引物设计软件(Primer Primer 5.0)安装流程

引物设计软件(Primer Primer 5.0)安装流程
引物设计软件(Primer Primer 5.0)安装流程

引物设计软件(Primer Primer 5.0)安装流程

(鉴于好多人不懂如何安装该引物设计软件,特制作此流程,希望能帮到大家,本次安装的引物设计软件是“Primer Primer 5.0”。)

1.首先,将引物设计软件下载后解压

2.打开下图中的软件

3.选择“是”,会出现如下进度条。

注意:该软件只能安装在32位的计算机系统中,64位的请绕行。

4.进度条集满后,会出现如下授权窗口,选择“Yes”

5.该软件默认安装在C盘,你也可以点击“Browse”自定义安装位置,选择好安装位置后,点击Next进入下一步

6.进入安装界面,安装完成后,会出现如下窗口,如果你想阅读README文件,就选择复选框,之后点击Finish按钮,完成安装。

7.接下来需要激活该软件,方可使用,打开已安装好的程序(在之前选择的安装路径下寻找),打开下图中框内的程序,同时你也可以创建快捷方式到桌面,以方便后续使用时打开。

8.再打开安装包中的PSKeyGen.exe,如下图所示。

9.点击引物设计软件中的“Active Product”按钮。

会出现如下图窗口,记住窗口中的Machine ID。

10.打开PSKeyGen.exe,选择“Primer Primer 5.0”,将Machine ID号输入到下面的文本框中,点击“Generate it!”。

记住出现的激活码

11.将激活码输入到引物设计软件中的激活窗口,如下图。

再点击“OK”完成激活。这样该软件就可以使用了。

制作人:王名利

2014年6月2日

平面设计软件都有哪些

平面设计软件都有哪些 导语:在当今这个信息化时代,电脑已经渗透到生活的方方面面,纯靠手工打造平面设计的时代已经不再,更多的是要依靠那些强大的平面设计软件,那么,平面设计软件都有哪些?下面和小编一起来看看吧! 软件及优点:photoshop主要是用来进行图像处理的,把图片通过处理使其更加具有真实感。 软件及优点:3dmax是每个设计者必须掌握的软件,3dmax这个软件用来建模、材质、模型、灯光的展示; 软件及优点:AutoCAD是用来进行平面制图的,平面布置图、施工图、立面图、以及三维图的绘制都是用CAD这个软件来操作的。 软件及优点:CorelDRAW,Illustrator是应用于商标设计、标志制作、模型绘制、插图描画、排版及分色输出等等诸多领域 软件及优点:Flash、Fireworks、dreamweaver用来制作精美的网页,通常需要集中软件的相互配合,这根据自身要求。 组版软件是将文字和图片组合成美观印品的专业软件,这类软件本身没有什么对图片或图形的处理功能。不过,在客观工作中,平面制作人员需要在这三类常用软件中不停地

来回切换,造成了大量不必要的烦琐程序。 代表软件:QuakeXpress、方正飞腾、Pagemaker 软件及优点:Illustrator、CorelDRAW两个软件的特点均为可以随意放大缩小而清晰度不变,而且标志设计、文字、排版特别出色,但是 Illustrator在MAC和PC都可以使用,CorelDRAW多用于PC。文字排版类软件软件及优点:PageMaker是常见的文字排版处理软件,称为最底层平台,优点是任何软件做的文件均可承载,缺点该软件在MAC和PC 上不能互通,且太过于简单,无法作相应的特效处理,需要借助其他软件才能完成,多见于MAC,PC机上的PM不能输出。 之所以说是辅助类的,主要是因为他们不是作为平面制作人员必须要掌握的软件,但因为客户提供的文件不尽相同,对平面设计人员的常识要求就不同,多掌握一点没什么坏处。 这其中包括: 文字处理软件MicrosoftOfficeWord 观看效果软件AdobeAcrobat

引物设计基本方法

Primer 5.0搜索引物: 1.Primer Length我常设置在18-30bp,短了特异性不好,长了没有必要。当然有特殊要求的除外,如加个酶切位点什么的。 2.PCR Product size最好是100-500bp之间,小于100bp的PCR产物琼脂糖凝胶电泳出来,条带很模糊,不好看。至于上限倒也不必要求苛刻。 3.Search parameters还是选Manual吧,Search stringency应选High,GC含量一般是40-60%。其它参数默认就可以了。 4.搜索出来的引物,按Rating排序,逐个送Oligo软件里评估。当然,搜索出的引物,其扩增产物很短,你可以不选择它,或是引物3端≥2个A或T,或引物内部连续的G或C太多,或引物3端≥2个G或C,这样的引物应作为次选,没得选了就选它。对于这样的引物,如果其它各项指标还可以,我喜欢在引物末端去掉一个不满意的或加上一个碱基,看看引物的评估参数有没有变好点。 Oligo 6.0评估引物: 1.在analyze里,Duplex Formation不管是上游引物、下游引物还是上下游引物之间,The most stable 3’-Dimer绝对值应小于4.5kcal/mol, The most stable Dimer overall绝对值一般应小于多少kcal/mol跟PCR退火温度有关,我几次实验感觉在PCR退火温度在65°的时候,The most stable Dimer ove rall 6.7kcal/mol没有问题。 2.Hairpin Formation根据黄金法则 3.False priming sites: Primer的priming efficiency应该是错配地方的4倍左右,更多当然更好。 4.在PCR栏,个人感觉其所显示的optimal annealing temperature数值值得参考。在PCR摸索条件的时候,退火温度为其数值加减2的范围就可以了。 5.Internal stability很重要:我们希望引物的内部稳定性是中间高、两边低的弧形,最起码保证3端不要过于稳定。下图1引物3端过于稳定,很容易导致不适当扩增。△G参照黄金法则,这其实很好理解:把一滴水放到大海里,这滴水就会不停的扩散分布,扩散的越厉害越稳定,所以△G绝对值越大结构越稳定。 最后说一句,敢于尝试就会成功。 第二贴 --科室工作很多,小医生了,没有办法,所以肯怕不能满足很多战友的要求(qq聊或帮助设计),在此表示抱歉。就楼上的问题我试着回答一下,不一定正确,供参考吧。 --1、两个评价系统不一样,个人感觉oligo评价引物好点,primer出来的引物,我一般按效率排序,再结合退火温度和引物长度,选择引物到oligo测试。这是初步的选择,其实引物到了oligo里,退火温度也不一样。 --2、3端的二聚体应该避免,这个要看你的退火温度决定,一个50°的退火温度肯定和65°对二聚体的影响不一样了,一般来讲尽量控制在-4.5kcal/mol以下(个人观点,很多东西真得还是需要自己摸索)。 --3、个人感觉3端有A无A影响不大,3端有T的没有经验。有T是不是一定不行,个人感觉不见得。软件是评估,法则也不是没有例外,不是1+1=2那么确定。 --4、错配和二聚体谁轻谁重,个人觉得“到致命的程度”谁都重要,我也说不好。我设计的时候,尽量两个都不得罪。 --5、GC含量并非不重要,它直接影响引物各端稳定性,3端来两个G或C,稳定性就上去了,粘在模板上很牢。所以我设计的时候,尽量避免这样的情况出现。 谈一下我学这个引物设计的过程吧:

引物设计原则(含Realtime引物)

1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。 2.引物长度一般在15~30碱基之间。 引物长度(primer length)常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA 聚合酶进行反应。 3.引物GC含量在40%~60%之间,Tm值最好接近72℃。 GC含量(composition)过高或过低都不利于引发反应。上下游引物的GC含量不能相差太大。另外,上下游引物的Tm值(melting temperature)是寡核苷酸的解链温度,即在一定盐浓度条件下,50%寡核苷酸双链解链的温度。有效启动温度,一般高于Tm值5~10℃。若按公式Tm= 4(G+C)+2(A+T)估计引物的Tm值,则有效引物的Tm为55~80℃,其Tm 值最好接近72℃以使复性条件最佳。 4.引物3′端要避开密码子的第3位。 如扩增编码区域,引物3′端不要终止于密码子的第3位,因密码子的第3位易发生简并,会影响扩增的特异性与效率。 5.引物3′端不能选择A,最好选择T。 引物3′端错配时,不同碱基引发效率存在着很大的差异,当末位的碱基为A时,即使在错配的情况下,也能有引发链的合成,而当末位链为T时,错配的引发效率大大降低,G、C 错配的引发效率介于A、T之间,所以3′端最好选择T。 6. 碱基要随机分布。 引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错误引发(False priming)。降低引物与模板相似性的一种方法是,引物中四种碱基的分布最好是随机的,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。尤其3′端不应超过3个连续的G或C,因这样会使引物在GC富集序列区错误引发。 7. 引物自身及引物之间不应存在互补序列。 引物自身不应存在互补序列,否则引物自身会折叠成发夹结构(Hairpin)使引物本身复性。这种二级结构会因空间位阻而影响引物与模板的复性结合。引物自身不能有连续4个碱基的互补。 两引物之间也不应具有互补性,尤其应避免3′ 端的互补重叠以防止引物二聚体(Dimer与Cross dimer)的形成。引物之间不能有连续4个碱基的互补。 引物二聚体及发夹结构如果不可避免的话,应尽量使其△G值不要过高(应小于4.5kcal/mol)。否则易导致产生引物二聚体带,并且降低引物有效浓度而使PCR 反应不能正常进行。 8. 引物5′ 端和中间△G值应该相对较高,而3′ 端△G值较低。 △G值是指DNA 双链形成所需的自由能,它反映了双链结构内部碱基对的相对稳定性,△G 值越大,则双链越稳定。应当选用5′ 端和中间△G值相对较高,而3′ 端△G值较低(绝对值不超过9)的引物。引物3′ 端的△G 值过高,容易在错配位点形成双链结构并引发DNA 聚合反应。(不同位置的△G值可以用Oligo 6软件进行分析) 9.引物的5′端可以修饰,而3′端不可修饰。 引物的5′ 端决定着PCR产物的长度,它对扩增特异性影响不大。因此,可以被修饰而不影响扩增的特异性。引物5′ 端修饰包括:加酶切位点;标记生物素、荧光、地高辛、Eu3+等;引入蛋白质结合DNA序列;引入点突变、插入突变、缺失突变序列;引入启动子序列等。引物的延伸是从3′ 端开始的,不能进行任何修饰。3′ 端也不能有形成任何二级结构可能。 10. 扩增产物的单链不能形成二级结构。

wysiwyg专业灯光设计软件灯光师高级教程

Wisiwyg简易教程 软件介绍: WYSIWYG 是 What You See Is What You Get 的首字母缩略词。 1.01、能模拟真实的现场。我们可以根据演出场所的实际大小尺寸生成演出现场,并安装各类设备,模拟一个完整的灯光现场。 1.02、通过控制系统,控制模拟灯光现场的效果。我们可以应用控制设备或离线软件配置灯光通道进行灯光控制,并实时的在屏幕上看到演出灯光效果。 1.03、只要通过布置现场设备配置即可得到你所需要的所有灯光资料。当你布置好一个模拟的现场后,系统便会自动产生现场控制和维护的所有数据,如灯位图、通道表、配接表、灯具统计表、模拟效果图等等,为现场操作提供参考依据 1.04、设计不受空间的限制。使用了WYSIWYG Perform,设计者无需在演出现场指挥,在家就可以完成所有的灯光设计,包括灯具布置、场景布置、灯光设计、灯光控制等等。 1.05、在现场实时控制时,能实时显示控制效果及设备的运行情况。 1.06、支持多种文件格式的导入、导出。我们可以应用现成的文件将原设计导入WYSIWYG Perform进行灯光设计,导出成需要的文件格式。 设计展示 1.1导航介绍 打开软件首先看到的窗口(下图)

1.2工作界面布局 1.2窗口模式

Wireframe:全屏绘图 Quad:四分工作窗 Flight case:预选设备窗口 Shaded:全屏预览窗口 1.3工作模式 Design:电脑灯具对光模式 Pres:效果图以及灯具参数,数量同步生成 Live:现场模式 Link:连接模式 1.4工具栏(工具栏的位置可以拖拽移动),在界面上点右键可调出隐

引物设计原则

1. 引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。 2. 引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基,如GGG或CCC,也会使错误引发机率增加。 3. 引物3’端的末位碱基对Taq酶的DNA合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率,末位碱基为A的错配效率明显高于其他3个碱基,因此应当避免在引物的3’端使用碱基A。另外,引物二聚体或发夹结构也可能导致PCR反应失败。5’端序列对PCR影响不太大,因此常用来引进修饰位点或标记物。 4. 引物序列的GC含量一般为40-60%,过高或过低都不利于引发反应。上下游引物的GC含量不能相差太大。 5. 引物所对应模板位置序列的Tm值在72℃左右可使复性条件最佳。Tm值的计算有多种方法,如按公式Tm=4(G+C)+2(A+T),在Oligo软件中使用的是最邻近法(the nearest neighbor method)。 6. ΔG值是指DNA双链形成所需的自由能,该值反映了双链结构内部碱基对的相对稳定性。应当选用3’端ΔG值较低(绝对值不超过9),而5’端和中间ΔG值相对较高的引物。引物的3’端的ΔG值过高,容易在错配位点形成双链结构并引发DNA聚合反应。 7. 引物二聚体及发夹结构的能值过高(超过mol)易导致产生引物二聚体带,并且降低引物有效浓度而使PCR反应不能正常进行。 8. 对引物的修饰一般是在5’端增加酶切位点,应根据下一步实验中要插入PCR 产物的载体的相应序列而确定。 引物序列应该都是写成5-3方向的, Tm之间的差异最好控制在1度之内, 另外我觉得扩增长度大一些比较好,500bp左右。 要设计引物首先要找到DNA序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构,就要避开它。如这一段不能形成二级结构,那就可以在这一区域设计引物。

Oligo引物设计软件使用方法

作为目前最好、最专业的引物设计软件,Oligo的功能很强,在这里我们介绍它的一些主要功能:如:普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估引物对质量等等。 在正式进行引物设计前,我们首先面临的一个任务就是向Oligo程序导入模板序列,根据不同的实验情况,导入模板有三种方法: 1,直接用键盘输入: a,点击file菜单中的New Sequence 浮动命令,或直接点击工具栏中的New Sequence 命令,进入序列展示窗口; b,此时即可键入DNA序列; c,如果需要的话,Oligo提供碱基回放功能,在边键入时边读出碱基,防止输入错误。点击Edit菜单中的“Readback on”即可。 2,利用复制和粘贴:当我们序列已经作为TXT文件存在或其它oligo不能直接open的文件格式,如word文件.html格式,这个功能就显得很有用了。在相应文件中复制序列后在序列展示窗口粘贴,oligo会自动去除非碱基字符。当序列输入或粘贴完成后,点击Accept/Discard菜单中的Accept浮动命令,即可进入引物设计模式。 3,如果序列已经保存为Seq格式或者FASTA,GenBank格式时,oligo就可以直接打开序列文件。 点击File菜单中的“Open”浮动命令,找到所需文件,打开即可。 进入引物设计模式后,oligo一般会弹出三个窗口,分别是6-碱基频率窗口,碱基退火温度窗口以及序列内部碱基稳定性窗口,其中的退火温度窗口是我们引物设计的主窗口,其它的两个窗口则在设计过程中起辅助作用,比如6-碱基频率窗口可以使我们很直观地看到所设计引物在相应物种基因组中的出现频率,如果我们的模板是基因组DNA或混合DNA时,

引物设计软件oligo应用简介

引物设计软件oligo 应用简介 作者: 来源: 时间: 2007-03-07 字体: [大 中 小] 在专门的引物设计软件中,“Oligo”是最著名的。它的使用并不十分复杂,但初学者容易被其复杂的图表吓倒。 Oligo 5.0的初始界面是两个图:Tm 图和ΔG 图;Oligo 6.0的界面更复杂,出现三个图,加了个Frq 图。 “Oligo”的功能比“Premier”还要单一,就是引物设计。但它的引物分析功能如此强大以至于能风靡全世界。 oligo 的下载和安装我就不多说了,打开oligo 相信也无需多讲。打开oligo 的页面如下: 单击file 菜单再点open 或点击“打开”快捷图标或者用快捷键“CTrl+O”可打开下面的窗口

在打开的OPEN窗口内选择FreqSeq再点“打开” 选择drosfr或者其它一个文件点击“打开”

出现以下窗口,点击“window”再点击“Tile” 出现以下窗口,图中显示的三个指标分别为Tm、ΔG和Frq,其中Frq是6.0版本的新功能,

为邻近6至7个碱基组成的亚单位在一个指定数据库文件中的出现频率。 该频率高则可增加错误引发的可能性。 因为分析要涉及多个指标,起动窗口的cascade排列方式不太方便,可从windows菜单改为tile方式。 如果觉得太拥挤,可去掉一个指标,如Frq,这样界面的结构同于Oligo 5.0,只是显示更清楚了。 ?G值反映了序列与模板的结合强度,最好引物的?G值在5’端和中间值比较高,而在3’端相对低(如图:) Tm值曲线以选取72℃附近为佳,5’到3’的下降形状也有利于引物引发聚合反应。Frq曲线为“Oligo 6”新引进的一个指标,揭示了序列片段存在的重复机率大小。选取引物时,宜选用3’端Frq值相对较低的片段

专业好用的平面图纸设计软件下载

专业好用的平面图纸设计软件下载 导语: 现在有越来越多的人喜欢自己在电脑上制作图形图像。但我们知道专业的绘制功能都比较复杂,需要进行学习。那么是否有容易上手的专业平面图纸设计软件呢?本文将告诉你答案! 立即获取海报设计软件:https://www.360docs.net/doc/669878667.html,/infographic/ 专业好用的平面图纸设计软件有哪些

专业平面图纸设计软件其实除了大众的PS、AI,还有小众的亿图图示。你可能听过亿图图示,心想不是做流程图的吗?对,亿图图示不只可以做专业流程图,做平面设计也是很专业的。软件智能的排版布局、一键更换主题,省时且高效;一键导出你的图表作品到各种格式的图片、Html、PDF、SVG、office等。全面的绘制功能,大量的免费模板,满足多方面的绘图需求。 亿图图示软件特色: 1、丰富的模板例子:亿图图示支持超过200种图表绘制,轻松绘完平面图。 2、专业的图表软件:不仅可以绘制平面图,还可以绘制组织结构图、思维导图、网络图等。 3、值得信赖的产品:超过六百万次的下载,用户遍布全世界。 4、支持在线分享,生成的网页链接可以在不同的用户终端进行查看。 5、可以使用软件轻松绘制箭头、图框,让办公效率无限提升。 如何下载使用专业的平面图纸设计软件

1、首先需要在电脑上下载安装好亿图图示绘图软件,打开浏览器,搜索“亿图图示”,然后找到带有官网标识的网站,进入下载即可。 2、接着打开软件,点击“新建”,选择“平面设计”----“海报”,这个时候可以看到有很多好看的模板可以选择,我们可以利用这些模板来快速制作。 3、选中一个打折的模板之后双击打开它,然后就进入了画布模式,我们可以自由修改模板中的文字、图片、配色等等,还可以添加一些可爱的小贴画。

引物设计步骤与要点

引物设计step by step 1、在NCBI上搜索到目的基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。 2、用Primer Premier5搜索引物 ①打开Primer Premier5,点击File-New-DNA sequence, 出现输入序列窗口,Copy目的序列在输入框内(选择As),此窗口内,序列也可以直接翻译成蛋白。点击Primer,进入引物窗口。 ②此窗口可以链接到“引物搜索”、“引物编辑”以及“搜索结果”选项,点击Search按钮,进入引物搜索框,选择“PCR primers”,“Pairs”,设定搜索区域和引物长度和产物长度。在Search Parameters里面,可以设定相应参数。一般若无特殊需要,参数选择默认即可,但产物长度可以适当变化,因为100~200bp的产物电泳跑得较散,所以可以选择300~500bp. ③点击OK,软件即开始自动搜索引物,搜索完成后,会自动跳出结果窗口,搜索结果默认按照评分(Rating)排序,点击其中任一个搜索结果,可以在“引物窗口”中,显示出该引物的综合情况,包括上游引物和下游引物的序列和位置,引物的各种信息等。 ④对于引物的序列,可以简单查看一下,避免出现下列情况:3’不要出现连续的3个碱基相连的情况,比如GGG或CCC,否则容易引起错配。此窗口中需要着重查看的包括:Tm 应该在55~70度之间,GC%应该在45%~55%间,上游引物和下游引物的Tm值最好不要相差太多,大概在2度以下较好。该窗口的最下面列出了两条引物的二级结构信息,包括,发卡,二聚体,引物间交叉二聚体和错误引发位置。若按钮显示为红色,表示存在该二级结构,点击该红色按钮,即可看到相应二级结构位置图示。最理想的引物,应该都不存在这些二级结构,即这几个按钮都显示为“None”为好。但有时很难找到各个条件都满足的引物,所以要求可以适当放宽,比如引物存在错配的话,可以就具体情况考察该错配的效率如何,是否会明显影响产物。对于引物具体详细的评价需要借助于Oligo来完成,Oligo自身虽然带有引物搜索功能,但其搜索出的引物质量感觉不如Primer5. ⑤在Primer5窗口中,若觉得某一对引物合适,可以在搜索结果窗口中,点击该引物,然后在菜单栏,选择File-Print-Current pair,使用PDF虚拟打印机,即可转换为Pdf文档,里面有该引物的详细信息。 3、用Oligo验证评估引物 ①在Oligo软件界面,File菜单下,选择Open,定位到目的cDNA序列(在primer中,该序列已经被保存为Seq文件),会跳出来两个窗口,分别为Internal Stability(Delta G)窗口和Tm窗口。在Tm窗口中,点击最左下角的按钮,会出来引物定位对话框,输入候选的上游引物序列位置(Primer5已经给出)即可,而引物长度可以通过点击Change-Current oligo length来改变。定位后,点击Tm窗口的Upper按钮,确定上游引物,同样方法定位下游引物位置,点击Lower按钮,确定下游引物。引物确定后,即可以充分利用Analyze 菜单中各种强大的引物分析功能了。

学广告设计需要学什么软件

学广告设计需要学什么软件 广告设计主要学习Photoshop、Illustrator 、InDesign、 Acrobat这几个软件。就目前的国内市场来说,还没有多少比平面广告设计师的就业范围还广泛的职业了,因为平面广告设计与各行各业都有密切的联系,无论你是做什么产品、做什么行业的都离不开设计,因为平面宣传是最为普遍、快捷、低成本的一种宣传方式。而如果公司要在这方面占有优势,势必要拥有几个专业的平面广告设计师来完成工作。如果你不喜欢,那么你也可以选择到专业的平面广告公司就职。 平面广告设计师工资待遇也是相当可观的,一名成手的设计师一个月拿3000多的工资是没有问题的,一名优秀的设计师,可以胜任技术主管工作的话,那么一个月的工资待遇有可能在5000,或者到8000左右,当然如果可以私下有自己的工作室,或接一些小项目那么您的收入将突破这些数字。 平面广告设计师就业前景很好,如果你喜欢设计,那么选择平面广告设计是正确的,作为设计师我们不光可以享受物质上的优越,更是一种精神上的享受,我们每天都工作在一种全新的创作之中,一同分享设计作品的喜悦。 武汉IT新时空学员平面广告设计作品分享 平面广告设计课程内容简介: 第一部分:设计理论基础: 一、美术基础: 1、素描:明确素描的基本概念,学习掌握素描的各种表现形式提高审美能

力。对素描的三大面五大调子深入讲解,人物素描比例的具体勾画等。 2、色彩构成:掌握色彩的运用于搭配,提高对色彩的审美感及色彩空间的表现能力。 3、平面构成:使学员掌握点、线、面设计元素的灵活运用等。 二、设计理论: 1、书籍封面设计:掌握书籍封面设计的原理及主要运用到的设计元素和具体内容。 2、名片设计,宣传单设计,VI设计,挂历设计及各种广告设计等知识理论的讲解。 第二部分:平面广告设计软件操作 1、Photoshop 此软件学习者可以说是一种人生艺术情操的熏陶,平时人们常说艺术是一种高尚人的生活方式,如果我们学会此软件就可以对我们生活中的美丽画面进行有效的艺术变化处理。比如;平时相机和手机的照片进行图像美化处理,人物场景变化等。 学习图像处理、编辑、通道、图层、路径综合运用、图像色彩的校正,各种特效滤镜的使用,特效字的制作,图像输出与优化等。灵活运用图层风格,蒙板,制作出千变万化的图像特效。对从事广告、包装、简报、彩页、手册、标识、照片扫描及印刷行业的人员和业余爱好者学习。 2、CorelDRAW 是一款矢量图像处理软件操作和实际应用(名片、标志设计、卡片、包装效果图、海报设计、宣传单设计等)。适合从事广告、包装、简报、彩页、手册、标识、网页及印刷行业的人员和业余爱好者学习。 3、Illustrator 重点学习Illustrator图形绘制、包装、宣传页的制作,让你更加方便的进行LOGO及VI设计,能迅速提高你的构想和思维,在标志设计、字型处理、插图、包装演示、工程绘图和信息图形领域展现自己无限的创意空间。 4、Photoshop与CorelDRAW软件之间的交互使用等讲解。

引物设计的原理与方法

引物设计的原理与方法 This model paper was revised by the Standardization Office on December 10, 2020

PCR引物设计的原理及方法 阎振鑫S111666(四川大学生命科学学院细胞生物学成都 610014) 摘要:自20世纪后期发展了PCR技术以来,PCR已经改变了整个生物学研究的进程。而PCR反应的第一步就是设计引物,引物设计的好坏直接关系到PCR的成败。PCR引物设计有许多的原则必须要遵循:引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,引物与模板的序列要紧密互补。引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应等。另外,引物的设计方法也越来越多,出现了许多专门的设计软件和网站,如:PrimerPremier5.0等。 关键词:PCR 引物原理方法 NCBI PrimerPremier5.0 PCR primer design principle and method YanZhenxin (sichuan Univercity, Life science college cell biology chengdu 610014 ) Abstract: When PCR technology was find, PCR has changed all of the program in research of biology. The design of primer is the frist step of PCR. It is relation to the fate of PCR. There are some principals must be obey: dipolymer and hairpin structure must be avoid between different primers. The DNA polymerization reaction should not be triggered at the wrong site. Therefore, there are more and more methods of design primer, include the professional softwares and professional web site. Key word: PCR primer principle NCBI PrimerPremier5.0 聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction。PCR)是20世纪后期发展起来的 一种体外扩增特异DNA片断的技术。具有快速、简便及高度敏感等优点,能极大地缩短目的基因扩增时间[1]。因此,其一直是生物学者们致力于构建cDNA文库、基因克隆以及表达调控研究的必要前提和基础[2]。PCR的第一步就是引物设计。引物设计的好坏,直接影响了PCR的结果,因此这一步很关键。成功的PCR反应既要高效,又要特异性扩增产物,因此对引物设计提出了较高的要求。引物设计需要注意的地方很多,在大多数情况下,我们都是在知道已知模板序列时进行PCR扩增的。在某些情况比如构建文库的时候也会在不知道模板序列的情况下进行设计。这个时候随机核苷酸序列

引物设计软件使用

一、引物设计step by step 1、在NCBI上搜索到目的基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。 2、用Primer Premier5搜索引物 ①打开Primer Premier5,点击File-New-DNA sequence, 出现输入序列窗口,Copy目的序列在输入框内(选择As),此窗口内,序列也可以直接翻译成蛋白。点击Primer,进入引物窗口。 ②此窗口可以链接到“引物搜索”、“引物编辑”以及“搜索结果”选项,点击Search按钮,进入引物搜索框,选择“PCR primers”,“Pairs”,设定搜索区域和引物长度和产物长度。在Search Parameters里面,可以设定相应参数。一般若无特殊需要,参数选择默认即可,但产物长度可以适当变化,因为100~200b p的产物电泳跑得较散,所以可以选择300~500bp. ③点击OK,软件即开始自动搜索引物,搜索完成后,会自动跳出结果窗口,搜索结果默认按照评分(Rating)排序,点击其中任一个搜索结果,可以在“引物窗口”中,显示出该引物的综合情况,包括上游引物和下游引物的序列和位置,引物的各种信息等。 ④对于引物的序列,可以简单查看一下,避免出现下列情况:3’不要出现连续的3个碱基相连的情况,比如GGG或CCC,否则容易引起错配。此窗口中需要着重查看的包括:T m应该在55~70度之间,GC%应该在45%~55%间,上游引物和下游引物的T m值最好不要相差太多,大概在2度以下较好。该窗口的最下面列出了两条引物的二级结构信息,包括,发卡,二聚体,引物间交叉二聚体和错误引发位置。若按钮显示为红色,表示存在该二级结构,点击该红色按钮,即可看到相应二级结构位置图示。最理想的引物,应该都不存在这些二级结构,即这几个按钮都显示为“None”为好。但有时很难找到各个条件都满足的引物,所以要求可以适当放宽,比如引物存在错配的话,可以就具体情况考察该错配的效率如何,是否会明显影响产物。对于引物具体详细的评价需要借助于Oligo来完成,Oligo自身虽然带有引物搜索功能,但其搜索出的引物质量感觉不如Primer5. ⑤在Primer5窗口中,若觉得某一对引物合适,可以在搜索结果窗口中,点击该引物,然后在菜单栏,选择File-Print-Current pair,使用PDF虚拟打印机,即可转换为Pdf文档,里面有该引物的详细信息。 3、用Oligo验证评估引物 ①在Oligo软件界面,File菜单下,选择Open,定位到目的cDNA序列(在primer中,该序列已经被保存为Seq文件),会跳出来两个窗口,分别为Internal Stability(Delta G)窗口和Tm窗口。在Tm 窗口中,点击最左下角的按钮,会出来引物定位对话框,输入候选的上游引物序列位置(Primer5已经给出)即可,而引物长度可以通过点击Change-Current oligo length来改变。定位后,点击Tm窗口的U

PCR引物设计原理及原则

PCR引物设计原理及原则 PCR引物设计原理 PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。 要设计引物首先要找到DNA序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构,就要避开它。如这一段不能形成二级结构,那就可以在这一区域设计引物。 现在可以在这一保守区域里设计一对引物。一般引物长度为15~30碱基,扩增片段长度为100~600碱基对。 让我们先看看P1引物。一般引物序列中G+C含量一般为40%~60%。而且四种碱基的分布最好随机。不要有聚嘌呤或聚嘧啶存在。否则P1引物设计的就不合理。应重新寻找区域设计引物。 同时引物之间也不能有互补性,一般一对引物间不应多于4个连续碱基的互补。 引物确定以后,可以对引物进行必要的修饰,例如可以在引物的5′端加酶切位点序列;标记生物素、荧光素、地高辛等,这对扩增的特异性影响不大。但3′端绝对不能进行任何修饰,因为引物的延伸是从3′端开始的。这里还需提醒的是3′端不要终止于密码子的第3位,因为密码子第3位易发生简并,会影响扩增的特异性与效率。 PCR引物的设计原则: ①引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。 ②产物不能形成二级结构。 ③引物长度一般在15~30碱基之间。 ④G+C含量在40%~60%之间。 ⑤碱基要随机分布。 ⑥引物自身不能有连续4个碱基的互补。 ⑦引物之间不能有连续4个碱基的互补。 ⑧引物5′端可以修饰。 ⑨引物3′端不可修饰。 ⑩引物3′端要避开密码子的第3位。 PCR引物设计的目的是找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。如前述,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。对引物的设计不可能有一种包罗万象的规则确保PCR的成功,但遵循某些原则,则有助于引物的设计。 1.引物的特异性 引物与非特异扩增序列的同源性不要超过70%或有连续8个互补碱基同源。 2.避开产物的二级结构区 某些引物无效的主要原因是引物重复区DNA二级结构的影响,选择扩增片段时最好避开二级结构区域。用有关计算机软件可以预测估计mRNA的稳定二级结构,有助于选择模板。实验表明,待扩区域自由能(△G°)小于58.6lkJ/mol时,扩增往往不能成功。若不能避开这一区域时,用7-deaza-2′-脱氧GTP取代dGTP对扩增的成功是有帮助的。 3.长度 寡核苷酸引物长度为15~30bp,一般为20~27mer。引物的有效长度:Ln=2(G+C)+(A+T+,Ln值不能大于38,因为>38时,最适延伸温度会超过Taq DNA聚合酶的最适温度(74℃),不能保证产物的特异性。 4.G+C含量

引物设计的原理与方法

引物设计的原理与方法 The latest revision on November 22, 2020

PCR引物设计的原理及方法 阎振鑫S111666(四川大学生命科学学院细胞生物学成都 610014) 摘要:自20世纪后期发展了PCR技术以来,PCR已经改变了整个生物学研究的进程。而PCR反应的第一步就是设计引物,引物设计的好坏直接关系到PCR的成败。PCR引物设计有许多的原则必须要遵循:引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,引物与模板的序列要紧密互补。引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应等。另外,引物的设计方法也越来越多,出现了许多专门的设计软件和网站,如:PrimerPremier5.0等。 关键词:PCR 引物原理方法 NCBI PrimerPremier5.0 PCR primer design principle and method YanZhenxin (sichuan Univercity, Life science college cell biology chengdu 610014 ) Abstract: When PCR technology was find, PCR has changed all of the program in research of biology. The design of primer is the frist step of PCR. It is relation to the fate of PCR. There are some principals must be obey: dipolymer and hairpin structure must be avoid between different primers. The DNA polymerization reaction should not be triggered at the wrong site. Therefore, there are more and more methods of design primer, include the professional softwares and professional web site. Key word: PCR primer principle NCBI PrimerPremier5.0 聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction。PCR)是20世纪后期发展起来的 一种体外扩增特异DNA片断的技术。具有快速、简便及高度敏感等优点,能极大地缩短目的基因扩增时间[1]。因此,其一直是生物学者们致力于构建cDNA文库、基因克隆以及表达调控研究的必要前提和基础[2]。PCR的第一步就是引物设计。引物设计的好坏,直接影响了PCR的结果,因此这一步很关键。成功的PCR反应既要高效,又要特异性扩增产物,因此对引物设计提出了较高的要求。引物设计需要注意的地方很多,在大多数情况下,我们都是在知道已知模板序列时进行PCR扩增的。在某些情况比如构建文库的时候也会在不知道模板序列的情况下进行设计。这个时候随机核苷酸序列

平面设计常用软件

平面设计常用软件 说到平面设计软件、修图软件,大家首选联想到的肯定是Photoshop(也就是PS),但是在平面设计中,图像处理软件培训除了PS软件以外,还有CorelDraw、InDesign、Illustrator 等等。下面小编为大家简单介绍下除了PS软件,还有哪些常用的平面设计常用软件吧: CorelDraw软件 属于矢量绘图软件,也可称之为图形图像软件。学习文字的各个类型,掌握不同风格的版式,利用蒙版技巧实现像素图的遮罩处理。通过Coreldraw强大的交互式工具,使其创作出多种富于动感的特殊效果。掌握页面设计,网站设计,位图的编辑,海报制作,展板设计,DM广告,包装设计等。 Illustrator软件 矢量绘图软件,学习基本图形工具组,运用基本图形工具组实现卡通插画,掌握路径编辑,完成创意文字的修饰手法。学习文字编排实现报刊排版、画册内页排版等。利用渐变与混合特效完成商业设计,如:杂志设计、书籍装帧、海报设计与复杂插画设计等。掌握强大的外观、效果与滤镜,实现3D特效处理与创意设计。 InDesign软件 专业排版软件,认识主页的意义,掌握主页的功能与增加主页,完成各种排版。学习表格的使用,如:在表格中添加文本,添加图片,将表格转换为文本等。利用强大的编辑排版技巧,熟练手动排版与自动排版的领域。页码的设计与目录的制作等。掌握杂志、书籍、广告排版等技巧。 After Effects软件 图形视频处理软件——可以理解为动的Photoshop 学习扫描格式在各个领域的运用,掌握帧在动画里的定义,序列帧导入的技巧与问题,学习照相馆相片动画的制作,影视片头制作等。学习关键帧动画,文字特效动画,三维合成(灯光的运用摄像机的布局),遮罩蒙版的技巧,追踪技巧的控制,动态图像抠图,仿真特效的使用(下雨、下雪、爆炸、粉碎等),结合PS、AI完成动态广告设计。 Premiere软件 它是非线性编辑设备的视音频编辑软件,可以在各种平台下和硬件配合使用,被广泛的应用于电视台、广告制作、电影剪辑等领域。学习剪片技巧与表现,掌握声画对位,三点四点编辑,声音处理手法,影片与声音的分离,DV与自拍短片制作等。 总结:平面设计是一个涉及的很广的行业,基本上各行各业都会需要的,所以相对于其它设计行业来说,平面设计是就业面最广的,也就是最好就业的。假设是个人兴趣想要学学修图,那么自学下PS软件就行啦,如果是想从事平面设计这个行业,以后想有更好的发展前景,那么会的软件当然是多多益善了。以上内容由武汉it新时空整理发布,转载请注明来源。

引物设计的原理与方法

PCR引物设计的原理及方法 阎振鑫S111666(四川大学生命科学学院细胞生物学成都610014) 摘要:自20世纪后期发展了PCR技术以来,PCR已经改变了整个生物学研究的进程。而PCR反应的第一步就是设计引物,引物设计的好坏直接关系到PCR的成败。PCR引物设计有许多的原则必须要遵循:引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,引物与模板的序列要紧密互补。引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应等。另外,引物的设计方法也越来越多,出现了许多专门的设计软件和网站,如:PrimerPremier5.0等。 关键词:PCR 引物原理方法NCBI PrimerPremier5.0 PCR primer design principle and method YanZhenxin (sichuan Univercity, Life science college cell biology chengdu 610014 ) Abstract: When PCR technology was find, PCR has changed all of the program in research of biology. The design of primer is the frist step of PCR. It is relation to the fate of PCR. There are some principals must be obey: dipolymer and hairpin structure must be avoid between different primers. The DNA polymerization reaction should not be triggered at the wrong site. Therefore, there are more and more methods of design primer, include the professional softwares and professional web site. Key word: PCR primer principle NCBI PrimerPremier5.0 聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction。PCR)是20世纪后期发展起来的一种体外扩增特异DNA片断的技术。具有快速、简便及高度敏感等优点,能极大地缩短目的基因扩增时间[1]。因此,其一直是生物学者们致力于构建cDNA文库、基因克隆以及表达调控研究的必要前提和基础[2]。PCR的第一步就是引物设计。引物设计的好坏,直接影响了PCR的结果,因此这一步很关键。成功的PCR反应既要高效,又要特异性扩增产物,因此对引物设计提出了较高的要求。引物设计需要注意的地方很多,在大多数情况下,我们都是在知道已知模板序列时进行PCR扩增的。在某些情况比如构建文库的时候也会在不知道模板序列的情况下进行设计。这个时候随机核苷酸序列就与模板不是完全匹配。我们通常指的设计引物都是在已知模板序列的情况下进行。设计的目的是在两个目标间取得平衡:扩增特异性和扩增效率。

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