酵母RNA的提取及组份鉴定与核酸的定量测定

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实验酵母RNA的提取及组份鉴定与核酸的定量测定

【课前预习】

1. 为什么用稀碱溶液可以使酵母细胞裂解?

2.如何从酵母中提取到较纯的RNA?

3.干扰RNA的提取的物质有哪些并设计排除这些干扰的实验。

4.干扰紫外线(UV)吸收法测定核酸浓度实验的物质有哪些?

【目的要求】

1. 了解并掌握稀碱法提取RNA的原理和方法。

2. 了解核酸的组分并掌握其鉴定方法。

3. 学习紫外线(UV)吸收法测定核酸浓度的原理。

【基本原理】

由于RNA的来源和种类很多,因而提取制备方法也很各异。一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。其中苯酚法又是实验是最常用的。组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被酚饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中。向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好的除去DNA和蛋白质。上述方法提取的RNA具有生物活性。工业上常用稀碱法和浓盐法提取RNA,用这两种方法所提取的核酸均为变性的RNA,主要用作制备核苷酸的原料,其工艺比较简单。浓盐法使用10%左右氯化钠溶液,90℃提取3-4h,迅速冷却,提取液经离心后, 上清液用乙醇沉淀RNA。稀碱法使用稀碱使酵母细胞裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀RNA或调pH2.5利用等电点沉淀。酵母含RNA达2. 67-10.0%,而DNA含量仅为0.03-0.516%,为此,提取RNA多以酵母为原料。RNA含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸各组分。加硫酸煮可使RNA水解,从水解液中可用定糖,定磷和加银沉淀等方法测出上述组份的存在。

核酸及其衍生物,核苷酸、核苷、嘌呤和嘧啶有吸收UV的性质,其吸收高峰在260nm波长处。核酸的摩尔消光系数(或称吸收系数)用来表示。为每升溶液中含有1克

原子核酸磷的光吸收值(即A值)(表)。测得未知浓度核酸溶液的A260nm值,即可以计算出其中RNA或DNA的含量。该法操作简便,迅速,并对被测样品无损,用量也少。

核酸摩尔消光系数及相应光吸收值

ε(P)

含磷量/(%) A260nm

pH7,260nm 1μg/mL RNA 7700-7800 9.5 0.022-0.024 DNA-Na盐6600 9.2 0.02

(小牛胸腺)

蛋白质也能吸收紫外光。通常蛋白质的吸收高峰在280nm波长处,在260nm出的吸收值仅为核酸的1/10或更低,因此对于含有微量蛋白质的核酸样品,测定误差较小。RNA的260nm 与280nm吸收的比值在2.0以上;DNA的260nm与280nmx吸收的比值则在1.9左右,当样品中蛋白质含量较高时,比值下降。若样品内混在有大量的蛋白质和核苷酸等吸收紫外光的物质,应设法先除去。

【实验用品】

1.试剂

1) 0.04M NaOH溶液;

2) 95%乙醇;1.5M硫酸;

3) 浓氨水;

4) 0.1M硝酸银;

5) 酸性乙醇溶液:30mL乙醇加0.3mL HCl;

6) 三氯化铁浓盐溶液:将2mL 10%三氯化铁(FeCl3· 6H2O)溶液加入400mL浓HCl;

7) 苔黑酚(3,5-二羟基甲苯)乙醇溶液:称取6g苔黑酚溶于95%乙醇100mL。

8) 定磷试剂:

(1) 17%硫酸:将17mL浓硫酸(比重1084)缓缓倾入83mL水中;

(2)2.5%鉬酸铵:2.5g鉬酸铵溶于100mL水中;

(3)10%抗坏血酸溶液:10g抗坏血酸溶于100mL 水,棕色并保存溶液;

临用时将三种溶液和水按下列比例混合: 17%硫酸:2.5%鉬酸铵:10%抗坏血酸:水=1:1:1:2(V/V)。

9) 钼酸铵-过氯酸沉淀剂:取3.6mL 70%过氯酸和0.25g钼酸铵溶于96.4mL蒸馏水中,即成0.25%钼酸铵-2.5%过氯酸溶液。

10) 5-6%氨水:用25-30%氨水稀释5倍。

11) 钼酸铵-过氯酸沉淀剂:取3.6mL 70%过氯酸和0.25g钼酸铵溶于96.4mL蒸馏水中,即成0.25%钼酸铵-2.5%过氯酸溶液。

12) 5-6%氨水:用25-30%氨水稀释5倍。

2.测试样品

干酵母粉。

3.器材

移液管0.2mL(×1),0.5mL(×2),1mL(×4),2mL(×4);滴管;容量瓶50mL(×3);量筒10 mL(×1);离心机;分光光度计;冰浴;水浴锅。

【方法步骤】

1.酵母RNA提取

称5g干酵母粉悬浮于30mL 0.04M NaOH溶液中并在研钵中研磨均匀。悬浮液转入三角烧瓶,沸水浴加热30min,冷却,转入离心管。3000转/分,离心15分钟后,将上清慢慢倾入10m L酸性乙醇,边加边搅动。加毕,静置,待RNA沉淀完全后,3000r/min离心3min。弃去上清液。用95%乙醇洗涤沉淀两次。再用乙醚洗涤沉淀一次后,用乙醚将沉淀转移至布氏漏斗抽滤,沉淀在空气中干燥。称量所得RNA粗品的重量,计算。

2. RNA组份鉴定

取2g提取的核酸,加入1.5M硫酸10mL, 沸水浴加热10分钟制成水解液,然后进行组份鉴定。

1) 嘌呤碱:取水解液1mL 加入过量浓氨水。然后加入1mL 0.1M硝酸银溶液,观察有无嘌呤碱银化合物沉淀。

2) 核糖:取水解液1mL,三氯化铁浓盐酸溶液2mL和苔黑酚乙醇溶液0.2mL。放沸水浴中1 0min。注意观察核糖是否变成绿色。

3) 磷酸:取水解液1mL,加定磷试剂1mL。在水浴中加热观察溶液是否变成蓝色。

3. 紫外吸收法测定核酸的含量

1) 准确称取待测核酸样品0.5g,加少量0.01mol/L NaOH调成糊状,再加适量水,用5-6%氨水调至pH7.0,定容至50mL。

2) 取两支离心管,甲管加入2mL样品溶液和2mL蒸馏水,乙管加入2mL样品溶液和2mL沉淀剂。混匀,在冰浴上放置30min。

3) 在3000r/min下离心10min。从甲、乙两管中分别吸取0.5mL上清液,用蒸馏水定容至5 0mL。选择厚度为1cm的石英比色杯,在260nm波长处测定A值。

【实验结果】

1.干酵母粉RNA粗品的含量:

2.记录RNA组份鉴定各管的现象;

3.计算干RNA粉中核酸的含量:

式中,为甲管稀释液在260nm波长处A值减去乙管稀释液在260nm波长处A值;

L──比色杯的厚度,1cm;N为稀释倍数;

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