DNA提取的完整步骤

DNA提取的完整步骤
DNA提取的完整步骤

DNA提取的完整步骤

1.取新鲜或冷冻样品的肌肉组织100ul-200ul或95%ALC保存的样品组织0.05g。

2.将组织尽量剪碎,分别装入1.5ml 的离心管中。

3.每管中加入450ul的裂解缓冲液(10mM Tris-HCl pH8.0; 100mM EDTA, pH8.0)

4.每管加入10% SDS 50-100ul(70-80不定) (1-2%),再加入2.5-5ul(3ul)蛋白酶K (20mg/ml),是其终浓度达100ug/ml. 混匀,55℃3h至过夜(期间将管子颠倒几次)。

5.样品中加入150ul NaCl(盐析作用),室温8000rpm离心20min,去沉淀,然后在上清液中加入等体积(500ul)预冷异丙醇(沉淀DNA),混匀,20℃处理30min,14000rpm离心10min,去上清液。沉淀加70%ALC洗涤离心去ALC,室温挥发ALC5-10min,加TE 500ul,加10ul RNAase (终浓度4mg/ul),即2.5ul。37℃ 30min 或65℃ 15min。

6.加等体积酸液(提取DNA中的蛋白质)缓慢来回颠倒离心管10min,13000-15000rpm离心10min。用移液管(大口Tip头)小心取出上层相至另外干净的离心管中,不要触到两相之间的白色蛋白层(可视情况重复操作次)。

7.加入等体积酚:氯仿(催取酚)(1:1),轻摇,缓慢颠倒混匀10min 13000-15000rpm 离心5-10分钟,取上层清液于干净离心管中。

8.加入等体积氯仿(氯仿:异戊醇(阻止氯仿挥发)=24:1),轻摇,缓慢颠倒混匀10min,13000-15000rpm离心5-10min。取上清液加入1/10体积2M NaCl和等体积-20℃保存的无水乙醇(或等体积异丙醇)(沉淀DNA),沉淀DNA 10min,13000rpm离心5min,去上清,加入100-150ul70%ALC,离心,小心倒掉ALC(当心DNA沉淀丢失),用70%ALC 再洗一次,然后去ALC。45℃烘箱烘干15-30min,用双蒸水沿管壁沿四周冲洗(TE量视DNA沉淀量而定,在80-250ul之间),溶解12-24h,-20℃保存备用。

魁蚶DNA提取

(因裂解严重,故简化DNA提取步骤)

1.取95%乙醇保存的组织0.05g,放入500ul的蒸馏水中浸泡半天,再换一次蒸馏水浸泡半天。

2.将组织尽量剪碎,放入盛有450ul裂解缓冲液(TE)的1.5ml 离心管中(10mM Tris-HCl,pH8.0,10mM EDTA pH8.0)

3.每管中加入10%的SDS 50-100ul (80ul),(1-2%),再加入2.5-5.0ul(一般4.0ul或5.0ul)蛋白酶K(20mg/ml),使其终浓度达100ul/ml,混匀。55℃水浴 3小时至过夜(期间将管子颠倒几次),加2.5ul RNAase,37℃ 30min或65℃ 15min,(RNAase易降解,一般不许再加RNAase,形成沉淀)。

4.样品中加入150ul NaCl,室温4000rpm离心20min (T=15℃),去沉淀,然后在上清液中加入等体积酚液(提Pr)。缓慢颠倒离心管10min,13000-15000rpm离心10-15min,用移液管大口Tip头小心取出上层水相至另外干净的离心管中,不要触到两相间的白色蛋白层。

5.再上清液中加入于冷得等体积异丙醇(沉淀DNA),混匀,20℃处理30min,14000rpm离心10min,去上清液。

6.沉淀用70%的乙醇洗涤,离心去乙醇,室温挥发。

后80ul H2O 离解DNA

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