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“典爸典妈”如何运用原典法

写给“典爸典妈”的一封信 ---“典爸典妈”如何运用原典法

原典英语自学法网站刚刚开通,站长告诉我,登录的网友大多为30-40岁的家长,令我心有所感,心有所动。

在站长PATRICK 勤奋工作的推动下,原典法网站终于启航。但一个新网站不可避免存还有诸多不完善之处。而徐老师自己,十月一日起就要回到闭关状态,潜心修书了。闭关期间,无法助网站一臂之力。这未免有欠于热心的网友。

因此,徐老师在闭关之前,给热心的全体网友,写一封信,选取出传书的代表,是“典爸典妈”,但信的内容,对全体网友都适用。

顺便,带上我,对各位网友节日的问候。

30-40岁的父母,大多都学过英语,有不少还学过很多年,少则三五年,多则十来年。但真正掌握英语的,比例不高。

徐老师当年,没有受过任何正规的中学教育,虽然,在文革期间,前前后后在中学里面逗留的时间,加满一共有两年,但这两年里,学习红宝书和下乡劳动的时间,远远超过学文化课。注意,红宝书不是现在的背单词红宝书,而是主席语录红宝书。

原典法实际上已经有20多年的历史了。和各位家长一样,正因为当年徐老师学英语痛苦万状,所以有了孩子以后,就一直一直在琢磨,怎样令孩子不再重蹈覆辙,避免这种不合理的学习模式。这个问题,徐老师在1986年就解决了,这就是原典法的来源。

孩子的成长过程中,英语从来不是“障碍”,相反,由于他的英语实际能力超群,他永远是同班同学里那些超级女生嫉妒的对象。这些超级女生,都是天资聪慧,又外加勤奋好学,但她们在英语上,尽管考试成绩与我儿子不相上下,始终保持年级前五名之列,但实际运用能力上,怎么也赶不不上我的孩子。一个和我

的孩子多年同班的女生,容忆,是一位天才女生,我还记得开家长会,班主任向我们的通报:容忆和另几个女生,都发誓,一定要打败徐海天(我的孩子)。容忆高中毕业,获美国芝加哥大学全额奖学金,直接赴美留学。这个过程中,我还帮过她的忙。

虽然孩子的英语很好,虽然在他小学和中学阶段,我心底里一直希望,他将来学社会科学和人文,但他居然对自己最强项的英语兴趣不大,最后选择了理工科方向。尽管,他在国外生活,没有英国人加拿大人相信他是在中国长大的。口语太流畅口音太纯正了。他跟国内名牌大学的英语专业研究生通过电话匿名沟通的时候,这些国内的英语高材生,也根本不相信他是中国人!

孩子英语过关后,我就没有再特别关注中国的英语教学——尽管我知道它不合理——直到2006年前后。

话扯远了。我们还是来讨论,三十岁以上的成人,如何运用原典法学习英语。

三十来岁的典妈典爸,如何用原典学英语

其实方法很简单很简单。但徐老师力不从心的是,难以说服我们的英语教学专家,他们从小到大,思维已经僵化固化了。

徐老师从来不教学生,从来不教具体知识,但徐老师的学生中,拔类出萃着众多?什么原因,就是因为,他们的思维不僵化,徐老师一点拨,他们就通了,就开始起跑起飞,飞得高高的远远的,也就不算是徐老师的学生了。毕竟,每个学生,我只点拨过三两回。

所以,我说力不从心,那么多学生,飞得高高的远远的,榜样放在那里,可是,总是有人,既有专家,也有学生,难以开窍。

为什么有那么多英语学习法,这就好比,对一种“疾病”,没有特效药,特效疗法,就会有层出不穷的替代药,替代疗法,每一种都吹得天花乱坠,神乎其技,但真正用起来,成功者聊聊。

我恳请,典爸典妈,每一个热心的网友,一定回归常识,相信徐老师一次,就这一次,按以下方法坚持六个月(如果是少年,最多三个月就够了,但如果是成人,那是需要长一点时间的)。而且不要拖,从十一假

日就开始。坚持用了,就能提升,提升了,就能指导孩子,就能帮助孩子从受罪式的英语教学中解放出来。

很简单也绝对有效的方法就在于:仍旧是多聆听,年长的学习者,更要增加聆听的次数。

这样321X 法要改成633X 法:

徐老师特别强调,要向婴幼儿学习,特别是婴幼儿聆听时的不烦躁、无挫折。因此,徐老师有特别提倡静气功式聆听,禅式聆听,把入静养生,作为英语学习同样重要的修为。

徐老师说过,婴儿,听成人的话语,耐心地听12个月,从来不烦躁,一直很好奇很专注。你不要看他或她在游戏,他或她对周围的声音特别专注而敏锐。

成年人要学习英语,聆听时的除烦入静,是第一关。

徐老师说过,成人,包括少年,聆听外语时,最常见的错误,最常见的障碍,第一是,五分钟听不懂,就倍感挫折,十分钟听不懂,就烦躁不堪。这是学外语的第一大关口。第二种常见的障碍,是很容易入睡。一听就打瞌睡,甚至睡着了。睡着了没有什么不好,但外语学习的聆听,必须有相当部分,是在安静且清醒的状态下,才有好的效果。因此,宁静且清醒,是成人聆听外语时要修炼的心理状态。第三种常见的障碍,是太容易分神,表面上在听,也没有瞌睡,但大脑经常分神想其他事情,这样效果肯定也不好。因此,聆听外语,效果最佳的状态一定是,宁静+清醒+专注,我们将此称为禅式聆听,或禅式外语。禅式聆听的好处是,它既能增进你的外语水平,又能增进你的健康,还能普遍增进你作为生命个体的修为。

禅式聆听,可坐,可站,可躺,选择和营造安静的环境,闭上双目,完全放松,抑制和排除杂念,呼吸柔和均匀(可以先用一两分钟的时间入静,缓慢柔和的深呼——深吸——),神清气爽,宁心静思,意念专一,减少外界一切信息干扰,然后播放音频文件,全神贯注且宁静松弛地自然聆听,欣赏朗诵家嗓音的优美。聆听时每逢朗读中短暂的停顿,都要尝试让刚听到的语音流在脑海中一遍遍回荡,所谓话音绕梁,不绝于耳,不绝于脑。不必在意听不懂,集中于辨音、赏音——去欣赏朗读者醇正的发音、优美的朗读、张弛自如的节奏和抑扬顿挫的语调、男声的浑厚、女声的甜美,努力欣赏人类语言的音乐之美。

欲速则不达,一定不要想着自己的听力立刻能进步,就是单纯体会入静,单纯体会声音之美,专注于赏音而辨音。

比较好动容易坐不住的家长,可以用三到五分钟的段落,用633X 法训练。即使连续听6遍,三到五分钟的段落,也就是18-30分钟。天性容易入静的家长,可以选择略长一些的段落,五到十分钟的段落,用633X 法训练。

聆听时,成人一般不需要做猜词训练,听写训练,那样比较费时间,不如把这个时间节省下来,仍旧用于禅式聆听。

聆听完6遍以上,就可以进入阅读阶段。在阅读阶段,要注重结合上下文,学习单词的词义,当时就要结合上下文,把包含目标生词的句子多播放几遍(在电脑上播放为好),同时自己朗读几遍,并应该把生词记录下来,用各种方法定期复习温习。成人记忆力略有下降,但只要专注、从聆听声音入手,从上下文入手,结合定期复习温习,成人能发挥很大的记忆潜能。

阅读完之后,仍旧要再次专注聆听。同样,如徐老师强调,仍旧是纯听——聆听时尽量不回忆故事内容和句子意义,纯粹专注于声音。

这一步做完了,一般情况下,如果聆听的段落并非自己最喜欢最有感觉,就可以跳过X 阶段,直接进入下

一个循环,即用633法,用聆听+阅读+聆听下一段音频文件。

如果完成一段音频/文本文件的633训练之后,感觉自己特别特别喜爱这一段,就开始针对这段进行X 训练。X 训练对成人一般也比较简单,不需要去抠语法,而是朗诵+背诵。朗诵+背诵的训练程序是

1→10 ? SL

所谓1,就是,把目标音频文件分割成1分钟左右的段落,最多不要超过两分钟,但也不要短于30秒钟,所谓10,就是,针对这约1分钟的音频朗诵,再用禅式聆听,听10遍。徐老师把这个过程,称作音轨韵律刻印训练。即把自己最喜欢的大师级朗诵的音轨韵律,深深地刻印在脑海里。如果音频文件太长,刻印的效果不好,如果太短,则大脑对音轨韵律加工“取样”的样本太小,整体效果也不佳,因此,1分钟左右是一个合适的数量。

这个刻印,不仅是语音的刻印,也包括语调的刻印,节奏感的刻印,抑扬顿挫的刻印,用英语来表达就包括 imprinting of prosody所以,称作音轨刻印。这一个层面太重要太重要,徐老师以后再撰文详解,目前,家长跟着做就行了。

1分钟的段落,听10遍也只有10分钟,不难做到专注地聆听;如果时间充裕且学习者自己愿意,音轨韵律刻印训练可以增加到20遍。

音轨韵律刻印训练完成了,就进入SL 训练。SL= Speak / Shout + Listen

音轨韵律刻印训练完成后,大脑中对这段话语的标准的声音表达,已经建立了比较完美的内控模板,此时,当你尝试朗诵、背诵或大声喊出来的时候,你会自我聆听。你同样要发挥着自我聆听的功能,自我聆听,就是根据大脑中的内控模板,自我监控,自我反馈,根据自我监控和自我反馈,反复体会、反复调整自己的发音和朗诵的语调韵律,这样,一遍又一遍的朗诵或背诵,一边朗诵背诵,一边体会并调整发音和语调韵律,要一直朗诵或背诵到第10遍。此时不仅比较熟练了,而且发音和语调韵律都比较逼真了。

通常,X 训练的比例,应该控制总体聆听量的在十分之一以下。例如,总体上用了60分钟长度的音频文件聆听,那么,可以从中挑选出自己最喜爱的总共5分钟段落,做1→10 ? SL 训练。

这样,当你一共聆听了10个小时长度的音频朗诵,你对应的朗诵和背诵训练,已经上升到50分钟,到了这个阶段,你会发现你的英语口语,已经相当地道了——比国内的大多数英语教师都强。

就这么简单的事,可惜专家们不懂,总是搞出这样那样的学习方法和考试。就这么简单的事,可惜我们的学生也缺乏毅力,学了12年,都学不好。用了12年的方法不管用,他们还不愿意换一种方式试试。所谓旧居鲍鱼之肆,不闻其臭。可惜又可惜。

简单归简单,但仍旧要有3-6个月的静心训练,静心修为,此后,就“一劳永逸”地掌握了英语。

徐老师2009-09-30

蛋白质组学与高通量药物筛选

蛋白质组学与高通量药物筛选 作者:王海娣, 杜冠华, 刘艾林 作者单位:中国医学科学院北京协和医学院,药物研究所国家药物筛选中心,北京 100050 本文读者也读过(10条) 1.陈伟.王莉莉走在药物发现前沿的高内涵药物筛选[期刊论文]-国外医学(药学分册)2007,34(3) 2.吕秋军.徐天昊.吴祖泽药物筛选技术的研究进展[期刊论文]-国外医学(药学分册)2003,30(3) 3.张莉.杜冠华.ZHANG Li.DU Guan-hua高内涵药物筛选方法的研究及应用[期刊论文]-药学学报2005,40(6) 4.杨根庆.廖飞药靶发现和药物筛选[期刊论文]-重庆医科大学学报2007,32(z1) 5.吴根福.WU Gen-fu以RNA为靶标的药物筛选新技术[期刊论文]-药学学报2005,40(12) 6.张琪药物筛选技术的研究与应用[期刊论文]-江苏科技信息2007(8) 7.徐志红.蒋志胜药物筛选新方法--高通量筛选[期刊论文]-生物学通报2003,38(3) 8.杜冠华.张莉.方莲华.刘艾林.王月华高通量药物筛选研究进展[会议论文]-2004 9.徐培平.朱宇同.张美义.朱元晓.Xu Peiping.Zhu Yutong.Zhang Meiyi.Zhu Yuanxiao多目标优化技术在中药复方药物筛选及组方优化中的应用[期刊论文]-世界科学技术-中医药现代化2005,7(2) 10.田光辉.刘存芳.辜天琪高通量药物筛选在新药开发中的应用[期刊论文]-内江科技2009,30(1) 引用本文格式:王海娣.杜冠华.刘艾林蛋白质组学与高通量药物筛选[会议论文] 2008

基因组学和蛋白质组学对新药研发的影响

通过校园网进入数据库例如维普期刊数据库、CNKI、超星电子图书等。完成 A、任选一题,检索相关资料,截取检索过程图片,做成一个ppt文件(50分)。 B、写综述形式的学术论文(学术论文格式,字数不限,正文字体小四),做成word文件(50分)。要求:按照自己的思路组织成文件,严禁抄袭。 写明班级学号,打印纸质版交给老师。 1、对检索课题“磷酸对草莓生长和开花的影响”检索中文信息。提示:磷酸的化学物质名称是“Phosphonic acid ”普通商业名称是“ethephon”, 2、基因组学和蛋白质组学对新药研发的影响 3、红霉素衍生物的设计、合成与抗菌活性研究 4、HPLC法测定复方谷氨酰胺肠溶胶囊中L-谷氨酰胺的释放度 姓名:朱艳红 班级: 11生科师范 学号: 11223074 学科教师:张来军

基因组学和蛋白质组学对新药研发的影响琼州学院生物科学与技术学院 11生科师范2班朱艳红 11223074 摘要 20世纪末伴随着人类基因组计划的实施,相继产生了基因组学和蛋白质组学,基因组学和蛋白质组学的迅速发展,对药学科学产生着深远的影响。文章在简介蛋白质组学基本概念、核心技术的基础上,综述了基因组学和蛋白质组学对新药研发带来的影响。 关键词:基因组学;蛋白质组学;药物研发 The impact of genomics and proteomics on the research and development of innovative drug abstract With the implementation of the 20th century,Genomics and proteomics had emerged one after the other. Driven by Soaring development of the omits,pharmaceutical industry presents a new vision,all human life faces a promising future. On the basis of proteomics Introduction to basic concepts, core technology, reviewed the genomics and proteomics research on the impact of new drugs. Keywords:Genomics; proteomics; drug development

蛋白质组学技术与药物作用新靶点研究进展

蛋白质组学技术与药物作用新靶点研究进展 [关键词]:蛋白质组学,新药发现,药物作用靶点,研究进展 药物开发是一个漫长的过程,包括以下步骤:样品制备、新化学实体的发现、靶的探测与验证、先导物选择、小分子筛选和优化以及临床前、临床试验研究等。其中药物作用靶点的探测与验证是新药发现阶段中的重点和难点,成为制约新药开发速度的瓶颈。基因组学研究表明,人体中全部药靶蛋白为1万~2万种,而在过去100年中发现的靶点,仅约有500种。因此,自1994年Wilkins等提出蛋白质组(pro- teome)和蛋白质组学(proteormcs)概念后,就迅速引起广大研究者和制药公司的兴趣和投资。近几年来,蛋白质组学技术和研究思路都有了令人鼓舞的进展,新技术的出现和发展,如多维色质联用(multidimensional liquid chromatography and tan- dem mass spectrometry, MudLC-MS/MS)、表面增强激光解吸离子化-蛋白质芯片系统(surface enhanced laser desorption ion- ization-proteinchip, SELDI-ProteinChip)、同位素亲和标签(iso- tope-coded affinity tags, ICAT)、胶上差示电泳(differential in- gel electrophoresis, DIGE)等技术,弥补了普通双向电泳上样量和检测极限的局限,自动化、特异性和重复性都得到了加强。 蛋白质组学是研究疾病发生过程中蛋白质变化、生化代谢途径改变和鉴定的有力工具。在药物开发中的作用主要表现在疾病检测、药物靶点发现、药物代谢转化、药物不良反应研究等方面。通过比较正常体与病变体、给药前后蛋白质谱的变化,蛋白质组学技术可提供疾病发生、药物作用和药物不良反应的分子机制信息。通过蛋白质组学鉴定的特异生物标记可作为排查药物的功效、抗性和优选。因此,蛋白质组学在药物研究开发中的各个方面得到了细化,如化学蛋白质组学(chemical proteomics),拓扑蛋白质组学(topological proteomics),临床蛋白质组学(clinical proteomics),毒性蛋白质组学(toxicoproteomics)和药物蛋白质组学(phamiaco- proteormcs),这些“亚蛋白质组学”技术的发展,与基因组学结合,将对药物靶标验正和药物开发引起重大变革。笔者就蛋白质组学及相关技术在药物作用靶 点的探测和验证方面的应用作一概述。 1药靶的探测 与药物作用相关的靶或蛋白质主要有3类:①疾病相关(特异性)蛋白质;②生物标记分子;③信号传导分子。蛋白质组学探测药物作用相关靶点的基本策略是蛋白质 组的比较,即健康与病变组织、细胞或体液(如血清、脊髓液、尿液和气管呼出物等)的蛋白质表达谱差异和表达量变化。蛋白质组学已成功用于肿瘤、糖尿病、艾滋病、关节炎等多种疾病相关蛋白或标记蛋白的检测,成为疾病诊断、监测、治疗的有力工具。例如丹麦人类基因组研究中心Julio Celis实验室从膀胱鳞片状细胞癌(SCC)患者的尿液中分离鉴定了一个生物标记—牛皮癣素(psoriasin),免疫组织化学分析表明该蛋白质在正常人的泌尿系统中不存在,因而成为临床检测膀胱鳞片状细胞癌的标记蛋白。 给药前后蛋白质组比较,是比较蛋白质组学的另一个重要内容,是探测新靶蛋白,深入了解药物作用机制,评价药物不良反应,更合理地设计药物的一个新途径。Chen等利用这个方法,找到了抗MCF-7人乳腺癌药物阿霉素的一个作用靶—Hsp27。 类似的方法也用于探测信号传导途径中 的药物作用靶。信号级联放大系统中信号的传递一般与蛋白质磷酸化/去磷酸化密切 相关。通过合适的预分离技术,如亚细胞蛋白质组制备或用免疫色谱分离磷酸化的亚 蛋白质组,得到与信号传导途径相关的蛋白质组以及在细胞中的定位信息,然后通过双向电泳技术分析蛋白质修饰和表达变化。利用这个方法,Stancato等在人原淋巴细胞

有关药物研究中蛋白质组学的研究

有关药物研究中蛋白质组学的研究 发表时间:2012-02-03T16:28:09.440Z 来源:《中国健康月刊(学术版)》2011年第12期供稿作者:权智峰 [导读] 对蛋白质组相关问题的研究称之为蛋白质组学,主要是在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律。权智峰 (陇西县第二人民医院甘肃陇西 748100) 【摘要】作者针对药物研究中蛋白质组学做了一些理论和实践的探讨,包括蛋白质组学研究近况,并对在药物研究中的应用进行了介绍。【关键词】药物研究;蛋白质组学 【中图分类号】R156.3【文献标识码】B【文章编号】1005-0515(2011)12-0379-01 药物研究是一个漫长的过程,基因组技术的发展对药物研究起到了巨大的推动作用,但如何加快药物发现和药物开发的速度,开发有效的药物仍然是药物研究的重点和难点。蛋白质组学作为基因组时代或后基因组时代的核心部分,可以通过直接比较正常体与病变体、给药前后蛋白质图谱的变化弄清疾病的发生发展,发现药物蛋白靶点及药物治疗的分子机制,从而使快速发现更有效的药物成为可能。 1蛋白质组学研究近况 1.1蛋白质组学相关概念:蛋白质组这一概念是1995年由澳大利亚学者[1]最先提出来的,指的在一个特定的时间和空间内,一个基因组、一种细胞组织或一种生物体所表达的全部蛋白质。对蛋白质组相关问题的研究称之为蛋白质组学,主要是在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律。 1.2蛋白质组学相关技术:经典的蛋白质组学研究技术主要包括四大方面:(1)蛋白质的分离技术;(2)蛋白质鉴定技术;(3)蛋白质相互作用的研究技术;(4)大量数据的分析技术。其中二维凝胶电泳和质谱技术是蛋白分离纯化鉴定的核心技术。近几年随着蛋白质组学的发展,出现了不少新的研究技术和研究思路,如固相化pH梯度胶条、二维差异凝胶电泳、多维色质联用、表面增强激光解析离子化-蛋白质芯片系统,表面等离子共振、同位素亲和标记等技术的发展,不仅优化了普通二维电泳上样量和检测的极限,而且在自动化、特异性和重复性上都有所突破。 2在药物研究中的应用 近年来,随着蛋白质组学的快速发展,蛋白质组学技术在药物研究领域有着越来越多的应用,为高通量、特异性、快速的进行药物相关研究提供了强有力的技术支持。 2.1靶点的发现和确认:药物靶点是指药物在体内的作用结合位点,包括基因位点、受体、酶、离子通道、核酸等生物大分子。筛选与确定新的药物作用靶点不仅为揭示药物的作用机理提供了重要信息,而且对新药的开发研制、建立筛选模型、发现先导化合物等也具有重要意义。Weingarten等用二维电泳和生物质谱联用技术,对调节性T细胞进行了蛋白质组学分析,寻找与其功能相关的蛋白靶点,以期找到用于治疗多发性硬化症等免疫系统疾病的新药物靶点。Hu等对法尼基转移酶抑制剂的抗癌作用机制进行了蛋白质组学研究。他们对药物作用前后的卵巢癌细胞总蛋白进行了双向电泳以及质谱分析,发现热休克蛋白70在药物作用后表达上调,然后利用热休克蛋白抑制剂和酶联免疫吸附分析进行了后续研究,他们进一步发现热休克蛋白70能够对法尼基转移酶导致的癌细胞凋亡起到保护作用,而热休克蛋白70的抑制可能成为卵巢癌治疗的新靶点[2]。 2.2耐药相关机制研究中的应用:在癌症、感染等疾病的治疗中,抗肿瘤、抗菌以及抗病毒等药物的耐药问题已经成为相关疾病难治疗、易复发的主要原因之一。关于耐药机制的探讨已经成为了抗菌药物领域的研究热点。利用该技术,研究人员已经发现了多种与耐药相关的蛋白,如:磷酸丙糖异构酶、HSP27、Sorcin等可能与胃癌多药耐药相关;线粒体转录因子A、组蛋白H2B、组蛋白H4、核糖体蛋白L3等可能与结肠癌5-氟尿嘧啶耐药相关; Sigma调控因子RpoD和膜孔蛋白F可能与铜绿假单胞菌多重耐药相关等。这些蛋白的鉴定为深入研究药物耐药性产生机制提供了线索,而且对进一步筛选具有潜在价值的抗多重耐药的药物治疗靶点具有参考价值。 2.3临床医药研究中的应用:近年来,蛋白质组学技术也被广泛应用于临床研究中。蛋白质组学技术高通量、大规模的优势在临床药物研究中得以充分发挥。例如:根据不同病理过程中蛋白质的种类和数量的变化,筛选疾病特异性发生变化的蛋白质,把这些特异的与疾病相关的蛋白质作为生物标志物进行疾病筛查和分期、分型;根据不同治疗、用药阶段蛋白质表达发生变化的情况,筛选病程、药物作用相关的蛋白,利用这些蛋白标志物进行病程分析和用药时机的选择等;根据生物标志物在不同疾病中的变化,从而辨别疾病的性质和进程,对预后进行判断等。Eberini等研究了佐剂关节炎大鼠模型服用非甾体类抗炎药前后血清蛋白质表达图谱的变化,发现不同的药物对血清蛋白质表达水平的影响不同,而且血清蛋白表达水平的变化与炎症参数如关节肿胀等平行。此研究表明,通过研究用药前后蛋白质谱的变化可以判断药物的疗效,进而为临床选择用药及观察疗效提供有力依据。 3展望 蛋白质与蛋白质相互作用,交叉形成复杂的网络系统,是各项生命活动的基础。从先导化合物设计、靶点的寻找与确认,到药物疗效和毒性的评价,最终到临床个体化给药的实现,都是蛋白质组学发挥其技术的舞台。蛋白质组学技术为新药研发提供了新的思路,无疑将对药物研究起到强大的推动作用,将有良好的应用前景。 参考文献 [1]易红,杨轶轩,陈主初,等.应用蛋白质组学技术筛选胃癌耐药相关蛋白质[J].生物化学与生物物理进展, 2006,33(3):267-76. [2]乐军,蒋晓飞,梁莉,吕元.蛋白质组学分析多重耐药的铜绿假单胞菌[J].中国抗生素杂志, 2006,31(8): 496-500.

蛋白质组学及其主要技术

蛋白质组学及其主要技术 朱红1 周海涛2 (综述) 何春涤1, (审校) (1.中国医科大学附属第一医院皮肤科,辽宁沈阳110001; 2.北京大学深圳医院核医学 科,广东深圳518036) 【摘要】蛋白质组是指一种细胞、组织或有机体所表达的全部蛋白质。蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象的新兴学科,近年来发展迅速,已成为后基因组时代的研究热点。目前,蛋白质组学研究技术主要包括:样品的制备和蛋白质的分离、蛋白质检测与图像分析、蛋白质鉴定及信息查询。本文就蛋白质组学概念及主要技术进行综述。 【关键词】蛋白质组,蛋白质组学 1蛋白质组学的概念 随着人类基因组测序计划的完成,人们对生命科学的研究重点由结构基因组转向功能基因组,1994年Wilkins和Williams首先提出蛋白质组一词[1],蛋白质组是指一种细胞、组织或有机体所表达的全部蛋白质。从基因到蛋白质存在转录水平、翻译水平及翻译后水平的调控,组织中mRNA丰度与蛋白质丰度不完全符合[2]。蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质-蛋白质相互作用等也无法从DNA/mRNA水平来判断。因此,只有将功能基因组学与蛋白质组学相结合,才能精确阐明生命的生理及病理机制。 蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象,对组织、细胞的整体蛋白进行检测,包括蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质的相互作用,在蛋白质水平上了解细胞各项功能、各种生理、生化过程及疾病的病理过程等[3,4]。蛋白质组学有两种研究策略。一种是高通量研究技术,把生物体内所有的蛋白质作为对象进行研究,并建立蛋白质数据库,从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,更符合蛋白质组学的本质。但是,由于剪切变异和翻译后修饰,蛋白质数量极其庞大,且表达随空间和时间不断变化,所以分析生物体内所有的蛋白质是一个耗时费力,难以实现的理想目标。另一种策略是研究不同状态或不同时期细胞或组织蛋白质组成的变化,主要目标是研究有差异蛋白质及其功能,如正常组织与肿瘤组织间的差异蛋白质,寻找肿瘤等疾病标记物并为其诊断治疗提供依据。 2蛋白质组学的常用技术 2.1样品的制备和蛋白质的分离技术 2.1.1样品的制备样品制备包括细胞裂解与蛋白质溶解,以及去除核酸等非蛋白质成分。 激光捕获显微切割(Laser-captured microdissection, LCM)[5]技术可大量获得足够用于蛋白质组学研究的单一细胞成分,避免其他蛋白成分对电泳结果的干扰。尤其是肿瘤的蛋白质组学研究常用LCM技术来获取单一的肿瘤细胞。 2.1.2蛋白质的分离技术 ①双向凝胶电泳(Two-dimensional electrophoresis, 2-DE):双向电泳方法于 l975年由O'Farrell[6]首先提出,根据蛋白质等电点和分子量的差异,连续进行成垂直方向的两次电泳将其分离。 第一向为等电聚焦(Isoelectric focusing,IEF)电泳,其基本原理是利用蛋白质分子的等电点不同进行蛋白质的分离。较早出现的IEF是载体两性电解质pH梯度,即在电场中通过两性缓冲离子建立pH梯度;20世纪80年代初建立起来的固相pH梯度(Immobilized pH gradients,IPG)IEF,是利用一系列具有弱酸或弱碱性质的丙烯酰胺衍生物形成pH梯度并参与丙烯酰胺的共价聚合,形成固定的、不随环境电场条件变化的pH梯度。IPG胶实验的重复

蛋白质组学与药物研究中的关系

蛋白质组学与药物研究中的关系 本世纪初Nature和Science杂志分别公布了人类基因组的全部序列。这是“人类基因组计划”进展的一个划时代的里程碑,标志着一个新的纪元——后基因组时代的到来,生命科学的研究重心已开始从揭示生命的所有遗传信息转移到对其功能的研究。因此,蛋白质组学的地位被提到了前所未有的高度。 蛋白质组(proteome)一词的含义为一个基因组、一种生物或一种细胞/组织在某一特定环境下某一时刻所表达的全套蛋白质。当今新药研究所面临的重点和难点是如何加快新药发现的速度,蛋白质组学作为一个全新的领域已经吸引了众多医药公司和专业化公司的广泛兴趣和大量投资,已在药物靶点的探测、分子药理筛选模型的建立、药物毒性评价等方面获得了惊人的成果。(万方数据陈晓红张卫东李时悦李德容孙宝清《蛋白质组学与药物研究》第一二段广州医学院学报第34卷第5期2006年10月)而且随着科学技术的发展,生命科学研究进入了后基因组时代,研究者们越来越意识到,仅仅完成基因组的测序并不足以阐明生物的功能,研究重点逐渐由获取基因序列信息转向研究基因的功能。蛋白质是生物功能的主要体现者,它通过其自身特有的活动,例如修饰加工、转运定位、结构变化、蛋白质与蛋白质的相互作用、蛋白质与其它生物分子的相互作用等,控制和调节着诸多的生命活动。蛋白质组是指某一物种、个体、器官、组织或者细胞基因组的全部蛋白质产物的表达谱,或称一种细胞内存在的全部蛋

白质。蛋白质组学(proteomies)是指研究蛋白质组的科学?,本质上是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平、翻译后的修饰、蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。近年来,蛋白质组学有了长足的发展,技术已经趋于成熟,并广泛应用于各个领域,其中在药物的靶点确认、药物作用机制研究等方面发挥出了其极大的技术优势,明显提高了药物发现的效率。蛋白质组学技术已经应用于药物研究的各个阶段,其技术路线如Fig 1所示。

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