XRCC1Arg399Gln位点多态性和结直肠癌易感性关系的Meta分析
XRCC1Arg399Gln位点多态性和结直肠癌易感性关系的Meta分析
XRCC1Arg399Gln Polym orph is m a n d Colore cta l Ca n ce r S u s ce ptibility:a Me ta-a n a lys is Z HANG C ha o,MA L a n-jing
张超,马澜婧(第二军医大学长海医院实习大队,上海200433)
摘要:[目的]探讨X射线交叉互补修复基因1(X-ray repair cross-complementing group1,XRCC1)的399位点(Arg399Gln)多态性与结直肠癌(CRC)易感性的关系。[方法]检索中国生物医学数据库(CBM)、PubMed、Springer等数据库,获取有关XRCC1Arg399Gln多态性同结直肠癌易感性关系的病例对照研究并进行Meta分析,以病例组及对照组XRCC1Arg399Gln等位基因分布的比值比(OR)为效应指标,应用Meta分析软件Review Manager(version5.0.10)对各研究原始数据进行统计处理及异质性检验,计算合并OR值及其95%可信区间(95%CI)。[结果]纳入11项病例对照研究,共2287例结直肠癌患者和3485例对照,Meta分析结果显示,Gln/Gln vs.Arg/Arg OR=1.12,95%CI为0.76~1.65,Z=0.58,P OR=0.56;Gln/Gln+Arg/Gln vs.Arg/Arg OR=1.11,95%CI为0.85~1.44,Z=0.78,P OR=0.43;Gln/Gln vs.Arg/Arg+Arg/Gln OR=1.07,95%CI为0.79~1.46,Z=0.43,P OR=0.67;Arg/Gln vs.Arg/Arg OR=1.14,95% CI为0.88~1.48,Z=1.02,P OR=0.31。[结论]XRCC1Arg399Gln多态性与结直肠癌易感性之间无显著相关性。
关键词:结直肠癌;XRCC1;基因多态性;Meta分析
中图分类号:R735.3文献标识码:A文章编号:1004-0242(2010)05-0343-05
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)发病率在全球最常见的癌症中居第3位[1]。我国结直肠癌的发病率虽较发达国家低,但近年来有明显增加趋势。结直肠癌的发生是外界环境与遗传因素共同作用的结果。外部环境因素通过对基因的载体DNA的影响而在结直肠癌的发生中发挥作用。双生子对照研究表明遗传因素在结直肠癌发生中的作用占到35%[2]。因此基因的稳定性,即DNA损伤后的修复能力可能与结直肠癌的发生相关,同时也可能决定了不同个体对结直肠癌易感性的不
同。X射线交叉互补修复基因1
(X-ray repair cross-complementing
group1,XRCC1)是DNA损伤修
复基因的一种,人类XRCC1基因
位于19号染色体的长臂(q13.2~
q13.3),全长33kb[3]。XRCC1编码
的蛋白质虽然没有直接的催化活
性,但能与DNA聚合酶β、DNA
连接酶Ⅲ、聚(二磷酸腺苷—核
糖)多聚酶(poly ADP-ribose poly-
merase,PARP)结合形成复合体,
发挥重要的支架蛋白的作用,参
与碱基切除修复和DNA单链断
裂修复。目前已经发现XRCC1
基因的编码区有多个单核苷酸多
态性(single nucleotide polymor-
phism,SNP)位点可导致其编码蛋
白相应氨基酸的改变,研究比较
多的有C26304T(Arg194Trp)、
G27466A(Arg280His)和G28152A
(Arg399Gln)。第194密码子和第
280密码子位于DNA聚合酶β
结合区域和PARP结合区域之
间,而第399密码子位于PARP
结合区域,因此推测第399密码
子可能对蛋白功能的影响较大。
XRCC1基因Arg399Gln位点
G→A的变异,导致第399密码
子编码的氨基酸Arg→Gln的改
变,研究表明这一突变降低了
XRCC1修复DNA损伤的能力,
收稿日期:2009-08-24;修回日期:2009-11-22 E-mail:zhangchao987629@https://www.360docs.net/doc/22154895.html,
表1
纳入Meta 分析的文献基本情况
第一作者
Abdel -RahmanaSZ [16]Krupa R [17]Hong YC [18]
Skjelbred CF [19]Moreno V [20]Stern MC [21]Yeh CC [22]
Martinez -Balibrea E [23]Sliwinski T [24]Kasahara M [25]宋华宁[26]时间20002004200520062006200720072007200820082008人群
埃及波兰韩国挪威德国
新加坡(华裔)台湾西班牙波兰日本中国
基因型分布情况
Arg/Arg 22231126315416740730474291
Arg/Gln 21198870160112260333799
Gln/Gln 5992441155171627
26*对照组
Arg/Arg Arg/Gln Gln/Gln 3739136148137607384393962165
94564187145428291324583
21696440855411167
59*
*:原文中只给出基因型Arg/Gln +Gln/Gln 的总数据
使DNA 聚合物、红细胞血型糖蛋白A (glycophorin A ,GPA )突变、淋巴细胞姊妹染色单体互换(sis -
ter chromatid exchange ,SCE )增加。但是DNA 聚合物、GPA 突变、SCE 增加只是肿瘤发生的标志物,与肿瘤发生不可直接等同[4]。
目前,国内外已有多个研究分析了XRCC1基因399位点多态性同结直肠癌易感性之间的关系,但结果不尽一致,且多为小样本研究。本文拟对国内外正式发表的有关XRCC1基因399位点多态性同结直肠癌易感性关系的病例对照研究进行Meta 分析,以综合评价XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性之间的关系。
1
材料与方法
1.1
资料来源
通过检索中国生物医学数据
库(CBM )、PubMed 、Springer 等数据库,辅以文献追溯和人工检索的方法,收集国内外2000~2009年间公开发表的关于XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性关系的病例对照研究,中文主题词包括:结直肠癌、X 射线交叉互补修复基因1、基因多态性;英文主题词包括:colorec -
tal cancer ,X -ray repair cross -complementing group 1,XR -CC1,genetic polymorphism 。1.2纳入标准
文献的研究类型是已发表的病例对照研究,语言种类为英文或中文;原文给出明确的XRCC1Arg399Gln 基因型频数,以用来计算比值比(odds ratio ,OR )及其95%可
信区间(confidential interval ,CI);对照组基因型分布符合H -W 遗传平衡检验。
1.3排除标准
原始文献试验设计不严谨
(如诊断判定标准不规范、样本资料交代不清或不全等);重复发表
的文献;综述或个案报道。
1.4数据提取与统计学处理提取入选文献的的第一作
者、发表年份、样本来源、病例组和对照组人数以及各基因型频数等信息。应用Meta 分析软件
Review Manager (version 5.0.10)
进行统计分析。先评价各研究间的异质性,若各研究间无显著异质性则采用固定效应模型(fixed
effects model ,FEM )进行数据合并,否则采用随机效应模型(ran -dom effects model ,REM )[5]。计算
各研究及合并数据的比值比及其
95%CI ,给出森林图,展示各研究
结果及特征,根据漏斗图以及
Egger 法,进行线性回归分析,评
价发表偏倚。
2
结果
2.1
文献数据描述
根据文献检索方案,共检索
到126篇相关文献,经过阅读摘
要后初步纳入21篇文献。按照入选和排除标准,有10篇文献被排除,其中包括三项关于结直肠腺瘤的研究[6~8],两篇文献与纳入文献引用相同的数据[9,10],两篇不含相关基因型数据[11,12],三项研究的对照组不符合H -W 遗传平衡检验[13~15](P Improta G =0.049<0.05;P 金明娟=
0.023;P Ren Z =0.001)。最终共纳入11篇文献,包括英文10篇[16~25],中文1篇[26]。共累计结直肠癌病例2287例,对照3485例,见表1。
2.2Meta 分析结果
表2列出了Meta 分析的主
要结果。我们共进行了四组基因模型的分析,对于这四种模型的异质性检验,大多I 2均大于
50%,且P H 均大于0.1,说明异质
性达到显著水平,故均采用随机效应模型进行数据合并。我们发现异质性显著的原因主要来自宋华宁的研究[26]。当我们去除宋华宁的研究后,I 2均明显减小,P H 大多大于0.1。然而加上宋华宁的研究后并不影响Meta 分析的结果。
四组基因型的分析结果如
下:Gln/Gln vs.Arg/Arg OR =
1.12,95%CI 为0.76~1.65,Z =0.58,P OR =0.56;Gln/Gln +Arg/Gln vs.Arg/Arg OR =1.11,95%CI 为0.85~1.44,Z =0.78,P OR =0.43;Gln/
表2
XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性Meta 分析结果
基因型
Gln/Gln vs.Arg/Arg
Gln/Gln +Arg/Gln vs.Arg/Arg Gln/Gln vs.Arg/Arg +Arg/Gln Arg/Gln vs.Arg/Arg
研究数
(病例数/对照数)
10(1320/2035)11(2287/3485)10(2219/3364)10(2015/3060)比值比
OR[95%CI]Z
P OR 1.12[0.76~1.65]1.11[0.85~1.44]1.07[0.79~1.46]1.14[0.88~1.48]
0.580.780.431.02
0.560.430.670.31异质性检验
I 2(%)
P H
657850740.003<0.000010.03<0.0001
REM *REM REM REM
模型
REM :随机效应模型。
研究者及年份
病例组
Arg/Gln +Gln/Gln 例数
对照组
Arg/Gln +Gln/Gln
例数权重
(%)
OR 值
[95%CI]OR 值
[95%CI]Abdel -Rahmana SZ 2000Hong YC 2005Kasahara M 2008Krupa R 2004
Martinez -Balibrea E 2007Moreno V 2006Skjelbred CF 2006Sliwinski T 2008宋华宁2008Stern MC 2007Yeh CC 2007合计异质性检验:Tau 2=0.14;χ2=46.39,df=10(P <0.00001);I 2=78%总效应:Z =0.78;P =0.43
48209685170355157100217294718
228726
972628402019453126127311
112948209121100823223991002551120729
348511735961431852516190513345
1692 5.310.07.66.97.311.010.28.110.211.512.0
100.0 3.98[1.65~9.59]1.61[1.09~2.39]0.65[0.36~1.19]0.78[0.39~1.54]1.21[0.64~2.30]0.97[0.71~1.31]0.88[0.60~1.28]0.72[0.41~1.26]2.54[1.75~3.68]0.90[0.69~1.17]0.85
[0.69~1.05]
1.11[0.85~1.44]
0.01
0.11
10100
病例组
对照组
图1
XRCC1基因399位点多态性与结直肠癌易感性Meta 分析森林图
(Gln/Gln +Arg/Gln vs.Arg/Arg )
Gln vs.Arg/Arg +Arg/Gln OR =1.07,95%CI 为0.79~1.46,Z =0.43,P OR =0.67;Arg/Gln vs.Arg/Arg OR =1.14,95%CI 为0.88~1.48,Z =1.02,P OR =0.31。以上结果均说明XRCC1Arg399Gln 多态
性与结直肠癌易感性之间无显著相关性。图1给出了(Gln/Gln +
Arg/Gln)与Arg/Arg 比较的森林
图。
2.3发表偏倚估计
图2中漏斗图的形态未见明
显不对称。按Egger 线性回归法对漏斗图对称性进行定量评价,模型(Gln/Gln +Arg/Gln)vs.Arg/
Arg 的t =0.94,P =0.373>0.05,95%
CI 为-2.17~5.23,
亦说明不存
在明显的发表偏倚。
3讨论
人类的大多数肿瘤是环
境和遗传因素共同作用的结果。环境致癌物或其代谢产物攻击体细胞,并引起DNA 损伤。当DNA 受到损伤后,细胞启动DNA 修复系统修复DNA 损伤,以保证机体基因组的稳定性和准确性。人类细胞参与DNA 损伤修复的基因有130多种,并存在多种DNA 损伤修复机制。当这些修复系统的基因发生突变后,可能会导致其编码蛋白的改变,进而可能影响
DNA 损伤修复系统的正常修复功能,使损伤后的DNA 得不到及
时的修复,最终导致细胞癌变,因此DNA 修复基因多态性可能与肿瘤发生之间有密切的联系。
XRCC1是DNA 损伤修复基因的一种,其编码的蛋白质与DNA 聚合酶β、DNA 连接酶Ⅲ、PARP 结
合形成复合体,发挥重要的支架蛋白的作用,参与碱基切除修复和DNA 单链断裂修复。在已经发现的XRCC1基编码区可以导致其蛋白质相应的氨基酸改变的多个SNP 位点中,研究比较多的有
C26304T (Arg194Trp )、G27466A (Arg280His )和G28152A (Arg399Gln ),第194密码子和第280密码子位于DNA 聚合酶β结合区域和PARP 结合区域之间,而第399密码子位于PARP 结合区域,因此推测第399密码子可能对蛋白
功能的影响较大。因此,作为一种
可能的肿瘤易感基因,XRCC1基因多态性与结直肠癌易感性之间的关系也被广泛地研究过,其中就包括Arg399Gln位点。但由于这些研究多为小样本研究,结果可信度较低,并且也不一致,因此有必要对这些研究结果进行合并分析,以合理评价XRCC1 Arg399Gln多态性与结直肠癌易感性的关联关系。
本次Meta分析通过严格筛选、纳入相关研究,最终对11个研究(共计结直肠癌病例2287例,对照3485例)进行了合并分析。Meta分析结果显示,Gln/Gln vs.Arg/Arg OR=1.12,95%CI为0.76,1.65,Z=0.58,P OR=0.56;Gln/ Gln+Arg/Gln vs.Arg/Arg OR= 1.11,95%CI为0.85~1.44,Z= 0.78,P OR=0.43;Gln/Gln vs.Arg/ Arg+Arg/Gln OR=1.07,95%CI为0.79~1.46,Z=0.43,P OR=0.67;Arg/ Gln vs.Arg/Arg OR=1.14,95%CI 为0.88~1.48,Z=1.02,P OR=0.31,表明XRCC1Arg399Gln多态性与结直肠癌易感性无显著关联。值得关注的是,目前临床研究中也没有发现XRCC1Arg399Gln 与结直肠癌有明显相关性,例如Paré等[27]在一项前瞻性研究中发现XRCC1Arg399Gln与结直肠癌患者对奥沙利铂/5-氟尿嘧啶的临床治疗效果不存在明显相关性,这与我们的分析结果相一致。
目前关于XRCC1基因399位点遗传多态性与肿瘤关系的Meta分析较多,但是结果却不尽一致。Saadat等[28]对20837名乳腺癌患者和22879名对照进行Meta分析,结果显示Gln/Gln可以增加乳腺癌发生的危险度(Gln/Gln vs.Arg/Gln+Arg/Arg OR=1.49,95%CI为1.22~1.81);
Kiyohara等[29]的研究结果显示在
亚洲人群中,Gln/Gln可以增加肺
癌发生的危险度(Gln/Gln vs.
Arg/Arg OR=1.34,95%CI=1.16~
1.54),但在高加索人中却没有发
现明显相关性(Gln/Gln vs.Arg/
Arg OR=0.94,95%CI为0.80~
1.11)。同样,在亚洲人群中,Geng
等[30]也发现Gln/Gln可以增加前
列腺癌发生的危险度(Gln/Gln
vs.Arg/Gln+Arg/Arg OR=
1.43,95%CI为1.02~
2.00)。Zhang
等[31]却发现绝经前的妇女中,Gln/
Gln组乳腺癌的发病率减少(Gln/
Gln vs.Arg/Arg OR=0.60,95%CI
为0.40~0.90)。而Geng等[32]以及
Lao等[33]的研究亦表明
Arg399Gln多态性与胃癌以及膀
胱癌无明显相关。我们关于
XRCC1Arg399Gln多态性与结直
肠癌易感性的研究,以及该基因
位点与其他肿瘤易感性研究的结
果不尽相同,其中的原因尚不清
楚,可能是不同的Meta分析入选
和排除标准、入选的病例及对照
人数存在较大差别所致,当然也
可能是同一基因在不同的肿瘤发
生机制中的不同作用所致。
本次Meta分析通过其数学
模型及漏斗图分析,各研究不存
在明显发表偏倚。但由于研究资
料来源于已发表文献之中,无法
获得更详细的资料,因而潜在混
杂如职业、饮食、吸烟和精神等因
素未能控制,显然这些因素会对
研究结果产生一定的影响。例如
Lao等[33]的研究发现XRCC1
Arg399Gln在吸烟的人群中可以
降低膀胱癌的发生率,但在总的
人群中无明显相关性。XRCC1
Arg399Gln多态性与结直肠癌易
感性之间的相关性尚需要更进一
步的多中心、大样本的研究。另
外,本研究只是对XRCC1基因的
399位点进行分析,没有考虑基
因之间以及基因与环境的相互作
用,在将来的研究中可进一步深
入探究,以利于发现结直肠癌的
发病机制。
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