噬菌蛭弧菌分子生物学特性的研究

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噬菌蛭弧菌分子生物学特性的研究

噬菌蛭弧菌分子生物学特性的研究

中国医学细菌中心弧菌噬菌体研究室秦生巨

一、前言

噬菌蛭弧菌(Bdellovibrio bacteriovorus,以下简称蛭弧菌)是60年代中期Stolp 等[1]发现的一类细菌寄生菌。它比通常的细菌要小,有似细菌病毒(噬菌体)的作用,但不是病毒,具有细菌的特性。“寄生”和“裂解(溶菌)”宿主细菌是蛭弧菌独特的生物学特性。这一生物学特性引起了人们极大的兴趣和关注。20多年来,美国、苏联、日本、法国、以色列、印度等30多个国家和地区的许多实验室对这类菌进行了研究。1982年,秦生巨等在我国首次发现并及时报道了对蛭弧菌的研究。自从蛭弧菌发现以来,国内外许多研究人员对蛭弧菌的生物学、生态学、生理学、分类学、生物化学、分子生物学及其与生物间的拮抗作用进行了研究。特别是70年代后期,对蛭弧菌分子生物学方面的研究更为广泛和细致,发现蛭弧菌在分子生物学方面亦具有许多独特的特性:蛭弧菌不能利用碳水化合物,但分解蛋白质的能力极强,它是利用多肽及氨基酸作为能源和碳源的;蛭弧菌生长代谢过程中乙醛酸循环不明显,以不完全的三羧酸循环为主要代谢途径;蛭弧菌蛋白质含量极为丰富,可达干重的60%~65%,DNA含量为5%,含有典型的嘌呤和嘧啶;蛭弧菌DN A合成的前体物质,全部来自宿主菌细胞,大约70%来源于宿主DNA,3 0%来源于RNA;蛭弧菌可直接利用单核苷酸作前体物质,合成其核酸;蛭弧菌γATP(每消耗1g ATP所得细胞千重)值高达20%~30%;蛭弧菌在吸附、侵染、穿入等的整个生命周期中,需要多种酶类的参加;蛭弧

菌的鞭毛,粗且带鞘,早期有人认为,鞭毛鞘是由细胞壁外膜组成,对尿素十分敏感。近年来,许多实验室对蛭弧菌的噬菌特性以及利用蛭弧菌清除自然环境河水中的某些肠道致病菌方面,做了许多卓有成效的探索工作。目前已证实,蛭弧菌对沙门菌属、志贺菌属、埃希菌属、假单胞菌属、欧文菌属、变形杆菌属、弧菌属等均有很高的裂解活性,特别是对沙门菌属和志贺菌属。进一步研究发现,蛭弧菌对自然河水中的E lTor霍乱弧菌、不凝集弧菌、伤寒沙门菌、大肠杆菌、细菌总数、浮游球衣菌、大肠菌群等均有显著的净化作用。本文就蛭弧菌的形态结构、化学组分、能量代谢、生命周期以及蛭弧菌生物拮抗作用等方面的研究阐述如下。

二、蛭弧菌的形态

(一)一般形态

蛭弧菌革兰染色,于普通光学显微镜下呈阴性弧、杆菌。相差显微镜下,可见到蛭弧菌积极追捕宿主呈跳跃式的运动。电子显微镜观察、蛭弧菌以弧、杆状为主(图1)。其菌体长约为0.8~1.2μm,宽约为0.2 5~0.40μm。菌体一端附着一根端生鞭毛,极少数有2~3根。蛭弧菌的鞭毛比其它细菌鞭毛为粗,直径约为21~28nm,长一般为菌体的10~40倍,通常呈波状。靠近菌体的最初3个“波段”的“波长”递减,远端“波段”的“波长”相当稳定。这种结构与其侵袭功能直接相关,并被认为是蛭弧菌的又一特征。Shilo等发现,与蛭弧菌鞭毛相对的菌体另一端(头部)有钉状的纤毛结构存在,通常2~3根,最多可有6根,纤毛直径为4.5~10nm,长为0.8~1.5μm,呈直线形或三角弯曲状。

图(1)蛭弧菌Bd39电镜照片

蛭弧菌的形状结构,不同菌株各有差异。而且培养基的选择及培养条件许多因素均可影响蛭弧菌形态特征的发育。

(二)超微结构

蛭弧菌细胞壁通常有内外两层组成,内层覆于细胞膜,其上有数个分散的颗粒,直径约为6~10 nm。蛭弧菌胞浆中常可观察到致密小体,长约150~300nm,宽约70~120nm,呈片状结构,据推测这可能是细胞膜内陷而形成的。核区非常明显,周围包绕着数个核糖体颗粒。在蛭弧菌的菌体中还可见到间体及其他许多内含物,有人认为间体的存在与蛭弧菌附着宿主有关。

当蛭弧菌在深红红螺菌中生长发育时,常见形成异形结构的“孢囊体”,长约为1.2μm,宽约为0.6μm,孢囊体外壁和内膜都很厚,外壁可厚达30~40nm。

蛭弧菌的鞭毛结构是独特的,它由鞭毛鞘和轴心组成,鞘壁厚约7.5nm,轴心直径约13nm。Abram等[3]早期认为,蛭弧菌的鞭毛鞘是由细

胞壁外膜延伸而组成的,但是当6 mol/L尿素存在时,鞭毛鞘极易被溶

解破坏,而细胞壁不受影响。推测组成鞭毛鞘的物质可能对尿素比较敏感,使鞭毛鞘肿胀,直至破裂。有人认为,蛭弧菌鞭毛的结构与其他革兰阴性细菌的鞭毛结构基本相似,但至今尚未发现蛭弧菌鞭毛基部有类似于其他革兰阴性菌鞭毛基部所具有的L环结构(图3)。

图3 蛭弧菌鞭毛基部L环结构模式

蛭弧菌的纤毛基部起源于细胞膜,有6~12个环状结构,有的分散,有的成簇集结在一起。有人称这一结构为“感染锥子”或“吸附器(固着器)”。这一结构的存在,与蛭弧菌的寄生特性有关,对蛭弧菌进入宿主细胞时机械性钻孔也有积极作用。

三、蛭弧菌的化学组成

蛭弧菌具有典形的革兰阴性细胞的化学组分。在这之前,曾有人误认为蛭弧菌细胞中不存在肽聚糖。Tinelli等研究报道,蛭弧菌和其他革兰阴性细胞一样,含有典型的肽聚糖成分,并测得蛭弧菌的肽聚糖成分由胞壁酸、葡萄糖胺及其他13种氨基酸组成,同其他原核细胞壁肽

聚糖组分和结构类似,其甘氨酸:谷氨酸二异丙基氟磷酸:胞壁酸:谷氨酰肽比例为2:1:1:1:1。在腐生的蛭弧菌中分离到核糖及rRNA,Bd6-5-S在蛀螺菌中繁殖,则可产生含有氨基糖和可溶性胞壁酸的亚微粒子。Murray报到,锌离子对蛭弧菌细胞壁及细胞膜结构的稳定性很重要,在缺乏锌离子的情况下,细胞壁将会变得十分疏松。蛭弧菌细胞膜的研究发现,其甘油磷脂成分主要是由磷脂酸乙醇胺和磷脂酰甘油组成,他们中主要成分为15碳支链脂肪酸。外膜中的类脂A是利用宿主细胞的类脂A,并经过一定的修饰,插入自身细胞的脂多糖结构而形成。脂多糖主要是由葡萄糖、宕藻聚糖、十九烷酸组成。此外,还含有一些其他脂肪酸、戊糖、酮脱氧锌酸及磷脂。在蛭弧菌外膜中存在类OmpF 蛋白。

蛭弧菌的蛋白质含量丰富,可达细胞干重的60%~65%,DNA的含量为5%,含有典型的嘌呤和嘧啶,DNA的G+C比例,大多数菌株为50.2±0.8%~50.8±0.9%,兼性寄生蛭弧菌DNA的G+C比例较低,为42.7±1. 0%~42.8±0.9%。以蛭弧菌Bd109为例,蛭弧菌中主要大分子物质的比例见表1。在蛭弧菌BdA3.12和Bd109中,发现脱氧胞苷酸、尿苷酸、核糖、腺膘呤和鸟嘌呤。到目前为止,除了蛭弧菌DNA的基因位置和装配结构尚不清楚外,还尚未发现蛭弧菌DNA结构成分的特殊性。

表1 蛭弧菌109和大肠杆菌ML35大分子及含量

成分蛭弧菌大肠杆菌

μg/1010细胞千重(%)μg/1010细胞千重(%)

蛋白质 320 54 2200 54

RNA 100 17 830 21

DNA 65 11 110 2.8 脂类 880 14 320 8

多糖 20 3.4 240 6

肽葡聚糖 5 0.8 40 1

干重 590 4000

Thomashow[2]报道,蛭弧菌鞭毛主要是由蛋白质、磷脂和脂多糖组成,其鞭毛轴心由多肽组成。鞭毛鞘易溶于Triton X-100。蛭弧菌鞭毛鞘不同于细胞外膜,具有特殊的生化性质,有鞭毛磷脂高达54%~58%,蛋白质的含量仅为23%~28%。与典型的细胞外膜的磷脂、蛋白质的含量有明显差异。这种高磷脂/蛋白质的比率揭示鞭毛鞘中具有磷脂双层结构。同时,与细胞膜的磷脂双层结构相比,具有较大的“流动”性,这可能为鞭毛的运动功能提供了物质结构基础。组成鞭毛轴心的多肽主要由分子量为28kDa和29.5kDa的亚基组成,28kDa亚基位于菌体近端,29.5 kDa亚基位于菌体远端。

蛭弧菌Bd.bdukiz的研究中,发现含有磷脂,其脂质中有的鞘脂类是其它细菌研究中极为罕见的。

四、蛭弧菌的菌能量代谢

蛭弧菌严格耗氧,在宿主细胞中生长,所需氧压在533Pa以下,其呼吸率为20×10-12m1O2/细胞(35℃,1h)。当蛭弧菌裂解菌体时,呼吸相应的增高。精氧酸、谷氧酸等氨基酸对呼吸有明显的促进作用。蛭弧菌在综合培养基上能产生细胞色素a(吸收峰605nm)、b(吸收峰559、5 28、426nm)、c(吸收峰522、524nm)。BdA3.12细胞色素c的索瑞带的

吸收峰在607nm,其余在421~423之间。蛭弧菌Bd6-5-S含有烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH2)、烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸(DNAPH2)细胞色素氧化酶,DADH2氧化酶的氧化率为DNDPH2氧化酶的2倍。NADH2氧化酶活性受氰化钾和叠氮钠所抑制,但不能被鱼藤酮及4:1一氧化碳和氧气混合物所抑制。NADH2氧化酶不受上述任何抑制剂的抑制。在蛭弧菌Bd6-5-S抽提物中,谷氨酸、α-酮戊二酸、琥珀酸、延胡索酸、苹果酸、丙酮酸、乙酸、α-磷酸甘油、烟酰胺腺呤核苷酸及烟酰胺腺嘌呤核苷磷酸不改变耗氧量,但NADH2及NADPH2与耗氧量有关。

有人报道,在细胞抽屉提物的微粒中存在三磷酸腺苷酶(ATP酶),同时还存在催化ATP与32P相互转换的酶类物质。由于砷化物、叠氮化合物和2,4-二硝基苯酚对这种转换无抑制作用,因此,这种转换途径可能受氨基酸氧化所催化。氧化NADPH2可能有两种途径:①由黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)或黄素单核苷酸(FMN)所刺激,产生过氧化氢,对氰化钾不敏感;②通过细胞色素产生过氧化氢,对氰化钾敏感。研究中发现,有些蛭弧菌含有丰富的触酶,但不是所有蛭弧菌都含有触酶。

蛭弧菌Bd6-5-S中含有三羧酸循环所需的异柠檬脱氢酶,α-酮戊二酸脱氢酶、延胡索酸水解酶、苹果酸脱氢酶及琥珀酸脱氢酶等。但未发现其糖酵解途径,不能利用碳水化合物及乙醇。蛋白质、多肽、氨基酸及核酸是主要的碳源和能量来源。Mitchel发现,一株海洋蛭弧菌可利用宿主——大肠杆菌细胞壁为唯一的碳源。Seidler等[5]检查了7株蛭弧菌,结果发现这些菌株都含有丙氨酸、谷氨酸、苹果酸,异柠檬酸脱氢酶、延胡索酸水解酶、腺苷酸激酶、醌还原酶以及四唑氧化酶。但

不同的菌株所含的酶类具有不同的理化性质,这一结果用于蛭弧菌分类是实际指导意义的。

Rittenberg等[10]通过U-14C标记宿主细胞,测得蛭弧菌在细胞内生长时rATP值为18.5~25.9。一般细菌rATP值为10。达到这样高效果的部分原因,是因为蛭弧菌具有直接从宿主细胞吸收核苷酸的能力。因而贮存了高能磷酸键。在电子转运系统中,每对电子转运产生了3分子A TP(P/O值为3),底物磷酸化作用几乎可以忽略,主要是三羧酸循环及电子转运系统中产能。但其中还是含有低水平的糖酵解酶。在蛭弧菌能量代谢过程中,ATP酶是起主要作用的,约60%~80%存在于可溶成分中,对二环已基碳二亚胺(DCCI)敏感,能被其抑制,细胞膜上的ATP酶对DCCI具有抗性,参与蛭弧菌氨基酸及磷酸的转运,对DCCI的抗性主要是由于ATP酶与膜连接后产生的。

Hespll等[6]对蛭弧菌三羧酸循环及糖酵解途径中各种酶活性进行了分析(表2)。最初糖酵酶活性与大肠杆菌及蛭弧菌Bd109中的三羧酸循环中的酶活性相关。当蛭弧菌进入宿主细胞90min时,三羧酸循环中的酶活性增加约10%,而糖酵解酶活性下降25%~60%;110~180min时,三羧酸循环酶的活性增加50%~60%,而糖酵解酶下降到接近0。而磷酸葡萄糖异构酶及甘油醛磷酸脱氢酶的活性较高。由于蛭弧菌严重耗氧,因此这二种酶可能与蛭弧菌生物合成有关,而并非是用于能量代谢。

表2 蛭弧菌Bd109和大肠杆菌ML35细胞提取液中酶的活性

酶的种类

大肠杆菌蛭弧菌

需氧厌氧需氧

葡糖激酶 48 50 2.4

磷酸葡糖异构酶 42 204 109

磷酸果糖激酶 77 212 13

果糖磷酸醛缩酶 142 198 9.5

磷酸丙糖异构酶 141 177 33

甘油醛磷酸脱氢酶 944 1193 690

丙酮酸激酶 345 190 7.5

柠檬酸合酶 1467 86 3360

异柠檬酸脱氢酶 305 25 893

延胡索酸酶 158 - -

苹果酸脱氢酶 5597 52 2200

?-半乳糖苷酶 3100 2810 -

五、蛭弧菌的生命周期

蛭弧菌为细胞内寄生菌,整个生活周期可分为:识别、侵染、吸附(攻击);穿入宿主细胞、生长发育、裂解宿主、释放子代蛭弧菌(图4)。

图4 蛭弧菌生活周期模式(本图引自:Philp H(1980).J Theor Biol)a:蛭弧菌侵染宿主细胞;b:穿入宿主细胞壁;c:进入宿主细胞质,鞭毛脱落; d:蛭弧菌在此摄取营养,经过1到数小时生长,蛭弧菌小体延长;e-f:蛭弧菌生长分化,鞭毛形成;g:宿主细胞裂解,子代蛭弧菌释放;α-ε:蛭弧菌腐生生活周期

(一)识别宿主

蛭弧菌的化学趋避运动是识别宿主菌细胞的重要方式,当蛭弧菌从宿主细胞内释放之后,处于极度的饥饿状态,约50%在10 h内失活,但当有能源及碳源存在时,其存活略有提高。如培养液中宿主细胞含量在1.5×105个/ml时,蛭弧菌50%以上通过自由碰撞吸附于宿主细胞上。进一步研究发现,蛭弧菌并非是运用化学趋避性直接感染宿主的,而是蛭弧菌在含有L-天氡氨酸、L-半胱氨酸、L-谷氨酸、L-组氨酸、L-赖氨酸及L-苏氨酸等氨基酸及化合物的环境中,通过化学趋向运动,寻找碳源和能源,缓和“饥饿”状态,这样蛭弧菌在其宿主菌所需的营养物质周围集聚,而宿主菌也向其营养物质接近,局部环境中的宿主菌浓度升高,因此,蛭弧菌增加了对宿主侵染和吸附的机会。

(二)吸附

一般来说,开始时蛭弧菌与宿主细胞激烈碰撞,以没有鞭毛的一端(头部)直接吸附到宿主细胞上,头部与宿主通过一系列的反应,菌体也高速转动,速率100r/s以上,在此之后,蛭弧菌通过宿主细胞的细孔(附着位点)进到细胞壁和细胞膜之间,或直接进入细胞质中。侵入过程非常快,几秒种内即可完成。有时可有很多个蛭弧菌同时吸附于同一宿主,有人发现,蛭弧菌吸附宿主是可逆的。蛭弧菌与宿主菌的比例在1:10~100时,蛭弧菌吸附率最高。早期研究认为,蛭弧菌仅仅对生活的革兰阴性宿主细胞有吸附能力,进一步研究发现,蛭弧菌对死的宿主菌和革兰阳性菌同样有吸附作用,但吸附率较低。秦生巨等近来研究发现,蛭弧菌对热死(100℃、80℃、15min)或三氯甲烷处理致死的宿主细胞吸附略著高于对活菌的吸附率,前者是后者的35-265倍。原因

尚不完全清楚,有待进一步研究。但Murray报道,去掉宿主细胞壁外层结构,有利于蛭弧菌的吸附。因此推断,其外层结构中具有防御蛭弧菌侵入的物质,加热或三氯甲烷处理宿主可能使这些天然屏障被破坏。目前已知蛭弧菌的吸附作用受pH值、O2压、温度等许多环境条件的影响。有人推测蛭弧菌吸附于宿主菌时,它们之间存在一个“连接键”,由特定的“吸附器(固着器)”所介导。Varon等[7]报道,蛭弧菌Bd10 9、BdGB对大肠杆菌和鼠伤寒沙门菌突变株(含有核心抗原,缺乏O抗原侧链)的吸附比对它们的野生株更容易。但抗原缺乏过多,其吸附能力却减弱。他们认为在宿主菌中存在吸附“受体”,位于R抗原中。但H uang重复了这项研究,并未能得到类似结果。Schelling等[8]进一步的研究发现,蛭弧菌对宿主的吸附性确实存在受体,他认为“受体”存在于宿主细胞壁脂多糖中的核心多糖上,与O侧链无关,但Bd.bukiz的吸附识别反应不需要宿主脂多糖参与。

(三)穿入

蛭弧菌吸附宿主细胞之后,几分钟内就可破坏细胞壁,穿入宿主细胞,此时鞭毛消失,整个过程最长为60min,穿入方式:①有人认为,由于蛭弧菌高速运转,使得蛭弧菌在宿主细胞壁上机械打孔穿入细胞壁。其动力主要来源于特殊的鞭毛结构。Burnhgm报道[9],蛭弧菌在穿入前,宿主细胞的吸附附着位点在细胞内压力作用下使局部凸起,蛭弧菌在自身动力的驱使下,首先进入凸出部分,破坏细胞壁,进入宿主细胞。亦有人认为,蛭弧菌吸附宿主细胞后,在细胞壁上钻孔,头部与宿主原生物质体连接在一起,宿主细胞壁结构遭到破坏,导致内外渗透压

的平衡失调,从而引起宿主壁及原生质体的膨胀,最后导致蛭弧菌在吸附位点细胞壁与原生质体紧密结合,这时,整个蛭弧菌菌体被动地进入膨胀的细胞壁与原生质之间(周质)。完成穿入过程。②有人发现,用蛋白质合成抑制剂,如链霉素、嘌呤素及氯霉素等,可抑制蛭弧菌的穿入。据此认为,蛭弧菌穿入时宿主细胞壁破坏还有诱导酶的产生,诱导物存在于宿主细胞内。当蛭弧菌吸附于宿主细胞壁。Fackeell等报到,蛭弧菌穿入宿主细胞时,至少有溶菌酶、胞壁酸酶及酯酶等,Bd6-5-S 还可释放两种多肽酶,分子分量为40kDa及100kDa。Michael等研究证明,当蛭弧菌穿入宿主时,聚糖酶及多肽酶的活性很高,短时间内溶解宿主菌10%~15%的肽聚糖。聚糖酶溶解肽聚糖中的氨基糖,多肽酶水解肽聚糖中的二氨基庚二酸、大约30%二氨基庚二酸残基被水解。穿入过程结束时,这两种酶的活性明显降低或消失。与此同时在脂多糖中25%的葡萄糖胺被一种分子量小于2kDa的酶水解,该酶在穿入结束时,也不起任何作用。为此,许多人认为,酶是蛭弧菌穿入宿主细胞壁的主要因子。

作者认为,蛭弧菌穿入宿主的机制是极为复杂的,可能是多种因素联合作用的结果。

(四)蛭弧菌的生长发育

1、蛭弧菌小体的形成及其特性蛭弧菌穿入过程完成之后,对宿主细胞的结构进行一系列的修饰和改造,形成一个适合蛭弧菌生长的环境——蛭弧菌小体。当蛭弧菌进入宿主周质间后,宿主细胞肽聚糖的60%~7 0%的葡萄糖胺及胞壁酸发生去乙酰化作用。从而由对溶菌酶敏感转成不

敏感,保护菌体肽聚糖不被穿入时释放的酶继续破坏。除此之外,宿主菌细胞壁的修饰过程中,还有非蛋白质大分子与肽聚糖共价连接,同时肽聚糖中的Braun脂蛋白大量丢失。蛭弧菌进入周质间,长链脂肪酸(6 0%棕榈酸、20%油酸)通过羧酯键等联接于宿主肽聚糖上,由于酰化作用的反应,蛭弧菌小体外膜具有更强的抗渗透压的能力,从而起到稳定蛭弧菌小体的作用。另有报到,蛭弧菌进入周质间,除了对宿主肽糖的修饰以外,二氨基庚二酸还可与宿主肽聚糖结合,而赖氨酸、鸟氨酸、胍氨酸和2,4-二氨丁酸则不能发生类似反应。蛭弧菌在大肠杆菌、恶臭假单胞菌、蔓延螺菌中生长时,均发生上述反应。该反应在热死的宿主细胞上仍然能发生,且不受能量产生系统抑剂,蛋白和RNA合成抑制剂及细胞壁合成抑制剂的影响,并且大约1/3的二乙丙基纤维素可与宿主细胞外二乙丙基纤维素交换。推测二乙丙基纤维素的修饰作用是完全由蛭弧菌自身的胞外酶催化的酶促反应来完成的。蛭弧菌还通过自身合成系统对宿主细胞肽聚糖进行修饰、改造,使其更适合自身生长的需要。

蛭弧菌小体有4层特征性的结构:蛭弧菌小体壁;由宿主细胞组成的膜状结构;蛭弧菌细胞壁及细胞膜。这些结构的通透性可调节其内外物交换,与蛭弧菌生长直接相关。

Cover等[22、23]报到,蛭弧菌进入宿主菌60min时,蛭弧菌小体的体积增长到最大,超过底物细胞菌体。这时,蔗糖可任意通过底物细胞,但对寡聚糖有效通过无改变。在蛭弧菌小体细胞中,对亲水分子通透性也无改变。宿主细胞疏水性增高。疏水性的增加受到氯霉素的抑制,这与蛭弧菌合成相应的蛋白有关。

在蛭弧菌小体形成初期,外膜蛋白对通透性具有重要的调节作用,Braun,脂蛋白丢失,随后宿主细胞OmpA蛋白也逐步消失,但OmpF蛋白却存在。这些变化,对蛭弧菌代谢过程中物质转换提供了有利的条件。

2、核酸代谢蛭弧菌在宿主细胞中生长时,可直接利用单体前体物质合成生物大分子,从而大大提高了其生物合成的速度。其核酸的合成,是直接利用单核苷酸作前体物质开始合成的途径。Pritchard报到,蛭弧菌Bd109在大肠杆菌周质间生长时,对氨甲喋呤无明显反应,而蛭弧菌Bd109突变株生长在酵母浸膏浸出物,及蛋白胨培养基上的生长率及细胞得量受到氨甲喋呤的强烈抑制;但若培养基中加入胸腺嘧啶,或胸腺嘧啶核苷,或5’-P-胸苷时,其抑制作用消失。大肠杆菌在缺乏四氢叶酸时,受氨甲喋呤的影响,产生异常高的蛋白/DNA比率。蛭弧菌在此宿主上生长细胞得量显著减少,但总的DNA量高于大肠杆菌中DNA的量。5’-P-胸苷可以除去上述抑制作用;同时,蛭弧菌也存在着胸腺嘧啶脱氧核苷酸合成酶、胸腺嘧啶核苷磷酸及胸腺嘧啶激酶,具有从头合成DNA的潜在能力。Rittenberg研究发现,在宿主细胞周质中生长的蛭弧菌,首先利用宿主内源性磷,尽管外源性磷也进入周质。这一选择性同样适合于脂磷及核酸磷,内源性5’-P-胸苷有效地被蛭弧菌用作DNA 合成前体,而外源性的胸腺嘧啶利用率极低,对外源性的胸腺嘧啶及尿嘧啶核苷几乎是不利用。而对外源性的5-磷酸单核苷酸可直接用于蛭弧菌核酸的生物合成,宿主细胞核酸中的高能磷酸键的能量保存于蛭弧菌中,供其生长代谢需要。

通过[2-14C]标记尿嘧啶检查,发现50%标记物掺入蛭弧菌核酸,剩

下的部分以核酸碱基形式释放,宿主大肠杆菌50S及30S的核糖体及2 3S和16S的核糖体核酸在90min内几乎全部降解,90min后蛭弧菌RNA 开始合成,其活性及标记物在碱基中的比例与宿主菌核酸相似。蛭弧菌DNA中的放射性标记量高于大肠杆菌,而且它们的胞嘧啶与胸腺嘧啶比例不变。当加入外源性的单磷酸核苷酸后,放射性掺入蛭弧菌量明显降低。加入核苷酸及碱基不影响蛭弧菌中放射性掺入量。从而说明,蛭弧菌RNA的合成,主要是通过降解宿主细胞RNA成单核苷酸后而以其作为前体物质开始的,并且宿主的RNA降解物可作为蛭弧菌DNA合成的前体物质。

Rosson等[18、19]报道,蛭弧菌生长于[2-14C]标记DNA的大肠杆菌周质中,约30%的放射性以单磷酸核苷及碱基形式释放到培养基中,其余掺入蛭弧菌,在60min时,仅10%的大肠杆菌DNA被溶解,其余DNA被降解成0.5Mda的片断并入蛭弧菌小体中,先形成单链,然后形成双链DNA 片断。蛭弧菌DNA的合成前体物质,大约70%来源于宿主菌的DNA,30%来源于宿主菌的RNA。进一步研究证明,宿主菌DNA的降解及溶解主要是由蛭弧菌合成的DNA酶所致。

Hespell等[11、12、17]对RNA的代谢过程进行了深入的研究,认为蛭弧菌在周质中生长时,利用宿主菌的RNA合成自身的RNA及DNA,同时约20%~40%的RNA降解成碱基及核糖-1-磷酸残基。核糖-1-磷酸进一步为蛭弧菌所代谢,作为能量的来源,及非核酸性细胞成分的生物合成的底物。在必要时,核糖也可用于其单磷枝核苷的合成。

由于蛭弧菌在缺乏四氢叶酸的大肠杆菌中生长时,蛭弧菌子代细胞

DNA的总量高于宿主大肠杆菌DNA的总量;蛭弧菌突变株在酵母浸出物及蛋白胨培养基上生长时,受到氨甲喋呤的强烈抑制。因此认为,在蛭弧菌中可能存在从小分子合成单体前体物质,然后再合成DNA的途径,甚至存在全新的合成脱氧胸腺嘧啶核苷酸的途径。Rosson在研究中发现,蛭弧菌能够使嘧啶相互转化,并且合成5’-三磷酸嘧啶核苷酸,其途径与肠道菌相似,蛭弧菌在宿主细胞周质中生长与其突变株在培养基上生长时,这一途径略有差异。现已查明,由5’-单核苷酸形成三磷酸核苷酸的酶浓度很高。并且,所有催化胸腺嘧啶补救途径的酶(除胸腺嘧啶激酶之外)均在野生菌株中存在。通过代谢抑制的实验观察,确立了蛭弧菌嘧啶代谢的途径(图6),并发现几乎蛭弧菌所有的非来源于底物细胞的DNA均来源于底物细胞的RNA。但没有发现从氨基酸直接开始合成嘧啶的途径。然而到目前为止,尚没有足够的证据否定这种途径的存在。

图6 蛭弧菌的嘧啶代谢途径

此图为大肠杆菌、沙门菌的嘧啶代谢全过程。图中附有数字箭头表示蛭弧菌嘧啶代谢过程中已证实同样存在此途径,相同的数字表示酶相同;空箭头表示蛭弧菌嘧啶过程中可能存在的途径,但未被证实。酶:1、胸苷合成酶;2、胸苷磷酸化酶;3、胸苷激酶;4、脱氧胸苷酸激酶;5、二磷酸核苷激酶;6、胞苷脱氧酶;7、尿苷磷酸化酶;8、尿苷激酶;9、尿苷一磷酸焦磷酸化酶;10、核苷二磷酸还原酶。dR-1-P脱氧核糖1-磷酸;

T胸腺嘧啶;TdR脱氧胸苷;U:尿苷;UdR脱氧尿苷;UR尿嘧啶;CR胞苷;CdR脱氧胞苷Rudy[24,38,41]对单核苷酸的转运作了专门的研究,结果证明,蛭弧菌在侵入宿主细胞前后,均能有效地转运单核苷酸,转运机制相同。耗能主动转运单核苷酸是蛭弧菌固有的途径,并非进入周质后而形成的。

3、其它大分子的合成蛭弧菌在周质中生长,其核酸蛋白质、脂类等均是主要从底物细胞同类大分子的降解单体开始合成的。Rittenberg等[1 0]认为,底物细胞的肽聚糖不能用于合成蛭弧菌的肽聚糖,而是用于维持蛭弧菌小体的稳定,蛭弧菌肽聚糖的合成是由小分子开始的。此外,蛭弧菌的其它一些部分合成如下。

(1)脂多糖的合成:在非周质中生长的蛭弧菌的脂多糖,是由葡萄糖、中性糖、岩藻糖胺、氨基糖、十九烷酸及其它脂肪酸、戊糖、酮脱氧辛酸、磷酸等组成。在周质中生长的蛭弧菌,其脂多糖的组成兼有非周质中生长的蛭弧菌脂多糖及宿主大肠杆菌脂多糖的特性。由宿主细胞脂多糖来源的各种脂肪酸占蛭弧菌脂多糖脂肪酸的大部分,并且两者脂多糖中的脂肪酸比例相等。蛭弧菌从宿主细胞脂多糖中获得的葡萄胺占其脂多糖总已糖胺残基的1/3,然而大肠杆菌脂多糖中的核心抗原及O抗原在蛭弧菌中未检出。因此有人提出,蛭弧菌脂多糖中的类脂A直接来源于宿主细胞。当蛭弧菌依次在两个不同的宿主细胞中生长时,这两个宿主细胞脂多糖中的类脂A的主要成分。有人重复了上述实验,也证明了上述的观点,宿主来源于类脂A完全可以掺入蛭弧菌的脂多糖结构。从于大肠杆菌周质中生长的蛭弧菌脂多糖中分离到的类脂A具有两种Rf值,一种与大肠杆菌脂多糖中的类脂A相同(Rf1);另一种与在非周质间生长的蛭弧菌类脂A Rf值相同(Rf2)。说明在周质中生长的

蛭弧菌的类脂A 部分由宿主菌来源,且结构没有发生明显改变。但两种Rf值的类脂A均含有来源于宿主细胞的葡萄糖胺。Rf1的类脂A中的脂肪酸约65%来源于宿主菌的类脂A;Rf2的类脂A中的脂肪酸60%是蛭弧菌自身合成。来源于宿主细胞的脂肪酸N-酰基及O-酰基键分布与其类脂A中该键的分布相同。据此可知,在周质中生长的蛭弧菌的类脂A,一部分是自身合成;一部分是由宿主菌细胞直接提供。在掺入蛭弧菌的过程中,二糖单位及N-、O-、酰基键不发生改变。这为进一步详细阐明蛭弧菌脂多糖的合成提供了实验依据。

(2)外膜蛋白OmpF的合成:蛭弧菌是否能合成OmpF,长期以来一直是个有争议的问题。Fairbands等认为,蛭弧菌在周期中生长时,直接利用宿主菌中的外膜蛋白“蛋白I”或“矩阵蛋白”掺入蛭弧菌外膜。Diredrich等认为,掺入的是宿主菌细胞的OmpF蛋白或OmpC蛋白(缺乏OmpF时)。Bachmann等实验发现,“蛋白I”或所谓“矩阵蛋白”由O mpF及OmpC组成。Guerrini等用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳实验分析了蛭弧菌中的外膜蛋白情况。结果为:当宿主细胞中含有OmpF时,其周质中生长的蛭弧菌也具有OmpF电泳谱,当宿主中不含有OmpF谱带。因此,他们推断蛭弧菌的外膜蛋白直接存在于宿主细胞。Guerrini等认为,蛭弧菌缺乏编码膜蛋白(MP)的基因。Diredrich等发现,蛭弧菌可生长于缺乏OmpF的宿主细胞。从而认为,OmpF对蛭弧菌的生活周期并不重要。

Rayner等 [25]通过详细的实验研究发现,用三硝基甲苯X-100(Tri ton X-100)处理生长于含有OmpF的大肠杆菌周质的蛭弧菌外膜,在蛭

弧菌中含有一迁移率(SDS-丙烯胺梯度凝胶电泳)几乎与大肠杆菌Omp F相同的OmpF蛋白。当凝胶中加入尿素后,两者迁移率同。但他们同时在缺乏OmpF的宿主细胞中生长的蛭弧菌及非周质中生长的蛭弧菌的外膜中发现了蛋白,而且多肽谱与大肠杆菌的OmpF的多肽谱无同源性。因此,他们认为蛭弧菌自身可以合成OmpF蛋白。具体合成步骤至今尚不清楚有待于进一步探讨。

(3)关于蛭弧菌大分子的生物合成:Thomaschow等[15,16,26]指出,生活于周质间的蛭弧菌多聚体的合成,主要是通过降解宿主细胞相应的大分子成为单体,然后直接不变地或改变很少地掺入蛭弧菌,用于其生物大分子的合成。这样,大大节省了合成所需的能量,为蛭弧菌高效生长提供了物质基础。

(4)蛭弧菌的成熟与分裂:当蛭弧菌进入宿主细胞之后,进行了一系列的生理形态变化:鞭毛消失;菌体延长。当蛭弧菌在宿主中生长后期,菌体成熟,鞭毛重新形成,多个子代蛭弧菌形成。

Ruby等到、将蛭弧菌小体用EDTA(乙二胺四乙酸)及菌体裂解酶处理,使蛭弧菌释放。当蛭弧菌释放时,所有的DNA合成停止,分化成具有侵染力的子代蛭弧菌。蛭弧菌在侵入宿主后约60min,由起动信号开始其DNA合成,在每个DNA合成周期结束后,由宿主菌的另一信号启动第二轮DNA合成。子代蛭弧菌DNA合成后,随着其它大分子的合成,装配分化成多个子代蛭弧菌细胞。研究中发现,生长期的蛭弧菌具有很强的适应性,在任何时候都可以分化,不需要外源性的碳源和能源,完全是依赖蛭弧菌自身。蛭弧菌正常的周质生长期是在其“调节”物质耗

尽时开始的。

(五)宿主细胞的裂解

蛭弧菌对宿主细胞的裂解特性,长时间以来,一直被人们关注。对蛭弧菌的裂解机制也进行了大量的研究工作。1978年Thomashow等 [15,1 6]提出的“蛭弧菌穿入、稳定、裂解”模型较有代表性。参与这一过程的主要酶包括:聚糖酶,蛋白酶,N-脱酰基酶、酰基转移酶,Braun去脂蛋白酶(可能是蛋白酶),裂解经修饰的肽糖酶,脂酶,溶菌酶等。

聚糖酶及脂蛋白酶只是在蛭弧菌“穿入”时有活性,而蛋白酶在蛭弧菌的大部分生活期间有活性,但活力不断下降。这三种酶在蛭弧菌“钻孔”中起了作用。N-脱酰基酶、酰基转移酶的作用是维持蛭弧菌小体的稳定,能使之抗渗透压,不被破坏。去Braun脂蛋白酶主要是通过修饰底物细胞壁,使聚糖酶作用消失,而完成这一功能。当蛭弧菌在周质中生长时成熟后,蛭弧菌合成一种新的酶,其功能是完全裂解修饰的肽聚糖,其作用位点于肽聚糖中不可缺少的氨基糖连接键。从而释放子代蛭弧菌。

六、蛭弧菌突变菌株的研究

早期研究认为,蛭弧菌是胞内寄生物。1975年Starr指出,蛭弧菌与宿主细胞不仅仅是寄生的关系,而且还存在共同生的关系。并且发现蛭弧菌存在依赖于宿主菌生长和非依赖宿主菌生长的两种菌株。因此,蛭弧菌可被认为有“依赖共生(S-D)”及“非依赖共生(S-C)”或“非依赖共生条件突变株(S d-comp+)”两种。非依赖共生条件突变株最早于1963年分离得到,称为“非依赖宿主”菌。然而,这些命名均不能准确

分子生物学课后题

第一章 1、简述细胞的遗传物质,怎样证明DNA是遗传物质? 答:核酸是细胞内的遗传物质,包括脱氧核糖核酸(|DNA)和核糖核酸(RNA)两类,DNA是主要的遗传物质,具有储存遗传信息,将遗传信息传递给子代,物理化学性质稳定,有遗传变异能力适合作为遗传信息的特性,T2噬菌体侵染实验证明了DNA是遗传物质,将蛋白质被35S标记和DNA被32P 标记的T2噬菌体分别侵染E.coli后,发现进入宿主细胞的只有32P标记的DNA,而无35S标记物,所产生的子代噬菌体只含有32P标记的DNA,无S标记的蛋白质,因此证明DNA是遗传物质。 2、研究DNA的一级结构有什么重要的生物学意义? 答:DNA的一级结构是指DNA分子中的核苷酸排列顺序,它反映了生物界物种的多样性和复杂性,任何一段DNA序列都可以反映出它的高度的个体性和种族特异性,另外DNA一级结构决定其高级结构,研究DNA一级结构对阐明遗传物质结构、功能及表达调控都极其重要。 3、简述DNA双螺旋结构与现在分子生物学发展的关系。 答:DNA双螺旋结构具有碱基互补配对原则具有极其重要的生物学意义,它是DNA复制、转录、逆转录等基因复制与表达的分子基础。DNA为双链,维持了遗传物质的稳定性。 4、DNA双螺旋结构有哪些形式?说明其主要特点和区别。 答:主要有B-DNA,A-DNA,E-DNA形式 B-DNA:每一螺周含有10个碱基对,两个核苷酸之间夹角为36度 A-DNA:碱基对与中心倾角为19度,螺旋夹角为32.7度 E-DNA:左手螺旋,每圈螺旋含12对碱基,G=C碱基对非对称地位于螺旋轴附近。 第二章 1、简述DNA分子的高级结构。 答:1、单链核酸形成的二级结构(发夹结构)2、反向重复序列(十字架结构,每条链从5'--3'方向阅读)3、三股螺旋的DNA(一条链为全嘌呤核苷酸链,另一条链为全嘧啶核苷酸链)4、DNA的四链结构5、DNA结构的动态性与精细结构6、DNA的超螺旋结构与拓扑学性质。 2、什么是DNA的拓扑异构体,它们之间的相互转变依赖于什么? 答:DNA不同的空间分子构象又称拓扑异构体它们之间转换依赖于连环数L。连环数是指双螺旋DNA中两条链相互缠绕交叉的总次数。 3、简述真核生物染色体的组成,它们是如何组装的? 答:真核生物的染色体在间期表现为染色质,染色质是以双链DNA作为骨架与组蛋白和非组蛋白及少量各种RNA等共同组成的丝状结构的大分子物质、 组装的顺序:DNA—核小体链—纤丝—突环—玫瑰花结—螺旋圈—染色体 4、简述细胞内RNA的分布结构特点 答:成熟的RNA主要分布在细胞质中,无论是真核或原核细胞质中,成千上万种的RNA都分为三大类:1、转运RNA 2、信使RNA 3、核蛋白体RNA。细胞核内的RNA统称为nRNA. 5、简述细胞内RNA的结构特点以及与DNA的区别。 答:1、碱基组成不同,RNA分子主要是A G C U 而DNA以T代替U。 2、RNA分子中的核糖都是D-核糖,而DNA则是D-2-脱氧核糖。 3、RNA分子中有许多稀有,微量碱基,而DNA除个别外,不含有稀有碱基 4、RNA分子中嘌呤碱基与嘧啶碱基不一定相等。 5、RNA分子具有逆转录作用,RNA翻译成蛋白质是遗传物质,是遗传信息的传递结合表达者。 6、RNA分子具有催化功能。 6、引起DNA变性的主要因素有哪些?核酸变性后分子结构和性质发生了哪些变化? 答:①加热②极端PH值③有机溶剂,尿素和酰胺等 核酸变性后氢键被破坏而断裂,双链变为单链,而磷酸二酯键并未锻裂在A260nm 处呈现增色效应。DNA溶液的黏度大大下降、沉淀速度增加、浮力密度上升。紫外吸收光谱升高。酸碱滴定曲线改变,生物活性丧失等。 7、检测核酸变性的定性和定量方法是什么?具体参数如何? 答:在DNA变性过程中,紫外吸收光谱的变化时检测变性最简单的定性和定量方法。核酸在260nm 处具有特征的吸收峰,便是为A260nm。以50ug/ml DNA溶液在A260下测定,三者的A260数值为:

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现代分子生物学 复习提纲 第一章绪论 第一节分子生物学的基本含义及主要研究内容 1 分子生物学Molecular Biology的基本含义 ?广义的分子生物学:以核酸和蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息和细胞信息传递中的作用为研究 对象,从分子水平阐明生命现象和生物学规律。 ?狭义的分子生物学:偏重于核酸(基因)的分子生物学,主要研究基因或DNA的复制、转录、表达和调控 等过程,也涉及与这些过程相关的蛋白质和酶的结构与功能的研究。 1.1 分子生物学的三大原则 1) 构成生物大分子的单体是相同的 2) 生物遗传信息表达的中心法则相同 3) 生物大分子单体的排列(核苷酸、氨基酸)的不同 1.3 分子生物学的研究内容 ●DNA重组技术(基因工程) ●基因的表达调控 ●生物大分子的结构和功能研究(结构分子生物学) ●基因组、功能基因组与生物信息学研究 第二节分子生物学发展简史 1 准备和酝酿阶段 ?时间:19世纪后期到20世纪50年代初。 ?确定了生物遗传的物质基础是DNA。 DNA是遗传物质的证明实验一:肺炎双球菌转化实验 DNA是遗传物质的证明实验二:噬菌体感染大肠杆菌实验 RNA也是重要的遗传物质-----烟草花叶病毒的感染和繁殖过程 2 建立和发展阶段 ?1953年Watson和Crick的DNA双螺旋结构模型作为现代分子生物学诞生的里程碑。 ?主要进展包括: ?遗传信息传递中心法则的建立 3 发展阶段 ?基因工程技术作为新的里程碑,标志着人类深入认识生命本质并能动改造生命的新时期开始。 ? 第三节分子生物学与其他学科的关系 思考 ?证明DNA是遗传物质的实验有哪些? ?分子生物学的主要研究内容。 ?列举5~10位获诺贝尔奖的科学家,简要说明其贡献。

分子生物学习题与答案

第0章绪论 一、名词解释 1.分子生物学 2.单克隆抗体 二、填空 1.分子生物学的研究内容主要包含()、()、()三部分。 三、是非题 1、20世纪60年代,Nirenberg建立了大肠杆菌无细胞蛋白合成体系。研究结果发现poly(U)指导了多聚苯丙氨酸的合成,poly(G)指导甘氨酸的合成。(×) 四、简答题 1. 分子生物学的概念是什么? 2. 你对现代分子生物学的含义和包括的研究范围是怎么理解的? 3. 分子生物学研究内容有哪些方面? 4. 分子生物学发展前景如何? 5. 人类基因组计划完成的社会意义和科学意义是什么? 6.简述分子生物学发展史中的三大理论发现和三大技术发明。 7. 简述分子生物学的发展历程。 8. 二十一世纪生物学的新热点及领域是什么? 9. 21世纪是生命科学的世纪。20世纪后叶分子生物学的突破性成就,使生命科学在自然科学中的位置起了革命性的变化。试阐述分子生物学研究领域的三大基本原则,三大支撑学科和研究的三大主要领域? 答案: 一、名词解释 1.分子生物学:分子生物学就是研究生物大分子之间相互关系和作用的一门学科,而生物大分子主要是指基因和蛋白质两大类;分子生物学以遗传学、生物化学、细胞生物学等学科为基础,从分子水平上对生物体的多种生命现象进行研究。

2.单克隆抗体:只针对单一抗原决定簇起作用的抗体。 二、填空 1.结构分子生物学,基因表达与调控,DNA重组技术 三、是非题 四、简答题 1. 分子生物学的概念是什么? 答案: 有人把它定义得很广:从分子的形式来研究生物现象的学科。但是这个定义使分子生物学难以和生物化学区分开来。另一个定义要严格一些,因此更加有用:从分子水平来研究基因结构和功能。从分子角度来解释基因的结构和活性是本书的主要内容。 2. 你对现代分子生物学的含义和包括的研究范围是怎么理解的? 分子生物学是从分子水平研究生命本质的一门新兴边缘学科,它以核酸和蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息和细胞信息传递中的作用为研究对象,是当前生命科学中发展最快并正在与其它学科广泛交叉与渗透的重要前沿领域。狭义:偏重于核酸的分子生物学,主要研究基因或DNA的复制、转录、表达和调节控制等过程,其中也涉及与这些过程有关的蛋白质和酶的结构与功能的研究。分子生物学的发展为人类认识生命现象带来了前所未有的机会,也为人类利用和改造生物创造了极为广阔的前景。所谓在分子水平上研究生命的本质主要是指对遗传、生殖、生长和发育等生命基本特征的分子机理的阐明,从而为利用和改造生物奠定理论基础和提供新的手段。这里的分子水平指的是那些携带遗传信息的核酸和在遗传信息传递及细胞内、细胞间通讯过程中发挥着重要作用的蛋白质等生物大分子。这些生物大分子均具有较大的分子量,由简单的小分子核苷酸或氨基酸排列组合以蕴藏各种信息,并且具有复杂的空间结构以形成精确的相互作用系统,由此构成生物的多样化和生物个体精确的生长发育和代谢调节控制系统。阐明这些复杂的结构及结构与功能的关系是分子生物学的主要任务。 3. 分子生物学主要包含以下三部分研究内容:A.核酸的分子生物学,核酸的分子生物学研究核酸的结构及其功能。由于核酸的主要作用是携带和传递遗传信息,因此分子遗传学(moleculargenetics)是其主要组成部分。由于50年代以来

噬菌体简介

噬菌体 一、生物学特性 噬菌体(Phage)属于非细胞型微生物,是侵染细菌、放线菌等细胞型微生物的病毒。它们个体微小,通常仅能在电子显微镜下观察到;结构简单,多数噬菌体仅由蛋白质和核酸两种成分组成,蛋白质构成的衣壳包裹着核酸。在自然界单独存在的噬菌体不表现出生命规象,但具有潜在的生命力。噬菌体从吸附至宿主细胞上的一瞬间,就开始了自己的生命过程。根据噬菌体与宿主的关系,可将其分为烈性噬菌体与温和噬菌体。烈性噬菌体通过吸附、侵人、生物合成、装配与释放等步骤使宿主细胞裂解死亡;而温和噬菌体侵染宿主后,则将其核酸整合在宿主基因组上,并以原噬菌体状态存在,宿主则转为溶原性菌株;但有时也有机率较少的温和噬菌体与烈性噬菌体一样,引起宿主细胞的裂解死亡。温和噬菌体对溶原状态和裂解途径的选择,取决于感染细胞内的一些宿主基因产物和噬菌体基因产物活性之间的平衡。[1] 噬菌体广泛分布于自然界是与其宿主的广泛分布分不开的。迄今为止,几乎没有一群细菌尚未发现其相应的噬菌体,只有那些我们了解的还很肽浅的细菌才尚未见其相应噬菌体的报导。[2] 根据大小、形态结构特征,可以把噬菌体分为3种类型,一是蝌蚪状不可收缩尾的噬菌体,其头部为二十面体,直径约110 -120nm,尾部长220-230 nm,尾宽13-15 nm,无尾鞘、基板、尾丁、尾兹等结构。二是蝌蚪状可收缩尾的噬菌体,其头部为三十面体,约70nm x 110 nm,尾部长约120 -130 nm,尾宽约18-22nm,有尾鞘、基板、尾丁、尾兹等结构,该噬菌体似有包膜。三是短尾噬菌体,其头部为二十面体,大小为20 nm,尾部长约2-3 nm。 [3]

【生物科技公司】分子生物学中英文对照

(生物科技行业)分子生物学中英文对照

acetylCoA/乙酰辅酶A一种小分子的水溶性代谢产物,由与辅酶A相连的乙酰基组成,产生于丙酮酸、脂肪酸及氨基酸的氧化过程;其乙酰基在柠檬酸循环中被转移到柠檬酸。 actin/肌动蛋白,肌纤蛋白富含于真核细胞中的结构蛋白,与许多其他蛋白相互作用。其球形单体(G2肌动蛋白)聚合形成肌动蛋白纤丝(F2肌动蛋白)。在肌肉细胞收缩时F2肌动蛋白与肌球蛋白相互作用。activationenergy/活化能(克服障碍以)启动化学反应所需的能量投入。降低活化能,可增加酶的反应速率。activesite/活性中心,活性部位酶分子上与底物结合及进行催化反应的区域。 activetransport/主动转运离子或小分子逆浓度梯度或电化学梯度的耗能跨膜运动。由ATP耦联水解或另一分子顺其电化学梯度的转运提供能量。 adenylylcyclase/酰苷酸环化酶催化由ATP生成环化腺苷酸(cAMP)的膜附着酶。特定配体与细胞表面的相应受体结合引发该酶的激活并使胞内的cAMP升高。 allele/等位基因位于同源染色体上对应部位的基因的两种或多种可能形式之一。allosterictransition/变构转换小分子与蛋白质上特定调节部位相结合所引起的蛋白质之三级及(或)四级结构的改变,其活性随之发生变化。多亚单位酶的变构调节很普遍。 alpha(α)helix/α螺旋常见的蛋白质二级结构,其氨基酸线性序列叠为右旋螺旋,借助主链上的羧基与酰胺基间的氢键维持稳定。 aminoacyl2tRNA/氨酰转移核糖核酸用于蛋白合成的氨基酸的激活形式,含有借高能酯键与tRNA分子上3’2羟基相结合的氨基酸。 amphipathic/两亲的,兼性的指既有亲水性部分又有疏水性部分的分子或结构。 anaphase/(细胞分裂)后期姐妹染色体(或有丝分裂期的成对同源物)裂开并分别(分离)朝纺锤体两极移动的有丝分裂期。 anticodon/反密码子与mRNA的密码子互补的tRNA中三个核苷酸的序列,蛋白合成过程中,密码子与反密码子之间的碱基配对使携带增长肽链的新增对等氨基酸的tRNA排齐。 antiport/反向转运协同转运的一种形式,膜蛋白(反向转运子)向相反的方向转运两种不同的分子或离子跨越细胞膜。 antisenseRNA/反义核糖核酸具有与某种特异性RNA转录物或mRNA互补序列的核糖核酸,其结合可阻止mRNA转录或翻译过程。 apoptosis/编程性细胞死亡,细胞程序死亡通过一系列很鲜明的形态学改变而导致细胞死亡的受调节过程。aster/星体由微管组成的星形结构(称星状纤维),它在有丝分裂期自中心体呈放射状向外延伸。ATPsynthase/ATP合酶附着在线粒体内膜、叶绿体的类囊体膜及细菌浆膜的多聚体蛋白复合物,它在氧化磷酸化及光合作用过程中催化ATP的合成。也叫F0F1复合体。 ATPase/ATP酶催化ATP水解成ADP与无机磷酸并释放自由能的一大族酶中的一种。autonomouslyreplicatingsequence(ARS)/自主复制序列可使酵母菌DNA分子复制的序列;酵母菌DNA 复制的一个起源。 autoradiography/放射自显影术让照相底片或胶片暴露于样本,使样本(如组织切片或电泳凝胶)中的放射活性分子显影的技术。片子叫作放射自显影图或放射自显影片。 auxotroph/营养缺陷体只有培养基内含有不为野生型所需的某种特定养分或代谢物时才能够生长的一种突变细胞或微生物。 axoneme/轴丝存在于纤毛及鞭毛、由微管及相连蛋白构成的束,它负责其运动功能。 basalbody/基体纤毛及鞭毛基底部的结构,微管自该处形成轴丝放射,构造上与中心粒相似。basallamina(pl.basallaminae)/基底层细胞外基质成分组成的薄片网状物,位于大多数动物上皮层及其他形成组织的细胞(如肌肉)的结构之下,使其与结缔组织分隔开来。 base/碱基通常含有氮,可以接受一个质子(H+)的化合物。一般在DNA和RNA中表示嘌呤与嘧啶。basepair/碱基对DNA或RNA分子上两个互补核苷酸的结合,靠彼此碱基成分间的氢键来固定。

2005至2006学年第2学期分子生物学试题A卷

2005至2006学年第2学期分子生物学试题A卷 一、名词解释(每题3分,共18分) 1、冈崎片段 2、RNA的剪接 3、操纵子 4、基因 5、SD序列 6、密码子

二、填空(每空1分,共22分) 1、染色体的包装结构模型主要包括 和。 2、真核生物mRNA零类帽子结构的简写形式为。 3、所有转座子都有两个特征,第一个特征是;第二 个特征是。 4、大肠杆菌的基因组的复制原点位于和之 间,共有245bp,称为。 5、在DNA的错配修复中,区别模板链和新合成链是通过实现的,这 是由负责的。 6、tRNA具有两种功能,分别是和。 7、遗传密码的破译分为三个过程,分别为、 、。 8、真核生物RNA聚合酶Ⅱα—鹅膏蕈碱表现为,此酶存在,其 功能是。 9、内含子的结构特征是mRNA序列、。 10、在原核生物中,和对基因的表达 起着重大的影响。 三、判断是非题(每题1分,共10分,对者在括号内填“√”; 错者在括号内填“×”) ()1、试验研究表明,B-DNA是活性最高的DNA构象,B-DNA变为A-DNA 后,仍具有活性,但局部变为Z-DNA后活性明显降低。 ()2、64个可能的mRNA密码子中有61个是有意义的,所以在翻译过程中至少需要61种tRNA分子。 ()3、诱导物与辅阻遏物都可以引起阻遏蛋白分子的空间结构发生改变。

()4、如果RNA聚合酶只带有核心酶,它不能找到模板上的起始位点,而且DNA两条链都可以作为模板。 ()5、一个核小体单位包括200bp的DNA和一个组蛋白八聚体,组蛋白八聚体由H2A、H2B、H3、H4各两个分子组成。 ()6、大肠杆菌中SOS反应的最主要作用是通过在原始DNA损伤区附近导入补偿突变来提高细胞存活率。 ()7、分泌蛋白的运输为翻译—转运同步机制,分泌蛋白一般由游离核糖体合成。 ()8、核糖体小亚基最基本的功能是连接mRNA与tRNA,大亚基则催化肽键的形成。 ()9、Poly(A)是转录后在mRNA末端由腺苷酸转移酶所催化形成的腺苷酸多聚体。 ()10、如果tRNA Tyr的反密码子发生单个碱基变化后成为丝氨酸的反密码子,这种tRNA被加入到无细胞系系统,所得的蛋白质在原来应为丝氨酸的 位置都变成了酪氨酸。 四、简答题(每题5分,共25分) 1、原核生物与真核生物各自的mRNA的特征。

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分子生物学试题及答案 一、名词解释 1.cDNA与cccDNA:cDNA是由mRNA通过反转录酶合成的双链DNA;cccDNA是游离于染色体之外的质粒双链闭合环形DNA。 2.标准折叠单位:蛋白质二级结构单元α-螺旋与β-折叠通过各种连接多肽可以组成特殊几何排列的结构块,此种确定的折叠类型通常称为超二级结构。几乎所有的三级结构都可以用这些折叠类型,乃至他们的组合型来予以描述,因此又将其称为标准折叠单位。 3.CAP:环腺苷酸(cAMP)受体蛋白CRP(cAMP receptor protein ),cAMP与CRP结合后所形成的复合物称激活蛋白CAP(cAMP activated protein ) 4.回文序列:DNA片段上的一段所具有的反向互补序列,常是限制性酶切位点。 5.micRNA:互补干扰RNA或称反义RNA,与mRNA序列互补,可抑制mRNA的翻译。 6.核酶:具有催化活性的RNA,在RNA的剪接加工过程中起到自我催化的作用。 7.模体:蛋白质分子空间结构中存在着某些立体形状和拓扑结构颇为类似的局部区域 8.信号肽:在蛋白质合成过程中N端有15~36个氨基酸残基的肽段,引导蛋白质的跨膜。 9.弱化子:在操纵区与结构基因之间的一段可以终止转录作用的核苷酸序列。 10.魔斑:当细菌生长过程中,遇到氨基酸全面缺乏时,细菌将会产生一个应急反应,停止全部基因的表达。产生这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸(pppGpp)。PpGpp与pppGpp的作用不只是一个或几个操纵子,而是影响一大批,所以称他们是超级调控子或称为魔斑。 11.上游启动子元件:是指对启动子的活性起到一种调节作用的DNA序列,-10区的TATA、-35区的TGACA 及增强子,弱化子等。 12.DNA探针:是带有标记的一段已知序列DNA,用以检测未知序列、筛选目的基因等方面广泛应用。13.SD序列:是核糖体与mRNA结合序列,对翻译起到调控作用。 14.单克隆抗体:只针对单一抗原决定簇起作用的抗体。 15.考斯质粒:是经过人工构建的一种外源DNA载体,保留噬菌体两端的COS区,与质粒连接构成。16.蓝-白斑筛选:含LacZ基因(编码β半乳糖苷酶)该酶能分解生色底物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)产生蓝色,从而使菌株变蓝。当外源DNA插入后,LacZ基因不能表达,菌株呈白色,以此来筛选重组细菌。称之为蓝-白斑筛选。 17.顺式作用元件:在DNA中一段特殊的碱基序列,对基因的表达起到调控作用的基因元件。18.Klenow酶:DNA聚合酶I大片段,只是从DNA聚合酶I全酶中去除了5’→3’外切酶活性 19.锚定PCR:用于扩增已知一端序列的目的DNA。在未知序列一端加上一段多聚dG的尾巴,然后分别用多聚dC和已知的序列作为引物进行PCR扩增。 20.融合蛋白:真核蛋白的基因与外源基因连接,同时表达翻译出的原基因蛋白与外源蛋白结合在一起所组成的蛋白质。 二、填空 1. DNA的物理图谱是DNA分子的(限制性内切酶酶解)片段的排列顺序。 2. RNA酶的剪切分为(自体催化)、(异体催化)两种类型。 3.原核生物中有三种起始因子分别是(IF-1)、(IF-2)和(IF-3)。 4.蛋白质的跨膜需要(信号肽)的引导,蛋白伴侣的作用是(辅助肽链折叠成天然构象的蛋白质)。5.启动子中的元件通常可以分为两种:(核心启动子元件)和(上游启动子元件)。 6.分子生物学的研究内容主要包含(结构分子生物学)、(基因表达与调控)、(DNA重组技术)三部分。7.证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是(肺炎球菌感染小鼠)、( T2噬菌体感染大肠杆菌)这两个实验中主要的论点证据是:(生物体吸收的外源DNA改变了其遗传潜能)。 8.hnRNA与mRNA之间的差别主要有两点:(hnRNA在转变为mRNA的过程中经过剪接,)、 (mRNA的5′末端被加上一个m7pGppp帽子,在mRNA3′末端多了一个多聚腺苷酸(polyA)尾巴)。 9.蛋白质多亚基形式的优点是(亚基对DNA的利用来说是一种经济的方法)、(可以减少蛋白质合成过程中随机的错误对蛋白质活性的影响)、(活性能够非常有效和迅速地被打开和被关闭)。 10.蛋白质折叠机制首先成核理论的主要内容包括(成核)、(结构充实)、(最后重排)。 11.半乳糖对细菌有双重作用;一方面(可以作为碳源供细胞生长);另一方面(它又是细胞壁的成分)。所以需要一个不依赖于cAMP—CRP的启动子S2进行本底水平的永久型合成;同时需要一个依赖于cAMP—CRP的启动子S1对高水平合成进行调节。有G时转录从( S2)开始,无G时转录从( S1)开

分子生物学的研究及发展

分子生物学的应用及发展 摘要:本文在文献检索的基础上,对分子生物学的发展简史,基本原理,研究领域等作了简单介绍,阐述了分子生物学在人们日常生活中的应用并结合药学专业着重讨论了其在药学及中药开发发面的应用,并进一步对分子生物学未来的研究技术、方向和前景做了展望。 一前言 生物以能够复制自己而区别于非生物。生命现象最基本的特征是进行“自我更新”。进行“自我更新”体现了一种最高级和最复杂的运动状态。这种运动就是生物机体从环境中摄取物质和能量,以更新本身的物质组成,而山现生长、繁殖,在这样的过程中保证了将自身的特征传给历代;同时也不断地向环境输送一些物质和释放能量。在生物机体的组成物质中,防水分外,有各种无机盐类和各种有机化合物。其中生物大分子——核酸和蛋白质在进行自我更新运动中,以其功能的重要性占第一位。为探索生命现象的本质问题,产生了分子生物学这一学科[1]。 分子生物学(molecular biology)是从分子水平研究生命本质为目的的一门 新兴边缘学科,它是研究核酸、蛋白质等生物大分子的形态、结构特征及其重要性、规律性和相互关系的科学,是当前生命科学中发展最快并正在与其它学科广泛交叉与渗透的重要前沿领域[2]。 分子生物学的最终目标是远大的,从产生基本细胞行为类型的各种分子的角度,来理解这五类行为类型:生长、分裂、分化、运动和相互作用。即分子生物学力图完整地描述细胞大分子的结构、功能和相互联系,从而理解细胞为什么要采取这种方式[3]。

分子生物学作为一门新兴的边缘学科。它的迅速发展及其在整个生命科学领域的广泛渗透和应用,促使人们对生物学等生命科学的认识从细胞水平进入分子水平。在农业、畜牧、林业、微生物学等领域发展十分迅速,如转基因动植物等。在医学领域,为医学诊断、治疗及新的疫苗、新药物研制等开辟了新的途径,使医学科学中原有的学科发生分化组合,医学分子生物学等新的学科分支不断产生,使医学科学发生了深刻的变革,不认识到这一点就很难跟上科学发展的步伐。 分子生物学的发展为人类认识生命现象带来了前所未有的机会,也为人类利用和改造生物创造了极为广阔的前景。 二分子生物学发展简史 分子生物学的发展大致可分为三个阶段[4-7]: 2.1准备和酝酿阶段 19世纪后期到20世纪50年代初,是现代分子生物学诞生的准备和酝酿阶段。在这一阶段产生了两点对生命本质的认识上的重大突破:一是确定了蛋白质是生命的主要基础物质,二是确定了生物遗传的物质基础是DNA。这也为以后分子生物学的发展提供了理论基础。 2.2现代分子生物学的建立和发展阶段 这一阶段是从50年代初到70年代初,以1953年Watson和Crick提出的DNA双螺旋结构模型作为现代分子生物学诞生的里程碑开创了分子遗传学基本理论建立和发展的黄金时代。DNA双螺旋发现的最深刻意义在于:确立了核酸作为信息分子的结构基础;提出了硷基配对是核酸复制、遗传信息传递的基本方式;从而最后确定了核酸是遗传的物质基础,为认识核酸与蛋白质的关系及其在

乳杆菌噬菌体的分离鉴定及生物学特性分析

乳杆菌噬菌体的分离鉴定及生物学特性分析乳杆菌作为公认的安全级微生物,具有促消化、抗菌、增强免疫力等多种益生功能,广泛应用于食品工业、医药工程和畜牧业,其中植物乳杆菌、干酪乳杆菌和戊糖乳杆菌较为常用。在发酵工程中,噬菌体的污染可造成不可忽视的后果,严重影响产品品质,甚至导致发酵失败。 本研究通过噬菌体富集法从酸菜中分离出两株烈性乳杆菌噬菌体,分别命名为LpeD和Lpa804,并对这两株噬菌体进行了生物学特性的鉴定。通过电镜观察,噬菌体LpeD和Lpa804均具有典型的二十面体头部和非收缩性尾部,均属于尾噬菌体目、长尾噬菌体科。 根据宿主范围测定结果,噬菌体Lpa804可感染植物乳杆菌(L.plantarum PA106和L.plantarum SC),而噬菌体LpeD可感染戊糖乳杆菌(L.pentosus KLDS1.0413)和植物乳杆菌(L.plantarumKLDSl.0344)。一步生长曲线的测定结果显示,噬菌体LpeD的潜伏期为15min,裂解期为90min,裂解量为194PFU/cell;噬菌体Lpa804的潜伏期为30min,裂解期为105 min,裂解量为221 PFU/cell。 理化因素对噬菌体的影响结果表明,噬菌体LpeD和Lpa804均对热敏感,LpeD 在56℃作用2 min全部失活,Lpa804在63℃作用2 min全部失活。噬菌体LpeD 和Lpa804在pH 4-12的环境中较为稳定,显示了较强的酸碱耐受性。 紫外线照射并不能使噬菌体LpeD和Lpa804完全灭活,二者在紫外线照射20 min后均仍有部分噬菌体颗粒存活。噬菌体LpeD和Lpa804对乙醇和异丙醇较敏感,35%乙醇作用10 min可使LpeD全部失活,25%乙醇作用10 min可使Lpa804 全部失活。 35%异丙醇作用10 min可使LpeD全部失活,25%异丙醇作用10 min可使

分子生物学期末考试重点

1. 定义重组DNA 技术将不同的DNA 片段按照人们的设计定向连接起来,然后在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状。 2. 说出分子生物学的主要研究内容 1. DNA 重组技术 2. 基因表达研究调控 3. 生物大分子的结构功能研究 4. 基因组、功能基因 组与生物信息学研究 3. 简述DNA 的一、二、三级结构 一级: 4 种核苷酸的连接及排列顺序,表示了该DNA 分子的化学成分 二级: 2 条多核苷酸连反向平行盘绕所形成的双螺旋结构 三级:DNA 双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定的空间结构 4. 原核生物DNA 具有哪些不同于真核生物DNA 的特征? ①DNA双螺旋是由2条互相平行的脱氧核苷酸长链盘绕而成,多核苷酸的方向由核苷酸间的磷酸二酯键的走向决定,一条是5---3,另一条是3---5②DNA双螺旋中脱氧核糖和磷酸 交替连接,排在外侧构成基本骨架,碱基排在内侧③两条链上的碱基通过氢键相结合,形成碱基对 5. DNA 双螺旋结构模型是由谁提出的?沃森和克里克 6. DNA 以何种方式进行复制,如何保证DNA 复制的准确性? 线性DNA 的双链复制:将线性复制子转变为环状或者多聚分子,在DNA 末端形成发卡式结构,使分子没有游离末端,在某种蛋白质的介入下在真正的末端上启动复制。环状DNA 复制:B型、滚环型、D型 ①以亲代DNA 分子为模板进行半保留复制,复制时严格按照碱基配对原则 ②DNA聚合酶I非主要聚合酶,可确保DNA合成的准确性

③DNA修复系统:错配修复、切除修复、重组修复、DNA直接修复、SOS系统 7. 简述原核生物DNA复制特点 只有一个复制起点,复制起始点上可以连续开始新的DNA复制,变现为虽只有一个复制单元,但可以有多个复制叉 8. 真核生物DNA的复制在哪些水平上受到调控? 细胞生活周期水平调控;染色体水平调控;复制子水平调控 9. 细胞通过哪几种修复系统对DNA损伤进行修复? 错配修复,恢复错配;切除修复,切除突变的碱基和核苷酸片段;重组修复,复制后的修复;DNA直接修复,修复嘧啶二聚体;SOS系统,DNA的修复,导致变异 10?什么是转座子?分为哪些种类? 是存在于染色体DNA上可自主复制和移动的基本单位。可分为插入序列和复合型转座子 11?什么是编码链?什么是模板链? 与mRNA序列相同的那条DNA链称为编码链,另一条根据碱基互补配对原则指导mRNA 合成DNA链称为模板链 12. 简述RNA的种类及其生物学作用 mRNA :编码了一个或多个多肽链序列。 tRNA :把mRNA上的遗传信息变为多肽中的氨基酸信息。 rRNA :是核糖体中的主要成分。 hnRNA :由DNA 转录生成的原始转录产物。 snRNA :核小RNA,在前体mRNA 加工中,参与去除内含子。 snoRNA :核仁小RNA,主要参与rRNA及其它RNA的修饰、加工、成熟等过程。 scRNA :细胞质小RNA在蛋白质合成过程起作用。

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分子生物学 第一章绪论 分子生物学研究内容有哪些方面? 1、结构分子生物学; 2、基因表达的调节与控制; 3、DNA重组技术及其应用; 4、结构基因组学、功能基因组学、生物信息学、系统生物学 第二章DNA and Chromosome 1、DNA的变性:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。 2、DNA复性:变性DNA在适当条件下,分开的两条单链分子按照碱基互补原则重新恢复天然的双螺旋构象的现象。 3、Tm(熔链温度):DNA加热变性时,紫外吸收达到最大值的一半时的温度,即DNA分子内50%的双链结构被解开成单链分子时的温度) 4、退火:热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,称为退火 5、假基因:基因组中存在的一段与正常基因非常相似但不能表达的DNA序列。以Ψ来表示。 6、C值矛盾或C值悖论:C值的大小与生物的复杂度和进化的地位并不一致,称为C值矛盾或C值悖论(C-Value Paradox)。 7、转座:可移动因子介导的遗传物质的重排现象。 8、转座子:染色体、质粒或噬菌体上可以转移位置的遗传成分 9、DNA二级结构的特点:1)DNA分子是由两条相互平行的脱氧核苷酸长链盘绕而成;2)DNA分子中的脱氧核苷酸和磷酸交替连接,排在外侧,构成基本骨架,碱基排列在外侧;3)DNA分子表面有大沟和小沟;4)两条链间存在碱基互补,通过氢键连系,且A=T、G ≡ C(碱基互补原则);5)螺旋的螺距为3.4nm,直径为2nm,相邻两个碱基对之间的垂直距离为0.34nm,每圈螺旋包含10个碱基对;6)碱基平面与螺旋纵轴接近垂直,糖环平面接近平行 10、真核生物基因组结构:编码蛋白质或RNA的编码序列和非编码序列,包括编码区两侧的调控序列和编码序列间的间隔序列。 特点:1)真核基因组结构庞大哺乳类生物大于2X109bp;2)单顺反子(单顺反子:一个基因单独转录,一个基因一条mRNA,翻译成一条多肽链;)3)基因不连续性断裂基因(interrupted gene)、内含子(intron)、外显子(exon);4)非编码区较多,多于编码序列(9:1) 5)含有大量重复序列 11、Histon(组蛋白)特点:极端保守性、无组织特异性、氨基酸分布的不对称性、可修饰作用、富含Lys的H5 12、核小体组成:由组蛋白和200bp DNA组成 13、转座的机制:转座时发生的插入作用有一个普遍的特征,那就是受体分子中有一段很短的被称为靶序列的DNA会被复制,使插入的转座子位于两个重复的靶序列之间。 复制型转座:整个转座子被复制,所移动和转位的仅为原转座子的拷贝。 非复制型转座:原始转座子作为一个可移动的实体直接被移位。 第三章DNA Replication and repair 1、半保留复制:DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板(template)按碱

研究生分子生物学知识点

分子生物学知识点总结 1.蛋白质组(proteome):proteins expressed by a genome, 即基因组表达的 全套蛋白质。蛋白质组学(Protemics)则是以蛋白质组为研究对象,从整体角度,分析细胞或组织内蛋白质构成的动态变化和活动规律的科学。(相互作用网络PPI) 2.表达蛋白质组学研究的基本流程:蛋白样品的制备及定量-总蛋白的双向凝 胶电泳(染色)-凝胶分析软件分析-胶内酶解(胰肽酶)-质谱分析(肽质量指纹图谱)-数据库搜索鉴定蛋白性质 3.双向凝胶电泳:相互垂直的两个方向上,分别基于蛋白质不同的等电点和分 子量,先经等电聚焦电泳(isoelectric focusing, IEF),再经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)把复杂的蛋白质成分分离。 4.比较蛋白质组学:通过比较同一个体肿瘤细胞(组织)与正常细胞(组织) 之间蛋白质在表达数量、表达位置和修饰状态上的差异,发现与肿瘤发病或者发展有关的分子标记,用来作为肿瘤诊断的肿瘤相关蛋白。 5.软电离:所谓“软电离”是指样品分子电离时保留整个分子的完整性,不会 形成碎片离子。 6.肿瘤血清蛋白质分析方法(tumor serologic proteome analysis, SERPA): 是从肿瘤免疫学观点出发建立的一种蛋白质组学和肿瘤免疫学相结合的方法。 SERPA其实验过程如下: ①双向电泳分离肿瘤组织(细胞)总蛋白质; ②转膜; ③建立western blotting蛋白质印迹反应图谱(与患者或正常人血清反应); ④软件分析确定差异反应的蛋白质斑点; ⑤质谱鉴定和生物信息对肿瘤组织平行胶(replica gel)中相应的差异蛋白 质点进行鉴定,筛选出肿瘤分子标志物; ⑥用ELISA、免疫组化等方法对该分子标志物进行原位验证,或者进一步分 析该蛋白功能,研究其在肿瘤进展中发挥的作用。 7.蛋白质芯片:是将大量蛋白质分子按预先设置的排列固定于一种载体表面, 形成微阵列,根据蛋白质分子间特异性结合的原理,构建微流体生物化学分析系统,以实现对生物分子的准确、快速、大信息量的检测。 8.功能蛋白质组学:是指对蛋白质间、蛋白质与DNA/RNA间的相互作用的研究。 以细胞内与某个功能有关或某种条件下的一群蛋白质为主要研究内容,由此建立细胞内外信号传递的复杂网络。研究方法主要有: ●蛋白质芯片技术 目前常用蛋白质芯片有: 1. SELDI-TOF-MS蛋白质芯片 2. 抗体芯片 3. 靶蛋白质芯片 4. 液相蛋白质芯片 ●噬菌体展示技术 ●酵母双杂交系统 ●免疫共沉淀

分子生物学常见名词解释完全版

分子生物学常见名词解释完全版(中英文对照) A Abundance (mRNA 丰度):指每个细胞中mRNA 分子的数目。 Abundant mRNA(高丰度mRNA):由少量不同种类mRNA组成,每一种在细胞中出现大量 拷贝。 Acceptor splicing site (受体剪切位点):内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。Acentric fragment(无着丝粒片段):(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒,从而 在细胞分化中被丢失。 Active site(活性位点):蛋白质上一个底物结合的有限区域。 Allele(等位基因):在染色体上占据给定位点基因的不同形式。 Allelic exclusion(等位基因排斥):形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的 免疫球蛋白质。 Allosteric control(别构调控):指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。Alu-equivalent family(Alu 相当序列基因):哺乳动物基因组上一组序列,它们与人类Alu 家族相关。 Alu family (Alu家族):人类基因组中一系列分散的相关序列,每个约300bp长。每个成员 其两端有Alu 切割位点(名字的由来)。 α-Amanitin(鹅膏覃碱):是来自毒蘑菇Amanita phalloides 二环八肽,能抑制真核RNA聚 合酶,特别是聚合酶II 转录。 Amber codon (琥珀密码子):核苷酸三联体UAG,引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。Amber mutation (琥珀突变):指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码 子的任何DNA 改变。 Amber suppressors (琥珀抑制子):编码tRNA的基因突变使其反密码子被改变,从而能识 别UAG 密码子和之前的密码子。 Aminoacyl-tRNA (氨酰-tRNA):是携带氨基酸的转运RNA,共价连接位在氨基酸的NH2 基团和tRNA 终止碱基的3¢或者2¢-OH 基团上。 Aminoacyl-tRNA synthetases (氨酰-tRNA 合成酶):催化氨基酸与tRNA 3¢或者2¢-OH基团共价连接的酶。 Amphipathic structure(两亲结构):具有两个表面,一个亲水,一个疏水。脂类是两亲结构,一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋,拥有一个带电的表面和中性表面。 Amplification (扩增):指产生一个染色体序列额外拷贝,以染色体内或者染色体外DNA形 式簇存在。 Anchorage dependence (贴壁依赖):指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。Aneuploid (非整倍体):组成与通常的多倍体结构不同,染色体或者染色体片段或成倍丢失。Annealing (退火):两条互补单链配对形成双螺旋结构。 Anterograde (顺式转运):蛋白质质从内质网沿着高尔基体向质膜转运。 Antibody (抗体):由B 淋巴细胞产生的蛋白质(免疫球蛋白质),它能识别特殊的外源“抗 2 原”,从而引起免疫应答。 Anticoding strand (反编码链):DNA 双链中作为膜板指导与之互补的RNA 合成的链。Antigen (抗原):进入基体后能引起抗体(免疫球蛋白质)合成的分子。 Antiparallel (反式平行):DNA双螺旋以相反的方向组织,因此一条链的5¢端与另一条链的3¢端相连。

2016年电子科技大学613分子生物学真题

电子科技大学 2016年攻读硕士学位研究生入学考试试题 考试科目:613 分子生物学 注:所有答案必须写在答题纸上,写在试卷或草稿纸上均无效。 一、名词解释(30分,每题3分) 1、冈崎片段 2、氨酰tRNA 3、多顺反子mRNA 4、BLAST 5、DNA复性 6、反密码子 7、增强子8、CpG岛 9、外显子10、移码突变 二、填空题(30分,每空1分) 1、大肠杆菌染色体的分子质量大约是2.5X109 Da,核苷酸的平均分子质量是330 Da,两个 邻近核苷酸对之间的距离是0.34 nm,可推算大肠杆菌染色体分子大约长nm。 2、DNA甲基化后将基因的转录。 3、从Bacillus globigii里分离出来的第2种限制性内切酶应命名为。 4、某双链DNA分子中,A的含量为15%,则C的含量是。 5、大肠杆菌基因组大小4.6x106 bp,用限制性内切酶Eco RI (GAA TTC) 对其基因组进行酶切 消化,理论上可以产生个DNA片段。 6、RNA生物合成中,RNA聚合酶的活性需要模板,原料是。 7、是一类具有催化活性的RNA分子。 8、能形成DNA—RNA杂交分子的生物合成过程有、,形成的分子基础 是。 9、克隆来自人基因组约500kb长的DNA片段,最佳载体是。 10、PCR全称,通过多次重复、和三个过程,在体外获得大量目 的DNA片段。典型的PCR反应体系包括、、、、缓冲液和Mg2+等物质。 11、体内DNA复制一般以为引物,复制方向,催化引物合成的酶称为。 12、癌基因可分为、两大类。 13、大肠杆菌在进行错配修复时,以作为识别子、母链的标记,而参与修复合成的DNA 聚合酶是。 14、三个DNA片段A、D1和D2分别置于一个FIN2启动子控制的新霉素抗性基因的不同位 置上,如下图左所示;质粒分别转染小鼠肾细胞系,所得细胞克隆在含有G418的培养基

分子生物学与基因工程复习资料

分子生物学与基因工程 绪论 1、分子生物学与基因工程的含义 从狭义上讲,分子生物学主要是研究生物体主要遗传物质-基因或DNA的结构及其复制、转录、表达和调节控制等过程的科学。 基因工程是一项将生物的某个基因通过载体运送到另一种生物的活体细胞中,并使之无性繁殖和行使正常功能,从而创造生物新品种或新物种的遗传学技术。 2、分子生物学与基因工程的发展简史,特别是里程碑事件,要求掌握其必要的理由 上个世纪50年代,Watson和Crick提出了的DNA双螺旋模型; 60年代,法国科学家Jacob和Monod提出了的乳糖操纵子模型; 70年代,Berg首先发现了DNA连接酶,并构建了世界上第一个重组DNA分子; 80年代,Mullis发明了聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)技术; 90年代,开展了“人类基因组计划”和模式生物的基因组测序,分子生物学进入“基因组时代” 3、分子生物学与基因工程的专业地位与作用。 核酸概述 1、核酸的化学组成 2、核酸的种类与特点:DNA和RNA的区别 (1)DNA含的糖分子是脱氧核糖,RNA含的是核糖;

(2)DNA含有的碱基是腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T),RNA含有的碱基前3个与DNA完全相同,只有最后一个胸腺嘧啶被尿嘧啶(U)所代替; (3)DNA通常是双链,而RNA主要为单链; (4)DNA的分子链一般较长,而RNA分子链较短。 3、DNA作为遗传物质的直接和间接证据; 间接: (1)一种生物不同组织的细胞,不论年龄大小,功能如何,它的DNA含量是恒定的,而生殖细胞精子的DNA含量则刚好是体细胞的一半。多倍体生物细胞的DNA含量是按其染色体倍数性的增加而递增的,但细胞核里的蛋白质并没有相似的分布规律。 (2)DNA在代谢上较稳定。 (3)DNA是所有生物的染色体所共有的,而某些生物的染色体上则没有蛋白质。(4)DNA通常只存在于细胞核染色体上,但某些能自体复制的细胞器,如线粒体、叶绿体有其自己的DNA。 (5)在各类生物中能引起DNA结构改变的化学物质都可引起基因突变。 直接:肺炎链球菌试验、噬菌体侵染实验 4、DNA的变性与复性:两者的含义与特点及应用 变性:它是指当双螺旋DNA加热至生理温度以上(接近100oC)时,它就失去生理活性。这时DNA双股链间的氢键断裂,最后双股链完全分开并成为无规则线团的过程。简而言之,就是DNA从双链变成单链的过程。

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