蛋白质专题训练

蛋白质专题训练
蛋白质专题训练

蛋白质专题训练

湖北省恩施清江外国语学校彭邦凤

一、选择题(每小题只有一个选项符合题意)

1.已知氨基酸的平均分子量为128,有100个氨基酸形成3条肽链的蛋白质,分子量约为

A.12800 B.11018 C.11054 D.11638

2.通常情况下,分子式为C63H103O65N17S2的蛋白质分子,最多含有肽腱的个数为

A.63 B.62 C.17 D.16

3.血红蛋白分子中含574个氨基酸,共有4条肽链。在形成此蛋白质分子时,脱下的水分子数、形成肽键数、至少含有的氨基数和羧基数分别是

A.573、573、573、573 B.570、573、571、571

C.570、573、4、4 D.570、570、4、4

4.下列对蛋白质和核酸的描述正确的是

A.核酸是一切生物的遗传物质 B.蛋白质是生命活动的主要承担者

C.所有酶的化学本质都是蛋白质D.生物新陈代谢的全部化学变化都是酶促反应

5.现有A、B、C三种氨基酸,当每种氨基酸数目不限的情况下,可形成三肽化合物的种类数及形成含3种氨基酸的三肽化合物的种类数分别为

A.3,3 B.6,3 C.9,27 D.27,6

6.某物质的分子式为C184H3012O576N468S21,则该物质最可能是

A.糖类B.脂肪C.蛋白质D.核酸

7.已知20种氨基酸平均相对分子质量为a,现有某蛋白质分子由n条多肽链组成且相对分子质量为b,此蛋白质分子中的肽键数为

8.有一种二肽,化学式是C8H14N2O5,水解后得到丙氨酸和另一种氨基酸M,则M的R基的化学式是

A.—C5H9NO4B.—C3H5NO2C.—C5H7O2D.—C3H5O2

9.下表为某种食物中四种氨基酸的含量和人体蛋白质中这四种氨基酸的平均含量。如果食用这种食物,可通过哪种生理过程,使食物中的这四种氨基酸得到充分合理的利用

A.呼吸作用

B.转氨基作用

C.脱氨基作用

D.氧化作用

10.生物体内的蛋白质千差万别,即使像催产素、牛加压素、血管舒张素等由相同数量的氨基酸构成的蛋白质,生理功能也差异很大。其原因不可能是

A.组成肽键的化学元素或合成场所不同B.组成蛋白质的氨基酸种类和数量不同

C.氨基酸排列顺序不同D.蛋白质的空间结构不同

11.组成蛋白质的氨基酸之间的肽键结构式是

A.NH—CO B.-NH-CO—C.-NH2-COOH—D.NH2—COOH

12.动物体内甲种氨基酸通过转氨基作用生成乙种氨基酸,可以肯定的是

A.甲种氨基酸是必需氧某酸B.甲种氨基酸是非必需氨基酸

C.乙种氨基酸是必需氨基酸D.乙种氨基酸是非必需氨基酸

13.临床通过检测尿液中一定时间内的含氮量,可粗略地估算下列哪一营养物质在该段时间内的氧化分解量

A.蛋白质 B.脂肪 C.糖 D.维生素D

14.有一种“十五肽”的化学式为C x H y N z O d S e(z>15,d>16)。已知其彻底水解后得到下列几种氨基酸:

下列有关说法中不正确的是

A.水解可得e个半胱氨酸B.水解可得(d-16)/2个天门冬氨酸

C.水解可得z-15个赖氨酸D.水解时消耗15个水分子

15.关于人体内蛋白质的叙述,错误的是

A.合成蛋白质的氨基酸全部为必需氨基酸 B.蛋白质也可被氧化分解释放能量

C.组成肌肉细胞的有机物中蛋白质含量最多D.有些蛋白质具有调节新陈代谢的作用16.水蛭素是由65个氨基酸组成的蛋白质,控制该蛋白质合成的基因其碱基数至少应A.390 B.195 C.65 D.260

17.某蛋白质由n条肽链组成,氨基酸的平均分子量为a,控制该蛋白质合成的基因含b个碱基对,则该蛋白质的分子量最多

A.B.C.D.

18.下列关于细胞主要化学成分的叙述,不正确的是

A.蛋白质在加热、X射线照射、强酸、强碱及重金属盐的作用下功能丧失的原因是结构改变的结果

B.染色体除含有DNA外,还有蛋白质和RNA

C.胆固醇、性激素、维生素D都属于脂类

D.动物乳汁中的乳糖和植物细胞中的纤维素都属于多糖

19.关于进入动物细胞内氨基酸所发生变化的描述,正确的是

A.可以合成蛋白质B.分解的最终产物是二氧化碳和水

C.直接合成性激素

D.经过氨基转换作用形成尿素

20.糖尿病患者使用胰岛素治疗时,大都采用肌肉注射而不是口服,其根本原因是

A.肌肉注射比口服的先进入人体B.口服时药液对消化道的刺激过于强烈

C.口服时药液将被消化液中的蛋白酶分解D.口服时药液被消化液中的脂肪酶分解

二、非选择题(本大题为非选择题,共3个小题)

21.根据下图回答问题:

⑴图中A表示、D表示、G表示;

⑵某一化合物水解过程中得到了甲、乙两种化合物,它们的名称是:、;经分析知道,若需将该化合物彻底水解,则水解过程中用于每分子该化合物的水分子数为150个,则这种化合物是由个氨基酸分子脱水综合形成。

⑶某同学说:“图中B、C、E、F所示结构均为肽键”,其说法正确吗?请说说你的理由。

22.某蛋白质由51个氨基酸、两条链构成,结构图中—S—S—为两个—SH形成。其结构模式图如下:

⑴该蛋白质分子形成过程中形成了个水分子和个肽键;形成过程中消耗掉的氨基和羧基数分别是、;该蛋白质分子中至少还有游离氨基和羧基数分别是、。

⑵组成该蛋白质的氨基酸的不同之处在于它们具有不同的R基,在形成此蛋白质的氨基酸中最多含有种不同的R基。

⑶如果形成该蛋白质分子的氨基酸的平均相对分子质量为100,则该蛋白质的分子质量是,控制该蛋白质分子合成的基因至少含有碱基对。

23.酶是一类具有生物催化功能的有机物,就其化学本质而言,到目前为止,人们所发现的酶主要有蛋白质和RNA两大类,人的唾液中含有唾液淀粉酶,有人说:“唾液淀粉酶的化学本质是蛋白质”。请设计一个实验以证明该酶是否是蛋白质。

实验材料:5%的NaOH溶液、3%的CuSO4溶液、鸡蛋、人的唾液5mL、水、小烧杯、玻璃棒、试管、滴管。

实验步骤:

第一步:制备蛋清液。取生鸡蛋一个,打破蛋壳(不要破坏蛋黄),取少量蛋清注入小烧杯中,加入30 mL的清水,用玻璃棒调匀,制成蛋清液。

第二步:

第三步:

第四步:

实验结果:

结果分析:

蛋白质专题训练参考答案

一、选择题

1.D

2.D 解析:每分子氨基酸至少含有一个氨基,即至少含有一个氮原子,该化合物最多由17个氨基酸脱水缩合形成,即最多有肽键16个。

3.D 解析:氨基酸之间通过脱水缩合形成肽键的方式来构成肽链。假设有m个氨基酸,通过脱水缩合形成n条肽链,那么,脱下的水分子数等于形成的肽键数等于m-n。脱水数与形成的肽键数、消耗的氨基和羧基数相等,而一个氨基酸至少有一个氨基和羧基,因为R 基上可能含有氨基和羧基,由原有氨基和羧基减去消耗的,剩余的氨基和羧基至少等于链的条数,即4和4。

4.B 解析:新陈代谢是活细胞中全部有序的化学变化的总称,绝大多数的化学反应都是在酶的催化下进行的,水光解例外,在特殊的叶绿素A的作用下进行;多数酶是蛋白质,少数为RNA;蛋白质是生命活动的主要承担者和体现者;核酸绝大多数生物的遗传物质,朊病毒不含核酸。

5.D 解析:当氨基酸种类数为m,在每种氨基酸数目不限的情况下,形成n肽的种类数为mn,本题形成的3肽种类数为33=27种;若要求多肽中每种氨基酸不同的情况下,形成n肽(m>n)的种类数为m×(m-1)×…×(m-n),本题能够形成含3种氨基酸的三肽化合物的种类数为3×2×1=6种。

6.C 解析:糖类、脂肪由C、H、O三种元素组成,蛋白质由C、H、O、N四种元素组成,有的还有P、S等元素,核酸由C、H、O、N、P五种元素组成。从题干中得知该化合物中含有N元素,所以一定不是糖类和脂肪,又不含P元素,所以也不可能是核酸。

7.B 解析:设氨基酸个数为x,则有xa-(x-n)×18=b,求得x=(b-18n)/(a-18),由肽键数=x-n可求得肽键数为(b-an)/(a-18)。

8.D 解析:由二肽水解可知,水解形成的两种氨基酸具有的C、H、N、O原子个数依次是8、16、2、6,而丙氨酸的分子为C3H7NO2,可知另一种氨基酸中C、H、N、O个数依次是5、9、1、4,而氨基酸的通式中除去R基后含有的C、H、N、O原子数为2、4、1、2,则R其中C、H、N、O各原子个数依次是3、5、0、2,则R基应该是—C3H5O2

9.B 解析:蛋白质的营养价值的高低取决于各种氨基酸的含量是否均衡,尤其是必需氨基酸的含量,一般来说,食物中的氨基酸含量均不能正好与人体的需要量相吻合,为了使其有效利用,机体可通过转氨基作用将含量较多的氨基酸转变为含量相对不足的非必需氨基酸,如本题中可将甘氨酸通过转氨基作用形成另外三种氨基酸。

10.A 解析:蛋白质的多样性是由组成蛋白质的氨基酸种类和数量,排列顺序和肽链空间结构来决定,而组成肽键的化学元素是相同的。但与合成场所没有关系。

11.C 解析:肽键是组成蛋白质的相邻氨基酸的氨基和羧基之间脱去一分子水后形成的新键,正确表示应该是-NH2-COOH—。

12.D

13.A

14.C 解析:⑴根据反应前后S原子守恒,S原子在脱水缩合时不消耗,可知“十五肽”中S原子个数即为半胱氨酸个数,即形成该多肽消耗了e个半胱氨酸;⑵设组成该多肽的天门冬氨酸为n个,可知:

反应前氨基酸的O原子数=2×15(组成每分子多肽的氨基酸数)+2×n(天门冬氨酸数)

反应后生成物中O原子数=d(多肽中O原子数)+14(脱下水中的O原子数)

根据反应前后O原子守恒,可得:2×15+2×n=d+14→n=(d-16)/2

⑶设组成该多肽的赖氨酸为m个,同⑵推理:只有赖氨酸含有两个氨基,反应前后N原子不会变化,由反应前后N原子守恒,可得:5+m=z→m=z-15

15.A

16.A 解析:DNA(基因)经转录形成mRNA,翻译形成蛋白质。由于控制蛋白质合成的基因中存在非编码区,对真核基因而言其编码区内还含有内含子,因此蛋白质AA数目与mRNA上的密码子、基因(DNA)上的碱基数量关系为:1:3:6,因此控制65个氨基酸的蛋白质的基因中至少应有碱基数65×6=390。

17.D 解析:由b个碱基对组成的基因转录时最多形成b/3个密码子,对应AA数量b/3个,形成n条肽链时,脱水数为b/3-n,则形成的蛋白质的分子量为a×b/3-(b/3-n)×18,即D。

18.D 解析:蛋白质易受到加热、X射线照射、强酸、强碱及重金属盐等因素的影响而变性;染色体主要由DNA和蛋白质构成,还有少量RNA;胆固醇、性激素、维生素D属于脂类中的固醇;乳糖属于二糖。

19.A 解析:氨基酸在体内可以合成蛋白质。其分解过程先经过脱氨基作用得到含氮部分和不含氮部分后,含氮部分解毒形成尿素,不含氮部分可转化为脂类物质,也可分解为二氧化碳和水。

20.C 解析:治疗糖尿病时所用胰岛素本质为蛋白质,口服时会被消化酶分解而失去治疗作用,故不宜使用口服方式,而应采用注射的方法。

二、非选择题

21.⑴氨基羧基甲基

⑵三肽二肽151

⑶不正确。依据定义:肽键是氨基酸脱水缩合而成,判断时可根据该结构水解时是否形成氨基酸来确定,B、C、E是由氨基酸脱水缩合形成的,属于肽键,F结构不是氨基酸脱水缩合形成,因而不是肽键。

22.解析:⑴在蛋白质的形成过程中,形成的水分子数=形成的肽键数=氨基总数-肽键条数=51-2=49;每形成一个肽键,消耗一个游离氨基和一个游离羧基,即消耗49个氨基和49个羧基;每分子氨基酸在形成肽链前,至少含有一个氨基和一个羧基(R基上可能含有),因此,每条直链多肽至少含有一个游离氨基和一个游离羧基。

⑵不同氨基酸的不同之处在于R基的不同,但由于组成生物蛋白的氨基酸只有20种,因此,组成该蛋白质分子的R基最多只有20种。

⑶蛋白质的分子质量=形成前氨基酸的分子质量之和-形成蛋白质分子时脱掉的部分(包括脱掉的水分和其它——如形成—S—S—时脱掉的H)=100×51-(49×18+3×2×1)=4212;在不考虑基因中的非编码区和内含子的碱基数时,组成蛋白质的氨基酸数与mRNA上的密码子数、基因的碱基对数的比例关系为:1:3:3,由此可知,控制51个氨基酸的蛋白质分子的基因中含有的碱基对数至少为153对。

答案:⑴49 49 49 49 2 2

⑵20

⑶4212 153

23.解析:蛋清的主要成分是蛋白质,在碱性溶液中,蛋白质与Cu2+反应能产生紫色物质,

即蛋白质的双缩脲反应。如果通过实验证明酶能发生双缩脲反应,即可证明酶的化学本质是蛋白质。可以蛋清为实验对照。

答案:第二步:取两支试管编号,在1号试管中加入2 mL蛋清液,2号试管中加入2 mL 唾液。

第三步:向两支试管中各加入2~3滴5%的NaOH溶液,振荡。

第四步:向两支试管中各加入2~3滴5%的CuOH溶液,振荡。

实验结果:两支试管中都呈现红紫色。

结果分析:证明唾液中存在着与蛋清相同的成分,即蛋白质。

2007-09-18 人教网

蛋白质计算的公式汇总

蛋白质计算的公式汇总文件排版存档编号:[UYTR-OUPT28-KBNTL98-UYNN208]

有关蛋白质计算的公式汇总 ★★规律1:有关氨基数和羧基数的计算 ⑴蛋白质中氨基数=肽链数+R基上的氨基数=各氨基酸中氨基的总数-肽键数; ⑵蛋白质中羧基数=肽链数+R基上的羧基数=各氨基酸中羧基的总数-肽键数; ⑶在不考虑R基上的氨基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链 中,至少含有的氨基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至 少含有的氨基数等于肽链数; ⑷在不考虑R基上的羧基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链 中,至少含有的羧基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的羧基数等于肽链数。 ★★规律2:蛋白质中肽键数及相对分子质量的计算 ⑴蛋白质中的肽键数=脱去的水分子数=水解消耗水分子数=氨基酸分子个数-肽链数; ⑵蛋白质的相对分子质量=氨基酸总质量(氨基酸分子个数×氨基酸 平均相对分子质量)-失水量(18×脱去的水分子数)。 注意:有时还要考虑其他化学变化过程,如:二硫键(—S—S—)的形成等,在肽链上出现二硫键时,与二硫键结合的部位要脱去两 个H,谨防疏漏。 ★★规律3:有关蛋白质中各原子数的计算

⑴C原子数=(肽链数+肽键数)×2+R基上的C原子数; ⑵H原子数=(氨基酸分子个数+肽链数)×2+R基上的H原子数=各氨 基酸中H原子的总数-脱去的水分子数×2; ⑶O原子数=肽链数×2+肽键数+R基上的O原子数=各氨基酸中O原子 的总数-脱去的水分子数; ⑷N原子数=肽链数+肽键数+R基上的N原子数=各氨基酸中N原子的总数。 注意:一个氨基酸中的各原子的数目计算:① C原子数=R基团中的C原子数+2;②H 原子数=R基团中的H原子数+4;③ O原子数=R基团中的O原子数+2;④N原子数=R基团中的N原子数+1。 ★★规律4:有关多肽种类的计算: 假设有n(0<n≤20)种、m个氨基酸,任意排列构成多肽(这里m≤n): ⑴若每种氨基酸数目无限(允许重复)的情况下,可形成肽类化合物的种类:有n m种; ⑵若每种氨基酸只有一个(不允许重复)的情况下,可形成肽类化合 物的种类:有n×(n-1)×(n-2)…×(n-m+2)×(n-m+1)= 种。 ★★规律5:蛋白质中氨基酸数目与核酸中碱基数的计算: ⑴DNA基因的碱基数(至少):mRNA的碱基数(至少):氨基酸的数目=6:3:1; ⑵肽键数(得失水数)+肽链数=氨基酸数=(DNA)基因碱基数/6= mRNA碱基数/3。

高中生物必修一《生命活动的主要承担者——蛋白质》测试题[001]

高中生物必修一《生命活动的主要承担者——蛋白质》测试题 一、选择题(本题共16题,每题4分,共64分。每小题只有一个选项符合题意。) 1.观察下列生物体内组成蛋白质的两种氨基酸,可以确定共同的结构特点是() A.都只含有一个氨基(—NH2) B.都只含有一个羧基(—COOH) C.都只含有一个氢原子 D.都含有一个氨基和一个羧基,有一个氨基和一个羧基连接在同一个碳原子上 2.下图表示有关蛋白质分子的概念图,下列对图示分析不正确的是() A.一个分子量大于10000的多肽中A的种类可能有20种 B.蛋白质中的N元素主要存在B中 C.多肽中A的数目一般大于B的数目 D.蛋白质结构和功能的多样性取决于A的多样性 3.下列关于氨基酸和蛋白质的叙述,错误的是() A.酪氨酸几乎不溶于水,而精氨酸易溶于水,这种差异是由R基的不同引起的 B.甜味肽的分子式为C13H16O5N2,则甜味肽是一种二肽 C.某二肽的化学式是C8H14N2O5,水解后得到丙氨酸(R基为-CH3)和另一种氨基酸X,则X的化学式应该是C5H9NO4 D.n个氨基酸共有m个氨基,则这些氨基酸缩合成的一个多肽中氨基数为m-n 4.三鹿牌等不合格婴幼儿奶粉中掺入了一种“假蛋白”——三聚氰胺。右图为三聚氰胺分子的结构式。下列有关“假蛋白”的说法正确的是() A.三聚氰胺可与双缩脲试剂发生紫色反应 B.三聚氰胺中氮元素的含量比碳元素的含量还高 C.在奶粉中添加三聚氰胺后提高了蛋白质的含量 D.三聚氰胺分子中含有三个肽键 5.如下图表示一个由153个氨基酸构成的蛋白质分子。下列叙述正确的是()

A.该分子中含有152个肽键 B.该分子形成过程中,产生了153个水分子 C.该分子中有1个氨基酸侧链基团含硫 D.该分子彻底水解将产生153种氨基酸 6.催产素、牛加压素、血管舒缓素等多肽化合物的氨基酸数量相同,但其生理功能却不同,原因有() ①氨基酸种类不同②合成的场所不同③氨基酸的排列顺序不同④肽链的折叠盘曲方式不同 A.①②③B.①③④C.②③④D.①②③④7.关于生物体内氨基酸的叙述正确的是() A.氨基酸是蛋白质分子的单体,由氨基和羧基组成 B.组成蛋白质的氨基酸共有的结构是 C.每个氨基酸分子都只含有C、H、O、N四种元素 D.组成人体的氨基酸都能在人体内合成 8.胰岛素是胰岛素原通过蛋白酶的水解作用而生成的,那么胰岛素原水解所需的水中的氢用于() A.形成-COOH和-SH B.形成-COOH和连接碳的-H C.形成-SH和-OH D.形成-NH2和-COOH 9.丙氨酸的R基是-CH3,丙氨酸是由哪几种化学元素组成的?() A.C、H、O B.C、H、O、N C.N、P、K、H、C D.C、H、O、N、P 10.人体细胞中多种多样的蛋白质执行着各种特定的功能,抗体具有的主要功能是()A.进行物质运输B.发挥免疫作用C.催化生化反应D.构成细胞成分11.某条肽链由88个氨基酸缩合而成,其中共有氨基6个,甲硫氨酸5个,且在肽链中的位置为3、25、56、78、88,甲硫氨酸的分子式为C5H11O2NS,以下叙述正确的是()A.合成该多肽的氨基酸共有N原子数目94个 B.去掉甲硫氨酸得到的肽链中,肽键数目会减少10个 C.去掉甲硫氨酸得到6条肽链,氨基和羧基均分别增加5个 D.特殊水解酶水解掉甲硫氨酸后,所得产物中氧原子增加5个 12.人体的肌肉主要是由蛋白质构成的,但骨骼肌、心肌、平滑肌的功能各不相同,这是因为() A.肌细胞形状不同B.在人体的分布位置不同 C.支配其运动的神经不同D.构成肌细胞的蛋白质分子结构不同 13.一种酶切除一种三十九肽中的所有丙氨酸,得其余氨基酸组成的肽链如下图,那么原肽链中的丙氨酸个数和新生成肽链中所有的肽键数是()

蛋白质相关计算专题

“蛋白质相关计算”专题 二、求氨基酸的分子式 此类题型的关键就是按照氨基酸分子通式和所给 R 基写出氨基酸的分子式,涉及到多肽时则根据脱水缩合原理 反向推断。 例题2.谷胱甘肽(C 10H 17O 6N 3S )是存在于动植物和微生物细胞中的一种重要三肽, 它是由谷氨酸(C 5H 9O 4N )、甘氨酸 (C 2H 5O 2N ) 和半胱氨酸缩合而成的,则半胱氨酸可能的分子式为 ( ) A . GHNS B. GH 5NS C . C 3H 7QNS D. C 3H 3C 2NS 三、有关蛋白质中氨基酸数、肽链数、肽键数、脱水数的计算 1 .n 个氨基酸脱水缩合形成一条多肽链,则肽键数=脱水数=氨基酸数— 1 = ( n -1)个; 2.n 个氨基酸脱水缩合形成一个由m 条多肽链组成的蛋白质时,则脱去的水分子数和形成的肽键数为 (n-m )个; 3?无论蛋白质中有多少条肽链,始终有:脱水数=肽键数=氨基酸数-肽链数; 4?注:环状肽特点是肽键数与氨基酸数相同。即肽键的数目 =脱去的水分子的数目=氨基酸的数目。 例题3.某蛋白质分子共有四条肽链,300个肽键,则形成这个蛋白质分子所需氨基酸分子数以及它们在脱水缩合过程中生成 的水分子数分别是( ) A . 296 和 296 B . 304 和 304 C . 304 和 300 D . 300 和 300 例题4.某三十九肽中共有丙氨酸 4个,现去掉其中的丙氨酸得到 4条长短不等的多肽(如图),这些多肽中肽键总数为 () A . 31 B . 32 C . 34 D . 35 四、有关蛋白质中游离的氨基或羧基数目的计算 氨基酸间脱水缩合时,原来的氨基和羧基已不存在,形成的多肽的一端是 -NH 2,另一端是一COOH 所以对 于n 条肽链的多肽,每1条肽链至少应有1个-NH 2, 1个一COOH 若还有--NH 2或一COOH 则存在于R 基中。 1. 蛋白质中氨基数=肽链条数+R 基上的氨基数=各氨基酸中氨基的总数-肽键数; 2. 蛋白质中羧基数=肽链条数+R 基上的羧基数=各氨基酸中羧基的总数-肽键数; 3. 在不考虑R 基上的氨基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中, 至少含有的氨基数为1,蛋白质分 子由多条肽链构成,则至少含有的氨基数等于肽链数; 4. 在不考虑R 基上的羧基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中, 至少含有的羧基数为1,蛋白质分 子由多条肽链构成,则至少含有的羧基数等于肽链数。 例题5.氨基酸分子脱水缩合形成含 氨基酸数和肽键数分别是( 2条肽链的蛋白质分子时,相对分子量减少了 ) 900,由此可知, 此蛋白质分子中含有的 A . 52、52 B . 50、50 C . 52、50 D . 50、 49 、氨基酸、多肽、肽键、肽链和蛋白质的关系可归纳成下图: :T4 1.1 例题1.能正确表示蛋白质分子由简到繁的结构层次的一组是: ) 多肽 ⑤肽链 ⑥形成具有一定空间结构的蛋白质分子( A.①②③④⑤⑥ B .②①④③⑤⑥ C .②①④③⑥⑤ D .②①③④⑤⑥ ①氨基酸 ②CHON 等化学元素 ③氨基酸分子互相结合 ④

蛋白质数据库

生物芯片北京国家工程研究中心 湖南中药现代化药物筛选分中心 暨湖南涵春生物有限公司 常用数据库名录 1、蛋白质数据库 PPI - JCB 蛋白质与蛋白质相互作用网络 ?Swiss-Prot - 蛋白质序列注释数据库 ?Kabat - 免疫蛋白质序列数据库 ?PMD - 蛋白质突变数据库 ?InterPro - 蛋白质结构域和功能位点 ?PROSITE - 蛋白质位点和模型 ?BLOCKS - 生物序列分析数据库 ?Pfam - 蛋白质家族数据库 [镜像: St. Louis (USA), Sanger Institute, UK, Karolinska Institutet (Sweden)] ?PRINTS - 蛋白质 Motif 数据库 ?ProDom - 蛋白质结构域数据库 (自动产生) ?PROTOMAP - Swiss-Prot蛋白质自动分类系统 ?SBASE - SBASE 结构域预测数据库 ?SMART - 模式结构研究工具 ?STRING - 相互作用的蛋白质和基因的研究工具

?TIGRFAMs - TIGR 蛋白质家族数据库 ?BIND - 生物分子相互作用数据库 ?DIP - 蛋白质相互作用数据库 ?MINT - 分子相互作用数据库 ?HPRD - 人类蛋白质查询数据库 ?IntAct - EBI 蛋白质相互作用数据库 ?GRID - 相互作用综合数据库 ?PPI - JCB 蛋白质与蛋白质相互作用网络 2、蛋白质三级结构数据库 ?PDB - 蛋白质数据银行 ?BioMagResBank - 蛋白质、氨基酸和核苷酸的核磁共振数据库?SWISS-MODEL Repository - 自动产生蛋白质模型的数据库 ?ModBase - 蛋白质结构模型数据库 ?CATH - 蛋白质结构分类数据库 ?SCOP - 蛋白质结构分类 [镜像: USA | Israel | Singapore | Australia] ?Molecules To Go - PDB数据库查询 ?BMM Domain Server - 生物分子模型数据库 ?ReLiBase - 受体/配体复合物数据库 [镜像: USA] ?TOPS - 蛋白质拓扑图 ?CCDC - 剑桥晶体数据中心 (剑桥结构数据库 (CSD))

高中生物蛋白质相关计算专题

“蛋白质计算”专题讲练 在高中生物学中,涉及蛋白质各种因素之间的数量关系比较复杂,是学生学习中的重点和难点,也是高考的考点与热点。因此,在复习时牢牢掌握氨基酸分子的结构通式以及脱水缩合反应的过程,恰当的运用相关公式是解决问题的关键。现将与蛋白质相关的计算公式及典型例题归析如下,以便复习参考。 一、有关蛋白质计算的公式汇总 ★★规律1:有关氨基数和羧基数的计算 ⑴蛋白质中氨基数=肽链数+R基上的氨基数=各氨基酸中氨基的总数-肽键数; ⑵蛋白质中羧基数=肽链数+R基上的羧基数=各氨基酸中羧基的总数-肽键数; ⑶在不考虑R基上的氨基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中,至少含有的氨基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的氨基数等于肽链数; ⑷在不考虑R基上的羧基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中,至少含有的羧基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的羧基数等于肽链数。 ★★规律2:蛋白质中肽键数及相对分子质量的计算 ⑴蛋白质中的肽键数=脱去的水分子数=水解消耗水分子数=氨基酸分子个数-肽链数; ⑵蛋白质的相对分子质量=氨基酸总质量(氨基酸分子个数×氨基酸平均相对分子质量)-失水量(18×脱去的水分子数)。 注意:有时还要考虑其他化学变化过程,如:二硫键(—S—S—)的形成等,在肽链上出现二硫键时,与二硫键结合的部位要脱去两个H,谨防疏漏。 ★★规律3:有关蛋白质中各原子数的计算 ⑴C原子数=(肽链数+肽键数)×2+R基上的C原子数; ⑵H原子数=(氨基酸分子个数+肽链数)×2+R基上的H原子数=各氨基酸中H原子的总数-脱去的水分子数×2; ⑶O原子数=肽链数×2+肽键数+R基上的O原子数=各氨基酸中O原子的总数-脱去的水分子数; ⑷N原子数=肽链数+肽键数+R基上的N原子数=各氨基酸中N原子的总数。

相互作用蛋白质组学

1.研究相互作用蛋白质组学的意义? 答:①蛋白质很少单独发挥作用。在所有生物功能中,通常以蛋白质复合物的功能占主导地位。在所有的细胞中,蛋白质是最重要的组成部分,并且在大多数细胞功能中蛋白质之间的相互作用是最基本的。如基因转录、细胞周期控制、信号转导和调控等一些基本的过程都依赖于有着正常功能的蛋白质复合物。②对干扰蛋白质的合成或者扰乱蛋白复合物的组装经常会导致细胞功能失调,并且最终引发疾病。因此,在疾病的病理生理学研究方面对蛋白质之间相互作用的透彻研究已变得非常重要,由此也可以找到新的药物作用靶细胞。 由上述两点可知在全球范围内进行相互作用蛋白(即所谓的相互作用组)的研究,就对现代分子生物学显得尤为重要。 2.相互作用蛋白质组学的研究方法有哪些? 答:一般而言,相互作用蛋白质组学的研究方法包括遗传学方法和生物化学方法。 遗传学方法:①(PCA)蛋白质片段互补分析技术 ②(MYTH)膜酵母双杂交技术 ③(RET)共振能量传递技术 ④(LUMIER)发光标记哺乳动物相互作用组定位技术 ⑤(MAPPIT)哺乳动物蛋白质—蛋白质相互作用链和其变异技术 ⑥(Phage display)噬菌体展示技术 ⑦(Protein microarrays)蛋白质微阵列技术 生物化学方法:①免疫共沉淀法

②串联亲和纯化法 ③基于质谱分析的各种生化方法 3与传统蛋白质相互作用研究方法相比,相互作用蛋白质组学的优势在哪里? 答:①(MYTH)膜酵母双杂交技术 :不像传统的酵母双杂交系统,膜酵母双杂交系统不需要蛋白质的相互作用发生在细胞核内,因此某些细胞外蛋白和细胞膜受体蛋白等的研究就不受限制了。系统可以成功地应用于高通量和低通量形式,来确定完整膜和膜相关蛋白的相互作用,这些蛋白可来自不同种类的有机生物体中不同功能、结构和亚细胞定位。 ③(RET)共振能量传递技术:能够不改变相互蛋白质所依赖的生理环境,能够在生物体内便可对其进行实时生理监测。 ④(LUMIER)光标记哺乳动物相互作用组定位技术:LUMIER可以以自动化高通量的方式研究哺乳动物自然环境中的PPI,对今后哺乳动物的信号转导通路的研究是不可或缺的。 ⑤(MAPPIT)哺乳动物蛋白质—蛋白质相互作用链和其变异技术 :MAPPIT在发现新药物和药物作用靶位的分析的中有重要价值。 ⑥(Phage display)噬菌体展示技术:特别适用于快速筛查和优化分子间的相互作用,使其成为药物开发的重要工具。 ⑦(protein microarrays)蛋白质阵列:检测快速、简便易行、样本用量少、可进行高通量分析, 具有高度并行性、多样性、微型化和

蛋白质的各种计算方法

蛋白质相关计算的三种解题策略 与蛋白质相关的计算题,题型较多,难度较大。但总体上可分为三种类型,且每类题型都有相应的解 题目类型解题策略 有关蛋白质的相对分子质量、氨基 列方程求解 酸数、氨基数、羧基数、肽链数、肽键 数、脱水数的计算 蛋白质(或多肽)中原子数计算用原子守恒解答 多肽种类计算用数学中“排列组合”解答 1.蛋白质中氨基酸、氨基、羧基、肽链、肽键、脱水数及蛋白质的相对分子质量的计算[方法依据] 可将肽链看作“C”与“—CO—NH—”交替连接构成的基本骨架,在“C”上连接着R基和H,在肽链的两端分别是游离的“—NH2”和“—COOH”,如下图所示: [妙法指津] 结合上面的示意图,可以得出如下规律: (1)缩合时脱去的水分子数=肽键数=氨基酸数-肽链数。 (2)蛋白质中氨(羧)基数=肽链数+R基上的氨(羧)基数=各氨基酸中氨(羧)基的总数-肽键数。 注意如果不考虑R基上的氨(羧)基数,一条多肽链中,至少含有一个游离氨(羧)基;若蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的氨(羧)基数等于肽链数。 (3)蛋白质的相对分子质量=氨基酸总相对分子质量(氨基酸个数×氨基酸平均相对分子质量)-失水量 (18×脱去的水分子数)。 注意有时还要考虑其他化学变化过程,如肽链上出现二硫键(—S—S—)时,要再减去2(即两个H)。 (4)若为环状多肽,则可将公式中的肽链数视为零,再进行相关计算。 [典例剖析] 已知氨基酸的平均相对分子质量为128,测得某蛋白质的相对分子质量为5 646,则组成该蛋白质的氨基酸数、肽链数以及至少游离的氨基数分别为 ( ) A.51、1、51 B.51、2、2 C.51、2、51 D.44、2、2 解析解题时可采用“列方程求解”的方法。设氨基酸数为n,肽链数为x,则n×128=5 646+(n-x)×18,化简得110n+18x=5 646。当x=1时,n≈51.16;当x=2时,n=51。因此只有 B、C项的数值符合氨基酸数和肽链数。又知两条肽链上至少游离着2个氨基,故B项正确。 答案 B 2.多肽中各原子数的计算 [方法依据] 氨基酸的结构通式是解答此类题目的突破口。在一个氨基酸中,若不考虑R基,至少含有2个碳原子、2个氧原子、4个氢原子和1个氮原子。而脱水缩合形成多肽时,要失去部分水分子,但是碳原子、氮原子的数目不会减少。 [妙法指津] (1)碳原子数=氨基酸的分子数×2+R基上的碳原子数。 (2)氢原子数=各氨基酸中氢原子的总数-脱去的水分子数×2。 (3)氧原子数=各氨基酸中氧原子的总数-脱去的水分子数。 (4)氮原子数=肽链数+肽键数+R基上的氮原子数=各氨基酸中氮原子的总数。 (5)由于R基上的碳原子数不好确定,且氢原子数较多,因此以氮原子数或氧原子数的计 算为突破口,计算氨基酸的分子式或氨基酸个数最为简便。

重点高中生物必修一蛋白质的计算题归析

重点高中生物必修一蛋白质的计算题归析

————————————————————————————————作者:————————————————————————————————日期:

高中生物必修一蛋白质的计算题归析(灵璧中学) 1.有关蛋白质相对分子质量的计算 例1组成生物体某蛋白质的20种氨基酸的平均相对分子质量为128,一条含有100个肽键的多肽链的分子量为多少? 解析:在解答这类问题时,必须明确的基本关系式是: 蛋白质的相对分子质量=氨基酸数×氨基酸的平均相对分子质量?脱水数×18(水的相对分子质量) 本题中含有100个肽键的多肽链中氨基酸数为:100+1=101,肽键数为100,脱水数也为100,则依上述关系式,蛋白质分子量=101×128?100×18=11128。 变式1:组成生物体某蛋白质的20种氨基酸的平均相对分子质量为128,则由100个氨基酸构成的含2条多肽链的蛋白质,其分子量为() A.12800 B.11018 C.11036 D.8800 解析:对照关系式,要求蛋白质分子量,还应知道脱水数。由于题中蛋白质包含2条多肽链,所以,脱水数=100?2=98,所以,蛋白质的分子量=128×100?18×98=11036,答案为C。 变式2:全世界每年有成千上万人由于吃毒蘑菇而身亡,其中鹅膏草碱就是一种毒菇的毒素,它是一种环状八肽。若20种氨基酸的平均分子量为128,则鹅膏草碱的分子量约为( ) A.1024 B. 898 C.880 D. 862 解析:所谓环肽即指由首尾相接的氨基酸组成的环状的多肽,其特点是肽键数与氨基酸数相同。所以,鹅膏草碱的分子量=8 ×128?8 ×18=880,答案为C。 2.有关蛋白质中氨基酸数、肽链数、肽键数、脱水数的计算 在解答这类问题时,必须明确的基本知识是蛋白质中氨基酸数、肽链数、肽键数、脱水数的数量关系。基本关系式有: n个氨基酸脱水缩合形成一条多肽链,则肽键数=(n?1)个; n个氨基酸脱水缩合形成m条多肽链,则肽键数=(n?m)个; 无论蛋白质中有多少条肽链,始终有:

生物信息研究中常用蛋白质数据库的总结

生物信息研究中常用蛋白质数据库简述 内蒙古工业大学理学院呼和浩特孙利霞 2010.1.5 摘要:在后基因组时代生物信息学的研究当中,离不开各种生物信息学数据库。尤其在蛋白质从序列到功能的研究当中,目前各种行之有效的方法都是基于各种层次和结构的蛋白质数据库。随着计算机技术及网络技术的发展,目前的蛋白质数据库不论是所包含数据量还是功能都日新月异,新的数据库层出不穷。一个新手面对如此浩瀚的数据量往往无从下手。本文粗浅地为目前蛋白质数据库的使用勾画出一个轮廓,作为自己蛋白质研究入门的一个引导。 关键词:蛋白质;数据库 0 引言 随着科技的发展,个人的知识往往赶不上快速膨胀的信息量,人们为了解决这个问题,便创建了形形色色的数据库。蛋白质数据库是指:在蛋白质研究领域根据实际需要,对蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释,构建出具有特殊生物学意义和专门用途的数据库。蛋白质数据库总体上可分为两大类:蛋白质序列数据库和蛋白质结构数据库,蛋白质序列数据库来自序列测定,结构数据库来自X-衍射和核磁共振结构测定(详见图1)。这些数据库是分子生物信息学的基本数据资源。上世纪90年代,我国从事蛋白质研究的学者使用的蛋白质数据库储存介质还是国外实验室发布的激光光盘[1]。信息的传播储存甚为不便。随着蛋白质研究的发展飞快,同时伴随着计算机和因特网发展,蛋白质数据库的储存传播方式也发生的巨大的变化。进入21世纪后,我们所用的各种蛋白质数据库都发展成为存储在网络服务器上,基于“服务器—客户机”的访问查询方式。伴随着计算机及物理测试技术的发展数据库的容量和功能成数量级膨胀。但是面对如此浩瀚的数据,新手往往感到无从下手,在需要时找不到自己需要的合适数据库。 本文从目前蛋白质数据库建立的的逻辑层次出发,系统地简绍了常用蛋白质数据的概况,它们的查询方法以及它们相互之间的联系。同时尽量不涉及数据库建设和维护方面的计算机和网络这些数据库底层的技术,为蛋白质研究的入门者及对蛋白质感兴趣的人员的一个引导。

蛋白质计算练习题

有关蛋白质的计算 一、有关蛋白质相对分子质量的计算 例1组成生物体某蛋白质的20种氨基酸的平均相对分子质量为128,一条含有100个肽键的多肽链的分子量为多少? 蛋白质分子量=101×128?100×18=11128。 ?在解答这类问题时,必须明确的基本关系式是: ?蛋白质的相对分子质量=氨基酸数×氨基酸的平均相对分子质量?脱水数×18(水的分子质量) 变式1:组成生物体某蛋白质的20种氨基酸的平均相对分子质量为128,则由100个氨基酸构成的含2条多肽链的蛋白质,其分子量为() A. 12800 B. 11018 C. 11036 D. 8800 变式2:全世界每年有成千上万人由于吃毒蘑菇而身亡,其中鹅膏草碱就是一种毒菇的毒素,它是一种环状八肽。若20种氨基酸的平均分子量为128,则鹅膏草碱的分子量约为( ) A. 1024 B. 898 C. 880 D. 862 二、有关蛋白质中氨基酸数、肽链数、肽键数、脱水数的计算 例2氨基酸分子缩合形成含2条肽链的蛋白质分子时,相对分子量减少了900,由此可知,此蛋白质分子中含有的氨基酸数和肽键数分别是() A.52、52 B. 50、50 C.52、50 D. 50、49 ?在解答这类问题时,必须明确的基本知识是蛋白质中氨基酸数、肽链数、肽键数、脱水数的数量关系。基本关系式有: ?n个氨基酸脱水缩合形成一条多肽链,则肽键数=(n?1)个; ?n个氨基酸脱水缩合形成m条多肽链,则肽键数=(n?m)个; ?无论蛋白质中有多少条肽链,始终有:脱水数=肽键数=氨基酸数?肽链数 变式1:若某蛋白质的分子量为11935,在合成这个蛋白质分子的过程中脱水量为1908,假设氨基酸的平均分子量为127,则组成该蛋白质分子的肽链有() A. 1条 B. 2条 C. 3条 D. 4条 变式2:现有一分子式为C63H103O45N17S2的多肽化合物,已知形成该化合物的氨基酸中有一个含2个氨基,另一个含3个氨基,则该多肽化合物水解时最多消耗多少个水分子?变式3:已知氨基酸的平均分子量为128,测得某蛋白质的分子量为5646,试判断该蛋白质的氨基酸数和肽链数依次是 ( ) A. 51和1 B. 51和2 C. 44和1 D. 44和2 三、有关蛋白质中至少含有氨基数和羧基数的计算:N条肽链则至少含有n个氨基和羧基例3某蛋白质分子含有4条肽链,共有96个肽键,则此蛋白质分子中至少含有-COOH 和-NH2的数目分别为 ( ) A. 4、 100 B. 4、 4 C. 100、100 D. 96、96 变式:一个蛋白质分子由四条肽链组成,364个氨基酸形成,则这个蛋白质分子含有的-COOH和-NH2数目分别为 ( ) A . 366、366 B. 362、362 C . 4、 4 D. 无法判断 四、有关蛋白质中氨基酸的种类和数量的计算 例4今有一化合物,其分子式为C55H70O19N10,已知将它完全水解后只得到四种氨基酸: ⑴该多肽是多少肽?⑵该多肽进行水解后,需个水分子,得到个甘氨酸分

蛋白质相关计算试题带解析完整版

蛋白质相关计算试题带 解析 HUA system office room 【HUA16H-TTMS2A-HUAS8Q8-HUAH1688】

蛋白质相关计算试题(带答案解析)1.如图是某蛋白质分子的结构示意图,图中“▲—★—■—●”表示不同种类的氨基酸,图中A链由21个氨基酸组成,B链由19个氨基酸组成,图中“—S—S—”是在蛋白质加工过程中由两个“—SH”脱下2个H形成的。下列有关叙述中,错误的是()A.该蛋白质多样性的主要原因是氨基酸的排列顺序 B.该蛋白质分子中至少含有两个羧基 C.图中“—”代表的化学键是在高尔基体中形成的 D.形成该蛋白质分子时相对分子质量减少了686 2.一切生命活动都离不开蛋白质。下列有关蛋白质的结构和功能的叙述中,不正确的是() A.玉米的蛋白质中缺少赖氨酸 B.盐析作用不会改变蛋白质的结构 C.由574个氨基酸所组成的蛋白质在形成过程中脱去了573个水分子 和一个—COOH D.每种氨基酸分子至少都含有一个—NH 2

3. 某环状多肽由39个氨基酸形成,其中含有4个谷氨酸(R 基为一CH 2一CH 2一 COOH ),则该多肽() A .有38个肽键 B .可能没有游离氨基 C .至少有5个游离羧基 D .最多有36种氨基酸 4. 亮氨酸的R 基为-C 4H 9,缬氨酸的R 基为-C 3H 7,它们缩合形成的二肽分子中,C 、H 的原子比例为() A .11:24 B .9:18 C .11:22 D .10:22 5. 已知苯丙氨酸的分子式是C 9H 11NO 2,那么该氨基酸的R 基是() A .—C 7H 7O B .— C 7H 7C .—C 7H 7N D .—C 7H 5NO 6. 某蛋白质由3条多肽链、N 个氨基酸组成,下列关于该蛋白质说法正确的是() A.形成该蛋白质时产生了N 个水分子 B.该蛋白质中至少含有N 个肽键 C.该蛋白质中至少含有3个游离的羧基 D.合成该蛋白质至少需要20种氨基酸 7. 下列有关生物学的计算,不正确的是( 8. ) 9. A .由100个氨基酸合成二条肽链,脱去98个水分子

蛋白质专题汇总

第二章细胞中的蛋白质专题 一、选择题 1.下面是三种组成蛋白质的氨基酸的结构式,据图分析下列叙述不正确的是() A.以上这三种氨基酸的R基依次是—H、—CH3、—CH2OH B.将这三种氨基酸(足量)置于适宜条件下,经脱水缩合可形成三肽化合物最多有27种 C.甲是最简单的氨基酸 D.从上式可看出,只要含有一个氨基和一个羧基的化合物就是组成蛋白质的氨基酸 2 关于生物体内氨基酸的叙述正确的是() A.氨基酸是蛋白质分子的单体,由氨基和羧基组成 B.组成蛋白质的氨基酸共有的结构是 C.每个氨基酸分子都只含有C、H、O、N四种元素 D.组成人体的氨基酸都能在人体内合成 3.水稻细胞内合成的某物质,能够在常温下高效分解淀粉,该物质() A.在4℃条件下易变性B.只含有C、H C.也能催化淀粉合成D.含有羧基 4.某些婴幼儿奶粉及液态奶中被检测出三聚氰胺,这是一些不法商家为了提高奶粉及液态奶中的含氮量而 添加的。一般来说,每100克蛋白质平均含氮量为16克,这些氮主要存在于蛋白质的() A.—CO—NH—B.游离的氨基C.游离的羧基D.R基 5.下列关于氨基酸和蛋白质的叙述,错误的是() A.甲硫氨酸的R基是—CH2—CH2—S—CH3,则它的分子式是C5H11O2NS B.酪氨酸几乎不溶于水,而精氨酸易溶于水,这种差异是由R基的不同引起的 C.n个氨基酸共有m个氨基,则这些氨基酸缩合成的一个多肽中的氨基数必为m-n D.甜味肽的分子式为C13H16O5N2,则甜味肽一定是一种二肽 6.蛋白质是细胞中重要的有机化合物。以下关于蛋白质的说法正确的是() A.酶都是蛋白质B.抗体都是蛋白质C.动物激素都是蛋白质 D.神经递质都是蛋白质7.下列关于生物体内蛋白质的叙述中,正确的是() A.蛋白质具有多样性,是由于氨基酸种类、数目、排列顺序和蛋白质的空间结构不同 B.指导蛋白质合成的基因中的碱基有C、G、A、T、U

蛋白质组学及其主要技术

蛋白质组学及其主要技术 朱红1 周海涛2 (综述) 何春涤1, (审校) (1.中国医科大学附属第一医院皮肤科,辽宁沈阳110001; 2.北京大学深圳医院核医学 科,广东深圳518036) 【摘要】蛋白质组是指一种细胞、组织或有机体所表达的全部蛋白质。蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象的新兴学科,近年来发展迅速,已成为后基因组时代的研究热点。目前,蛋白质组学研究技术主要包括:样品的制备和蛋白质的分离、蛋白质检测与图像分析、蛋白质鉴定及信息查询。本文就蛋白质组学概念及主要技术进行综述。 【关键词】蛋白质组,蛋白质组学 1蛋白质组学的概念 随着人类基因组测序计划的完成,人们对生命科学的研究重点由结构基因组转向功能基因组,1994年Wilkins和Williams首先提出蛋白质组一词[1],蛋白质组是指一种细胞、组织或有机体所表达的全部蛋白质。从基因到蛋白质存在转录水平、翻译水平及翻译后水平的调控,组织中mRNA丰度与蛋白质丰度不完全符合[2]。蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质-蛋白质相互作用等也无法从DNA/mRNA水平来判断。因此,只有将功能基因组学与蛋白质组学相结合,才能精确阐明生命的生理及病理机制。 蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象,对组织、细胞的整体蛋白进行检测,包括蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质的相互作用,在蛋白质水平上了解细胞各项功能、各种生理、生化过程及疾病的病理过程等[3,4]。蛋白质组学有两种研究策略。一种是高通量研究技术,把生物体内所有的蛋白质作为对象进行研究,并建立蛋白质数据库,从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,更符合蛋白质组学的本质。但是,由于剪切变异和翻译后修饰,蛋白质数量极其庞大,且表达随空间和时间不断变化,所以分析生物体内所有的蛋白质是一个耗时费力,难以实现的理想目标。另一种策略是研究不同状态或不同时期细胞或组织蛋白质组成的变化,主要目标是研究有差异蛋白质及其功能,如正常组织与肿瘤组织间的差异蛋白质,寻找肿瘤等疾病标记物并为其诊断治疗提供依据。 2蛋白质组学的常用技术 2.1样品的制备和蛋白质的分离技术 2.1.1样品的制备样品制备包括细胞裂解与蛋白质溶解,以及去除核酸等非蛋白质成分。 激光捕获显微切割(Laser-captured microdissection, LCM)[5]技术可大量获得足够用于蛋白质组学研究的单一细胞成分,避免其他蛋白成分对电泳结果的干扰。尤其是肿瘤的蛋白质组学研究常用LCM技术来获取单一的肿瘤细胞。 2.1.2蛋白质的分离技术 ①双向凝胶电泳(Two-dimensional electrophoresis, 2-DE):双向电泳方法于 l975年由O'Farrell[6]首先提出,根据蛋白质等电点和分子量的差异,连续进行成垂直方向的两次电泳将其分离。 第一向为等电聚焦(Isoelectric focusing,IEF)电泳,其基本原理是利用蛋白质分子的等电点不同进行蛋白质的分离。较早出现的IEF是载体两性电解质pH梯度,即在电场中通过两性缓冲离子建立pH梯度;20世纪80年代初建立起来的固相pH梯度(Immobilized pH gradients,IPG)IEF,是利用一系列具有弱酸或弱碱性质的丙烯酰胺衍生物形成pH梯度并参与丙烯酰胺的共价聚合,形成固定的、不随环境电场条件变化的pH梯度。IPG胶实验的重复

生物必修一蛋白质计算公式总结生物必修一蛋白质女王

生物必修一蛋白质计算公式总结生物必修一蛋 白质女王 纵观近几年高考试题,与生物必修一蛋白质计算有关的内容进行了不同程度的考查,下面是WTT给大家带来的生物必修一蛋白质计算公式总结,希望对你有帮助。 生物必修一蛋白质计算公式 [注:肽链数(m);氨基酸总数(n);氨基酸平均分子量(a);氨基酸平均分子量(b);核苷酸总数(c);核苷酸平均分子量(d)]。 1.蛋白质(和多肽):氨基酸经脱水缩合形成多肽,各种元素的质量守恒,其中H、O参与脱水。每个氨基酸至少1个氨基和1个羧基,多余的氨基和羧基来自R基。①氨基酸各原子数计算:C 原子数=R基上C原子数+2;H原子数=R基上H原子数+4;O原子数=R基上O原子数+2;N原子数=R基上N原子数+1。②每条肽链游离氨基和羧基至少:各1个;m条肽链蛋白质游离氨基和羧基至少:各m个;③肽键数=脱水数(得失水数)=氨基酸数-肽链数=n m ;④蛋白质由m条多肽链组成:N原子总数=肽键总数+m个氨基数(端)+R基上氨基数; =肽键总数+氨基总数 ≥ 肽键总数+m个氨基数(端); O原子总数=肽键总数+2(m个羧基数(端)+R基上羧基数); =肽键总数+2-羧基总数 ≥ 肽键总数+2m个羧基数(端);

⑤蛋白质分子量=氨基酸总分子量脱水总分子量( 脱氢总原子量)=na 18(n m); 2.蛋白质中氨基酸数目与双链DNA(基因)、mRNA碱基数的计算: ①DNA基因的碱基数(至少):mRNA的碱基数(至少):蛋白质中氨基酸的数目=6:3:1; ②肽键数(得失水数)+肽链数=氨基酸数=mRNA碱基数/3=(DNA)基因碱基数/6; ③DNA脱水数=核苷酸总数 DNA双链数=c 2; mRNA脱水数=核苷酸总数 mRNA单链数=c 1; ④DNA分子量=核苷酸总分子量 DNA脱水总分子量=(6n)d 18(c 2)。 mRNA分子量=核苷酸总分子量 mRNA脱水总分子量=(3n)d 18(c 1)。 ⑤真核细胞基因:外显子碱基对占整个基因中比例=编码的氨基酸数-3÷该基因总碱基数-100%;编码的氨基酸数-6≤真核细胞基因中外显子碱基数≤(编码的氨基酸数+1)-6。

最新人教版高中生物必修一蛋白质练习

精品文档 精品文档 1.某蛋白质分子由M 个氨基酸、4条肽链组成,则该蛋白质分子( ) A .共有M 个肽键 B .至少含有20种氨基酸 C .至少含有4个羧基 D .水解时需要M+4个水分子 2.组成蛋白质的氨基酸之间的肽键结构式是( ) A.NH -CO B. NH2-COOH C.-NH 2-COOH - D.-NH -CO - 3.生物体内的蛋白质千差万别,其原因不可能是( ) A .蛋白质的空间结构不同 B .组成蛋白质的氨基酸种类和数量不同 C .氨基酸排列顺序不同 D .组成肽键的化学元素不同 4. 某同学在显微镜下观察落花生子叶的切片,当转动细准焦螺旋时,有一部分细胞看得清楚,另一部分细胞较模糊,这是由于( ) A .反光镜未调好 B .显微镜物镜被破坏 C .细准焦螺旋未调好 D .标本切得厚薄不均 5.免疫球蛋白IgG 的结构示意图如右,其中-S-S-表示连接两条相 邻肽链的二硫键。若该IgG 由m 个氨基酸构成,则该IgG 有肽键数 ( ) A .m 个 B .(m-4)个 C .(m-2)个 D .(m+1)个 6.两个氨基酸分子缩合形成二肽,并生成一分子水,这一分子水中的氢来自于( ) A .羧基和氨基 B .氨基 C .羧基 D .连接在碳原子上的氢 7.用光学显微镜观察同一材料的同一部分时,高倍镜视野与低倍镜视野相比,前者( ) A .亮,看到的细胞数目多 B .暗,看到的细胞数目多 C .亮,看到的细胞数目少 D .暗,看到的细胞数目少 8.人体的肌肉主要由蛋白质构成,但平滑肌和骨骼肌的功能不同,其根本原因是( ) A .属于不同系统 B .在人体内的分布位置不同 C .肌肉细胞的形状不同 D .所含蛋白质分子结构不同 9.使用高倍镜观察装片的步骤是( ) (1)转动转换器把低倍物镜移走,换上高倍镜 (2)在低倍镜下找到目标 (3)将目标移到视野中央 (4)调节细准焦螺旋和反光镜,直到视野适宜,物象清晰为止 A.(2)(3)(4)(1) B. (2)(4)(1)(3) C.(2)(3)(1)(4) D.(3)(4)(2)(1) 10.用普通光学显微镜观察组织时,下列说法正确的是( ) A .用10倍物镜观察组织时镜头与玻片的距离比用40倍物镜观察时近 B .若将玻片标本向右移动,一污点不动,则污点在反光镜上 C .若载玻片上有d 字母,则视野中呈现p 字母 D .换上高倍物镜后一定要用凹面镜和放大光圈 11.某22肽被水解成1个4肽,2个3肽,2个6 肽,则这些短肽的氨基总数的最小值及肽键

蛋白常用数据库

搞蛋白质的童鞋们,甭要只查NCBI了~蛋白质相关数据库启蒙~ ★ 小木虫(金币+1):奖励一下,谢谢提供资源 qinhy:恭喜,您的帖子被版主审核为资源贴了,别人回复您的帖子对资源进行评价后,您就可以获得金币了理由:资源贴2011-11-26 16:56 本来是带图的,可是弄过来就变成米图了,附件里面一个是PDF版、一个是WORD版均是带图的,童鞋们看带图的可能比较方便点哦~ 基于蛋白质序列的蛋白质相互作用位点预测(闲谈版) 这个不是论文不是论文啊~~这个是应某某的要求帮他找的,所以都是用现成的免费的网站数据库做的预测分析。无论文为依托,无原理为根据,纯粹就是流连各大网站作个的闲谈。 1、用这些网站先查查你要研究的蛋白质的底细。 这些网站的数据库大多数是实验或者一些相关文献报道的数据的组成。 ★String http://string.embl.de/ 输入你要搜寻的蛋白,它就把这个蛋白相关的数据反映给你,分confidence、evidence的数据可信度参考,同时还具有actions选项,反应它们之间可能是激活/抑制的关系。按按+、-号可以扩大缩小关联蛋白的数量范围。 往下拉一点点就是数据,哈哈,我们都要看数据吃饭啊~~ 分析的数据源自Neighborhood、Fusion、Occurrence、Coexpression、Experiments Database、Textminin及Homology,表示点得证明有数据,根据各项数据给出综合评分。评分越高相互存在关系可能性越高。点击下方各项图标等详细看到各项数据内容。 设条件确定筛选范围。 ★DIP https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/dip/Main.cgi 跟上面的大同小异的功能,装上它附带的软件可能操作性会好一点,不过我米有试过哦。倒是跟它有链接的几个数据库都很强大,大家可以点击看看。 ★BIND http://www.bind.ca 文献有介绍的网站,不过我不能理解为什么我注册就注不了……. 2、继续查,用这些网站将要研究的蛋白质的家庭背景,月收入也大起底。 这里的网站可能跟相互作用方面的关系不大,但是如果知道这些,可以对研究的蛋白有更深的了解。 ★PDB https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/pdb/home/home.do 要查3D结构就往这里查~通常说的PDB号为文献号末4位。 ★PIR https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/pirwww/index.shtml 在蛋白质方面如NCBI般强大的网站,去上面晃荡下吧,会有收获滴。 ★KEGG http://www.genome.jp/kegg/ 粉强大的一个网站,我只说说它的KEGG PA THW AY子项,能迅速掌握一个蛋白质的功能通路,对于小白的偶们来说,很有用,有木有。 3、正题正题,做完上面那些后,接着就是纯预测的成分。也因为如此,要找着这些网站是很悲催的一件事。就算你找着了,你不懂语言,不懂算法,到底结果的可靠性怎样,见人见智。 需要PDB号作分析: promate http://bioinfo.weizmann.ac.il/promate/

蛋白质相互作用数据库和分析方法

蛋白质相互作用数据库和分析方法 1. 蛋白质相互作用的数据库 蛋白质相互作用数据库见下表所示: 数据库名 说明 网址 BIND 生物分子相互作用数据库 http://bind.ca/ DIP 蛋白质相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/ IntAct 蛋白质相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/intact/index.html InterDom 结构域相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,.sg/ MINT 生物分子相互作用数据库 http://mint.bio.uniroma2.it/mint/ STRING 蛋白质相互作用网络数据库 http://string.embl.de/ HPRD 人类蛋白质参考数据库 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/ HPID 人类蛋白质相互作用数据库 http://wilab.inha.ac.kr/hpid/ MPPI 脯乳动物相互作用数据库 http://fantom21.gsc.riken.go.jp/PPI/ biogrid 蛋白和遗传相互作用数据,主要来自于酵母、线虫、果蝇和人 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/ PDZbase 包含PDZ 结构域的蛋白质相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/services/pdz/start Reactome 生物学通路的辅助知识库 https://www.360docs.net/doc/0414818761.html,/ 2. 蛋白质相互作用的预测方法 蛋白质相互作用的预测方法很非常多,以下作了简单的介绍 1) 系统发生谱 这个方法基于如下假定:功能相关的(functionally related)基因,在一组完全测序的基因组中预期同时存在或不存在,这种存在或不存在的模式(pattern)被称作系统发育谱;如果两个基因,它们的序列没有同源性,但它们的系统发育谱一致或相似.可以推断它们在功能上是相关的。

相关文档
最新文档