VASP5.3.5并行版详细安装教程

vasp5.3.5安装教程

制作者：甄江苏（湘潭大学材料科学与工程学院）1.安装Intel编译器：

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然后添加环境变量，在/etc/profile文件中最下面插入：

source /opt/intel/composer_xe_2015.2.164/bin/ifortvars.sh intel64

source /opt/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/bin/mklvars.sh intel64

然后在终端执行：

[root]# source /etc/profile

这里提供的安装包会把其他的Intel的组件包括并行编译器也安装上，但是后面不用它的mpirun这个命令，而是用mpich的mpirun命令，所以进入/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/文件夹，把文件夹mpirt改名，让它的路径失效，比如改成mpirt11111。

此外，安装完后后，最好把licence文件放到安装目录里，Intel编译器指定的license 存放目录之一是/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/license/这个文件夹，这个文件夹要自己新建，然后把license文件拷贝进去即可，不然的话，对于共享此软件的其他节点来说，会找不到license。

然后进入/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/interfaces/fftw3xf/文件夹，执行：[root]# make libintel64

将会生成一个名为libfftw3xf_intel.a的静态库文件，用于后面vasp的链接。

2.安装openmpi：(openmpi总是出问题，无法多节点并行，原因不明，所以建

议用后面的mpich)

进入openmpi解压目录，执行：

[root]# ./configure --prefix=/opt/openmpi CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort

[root]# make all install

然后添加环境变量，在/etc/profile中添加：

export PATH=$PATH:/opt/openmpi/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi/lib

export MANPATH=$MANPATH:/opt/openmpi/share/man

然后在终端执行：

[root]# source /etc/profile

3.安装mpich3:

将mpich3压缩包解压，然后进入，执行：

[root]# ./configure --prefix=/opt/mpich3 --enable-fortran=all --enable-cxx

F77=ifort FC=ifort FCFLAGS="-O2 -xHost"FFLAGS="-O2 -xHost"\

CC=icc CXX=icpc CFLAGS="-O2 –xHost" CXXFLAGS="-O2 -xHost"\ --enable-threads=multiple --enable-fast=all --enable-mpit-pvars=all [root]# make -j 8

[root]# make install

然后添加环境变量：

export PATH=$PATH:/opt/mpich3/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/ mpich3/lib

然后在终端执行：

[root]# source /etc/profile

注意，安装完并行库(不论是openmpi还是mpich)后，都要设置一下：

在/etc/目录中新建一个名为mpd.conf的文本文件，在里面填写上：

MPD_SECRETWORD=mr45-j9z

然后保存退出，给这个文件加上权限：

[root]# chmod 600 /etc/mpd.conf

4.安装vasp（包含NEB）

将vasp的两个压缩包放到一个文件夹中(比如命名为V ASP_Install)，并将这两个压缩包解压，会得到名为vasp.5.3和vasp.5.lib两个目录，然后进入vasp.5.lib文件夹中，找到名为makefile.linux_ifc_P4的文件，打开修改：

将“FC=ifc”改为“FC=ifort”，然后保存退出，并在终端执行：

[root]# make -f makefile.linux_ifc_P4

这将会生成一个名为libdmy.a的文件

然后编译vasp主文件

首先进入网站：https://www.360docs.net/doc/2b13461508.html,/vtsttools/download.html

下载两个VTST相关的压缩包(下图显示的两个)

然后解压

或者直接在终端执行：

svn co https://www.360docs.net/doc/2b13461508.html,/svn/vtsttools

这将会直接将这两个文件的解压版本和另外一个doc文件夹下载到linux本地的vtsttools文件夹下

然后将vtstcode目录中的所有文件拷贝到vasp.5.3目录中，如果有覆盖情况，则选择覆盖

修改vasp.5.3目录中的main.F文件，定位到文件中“CHAIN_FORCE”这行，在“LATT_CUR%A”前面加上“TSIF, ”如图所示：

然后保存退出。

然后将vasp.5.3目录中的makefile.linux_ifc_P4文件重命名为makefile，并修改内容：

这个文件的上半部分是串行的配置，下半部分是并行的配置(但上半部分某些配置是全局的)，我们主要修改下半部分，上半部分有小改动(行号可能和你们的不一样，但是大概就在那个位置)：

将62, 64, 79和98行用“#”注释掉：

在108行后面加上“-heap-arrays 64”,而123行的OFLAG后面可以修改可以不修改，就是优化用的。

将147行前的“#”去掉，并把这一行最后面的“-lguide”改为“-mkl=sequential”，然后将149行和182行用“#”注释掉

将205行和206行的“#”去掉，并在206行后面加上“-mkl=sequential”，然后将223, 224, 225和226行的“#”去掉，并在225行后面添加一个“\”(注意，斜杠后面不能有任何字符，要直接换行)，然后将234和235行的“#”去掉，此处注意，如果采用的是mpich版本的并行库，则要把“BLACS=”那行后面改为“-lmkl_blacs_intelmpi_lp64”。最后将241, 242和243行的“#”去掉(LIB那部分)。此外，如果需要计算spin-orbit coupling (SOC)(自旋-轨道耦合)，则要把“-DNGZhalf”这个参数去掉(所以可以编译出两个版本的vasp)。最后，可以将CPP 中的-DCACHE_SIZE的数值改为12000，貌似会加快计算速度。

将257和258行的“#”去掉。然后就是修改*.o文件了，在“chain.o”前面加上如下图所示的*.o文件，注意结尾处的“\”字符后面不能有空格，也就是说输入“\”后就立即回车，到下一行继续输入(但是行的开始处是可以加空格的，为了美观！)

最后，将下面这里所有的“-lowercase”改成“lowercase”并在前面都加上“-names”，最后在“(-O3 seems to work)”下面的优化项都改成“-O3”

最后保存退出，然后让终端进入vasp.5.3中，执行：

[root]# make

如果编译不报错，20分钟左右就会在此目录中生成一个名叫vasp的可执行文件，我们只需要这个文件，可以把这个文件拷贝到想要拷贝到的地方，如果想要重新修改makefile文件，则修改后要在终端执行：

[root]# make clean

以清除先前的文件

测试的话，直接在单个机器上测试就行，可以把编译得到的可执行文件放到某个目录下，并把三个CAR文件和一个KPOINTS文件放进来，然后进入非root用户，在此文件夹下执行(8表示8个核)：

mpirun -n 8 ./vasp

如果顺利运行，则编译成功！！！