whonet5.6使用说明
whonet 使用手册 (中文版)说明书

WHONET使用手册全球抗微生物药物耐药性监测系统John Stelling布莱根妇女医院世卫组织抗微生物药物耐药性监测合作中心马萨诸塞州波士顿2016年11月缩略语AMR 抗微生物药物耐药性CLSI 临床和实验室标准协会EUCAST 欧洲药敏试验委员会GLASS 全球抗微生物药物耐药性监测系统ID 识别码MIC 最小抑菌浓度WHO 世界卫生组织目录1.序言 (1)2.安装WHONET (2)3.实验室配置 (3)3.1创建新的实验室配置 (3)3.2复制现有实验室配置 (6)3.3修改实验室配置 (7)4. 用于全球耐药监测系统的WHONET数据输入 (8)4.1 通用 (8)4.2 全球耐药监测系统最低配置下各数据域填写说明 (9)4.3查看数据库 (13)5. 国家层面的数据收集 (13)6. 将WHONET 文件导出为全球耐药监测系统交换格式 (14)6.1 合并WHONET文件 (14)6.2汇总WHONET文件 (15)6.3WHONET在全球耐药监测系统交换格式中排除“重复分离株”的规则 (18)7. 全球耐药监测系统数据检查和反馈报告 (19)8. 将全球耐药监测系统格式的数据文件上传到全球耐药监测系统信息技术平台 (21)附件1 – 修改实验室配置 (22)1.一般实验室信息 (22)2.抗生素 (23)3.抗生素断点 (24)4.地点 (27)5.修改数据域配置 (27)附件2 – BacLink简介 (28)1.序言本手册主要为各国全球抗微生物药物耐药性监测系统(GLASS,以下简称“全球耐药监测系统”)数据管理员撰写,也可供为参加该系统的监测点服务的实验室数据管理员使用。
手册描述在为全球耐药监测系统处理数据时如何使用WHONET软件。
WHONET支持将数据输出为全球耐药监测系统交换格式,以便上传到该系统的信息技术平台。
本手册并非描述WHONET全部功能和特征的完整使用手册。
WHONET使用

WHONET系统的应用-散点图
WHONET系统的应用-散点图
WHONET系统的应用-散点图
耐药分析组合
耐药分析组合反映了某一特殊克隆菌 群的一组固有的及获得性染色体与质 粒介导的耐药基因
耐药分析组合可用于定义细菌亚群
感染控制人员可利用耐药分析组合对 某一细菌的耐药机制特征进行进一步 的研究
定义新的实验室
实验室设置-抗生素
抗生素判定标准更新
出现的警示
抗生素判定标准更新
抗生素判定标准更新
抗生素顺序调整
抗生素组合设置
抗生素分析组合设定
方法学选择
病区设置
病区设置
数据段设置
数据段设置
数 据 输 入
数据输入-创建新的数据文件
WHONET数据文件
以dBASE格式保存,其内容由实验室设置所决定
阳性/革兰阴性菌、厌氧菌、分枝杆
菌、真菌、寄生虫等)。
5. 特定菌株组的设定:
可根据要求将种属相近或耐药
机制相同的几种菌种合并为一组
(作为一种菌株)进行分析,使统 计分析更能够突出主题、反映问题。
6.数据库的建立:
可同时建立多个数据库(如全国 的、地分别或联合统计分析,
主要内容
WHONET系统的安装
WHONET系统主要功能介绍 WHONET系统的应用
WHONET系统的安装
从中国抗感染化疗杂志网站下载 阳光检验网论坛: /bbs CD-Rom光盘安装 按标准程序进行安装 软盘安装 第一张软盘安装结束后,插入下一张软盘。
对泰能耐药对舒普深敏感的革兰阴性杆菌
代码 pma pae fme aba pme axy pce fin
WHONET软件安装及设置图解

应华永 金华市中心医院 检验科
1
WHONET系统的获取
• WHONET 官方网站
• http://Βιβλιοθήκη
• 金华市耐药监测网公共网盘
• • 账号:whonet@ • 密码:whonet
账号:whonet@ 密码:whonet
(注意密码是小写)
大家有什么好的资料都可以点击这里上 传到公共网盘——分享才是硬道理!
WHONET软件的安装
将此处的 C 改成 D或E 等其他盘符
BacLink:数W据H库O转N换ET工软具件,其的主安要功装能是可以将不
选择语言 选择字体
WHONET主界面
WHONET主界面
WHONET主界面
实验室设置
• 输入资料前,必须提供实 验室的某些信息
– 实验室所用的抗生素 – 医院或病区设置 – 信息数据段:可对WHON
ET所提供的数据段进行 添加或删除
抗生素实验代码
• 每一抗生素实验设置一个代码(最多9个字母),其构成如 下
– 抗生素代码:以三个字母表示,如头孢他啶的代码为CAZ – 实验标准:以一个字母表示,如N=NCCLS – 试验方法:以一个字母表示:D=纸片法,M=MIC测定,E=E-test – 纸片含量(纸片法),用数字表示。
• 例如
– GEN_ND10代表庆大霉素,NCCLS,纸片法,10ug。 – GEN_NM代表庆大霉素,NCCLS,MIC测定。
同仪器、不同LIS中导出非标准化格式的数据库文 件转换为以WHONET软件为标准的数据库文件
WHONET5:这就是我们今天要重点介绍的软件
WHONET程序初始界面
新实验室
全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准V60

全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准V6.02017年1月1日修订全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统” 收集所有成员单位的耐药监测数据,系统具备完善的数据筛选和容错处理功能,支持上传的数据文件格式为WHONET 5.6软件所导出的通用数据文件格式,文件后缀无要求。
除此以外,系统还支持ExceI表格,包括Excel 2003 以下版本生成的(*xls)以及Excel 20072010所生成的*xlsx。
一、科室代码设置监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能,登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上,该映射关系可随着本院的科室变化随时进行调整(增加、删除、修改),调整之后不影响曾经上传过的文件,仅影响在调整时间点后上传的数据。
而各医院临床科室对应上报数据文件中的WARD字段保存的值,可以为本院临床科室名称或本院临床科室代码,取决于各院在WHONET中是如何管理的,或者是如何从LIS系统导出的。
完成医院科室设置后,在上传本院数据时,系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准的科室分类进行映射,并将映射结果直接写入DEPARTMENT?段,不影响WARD 字段中上传的原始值,DEPARTMEN字段实际上可以不填写,甚至是整列都不存在。
建议在上报的数据文件中直接将DEPARTMEN■字段设置成系统内置的标准科室代码(3位字符)。
二、数据文件各字段要求1、来源ORIGIN非必填字段,最长1个字符。
若填写,则其必须为“ h”,若不填写,数据上传后系统会自动补充,若填写值不为“h”,系统将自动替换成“h”。
2、国家COUNTRY_A非必填字段,最长3个字符。
若填写,则其必须为“ CHN,若未填写,数据上传后系统会自动补充。
3、医院INSTITUT非必填字段,为国家卫生计生委统一分配的标准代码,标准6 字符,前两位为国家标准省级代码(如北京为11,福建为35 等),后4位为各省编码(从0001 开始),例如福建省立医院为350001,若未填写,数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码,若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代码。
Whonet基础

六:怎样使用WHONET?
Whonet 快捷方式
WHONET的主要组成
实验室设置:
实验室设置这一系统,必需提供详细信息,如实验所用的抗生素及患者的医护场所。 另外,还可指出你希望数据文件中所需要的数据字段。以后,还可随时修改实验室设置。
数据输入:
使用WHONET,可常规输入药敏试验结果,并可恢复、纠正及打印临床报告。 通过选项,可即刻向实验人员反馈菌株表型。若WHONET数据可从已有实验室系统转换而来,则无 需直接输入数据。
三:在哪里下载WHONET?
WHONET中文网: /index.html WHONET的最新版本是5.6版(20130913) WHONET 优化升级 V1.2 程序发布 WHONET中文论坛: /forum.php
由于我院总体来说微生物送检标本量过少,菌株 <30株无统计学意义,分析出的耐药情况仅供参 考
数据分析界面
数据分析-分析类型及选项
数据分析-细菌
数据分析-菌株
数据分析-数据文件
WHONET系统对重复分离菌株的耐药性估计问题
自同一患者可重复分离出同一菌株,
这可对患者人群的耐药性总体估计产 生偏差。
实验室设置-抗生素
实验室设置:科室设置
实验室设置-数据字段
→ 点击此处打开此前输出的**.zb1文件
默认的Data文件夹
→
选中你刚刚用To whonet输出的文件
由于软件对接问题, 设置的字段有若干差 异,可忽略。
操 作 按 钮
查看和修改数据
分析数据
WHONET系统数据分析类型
一:什么是WHONET?
WHONET的基本使用

• WHONET的使用是方便、简单的。但是 如何更有效的使用WHONET、能从中更 好的获取你所需要的信息,还完全依赖 于你自己微生物以及抗生素的知识。
由患者分离的每种抗生素最耐药 (敏感)的结果
• 考虑所有的菌株,对每一患者的每一抗 生素进行单独分析,计算耐药率时,只 应用最耐药(敏感)的结果
由患者-选每一抗生素解释的 结果
对每一抗生素、每一患者分离的菌的解释 (RIS)计数一次,若患者分离出的对某一
抗生素耐药(敏感)的菌株,即对患者 计数耐药(敏感)一次。这样能导致(R +I+S)% >100%,若超过100%则表 明耐药结果混杂或不一致的患者百分比。
输入数据
操
样
作
本
按
信
钮
息
样
本
结
果
提示信息
数据输入注意点
• 1、所有信息均具有可选择性(不需必须输入) • 2、日期格式:dd/mm/yy dd-mm-yy 等 • 3、质控菌株的输入:
Ⅰ、在病例号中输入菌株名如:ATCC 22922 系统会自动将标本种类改为“qc”。
II、若系统无法认识上标准菌株,可将标本种类改为 “qc”
• 对OPGV耐药组合的金葡菌的分析(OX、 GEN、PEN、VAN)
耐药分析组合
从敏感到多重耐药排列
有字母=耐药或中敏 空格=敏感 -=未做实验
BacTrack分析
• BacTrack分析的作用是创建有统计学意 义的不常见的细菌表型、不常见的抗生 素、不常见的耐药组合的bactrack文件, 来监视你下次输入这些不常见的结果时, 有所提示。从而可以发现此次实验是否 存在误差,或提示如新的耐药机制的出 现。
whonet5.6使用说明

全国耐药监测网新版系统的使用说明
• 新版系统的简介 • 如何上传高质量的数据
软件版本划分
重点
60
系统形式
• 使用主流最新版浏览器直接登录无须完装 任何软件
61
系统软硬件要求
• 计算机必须连接互联网(Internet) • 网速至少达到2M(推荐4M)
• 使用兼容性较好的最新版浏览器
– W0398CHN. GSY W0798CHN. GSY – W0498CHN. GSY 不W合0适89的8C文HN件.格G式SY
W1198CHN. GSY W1298CHN. GSY
• 数据文件可以用EXCEL软件打开、编辑并保存!
合并数据库
可将多个数据文件合并为单个大的数据文件
14W01chn.gsy 14W02chn.gsy 14W03chn.gsy 14W04chn.gsy 14W05chn.gsy 14W06chn.gsy
Over flow
即“溢出”“
所谓“溢出”是指输入了超过软件设置最大限度的数据,如“日期”一项最 大为3000年,但却错误地输入了超过3000年的数据,如4723年,5981年。
原始顺序
从小到大
从大到小
标本类型未输入
47
标本类型大写、无标本类型或错误的标本类型的影响
标本类型大写
无标本类型
错误的标本类型
• 高质量记录占比:就是所有上报成功的数据中高质量记录所
占的比重,这个指标并不影响您的数据上报,即使高质量记
录占比为0%,也有可以上报成功。
68
*数据文件的整体校验规则
• 系统如何判断一个文件能够上报成功?
– 系统对数据文件中的每一个字段都有一个最低校验通过 率的要求,当所有的字段都达到这个最低要求,就可以 上报成功;达不到就算上报失败。
WHONET使用

WHONET系统简介
临床选择抗生素
发现医院感染暴发 发现实验室中的质量控制问题 确定耐药机制 耐药菌株的流行情况
WHONET 5 软件的功能
帮助微生物实验室提高利用药敏数据的能力 帮助临床合理选择和使用抗菌药物以及相关政 策的制定 监控医院感染的爆发流行 通过数据交换达到资源共享提高进行细菌耐药 监测的合作能力 评价和提高实验室的鉴定和药敏水平 支持相关科研工作
细菌名称(中文) 鲍曼不动杆菌
大肠埃希菌 粪肠球菌 屎肠球菌 肺炎克雷伯菌 金黄色葡萄球菌 流感嗜血杆菌 阴沟肠杆菌 铜绿假单胞菌 嗜麦芽窄食单胞菌
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- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
18
文本格式 与 数字格式 的差别
由于日期格式的不规范而导致的统计中断
即”类型不匹配“
• 所谓“类型不匹配”是指在本该为日期格式一栏中输入了非日期格式的数据, 如20060607,而规范的格式应为2006-06-07.
数据文件格式
• WHONET数据文件
– 以dBASE格式保存,其内容由实验室设置所决定
菌株行列表及总结 甘肃省人民医院医院2011年菌种分布
耐药率
注意判断标准的差异
27
编辑显示于屏幕的图形
28
图形美化
29
散点图—不同抗菌药物的比较
肺炎克雷伯菌
多文件耐药/敏感率的比较
31
耐药分析组合
• 识别可能发生的感染爆发或不常见的表型 • 定期进行耐药分析组合,可提示某些克隆菌株的频率增
• 使用宏可以节省时间 • 可避免由于多次的重新选择二导致抗菌药物漏选
的问题
宏的设置
宏的应用
细菌耐药监测数据的处理及应对措施
41
日期格式错误导致数据不能统计
42
输入超范围 的数据
时间跨度:至3000年
直径跨度:680mm
43
出生日期超过年限范围—仪器导入错误
44
抑菌圈直径过大
45
由于超范围数据而导致的统计中断
51
更改设置
• 加入新的抗菌药物种类后打开原来的文件 不显示
• 加入新的数据段后打开原来的文件不显示 ‥‥‥‥‥‥
原因何在?
增加“替加环素”
无“TGC-ND”一项
54
打开原有数据
“TGC-ND” 项
56
轻松57 拷贝WHONET设置
如何升级WHONET软件
• 在“控制面板”中删除旧版本的WHONET软件 • 重新安装新版本的WHONET软件
不同实验室设置共存 多语言版本转换
WHONET主界面
10
如何进行实验室设置---最主要的工作
标本信息区 药敏数据区
• 输入资料前,必须提供实验 室的某些信息 –药敏试验所用的抗生素 –医院或病区设置 –信息数据段:可对WHONET 所提供的数据段进行添 加或删除
实验室设置
抗生素设置
科室设置
数据字段设置设置
• 加强实验室数据在当地的应用
• 管理实验室常规药物敏感性试验结果
• 进行数据统计分析,尤其是抗生素药敏试验结果。
• 临床选择抗生素,指导临床合理用药。
• 发现医院感染暴发
• 发现实验室中的质量控制问题
耐药监测网的建立
• 确定耐药机制
• 通过数据交换,促进不同实验室间的协作
5
WHONET软件特征
• 标准化的windows操作,操作简单。 • 支持多国语言(支持中文) • 强大的数据分析能力 • 开放的代码结构。
提示语设置
13
14
药敏组合的作用:输入药敏结果时,快速定位
15
无细菌时的界面 包含所有抗菌药物
输入细菌时的界面 只显示“药敏组合”选择的抗菌药物
16
专家系统的应用
数据输入注意点
• 所有信息均具有可选择性(不需必须输入)
• 日期格式:一定要按日期格式输入,否则将影响统计
– 日/月/年 日-月-年
• 字段最低校验通过率:代表一个字段中所填写全部值的最低 正确率。比如:某字段的最低校验通过率要求达到90%,当 此字段填写了100个值,那么这100个值中至少要填对90个, 这个字段才可以通过校验,否则该字段就无法通过校验,直 接导致整个数据文件无法上报成功。
• 高质量记录:就是一条记录中,所有字段填写的值均是正确 的值,没有产生任何警告信息或者错误信息。
Windows界面 多国语言
WHONET软件简介
• 世界卫生组织独立开发的用于管理细菌实验结果的数 据库软件
• 目的是管理实验室常规实验结果,进行耐药监测数据 的统计分析。
• 具有动态性、高效性、广泛性和共享性等特点。 • 已成为全球广泛使用的病原菌耐药监测的有力工具
4
WHONET分析软件主要用途
Over flow
即“溢出”“
所谓“溢出”是指输入了超过软件设置最大限度的数据,如“日期”一项最 大为3000年,但却错误地输入了超过3000年的数据,如4723年,5981年。
原始顺序
从小到大
从大到小
标本类型未输入
47
标本类型大写、无标本类型或错误的标本类型的影响
标本类型大写
无标本类型
错误的标本类型
• 由于微软宣布从2014年4月开始,不再对 Windows XP 操作系统进行补丁更新,同时对 IE8 以下版本的浏览器也不再提供更新。因此, 对于还在使用 XP 操作系统的用户,我们强烈建 议您升级为更加安全的 Windows 7 或者 Windows 8。否则,连接互联网之后,很有可能 瞬间被入侵或者被植入木马,这会对您的数据安 全造成极大威胁。
– W0398CHN. GSY W0798CHN. GSY – W0498CHN. GSY 不W合0适89的8C文HN件.格G式SY
W1198CHN. GSY W1298CHN. GSY
• 数据文件可以用EXCEL软件打开、编辑并保存!
合并数据库
可将多个数据文件合并为单个大的数据文件
14W01chn.gsy 14W02chn.gsy 14W03chn.gsy 14W04chn.gsy 14W05chn.gsy 14W06chn.gsy
– 月/日/年 月-日-年
推荐格式
• 质控菌株的输入:
– 在病例号中输入菌株名如:ATCC 22922,系统会自动将标本种类改 为“qc”。
– 若系统无法认识上标准菌株,可将标本种类改为“qc”
• 有设置药敏组合的输入时,按“ENTER”会自动跳到组合中的下一个 抗生素。
• 药敏结果:可用“RIS”方式输入,但推荐使用定量输入如在纸片法
如果您本机已经安装了微软IE10以上版本的浏览器,那在这台机器您可以使用 任意浏览器登录本系统。
官方网站访问地址
• 官方网站的永久域名为:
/
64
数据上报相关要求
• 上报频率:
– 目前系统要求1个季度上报一个文件,不允许提前上报。
• 系统能接收的数据文件格式:
• CD-Rom光盘安装(很少使用) • 软盘安装(8张软盘)(已淘7 汰)
主要内容
• WHONET系统的功能、应用及注意事项
–数据输入
–实验室设置
高
பைடு நூலகம்
–数据统计分析
手
–统计参数的保存
之
• 耐药监测资料分析前处理及统计要求 –输入错误纠正
路
–药敏结果错误纠正
–补充Etest等MIC数据
WHONET软件的主界面
– 自定义代码 – 汉化细菌名称、标本种类等 – 导入其它数据文件,可避免重复输入 – 无缝连接Microsoft Office软件
6
WHONET系统的安装
• 程序获取(最广泛的用途) –世界卫生组织网站. • http://www.who.int/drugresistance/whonetsof tware/en/ –WHONET中文官方网 • /index.html –微生物之家论坛 –中国感染与化疗杂志网站 •
加或传播与否。 • 感染控制人员可利用耐药分析组合对某一细菌的耐药机
制特征进行进一步的研究 • 可有效地定义耐药酶的优先底物,由此可推测具体的耐
药机制。 • 输出格式
–首先列出敏感菌株,最后为多重耐药株。
鲍曼不动杆菌
耐药分析组合-输出
有字母=耐药或中敏 空格=敏感 “-”=未做实
MDR XDR P验DR
两者相差300株
48
输入错误
49
细菌类型对统计结果的影响
导致结果
G+菌与G-菌相加 与数据总数不一 致
50
药敏数据方面的错误
判断标准的差异 葡萄球菌属
替考拉宁:11-13mm 利奈唑胺:≥21mm 肠球菌属: 万古霉素:14-17mm 替考拉宁:10-14mm 利奈唑胺:20-23mm 链球菌属 万古霉素:≥17mm 利奈唑胺:≥21mm
– 例如:系统要求【WARD】的最低校验通过率为100% ,其实也就是要求该字段不能出现任何错误,如果您 上传了100条记录,其它的字段都填写正确,只有【 WARD】字段发现了1个错误,那么这个字段的通过率 为99%,未达到系统所要求的100%,因此整个文件都 不会被接收,如果100个全填写对了,就可以上报成功 ,至于【WARD】字段本身的校验规则,在后面会有 详细介绍。
– WHONET 5.6 标准DBF格式的数据文件,对文件扩展名无具体要求 。
– Office 2003 Excel 格式,文件扩展名必须为(.XLS) – Office 2007/2010 Excel 格式,文件扩展名必须为(.XLSX)
65
数据文件校验的相关术语-1
• 字段名:我们把数据文件中的表头称为字段名,一个数据 文件可以有多个字段,例如:FIRST_NAME、SEX、 SPEC_TYPE、AMX_NM等等
耐药分析组合的作用
同一耐药克隆菌株出现于不同时间
34
耐药分析组合的作用
同一耐药克隆菌株出现于病房
35
选择不同的组合得 出我们所需要的分 析结果
统计头孢呋辛敏感 但亚胺培南耐药的 肠杆菌科细菌
36
Bactrack提示功能
亚胺培南耐药的大肠埃希菌
37
宏的应用
• “宏”是通过一次点击就可应用的命令集。它几 乎可以自动完成程序执行过程中的任何操作,甚 至可以执行某些认为不可能完成的任务。