XRCC1Arg399Gln位点多态性和结直肠癌易感性关系的Meta分析

XRCC1Arg399Gln位点多态性和结直肠癌易感性关系的Meta分析

XRCC1Arg399Gln Polym orph is m a n d Colore cta l Ca n ce r S u s ce ptibility:a Me ta-a n a lys is Z HANG C ha o,MA L a n-jing

张超,马澜婧(第二军医大学长海医院实习大队,上海200433)

摘要:[目的]探讨X射线交叉互补修复基因1(X-ray repair cross-complementing group1,XRCC1)的399位点(Arg399Gln)多态性与结直肠癌(CRC)易感性的关系。[方法]检索中国生物医学数据库(CBM)、PubMed、Springer等数据库,获取有关XRCC1Arg399Gln多态性同结直肠癌易感性关系的病例对照研究并进行Meta分析,以病例组及对照组XRCC1Arg399Gln等位基因分布的比值比(OR)为效应指标,应用Meta分析软件Review Manager(version5.0.10)对各研究原始数据进行统计处理及异质性检验,计算合并OR值及其95%可信区间(95%CI)。[结果]纳入11项病例对照研究,共2287例结直肠癌患者和3485例对照,Meta分析结果显示,Gln/Gln vs.Arg/Arg OR=1.12,95%CI为0.76~1.65,Z=0.58,P OR=0.56;Gln/Gln+Arg/Gln vs.Arg/Arg OR=1.11,95%CI为0.85~1.44,Z=0.78,P OR=0.43;Gln/Gln vs.Arg/Arg+Arg/Gln OR=1.07,95%CI为0.79~1.46,Z=0.43,P OR=0.67;Arg/Gln vs.Arg/Arg OR=1.14,95% CI为0.88~1.48,Z=1.02,P OR=0.31。[结论]XRCC1Arg399Gln多态性与结直肠癌易感性之间无显著相关性。

关键词:结直肠癌;XRCC1;基因多态性;Meta分析

中图分类号:R735.3文献标识码:A文章编号:1004-0242(2010)05-0343-05

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)发病率在全球最常见的癌症中居第3位[1]。我国结直肠癌的发病率虽较发达国家低,但近年来有明显增加趋势。结直肠癌的发生是外界环境与遗传因素共同作用的结果。外部环境因素通过对基因的载体DNA的影响而在结直肠癌的发生中发挥作用。双生子对照研究表明遗传因素在结直肠癌发生中的作用占到35%[2]。因此基因的稳定性,即DNA损伤后的修复能力可能与结直肠癌的发生相关,同时也可能决定了不同个体对结直肠癌易感性的不

同。X射线交叉互补修复基因1

(X-ray repair cross-complementing

group1,XRCC1)是DNA损伤修

复基因的一种,人类XRCC1基因

位于19号染色体的长臂(q13.2~

q13.3),全长33kb[3]。XRCC1编码

的蛋白质虽然没有直接的催化活

性,但能与DNA聚合酶β、DNA

连接酶Ⅲ、聚(二磷酸腺苷—核

糖)多聚酶(poly ADP-ribose poly-

merase,PARP)结合形成复合体,

发挥重要的支架蛋白的作用,参

与碱基切除修复和DNA单链断

裂修复。目前已经发现XRCC1

基因的编码区有多个单核苷酸多

态性(single nucleotide polymor-

phism,SNP)位点可导致其编码蛋

白相应氨基酸的改变,研究比较

多的有C26304T(Arg194Trp)、

G27466A(Arg280His)和G28152A

(Arg399Gln)。第194密码子和第

280密码子位于DNA聚合酶β

结合区域和PARP结合区域之

间,而第399密码子位于PARP

结合区域,因此推测第399密码

子可能对蛋白功能的影响较大。

XRCC1基因Arg399Gln位点

G→A的变异,导致第399密码

子编码的氨基酸Arg→Gln的改

变,研究表明这一突变降低了

XRCC1修复DNA损伤的能力,

收稿日期:2009-08-24;修回日期:2009-11-22 E-mail:zhangchao987629@https://www.360docs.net/doc/22154895.html,

表1

纳入Meta 分析的文献基本情况

第一作者

Abdel -RahmanaSZ [16]Krupa R [17]Hong YC [18]

Skjelbred CF [19]Moreno V [20]Stern MC [21]Yeh CC [22]

Martinez -Balibrea E [23]Sliwinski T [24]Kasahara M [25]宋华宁[26]时间20002004200520062006200720072007200820082008人群

埃及波兰韩国挪威德国

新加坡(华裔)台湾西班牙波兰日本中国

基因型分布情况

Arg/Arg 22231126315416740730474291

Arg/Gln 21198870160112260333799

Gln/Gln 5992441155171627

26*对照组

Arg/Arg Arg/Gln Gln/Gln 3739136148137607384393962165

94564187145428291324583

21696440855411167

59*

*:原文中只给出基因型Arg/Gln +Gln/Gln 的总数据

使DNA 聚合物、红细胞血型糖蛋白A (glycophorin A ,GPA )突变、淋巴细胞姊妹染色单体互换(sis -

ter chromatid exchange ,SCE )增加。但是DNA 聚合物、GPA 突变、SCE 增加只是肿瘤发生的标志物,与肿瘤发生不可直接等同[4]。

目前,国内外已有多个研究分析了XRCC1基因399位点多态性同结直肠癌易感性之间的关系,但结果不尽一致,且多为小样本研究。本文拟对国内外正式发表的有关XRCC1基因399位点多态性同结直肠癌易感性关系的病例对照研究进行Meta 分析,以综合评价XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性之间的关系。

1

材料与方法

1.1

资料来源

通过检索中国生物医学数据

库(CBM )、PubMed 、Springer 等数据库,辅以文献追溯和人工检索的方法,收集国内外2000~2009年间公开发表的关于XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性关系的病例对照研究,中文主题词包括:结直肠癌、X 射线交叉互补修复基因1、基因多态性;英文主题词包括:colorec -

tal cancer ,X -ray repair cross -complementing group 1,XR -CC1,genetic polymorphism 。1.2纳入标准

文献的研究类型是已发表的病例对照研究,语言种类为英文或中文;原文给出明确的XRCC1Arg399Gln 基因型频数,以用来计算比值比(odds ratio ,OR )及其95%可

信区间(confidential interval ,CI);对照组基因型分布符合H -W 遗传平衡检验。

1.3排除标准

原始文献试验设计不严谨

(如诊断判定标准不规范、样本资料交代不清或不全等);重复发表

的文献;综述或个案报道。

1.4数据提取与统计学处理提取入选文献的的第一作

者、发表年份、样本来源、病例组和对照组人数以及各基因型频数等信息。应用Meta 分析软件

Review Manager (version 5.0.10)

进行统计分析。先评价各研究间的异质性,若各研究间无显著异质性则采用固定效应模型(fixed

effects model ,FEM )进行数据合并,否则采用随机效应模型(ran -dom effects model ,REM )[5]。计算

各研究及合并数据的比值比及其

95%CI ,给出森林图,展示各研究

结果及特征,根据漏斗图以及

Egger 法,进行线性回归分析,评

价发表偏倚。

2

结果

2.1

文献数据描述

根据文献检索方案,共检索

到126篇相关文献,经过阅读摘

要后初步纳入21篇文献。按照入选和排除标准,有10篇文献被排除,其中包括三项关于结直肠腺瘤的研究[6~8],两篇文献与纳入文献引用相同的数据[9,10],两篇不含相关基因型数据[11,12],三项研究的对照组不符合H -W 遗传平衡检验[13~15](P Improta G =0.049<0.05;P 金明娟=

0.023;P Ren Z =0.001)。最终共纳入11篇文献,包括英文10篇[16~25],中文1篇[26]。共累计结直肠癌病例2287例,对照3485例,见表1。

2.2Meta 分析结果

表2列出了Meta 分析的主

要结果。我们共进行了四组基因模型的分析,对于这四种模型的异质性检验,大多I 2均大于

50%,且P H 均大于0.1,说明异质

性达到显著水平,故均采用随机效应模型进行数据合并。我们发现异质性显著的原因主要来自宋华宁的研究[26]。当我们去除宋华宁的研究后,I 2均明显减小,P H 大多大于0.1。然而加上宋华宁的研究后并不影响Meta 分析的结果。

四组基因型的分析结果如

下:Gln/Gln vs.Arg/Arg OR =

1.12,95%CI 为0.76~1.65,Z =0.58,P OR =0.56;Gln/Gln +Arg/Gln vs.Arg/Arg OR =1.11,95%CI 为0.85~1.44,Z =0.78,P OR =0.43;Gln/

表2

XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性Meta 分析结果

基因型

Gln/Gln vs.Arg/Arg

Gln/Gln +Arg/Gln vs.Arg/Arg Gln/Gln vs.Arg/Arg +Arg/Gln Arg/Gln vs.Arg/Arg

研究数

(病例数/对照数)

10(1320/2035)11(2287/3485)10(2219/3364)10(2015/3060)比值比

OR[95%CI]Z

P OR 1.12[0.76~1.65]1.11[0.85~1.44]1.07[0.79~1.46]1.14[0.88~1.48]

0.580.780.431.02

0.560.430.670.31异质性检验

I 2(%)

P H

657850740.003<0.000010.03<0.0001

REM *REM REM REM

模型

REM :随机效应模型。

研究者及年份

病例组

Arg/Gln +Gln/Gln 例数

对照组

Arg/Gln +Gln/Gln

例数权重

(%)

OR 值

[95%CI]OR 值

[95%CI]Abdel -Rahmana SZ 2000Hong YC 2005Kasahara M 2008Krupa R 2004

Martinez -Balibrea E 2007Moreno V 2006Skjelbred CF 2006Sliwinski T 2008宋华宁2008Stern MC 2007Yeh CC 2007合计异质性检验:Tau 2=0.14;χ2=46.39,df=10(P <0.00001);I 2=78%总效应:Z =0.78;P =0.43

48209685170355157100217294718

228726

972628402019453126127311

112948209121100823223991002551120729

348511735961431852516190513345

1692 5.310.07.66.97.311.010.28.110.211.512.0

100.0 3.98[1.65~9.59]1.61[1.09~2.39]0.65[0.36~1.19]0.78[0.39~1.54]1.21[0.64~2.30]0.97[0.71~1.31]0.88[0.60~1.28]0.72[0.41~1.26]2.54[1.75~3.68]0.90[0.69~1.17]0.85

[0.69~1.05]

1.11[0.85~1.44]

0.01

0.11

10100

病例组

对照组

图1

XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性Meta 分析森林图

(Gln/Gln +Arg/Gln vs.Arg/Arg )

Gln vs.Arg/Arg +Arg/Gln OR =1.07,95%CI 为0.79~1.46,Z =0.43,P OR =0.67;Arg/Gln vs.Arg/Arg OR =1.14,95%CI 为0.88~1.48,Z =1.02,P OR =0.31。以上结果均说明XRCC1Arg399Gln 多态

性与结直肠癌易感性之间无显著相关性。图1给出了(Gln/Gln +

Arg/Gln)与Arg/Arg 比较的森林

图。

2.3发表偏倚估计

图2中漏斗图的形态未见明

显不对称。按Egger 线性回归法对漏斗图对称性进行定量评价,模型(Gln/Gln +Arg/Gln)vs.Arg/

Arg 的t =0.94,P =0.373>0.05,95%

CI 为-2.17~5.23,

亦说明不存

在明显的发表偏倚。

3讨论

人类的大多数肿瘤是环

境和遗传因素共同作用的结果。环境致癌物或其代谢产物攻击体细胞,并引起DNA 损伤。当DNA 受到损伤后,细胞启动DNA 修复系统修复DNA 损伤,以保证机体基因组的稳定性和准确性。人类细胞参与DNA 损伤修复的基因有130多种,并存在多种DNA 损伤修复机制。当这些修复系统的基因发生突变后,可能会导致其编码蛋白的改变,进而可能影响

DNA 损伤修复系统的正常修复功能,使损伤后的DNA 得不到及

时的修复,最终导致细胞癌变,因此DNA 修复基因多态性可能与肿瘤发生之间有密切的联系。

XRCC1是DNA 损伤修复基因的一种,其编码的蛋白质与DNA 聚合酶β、DNA 连接酶Ⅲ、PARP 结

合形成复合体,发挥重要的支架蛋白的作用,参与碱基切除修复和DNA 单链断裂修复。在已经发现的XRCC1基编码区可以导致其蛋白质相应的氨基酸改变的多个SNP 位点中,研究比较多的有

C26304T (Arg194Trp )、G27466A (Arg280His )和G28152A (Arg399Gln ),第194密码子和第280密码子位于DNA 聚合酶β结合区域和PARP 结合区域之间,而第399密码子位于PARP 结合区域,因此推测第399密码子可能对蛋白

功能的影响较大。因此,作为一种

可能的肿瘤易感基因,XRCC1基因多态性与结直肠癌易感性之间的关系也被广泛地研究过,其中就包括Arg399Gln位点。但由于这些研究多为小样本研究,结果可信度较低,并且也不一致,因此有必要对这些研究结果进行合并分析,以合理评价XRCC1 Arg399Gln多态性与结直肠癌易感性的关联关系。

本次Meta分析通过严格筛选、纳入相关研究,最终对11个研究(共计结直肠癌病例2287例,对照3485例)进行了合并分析。Meta分析结果显示,Gln/Gln vs.Arg/Arg OR=1.12,95%CI为0.76,1.65,Z=0.58,P OR=0.56;Gln/ Gln+Arg/Gln vs.Arg/Arg OR= 1.11,95%CI为0.85~1.44,Z= 0.78,P OR=0.43;Gln/Gln vs.Arg/ Arg+Arg/Gln OR=1.07,95%CI为0.79~1.46,Z=0.43,P OR=0.67;Arg/ Gln vs.Arg/Arg OR=1.14,95%CI 为0.88~1.48,Z=1.02,P OR=0.31,表明XRCC1Arg399Gln多态性与结直肠癌易感性无显著关联。值得关注的是,目前临床研究中也没有发现XRCC1Arg399Gln 与结直肠癌有明显相关性,例如Paré等[27]在一项前瞻性研究中发现XRCC1Arg399Gln与结直肠癌患者对奥沙利铂/5-氟尿嘧啶的临床治疗效果不存在明显相关性,这与我们的分析结果相一致。

目前关于XRCC1基因399位点遗传多态性与肿瘤关系的Meta分析较多,但是结果却不尽一致。Saadat等[28]对20837名乳腺癌患者和22879名对照进行Meta分析,结果显示Gln/Gln可以增加乳腺癌发生的危险度(Gln/Gln vs.Arg/Gln+Arg/Arg OR=1.49,95%CI为1.22~1.81);

Kiyohara等[29]的研究结果显示在

亚洲人群中,Gln/Gln可以增加肺

癌发生的危险度(Gln/Gln vs.

Arg/Arg OR=1.34,95%CI=1.16~

1.54),但在高加索人中却没有发

现明显相关性(Gln/Gln vs.Arg/

Arg OR=0.94,95%CI为0.80~

1.11)。同样,在亚洲人群中,Geng

等[30]也发现Gln/Gln可以增加前

列腺癌发生的危险度(Gln/Gln

vs.Arg/Gln+Arg/Arg OR=

1.43,95%CI为1.02~

2.00)。Zhang

等[31]却发现绝经前的妇女中,Gln/

Gln组乳腺癌的发病率减少(Gln/

Gln vs.Arg/Arg OR=0.60,95%CI

为0.40~0.90)。而Geng等[32]以及

Lao等[33]的研究亦表明

Arg399Gln多态性与胃癌以及膀

胱癌无明显相关。我们关于

XRCC1Arg399Gln多态性与结直

肠癌易感性的研究,以及该基因

位点与其他肿瘤易感性研究的结

果不尽相同,其中的原因尚不清

楚,可能是不同的Meta分析入选

和排除标准、入选的病例及对照

人数存在较大差别所致,当然也

可能是同一基因在不同的肿瘤发

生机制中的不同作用所致。

本次Meta分析通过其数学

模型及漏斗图分析,各研究不存

在明显发表偏倚。但由于研究资

料来源于已发表文献之中,无法

获得更详细的资料,因而潜在混

杂如职业、饮食、吸烟和精神等因

素未能控制,显然这些因素会对

研究结果产生一定的影响。例如

Lao等[33]的研究发现XRCC1

Arg399Gln在吸烟的人群中可以

降低膀胱癌的发生率,但在总的

人群中无明显相关性。XRCC1

Arg399Gln多态性与结直肠癌易

感性之间的相关性尚需要更进一

步的多中心、大样本的研究。另

外,本研究只是对XRCC1基因的

399位点进行分析,没有考虑基

因之间以及基因与环境的相互作

用,在将来的研究中可进一步深

入探究,以利于发现结直肠癌的

发病机制。

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