鸡病毒性关节炎病毒B-98株S1基因的克隆与序列分析
一株鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因分析
一株鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因分析谢蟾龙;杨傲冰;尚书文;林德锐【摘要】广西某种鸡场一株IBV,命名为GXJLZ6/150707,对其进行鸡胚发育分析,并测定S1全基因序列.结果显示,鸡胚出现蜷缩胚或发育不良等病理现象.S1基因序列分析发现,分离株GXJLZ6/150707与疫苗株4/91等793/B型毒株为相同的基因来源,与腺胃型毒株LX4型毒株亲缘性较近,氨基酸相似性为94.8％;与经典肾型疫苗毒株D274、Gray、澳大利亚T株和Mass型经典呼吸型疫苗毒株H52、H120和W93株等亲缘性较远,氨基酸相似性为65.7～85.6％.考虑到该种鸡场长期使用活疫苗ND+H120+4/91的情况,因此推测,分离毒株GXJLZ6/150707可能是一种嵌合病毒,即H120等Mass型疫苗毒株与4/91疫苗毒发生重组后形成的新型病毒.本研究结果可为IBV的防控工作和疫苗株的选择提供科学依据.【期刊名称】《广东畜牧兽医科技》【年(卷),期】2018(043)003【总页数】5页(P29-33)【关键词】传染性支气管炎;分离;鉴定;S1基因分析【作者】谢蟾龙;杨傲冰;尚书文;林德锐【作者单位】广东永顺生物制药股份有限公司,广东广州 511356;广东永顺生物制药股份有限公司,广东广州 511356;广东永顺生物制药股份有限公司,广东广州511356;广东永顺生物制药股份有限公司,广东广州 511356【正文语种】中文【中图分类】S852.65+7鸡传染性支气管炎（IB）是由传染性支气管炎病毒（IBV）引起的高度接触性、急性传染病，以气管啰音、咳嗽和打喷嚏为特征。
可引起料肉比降低、肉鸡品质受损、产蛋量下降和蛋的品质下降等，给养殖业造成严重的经济损失［1，2］。
IBV也能在输卵管复制。
成年鸡感染后产蛋量会下降10～50%或更多，同时畸形蛋数量增多，蛋壳色泽发生改变。
感染鸡群的产蛋率一般不能再恢复到正常水平。
我国鸡传染性支气管炎病毒的遗传变异和进化分析
我国鸡传染性支气管炎病毒的遗传变异和进化分析作者：李玉杰盛媛魏秀丽徐恩民吴静刘娜马秀丽来源：《家禽科学》2021年第06期摘要：本研究测定了2020年以来本实验室从不同地区分离的44个IBV毒株的S1基因序列，并与参考株序列进行比较分析。
结果发现分离的44个IBV毒株共占据5个分支。
其中：第一分支为QX型，包括25个分离株，QX型分离株又分为ClusterⅠ亚分支（7个）和ClusterⅡ亚分支（18个）;第二分支为4/91型，包括12个分离株;第三分支为LDT3型，包括3个分离株;第四分支为Mass型，包括2个分离株;第五分支为TW型，包括2个分离株。
从毒株遗传进化分析结果可以看出，QX型仍是我国IBV流行的主要基因型。
关键词：传染性支气管炎病毒;S1基因;遗传变异;进化变异中图分类号：S858.31 文献标识码：B 文章编号：1673-1085（2021）6-0005-05传染性支气管炎（IB）是鸡的一种急性、高度接触性的病毒性呼吸道疾病，在国内流行甚广。
传染性支气管炎病毒（IBV）属于冠状病毒科冠状病毒属的成员之一，其基因组为单股线状正链RNA，含有3种主要结构蛋白，即纤突蛋白S、膜蛋白M和核蛋白N。
S1基因是IBV 基因组中最易发生变异的部位，其编码蛋白可诱导机体产生IBV特异的中和抗体和血凝抑制抗体，S1蛋白在进化上比M蛋白和N蛋白都表现活跃，因此可不断导致IBV新的血清型、亚型和变异株的产生，致使IBV疫苗免疫失败，给鸡传染性支气管炎的防制带来新的困难。
由于传染性支气管炎病毒血清型和变异株众多，各型之间无交叉反应或交叉反应差。
因此，对于传染性支气管炎的防控，首先需明确当地流行传染性支气管炎的血清型和变异株。
从分子水平揭示近年来IBV的变异情况以及不同毒株之间的进化关系，对我国今后开展传染性支气管炎的监测和综合防控具有重要的指导意义。
因此，本研究針对2020年以来从不同地区分离的44株IBV毒株进行S1基因序列测定，比较分析了分离毒株的遗传演化，明确流行的基因型与变异趋势，对疫苗选择和疾病防控具有参考价值。
鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析的开题报告
鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析的开题报告一、研究背景及意义鸡传染性支气管炎（Infectious bronchitis，简称IB）是一种由禽传染性支气管炎病毒（Infectious bronchitis virus，IBV）引起的高度传染性呼吸道疾病，其主要临床表现为呼吸困难、鸡冠、眼睛和面部水肿、排泄物增多或减少等，对鸡的健康和养殖业的经济效益造成了很大的损失。
目前，虽然IBV可以通过疫苗预防和控制，但疫苗种类较多，不同毒株的疫苗保护效果不同，到目前为止，还没有一种完全有效的IBV疫苗，为了更好地预防和控制IBV感染，必须进一步深入研究IBV，对其分子特性和病理机理进行深入探究。
二、研究内容及目标本研究旨在通过分离IBV病毒，对其进行鉴定，并分析其S1基因序列，以期更深入地了解IBV的分子特性和病理机理，进而为研究和控制IBV感染提供科学依据和理论支持。
具体研究内容包括以下三个方面：1. 鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定：本研究将从感染鸡的上呼吸道样本中提取IBV病毒，并通过细胞培养等方法进行纯化和鉴定，确定其毒株类型。
2. S1基因的PCR扩增和测序：本研究将采用PCR技术扩增IBV病毒S1基因序列，并进行测序，获取其S1基因序列。
3. S1基因序列分析：通过对IBV病毒S1基因序列进行分析，包括启动子、终止密码子、保守位点和可变位点等，在比较其与其他IBV序列差异的基础上，研究IBV病毒的分子特性和病理机理。
三、研究方法1. 实验材料：IBV感染鸡的上呼吸道样本、细胞培养液等。
2. 实验方法：（1）IBV病毒分离鉴定：将感染鸡的上呼吸道样本进行稀释后，接种于鸡胚蛋并进行细胞培养，使用酶联免疫吸附试验（ELISA）和逆转录PCR等方法对样本中IBV病毒进行鉴定。
（2）S1基因PCR扩增和测序：采用PCR技术，合成适合的引物，对IBV病毒中的S1基因进行扩增，经过聚合酶扩增反应、纯化等步骤后，得到S1基因的PCR产物，将其进行测序。
鸡传染性支气管炎病毒KIBVXJ株S1基因的克隆及序列分析
有 良好 的免 疫 原 性 ， 以刺 激 机 体 产 生 特 异性 的免 可
研 究 ＫＩ ＶＸ Ｂ Ｊ株 Ｓ １基 因 的分子 结构 、 传进化 特点 遗
是 ５ ］ 其 临床症 状 以咳嗽 、 打喷 嚏 、 管 哕音 、 气 呼吸 困难 、 肠 疫抗 体 ， 良好 的 制 苗 毒 株［ 。本 试 验从 分子 水 平 纪 ９ ０年 代 报 道 肾 型 传 染 性 支 气 管 炎 （ ｎｅｔ ｕ 及基 因型 ， Ｉｆｃｉ ｓ ｏ 为新 疫 苗研 发筛 选 新 毒株 和 Ｉ Ｂ的防控 提 ｂ ｏ ｃ ｉｓ Ｉ ） ｒｎ ｈｔ ， 以来 ， ｉ Ｂ 肾型 传 染 性 支 气 管 炎 在 我 国大 供 可靠 的理 论 依据 。 部 分地 区流行 ［ ］ 其 主要 症 状 表 现 为 腹 泻 ， １， 患病 鸡 １ 材 料与 方法 最终 因 脱 水 而 死 亡 。病 理 变 化 主要 为 肾 脏 极 度 肿 １ １ 材料 ．
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鸡 传 染 性 支 气 管 炎 病 毒 ＫＩ ＶＸ Ｂ Ｊ株 Ｓ １基 因 的 克 隆 及 序 列分 析
鸡传支气管炎病毒分离及S1基因特性研究
种 急 性 、高 度 接 触 性 传 染 病 。 该 病 一 年 四季 均 可发 生 ，可
感染所有 １ ３龄鸡 只 ，多 发 于 寒 冷 潮 湿 冬 春 季 节 ，雏 鸡 最 为 易
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鸡传染性支气管炎病毒分离株与疫苗株抗原相关性和S1基因序列分析
鸡传染性支气管炎病毒分离株与疫苗株抗原相关性和S1基因序列分析任海松;张秀美;崔言顺;许传田;杨少华;李建亮;胡北侠【期刊名称】《山东农业大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2012(043)001【摘要】本实验挑选8株近年来山东省IBV分离株与疫苗株H120和491,利用SPF鸡分别制备了高免阳性血清,进行鸡胚交叉中和试验,计算其抗原相关系数,鉴定其血清型,并结合S1基因序列分析,研究其血清型和基因型之间的关系.结果显示:SDWF0608、SDLY0612、SDLY0701与疫苗株H120同属Mass血清型的不同亚型,其它5个分离株与H120和491不属于同一个血清型.结合S1基因序列分析发现,S1基因序列分析与血清中和结果二者不具有明显的相关性,8个分离株分属三个基因群,其中SDTA06111与H120等同属一个基因群,但血清中和实验显示它们不属于一个血清型；CK/CH/SD09/005与一个参考株独自构成一个基因群,其S1基因变异程度较大,并且能够与两个疫苗株发生交叉中和实验,但不属于一个血清型,它可能是一个基因重组后病毒.【总页数】5页(P74-78)【作者】任海松;张秀美;崔言顺;许传田;杨少华;李建亮;胡北侠【作者单位】山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018;山东农科院畜牧兽医研究所;山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东济南250100;山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018;山东农科院畜牧兽医研究所;山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东济南250100;山东农科院畜牧兽医研究所;山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东济南250100;山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018;山东农科院畜牧兽医研究所;山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东济南250100【正文语种】中文【中图分类】S852.65【相关文献】1.30株鸡传染性支气管炎病毒标准株与分离株S1基因的克隆及序列分析 [J], 谢志勤;谢芝勋;吕华刚2.鸡传染性支气管炎病毒广东分离株S1基因的克隆与序列分析 [J], 卢秀娴;张思远;叶贺佳;梅廷媛3.鸡传染性支气管炎病毒0801株的分离鉴定及S1基因序列分析 [J], 刘巍;孔义波;张兴晓;柴同杰4.两株鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析 [J], 尚辉琴;李琳;陈瑞爱;刘红波;梁梅兰;贺东生5.鸡传染性支气管炎病毒江苏分离株S1基因的克隆与序列分析 [J], 卢秀娴;张思远;梁昭平;叶贺佳;梅廷媛因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析的开题报告
2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析的开题报告【题目】2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及S1基因序列分析【研究背景】传染性支气管炎是一种由传染性支气管炎病毒引起的家禽呼吸道疾病，能够导致家禽呼吸道炎症和肺部病变。
该疾病对家禽养殖业造成了重大威胁，尤其是在冬季和春季高发期间，其致死率和感染率较高，给养殖业造成了较大的经济损失。
为了更好地控制和管理传染性支气管炎，对2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒进行分离鉴定和S1基因序列分析是非常必要的。
【研究目的】本研究旨在对2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒进行分离鉴定，并通过S1基因序列分析，探究病毒的分布情况、遗传特征等方面的内容，为传染性支气管炎的防治和管理提供基础资料。
【研究内容】本研究将采用细胞培养和RT-PCR技术对2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒进行分离鉴定，同时对其S1基因进行PCR扩增、克隆测序和分析，了解病毒的遗传特征、分布情况等方面的内容。
【研究方法】采用点滴法进行鸡传染性支气管炎病毒的分离培养，并通过RT-PCR技术对病毒进行鉴定。
使用PCR扩增技术对病毒S1基因进行扩增，克隆到载体上，然后进行测序。
通过序列比对和系统进化分析，探究鸡传染性支气管炎病毒的分布情况、遗传特征等方面的内容。
【预期结果】本研究将对2011-2012年鸡传染性支气管炎病毒进行分离鉴定和S1基因序列分析，明确病毒的分布情况和遗传特征，为传染性支气管炎的防治和管理提供基础数据和理论支持。
【研究意义】随着我国畜禽养殖技术的进步和养殖规模的扩大，传染性支气管炎对家禽养殖业的危害越来越大。
本研究将为传染性支气管炎的防治和管理提供基础资料和理论支持，探究病毒的分布、遗传特征等方面的内容，为科学防控这一疾病提供借鉴。
鸡传染性支气管炎北京地方株S1基因的克隆与鉴定
鸡传染性支气管炎北京地方株S1基因的克隆与鉴定
李华;杨汉春
【期刊名称】《中国兽医科技》
【年(卷),期】1999(029)001
【摘要】利用反转录套式聚合酶链反应技术从北京地区３株鸡性支气管炎病毒（ＩＢＶ）分离株中扩增出１０５４ｂｐＳ１基因高变区。
利用限制性内切酶ＳｉｎＩ和ＰｓｔⅠ的酶切位点分析图谱进一步证实了ＲＴ－ｎｅｓｔｅｄＰＣＲ的特异性。
将３段Ｓ１基因分别克隆到ＰＵＣ１９质粒中，获得重组质粒ＰＵＣＩＢＶＳ１－ＢＪ１，ＰＵＣＩＢＶＳ１－ＢＪ２和ＰＵＣＩＢＶＳ１－ＢＪ３。
【总页数】4页(P11-14)
【作者】李华;杨汉春
【作者单位】中国农业大学动物医学院;中国农业大学动物医学院
【正文语种】中文
【中图分类】S858.315.3
【相关文献】
1.鸡传染性支气管炎病毒两个地方分离株S1基因的扩增克隆与序列分析 [J], 戴亚斌;陈德胜;潘杰彦;姜焱;刘兴友;芦银华;刘梅;丁铲;陈溥言;蔡宝祥
2.鸡传染性支气管炎病毒地方-分离株S1基因克隆和基因型鉴定 [J], 祁贤;叶向阳;张婉华;朱永军;步志高;刘思国
3.我国鸡传染性支气管炎病毒地方性流行毒株S1基因的RT-PCR扩增及其克隆与鉴定 [J], 江国托;刘思国;康丽娟;步志高;祁贤;王秀荣;卢景良;褚玉锋
4.我国鸡传染性支气管炎病毒地方分离株S1基因的分离及初步鉴定 [J], 游洪;王林川
5.鸡传染性支气管炎病毒中国地方分离株S1基因的克隆及其鉴定 [J], 游洪;王林川
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（． １ 内蒙 古 农 业 大学 动 物 科 学 与 医 学 学 院 ，内 蒙古 呼 和浩 特 ０ ０ １ ； １ ０ ８ ２ 内蒙 古 动 物 疫 病 预 防 与 控制 中 心 ，内蒙 古 呼 和浩 特 ０ ０ １ ） ． １ ０ ０ 摘 要 ： 试验 对鸡病毒性 关节炎病 毒 （ 本 ＡＶＡ 包 头 地 区 分 离 株 （ 一８株 ） 行 总 Ｒ Ｖ） Ｂ９ 进 ＮＡ 的 提 取 。参 考 Ｇ ｎ ａ ｋ中 ＡＲ ｅＢｎ Ｖ— ｓ １ ３株ｓ 基 因组 序 列 设 计 两对 引 物 ， 用 Ｒ Ｐ Ｒ 技 术 特 异 性 地 扩 增 病 毒 的ｓ 基 因 的ｅ ＮＡ 片段 ， ｓ １３ １ 应 Ｔ—Ｃ １ Ｄ 将 １基 因 ｅ ＤＮＡ 克 隆 到
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中 国兽 医 杂志 ２ ０ ０ ７年 （ ４ 第 ３卷 ） ６期 第
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