串联亲和纯化偶联质谱技术
电喷雾电离串联分析质谱

百泰派克生物科技
电喷雾电离串联分析质谱
质谱仪是由离子源、质量分析器和质量检测器三个核心部分组成的。
离子源负责将待分析物电离成离子,目前已开发建立了多种电离技术,如基质辅助激光解吸电离和电喷雾电离等。
电喷雾电离(Electrospray ionization,ESI)是一种软电离技术,其利用高电压使待分析物发生静电喷雾进而形成带电荷的气溶胶来产生用于质谱分析的离子。
电喷雾电离质谱可以与多种分离技术联用,即电喷雾电离串联质谱分析,如液相色谱-电喷雾-串联质谱技术,其大致分析思路是在离子化前采用高效液相色谱技术作为进样系统,将待分析物的各组分及杂质进行分离,然后再进行电喷雾电离质谱检测。
液相色谱与电喷雾串联质谱仪的偶联(LC-ESI-MS/MS),能快速灵敏的检测多肽或蛋白质的部分氨基酸序列,鉴定蛋白质或多肽侧链中存在的二硫键以及修饰位点(如磷酸化、糖基化、乙酰化、甲基化等)。
结合日益扩展的蛋白质数据库,还可以查询到待测的蛋白质分子的氨基酸全序列或鉴别其是否为新蛋白。
百泰派克生物科技采用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱技术,提供高效精准的电喷雾电离串联质谱分析服务技术包裹,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析,欢迎免费咨询。
串联质谱的蛋白质序列鉴定技术综述

串联质谱的蛋白质序列鉴定技术综述
乔彦涛;缪佳铮;孙世伟;刘金刚;卜东波
【期刊名称】《计算机科学与探索》
【年(卷),期】2010(004)002
【摘要】蛋白质组学的主要目的是鉴定出生物体内的蛋白质的种类和数量.为达到这个目的,人们开发了多种蛋白质鉴定算法,包括数据库搜索方法、De Novo方法、PST(肽段序列标签)方法和质谱数据库方法.首先介绍了质谱仪中肽段断裂机理的研究,以及相关的质谱鉴定方法,然后综述了当前常用的蛋白质鉴定方法,分析了这些方法的优缺点,最后提出了自己的见解和展望.
【总页数】11页(P97-107)
【作者】乔彦涛;缪佳铮;孙世伟;刘金刚;卜东波
【作者单位】首都师范大学,计算机科学联合研究院,北京,100048;中国科学院,计算技术研究所,计算生物研究组,北京,100190;浙江工商大学,食品与生物工程学院,杭州,310018;中国科学院,计算技术研究所,计算生物研究组,北京,100190;首都师范大学,计算机科学,联合研究院,北京,100048;中国科学院,计算技术研究所,计算生物研究组,北京,100190
【正文语种】中文
【中图分类】TP311
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adc偶联药物生产工艺

ADC偶联药物生产工艺一、介绍ADC(Antibody Drug Conjugates)是一种新型的药物形式,将抗体与化学药物偶联在一起,以提高药物的靶向性和疗效。
本文将对ADC偶联药物的生产工艺进行全面、详细、完整且深入的探讨。
二、ADC的工作原理1.抗体选择:选择适合的抗体作为药物载体,确保其能够与靶标特异性结合。
2.链接技术:通过化学手段将抗体与化学药物偶联,常用的链接技术包括带硫醇的链接剂、带酐的链接剂、海因斯结构和光敏感结构等。
3.稳定性改进:针对ADC在体内易发生的非特异性结合和降解等问题进行改进,提高ADC的稳定性和血浆半衰期。
三、ADC生产工艺步骤1. 抗体生产1.细胞培养:培养表达产生特定抗体的细胞株,如CHO细胞、NS0细胞等。
2.抗体纯化:采用亲和层析、离子交换层析、凝胶过滤等技术将抗体从培养物中纯化出来。
2. 化学药物合成1.药物设计:选择合适的化学药物,根据靶标特异性进行药物设计。
2.合成路线设计:设计合理的合成路线,选择适当的合成方法和反应条件。
3.化学合成:根据设计合成路线进行化学合成,得到所需的化学药物。
3. 抗体与化学药物的偶联1.偶联试剂选择:根据化学药物的特性选择合适的偶联试剂,如SMCC、MCC-DM1等。
2.偶联反应:将抗体与化学药物进行偶联反应,形成ADC。
3.副反应去除:去除偶联反应中产生的副产物和未反应物。
4. ADC的质量控制1.纯化:采用亲和层析、凝胶过滤等技术对ADC进行纯化。
2.结构鉴定:采用质谱和核磁共振等技术对ADC的结构进行鉴定。
3.稳定性测试:通过离子交换层析、动态光散射等技术测试ADC的稳定性。
4.生物活性测试:通过细胞毒性实验等测试手段评价ADC的生物活性。
四、ADC生产中的关键问题和挑战1.抗体选择:选择合适的抗体具有重要意义,需考虑抗体的特异性、亲和力和内化效率等。
2.偶联稳定性:偶联反应后产生的ADC需要具有一定的稳定性,避免在体内发生非特异性结合和降解。
串联质谱 4d蛋白组

串联质谱 4d蛋白组
串联质谱(LC-MS/MS)是一种常用的蛋白质组学技术,用于
分析复杂的生物样品中的蛋白质。
4D蛋白组学是串联质谱的
进一步发展,结合了四个维度的分离。
4D蛋白组学中的第一个维度是样品分离。
常用的方法包括电泳、液相色谱和离子交换色谱等。
通过对样品进行分离,可以减少样品复杂性,增加检测的特异性。
第二个维度是质谱分析。
经过样品分离后,蛋白质会被逐一送入串联质谱仪进行分析。
在串联质谱中,蛋白质被解离成肽段,并通过质谱仪进行质荷比(m/z)的测定。
常用的串联质谱仪
包括四极杆质谱仪和飞行时间质谱仪等。
第三个维度是肽段的分离。
通过液相色谱技术,在肽段在质谱仪中进行分析之前,会按照其亲水性、疏水性等特性进行进一步的分离。
这样可以进一步减少样品复杂性,提高质谱的分辨率。
第四个维度是数据库搜索。
经过质谱分析后,得到的质谱数据会通过数据库搜索,与已知的蛋白质序列进行比对。
通过比对,可以确定蛋白质的身份和给出相应的定量信息。
4D蛋白组学技术的优势在于可以提高蛋白质组分析的深度和
准确性。
通过融合多个分离和质谱分析的维度,可以解决复杂样品中低丰度蛋白质的检测问题,从而进一步揭示生物样品中的蛋白质组成和功能特性。
同位素二甲基标记和串联质谱

同位素二甲基标记和串联质谱
同位素二甲基标记和串联质谱是一种常用的生物分析技术。
该技术基于同位素标记分子的原理,通过将分子中的特定原子替换成同位素来标记分子。
其中,常用的同位素有C、H、N、O和S等。
通过同位素标记,可以使分子在质谱中产生特定的质荷比,从而实现定量和定位分析。
串联质谱是一种多级质谱分析技术。
该技术将质谱仪与离子阱、四极杆等多级质谱分析器相结合,可以实现更加准确和精细的质谱分析。
串联质谱技术可用于分析生物样品中的各种分子,如蛋白质、代谢物等。
同位素二甲基标记和串联质谱技术的应用范围广泛,包括代谢组学、蛋白质组学、药物代谢动力学等领域。
通过这些技术的应用,可以更深入地研究生物分子的结构、功能和代谢途径,为生物医学研究和药物开发提供有力的支持。
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质谱流式技术简介

Review质谱流式技术在生物学研究中的应用Abstract作为最普遍使用的单细胞技术之一,流式技术一直在生物学各研究领域都有着广泛的应用。
Helios质谱流式细胞仪通过对传统流式技术和质谱技术的整合,彻底解决了荧光串色的问题,并实现了几十个参数的同时测量。
其强大的数据获取能力与现代信息生物学的分析手段紧密结合,对生物学多个领域的研究具有重大的推动作用。
在血液学领域,它可以对复杂的样品进行精细的免疫分型和信号通路分析;在免疫学的研究中,可以对免疫细胞进行自动分群,并对免疫细胞的功能多态性进行细致分析;在癌症研究领域,它可以对癌症组织进行精细的亚群分析,帮助研究者找到与临床预后密切相关的细胞亚群;在干细胞研究领域,可以深入探讨当前技术下所区分出的干细胞群体的异质性,对于以后干细胞治疗等领域具有重要的指导意义。
目录质谱流式在生物学研究中的应用 (1)一、传统流式技术的困局 (2)二、质谱流式简介 (3)1、技术简介 (3)2、基本原理 (3)3、技术特点 (4)三、质谱流式的应用实例 (5)1、现对复杂样品(骨髓、外周血等)进行精细的表型和信号通路分析 (5)2、展现不同免疫细胞之间的内在联系,探索免疫细胞的功能多样性 (6)3、对癌症组织的精细分群和功能分析 (10)4、干细胞和细胞分化的研究 (13)一、传统流式技术的困局生物体是由众多不同类型的细胞组成的,这些细胞存在非常大的异质性;一直以来,流式技术是分析复杂细胞群体的重要手段,它可以实现对细胞进行多参数分析,从而区分不同种类的细胞;其所能检测参数的多少,也决定了我们对于所研究群体异质性的了解程度。
传统的流式细胞仪,是基于荧光的检测系统,已经发展了40多年,目前在生物学各个研究领域有着广泛的应用;但是,由于不同荧光基团发射光谱的重叠,使得传统流式技术的发展遇到了瓶颈:一方面,传统流式细胞仪的检测通道数量已经很难有质的提升。
目前BD最高端的分析型流式细胞仪具有20个检测通道,而实验室常用的通道数量一般少于12个。
串联质谱法测肽段序列原理

百泰派克生物科技
串联质谱法测肽段序列原理
肽段测序是对肽段一级结构的氨基酸种类和排序进行检测分析,通常可使用串联质谱法测定肽段序列。
串联质谱可直接用于测定肽段的氨基酸序列,其原理是利用肽段在离子化过程产生亚稳定离子,通过分析相邻同组类型峰的质量差来识别相应的氨基酸残基。
串联质谱法测肽段序列是从一级质谱检测肽段母离子,采集质量峰值较高的肽段母离子进入二级质谱检测。
肽段母离子进入二级质谱后经惰性气体碰撞碎裂,肽段断裂产生碎片离子信号,通过检测肽段碎片离子信号即可获得肽段二级质谱图。
解析质谱图并根据各肽段质量数差值推导出肽段氨基酸序列,经过肽段之间的拼接可实现蛋白完整序列的测定。
百泰派克生物科技使用Thermo公司推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱技术,提供多肽测序服务,对多肽序列进行分析。
Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪,保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度;同时在肽段碎裂过程中采取HCD与ETD结合的模式,保证肽段碎裂片段的完整性。
得到质谱原始数据之后,我们使用数据库或de novo从头测序的方式对原始数据进行解析。
质谱分析蛋白质的相互作用

蛋白质间的相互作用存在于生物体每个细胞的生命活动过程中,互交叉形成网络,成细胞中一系列重要生理活动的基础。
其中,多数蛋白质是通过与配体分子结合或者是作为1个大的生物复合体的一部分,与细胞完整性维持、遗传物质复制、基因表达调控、信号转导、免疫应答等一系列生命过程。
研究蛋白质间相互作用的方式和程度,将有助于蛋白质功能的分析、疾病致病机理的阐明和治疗和新型药物的开发等众多难题的解决。
因此,确定蛋白质间相互作用关系、绘制相互作用图谱已成为蛋白质组学研究的热点。
近年来有许多方法被用于蛋白质相互作用的研究,酵母双杂交技术,免疫共沉淀技术,串联亲和纯化技术,化学交联技术,蛋白质芯片技术,荧光共振能量转移技术,噬菌体展示技术等。
酵母双杂交技术Fields和song等首先在研究真核基因转录调控中建立起来的,是在真核细胞中检测蛋白质与蛋白质之间的相互作用的方法。
该系统是通过两个分别称之为“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”的融合蛋白形成一个完整的转录激活因子,从而激活报告基因的表达,通过在营养缺陷型培养基上生长或呈现显色反应来检测系统的功能。
酵母双杂交系统可在全基因组规模上进行蛋白质一蛋白质相互作用高通量的研究。
免疫共沉淀技术免疫共沉淀是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的Protein A或G特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的现象开发出来的方法。
其基本原理是,在细胞裂解液中加入抗兴趣蛋白的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Agarose珠上的Protein A或G,若细胞中有与兴趣蛋白结合的目的蛋白,就可以形成这样一种复合物:“目的蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—Protein A或G”,经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物又被分开。
然后经免疫印迹或质谱检测目的蛋白。
这种方法得到的目的蛋白是在细胞内与兴趣蛋白天然结合的,符合体内实际情况,得到的结果可信度高。
这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合;也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。
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串联亲和纯化偶联质谱技术
串联亲和纯化偶联质谱技术是一种结合亲和纯化和质谱分析的
方法,用于鉴定蛋白质相互作用和识别蛋白质复合物的组成。
该技术首先利用亲和纯化技术从混合物中富集目标蛋白质及其结合伴侣,然后通过偶联质谱技术对富集物进行分析,鉴定蛋白质相互作用和确定复合物组成。
此技术的优点在于,能够对复杂的蛋白质混合物进行高效、准确的筛选,同时能够以较高的灵敏度和特异性检测出蛋白质相互作用。
与传统的亲和纯化和质谱分析相比,串联亲和纯化偶联质谱技术能够更加全面地分析蛋白质复合物,同时也能够更加深入地研究蛋白质相互作用的动态变化和功能调控。
因此,串联亲和纯化偶联质谱技术在生命科学领域中被广泛应用,如用于发现新的信号通路、鉴定药物靶点、探究蛋白质功能等方面。
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