项目设计,同时也为后续的数据库维护工作提供了良好的使用说明,也可以作为未来版本升级时的重要参考资料。 1.3.文档概述 《班级管理系统数据设计说明书》目的是明确“班级管理系统”中各项功能和非功能性需求实现时所需要的数据类型,数据关系,数据流程,并用于指导设计人员对数据库的设计。 《班级管理系统数据设计说明书》的阅读对象为: 2 北京师范大学珠海分校信息技术学院

GenBank数据库简介

GenBank数据库简介 点击次数:791 发布日期:2008-5-11 仅供参考,谢绝转载,否则责任自负 1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库,一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合(UniGene),人类基因组基因图谱,分类学浏览器,同国立癌症研究所合作的癌症基因组剖析计划(CGAP)等数据库。GenBank以指数形式增长,核酸碱基数目大概每14个月就翻一个倍。 2. 纪录样本 - 关于GenBank的各个字段的详细描述,以及同Entrez搜索字段的交叉索引。 3. 访问GenBank - 通过Entrez Nucleotides来查询。用accession number,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,还有许多其他的文本术语来查询。关于Entrez更多的信息请看下文。用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。 4. 增长统计 - 参见公布通知的2.2.6(每个分类的统计),2.2.7(每个物种的统计),2.2.8(GenBank 增长)小节。 5. 公布通知,最新 - 最近和即将有的变化,GenBank的分类,数据增长统计,GenBank的引用。 6. 公布通知,旧 - 同上相同,是过去公布的统计。 7. 遗传密码 - 15个遗传密码的概要。用来确保GenBank中纪录的编码序列被正确的翻译。 向GenBank提交数据: 1. 关于提交序列数据,收到accession number,和对纪录作更新的一般信息。 2. BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。(请在提交前用VecScreen去除载体) 3. Sequin - 提交软件程序,用于一条或者很多条的提交,长序列,完整基因组,alignments,人群/种系/突变研究的提交。可以独立使用,或者用基于TCP/IP的“network aware”模式,可以链接到其他NCBI 的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。(请在提交前用VecScreen去除载体) 4. ESTs - 表达序列标签,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。 5. GSSs - 基因组调查序列,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exon trap获得的序列,cosmid/BAC/YAC 末端,及其他。 6. HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列,未完成的(阶段0,1,2)和完成的(阶段3)序列。(注意:完成的人类的HTG序列可以同时在GenBank和Human Genome Sequencing页面上访问。) 7. STSs - 序列标签位点。短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。 8. 注:SNPs - 人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到NCBI数据库的单核苷酸多态性库中(dbSNP)。 国际核苷酸序列数据库合作组织: 1. GenBank,DDBJ,EMBL - 合作计划的概述,并链接到相应的主页。GenBank,DDBJ(DNA Data Bank of Japan),and EMBL (European Molecular Biology Laboratory)数据库共享的数据是每天都交换的,因此他们是相等的。数据纪录的格式和搜索方式可能会不一样,但是accession number,序列数据和注解都是一模一样的。即,你可以用accession number U12345在GenBank,DDBJ或EMBL中查找相应纪录,得到的结果是完全一样的序列数据,参考内容等等。? 2. DDBJ/EMBJ/GenBank特性表—特性表格式和标准被合作数据库用在序列记录的注释上,使得数据共享成为可能,包括详细的描述生物特性和特性限定语的附录,以及IUPAC规定的核苷酸和氨基酸的代号。?

数据库设计说明书

1引言 (2) 1.1编写目的 (2) 1.2背景 (2) 1.3定义 (2) 1.4参考资料 (2) 2外部设计 (2) 2.1标识符和状态 (2) 2.2使用它的程序 (3) 2.3约定 (3) 2.4专门指导 (3) 2.5支持软件 (3) 3结构设计 (3) 3.1概念结构设计 (3) 3.2逻辑结构设计 (3) 3.3物理结构设计 (4) 4运用设计 (4) 4.1数据字典设计 (4) 4.2安全保密设计 (4)

数据库设计说明书(GB8567——88) 1引言 1.1编写目的 说明编写这份数据库设计说明书的目的,指出预期的读者。 1.2背景 说明: a.说明待开发的数据库的名称和使用此数据库的软件系统的名称; b.列出该软件系统开发项目的任务提出者、用户以及将安装该软件和这个数据库的计算站(中心)。 1.3定义 列出本文件中用到的专门术语的定义、外文首字母组词的原词组。 1.4参考资料 列出有关的参考资料: a.本项目的经核准的计划任务书或合同、上级机关批文; b.属于本项目的其他已发表的文件; c.本文件中各处引用到的文件资料,包括所要用到的软件开发标准。 列出这些文件的标题、文件编号、发表日期和出版单位,说明能够取得这些文件的来源。2外部设计 2.1标识符和状态 联系用途,详细说明用于唯一地标识该数据库的代码、名称或标识符,附加的描述性信息亦要给出。如果该数据库属于尚在实验中、尚在测试中或是暂时使用的,则要说明这一特点及其有效时间范围。

2.2使用它的程序 列出将要使用或访问此数据库的所有应用程序,对于这些应用程序的每一个,给出它的名称和版本号。 2.3约定 陈述一个程序员或一个系统分析员为了能使用此数据库而需要了解的建立标号、标识的约定,例如用于标识数据库的不同版本的约定和用于标识库内各个文卷、、记录、数据项的命名约定等。 2.4专门指导 向准备从事此数据库的生成、从事此数据库的测试、维护人员提供专门的指导,例如将被送入数据库的数据的格式和标准、送入数据库的操作规程和步骤,用于产生、修改、更新或使用这些数据文卷的操作指导。如果这些指导的内容篇幅很长,列出可参阅的文件资料的名称和章条。 2.5支持软件 简单介绍同此数据库直接有关的支持软件,如数据库管理系统、存储定位程序和用于装入、生成、修改、更新数据库的程序等。说明这些软件的名称、版本号和主要功能特性,如所用数据模型的类型、允许的数据容量等。列出这些支持软件的技术文件的标题、编号及来源。 3结构设计 3.1概念结构设计 说明本数据库将反映的现实世界中的实体、属性和它们之间的关系等的原始数据形式,包括各数据项、记录、系、文卷的标识符、定义、类型、度量单位和值域,建立本数据库的每一幅用户视图。 3.2逻辑结构设计 说明把上述原始数据进行分解、合并后重新组织起来的数据库全局逻辑结构,包括所确定的关键字和属性、重新确定的记录结构和文卷结构、所建立的各个文卷之间的相互关系,形成本数据库的数据库管理员视图。

超市管理系统数据库设计说明书

目录 1引言 (2) 1.1编写目的 (2) 1.2背景 (2) 1.3定义 (2) 1.4参考资料 (2) 2外部设计 (3) 2.1标识符和状态 (3) 2.2使用它的程序 (3) 2.3约定 (3) 2.4专门指导 (3) 2.5支持软件 (3) 3结构设计 (4) 3.1概念结构设计 (4) 3.2逻辑结构设计 (4) 3.3物理结构设计 (5) 4运用设计 (7) 4.1数据字典设计 (7) 4.2安全保密设计 (8)

超市管理系统数据库设计说明书 1 引言 1.1编写目的 本数据库设计说明书是为了详细设计的数据结构而进行设计的,为后期工作打下基础。让该系统的需求者对该系统中的数据结构有个大致的了解。 1.2背景 a、待开发的数据库的名称:超市销售管理系统 b、使用此数据库的软件系统的名称:Microsoft SQL Server 2000 c、该软件系统开发项目的任务提出者:。。。。。 1.3定义 SQL语言英文全称是Structure Query Language,意为结构化查询语言。SQL语言的主要功能就是同各种数据库建立联系,进行沟通用来执行各种各样的操作,例如更新数据库中的数据、从数据库中提取数据等。SQL已被ANSI(美国国家标准协会)和国际标准化组织(ISO)定为关系型数据库语言的标准语言。目前绝大多数流行的关系型数据库管理系统,如Oracle、Sybase、MicroSoft Sql Server、DB2等都遵循SQL语言标准。SQL语句有很多,功能齐全,大致可以分为四大类: 数据定义:用于创建、删除、修改数据中的各类对象,如CREATE、DROP、ALTER。数据查询:对数据库查询检索,命令有SELECT。 数据更新:插入、更新、删除数据库,如NSERT、UPDATE、DELETE。 数据控制:数据控制管理,如表加锁、授权、回收授权、提交事务、回滚事务,命令有:LOCK、GRANT、REVOKE、COMMIT、ROLLBACK。 1.4参考资料 1、《超市销售管理系统可行性研究说明书》 2、《超市销售管理系统需求说明书》 3、《软件工程导论》——张海藩,清华大学出版社。 4、《数据库系统概论》——萨师煊高等教育出版社

数据库设计说明书

数据库设计说明书 内容管理系统(DWCMS) 版 本 历 史 1. 引言 在使用任何数据库之前,都必须设计好数据库,包括将要存储的数据的类型,数据之间的相互关系以及数据的组织形式。数据库设计是指对于一个给定的应用环境,构造最优的数据库模式,建立数据库及其应用系统,使之能够有效地存储数据。为了合理地组织和高效率地存取数据,目前最好的方式,就是建立数据库系统,因此在系统的总体设计阶段,数据库的建立与设计是一项十分重要的内容。由于数据库应用系统的复杂性,为了支持相关程序运行,数据库设计就变得异常复杂,因此最佳设计不可能一蹴而就,而只能是一种“反复探寻,逐步求精”的过程,也就是规划和结构化数据库中的数据对象以及这些数据对象之间关系的过程。 1.1 编写目的 数据库设计的好坏是一个关键。如果把企业的数据比做生命所必需的血液,那么数据库的设计就是应用中最重要的一部分,是一个系统的根基。用于开发人员进行项目设计,以此作为编码的依据,同时也为后续的数据库维护工作提供了良好的使用说明,也可以作为未来版本升级时的重要参考资料。数据库设计的目标是建立一个合适的数据模型。这个数据模型应当是满足用户要求,既能合理地组织用户需要的所有数据,又能支持用户对数据的的所有处理功能。并且要具有较高的范式,数据完整性好,效益高,便于理解和维护,没有数据冲突。 1.2 背景 文件状态: [ ] 草稿 [ √ ] 正式发布 [ ] 正在修改 文件标识: 兄弟连 大腕组-LMB-DATABASE 当前版本: 2.0 作 者: 大碗小组 文件状态: 2014-01-01 版本/状态 作者 参与者 起止日期 备注 1.0 大腕组 大腕组成员2013-01-18 2014-01-08 测试版 2.0 大腕组 大腕组成员 2014-01-09 2014-02-13 正式版

数据库详细设计说明书-模板

{项目名称} 数据库详细设计说明书

版本历史

目录 一、BSCISPDB数据库 (1) 1. CMS采集表(JC_ACQUISITION) (1) 2. 采集历史记录表(JC_ACQUISITION_HISTORY) (2) 3. 采集进度临时表(JC_ACQUISITION_TEMP) (2) 4. CMS广告表(JC_ADVERTISING) (3) 5. CMS广告属性表(JC_ADVERTISING_ATTR) (3) 6. CMS广告版位表(JC_ADVERTISING_SPACE) (3) 7. CMS栏目表(JC_CHANNEL) (4) 8. CMS栏目扩展属性表(JC_CHANNEL_ATTR) (4) 9. CMS栏目访问量计数表(JC_CHANNEL_COUNT) (4) 10. CMS栏目部门关联表(JC_CHANNEL_DEPARTMENT) (4) 11. CMS栏目内容表(JC_CHANNEL_EXT) (5) 12. 栏目可选内容模型表(JC_CHANNEL_MODEL) (6) 13. CMS栏目文本表(JC_CHANNEL_TXT) (6) 14. CMS栏目用户关联表(JC_CHANNEL_USER) (6) 15. CMS栏目投稿会员组关联表(JC_CHNL_GROUP_CONTRI) (6) 16. CMS栏目浏览会员组关联表(JC_CHNL_GROUP_VIEW) (6) 17. CMS评论表(JC_COMMENT) (7) 18. CMS评论扩展表(JC_COMMENT_EXT) (7) 19. CMS配置表(JC_CONFIG) (7) 20. CMS配置属性表(JC_CONFIG_ATTR) (8) 21. CMS配置模型项表(JC_CONFIG_ITEM) (9) 22. CMS内容表(JC_CONTENT) (9) 23. CMS内容附件表(JC_CONTENT_ATTACHMENT) (10) 24. CMS内容扩展属性表(JC_CONTENT_ATTR) (10) 25. CMS内容栏目关联表(JC_CONTENT_CHANNEL) (10) 26. CMS内容审核信息表(JC_CONTENT_CHECK) (10) 27. CMS内容计数表(JC_CONTENT_COUNT) (11) 28. 文库相关(JC_CONTENT_DOC) (11) 29. CMS内容扩展表(JC_CONTENT_EXT) (12) 30. CMS内容浏览会员组关联表(JC_CONTENT_GROUP_VIEW) (12) 31. CMS内容图片表(JC_CONTENT_PICTURE) (12) 32. CMS共享内容审核信息表(JC_CONTENT_SHARE_CHECK) (13) 33. CMS内容TAG表(JC_CONTENT_TAG) (13) 34. CMS专题内容关联表(JC_CONTENT_TOPIC) (13) 35. CMS内容文本表(JC_CONTENT_TXT) (13) 36. CMS内容类型表(JC_CONTENT_TYPE) (13) 37. CMS内容标签关联表(JC_CONTENTTAG) (14) 38. 部门(JC_DEPARTMENT) (14) 39. 字典表(JC_DICTIONARY) (14) 40. 标签模板(JC_DIRECTIVE_TPL) (14) 41. 附件(JC_FILE) (14)

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