[文献检索] 怎样在pubmed里查找资料

[文献检索] 怎样在pubmed里查找资料
[文献检索] 怎样在pubmed里查找资料

有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。

我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。

尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:

https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/ 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢?

PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。

进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

这是PubMed的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。

在主界面的左侧框(如左图),有:

· Journal Browser 期刊浏览

· MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表

· Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

· Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。· Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

· Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式)

3) Related Resources

· Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。

· Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

· Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。

· Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。

利用左侧框的这些服务,我们不仅能够进行功能更加强大的检索,而且还能得到不少非常有用的服务。这些都将在后续章节中介绍。

总体而言,PubMed的界面相当简洁清晰,几乎是傻瓜式的。

然而傻瓜式的界面并不意味着傻瓜式的操作。我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下"Go"按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁

芜杂的"无用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。

令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究一下PubMed。"君欲善其事,必先利其器",PubMed就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。

1.当你打开浏览器,在地址栏内键入https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/PubMed/ 或是https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/后,就进入了PUBMED检索系统主页,可以见到如下的页面。

2.在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。

在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。

说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符然后回车一敲便可万事大吉,其实不然。每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供读者参考:

? 明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字;

? 考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;

? 通过限定DATES, STUDY GROUP等,精炼你的检索范围;

? 多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。

3.通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率

最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。

? AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他

们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。

? 而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。

? NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时,除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。

4.PUBMED检索类型

通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:

? 词语(主题)检索这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可)。然后回车或点击"Go",PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Go",PubMed开始检索并将检索结果显示出来。? 著者检索当我们所要查询的是著作者时,在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:"著者姓空格名字首字母缩写",例如smith ja,然后回车或点击Go,系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。

? 刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。

? 日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击Go,系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08

也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。

? 检索期刊子集(辑)检索的格式为:检索词AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing。分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。? 检索带文摘的记录检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE记录中没有文摘。

? 布尔逻辑检索PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR或NOT)。具体使用时要注意的问题,详见上第3点所述。

5.如何处理检索结果

当你点击GO或回车后,PubMed将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目,并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索要求的项目是以SUMMARY(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息。

在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式,点击DISPLAY键后,系统按所选格式全部检索结果。

如果只需要显示其中一部分记录,则需点击该记录左边的查询框,使标记后,再点击Display键;如果只需显示一条记录,则可直接点击该记录中的作者姓名超链接,系统会自动显示该记录的文摘格式。

还有一点,系统所设定的默认值为每页显示20条选项,这点可以在SHOW后的下拉菜单处选择。

如果选中所感兴趣的内容,即可进行保存,打印等等操作。PubMed系统允许最多可保存5000条记录。要保存全部检索结果时,打开Summary下拉菜单选择其中一种格式,然后点击Save键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击Save键。

使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式,请先点击Text键,然后再打印。

不过在我们所要检索的问题相对较为复杂的时候,仅仅靠初级检索就远远达不到需求了。为了使得我们的检索更为准确,高效,我们可以充分利用PubMed所提供的高级检索功能。

在你进入PubMed首页之后,在检索框的下方,有PubMed所提供的五个重要的功能按钮,即Limits按钮, Preview/Index按钮, History按钮, Clipboard按钮,及Details按钮。如果你能够充分的利用好这几个功能按钮,那你的检索则很有可能

事半功倍。

首先,让我们来简单的了解一下这几个按钮的主要功能。

1. Limits 按钮

当你单击Limits按钮后,你可以看到如下界面。(fig1)

在这里可以进行以下设定:

? 将搜索范围设定在一个特定的域。

? 将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。

? 也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型(如综述)。? 设定只搜索包含摘要的文献。

? 设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。

? 设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库(如Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目)。

例如在All Fields域选择下拉菜单里,你可以把搜索词限定在一个特定的域,缺省设置是所有的域;打开下拉菜单就可以选择所需的域名了。又如"Only items with abstracts"指只检索那些有文摘的记录(1975年前出版的文章的记录中没有文摘)

2.Preview/Index 按钮

在按下Preview/Index按钮之后,我们可以进行的设定有:

? 在显示条目之前显示所查到的文献数。

? 随时通过增加查询单词来修改查询方案。

? 在特定的搜索域中向方案里加入查询词。

? 从Index中查看并选择词语来修改查询方案。

? 在你修改查询时查看方案。

Preview(预览) 使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。使用时,在输入框中键入搜索词,然后单击Preview,PubMed返回的信息是条目的数量。Index(索引)使用此功能,可以从特定域中选择以索引的单词,并把他们加入查询方案之中;可以查看某一个特定搜索域中词语列表;也可以使用布尔运算符来

建立一个查询方案。

3.History 按钮

History (历史记录)历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果,只有当你运行了一次查询之后,History中才有内容。History屏幕将会显示:你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。Preview显示的是历史记录中最近的三条记录,而使用History可以看到最近100次的查询结果。一旦查询数量超过100,PubMed会将最早的查询除去,加进最新的一次查询。如果两次查询内容相同,PubMed会将头一次的去除。

4.Clipboard 按钮

剪贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目,然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。将条目左边的复选框选中,单击"Add to clipboard"就可以将其加入剪切板中。当点击Clear History可以将History中的所有内容清除。

剪切板中最大的储存数是500条。而放在剪切板中的内容如果在一小时内没有任何操作,将会自动消失。

5.Details 按钮

Details是用于帮助你查看PubMed的检索策略。即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了那些词,并使用了什么样的检索规则和检索语法。此外,使用Details键可以对检索策略进行编辑,然后再一次检索。在PubMed Query框内显示的是PubMed实际使用的检索策略和语法。该框下有四个区域:Result区显示检索结果的记录总数,点击这个数字,可回到检索结果显示屏;Translation 区显示检索词转换的详细情况;Database区显示检索的数据库;User Query 区显示用户键入的检索词或检索式。

要对检索策略进行编辑可直接点击PubMed Query框中的检索策略,将其增加、删除或修改后点击Search键。

除了以上五个主要功能键以外,利用PubMed提供的其他一些功能,如MeSH 等,也可以在很大一部分程度上提高我们的检索效率。

如何获取全文

当很多人开始了解PubMed,并且逐渐得心应手的时候,都会面临一个棘手的问题,即如何获取全文?的确,PubMed真正向公众(public)免费开放的只是摘要部分,而绝大部分文章都没有全文提供。当然,最省事最直截了当的做法是在PubMed上花钱购买,但一篇文章动辄十几甚至几十美金,使很多医学工作者只好望而却步。其实,只要我们掌握一些技巧,还是有可能获得一些文章的全文的。笔者查阅文献数年,为获取全文也做了不懈努力,积累了一些经验供大家参考。

一、PubMed

PubMed上约有5%的文献是可以免费看到全文的,通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记。你只要点击这个图标,系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是,第一,很多时候,这个图标在PubMed处于显示简要(summary)状态下并不出现,而只有在选择显示摘要(abstract)时才出现。因此,如果你不只是泛泛浏览,而希望看到全文的话,我强烈建议你在display 下拉菜单中选择摘要(abstract)状态。第二,有些时候,小图标上仅标着Full Text,而并没有Free字样,但仍然可以链接入全文,你不妨试一试。

二、免费提供全文的期刊

天下没有免费的午餐,这句老话也不一定正确。有些期刊就提供全文免费检索。比如著名的美国Science(科学)杂志,以前国内很多高校、研究所的资料室都流传着Science杂志的影印本,印刷质量低劣,而且有盗版之嫌。后来Science的老板充分理解到中国的国情,干脆顺手做个人情,就与中国有关方面达成协议,使在中国大陆的读者都可以在网上免费看到Science的全文。

方法如下:

(1)先登录Science网址:https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html, 。注意,不是

https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,,否则你得不到全文。

(2)点击中间那个SEARCH按钮,就进入查询页了。你可以选择简单检索还是复杂检索。

(3)输入您要找的关键词(不一定是MESH标准主题词),再点击search就可以了。

(4)找出文章后,点击标题后的Full Text,就可以浏览原文了。

除了Science,其他一些期刊如美国科学院院报(PNAS),Genetics等都可以在网上获取全文,甚至能够下载文献的pdf格式,这样就和真正在期刊上的排版形式一模一样了。一般而言,那些相应期刊的网址是以org为域名的,往往提供免费的全文。例如上面提到的两家期刊的网址就分别是:https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html, ;

https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html, 。

这里,我特别推荐一个提供免费全文的网站High Wire Press。该网站号称拥有地球上最大最全的免费的科学文献全文数据库。输入网址https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/即可登录该网站,首页即列出几个生物医学相关栏目,包括:

1、生命科学(包含:生物化学,细胞和分子生物学/ 微生物学与病毒学/ 免疫与免疫学/ 神经科学与神经生物学/ 生理学/ 植物学/ 其他生命科学/)

2、医学(包含:心血管医学/ 临床医学/ 精神病学与心理学/ 医学研究/)

3、自然科学

以及其他科学栏目。

你可以在这些栏目中选择自己需要的期刊。然后,你需要重点看一下该期刊后面的的说明信息,尤其是提供免费全文的方式,如free ISSUES是在多长时间内可以享受免费索取原文,从5年到一个月不等。而free TRIAL 是在限定时间内,可以免费提供原文。至于free SITE 则是可以完全免费获取全文的站点。

当然,你也可以在检索框内输入关键字,然后点击首页右上方的Search all journals ,你就可以在所有的224种期刊里查找文献了。不过由于所检索到的结果仅仅局限于这200多种期刊,因此你一定要记住绝对不能用此网站来代替PubMed,来了解所研究课题的最新进展。我个人的建议是,先在PubMed上检

索,而仅以High Wire Press作为获取全文的一个途径而已。

三、利用一些高校图书馆网站

国内一些高等院校,尤其是一些名牌高校的图书馆经常和国外一些大的出版商签订协议,支付不菲的费用,从而可以检索并看到所有由这些出版商出版的期刊的全文。你可以就近到这些高校的图书馆的电子检索厅去检索,或者链接到大学图书馆的网站(如复旦大学图书馆的网址是https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,),然后通过该网站的链接进入相应的检索系统。可惜的是,从公众网到教育网之间的传输效率太低,很有可能等它等到你心痛,网页还是犹抱琵琶半遮面。

四、Free Medical Journals

与High Wire Press相似,该网站也提供了免费各种可能搜集到的全文期刊的列表。网址是https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/htm/index.asp。在这里,除了英文期刊,你还能检索到一些小语种的期刊全文。方法是在这个网站的左面是导航条,点击"Other Languages",里面有:法语、德语、加泰罗尼亚语、荷兰语、希腊语、意大利语、挪威语、土耳其语、西班牙语和葡萄牙语等等。

五、向作者索要

这种方法究竟效率如何,没有人统计过,不过在以上方法都没有用时不妨试一试。你可以根据作者的Email地址给作者去封信,先把对方的文章大大的吹捧一番,说它如何如何exciting,如何如何innovative,对自己的研究如何如何重要,然后说自己目前无法access to the full text,最后非常肯切地请求他能否通过email把全文寄来。这里,我有两条重要的建议。第一,不要简单的套用所谓的书信模板,应该多谈一谈你现在的研究内容以及对方的文章对自己的研究的重要性。这样才有可能引起作者的兴趣,不至于因为千篇一律而被对方直接删除到垃圾箱里。我总结的另一个技巧是,向第一作者而不是通信作者要全文。为什么这样说呢?我们知道,一篇医学文献往往有好几个作者。文献上有一个所谓的通信作者,通常是该实验室的老板。既然是老板,往往各种应酬套磁自然颇多,每天email信箱里的信杂七杂八一大堆,他的私人秘书只会挑选出一些重要的信件,而那些明显

无关紧要的讯问信件自然就遭受冷落了。而文献的第一作者,即该实验的主要承担者,应酬不会那么多,有email来讯问或索取文献也乐于答复。那么又如何知道第一作者的email地址呢?其实这很容易,你只要到PubMed上显示出文献摘要,上面亦包括作者的单位,然后从google上找到该单位网址,从网站上通常就不难查找到作者的通信方法。笔者就曾经多次用这种方法获取过全文,第一作者有一半以上都及时给予了答复,而通信作者大部分都有如石沉大海。

六、作者主页

有些作者会在他们的个人主页或实验室主页上放上所发表论文的全文,你也可以去看看。我就曾经为查找一篇文献的全文尝试了各种方法,最后竟然就在其作者的主页上意外地发现了。大有踏破铁鞋无觅处,得来全不费工夫之感觉。

当然,尽管在网络化生存的世界里,你也不要忘记最传统的办法,即到图书馆、资料室去查阅期刊文献,闻闻印刷品的特殊香味,聆听哗哗的翻页声,这些都是网络世界中无法体验的独特感受。

PubMed检索机制及规则

PubMed检索机制及规则 PubMed的检索功能非常强大,在检索中可实现检索词的自动转换、通配符的使用等功能,也可以进行强制性检索。 1 词汇的自动转换功能 在PubMed主页的检索提问框中输入检索词进行检索时,系统将按顺序自动使用如下3种索引,对检索词进行转换后再进行检索。 1.1 Mesh转换表(MeSH Translation Table) 包括MeSH词、参见词、副主题词、出版类型、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS)、补充概念(物质)名称表等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词(或其它词表中的词)和Text word词(题名词和文摘词),并用“OR”组配进行检索,同时停止使用其它的索引进行转换。有些词在转换后可能会出现3个词进行检索。例如:键入“blood",系统将其转换成"("blood"[MeSH Subheading] OR "blood"[MeSH Terms]) OR blood[Text Word]"后进行检索。 1.2 刊名转换表(Journal Tanslation Table) 包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其对应到相应的刊名进行检索。此外,该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Engl J Med”后进行检索。 1.3 著者索引(Author Index) 如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语,PubMed 即会自动查找著者索引。
如果仍然查不到相匹配的词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到为止。假如仍然不能找到匹配的词,系统将把各单词用“and”连接,在全部字段中进行查找。 要查看词汇的转换情况,可点击“Details”进行查看。 2 截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如:键入“flavor*”,系统会找到那些前一部分是flavor 的单词(如flavored, flavorful, flavoring等),并对其分别进行检索。如果这类词少于600个,PubMed会逐个词检索,若超过600个(如:ca*),PubMed将显示警告信息,要求增加词汇的开头字母数量。截词功能只限于单词,对词组无效。如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infection control”等。 注意:使用截词检索功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。 3 强制检索功能 如上所述,在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”,系统会用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索;但是,当键入的词语无匹配词时,PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程,若仍然没有匹配词,系统就将短语分解成单词,再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显,这样检索的结果是不符合用户要求的。因此,PubMed允许使用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。例如,在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”,并用双引号引起来,然后点击“Go”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功能。

新版Pubmed检索攻略

新版Pubmed检索攻略 ——日读一帖,解螺旋大V团队伴你科研路 【科研热点】让你时间比别人花的少、知道的比他早!【基金专栏】国自然等各项基金独到经验见解【SCI 专栏】从开始到接收全程tips【实验技能】这么棒快告诉你老板!关注我们,为您的科研路提速 第一章PubMed概述 笔者最近接到很多同学的微信,说希望看到pubmed的搜索教程,然后就在网上进行了检索,发现网上的教程都是老版的pubmed,比如还有limit按钮等等,其实pubmed改版之后已经变得更加简洁,就行百度搜索框一样,只有一个框和go。而以前的5个功能按钮早早已经删除,在你搜索结果中才可以显示,在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧! 我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花

上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事,必先利其器',PubMed就好像一 把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。 在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。 第二章PUBMED简单检索技巧 一.在这一章里,我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献,作以简单介绍。 1.直接检索。当你打开浏览器,在地址栏内键入 https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/PubMed/ 或是百度pubmed,就进入了PUBMED检索系统主页。在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed,是不是非常简洁?在检索框中输入查询词,然后单击'go'按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。 说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符

NCBI之PubMed完全攻略

PubMed完全攻略 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed 的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

PubMed中医药信息检索方法

PubMed中医药信息检索方法 PubMed是美国国立医学图书馆开发的专业医学信息网络检索系统。它的后台数据库中不仅包括Medline数据库,还包括Old-Medline数据库的一些内容。数据库中所收录的医学文献信息最早的可以追溯到1953年,可以说是当今世界上回溯期限最长,内容最丰富的文摘索引型数据库。由于这个数据库对所有用户都是免费开放的,因此它在全世界医务工作者中,享有非常高的声誉。 很多医护人员都曾经使用过这个数据库,针对自己感兴趣的方面做前瞻或回顾性的研究,不过也许大家没有留意过,这个由美国国立医学图书馆开发的数据库中还收录了许多中医药方面的文献信息,在这里,我就主要向大家介绍一下,如何在PubMed检索系统中查找有关的中医药学方面的文献信息。 PubMed检索系统中含有比较丰富的中药信息,包括一般性中药信息、单味中药信息和中药方剂信息。内容涉及理论探讨、药理实验、临床观察等等。有很多中国学者的科研成果都被收录其中。但是,由于该数据库编制人员本身都对中国医药方面知识的不够了解,使得PubMed检索系统并没有对其中的中药信息进行深度标引。单味中药和中药方剂也没有统一的英文名称。单味中药的名称往往是汉语拼音名称、英文名称、拉丁药材名称、拉丁动植物学名混用。中药方剂名称则主要为汉语拼音或以汉语拼音加英文构成。这些都给检索人员在使用过程中带来了很多的不便,必须引起人们足够的重视。下面我们就结合几个例子来给大家介绍一下如何在PubMed中检索不同的中医药方面的文献信息: 一. 如果用户仅仅是想了解一般意义上的中药方面的信息,那么我们倾向于让大家使用PubMed检索系统提供的几个中医药学方面的主题词进行检索,例如:”medicine, Chinese traditional”, “drugs, Chinese herbal”, 和”medicine, oriental traditional”等。这些主题词都是PubMed系统所认可的表示中医药学方面的主题词,使用这几个主题词进行检索,能够有效的检索到一些中医药方面总论性的文献,适合泛读及做科普性的了解。举个例子,在PubMed 检索系统中,输入检索式”drugs, Chinese herbal OR medicine, Chinese traditional OR oriental traditional”,检出记录16628条。也就是说,目前在PubMed的后台数据库中,共有总论性的中医药学方面的文献1万6千多条。 二. 检索植物类中药的信息,可同时使用中药的汉语拼音名称、英文名称、拉丁药材名称、去掉定名人的拉丁植物学名。在使用中药的拉丁植物学名时,如果某味中药来自同属多个物种,或来自同科多个物种,则各个物种的拉丁植物学名均须检索。植物类中药上述各种名称

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。 Limits:限定检索。PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History:检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。 例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献 步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索 点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。 输入提问词,点击go。如不是MeSH词,系统则提供相关概念供选择。 选择出现的MeSH词,可察看下面对该MeSH词的注释。 点击该主题词进入副主题词选择,选中需要的副主题词,也可点击进行加权、不扩展检索。 然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式,如要检索,发送到Search Box中,在Search Box中将显示检索表达式,可进行修改和继续添加。 最后点击Search PubMed进行检索。

PubMed检索完全攻略----好东西_吐血狂顶!

PubMed检索完全攻略----好东西,吐血狂顶! 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与

Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识 Pubmed是医学专业常用的数据库,对于医学科研工作至关重要,但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗?下面介绍了Pubmed三种检索方式,检验一下你都get到了吗? Pubmed主界面 1基本检索

引文状态标记值分为: [PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。 [PubMed-indexed for MEDLINE]: 被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词,具有完整的书目题录信息,检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。 [PubMed-in process]: 每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。 [PubMed-OLDMEDLINE]:

含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]: 是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到In Process Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。 布尔逻辑运算符(检索时需大写) AND 可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分,也即交集部分。如果用AND连接检索词A和检索词B,则检索式为:A AND B:表示让系统检索同时包含检索词A和检索词B的信息集合C。 OR 用于连接并列关系的检索词。用OR连接检索词A和检索词B,则检索式为:A OR B。表示让系统查找含有检索词A、B之一,或同时包括检索词A和检索词B的信息。 NOT 用于连接排除关系的检索词,即排除不需要的和影响检索结果的概念。用NOT

PubMed 文献检索完全攻略

PubMed检索完全攻略 第一章 进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/ 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这

PubMed检索

第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和

部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。 这是PubMed的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。 在主界面的左侧框(如左图),有: · Journal Browser 期刊浏览 · MeS h Browser可以用它来分层流览MeSH表 · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式) 3) Related Resources · Order Docume nts可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全攻略----好东西,吐血狂顶!2011-11-21 08:57阅读(4)转载 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医

PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享!

PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享! 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家

生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH )的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI 呢? PubMed 覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed 提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed ,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed 提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed 上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed 的主界面后, 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。 这是PubMed 的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit 键, Preview/Index 键, History 键,Clipboard 键和Details 键)即可完成。 在主界面的左侧框(如左图),有: · Journal Browser 期刊浏览 · MeSh Browser 可以用它来分层流览MeSH 表 · Single Citation Matcher 输入期刊的信息可以找到某 单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher 用一种特定的形式输入期刊 的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries 这一部分为临床医生设置,通过过 滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、 病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed 查询方式) 3) Related Resources · Order Documents 可以使用户在当地得到文献的全 文, 但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我 将在后面的有关章节中详述。

Pubmed检索攻略

PUBMED简介 一、何为PUBMED? PUBMED是美国国立卫生研究所(NIH)下属美国国立医学图书馆(NLM)开发的因特网检索系统,建立在国立生物医学信息中心(NCBI)平台上。PUBMED主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务,其中包括医学文献的定购、全文在线阅读的链接、专家信息的查询、期刊检索以及相关书籍的链接等。 二、PUBMED与图书馆光盘版本的MEDLINE有何不同? PUBMED与光盘版本MEDLINE的不同之处在于:由于互联网的及时性,PUBMED的更新速度快于光盘版,光盘版本的更新周期是3个月,而PUBMED的更新周期是1天,PUBMED包含了一些尚未收录入光盘版MEDLINE的最新文献信息,因此PUBMED享有PRE-MEDLINE的美誉。 三、如何进入PUBMED检索系统? 在浏览器地址栏中输入网址:https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/ 四、PUBMED主页的基本组成? PUBMED的检索系统大致由三个板块组成:页面上方的检索框和功能按钮(Limit、Preview/Index、History、Clipboard、Details)。在检索框"for"后面的空格中输入需要查询的关键词,点击"go"会出现相关的文献。每个功能按钮的具体功能下面会逐项介绍。左面的导航条指向PUBMED的一些其它功能板块,如MeSH Browser、Journal Browser等。剩下的右下方大片空间便是显示检索结果的空间。

五、PUBMED的主要功能按钮组成? PUBMED的主要功能按钮有五种:Limit按钮、Preview/Index按钮、History按钮、Clipboard按钮和Details按钮。 六、LIMIT 按钮的主要功能? 当点击Limit按钮,将出现以下界面: 各下拉框的基本作用如下: All Field:下拉可选择搜索的范围,如作者名、关键词等 Publication Types:下拉可选择所查文献的类型,如临床试验、荟萃分析等 Ages:下拉可选择所查文献研究对象的不同年龄组 Entrez Date:下拉可选择所查文献距离现在不同时间范围 Publication Date:下拉可选择限定所查文献发表日期 Language:下拉可选择所查文献的语种 Human or Animal:下拉可选择所查文献的研究对象:人或动物 Subset:下拉选择不同的医学网络系统,可查询特殊领域的文献AIDS, TOXICITY 七、Preview/Index按钮的功能? 点击Preview按钮,可以预览检索的结果,此预览功能使我们浏览结果前,先知道查询的结果数量,从而可估计是否有必要进一步修改检索式以缩小或扩大检索范围,避免每次因传输大量的无用数据而浪费时间。 Index按钮的功能则使我们在输入一个检索词之后知道这个检索词将导出多少篇文献,同时其特有的允

PubMed完全攻略

文献首页生物动态实验方法软件应用生物信息产业信息其他文档七嘴八舌软件下载 PubMed完全攻略(一) 作者:佚名整理时间:2005-08-19 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.360docs.net/doc/0c19185749.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed 所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。 进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦 注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。 PubMed简介 PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA 与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM等等。PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。 PubMed服务内容概括 基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。 提供MEDLINE、PreMEDLINE与其他相关数据库接入服务,如NCBI的其它数据库DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,及NCBI外的其它数据库。 提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 随着国内互联网的普及,网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展,了解世界先进水平的一个重要手段。 传统的医学文献检索(MEDLINE)尽管在本地局域网提供的情况下,具有高速的特点。但与互联网

PUBMED检索

?主题词(Mesh Heading),又称叙词Descriptor,从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语?款目词,又称入口词,entry word,主题词的同义词或近义词?副主题词(Subheading), 又称为限定词(Qualifiers), 对主题词进一步限定的规范化用词 ?缩小检索范围,获取最专指的文献 ?举例:茶碱治疗哮喘 ?哮喘 asthma(指"asthma"[MeSH Terms] OR asthma[Text Word])99696 asthma[mesh](指"asthma"[MeSH Terms] )81824 ?哮喘的药物治疗 asthma/drug therapy19695 ?茶碱(theophylline)治疗哮喘(2352) theophylline/TU7366 Medline:是PubMed的主体部分。[PubMed--Indexed for MEDLINE]。 OldMedline:含1950-1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录中没有MeSH字段和摘要字段,记录的标记是[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966]。 PreMedline:是Medline的前期数据库,收录的是那些正在等待标引的文献,其作用在于缩短文献报道时差。[PubMed--in Process] Publisher-Supplied Citations:出版商提供的电子期刊中有一些属于

选择性收录期刊。[PubMed - as supplied by publisher] PubMed主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接Nucleotide:DNA序列数据库 Protein:氨基酸(蛋白质)序列数据库 Genome:基因组序列数据库 Structure:分子结构模型数据库 Popset:种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy:生物分类数据库 OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库 Books:相关图书 注:在检索提问框内输入的检索词若不用字段限定,系统依次到下列3个表中进行词语的核对、转换和检索:①MeSH转换表(MeSH Translation Table)、②刊名转换表(Journals Translation Table)、③著者索引(Author Index)。如果在MeSH转换表中找到了相匹配的检索词,系统用MeSH词和Text Word词(TI、AB、MH、NM、PS、OT等字段中的词)一起进行检索。如果在MeSH转换表中未找到匹配的检索词,系统接着到刊名转换表和著者索引中搜词检索。如果在上述3个表中都找不到匹配的短语,系统将短语拆小,继续到这3个表中搜索,短语断开部分的逻辑关系是AND。如果拆到单词在以上3个表中还是找不到匹配词,将到所有字段中去搜索这些单词,单词之间的逻辑关系也是AND。 作者检索Smith j模糊(Smith JD/JR/J等)

如何利用PubMed检索医学文献

?药师之友? 如何利用PubMed检索医学文献 刁继红1*,甄连花2#(11延边大学附属医院,延吉市133000;21延边大学图书馆,延吉市133000) 中图分类号R95文献标识码C文章编号1001-0408(2009)22-1755-02 摘要目的:为便于医药工作者更好地利用PubMed检索外文文献提供参考。方法:结合实例,从检索方法、特殊服务功能、特征栏使用、检索结果的存盘与打印等方面对PubMed进行详细介绍。结果与结论:PubMed是世界公认的最重要、最具权威性且使用率最高的生物医学文献数据库之一,其内容涉及生物医学的各个领域。掌握PubMed的检索方法和技巧将有助于广大医务工作者快速、准确地检索外文文献。 关键词PubMed;方法;功能;医学文献 PubMed(htt p://www1ncbi1nlm1nih1g ov/PubMed)是由美国国家医学图书馆(National Librar y of Medicine,NL M)附属的国家生物技术信息中心(National Center for Biotech2 nolo gy Information,NCB I)开发研制的生物医学文献检索系统。1997年6月,PubMed在网上向用户提供免费检索服务。PubMed文献量大、更新及时、检索途径多样、功能齐全、链接点多,部分期刊还可在网上直接免费获得原文,深受用户欢迎。现在网上运行的是2003年8月改版的新版PubMed。改版后的PubMed界面直观、容易操作,检索程序简单,功能强大,很容易被使用者掌握。目前,PubMed已经成为国内医药卫生工作者使用的主要外文文献检索数据库。为了便于用户更好地利用PubMed,本文将其检索方法与技巧作一介绍。 1PubMed检索方法 111自动词语匹配检索 新版PubMed提供了强大的词语自动转换和匹配功能(Automatic Term Ma pp in g),该功能通过4个词表来实现,即MeSH转换表、刊名转换表、短语列表以及著者索引表[1]。在检索提问框中输入检索词,如果没有设定字段,系统会依次在这4个表中进行词语的核对、转换和检索。当在其中一个表中找到了相匹配的检索词时,系统会利用该匹配词和用户输入的检索词在相应的字段中进行检索,检索结果直接显示在下方。其检索式可在细节(Details)中查看。如果没有找到相匹配的词语,系统会将词语拆小,用AND将断开的词组或单词组配起来在上述各表中进行检索。如果仍找不到相匹配的词,系统将这些组配后的词于所有字段中进行检索。 112组配与字段限定检索 PubMed为用户提供了运算符AND、O R和NO T的逻辑组配运算功能,使用时,这3个运算符要大写。每组检索词可以限定检索字段,即要求检索词出现在指定的字段中,字段符号要括在方括号内(常用字段见表1)。如:要检索作者G on g HP 在期刊Clinical dru g investi g ation上发表的题名中含有“olmesartan medoxomil”方面的文章,其组配方式是:G on g HP[au]AND Clinical dru g investi g ation[ta]AND olmesar2 tan medoxomil[ti]。应当注意的是,限定字段后,系统将不再执行自动匹配和转换功能。 表1PubMed常用字段 T ab1Common f ield of PubMed 字段符号说明字段符号说明 ab文摘pg文章所在期刊的页码ad作者地址p mid PubMed记录识别号au作者p t出版物类型 c p出版国py年度 i p期刊的期号sh MeSH副主题词 is国际标准出版物号so文献出处 la语言ta刊名 mesh医学主题词ti题名 nm物质名称vi期刊卷号 113强制检索 PubMed的字段限定检索功能,只能限定检索词必须出现在指定的检索字段中,如Smit h J[au],可检索出姓名为Smit h J,Smit h J H,Smit h J P等作者发表的文章。同样,在刊名检索时,如用Cancer[ta]检索期刊“Cancer”的文献,系统会将刊名为“Cancer”、“BMC Cancer”、“Nat Rev Cancer”等的文献检索出来。强制检索就是精确检索某一个或某一组检索词,检索时用双引号将检索词引起来,并在其后加上相应的字段符号,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的相应的字段中 Method on Ho w to Retrieve Medical L iterature from PubMed D IAO J i-hon g(Yanbian U niversit y Affiliated Hos p ital,Yan j i133000,China) ZHEN Lian-hua(Librar y of Yianbian U niversit y,Yan j i133000,China) ABSTRACT OBJ EC T IV E:To p rovide references for medical workers about how to make better use of t he PubMed to re2 t rieve forei g n literat ure1M E THODS:The PubMed was int roduced in detail wit h exam p le in res p ect of t he ret rievin g met hod, s p ecial service f unction,use of s p ecial column,storin g and p rintin g of ret rievin g result s,etc1R ESUL TS&CONCL U SION S: PubMed is g enerall y acce p ted as one of t he most im p ortant and aut horitative biomedical biblio g ra p hic database and it s content s cover each field of biomedicine1Masterin g t he met hods and skills of ret rievin g PubMed is of g reat hel p for medical workers to ret rieve forei g n literat ure ra p idl y and accuratel y1 KEY WO RDS PubMed;Met hods;Function;Medical literat ure *副主任药师。研究方向:临床药学、医药信息。电话:0433- 2670824。E-mail:diao j h1959@sina1com #通讯作者:研究馆员。研究方向:医学信息学。电话:0433- 2660553。E-mail:lhzhen@y bu1edu1cn 中国药房2009年第20卷第22期China Pharmac y2009Vol.20No.22?1755?

相关文档
最新文档