琼脂X技术

琼脂X技术
琼脂X技术

X技术>中国专利技术>有机化合物处理,合成应用技术一种琼脂及其制备方法

专利名称一种琼脂及其制备方法技术领域本发明涉及一种低溶解温度、低凝固温度和低融化温度的琼脂制备方法。

背景技术琼脂也称“琼胶”,日本人将琼脂称为“寒天”,英文名为Agar-Agar或Agar,又名洋菜、冻粉,燕菜精,洋粉,是从石花菜、江蓠等红藻植物提制的多糖,其主要成分为多聚半乳糖的硫酸脂。琼脂因其有特殊的凝胶性质,已被广泛使用于食品、医药、化工、纺织、国防、科研等领域。琼脂早已被美国食品药物管理条例列为公认安全的产品,获准作为食品添加剂作为专题载入食品化学品药典之中。1973年联合国粮农组织和世界卫生组织评价认为琼脂每人每日每公斤体重允许摄入不加限制,所以琼脂是安全的、不加限制使用的食品添加剂。琼脂所具有凝胶化特性不但已被各种食品生产所利用,而且在微生物培养基上也得到了广泛的应用。但是常规琼胶只能在95°C下10-15分钟才完全溶解,而且溶液呈浑浊,不透明状。在加热溶解时需要高温和较长的时间,成为其应用时的一大缺陷。中国专利申请第2005101122M号公开了一种琼脂生产工艺,该工艺将琼脂粉和助溶剂在搅拌条件下分散于水中,然后将完全溶解的琼脂溶胶低温冷冻至完全冻结,然后融解,脱水,在自然条件下或热风干燥的条件下,将预先配置好的分散剂以喷淋方式喷到干燥物表面,得到速溶琼脂。所得琼脂的溶解温度可降低到80°C,但其凝固温度、融化温度都没有明显的改善。随着食品工业的快速发展,对性能优良的琼脂的需求也越来越来迫切,如何制备出一种低溶解温度、低凝固温度和低融化温度的琼脂,成为本领域亟待解决的问题。发明内容为了得到一种低溶解温度、低凝固温度和低融化温度的琼脂,本发明提供了一种琼脂制备方法。根据该制备方法制备得到的琼脂具有低溶解温度、低凝固温度,和较低的琼脂凝胶融化温度。本发明的一个目的在于提供一种琼脂制备方法,包括如下步骤将琼脂原料溶解到强碱溶液中,加入脱甲氧基试剂进行反应;然后对反应后的溶液进行过滤、冷冻、脱水以及干燥,制得具有低溶解温度,低凝固温度,和较低琼脂凝胶溶化温度的琼脂。进一步地,在对反应溶液进行过滤之后,并在进行冷冻处理之前,向滤液加入扩散剂。优选地,扩散剂可以是蔗糖脂肪酸酯和95%酒精混合而成的混合物,或者是聚甘油脂肪酸酯和95%酒精混合而成的混合物。进一步地,在反应过程中加入的脱甲氧基试剂可以是过氧化氢。进一步地,在对反应后的溶液进行过滤之前,将水加入反应溶液,升高溶液温度至 90-105摄氏度,并保持1-3小时;然后将溶液的反应温度降低至55-65摄氏度,加入过氧化氢酶进行反应,去除反应体系中多余的过氧化氢。进一步地,琼脂原料与过氧化氢的质量比为1 0.05-0.15。进一步地,琼脂原料与扩散剂的质量比为1 0.025-0.125。本发明的另一目的在于提供一种由上述方法制备而成的琼脂,制备而得的琼脂溶解温度为60-80°C,凝固温度为30-35°C,融化温度为60_70°C。本发明通过对琼脂进行脱甲氧基的方法,有效降低了琼胶中甲氧基的含量,从而降低了其凝固温度和融化温度。另外,本发明还通过在反应滤液中加入扩散剂,从而增加了琼脂在水中的扩散性,缩短了琼胶的溶解时间。具体实施例方式以下将对本发明的实施例进行详细说明,但如下实施例仅是用以理解本发明,

而不能限制本发明,本发明可以由权利要求限定和覆盖的多种不同方式实施。本发明提供的新型琼脂制备方法通过对琼胶进行脱甲氧基处理,从而制备了一种低溶解温度、低凝固温度,以及低融化温度的琼脂。该方法的具体步骤包括将琼脂原料溶解到强碱溶液中,加入脱甲氧基试剂进行反应;以及对反应后的溶液进行过滤、冷冻、脱水以及干燥处理,制得了一种新型的琼脂产品。本发明所指的“琼脂原料”是指含有琼脂的原材料,该原材料可以是江蓠、石花菜或者其它红藻属物质。本发明所指的“强碱溶液”是指由碱金属化合物所形成的可溶解琼脂的溶液。在本发明提供的具体实施方式中,该碱性溶液可以是氢氧化钠溶液或者氢氧化钾溶液。本发明所指的“脱甲氧基试剂”是指可脱除琼脂中的甲氧基的试剂,如过氧化氢。也可以采用过氧化钠,其在水溶液中分解为氢氧化钠和过氧化氢,同样可以发挥脱甲氧基的作用。将琼脂原料溶解到强碱溶液中,利用脱甲氧基试剂将琼脂原料中的甲氧基脱除,得到了低溶解温度、低凝固温度,以及低融化温度的琼脂。优选地,当脱甲氧基试剂与琼脂充分反应后,可进一步去除反应液中剩余的脱甲氧基试剂。通过去除处理,可以将剩余的过氧化氢从反应体系中除去,从而保证了最终产品的纯度,满足产品的食品级要求。可以理解的是,当采用其他脱甲氧基试剂进行脱甲氧基反应时,本领域技术人员完全可以根据所采用的具体脱甲氧基试剂而选择相应的去除方法,在这里就不再赘述了。进一步地,在本发明提供的制备方法中,可以在脱甲氧基反应后的滤液中加入扩散剂,从而增加琼脂在水中的扩散性,缩短琼胶的溶解时间。本发明所采用的扩散剂可以是蔗糖脂肪酸酯和95%酒精混合而成的混合物,或者是聚甘油脂肪酸酯和95%酒精混合而成的混合物。本发明所提供的琼脂制备方法的具体步骤包括:

1、取一定量的江蓠、石花菜或者其它红藻属琼脂原料,添加到强碱溶液中。强碱溶液可以是氢氧化钠或者是氢氧化钾,强碱溶液的浓度优选为5-15%,如果低于5%,则有可能琼胶不能完全溶出,如果高于15%,则可能会影响凝胶的强度。优选地,上述琼脂原料与强碱溶液的质量比为1 10,小于此比例可能会导致琼胶提取不充分,大于此比例可能凝胶的强度过低。

2、将琼脂原料溶解到强碱溶液后,向溶液中加入脱甲氧基试剂,并将反应溶液升温至70-90°C,保温1-3小时进行反应。优选地,上述琼脂原料与脱甲氧基试剂的质量比控制在1 0.05-0. 15,如果小于此比例,琼脂中的甲氧基可能反应不完全;如果大于此比例,则可能导致琼胶过度降解,凝胶强度下降。停止脱甲氧基反应后,倾去碱液,水洗至中性。优选地,为了满足琼脂的食品级要求,可在完成上述步骤之后,去除反应体系中剩余的脱甲氧基试剂。在本发明提供的具体实施方式中,去除脱甲氧基试剂的步骤具体为在洗净后的琼脂中加入水,琼脂与水的质量比可以是1 20,升温至90-105°C,保温1-3小时。然后将温度降至阳_651,加入过氧化氢酶去除溶液中剩余的过氧化氢。琼脂原料与过氧化氢酶的质量比可以是1 0. 0025-0. 0075 ;继续搅拌保温30-60分钟。

3、用板框压滤机或者袋滤进行过滤,得到澄清的滤液。优选地,在完成上述过滤处理后,在滤液中加入扩散剂,以加快琼脂的溶解速度。具体步骤如下将滤液降温至50-60°C,

向滤液中加入扩散剂,搅拌30-60分钟。扩散剂的制备方法为将蔗糖脂肪酸酯(或者聚甘油脂肪酸酯)和95%酒精按质量比1 10溶解,搅拌30-60分钟。优选地,琼脂和扩散剂的质量比控制在1 0.025-0. 125。在此比例范围内,琼脂的溶解时间较短。4、将滤液或加有扩散剂的滤液置于5°C冷冻4小时,然后置于_20°C冷冻M小时。将完全凝固的胶体进行解冻脱水后,进行压榨脱水,然后进行热风干燥或真空干燥,干燥的温度为50-70°C,干燥时间为12-36小时。如果真空干燥,真空度为65pa。将干燥后的琼胶粉碎,得到低温、速溶琼胶成品。下面通过实施例对本发明作进一步的阐述。所用原料江蓠(Gracilaria Verrucosa)采用山东省威海市俚岛的新鲜的江蓠,经过自然干燥后,水份控制在20%以下。氢氧化钠、过氧化氢采用工业级。过氧化氢酶为食品级,酶活力为50000U/G。蔗糖脂肪酸酯和聚甘油脂肪酸酯为食品级,符合中华人民共和国国家标准。酒精为食品级95%酒精。所用设备及其型号与制造商为真空干燥箱FZG-10型,常州市长江干燥设备有限公司;粉碎机30BIVV万能高效粉碎机,江苏振兴干燥设备有限公司板框压滤机杭州防腐设备有限公司的870型板框压滤机;

实施例1 取50公斤氢氧化钠,缓缓添加到950公斤常水中,搅拌5分钟备用。取100公斤江蓠干品,加入到上述氢氧化钠溶液中,然后加入5公斤过氧化氢,升温至70°C,保温1小时。然后倾去碱液,水洗至中性。用板框压滤机或者袋滤进行过滤,得到澄清的滤液。将滤液置于5°C冷冻4小时,然后置于_20°C冷冻M小时。将完全凝固的胶体进行解冻脱水后,进行压榨脱水,然后进行热风干燥或真空干燥,干燥的温度为50°C,干燥时间为12小时。将干燥后的琼胶粉碎,得到低温速溶琼胶成品19. 8公斤。

实施例2 取150公斤氢氧化钠,缓缓添加到850公斤常水中,搅拌5分钟备用。取100公斤江蓠干品,加入到上述氢氧化钠溶液中,然后加入15公斤过氧化氢,升温至90°C,保温3小时。然后倾去碱液,水洗至中性。洗净后的海藻(江蓠)加入2000公斤常水,升温至90°C,保温3小时。然后将温度降至65°C,加入0. 75公斤过氧化氢酶,搅拌保温60分钟。用板框压滤机或者袋滤进行过滤,得到澄清的滤液。将滤液置于5°C 冷冻4小时,然后置于_20°C冷冻M小时。将完全凝固的胶体进行解冻脱水后,进行压榨脱水,然后进行热风干燥或真空干燥,干燥的温度为70°C,干燥时间为36小时。将干燥后的琼胶粉碎,得到低温速溶琼胶成品18. 6公斤。

实施例3 取100公斤氢氧化钾,缓缓添加到900公斤常水中,搅拌5分钟备用。取100公斤江蓠干品,加入到上述氢氧化钠溶液中,然后加入10公斤过氧化氢,升温至80°C,保温2小时。然后倾去碱液,水洗至中性。洗净后的海藻加入2000公斤常水,升温至95°C,保温2小时。然后将温度降至 600C,加入0. 5公斤过氧化氢酶,搅拌保温45分钟。用板框压滤机或者袋滤进行过滤,得到澄清的滤液。取聚甘油脂肪酸酯7. 5公斤,加入到75公斤95%酒精中,搅拌45分钟。将海藻滤液降温至55°C,向滤液中加入上述扩散剂,搅拌45分钟。将滤液置于5°C冷冻4小时,然后置于-20°C冷冻M小时。将完全凝固的胶体进行解冻脱水后,进行压榨脱水,然后进行热风干燥或真空干燥,干燥的温度为60°C,干燥时间为M小时,真空度为65pa。将干燥后的琼胶粉碎,得到

低温速溶琼胶成品21. 1公斤。

实施例4 取100公斤氢氧化钠,缓缓添加到900公斤常水中,搅拌5分钟备用。取100公斤江蓠干品,加入到上述氢氧化钠溶液中,然后加入10公斤过氧化氢,升温至80°C,保温2小时。然后倾去碱液,水洗至中性。洗净后的海藻加入2000公斤常水,升温至95°C,保温2小时。然后将温度降至 600C,加入0. 5公斤过氧化氢酶,搅拌保温45分钟。用板框压滤机或者袋滤进行过滤,得到澄清的滤液。取蔗糖脂肪酸酯2. 5公斤,加入到25公斤95%酒精中,搅拌45分钟。将海藻滤液降温至55°C,向滤液中加入上述扩散剂,搅拌45分钟。将滤液置于5°C冷冻4小时,然后置于_20°C冷冻M小时。将完全凝固的胶体进行解冻脱水后,进行压榨脱水,然后进行热风干燥或真空干燥,干燥的温度为60°C,干燥时间为M小时,真空度为65pa。将干燥后的琼胶粉碎,得到低温速溶琼胶成品20. 6公斤。

实施例5 取100公斤氢氧化钠,缓缓添加到900公斤常水中,搅拌5分钟备用。取100公斤江蓠干品,加入到上述氢氧化钠溶液中,然后加入15公斤过氧化氢,升温至80°C,保温2小时。然后倾去碱液,水洗至中性。洗净后的海藻加入2000公斤常水,升温至95°C,保温2小时。然后将温度降至 600C,加入0. 5公斤过氧化氢酶,搅拌保温45分钟。用板框压滤机或者袋滤进行过滤,得到澄清的滤液。取聚甘油脂肪酸酯12. 5公斤,加入到25公斤95%酒精中,搅拌45分钟。将海藻滤液降温至^°C,向滤液中加入上述扩散剂,搅拌40分钟。将滤液置于5°C冷冻4小时,然后置于_20°C冷冻M小时。将完全凝固的胶体进行解冻脱水后,进行压榨脱水,然后进行热风干燥或真空干燥,干燥的温度为60°C,干燥时间为M小时,真空度为65pa。将干燥后的琼胶粉碎,得到低温速溶琼胶成品20. 3公斤。

附表产品性能对照表权利要求:

1.一种琼脂的制备方法,其特征在于,包括如下步骤将琼脂原料溶解到强碱溶液中,加入脱甲氧基试剂进行反应;以及对反应后的溶液进行过滤、冷冻、脱水以及干燥处理。

2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述制备方法进一步包括在进行所述过滤处理之后,所述冷冻处理之前,向滤液中加入扩散剂。

3.根据权利要求1或2所述的制备方法,其特征在于,所述脱甲氧基试剂为过氧化氢。

4.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于,所述扩散剂为蔗糖脂肪酸酯和95% 酒精混合而成的混合物,或者是聚甘油脂肪酸酯和95%酒精混合而成的混合物。

5.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,在对所述反应后的溶液进行过滤之前,所述制备方法进一步包括将水加入所述反应溶液,升高溶液温度至90-105摄氏度,并保持1-3小时;以及将温度降低至阳-65摄氏度,加入过氧化氢酶进行反应。

6.根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于,所述琼脂原料与过氧化氢的质量比为 1 0. 05-0. 15。

7.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于,所述琼脂原料与扩散剂的质量比

为 1 0.025-0.125。

8.一种由权利要求1-7中任一项制备方法制备而成的琼脂,其特征在于,所述琼脂的溶解温度为60-80°C,凝固温度为30-35°C,融化温度为60_70°C。

全文摘要本发明公开了一种琼脂制备方法及由其制得的琼脂。该制备方法包括如下步骤将琼脂原料溶解到强碱溶液中,加入脱甲氧基试剂进行反应;然后对反应后的溶液进行过滤、冷冻、脱水以及干燥处理,制得新型琼脂产品。根据该制备方法制备得到的琼脂具有低溶解温度、低凝固温度,和较低的融化温度的优点。文档编号C08B37/12GK102153677SQ20111006692 公开日2011年8月17日申请日期2011年3月18日优先权日2011年3月18日发明者张晓川申请人:张晓川

哥伦比亚血琼脂基础说明书

哥伦比亚血琼脂基础培养基使用说明书 【产品名称】 通用名称:哥伦比亚血琼脂基础培养基 英文名称:Columbia Blood Agar Base Medium 【包装规格】 Φ90㎜和Φ70㎜,5块/包。 【预期用途】 本产品用于营养需求较高的细菌培养和保存菌种用,既适合革兰氏阳性菌生长也适合革兰氏阴性菌生 长。 【检验原理】 培养基(Medium)是指由人工方法配制而成的,专供微生物培养、分离、鉴别、研究和保存用的混合营养制品。培养基按用途分为基础培养基、增菌培养基、选择性培养基、鉴别培养基和厌氧培养基等,按原料来源分为天然培养基、半合成培养基和合成培养基。按形态分为液体培养基、流体培养基、半固体培养基和固体培养基等。 本产品是以人工的方法配制而成的,除基础培养基外另外还添加了脱纤维羊血,以增加营养性能,适 应有些细菌的特殊营养要求。 【主要组成成份】 哥伦比亚血琼脂基础培养基由脱纤维羊血、蛋白胨、氯化钠、牛肉浸粉、琼脂粉和玫瑰红酸等原料经配制、高压灭菌,至45℃加入动物血定量灌入一次性塑料培养基内而成。 【贮存条件及有效期】 2-8℃,避光保存,有效期3个月,用前复温。 【样本要求】 标本可以是液体也可以是固体,液体标本可以直接使用,固体标本需用适量无菌生理盐水溶解后,取溶液使用。根据浓度需要决定是否采用10倍稀释法进行稀释。 【检验方法】 用接种环或棉签以无菌方法取标本直接画线接种于培养基中,或无菌吸取0.1ml适当浓度的标本溶液用玻璃涂布棒均匀涂布于培养基中,置35~37℃温箱中培养。 【检验结果的解释】 大肠埃希氏菌生长良好,菌落为白色半透明;金黄色葡萄球菌产生β-溶血环,菌落呈金黄色;肺炎链球菌的周围产生α溶血。 【检验方法的局限性】 正确的标本采集及良好的细菌划线分离技术是检出细菌的基础,所检出细菌要经镜检、生化鉴定来确 认。 【注意事项】 1.该培养基仅用于体外诊断。

琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳实验原理)

打印 琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳实验原理 聚丙烯酰胺凝胶电泳,普遍用于分离蛋白质及较小分子的核酸。琼脂糖凝胶孔径较大适用于分离同工酶及其亚型,大分子核酸等应用较广。琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。琼脂糖凝胶分离DNA度大小范围较广,不 同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA段。琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。聚丙烯酰胺分离小片段DNA (5-500bp) 效果较好,其分辩力极高,甚至相差1bp的DNA段就能分开。聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的DNA,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行DNA电泳。 琼脂糖凝胶电泳原理: 琼脂糖是从琼脂中提纯出来的,主要是由D-半乳糖和3,6脱水L-半乳糖连接而成的一种线性多糖。琼脂糖凝胶的制作是将干的琼脂糖悬浮于缓冲液中,通常使用的浓度是1%-3%,加热煮沸至溶液变为澄清,注入模板后室温下冷却凝聚即成琼脂糖凝胶。琼脂糖主要在DNA制备电泳中作为一种固体支持基质。琼脂糖之间以分子内和分子间氢键形成较为稳定的交联结构,这种交联的结构使琼脂糖凝 胶有较好的抗对流性质。琼脂糖凝胶的孔径可以通过琼脂糖的最初浓度来控制,低浓度的琼脂糖形成较大的孔径,而高浓度的琼脂糖形成较小的孔径。尽管琼脂糖本身没有电荷,但一些糖基可能会被羧基、甲氧基特别是硫酸根不同程度的取代,使得琼脂糖凝胶表面带有一定的电荷,引起电泳过程中发生电渗以及样品和凝胶间的静电相互作用,影响分离效果。 琼脂糖凝胶可以用于蛋白质和核酸的电泳支持介质,尤其适合于核酸的提纯、分析。如浓度为1%的琼脂糖凝胶的孔径对于蛋白质来说是比较大的,对蛋白质的阻碍作用较小,这时蛋白质分子大小对电泳迁移率的影响相对较小,所以适用于 一些忽略蛋白质大小而只根据蛋白质天然电荷来进行分离的电泳技术,如免疫电泳、平板等电聚焦电泳等。琼脂糖也适合于DNA、RNA分子的分离、分析,由于DNA、RNA分子通常较大,所以在分离过程中会存在一定的摩擦阻碍作用,这时分子的大小会对电泳迁移率产生明显影响。例如对于双链DNA,电泳迁移率 的大小主要与DNA分子大小有关,而与碱基排列及组成无关。另外,一些低熔点的琼脂糖在62 C时熔化,因此其中的样品(如DNA),可以在加热到熔点的水浴中放置一段时间,重新溶解到溶液中而回收。 由于琼脂糖凝胶的弹性较差,难以从小管中取出,所以一般琼脂糖凝胶不适合于管状电泳,管状电泳通常采用聚丙烯酰胺凝胶。琼脂糖凝胶通常是形成水平式板状凝胶,用于等电聚焦、免疫电泳等蛋白质电泳,以及DNA、RNA的分析。垂 直式电泳应用得相对较少。 目前多用琼脂糖为电泳支持物进行平板电泳,其优点如下:

琼脂糖凝胶电泳目的及后续工作

琼脂糖凝胶电泳的应用 琼脂糖凝胶电泳是用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。对于分子量较大的样品,如大分子核酸、病毒等,一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离。 1.分离纯化大片段DNA 琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广,尤其适于分离大片段DNA。普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。分离后如需回收:将需要的DNA胶部分切下,尽量不要切到多余的胶。切胶后加入3倍体积TE,水浴熔化后,酚、酚或氯仿抽提干净,乙醇沉淀即可。 2.提取大分子DNA构建大片段基因组文库的关键就是获得高分子量的基因组DNA。而利用成熟的商品化试剂盒提取基因组DNA只能得到大小约在20kb左右的DNA;酶抽提法需经过多次抽提法才能得到较纯的DNA,但极易造成基因组断裂,也难以得到大于300kb的基因组DNA。两种方法均不能达到目的,但经过研究人员不懈的研究,利用琼脂糖凝胶制备成凝胶块提取基因组DNA能够获得足够大的DNA片段,可以完全符合构建粘粒基因组文库的要求。在此过程中研究人员在用低熔点琼脂糖还是普通熔点琼脂糖制备凝胶块的问题中选择了后者,因为低熔点琼脂糖价格昂贵且胶块在制备纯化的过程中容易断裂,而普通熔点琼脂糖与低熔点琼脂糖在基因组DNA制备方面没有区别。 3.PCR产物检测在基因组DNA的提取中,DNA经孵育及抽提、沉淀后以70%乙醇洗涤2次,再适量的双蒸水溶解DNA。然后在1.0%的琼脂糖凝胶上进行电泳,以1kb DNA ladder 为参照,估计DNA溶液浓度。具体检验方法是:2.0%琼脂糖制成凝胶,取6 微升AFLP-PCR产物与1微升上样缓冲液混匀后上样,用1×TBE电泳缓冲液,120V电泳50min,使用EB溶液染色后在凝胶成像系统(ChampGel-3200)上观察拍照。 4.免疫扩散法中的应用免疫扩散法是指抗原与抗体在同一凝胶中扩散的方法,是观察可溶性抗原与相应抗体反应和抗原抗体鉴定的最基本方法之一。利用琼脂糖凝胶作为扩

琼脂糖凝胶电泳及其影响因素

琼脂糖凝胶电泳及其影响因素 琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离鉴定和纯化DNA片段的标准方法。该技术操作简便快速,可以分辨用其它方法(如密度梯度离心法)所无法分离的DNA片段。当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium bromide, EB)染色,在紫外光下至少可以检出1-10ng的DNA条带,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置。此外,还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA条带,用于以后的克隆操作。 琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。琼脂糖凝胶分离DNA片度大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA片段。琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。聚丙烯酰胺分离小片段DNA(5-500bp)效果较好,其分辩力极高,甚至相差1bp的DNA片段就能分开。聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的DNA,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行DNA电泳。 琼脂糖主要在DNA制备电泳中作为一种固体支持基质,其密度取决于琼脂糖的浓度。在电场中,在中性pH值下带负电荷的DNA向阳极迁移,其迁移速率由下列多种因素决定: 1、 DNA的分子大小: 线状双链DNA分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中蠕行,因而迁移得越慢。 2、琼脂糖浓度 一个给定大小的线状DNA分子,其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同。DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小。分离小于0.5kb的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%,分离大于10kb的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%。 3、 DNA分子的构象 当DNA分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子量有关,还和它本身构象有关。相同分子量的线状、开环和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度是不一样的,超螺旋DNA移动最快,而线状双链DNA 移动最慢。如在电泳鉴定质粒纯度时发现凝胶上有数条DNA带难以确定是质粒DNA不同构象引起还是因为含有其他DNA引起时,可从琼脂糖凝胶上将DNA带逐个回收,用同一种限制性内切酶分别水解,然后电泳,如在凝胶上出现相同的DNA图谱,则为同一种DNA。 4、电源电压 在低电压时,线状DNA片段的迁移速率与所加电压成正比。但是随着电场强度的增加,不同分子量的DNA片段的迁移率将以不同的幅度增长,片段越大,因场强升高引起的迁移率升高幅度也越大,因此电压增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围将缩小。要使大于2kb的DNA片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过5v/cm。 5、嵌入染料的存在 荧光染料溴化乙啶用于检测琼脂糖凝胶中的DNA,染料会嵌入到堆积的碱基对之间并拉长线状和带缺口的环状DNA,使其刚性更强,还会使线状DNA迁移率降低15%。 6、离子强度影响 电泳缓冲液的组成及其离子强度影响DNA的电泳迁移率。在没有离子存在时(如误用蒸馏水配制凝胶),电导率最小,DNA几乎不移动,在高离子强度的缓冲液中(如误加10×电泳缓冲液),则电导很高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化或DNA变性。

实验二 琼脂糖凝胶电泳实验知识交流

实验二琼脂糖凝胶电 泳实验

实验二琼脂糖凝胶电泳实验 【实验目的】 (1)学习琼脂糖凝胶电泳的基本原理; (2)掌握使用水平式电泳仪的方法; (3)学习在含有甲醛的凝胶上进行RNA电泳的方法。 【实验原理】 琼脂糖凝胶电泳是基因工程实验室中分离鉴定核酸的常规方法。核酸是两性电解质,其等电点为 pH2-2.5,在常规的电泳缓冲液中(pH约8.5),核酸分子带负电荷,在电场中向正极移动。核酸分子在琼脂糖凝胶中泳动时,具有电荷效应和分子筛效应,但主要为分子筛效应。因此,核酸分子的迁移率由下列几种因素决定: (1)DNA的分子大小。线状双链DNA分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中移动,因而迁移得越慢。 (2)DNA分子的构象。当DNA分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子量有关,还和它本身构象有关。相同分子量的线状、开环和超螺旋质粒DNA在琼脂糖凝胶中移动的速度是不一样的,超螺旋DNA移动得最快,而开环状DNA移动最慢。如在电泳鉴定质粒纯度时发现凝胶上有数条DNA带难以确定是质粒DNA不同构象引起还是因为含有其他DNA引起时,可从琼脂糖凝胶上将DNA带逐个回收,用同一种限制性内切酶分别水解,然后电泳,如在凝胶上出现相同的DNA图谱,则为同一种DNA。 (3)电源电压。在低电压时,线状DNA片段的迁移速率与所加电压成正比。但是随着电场强度的增加,不同分子量的DNA片段的迁移率将以不同的幅度增长,片段越大,因场强升高引起的迁移率升高幅度也越大,因此电压增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围将缩小。要使大于2kb 的DNA 片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过5v/cm。

琼脂糖凝胶电泳标准操作流程

琼脂糖凝胶电泳操作标准流程 一、实验目的 琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,具有操作方便、经济快速等优点。本铜人阵学习DNA 琼脂糖凝胶电泳的使用技术,此关为能力考核,通关成功后,代表具备操作琼脂糖电泳的能力。 二、实验原理 琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA 、RNA 分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA 分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。DNA 分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。在一定的电场强度下,DNA 分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。DNA 分子的迁移速度与其相对分子量成反比。不同构型的DNA 分子的迁移速度不同。如环形DNA 分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA )、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA)。这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为:cccDNA > IDNA >ocDNA 影响核酸分子泳动率的因素主要还是:1、DNA 分子大小;2、琼脂糖浓度; 3、DNA 构想; 4、所用的电压; 5、琼脂糖种类; 6、电泳缓冲液 核酸电泳中常用的染色剂是溴化乙锭(ethidium bromide EB )。溴化乙锭是一种扁平分子,可以嵌入核酸双链的配对碱基之间。在紫外线照射BE-DNA 复合物时,出现不同的效应。254nm的紫外线照射时,灵敏度最高,但对DNA损伤严重;360nm紫外线照射时,虽然灵敏度较低,但对DNA损伤小,所以适合对DNA样品的观察和回收等操作。300nm紫外线照射的灵敏度较高,且对DNA 损伤不是很大,所以也比较适用。 三、材料、试剂及器具 1、材料 不同大小的基因组片段; 2、试剂 Hind III digest DNA Marker (分子量标准)(TaKaRa);D2000(TianGen);

营养琼脂培养基配方及使用说明

营养琼脂培养基配方及使用说明 022020 营养琼脂(普通肉汤琼脂培养基) (Nutrient Agar) 营养琼脂培养基用途: 营养琼脂培养基NA用于细菌总数测定、保存菌种及纯培养,也可用于消毒效果测定(GB/T4789.28-2003 中4.7 ,GB/T4789.2-2003,GB15979-2002和GB15981-1995,ISO标准)。 营养琼脂培养基检测原理: 蛋白胨和牛肉膏粉提供氮源、维生素、氨基酸和碳源;氯化钠能维持均衡的渗透压;琼脂是培养基的凝固剂。 营养琼脂培养基配方(每升): 蛋白胨 10g 牛肉膏粉 3g 氯化钠 5g 琼脂 15g 最终pH 7.3±0.2 培养基使用方法:

1、称取营养琼脂培养基NA 33g,加入蒸馏水或去离子水1 L,搅拌加热煮沸至完全溶解,分装三角瓶,121℃高压灭菌15min,备用。 2、(食品)以无菌操作称取检样25克(或25mL),放入含有225mL灭菌生理盐水或其他稀释液的玻璃三角瓶中(瓶内预置适当数量的玻璃珠),充分振摇,即为1:10的均匀稀释液。依次做1:100,1:1000……稀释液。 3、根据对样品污染情况的估计,选择2—3个合适的稀释度,分别在做10倍稀释的同时,吸取1mL稀释液于灭菌平皿中,每个稀释度做2个平皿。 4、稀释液移入平皿后应及时将凉至46℃左右的培养基注入平皿约15mL,并转动平皿使混合均匀,同时将营养琼脂培养基倾入加有1mL稀释液的灭菌平皿内作空白对照。待琼脂凝固后,倒置于36±1℃温箱中培养48±2h。 5、观察结果。 6、菌落计数方法: 做平板菌落计数时,可用肉眼观察,必要时用放大镜检查,以防遗漏,在计下各平板的菌落数后,求出同稀释度的各平板平均菌落总数。

琼脂糖凝胶电泳 配方与步骤

?RNA琼脂糖凝胶电泳: 配制: 1.0.5M EDTA(pH=8.0): 100ml:称取18.61g Na2EDTA·2H2O(分子量372.24),加80ml ddH2O剧烈搅拌, 用NaOH调节PH值至8.0(约需2g NaOH).高压灭菌,室温保存。 2.50×TAE loading buffer:(Tris acetate-EDTA buffer)电泳缓冲液 组分:2M Tris-乙酸;100mM EDTA(pH=8.0) 500mL:称121.1g Trisbase(分子量121.14),加800ml ddH2O溶解,加57.1ml 乙酸和50ml0.5M EDTA溶液(pH=8.0),搅拌,ddH2O定容至500mL.室温保存。 3.1×TAE loading buffer: 取20ml50×TAE,ddH2O定容至1L.室温保存。 4.100×Sybergreen: 500ul:取495ul1×TAE于1.5ml离心管,加入5ul Sybergreen原液混匀,4℃锡纸 避光保存。 注意:Sybergreen原液需稀释10000倍; 6×DNA loading buffer上样缓冲液需稀释六倍,最终稀释倍数应不小于1×。 步骤: 1.制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml,我们用30ml): 称0.3g琼脂糖置于100ml锥形瓶中,加入30ml1×TAE,瓶口倒扣小烧杯。 微波炉加热煮沸3次,至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液。 2.胶板制备: 取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子.将内槽置于水平位置,并放好梳子. 将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层.室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止. 3.加样: 样品制备:(10ul体系/样品槽)于0.25ml离心管中 样品RNA(最后加):2ul/3ul/5ul 6×DNA loading buffer:10/6=1.7ul 100×Sybergreen:0.1ul DEPC水:至10ul (注意:加样前要先记下加样的顺序).分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个枪头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面. 4.电泳: 加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动.电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低.当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳. 5.电泳完毕后,取出凝胶,利用科212凝胶成像系统,在紫外灯(trans UV)下观察拍照 保存.DNA存在则显示出红色荧光条带.RNA完美提出应该是三条带:28,18,5.8。 28和18比较亮,而且28是18亮度的2倍,5.8基本很模糊,可有可无

RNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和步骤

RNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和步骤 关键词:RNA琼脂糖电泳2012-03-09 00:00 来源:互联网点击次数:38148 一、实验目的 掌握植物总RNA非变性胶电泳的原理和方法。 二、实验原理 RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1%琼脂糖凝胶即可。

三、实验材料、器具及药品 蘑菇的总RNA溶液。电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫外透射检测仪等。琼脂糖,1XTAE电泳缓冲液,0.5μg/ml溴化乙锭(EB)10X载样缓冲液。 四、实验步骤 (1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。 (2)在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4μl于封口膜上。在实验台上再加入5μl 1×TAE电泳缓冲液及1μl 的10X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。 (3)打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极电泳,约30min 后将凝胶放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗。在紫外透射检测仪上观察RNA电泳结果。

RNA的变性琼脂糖凝胶检测 试剂: (1)MOPS缓冲液(10*):0.4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS)(Ph7.0),0.1mol/L NaAc, 10mol/L EDTA。 (2)上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚蓝,0.4%二甲苯蓝。(3)甲醛。 (4)去离子甲酰胺。v电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)——水冲洗——乙醇干燥——3%H2O2灌满——室温放置10分钟——0.1%DEPC水冲洗。 操作:

培养基配方及配制方法

培养基配方1 斜面菌种保存培养基 培养基(马铃薯葡萄糖琼脂培养基) 称取200g马铃薯,洗净去皮切碎,加水1000ml煮沸,纱布过滤,滤液补足1000ml,再加15g葡萄糖和15-20g琼脂,充分溶解后趁热纱布过滤,分装试管,每试管约5-10ml(视试管大小而定),121℃灭菌20分钟左右后取出试管摆斜面,冷却后贮存备用。 麦芽汁琼脂培养基 麦芽汁的制备:干麦芽首先进行粉碎(不能太粗,也不必太细。太粗影响糖化效率,过细影响过滤速度),按麦芽重量的3~4倍加水,搅拌均匀后,37℃左右浸泡1小时,然后缓缓加温至55~63℃(在升温过程中应不断搅拌使温度均匀),保温4~6小时(用摩尔/升碘液测定为黄色至无色时),糖化结束。在糖化过程中,应每小时搅拌一次。取过滤后的清液,加%琼脂,分装试管,每试管约5-10ml(视试管大小而定),121℃灭菌20分钟左右后取出试管摆斜面,冷却后贮存备用。 2 基菌落总数检测 平板计数琼脂培养基 将?胰蛋白胨5.0g、酵母浸膏2.5g、葡萄糖1.0g、琼脂15.0g 加入蒸馏水1000ml中,煮沸溶解后,调pH,然后在121℃下灭菌15min,取出,稍微冷却后,带热倒入培养皿中。

3志贺氏菌检测 GN增菌液 成分:胰蛋白胨:20g,葡萄糖:1g,甘露醇:2g,柠檬酸钠:5g,去氧胆酸钠0.5g,磷酸二氢钾4g,磷酸氢二钾1.5g,氯化钠5g,蒸馏水1000ml。 制法:将上述物品加入蒸馏水中,加热溶解煮沸,调pH为,分装,在115℃高压灭菌15min。 HE琼脂 成分:胨:12g,牛肉膏3g,乳糖12g,蔗糖12g,水杨素2g,胆碱20g,氯化钠5g,琼脂18~20g,蒸馏水1000ml0,%溴麝香草酚蓝溶液16ml,Andrade指示剂20ml.,甲液20ml,乙液20ml。 制法:将上述前七种成分加入400ml蒸馏水中作为基础液,将琼脂加入到600ml蒸馏水中加热溶解,加入甲液乙液到基础液中,调pH,再加入指示剂,并与琼脂液合并,待冷却至50~55℃,倾注浇平板。注1:此培养基不能高温灭菌。 注2:甲液的配置: 硫代硫酸钠:34g,柠檬酸铁钠:4g,蒸馏水:100ml。 注3:乙液的配置: 去氧胆酸钠:10g,蒸馏水:100ml。 注4:Andrade指示剂的配置: 酸性复红:0.5g,1mol/l的氢氧化钠溶液:16ml,蒸馏水:100ml。将酸性复红溶解于蒸馏水中,加入氢氧化钠溶液,数小时后如复红褪

琼脂糖凝胶电泳

DNA琼脂糖凝胶电泳 跑胶即走电泳,是DNA 和protein 最基本的定性定量方法。一般是琼脂糖胶或page 胶,琼脂糖胶一般是检测DNA的,可以检验一下你到底提到dna没过确定你提dna分子量的大小:page胶一般是检测蛋白特性的,通过page胶里marker的分子量大小来确定你需要的目的蛋白分子量大小,如果有杂带那就可以判断那条带是你需要的目的条带,如果想知道蛋白浓度,还可以在page胶里带上一条定量marker,通过条带粗细,来判断你需要蛋白的浓度。二者原理一致,小分子量用大浓度的胶,大分子量用小浓度的胶,特别小的DNA 用丙烯酰胺凝胶。 一、基本原理 当把一个带净电荷(q)的颗粒放入电场,便有一个电场力(F)作用于其上。F的大小取决于颗粒静电荷量及其所处的电场强度(E),它们之间的关系可以表示成:F=E×q。 由于F的作用,使带电颗粒在电场中向一定方向泳动。此颗粒在泳动的过程中还受到一个相反方向的摩擦力(f*v)阻挡。当这两种力相等时,颗粒则以速度(v)向前泳动:v=F/f,其中f为摩擦系数。根据Stoke公式,阻力大小取决于带电颗粒的大小、形状以及所处介质的粘度,即f=6πγη, γ为颗粒半径,η为介质粘度。该公式指球形颗粒所受的阻力。代入F=E×q得到: v=E×q/6πγη.从这个公式可以看出,带电颗粒在电场中泳动的速度与电场强度和带电颗粒的净电荷量成正比,与颗粒半径和介质粘度成反比。 带电颗粒在电场中泳动的速度常用泳动度(m)或者迁移率以下列公式表示:m=μ/E=d*l/V*t d为带电颗粒泳动的距离(cm),l为支持物的有效长度(cm),t为通电时间(s),V为加在支持物两端的电压。 在一定条件下,任何带电颗粒都具有自己特定的泳动度。它是胶体颗粒的一个物理常数,可用其鉴定蛋白质、核酸等物质的纯度,还可以用其来研究蛋白质、核酸等物质的一些理化性质。影响泳动度的因子有颗粒的性质、电场强度、溶液的性质等。 二、琼脂糖凝胶电泳 通常情况下,核酸类物质的分离、鉴定是采用琼脂糖凝胶(做支持物)电泳法进行的。用琼脂糖分离线性DNA时,其迁移率与该物质分子质量的关系密切,而与结构和碱基组成无关。这也是采用凝胶电泳法测定核酸分子质量的依据所在。此方法除了可以分离线性DNA外,还可以分离、分析细菌质粒的闭环DNA和开环DNA,以及分子质量不等的RNA片段。一般实验室采用的琼脂糖凝胶的浓度为0.3%——2%。不同的凝胶浓度,可以分离不同长度的DNA片段。具体见表格: 琼脂糖凝胶 /% m/V 分离线性DNA片段的范围 /kb 0.3 50---60 0.6 1----20 0.7 0.8---10 0.9 0.5---7.0 1.2 0.4----6.0 1.5 0.3---3.0

(完整word版)DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤

一、实验目的 琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,学习DNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法。 二、实验原理 琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比。不同构型的DNA分子的迁移速度不同。如环形DNA分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA)。这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为:cccDNA>IDNA>ocDNA 核酸分子是两性解离分子,pH3.5是碱基上的氨基解离,而三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极泳动;而pH8.0-8.3时,碱基几乎不解离,而磷酸基团解离,所以核酸分子带负电,在电场中向正极泳动。不同的核酸分子的电荷密度大致相同,因此对泳动速度影响不大。在中性或碱性时,单链DNA与等长的双链DNA的泳动率大致相同。 影响核酸分子泳动率的因素主要是: 1、样品的物理性状 即分子的大小、电荷数、颗粒形状和空间构型。一般而言,电荷密度愈大,泳动率越大。但是不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对泳动率的影响不明显。 对线形分子来说,分子量的常用对数与泳动率成反比,用此标准样品电泳并测定其泳动率,然后进行DNA分子长度(bp)的负对数——泳动距离作标准曲线图,可以用于测定未知分子的长度大小。 DNA分子的空间构型对泳动率的影响很大,比如质粒分子,泳动率的大小顺序为:cDNA >IDNA>ocDNA但是由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭等的影响,会出现相反的情况。 2、支持物介质 核酸电泳通常使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶两种介质,琼脂糖是一种聚合链线性分子。含有不同浓度的琼脂糖的凝胶构成的分子筛的网孔大小不同,是于分离不同浓度范围的核酸分子。聚丙烯酰胺凝胶由丙烯酰胺(Acr)在N,N,N′-四甲基乙四胺(TEMED)和过硫酸铵

凝胶电泳实验原理与步骤

一、实验目的 学习和掌握琼脂糖电泳法鉴定DNA的原理和方法。 二、实验原理 琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。 三、实验材料 实验14提取的DNA样品, 四、器具及药品 电泳仪,电泳槽,紫外透射反射仪,恒温水浴锅,微波炉,微量进样器,三羟甲基氨基甲烷,盐酸,醋酸钠,EDTA,琼脂糖,溴酚蓝,溴化乙锭。 五、实验步骤 1、安装电泳槽 将有机玻璃的电泳凝胶床洗净,晾干,用胶带将两端的开口封好,放在水平的工作台上,插上样品梳。 2、琼脂糖凝胶的制备 称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按0.3-1.5%的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用0.5%的凝胶,200-2000bp的DNA用1.5%的凝胶)置微波炉或沸水浴中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。 3、灌胶 将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上。 4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。 5、加样 将DNA样品与加样缓冲液按4:1混匀后,用微量移液器将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。 6、电泳 安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。 7、染色和观察 取出凝胶,放在含有溴化乙锭的染色液中染色30min,即可在254nm的紫外灯下观察,有橙红色荧光条带的位置,即为DNA条带,或在紫外灯下照相记录电泳图谱。溴化乙锭是致癌剂,操作时要小心,必须戴手套。 附: ⑴5×TBE(tris-硼酸及EDTA)缓冲液的配制(1000ml): Tris 54g,硼酸27.5g,0.5mol/L EDTA 20ml,将pH调到8.0,定容至1000ml,4℃冰箱保存,用时稀释10倍。 ⑵加样缓冲液的配制: 0.25%溴酚蓝,40%(W/V)蔗糖水溶液,4℃冰箱保存。 ⑶溴化乙锭的配制: 称取0.1g溴化乙锭,溶于10ml水,配成终浓度为10mg/ml的母液,4℃冰箱保存。染

琼脂糖凝胶电泳

琼脂糖凝胶电泳 1.原理 琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。 琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。但由于其孔径相当大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。 蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广。普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速率向正极方向移动。 2操作流程 准备干净的配胶板和电泳槽 琼脂糖凝胶电泳:水平电泳 注意DNA酶污染的仪器可能会降解DNA,造成条带信号弱、模糊甚至缺失的现象。 (1)电泳方法

一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以;如果需要分辨率高的电泳,特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳;用普通电泳不合适的巨大DNA链应该使用脉冲凝胶电泳。注意巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。 (2)凝胶浓度 对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。注意高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。 (3)缓冲液 常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。注意电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。 三羟甲基氨基甲烷(Tris(hydroxymethyl)aminomethane,一般简称为Tris)是一种有机化合物,其分子式为(HOCH2)3CNH2。Tris被广泛应用于生物化学和分子生物学实验中的缓冲液的制备。例如,在生物化学实验中常用的TAE和TBE 缓冲液(用于核酸的溶解)都需要用到Tris。 (4)电压和温度 电泳时电压不应该超过20V/cm,电泳温度应该低于30℃,对于巨大的DNA 电泳,温度应该低于15℃。注意如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象 (5)DNA样品的纯度和状态 注意样品中含盐量太高和含杂质蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。乙醇沉淀可以去除多余的盐,用酚可以去除蛋白。注意变性的DNA样品可能导致条带模糊和缺失,也可能出现不规则的DNA条带迁移。在上样前不要对DNA样品加热,用20mM NaCl缓冲液稀释可以防止DNA变性。 (6)DNA的上样

实验五--核酸琼脂糖凝胶电泳

实验五核酸琼脂糖凝胶电泳 一、实验目的 琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,具有操作方便、经济快速等优点。本实验学习DNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法。 二、实验原理 琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率也不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。但是EB具有致癌性,所以我们选用无毒,高灵敏度是Ex Green染料,。此核酸染料在紫外透照仪及可见光透射仪上均可使用。ExGreen外观呈红色,与核酸结合后,可用300 nm (紫外透射仪)激发。

三、材料、仪器和试剂 1、材料大肠杆菌中提取的质粒DNA 2、仪器电泳仪;台式离心机;恒温水浴锅;微波炉;紫外透射仪;照相机或者凝胶成像系统 3、试剂 (1)50×TAE电泳缓冲液:称取Tris 242g,EDTA 37.2g,加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解,加入57.1ml的醋酸,充分搅拌,加去离子水定容至1L,室温保存。 (2)6×电泳上样缓冲液:0.25%溴酚蓝、40%(W/V)蔗糖水溶液,贮存于4℃。 (3)溴化乙锭(EB)溶液母液:将EB配制成10mg/mL。用铝箔或黑纸包裹容器,贮存于室温即可。 (4)分子量标准DNA:DNA Marker 四、操作步骤 1、制备1%琼脂糖凝胶(大胶用40ml,小胶用30ml):称取0.7 g(0.5 g) 琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml) 1×TAE,瓶口倒扣小烧杯。微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液。 注意:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须是相同的 2、胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子。将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子。在冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液中加入Ex Green染料(10ml:1ul),混匀后小

实验室常用培养基大全

表皮葡萄球菌 产气肠杆菌 鼠伤寒沙门氏菌 单核增生李斯特氏菌 大肠埃希氏菌 金黄色葡萄球菌 金黄色葡萄球菌 金黄色葡萄球菌 表皮葡萄球菌 表面接触碟/表面接触皿 https://www.360docs.net/doc/6416987597.html, 金黄色葡萄球菌 酿酒酵母菌 脑心浸出液肉汤(BHI) 品红亚硫酸钠液体培养基 MFC肉汤 CFU培养基基础 4-甲基伞形酮葡糖苷酸(MUG)培养基蛋白胨 胰蛋白胨 胰酪蛋白胨 酵母浸粉 大豆蛋白胨 酸水解酪蛋白 明胶蛋白胨 马铃薯浸粉 琼脂粉 琼脂粉 动物组织胃蛋白酶消化物 肉胃酶消化物 牛肉浸粉 牛肝浸粉 牛肝浸粉 牛心浸粉 多价蛋白胨(多聚蛋白胨) 月示蛋白胨 玉米浸出粉 一次性培养皿 表面接触碟 一次性培养皿(密理博浮游菌采样)表面接触碟/表面接触皿 https://www.360docs.net/doc/6416987597.html, 金属玻璃培养皿(可重复使用) 金属玻璃表面接触碟

嗜热脂肪肝菌芽孢菌片(ATCC7953 枯草杆菌黑色变种芽孢菌片(ATCC9372)121度高压灭菌化学指示卡 132℃压力蒸汽灭菌指示卡 葡萄糖 氯化钠 L-半胱氨酸盐酸盐 氧化酶试剂 三磷酸腺苷二钠盐(ATP) 费尔休林(无吡啶) SDS-PAGE凝胶配制试剂盒 SDS-PAGE电泳液 SDS-PAGE上样缓冲液5倍 考马斯亮蓝R-250染色套装 铜绿假单胞菌 金黄色葡萄球菌 表皮葡萄球菌 大肠埃希氏菌 大肠埃希氏菌 产气肠杆菌 乙型副伤寒沙门氏菌 枯草芽孢杆菌 白色念珠菌 表面接触碟/表面接触皿 https://www.360docs.net/doc/6416987597.html, 黑曲霉 生孢梭菌 大豆酪蛋白肉汤培养基(胰酪胨大豆肉汤) 大豆酪蛋白肉汤培养基(胰酪胨大豆肉汤) 无菌大豆酪蛋白肉汤培养基(胰酪胨大豆肉? 大豆酪蛋白肉汤培养基(胰酪胨大豆肉汤) 大豆酪蛋白消化液培养基 大豆酪蛋白琼脂培养基 大豆酪蛋白琼脂培养基 无菌大豆酪蛋白琼脂培养基 卵磷脂-吐温80营养琼脂培养基基础 胰化大豆坚固绿琼脂(TSFA) 营养肉汤(NB) 营养琼脂(NA) 0.5%葡萄糖肉汤培养基 pH7.0氯化钠-蛋白胨缓冲液 三糖铁琼脂培养基(TSI) 三糖铁琼脂培养基 R2A琼脂

琼脂糖凝胶电泳技术

电泳检测技术是指利用带电颗粒在电场中能向异性电极泳动这一现象来分离、纯化或分析检测供试品的一种生物化学技术。 原理:许多生物分子都带有电荷,在电场作用下可发生移动,由于混合物中各组分所带电荷性质、数量以及相对分子质量各不相同,使在同一电场作用下,各组分的泳动方向和速率也各有差异,所以在一定时间内,它们移动距离不同,从而可达到分离鉴定的目的。 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,包括电荷效应和分子筛效应。 琼脂糖是由天然的琼脂加工制得,是一种直链杂聚多糖,溶于热水,形成溶胶,冷却后成为孔径范围从50nm到大于200nm的大网孔径凝胶。由于孔径较大,对一般蛋白质不起分子筛作用,该电泳技术是目前分离、分析DNA片段的标准方法。 DNA琼脂糖凝胶电泳的原理 DNA 分子是两性电解质,在高于其等电点的溶液(pH8.0~pH8.3 DNA分子本身的大小和构型、凝胶浓度决定了DNA分子的迁移速度。)中,碱基几乎不解离,磷酸基团全部解离,DNA 分子带负电荷,在电场中向正极移动。 DNA分子大小对迁移速率的影响:相对分子质量大,迁移慢;相对分子质量小,迁移快。DNA分子构型对迁移速率的影响:迁移速度:闭环﹥直链DNA﹥开环DNA。 琼脂糖凝胶浓度的影响:同样大小的线性DNA片段,在不同浓度的琼脂糖凝胶中的迁移速度不同,浓度越大,迁移的越慢 常用的电泳上样缓冲液含溴酚蓝,有的还含有二甲苯青,这些指示剂可以指示电泳的速度。溴化乙淀(EB)是核酸的染色剂,能插入DNA分子中形成荧光结合物,EB在紫外线照射下的发射荧光。荧光的强度与DNA的含量成正比,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置及估计出待测样品的浓度。 EB是强致癌剂。 电泳操作步骤(整个过程要求带一次性手套 1、胶槽准备 ①将凝胶托盘放入制胶盒中; ②将加样梳垂直插入到制胶盒的小凹槽内,梳齿底端和凝胶托盘有1mm的间隙; ③将制胶盒放在调整好的水平台上。 2、凝胶准备用1×TAE配制1%琼脂糖凝胶。 ①称0.15g琼脂糖置三角瓶中,加15ml 1×TAE; ②微波炉加热大约1分钟,熔化琼脂糖; ③熔化的琼脂糖自然冷却到60~70℃时,加入DNA染料,并轻轻混匀。 3、倒胶:将冷却致60℃的凝胶倒入准备好的制胶盒内,凝胶厚度3~5mm,室温下静置半小时左右冷却,凝胶固化。 4、轻轻拔出固定在凝胶中的加样梳。将带凝胶的凝胶托盘置于电泳槽中,并使样品孔位于电场负极,向电泳槽中加入1×TAE电泳缓冲液,越过凝胶表面即可,出去样品孔的气泡。 6、样品准备:向核酸样品中加入约为样品体积1/10的上样缓冲液,用加样器轻轻混匀。 7、上样:用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中。加样量一般5-7μl。 8、盖上电泳槽,接通电源,开始电泳。 开始电泳前,再次确认凝胶样品孔处于电场的负极。 电泳条件:5v/cm;时间20-30分钟左右 9、电泳结束后,切断电源,取出凝胶。

血琼脂培养基配制标准操作规程

血琼脂培养基配制标准操作规程 1.目的 规范血琼脂培养基配制标准操作规程,保证培养基质量。 2.原理 羊血或兔血等是细菌生长繁殖的良好营养物质。在45~50℃的基础培养基中加入血液可以完好保存血液中某些不耐热的生长因子,同时血细胞不被破坏。若将NaCl浓度提高到0.85%,可使血平皿在35℃培养18~24小时后色泽仍然新鲜。 3.用途 供一般病原菌的分离培养、溶血性鉴别及保存菌种用。 4.配方 特殊蛋白胨23g、淀粉1g,氯化钠5g、琼脂10g、无菌脱纤维羊血(或兔血)5%~10%,pH7.1~7.5。 5.操作步骤

将上述成分混合,溶于1000ml蒸馏水中,加热溶化,校正pH,121℃高压灭菌15分钟。冷却至50℃加入无菌血液,充分摇匀后倾注平板,待凝固后冷藏备用。血琼脂层厚4mm。 6.储存条件 2~8℃冰箱。 7.有效期 实验室自行规定,确保培养基质量。 8. 质量控制 8.1 质控频度每次新配制时做质控 8.2 质控方法及结果见表5-18. 表5-18 配制血琼脂培养基质量控制方法及结果 试验方法结果 无菌试验<100块抽检5%,>100块随机取10 块,35℃培养,观察有无细菌生长 化脓性链球菌ATCC19615,35℃,培 无细菌生长

生长试验 平行试 验 养18~24小时 肺炎链球菌ATCC6305,35℃,培养 18~24小时 金黄色葡萄球菌ATCC25923, 35℃,培养18~24小时 大肠埃希菌ATCC25922,35℃,培养 18~24小时 做质控时,取新旧批号的培养基同时 做 生长良好,β溶血 生长良好,a溶血 生长良好,β溶血 生长良好, 9.注意事项 倾注时温度不易过高,否则血细胞易被破坏而溶血;若 温度过低,琼脂易凝固。 参考文献 [1] 周庭银编著.临床微生物学诊断与图解.第二版.上海: 上海科学技术出版社,2007

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