spm手册

spm手册
spm手册

鉴于广大战友都需要一个中文的spm手册

现在就发个给大家,这是一个非常入门级的手册,有问题请在下面跟贴。

另外,准备写点关于fMRI的东西,希望大家给点idea!见

https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,/bbs/post/iew?bid=89&id=5188803&sty=1#5188803

SPM软件说明.rar (156.84k)spm坐标变换程序,里面是mni2tal和tal2mni两个matlab小程序。

这是两个M文件,在matlab下,具体实用方法,见下:

1。在matlab中把两个程序的路径加到matlab的path中,然后sae,close。2。在matlab的command窗口中输入mni2tal([10 2 2])后,结果如下

ans =

9.9000 2.0295 1.7407

这就是转换以后的talairach坐标。

同理,tal2mni也是一样的用法。

spm_coordinate.rar (0.94k)占位贴占位贴下载了,对于我这样的入门级选手已经够用了!请版主给加分!请问楼主,您用的什么机子做的fMRI?我用GE1.5 T做的,图像要怎么处理才能转成analyze格式的,我用了MRIcro和MRIcone rt转都不行啊,谢谢!我用的也是GE 1。5T,

如果你用的是spm99,那么就必须要有MRIcro这个软件,方法见下;如果你用的是spm2或spm5b,那么就简单的用spm2 toolbox里的dicom这个插件就行了,不必使用MRIcro或是用spm5里的dicom import按钮来转换。

mricro使用简单步骤

1。点"Import/conert foreign to analyze",在出现的对话框中,number of files 为你的数据的总文件数,slice increment=1,olume increment=0,olumes 为你的实验的olume数。填好后,先点design,后点select,然后选中你的数据的第一个文件。然后保存。

2。点"file/open",打开刚才保存的img文件。

3。点"file/sae as ...[rotate/clip/format/4D->3D]",然后点击“sae intel”。即可

这样保存后的文件就是analyze格式的了。非常感谢您的回答!我用SPM转数据时老是不成功,而且特别慢,今天下午又试了一下MRIcro,可以了,但又很多疑问,

1、我一共128个时间点,但为什么在最前面还有个没有编号的head文件和i ma文件呢,即转过来的有129个head和img,我的理解是没有编号的那两个文件是转的时候保存的第一个文件,是没有用处的,对吗?

2、还有就是3d像和se像怎么设olume数呢?只有EPI像有olume数啊?

3、在用MRIcro转换时,里面打勾的地方该怎么设,比如,flip left(right)等啊,我不知道该怎么设,不然就会无意识的把左右方向搞错!

期待回答,多谢!我是做fMRI的,用MRIcro转换原始图像,可每个olume内图像顺序都是乱的,用SPM2relign误差很大,您遇到过这种问题吗

用SPM2如何处理dicom文件用spm2转换是很容易的,您肯定是文件没有弄好,或者是别的什么原因。

1、你说那个的head和img文件就是在mricro转换中在sae之前的那个文件及其头文件,属中间文件,应该是没有用的,在spm中不要把它也选上,选了就不对了。我的经验是把它直接删掉,不要留着它,用时再用mricro转换。

2、我想你说的是T1象吧,这个就可以把T1这个序列的olume 数设为1,就

行了。

3、我的经验是把所有的钩钩去掉。bianka0830 wrote:

>您好,很多次得到您的解答真是非常感谢!前段时间去心理所上了课,回来自己做了,但遇到很多的问题,所以又麻烦您了!您也用的是GE的机子,那一个RUN总的时间是有一个TR的时间来决定的,还是有什么地方可以设的?听人说总得时间是要自己设的,但我们不知道在哪里设啊?好像我们设好TR和TE 时间后,总时间自动出来了,比如,我们选择TR2000ms,总时间就自动为4

分16秒,您能告诉在哪里有设总时间吗?因为我觉得我们那种方法肯定是不对的!,多谢!

总时间是与你实验的总olume数相关的,如果是128个olume那么总时间=2×128=256秒=4分16秒。这个回答可以么???我想知道你所用的是什么样的机器,如果是GE的应该不会有这种可能,若是西门子的,那么如果你在mosa ic上不打钩,那么转换后的图像就是顺序乱的。在这里可以简单的解释一下,由于信号采集的原因,通常的采集顺序是这样的(对于16层而言):1 3 5 7 9 11 13 15 2 4 6 8 10 12 14 16

这样在每个olume中的矩阵就是这样的

1 3 5 7

9 11 13 15

2 4 6 8

10 12 14 16

而一般的GE的机器都会在你从工作站得到前给你做好了相应的转换,于是就得到了如下的矩阵

1 2 3 4

5 6 7 8

9 10 11 12

13 14 15 16

而通常西门子的MR通常不给做转换。

简单的办法就是用MRIcro在转换之前看一下,用Open命令,看看每个olume 中的图像是连续的还是交错的,就可以了。

附件中是最新的spm2的user guide,刚刚得到,大家看看吧!

SPM2_eng.pdf (237.25k)bianka0830 wrote:

>您好,很多次得到您的解答真是非常感谢!前段时间去心理所上了课,回来自己做了,但遇到很多的问题,所以又麻烦您了!您也用的是GE的机子,那一个RUN总的时间是有一个TR的时间来决定的,还是有什么地方可以设的?听人说总得时间是要自己设的,但我们不知道在哪里设啊?好像我们设好TR和TE 时间后,总时间自动出来了,比如,我们选择TR2000ms,总时间就自动为4

分16秒,您能告诉在哪里有设总时间吗?因为我觉得我们那种方法肯定是不对的!,多谢!

总时间是与你实验的总olume数相关的,如果是128个olume那么总时间=2×128=256秒=4分16秒。这个回答可以么???

再次感谢aushikun,我的意思是在扫EPI之前设一些参数,如TR和TE等,我的1个run的总时间在哪里设?因为您用的GE的机子,所以情况肯定差不多。我的实验要求4分20秒,即260s,这个时间我不知道在哪里设,就没设,但我设好TR:2000ms时,参数下方自动出来4分16秒这个时间。这肯定是不对的,

但就是不知道在哪里设那个时间,多谢!water2:我是做fMRI的,用MRIcro 转换原始图像,可每个olume内图像顺序都是乱的,用SPM2relign误差很大,您遇到过这种问题吗

用SPM2如何处理dicom文件

我用的是GE的机子,所以刚开始处理数据时也遇到很多的问题,后来只能用M RIcro转。用MRIcro转图像的步骤aushikun 战友已经说的很明白了,我就是按照他说的做的,最后一步时我刚开始选择的是以4d形式保存,所以出来错误的结果,不能选择4d!3d的两个选项好像都可以,只是文件名不同而已。还有如果你的机子的图像是间隔扫的,即interleae形式的,在spm中第一步sliceing中会选择interleae就行了,程序会转过来的,你试试看看吧,你用dis play就可以看看你的图像是否完整,是否对。我这儿有个SPM2的英文说明书,我觉得写的很详细,解释的也很明白,版本好像和aushikun 传的不太一样,如果需要也可以上传。

中文说明书有一本印刷本,但没有电子版的,大概40多页,翻的不是很好,但对于初学者很有用,如果有需要的,我试试扫描或者用数码相机照下来!

在北京学习过程中,觉得资源共享非常的重要,这样大家才能共同进步啊!to hmp33:打开MATlab后,把路径设到你要处理的数据的EPI目录下,在对话框中输入spm fmri,就会出现操作界面了,然后根据说明书一步步做,当然前提是你已经对fMRI的实验设计之类的有所了解!我是这样做的,所以不一定对,请aushikun指正!

还有在做的过程中发现要处理的数据只能放在根目录下,不然Matlab找不到,不知大家又没有遇到过相同问题?我是用的GE SIGNA,图像拷到硬盘上顺序没问题,20层X100olume,用ACDsee重命名也没问题。可第一步转换成一个im g文件就乱了。我能发Email给你吗?你是用什么转换文件的啊?我用MRIcro 没有重命名也可以转了啊谢谢帮助能发给我吗panchu◎https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,谢谢帮助能发给我吗panchu◎https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,用MRIcro啊。我有2000幅图像被RTIP装到三个序列里了。你有没有按照前面说的步骤转啊?

要设好olume数

MRIcro会根据你的总图像数和olume数来分配你的图像啊是的呀。我的三个序列图像数分别是979,999,22。都以img1开头。你的是这样吗你的3个什么序列,你是分3个run做的?有qq?19255917一个RTIP序列做的,可工作站自动存在三个序列里。我的机器是GE 1.5T signa ci。

不好意思,我没有QQ。呵呵,有点奇怪!还没听过有这样的,这可能需要改名后放在一个文件夹里!不然SPM认不到你的100个olume的是的。你用MRIc ro转换后是不是有128个img文件,每个文件里有扫描时设定的层数,而且是按顺序的?对,我是128个olume,所以转好后应该有128个img和128个h ead文件

head文件里包括许多的参数。其实也是在转是告诉MRIcro的,我输入总图像2 304,还有设了多少个olome,所以你确定后,它会跳出一个提示让你确认!你看过每一个img文件里面的图像是按你扫描的顺序排列的吗?对啊,可以用sp m_moie看一下嘛如果我没有理解错误,我想你的实验必须为4分20秒,那么这样话,一般来说,每个run都要有5个dummy acquisition,那么就是10秒,这样,剩下的就是4分10秒,你需要减少你的olume 数,即250÷2=125个o lume。

如果出去dummy不算,那么就是260÷2=130olumes。

如果我理解不对,那么还请详细描述你的实验设计。water2战友:

rtip实际上并不是一个很好的东西,它对于大于1000的图像序列,就自动分割为另外一个序列,依次类推,如果可以,要向GE公司的人要求升级系统,升级后可以扫描任意图像数的序列。

如果不给升级,那么就必须要用改名软件来修改文件名后,再用mricro来转换,当然改名时还一定要小心呦!

可以发邮件到我的油箱:aushikun@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,spm2的说明应该不会说适用于Matlab5。3 和6。0,即使是6。1都不行,必须是6。5以上,matlab7在我的机子上与spm2兼容性好。不好意思,我这两天在给儿子过生日,今天刚打开电脑。对于你的问题,,我想周一应该给你看看机器的设置,在我印象中好像就是简单的告诉MR scaner,TR和总的olume数就可以得出总的扫描时间。

朋友,能否给我也看看你的Talairach图谱呀?我的qq:325375看看2楼的东西是否是你需要的!aushikun老师:

1、对于机器设置得问题,我就是找不到设置olume数或总时间得地方,您能告诉在哪设olume数吗?非常感谢!

2、还有您上面说得坐标转换后能按Brodmannn分区吗?

3、如果处理有病得大脑,和处理正常大脑时有什么不同啊?是否都用自己得解剖像标准化和oerlay啊?那多个人之间怎么比较呢?

4、在oerlay时,我发现我选择slice和section时激活区得位置左右是相反得,但在文献上看别人得文献是一致得,所以不知道哪里错了,我处理得两个数据都有这样得问题?

至于那个图谱,我发到您得信箱吧!但不一定有用!望查收!我今天处理数据时发现GE得图像也是间隔扫描得啊,用dicom格式看时图像是正得,但为什么转成analyze时,图像就会间隔呢,然后用display看时,数据是不完整得,请问aushikun老师怎么解决这个问题?多谢!我已经解决了。在MRIcro的第一步,把Sort using DICOM index钩上即可我也发现了这个问题,后来试着打勾就好了,但是flip left/right那个勾要不要打上呢,今天我处理数据时发现左右是反的啊,您还有什么新发现?最近这个话题怎么没人讨论啦,非常希望能多看到一些关于脑功能成像方面的讨论!请问aushikun老师:

我得实验是这样得,block设计,左手运动、静止、右手运动,如果condition

设为二,那么最后define contrat时,我该怎么设,因为说明上说,总数加起来要为0

我原来把rest作为一种condition时,左手运动于静息得得T检验,设为1 0

-1 0,现在不把rest作为一种condition,我要看左手运动得激活区域,那么我该怎么设呢?

还有我现在在网上下载了olume one ,但那个插件老下载不下来,能否传给我一个啊,有没有说明olume one处理数据得过程得说明书啊?非常得感谢!bi anka0830 能发给我吗?谢谢

ylr737@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,同志们,中国人的头颅和西方人有差异,如何校正。bianka08 30 wrote:

我这儿有个SPM2的英文说明书,我觉得写的很详细,解释的也很明白,版本好像和aushikun 传的不太一样,如果需要也可以上传。

中文说明书有一本印刷本,但没有电子版的,大概40多页,翻的不是很好,但

对于初学者很有用,如果有需要的,我试试扫描或者用数码相机照下来!

在北京学习过程中,觉得资源共享非常的重要,这样大家才能共同进步啊!

谢谢!能传给我吗,现在急需susan33399@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,非常感谢

成立脑功能经验交流探讨小组,qq群为19355455。欢迎大家加入讨论。

小弟用spm2做自己的课题。遇到几个问题:

1 如何获得激活区的cluster数

2 有没有软件,给出tal坐标,就给出解剖位置。

3 contrast的t检验和f检验。有没有差别。

听北师的老师讲课,说是用几个量,去解释一个量,正好符合F检验。

请各位高手赐教。楼主人太好了。解决了我很大的问题。

我刚开始做fMRI,不懂的问题很多。希望以后有机会再向楼主大人请教。1 在result界面中点击olume,就可以得到了,自己研究研究吧!olume中的结果是非常非常重要的,应该重点研究!

3 我想学过统计的人都应该明白t test和F test的区别:t是用来对两者之间进行比较;F是对多者进行比较,其中任意两者有无显著性差异。

我想园子里应该有不少人懂spm,为何没人回答问题呢?一个人的力量是有限的。各位老师我最近正在做脑功能相关课题,苦于不会是用SPM、AFNI等后处理

软件,希望能得到更详细系统的说明!!!

另外有人使用西门子的机器么,西门子(AANTO 1.5T)的BOLD图像为什么会把头的36个断层图像放在一个DICOM原始图中,机器上浏览到的就是那个样子,不知在后处理时,如何设置参数!?

bianka0830:你能给我一个你的中文说明吗?dai.xian.feng@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,

万分感谢!!!有没有软件,输入talrach坐标,就能给出是哪个脑回。中文说明感觉用处不大,这里讨论的基本都是FMRI,针对于PET好像不多。talrach demon 软件

你应用T2模板得到的是MNI模板,尚需要有个转换才可以关于SPM2得到激活区后定位的问题,恳请哪位高手详细讲讲,要用哪些软件?具体步骤怎样?万分感谢!wo xu yao spm2

dyp5516@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,huashan608 wrote:

talrach demon 软件

你应用T2模板得到的是MNI模板,尚需要有个转换才可以

关于SPM2得到激活区后定位的问题,恳请哪位高手详细讲讲,要用哪些软件?具体步骤怎样?万分感谢!

对于激活坐标的定位问题有两种方法,如果你只是想大概的看看激活脑区的话,可以利用SPM中的AAL这个小TOOLS,它可以很快给你看看脑区的激活情况,不过这个结果不能写文章,只能给你说明你所作的统计的正确性而已!

另外你在下载一个软件叫xjiew的软件,非常好用,对于查找坐标以及定位等不问题不需要编程的,一次搞定的!

斑竹!能给我加一分不?water2 wrote:

我已经解决了。在MRIcro的第一步,把Sort using DICOM index钩上即可

我也发现了这个问题,后来试着打勾就好了,但是flip left/right那个勾要不要打上呢,今天我处理数据时发现左右是反的啊,您还有什么新发现?

不要转换了,因为医学上面习惯上把左、右颠倒,在SPM中有一步会自动

将左右转换过来,所以MRIcro中就不需要转换了。终于有高手肯指点了,先谢一个。

能讲详细点吗?关于软件的下载和用法。我已经快走投无路了。能传给我一份吗?我的邮件是duhanjian@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,

谢谢了mridoctor

我用的机器和你一样,西门子的AANTO 1.5T

这种把所有层面放在同一个图像里称为MOSIC格式,个人认为比分开放有优势,可以节约空间,并减少文件数量。

我使用的是AFNI,对SPM只是了解一点。我所知道的是AFNI和SPM对本机器的图像识别是很好的,按照说明的要求去转换就行了。我原来用GE公司的机器的时候也出现过这样的问题,后来发现有个Sorting using dicom data钩钩一定要钩上。我的具体步骤是这样的(我的是8个层面,128个olume,共102 4个图片):

MRIcro处理DICOM数据

1.Import->open foreign--------- Import->display header-----找到slice locatio n=-22.84781265-------再打开后一个文件,找到slice location ;如果不一样,说明文件是按扫描时间排的,而不是按扫描位置排的-------

2.Import→coert foreign to analyze→number of files: 1024, slice Increme nt: 1, olume increment: 0, olumes: 128 (1024/8)[T1结构像number of files: 8, olumes: 1]→点design 看文件是不是按每8个组成一个olume→√Autodet ect Mosaics, √sort using DICOM data, not filename, √open sequential file s: ignore filename→select→OK→图像所在文件夹→选取第一张→打开→取名(如run1.hdr)→保存在run1目录下→sae→File: open image [Analyze or oxB o] (run1.hdr)→open→OK→检查一下图像的顺序→File: sae a s [rotate/clip/for mat/4D→3D]→sae [intel]→segment [File001, File002]→保存

我手头还有一个Talaraich坐标定位的软件,自己用起来感觉不错,上传在附件中,希望对有这些问题的站友能有所帮助。使用时可能还要先下载一个Jaa run time软件。

我也是初学fMRI,希望能有更多交流机会,见到更多好贴。另外,能否请bian ko0830站友给我也发个SPM的说明,英文的也可。yongming-wu@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html, TDClient.part01.rar (490.0k)第二部分

TDClient.part02.rar (490.0k)第三部分

TDClient.part03.rar (490.0k)第四部分

TDClient.part04.rar (490.0k)第五部分

TDClient.part05.rar (114.84k)初来乍到,能传给我一份吗?下载了,对于我这样的入门级选手已经够用了!请版主给加分!mridoctor

我用的机器和你一样,西门子的AANTO 1.5T

这种把所有层面放在同一个图像里称为MOSIC格式,个人认为比分开放有优势,可以节约空间,并减少文件数量。

我使用的是AFNI,对SPM只是了解一点。我所知道的是AFNI和SPM对本机器的图像识别是很好的,按照说明的要求去转换就行了。

aslipper你好!

如果你能看到此条留言的话,方便时与我联系

(dai.xian.feng@https://www.360docs.net/doc/1d18868916.html,),我想和你交流一下afni处理fmri数据的问题!

谢谢!

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急性脑卒中溶栓指南

中国急性缺血性脑卒中静脉溶栓指导规范 国家卫生计生委脑卒中防治工程委员会 2016年5月

中国急性缺血性脑卒中静脉溶栓指导规范 组长:刘鸣 成员:崔丽英贺茂林徐运 增进胜刘峻峰畅雪丽

急性缺血性脑卒中的发病率、致残率和病死率均高,严重影响人类健康和生活。目前超早期采用重组组织型纤溶酶原激活剂(recombinant tissue plasmmogen activator, rt-PA) 静脉溶栓是改善急性缺血性脑卒中结局最有效的药物治疗手段,已被我国和许多国家指南推荐,但目前急性缺血性脑卒中溶栓治疗的比例仍然很低。 近期研究显示,约20% 的患者于发病 3 小时之内到达急诊室,12.6% 的患者适合溶栓治疗,只有 2.4% 的患者进行了溶栓治疗,其中使用rt-PA静脉溶栓治疗为1.6% 。开展急性缺血性脑卒中超早期溶栓治疗的一个主要难点是,大多数患者没有及时送达医院或各种原因的院内延迟。 为使更多急性缺血性脑卒中患者获得溶栓治疗并从中受益,美国等西方发达国家已普遍进行相应的医疗救治体系改革,包括完善院外医疗急救转运网络,组建院内卒中快速抢救小组,开通急诊“绿色通道”,建立卒中中心和卒中中心的认证体系等措施,其核心就是要让公众都知道卒中是急症,卒中发生后应尽快送达有能力进行卒中溶栓治疗的医院,并获得规范性溶栓治疗。 为使溶栓这一有效疗法能更好、更广泛地在我国使用,提高缺血性脑卒中急性期的救治率,脑防委特组织全国脑血管病权威专家制定静脉溶栓指导规范如下,其中的推荐强度和证据等级采用《中国急性缺血性脑卒中诊治指南2014》的标准。 一、溶栓相关公众教育 为使急性缺血性脑卒中患者获得及时救治,首先应能够识别脑卒中的发生。研究显示公众对脑卒中临床表现的相关知识仍然十分匮乏。根据加利福尼亚州急性卒中登记(California Acute Stroke Pilot Registry, CASPR) 报告若所有患者能在发病后早期就诊,则 3 h 内溶栓治疗的总体比例可由 4.3% 上升至28.6%, 因此开展更多的以教育卒中患者更早寻求治疗的宣传活动是必要的。 有效的社区教育工具包括印刷材料、视听节目、网络在线宣传、社区宣讲、板报以及电视广告。卒中教育不应仅针对潜在的患者,也应包括他们的亲属、公共服务部门比如警察以及医护人员,使他们能够在必要时启动急救医疗

spm8详细教程

SPM8数据处理教程 Lab 1. 数据的预处理 一、概述: 数据的预处理(preprocess):(1)Convert dicom files to hdr files and img images;(2)Slice Timing;(3)Realign: Estimate & Reslice;(4)Coreg: Estimate;(5)Segment;(6)两次Normalise: Write;(7)Smooth;(8)Fmri model specification;(8)Model Estimation。 二、DICOM Import: 说明:转换完后会在解剖像文件名前加s,在功能像文件名前加f。可以用“Display”来查看刚转换的图像。(Display还有一个重要的作用是定义原点——前联合和AC-PC连线,这在做Normalise中很重要。定义后reorient一下即可写入头信息)。 三、Slice timing 1、目的:使用数学的方法使不同时间扫面的层校正为同一时间获得层。 2、过程: Date .session---[选中所有要处理的f*.文件] Number of slices---[扫描层数] TR TA---[可以用公式表示:TR-(TR/nslices)] Slice order---[扫描顺序:例如1:2:31 2:2:32分别表示从1或2开始,每间隔2个数扫描一张,即1、3、5… 2、4、6…] Reference slice---[参考层,一般选择中间的一张,对于各层扫描,一般选择即是时间的中点,又是大脑的中点。如果是层数为偶,可以选择中点处2层中的任一层] Filename Prefix—a [默认头文件名为a] 3、说明:Block Design的实验数据这一步可以跳过; event related design的实验数据必须做这一步。

急性心肌梗死溶栓疗法指南(最新版)

急性心肌梗死溶栓疗法指南 一、原则 应在急性心肌梗塞发病后,争分夺秒,尽力缩短患者入院至开始溶栓的时间,目的是使梗塞相关血管得到早期、充分、持续再开通。 二、选择对象的条件 1.持续性胸痛≥半小时,含服硝酸甘油症状不缓解。 2.相邻两个或更多导联ST段抬高在肢体导联>0.1mV、胸导>0.2mV。 3.发病≤6小时者。 4.若患者来院时已是发病后6~12小时,心电图ST段抬高明显伴有或不伴有严重胸痛者仍可溶栓。 5.年龄≤70岁。70岁以上的高龄AMI患者,应根据梗塞范围,患者一般状态,有无高血压、糖尿病等因素,因人而异慎重选择。 三、禁忌证 1.两周内有活动性出血(胃肠道溃疡、咯血等),做过内脏手术、活体组织检查,有创伤性心肺复苏术,不能实施压迫的血管穿刺以及有外伤史者。 2.高血压病患者经治疗后在溶栓前血压仍≥21.3/1 3.3kPa(160/100mmHg)者。 3.高度怀疑有夹层动脉瘤者。 4.有脑出血或蛛网膜下腔出血史,>6小时至半年内有缺血性脑卒中(包括TIA)史。 5.有出血性视网膜病史。

6.各种血液病、出血性疾病或有出血倾向者。 7.严重的肝肾功能障碍或恶性肿瘤等患者。 四、溶栓步骤 溶栓前检查血常规、血小板计数、出凝血时间及血型。 (一)即刻口服水溶性阿司匹林0.15~0.3g,以后每日0.15~ 0.3g,3~5日后改服50~150mg,出院后长期服用小剂量阿司匹林。 (二)静脉用药种类及方法: 1.尿激酶(UK):150万IU (约 2.2万IU/kg)用10ml生理盐水溶解,再加入100ml 5%~10%葡萄糖液体中,30分钟内静脉滴入。尿激酶滴完后12小时,皮下注射肝素7500U,每12小时一次,持续3~5天。 2.链激酶(SK)或重组链激酶(rSK):150U用10ml生理盐水溶解,再加入100ml 5%~10%葡萄糖液体中,60分钟内静脉滴入。 3.重组组织型纤溶酶原激活剂(rt-PA):用rt-PA前先给予肝素5000U 静脉滴注。同时按下述方法应用rt-PA: (1)国际习用加速给药法:15mg静脉推注,0.75mg/kg(不超过50mg)30分钟内静脉滴注,随后0.5mg/kg(不超过35mg)60分钟内静脉滴注。总量≤100mg。 (2)近年来国内试用小剂量法:8mg静脉推注,42mg于90分钟内静脉滴注。总量为50mg。rt-PA滴毕后应用肝素每小时700~1000U,静脉滴注48小时,监测APTT维持,在60~80秒,以后皮下注射肝素7500U,每12小时一次,持续3~5天。

急性心梗溶栓指南1

急性心肌梗塞溶栓疗法指南 一、原则 应在急性心肌梗塞发病后,争分夺秒,尽力缩短患者入院至开始溶栓的时间,目的是使梗塞相关血管得到早期、充分、持续再开通。 二、选择对象的条件 1.持续性胸痛≥半小时,含服硝酸甘油症状不缓解。 2.相邻两个或更多导联ST段抬高在肢体导联>0. 1m V、胸导>0. 2m V。 3.发病≤6小时者。 4.若患者来院时已是发病后6~12小时,心电图ST段抬高明显伴有或不伴有严重胸痛者仍可溶栓。 5.年龄≤70岁。70岁以上的高龄AMI患者,应根据梗塞范围,患者一般状态,有无高血压、糖尿病等因素,因人而异慎重选择。 三、禁忌证 1.两周内有活动性出血(胃肠道溃疡、咯血等),做过内脏手术、活体组织检查,有创伤性心肺复苏术,不能实施压迫的血管穿刺以及有外伤史者。 2.高血压病患者经治疗后在溶栓前血压仍≥21 . 3/1 3. 3k Pa(160/100mm H g)者。 3.高度怀疑有夹层动脉瘤者。 4.有脑出血或蛛网膜下腔出血史, >6小时至半年内有缺血性脑卒中(包括TIA)史。 5.有出血性视网膜病史。 6.各种血液病、出血性疾病或有出血倾向者。 7.严重的肝肾功能障碍或恶性肿瘤等患者。 四、溶栓步骤 溶栓前检查血常规、血小板计数、出凝血时间及血型。 (一)即刻口服水溶性阿司匹林 0.15~0. 3g,以后每日0.15~0.3g, 3~5日后改服50~150mg,出院后长期服用小剂量阿司匹林。 (二)静脉用药种类及方法 1.尿激酶(UK ):150万IU (约 2. 2万IU/kg )用10ml生理盐水溶解,再加入100ml 5%~10%葡萄糖液体中, 30分钟内静脉滴入。尿激酶滴完后12小时,皮下注射肝素7500U,每12小时一次,持续3~5天。 2.链激酶(SK)或重组链激酶(rSK):150U用10ml生理盐水溶解,再加入100ml 5%~10%葡萄糖液体中, 60分钟内静脉滴入。 3.重组组织型纤溶酶原激活剂(rt-PA):用rt- PA前先给予肝素5000U静脉滴注。同时按下述方法应用rt- PA: (1)国际习用加速给药法:15mg静脉推注,0. 75mg/kg(不超过50mg)30分钟内静脉滴注,随后0. 5mg/kg(不超过35mg )60分钟内静脉滴注。总量≤100mg。 (2)近年来国内试用小剂量法:8mg静脉推注,42mg于90分钟内静脉滴注。总量为50mg。rt- PA滴毕后应用肝素每小时700~1000U,静脉滴注48小时,监测APTT维持,在60~80秒,以后皮下注射肝素7500U,每12小时一次,持续3~5天。 五、监测项目 (一)临床监测项目 1.症状及体征:经常询问患者胸痛有无减轻以及减轻的程度,仔细观察皮肤、粘膜、咳痰、呕吐物及尿中有无出血征象。 2.心电图记录:溶栓前应做18导联心电图,溶栓开始后3小时内每半小时复查一次12导联心电图,(正后壁、右室梗塞仍做18导联心电图)。以后定期做全套心电图导联电极位置应严格固定。 (二)用肝素者需监测凝血时间 可用L ee White三管法,正常为4~12分钟;或APTT法,正常为35~45秒。

急性缺血性卒中rt-PA静脉溶栓治疗手册

急性缺血性卒中rt-PA静脉溶栓治疗手册目录 一、rt-PA静脉溶栓登记表 (一)一般项目 (二)入选及排除标准 (三)筛选结果是否适合溶栓 (四)填写溶栓治疗知情同意书 二、rt-PA静脉溶栓操作流程 (一)溶栓前处理 (二)溶栓中处理 (三)溶栓后处理 三、rt-PA静脉溶栓治疗急性缺血性脑血管病知情同意书 四、美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS) 五、改良Rankin量表 六、Barthel 指数(BI)

一、rt-PA静脉溶栓登记表 (一)一般项目 病人姓名:住院号:发病时间:达到医院时间: 表格填写时间:表格填写医生: (二)入选及排除标准 表格填写医生必须严格按照以下标准入选和排除rt-PA静脉溶栓病人: 1. rt-PA静脉溶栓病人入选标准:以下任何一项答为“否”不能溶栓 1) 年龄18~80岁是否 2) 临床符合缺血性脑卒中诊断,NIHSS评分>4分是否 3) 从卒中症状发生到治疗的时间窗在3小时以内是否 4) 卒中临床表现持续至少30min,在治疗前未有明显改善是否 5) 既往卒中未遗留明显后遗症(mRS≤1)是否 6) CT(-),或仅有CT梗塞早期表现是否 7) MRI: DWI高信号且≤MCA1/3[注3],并且ADC低信号 Flair(+)/或(-),但T2,T1(-) 是否 8) 患者及家属愿意接受rt-PA静脉溶栓并签署知情同意书是否[注1]70岁以上者谨慎采用溶栓治疗。 [注2]CT梗塞早期表现定义为:患侧脑是指肿胀,与对侧比较脑沟脑回消失,有/或无患侧脑室受挤压征象但无中线移位;患侧脑实质白质与灰质界限模糊或消失;有/或无大脑中动脉征。 [注3] DWI高信号≥MCA1/3~≤1/2时,根据具体临床情况酌情确定是否溶栓,但DWI高信号>MCA1/2时因出血危险增加一般不采用溶栓治疗。 2. 排除标准(以下任一项答为“是”不能溶栓) 1)急诊CT检查有以下一项者不能入组是否 检查发现高密度病灶(出血)、是否 明显的占位效应伴中线移位(梗塞范围大)、是否 急性低密度病灶是否 颅内肿瘤是否 动静脉畸形是否

SPM中文教程 汇总(已整理)

一、SPM的安装与启动 先安装matlab,然后将SPM复制到matlab下的一个文件夹(SPM2需要matlab6.0或以上版本)。启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入SPM即可启动,然后选择fMRI,也可以直接输入SPM fMRI 二、SPM数据处理概要 先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。 三、SPM8数据处理的一般步骤 为方便后续的数据处理,如果数据分散处理后整合,建议所有处理数据路径保持一致,要统一路径。处理前首先要采用数据转换软件将dicom数据转换成SPM解析格式,然后进行数据预处理,预处理结束后到matlab安装目录中备份spm*.ps文件,其中包含了空间校正和标准化的信息,然后进行建模分析。 运行命令:spm fmri,打开spm8的操作界面 我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。 在spm8和spm5中,每一步处理都采用了直观的“树形结构”的面板,如果一个分支项左面有“+”号,你可以双击显示子分支项,如果一个分支项右面有“<-X”号,你必须为之指定选项(否则不能运行该tree),分支项的选项在其右侧面板指定,而帮助信息则在下面的面板中显示。如果我们处理数据没

有特殊需求,我们只关心带有“<-X”项目并完成输入即可,其余均可采用默认设置。另外注意在Tree Building Window的顶部菜单,新增了一个菜单项“TASKS”,在使用批处理分析时非常重要。 以下内容,还可以参考E:\《汇总》中“静息态fMRI的数据预处理流程”这部分的讲述。 1、转换数据 dicom格式转换为img文件,将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。转换时格式请选择NIfTI,可用SPM输入面板中的DiCOM Import模块转换,也可以采用专门的转换软件,如MRIcovert。 2、Slice timing 校正1个volume中层与层之间获取(采集)时间的差异,即纠正slice(下译为扫描层)之间采集时间的差异。这对事件相关设计的实验尤为重要,使一个TR中的各层获得时间一致(如都在一个TR的开始),相当于AFNI中tshift所做的工作。校正后的新文件名为:a+原文件名。 原理概述:Sliceorder(扫描层序数)用于指明扫描层被采集时的顺序,其总数为n,n即一个volume (volume为一个TR时间内的扫描量)里面所包含的扫描层的总数。每个Sliceorder(扫描层系数)同时指明了每个扫描层在图像文件中的存储位置。因此扫描层系数表明了扫描层被采集时的时间顺序。我们可以用SPM的Display功能来查看这个顺序。移动鼠标的十字准线到Z 坐标为1的位置时,我们看到的就是一个volume里面第一个slice(扫描层)上的象元(voxel)。核磁仪采集数据的时间精度为一个TR,因此我们通常默认一个TR内采集到的数据(一个volume)采自完全相同的时间。但事实并非如此,一个TR内我们需要采集很多扫描层(例如20层)的数据以覆盖较大的脑区(通常是全脑)。这些扫描层是一个接一个按照上面所说的sliceorder(扫描层序数)的顺序来采集的,因此各个扫描层之间的采集时间是有差异的。Slice timing这一步所要做的就是通过一定的算法纠正这一时间差异。常规的纠正方法是在保持整段采集信号不变的条件下推前或者推后采集的起始时间。这可以通过简单的移动采集信号的正弦相位来做到。一种常用的数学转换方法:傅立叶转换可以把任何复杂信号转换为由不同频率和相位的简单正弦曲线的线性组合。这样,只要通过加入一个常数到每个频率的相位中,就可以达到移动数据起始和结束时间的目的。 我们在按钮窗口中的预处理面板中点击“Slice Timimg”,将出现如下对话框:

spm8-fMRI大数据处理

目录 SPM简介和安装 (1) 一、数据准备(先设置数据输入和输出目录,再转换数据格式) (2) 二、数据预处理流程 (2) 0、预处理的workflow (2) 1、Slice Timing时间层校正 (3) 2、Realignment 头动校正 (3) 3、Coregister 配准 (5) 4、Segment 分割 (6) 5、Normalize 空间标准化 (6) 6、Smooth 平滑 (8) 三、GLM模型和Specify 1st-level (9) 四、实例:任务态数据预处理和一阶分析的批处理 (13) SPM简介和安装 SPM,即统计参数图,也是这个软件的最终输出,它是由英国伦敦大学的Friston教授等人在通用数学软件包Matlab基础上开发的软件系统,其统计功能非常强大,设计这个软件包的初衷是采用统计的方法来处理fMRI,PET和SPECT的数据。用SPM进行数据处理分析过程主要分为两大部分:预处理过程和统计分析过程。需要注意的是,静息态、任务态和DTI数据的预处理大致框架一致,但具体步骤不同,本教程主要讲任务态数据处理。 数据预处理主要包括三个大框架:(1)Convert dicom files to hdr files and img images;(2) Temporal processing,即Slice Timing;(3)Spatial processing,包括 Realign、Normalize和Smooth。具体步骤下面有讲。 统计分析过程包括:个体分析和组分析。使用Specify 1st level 做单个被试(single subject)分析;使用 Specify 2nd level做组分析(group analysis)。 先写一下SPM8的安装:有必要说一下SPM实际不是一个独立的软件,它相当于一个用Matlab程序编写的工具箱,必须依赖Matlab的环境完成其功能。言归正传,首先将下载好的SPM8程序包导入Matlab,复制整个spm8文件夹到MATLAB的安装路径: MATLAB\R2009a\toolbox\下。然后运行Matlab,在其主窗口选择File->set path->Add with Subfolders->spm8->save->close。设置完成后在Matlab中执行命令>>spm fmri。这样出现了spm8的操作界面(如下图),这也表示spm8安装成功!我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。

脑梗塞动静脉溶栓治疗指南及操作流程

脑梗塞动静脉溶栓治疗指南及操作流程 一、动、静脉溶栓总适应症 1、急性脑梗死; 2、发病4.5h内(选择全身静脉内溶栓),发病在4.5h-6h以内者(如怀疑为进展性卒中可延至 12h,基底动脉血栓可延至48h)选择动脉内局部介入溶栓; 3、年龄18-80岁; 4、脑功能损害的体征持续在一个小时以上,且比较严重(美国国立卫生研究院卒中量表NIHSS 在7~22分);如有明显瘫痪等神经定位体征者肌力低于IV级。 5、无明显意识障碍,神志不应差于嗜睡。但椎基底动脉血栓形成有意识障碍者,也可采用溶栓治疗。 6、脑CT无脑出血,未见明显的与神经功能缺损相对应的低密度病灶。或血管造影证实颅内血栓及部位。 7、家属同意。且患者或家属签署知情同意书。 二、动、静脉溶栓总禁忌症: 1、年龄>80岁; 2、血压>200/120mmHg;经治疗后,血压能降低到160/90mmHg左右者除外。 2、活动性内出血、颅内肿瘤、脑动脉瘤、脑血管畸形或近期发生脑出血者;体检发现有活动性出血或外伤(如骨折)的证据,近两周进行过大的外科手术。 3、神经系统症状核体征轻微(如肌力≤Ⅳ级)或病后症状体征明显改善者(如TIA); 4、口服抗凝药或出血素质者(INR>1.5,血小板计数<100,000/mm3 ); 5、严重心、肝、肾等实质脏器疾病。 三、动、静脉溶栓总体流程 有局灶定位体征患者 生化检查(血糖、出凝血全套、血常规、急诊九项、肌钙蛋白) 头部CT 低密度影或正常高密度影(缺血性卒中) (出血性卒中) 4.5h以内 4.5h以内 6h以内静脉溶栓常规治疗动脉溶栓(无禁忌症)(有禁忌症)(无禁忌症)动脉介入溶栓流程术前处理签署同意书、商讨溶栓药(尿激酶、爱通立)、通知介入室相关人员到位术前准备术前备药术前用药(备腹股沟区皮肤(尼莫通 NS250ml+胞二磷胆碱0.5 套尿套或停留尿管介入室已备有尿激酶 NS20ml+地塞米松5mg 碘试、左下肢留置 如rtPA则需取药)针、静脉推注泵)立即通知介入室、尽快送介入室术后处理术后处理:密切观察生命体征,血压控制在160/90mmHg或患者发病前水平为宜 24小时内绝对卧床24h,24h后复查CT 不用抗凝、抗血小板药测颅规、NIHSS评分q1hX6 24小时后观察足

SPM中文教程汇总已

S P M中文教程汇总已 Revised as of 23 November 2020

一、SPM的安装与启动 先安装matlab,然后将SPM复制到matlab下的一个文件夹(SPM2需要或以上版本)。启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入SPM即可启动,然后选择fMRI,也可以直接输入SPM fMRI 二、SPM数据处理概要 先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。 三、SPM8数据处理的一般步骤 为方便后续的数据处理,如果数据分散处理后整合,建议所有处理数据路径保持一致,要统一路径。处理前首先要采用数据转换软件将dicom数据转换成SPM解析格式,然后进行数据预处理,预处理结束后到matlab安装目录中备份spm*.ps文件,其中包含了空间校正和标准化的信息,然后进行建模分析。 运行命令:spm fmri,打开spm8的操作界面 我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。

在spm8和spm5中,每一步处理都采用了直观的“树形结构”的面板,如果一个分支项左面有“+”号,你可以双击显示子分支项,如果一个分支项右面有“<-X”号,你必须为之指定选项(否则不能运行该tree),分支项的选项在其右侧面板指定,而帮助信息则在下面的面板中显示。如果我们处理数据没有特殊需求,我们只关心带有“<-X”项目并完成输入即可,其余均可采用默认设置。另外注意在Tree Building Window的顶部菜单,新增了一个菜单项“TASKS”,在使用批处理分析时非常重要。 以下内容,还可以参考E:\《汇总》中“静息态fMRI的数据预处理流程”这部分的讲述。 1、转换数据 dicom格式转换为img文件,将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。转换时格式请选择NIfTI,可用SPM输入面板中的DiCOM Import模块转换,也可以采用专门的转换软件,如MRIcovert。 2、Slice timing 校正1个volume中层与层之间获取(采集)时间的差异,即纠正slice(下译为扫描层)之间采集时间的差异。这对事件相关设计的实验尤为重要,使一个TR中的各层获得时间一致(如都在一个TR的开始),相当于AFNI中tshift所做的工作。校正后的新文件名为:a+原文件名。 原理概述:Sliceorder(扫描层序数)用于指明扫描层被采集时的顺序,其总数为n,n即一个volume(volume为一个TR时间内的扫描量)里面所包含的扫描层的总数。每个Sliceorder(扫描层系数)同时指明了每个扫描层在图像文件中的存储位置。因此扫描层系数表明了扫描层被采集时的时间顺序。我们可以用SPM的Display功能来查看这个顺序。移动鼠标的十字准线到 Z 坐标为1的位置时,我们看到的就是一个volume里面第一个slice(扫描层)上的象元(voxel)。核磁仪采集数据的时间精度为一个TR,因此我们通常默认一个TR内采集到的数据(一个volume)采自完全相同的时间。但事实并非如此,一个TR内我们需要采集很多扫描层(例如20层)的数据以覆盖较大的脑区(通常是全脑)。这些扫描层是一个接一个按照上面所说的sliceorder(扫描层序数)的顺序来采集的,因此各个扫描层之间的采集时间是有差异的。Slice timing这一步所要做的就是通过一定

卒中病房急诊溶栓手册打印稿

神经内科卒中病房急诊溶栓治疗操作手册 2010年05月30日(第一版)

本手册是在遵循中国脑血管病诊治指南2010、欧美国家关于rt-PA溶栓指南的基础上,参考首都医科大学附属天坛医院神经内科的相关文件,结合我院神经内科的实际情况和多位专家的意见制定而成。感谢包仕尧教授、刘春风教授、赵合庆主任在本手册制定过程中给予的支持和帮助。 外院人员,仅供参考。 曹勇军、章春园、肖国栋 2010-05-30

——关于缺血性卒中超早期溶栓治疗的推荐 (一)改善脑血循环 1.溶栓:溶栓治疗是目前最重要的恢复血流措施,重组组织型纤溶酶原激活剂(rt-PA)和尿激酶(UK)是我国目前使用的主要溶栓药,目前认为有效措施抢救半暗带组织的时间窗为4.5h内或6h 内。 (1)静脉溶栓:1)rt-PA:已有多个临床试验对急性脑梗死rt-PA静脉溶栓疗效和安全性进行了评价,其治疗时间窗包括发病后3h内、6h内或3~4.5h。NINDS试验显示,3h内rt-PA 静脉溶栓组3个月完全或接近完全神经功能恢复者显著高于安慰剂组,两组病死率相似。症状性颅内出血发生率治疗组高于对照组。ECASS试验显示,在发病3~4.5h静脉使用rt-PA仍然有效。Cochrane系统评价rtPA溶栓的亚组分析显示,6h内静脉rtPA溶栓明显降低远期死亡或残疾,但显著增加致死性颅内出血率,每治疗1000例患者可减少55例死亡或残疾。用多模式MRI或CT帮组选择超过3h但存在半暗带可以溶栓的患者仍处于研究阶段。rt-PA除出血风险外,有出现血管源性水肿引起呼吸道部分梗阻的报道。2)尿激酶:我国九五攻关课题“急性缺血性脑卒中6h内的尿激酶静脉溶栓治疗”试验分为2个阶段。

spm8fMRI数据处理

目录
SPM 简介与安装..............................................................................................................................1 一、数据准备(先设置数据输入与输出目录,再转换数据格式) ...................................................2 二、数据预处理流程 ....................................................................................................................... 2 0、预处理的 workflow ....................................................................................................................2 1、Slice Timing 时间层校正 ...........................................................................................................2 2、Realignment 头动校正 ..............................................................................................................3 3、Coregister 配准..........................................................................................................................5 4、Segment 分割.............................................................................................................................6 5、Normalize 空间标准化..............................................................................................................6 6、Smooth 平滑 ..............................................................................................................................8 三、GLM 模型与 Specify 1st-level.................................................................................................9 四、实例:任务态数据预处理与一阶分析的批处理 .................................................................... 13
SPM 简介与安装
SPM,即统计参数图,也就是这个软件的最终输出,它就是由英国伦敦大学的 Friston 教授 等人在通用数学软件包 Matlab 基础上开发的软件系统,其统计功能非常强大,设计这个软件 包的初衷就是采用统计的方法来处理 fMRI,PET 与 SPECT 的数据。用 SPM 进行数据处理
分析过程主要分为两大部分:预处理过程与统计分析过程。需要注意的就是,静息态、任务态 与 DTI 数据的预处理大致框架一致,但具体步骤不同,本教程主要讲任务态数据 处理。
数据预处理主要包括三个大框架:(1)Convert dicom files to hdr files and img images;(2) Temporal processing,即 Slice Timing;(3)Spatial processing, 包括 Realign、Normalize 与 Smooth。具体步骤下面有讲。
统计分析过程包括:个体分析与组分析。使用 Specify 1st level 做单个被 试(single subject)分析;使用 Specify 2nd level 做组分析(group analysis)。
先写一下 SPM8的安装:有必要说一下 SPM 实际不就是一个独立的软件,它相当于一个 用 Matlab 程序编写的工具箱,必须依赖 Matlab 的环境完成其功能。言归正传,首先将下载好 的 SPM8程序包导入 Matlab,复制整个 spm8文件夹到 MATLAB 的安装路 径:MATLAB\R2009a\toolbox\下。然后运行 Matlab,在其主窗口选择 File->set path->Add with Subfolders->spm8->save->close。设置完成后在 Matlab 中执行命令>>spm fmri。这样 出现了 spm8的操作界面(如下图),这也表示 spm8安装成功!我们称左上侧的窗口为按钮窗 口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或 图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。

spm8-fMRI数据处理

目录
SPM 简介和安装.............................................................................................................................. 1 一、数据准备(先设置数据输入和输出目录,再转换数据格式) ........................................... 2 二、数据预处理流程....................................................................................................................... 2 0、预处理的 workflow .................................................................................................................... 2 1、Slice Timing 时间层校正 ........................................................................................................... 2 2、Realignment 头动校正 .............................................................................................................. 3 3、Coregister 配准 .......................................................................................................................... 5 4、Segment 分割............................................................................................................................. 6 5、Normalize 空间标准化 .............................................................................................................. 6 6、Smooth 平滑 .............................................................................................................................. 8 三、GLM 模型和 Specify 1st-level ................................................................................................. 9 四、实例:任务态数据预处理和一阶分析的批处理 ................................................................. 13
SPM 简介和安装
SPM,即统计参数图,也是这个软件的最终输出,它是由英国伦敦大学的 Friston 教授 等人在通用数学软件包 Matlab 基础上开发的软件系统,其统计功能非常强大,设计这个软 件包的初衷是采用统计的方法来处理 fMRI,PET 和 SPECT 的数据。用 SPM 进行数据处 理分析过程主要分为两大部分:预处理过程和统计分析过程。需要注意的是,静息态、任务
态和 DTI 数据的预处理大致框架一致,但具体步骤不同,本教程主要讲任务态数 据处理。 数据预处理主要包括三个大框架:(1)Convert dicom files to hdr files and img images;(2) Temporal processing,即 Slice Timing;(3)Spatial processing,包括 Realign、Normalize 和 Smooth。具体步骤下面有讲。 统计分析过程包括:个体分析和组分析。使用 Specify 1st level 做单个 被试(single subject)分析;使用 Specify 2nd level 做组分析(group analysis)。
先写一下 SPM8的安装:有必要说一下 SPM 实际不是一个独立的软件,它相当于一个 用 Matlab 程序编写的工具箱,必须依赖 Matlab 的环境完成其功能。言归正传,首先将下载 好的 SPM8程序包导入 Matlab,复制整个 spm8文件夹到 MATLAB 的安装路径: MATLAB\R2009a\toolbox\下。然后运行 Matlab,在其主窗口选择 File->set path->Add with Subfolders->spm8->save->close。设置完成后在 Matlab 中执行命令>>spm fmri。这样出现 了 spm8的操作界面(如下图) ,这也表示 spm8安装成功!我们称左上侧的窗口为按钮窗口 (button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或 图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。

SPM中文教程汇总已修订版

S P M中文教程汇总已 Document number:PBGCG-0857-BTDO-0089-PTT1998

一、SPM的安装与启动 先安装matlab,然后将SPM复制到matlab下的一个文件夹(SPM2需要或以上版本)。启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入SPM即可启动,然后选择fMRI,也可以直接输入SPM fMRI 二、SPM数据处理概要 先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。 三、SPM8数据处理的一般步骤 为方便后续的数据处理,如果数据分散处理后整合,建议所有处理数据路径保持一致,要统一路径。处理前首先要采用数据转换软件将dicom数据转换成SPM解析格式,然后进行数据预处理,预处理结束后到matlab安装目录中备份spm*.ps文件,其中包含了空间校正和标准化的信息,然后进行建模分析。 运行命令:spm fmri,打开spm8的操作界面 我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。

在spm8和spm5中,每一步处理都采用了直观的“树形结构”的面板,如果一个分支项左面有“+”号,你可以双击显示子分支项,如果一个分支项右面有“<-X”号,你必须为之指定选项(否则不能运行该tree),分支项的选项在其右侧面板指定,而帮助信息则在下面的面板中显示。如果我们处理数据没有特殊需求,我们只关心带有“<-X”项目并完成输入即可,其余均可采用默认设置。另外注意在Tree Building Window的顶部菜单,新增了一个菜单项“TASKS”,在使用批处理分析时非常重要。 以下内容,还可以参考E:\《汇总》中“静息态fMRI的数据预处理流程”这部分的讲述。 1、转换数据 dicom格式转换为img文件,将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。转换时格式请选择NIfTI,可用SPM输入面板中的DiCOM Import模块转换,也可以采用专门的转换软件,如MRIcovert。 2、Slice timing 校正1个volume中层与层之间获取(采集)时间的差异,即纠正slice(下译为扫描层)之间采集时间的差异。这对事件相关设计的实验尤为重要,使一个TR中的各层获得时间一致(如都在一个TR的开始),相当于AFNI中tshift所做的工作。校正后的新文件名为:a+原文件名。 原理概述:Sliceorder(扫描层序数)用于指明扫描层被采集时的顺序,其总数为n,n即一个volume(volume为一个TR时间内的扫描量)里面所包含的扫描层的总数。每个Sliceorder(扫描层系数)同时指明了每个扫描层在图像文件中的存储位置。因此扫描层系数表明了扫描层被采集时的时间顺序。我们可以用SPM的Display功能来查看这个顺序。移动鼠标的十字准线到 Z 坐标为1的位置时,我们看到的就是一个volume里面第一个slice(扫描层)上的象元(voxel)。核磁仪采集数据的时间精度为一个TR,因此我们通常默认一个TR内采集到的数据(一个volume)采自完全相同的时间。但事实并非如此,一个TR内我们需要采集很多扫描层(例如20层)的数据以覆盖较大的脑区(通常是全脑)。这些扫描层是一个接一个按照上面所说的sliceorder(扫描层序数)的顺序来采集的,因此各个扫描层之间的采集时间是有差异的。Slice timing这一步所要做的就是通过一定

急性脑梗塞动静脉溶栓治疗指南及操作流程(终审稿)

急性脑梗塞动静脉溶栓 治疗指南及操作流程 文稿归稿存档编号:[KKUY-KKIO69-OTM243-OLUI129-G00I-FDQS58-MG129]

急性脑梗塞动静脉溶栓治疗指南及操作流程 一、动、静脉溶栓总适应症 1、急性脑梗死; 2、发病4.5h内(选择全身静脉内溶栓),发病在4.5h-6h以内者(如怀疑为 进展性卒中可延至12h,基底动脉血栓可延至48h)选择动脉内局部介入溶栓; 3、年龄18-80岁; 4、脑功能损害的体征持续在一个小时以上,且比较严重(美国国立卫生研究 院卒中量表NIHSS在7~22分);如有明显瘫痪等神经定位体征者肌力低于IV 级。 5、无明显意识障碍,神志不应差于嗜睡。但椎基底动脉血栓形成有意识障碍者,也可采用溶栓治疗。 6、脑CT无脑出血,未见明显的与神经功能缺损相对应的低密度病灶。或血管造影证实颅内血栓及部位。 7、家属同意。且患者或家属签署知情同意书。 二、动、静脉溶栓总禁忌症: 1、年龄>80岁; 2、血压>200/120mmHg;经治疗后,血压能降低到160/90mmHg左右者除 外。 2、活动性内出血、颅内肿瘤、脑动脉瘤、脑血管畸形或近期发生脑出血者; 体检发现有活动性出血或外伤(如骨折)的证据,近两周进行过大的外科手术。

3、神经系统症状核体征轻微(如肌力≤Ⅳ级)或病后症状体征明显改善者(如TIA); 4、口服抗凝药或出血素质者(INR>1.5,血小板计数<100,000/mm3); 5、严重心、肝、肾等实质脏器疾病。 三、动、静脉溶栓总体流程 有局灶定位体征患者生化检查 (血糖、出凝血全套、血常规、急诊九项、肌钙蛋白) 头部CT 低密度影或正常高密度影 (缺血性卒中)(出血性卒中) 4.5h以内4.5h以内6h以内 静脉溶栓常规治疗动脉溶栓 (无禁忌症)(有禁忌症)(无禁忌症) 动脉介入溶栓流程 术前处理 签署同意书、商讨溶栓药(尿激酶、爱通立)、通知介入室相关人员到位 术前准备术前备药术前用药 (备腹股沟区皮肤(尼莫通NS250ml+胞二磷胆碱0.5 套尿套或停留尿管介入室已备有尿激酶NS20ml+地塞米松5mg?碘试、左下肢留置如rtPA则需取药) 针、静脉推注泵) 立即通知介入室、尽快送介入室

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