《生物信息学》教学大纲
《生物信息学》教学大纲
Bioinformatics
课程编码：27A11708 学分：1.5 课程类别：专业任选课
计划学时：24 其中讲课：20 上机：4
适用专业：生物技术专业、药学专业
推荐教材：薛庆中著，《DNA和蛋白质序列数据分析工具》，科学出版社，2014年。
参考书目：张成岗著，《生物信息学方法与实践》，科学出版社，2005年。
课程的教学目的与任务
本课程的教学目的是引导学生初步了解生物信息学的基本研究内容与研究方法以及生物信息在多学科领域的应用。使学生掌握生物信息学的基本术语、基本原理、基本研究方法、重要核酸和蛋白质数据库等。掌握指定的基于互联网的常用生物信息学软件的基本操作使用方法。要求学生通过基于问题和任务的学习方式，初步具备解决简单生物信息学问题的研究能力。
课程的基本要求
通过本课程的学习，要求学生1. 掌握该领域的基本知识。2. 掌握指定数据库与软件的应用。3.课程的主要任务包括一次期末考试和多次的章节作业以及课程问题讨论等。 4.培养与引导学生采用生物信息学实际操作能力、以期后期能用于相应领域的研究工作中。
各章节授课内容、教学方法及学时分配建议（含课内实验）
第一章：绪论建议学时：2 [教学目的与要求] 掌握专生物信息学产生背景、概念及研究内容；介绍常用的核酸、蛋白质数据库介。
[教学重点与难点] 掌握生物信息学概念机研究内容，熟悉常用数据库的使用。
[授课方法] 课堂讲授结合上机操作
[授课内容]
§1.1生物信息学的产生背景，概念
生物信息学的发展简史
生物信息学的不同定义
§1.2生物信息学的研究内容及常用的核酸、蛋白质数据库介绍
生物信息学的而研究内容
常用的核酸数据库
常用的蛋白质数据库
第二章：序列比对与同源性分析建议学时：8 [教学目的与要求] 掌握核酸数据库、核酸以及蛋白质数据查找方法；掌握同源性与相似性的定义与异同点以及直系同源与旁系同源的异同；掌握核酸与蛋白质数据库序列同源性与
相似性分析方法。掌握系统进化树的构建。
[教学重点与难点] 掌握同源性分析方法，学会根据比对要求选用合适的比对方法与程序。
[授课方法] 课堂讲授结合上机操作。
[授课内容]
§2.1核酸与蛋白质数据库的序列查询
数据库常用功能介绍
数据库中核酸与蛋白质序列查找与筛选
§2.2 相似性与同源性分析
相似性与同源性概念
序列比对概念
序列比对常用程序
§2.3 多序列比对分析与系统进化树的构建
多序列比对分析工具及意义
系统进化树构建方法及意义
§2.4 计算机操作
第三章：真核生物基因结构的预测建议学时：2 [教学目的与要求] 复习基因结构、掌握ORF的识别方法；CpG岛、启动子以及转录终止信号序列的预测；密码子偏好性计算；基因预测分析以及ASTD数据库使用。
[教学重点与难点] 基因及其各部分结构的预测。
[授课方法] 课堂讲授结合上机操作。
[授课内容]
§3.1基因及其各部分结构介绍与预测
基因可读框的识别
CpG岛、转录终止信号和启动子区域的预测
基因密码子偏好性计算
Spidey预测基因
§3.2 ASTD数据库介绍
第四章：基因注释与功能分类建议学时：2 [教学目的与要求] 了解后基因组以及功能基因组与各种组学概念、研究内容及其研究方法；掌握基因注释方法、意义及常用注释数据库。
[教学重点与难点] DAVID工具对数据进行注释与分类。
[授课方法] 课堂讲授结合上机操作。
[授课内容]
§4.1 引言
后基因组及功能基因组学概念
后基因组及功能基因组学研究内容
基因注释的意义
§4.2 DAVID软件
基因芯片数据与各种组学研究介绍
基因芯片数据与各种组学数据分析
DAVID 对基因功能进行注释与分类
第五章：基因本体和KEGG代谢途径分析建议学时：2 [教学目的与要求] 掌握基因本体GO概念， GO数据库与KEGG数据库。掌握使用KEGG数据库实现对不同代谢途径的分析。
[教学重点与难点] GO数据库与KEGG代谢途径的分析。
[授课方法] 课堂讲授结合上机操作。
[授课内容]
§5.1基因本体GO
基因本体GO概念
GO的细胞组分、分子功能与生物学过程等三方面内容
举例阐述基因的GO分析
§5.2 KEGG代谢途径分析
KEGG数据库简介
KEGG代谢途径的不同检索方法
举例阐述KEGG代谢途径分析
第六章：非编码RNA 建议学时：8 [教学目的与要求] 系统复习并拓展RNA及其分类与功能。重点讲授前言非编码RNA等内容，包括其产生的生物学背景、定义、分类与特征，了解各种类型非编码RNA的预测与分析
方法与常用数据库。
[教学重点与难点] 非编码RNA分类，MiRNA、lncRNA与circRNA等前言知识
[授课方法] 课堂讲授结合上机操作
[授课内容]
§6.1 miRNA
RNA分类
miRNA生物学特点
miRNA的产生
miRNA作为疾病与治疗的分子标记物
miRNA数据库及其基因预测
§6.2LncRNA
LncRNA定义与特点
LncRNA的预测原则
LncRNA的发现
LncRNA的功能
LncRNA 数据库
LncRNA 与疾病
§6.3CircRNA
CircRNA定义与特点
CircRNA的生物发生
CircRNA介导的基因表达调控
CircRNA的特点
CircRNA的功能
CircRNA与疾病
§6.4miRNA、LncRNA与CircRNA的相互作用
一、常用相关数据库
二、miRNA、LncRNA与CircRNA之间的相互作用
三、举例阐述miRNA、LncRNA与CircRNA之间的关系
撰稿人：鲁艳芹审核人：崔亚洲
水文地质学-教学大纲
《水文地质学》课程教学大纲 【英文译名】：Hydrogeology 【适用专业】：地质工程 【学分数】：2 【总学时数】：32 【实践学数】：0 一、本课程教学目的和课程性质 《水文地质学》是地质工程专业的一门专业基础必修课。本课程重点讲授有关的基本概念、地下水赋存、地下水运动的规律、地下水的补给与排泄、地下水的物化性质、地下水资源、地下水的生态环境特性。介绍了地球上水的循环、包气带水的运动、化学成分成因类型、地下水的动态与均衡等。本课程的目的是通过本课程的教学使学生系统掌握水文地质的基本知识，学会分析区域水文地质条件的问题的基本方法，能阅读和分析常用的水文地质图件和资料，为学生从事该方面的工作打下基础。 二、本课程的基本要求 通过本课程所有教学环节，要求学生掌握水文地质的基本知识，熟悉水文地质工作的技术和方法，能阅读和分析常用的水文地质图件和资料。通过以上学习，学生应具有分析、研究、解决水文地质实际问题的基本能力。 三、本课程与其他课程的关系 本课程学习前必须学习《普通地质学》、《矿物学》、《岩石学》、《构造地质学》等课程。 后继课程有《土力学与基础工程》等课程。 四、课程内容 注：“*”为重点部分；“＃”为难点部分。 绪论 水文地质学概念；研究内容；地下水在国民经济中的作用；水文地质学的分支；水文地质学的发展简史及发展趋势。 第1章地下水概论 1.1 地球上的水及其循环 地球上水的分布；
*水循环的概念、水文循环、地质循环； *影响水循环的因素； 我国水文循环概况。 *1.2 地下水的赋存 岩石的空隙性：孔隙、裂隙、溶穴的概念、表征和特征； 岩石中水的存在形式：岩石骨架中的水、岩石孔隙中的水(重力水*、毛细水*)。 岩石的水理性质：容水性、持水性、给水性和透水性的概念、表征及相互间的关系； 有效应力原理与岩土压密：有效应力原理*、地下水位变动引起的岩土压密； 包气带与饱水带：概念； 含水层、隔水层与弱透水层：理解掌握概念； 地下水的分类：按埋藏条件分为：上层滞水、潜水、承压水；按介质条件分为：孔隙水、裂隙水、岩溶水。 *1.3 地下水的物理性质和化学成分 *地下水的物理性质：色、嗅、味、比重、透明度、温度等； *地下水的化学性质：PH值、硬度、矿化度、侵蚀性。 *地下水化学成份的形成作用：溶滤作用、浓缩作用、脱碳酸作用、脱硫酸作用、阳离子交换吸附作用、混合作用及人为作用。 地下水化学成分的基本类型：溶滤水、沉积水和内和生水。 *地下水化学成分的分析与资料整理：简分析、全分析和专门分析；库尔洛夫式、舒卡列夫分类表。 *1.4 不同埋藏条件下的地下水 上层滞水：概念及特征； *潜水：相关概念、特征(分布特征、补给与排泄特征、动态特征及水化学特征等)、等水位线图及其应用； *承压水：相关概念、特征(分布特征、补给与排泄特征、动态特征及水化学特征等)、等水压线图及其应用； 潜水与承压水的转化。 第2章地下水的运动和动态 *＃2.1 重力水的运动
生物信息学复习题及答案
生物信息学复习题 名词解释 1. Homology (同源):来源于共同祖先的序列相似的序列及同源序列。序列相似序列并不一定是同源序列。 （直系同源）：指由于物种形成的特殊事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，它们具有相似的功能。 （旁系（并系）同源）：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因复制产生的一组基因，这些基因在功能上的可能发生了改变。基因复制事件是促进新基因进化的重要推动力。 (异同源)：通过横向转移，来源于共生或病毒侵染而产生的相似的序列，为异同源。 Score：The sum of the number of identical matches and conservative (high scoring) substitutions in a sequence alignment divided by the total number of aligned sequence characters. Gap总是不计入总数中。 6.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。 7. E值：得分大于等于某个分值S的不同的比对的数目在随机的数据库搜索中发生的可能性。衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列。 值：得分为所要求的分值比对或更好的比对随机发生的概率。它是将观测得到的比对得分S，与同样长度和组成的随机序列作为查询序列进行数据库搜索进行比较得到的HSP（高分片段对）得分的期望分布联系起来计算的。通常使用低于来定义统计的显著性。P=1-e-E 9.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法,是序列相似性分析的基础，其不同的选择将会出现不同的分析结果。 10．空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。 ：美国国家生物技术信息学中心，属于美国国立医学图书馆的一部分，具有BLAST, Entrez ,GenBank等工具，还具有PubMed文献数据库。另外还具有Genome, dbEST, dbGSS , dbSTS, MMDB, OMIM, UniGene, Taxonomy, RefSeq, etc. 序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有大于号（>）开始的核苷酸或者氨基酸序列的新文件，其中大于号后可以跟上序列的相关信息，其他无特殊要求。 13genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释，主要包含生物功能或数据库信息；第三部分是feature，对序列的注释；第四部分是序列本身，以“统发生树（Phylogenetic tree ）是研究生物进化和系统发育过程中的一种用树状分支图来概括各种生物之间亲缘关系，是一种亲缘分支分类方法。在树中，每个节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离（如估计的演化时间）。是用来研究物种进化与多样性的基础，是相近物种相关生物学数据的来源。17.基因树与物种树：物种树反映一组物种进化历程的系统树，其中每一个内部节点就代表一个物种形成的过程，而基因树则是代表来源于不同物种的单个同源基因的差异构建的系统树，而其内部的一个节点则代表一个祖先基因分化为两个新的独特的基因序列的事件。基因
《煤矿地质学》测试试题
《煤矿地质学》试题
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中国矿业大学2014～2015学年第 1 学期 《煤矿地质学》试卷（A）卷 考试时间：100 分钟考试方式：闭卷 学院班级姓名学号 题号一二三四总分 得分 阅卷人 一、名词解释（共20分） 1．节理与解理 答：节理——断裂两侧的岩层或岩体沿破裂面断开，但没有发生明显的相对位移的断裂构造称节理构造。 解理——指结晶矿物在受外力打击后，沿一定的方向规则地裂开，形成光滑平面的性质。 2．层理构造与层面构造 答：层理构造—是沉积物在沉积过程中在层内形成的构造，主要由沉积物的成分、结构、颜色等在垂向上的变化而显示出来。是沉积岩最重要的沉积构造类型。 层面构造—不同性质沉积层的分隔界面称层面，常见的层面构造有波痕、 泥裂、印模和结核。 3．年代地层单位与地质年代单位 答：年代地层单位—是指在特定的地质时间间隔中形成的成层或非成层的岩石体：宇、界、系、统、阶、时带。每个年代地层单位都有一个对应的地质年代单位（地质时间间隔）：宙、代、纪、世、期、时。 4．煤的变质作用 答：褐煤在地下受到温度、压力、时间等因素影响转变为烟煤或无烟煤的地球化学作用。 5．内力地质作用与外力地质作用 答：由地球内部能量引起的地质作用称内力地质作用，包括构造运动、岩浆作用、变质作用和地震作用。 由地球外部能量引起的地质作用称外力地质作用，按外应力的类型可以分为河流的地质作用、地下水的地质作用、冰川的地质作用、湖泊和沼泽的地质作用、风的地质作用和海洋的地质作用，按其发生的序列可分为风化作用、剥蚀作用、搬运作用、沉积作用和成岩作用。
《地质学基础实习》教学大纲【模板】
《地质学基础实习》教学大纲 一、基本信息 二、教学目标及任务 通过野外实习，使同学们对地质学和地质工作及其与农业的相关性有更具体的认识，更好地理解和巩固课堂教学中学习的基本知识、基本理论、原理和地质观测与研究方法以及课堂上难以学到的实践知识和方法，使课堂上的理论教学与野外的实践教学有机结合，收到更好的教学效果。其目的、任务与意义大体可归结为以下几点： 1）通过地质博物馆的参观学习，有助于对课堂教学中所学知识的理解和掌握，能帮助同学们更全面而系统地了解地质学内容，扩大同学们的知识面，特别是矿物、岩石、矿产、地质演变等方面的知识，弥补校内教学中标本和器材不足的弱点。 2）实地观测并记录各种岩石及其所含矿物特征和野外产出状态，认识各种岩石中的代表岩石类型，特别是沉积岩中的各种代表岩石，如砂岩、砾岩、页岩、粉砂岩、石灰岩、白云岩等各种岩石在野外的产出状态和一般特征。使课堂所学理论知识在野外实践中得到验证，使理论知识有了实践基础。 3）观察地质构造现象及其与地形地貌的关系，认识基本地质构造现象，如断层、褶皱及其与地形地貌的关系，不仅使课堂所学知识得到巩固和实际验证，而且能有新的认识，开阔视野。 4）观察不同岩层间的接触关系，观察不同岩层在野外的出露情况，寻找典型地段观察并分析各种岩石演化为土壤的过程和机理。这都有助于对农地关系的理解和掌握。 三、教学内容、教学要求及时间安排 第一天： 1）观察晚古生代石灰岩、砂岩等沉积岩的特征；
2）观察石灰岩中燧石结核的特征及其产出规律； 3）观察石灰岩中珊瑚、菊石等化石的特点； 4）认识一般的地质构造（断层、节理、褶皱）； 5）介绍罗盘的结构和使用方法。 第二天： 1）学习使用罗盘测量地层产状； 2）认识砾岩、砂岩、泥岩； 3）在泥岩中寻找和观察植物化石； 4）学习观察河流二元结构。 第三天： 1）观察差异风化； 2）观察层内揉皱； 3）观察断层并判断其性质； 4）观察褶皱并分析其形成机制； 5）观察燕山期正长斑岩的特征及其产出状况； 6）观察下志留统高家边组泥岩、页岩中的笔石和灰岩中的腕足类动物化石。 第四天： 1）观察上白垩统浦口组角砾岩及其层理构造； 2）认识河流阶地和现代河流沉积物的层状构造特点； 3）观察石灰岩表面的溶蚀现象以及溶洞形态，并分析其成因； 4）观察石钟乳、石笋和石柱的生长状况； 5）观察三级溶洞—地壳三次抬升的证据； 6）观察直立岩层和倾斜岩层； 7）观察背斜核部的特点并学习绘制素描图； 第五天： 1）上白垩统赤山组红色粉砂岩和细砂岩； 2）观察火山构造； 3）观察玄武岩与下伏的沉积岩的接触关系； 4）观察气孔状和杏仁状构造的玄武岩； 5）观察玄武岩的球状风化； 6）辉绿岩岩墙； 第六天： 1）观察和描述晚古生代地层剖面：五通组石英砂岩、黄龙组灰岩、船山组生物碎屑灰岩； 2）观察褶皱构造和断裂构造； 3）观察洞穴形态； 4）观察洞穴堆积类型—石柱、石钟乳、石笋； 第七天 1）观察玄武岩及其中的橄榄石包裹体，仔细观察并描述玄武岩的柱状节理和气孔状构造； 2）观察玄武岩的基底岩石－第三纪中新统浦镇组砾石层、砂砾层；
生物信息学习题
一：名词解释 1.生物信息学 2.NCBI 3.PubMed 4.生物芯片 5.BLAST 6.UniProt 7.电子克隆 8.EMBL 二：填空题 1.基因芯片可以分为 2. 人类基因组全序列分析分两大步骤即制图和测序，并最终绘制出四张 图谱： 3. 分子系统发生分析主要分为三个步骤即 4. 国际上最主要的三大核酸序列数据库分别是 5. 蛋白质得分矩阵有 7. 文献是掌握科研进展的最直接方式，目前由NCBI维护的大型文献资源 是。 3. 用于核酸序列比对中常见的三种得分矩阵，分别为 4. 根据生物芯片探针分子类型的不同，可以将生物芯片哪三种， 5. 核酸序列分析所获得的信息主要有（举例说明四个） 6. 限制性酶切分析是分子生物学实验中的日常工作之一，这方面最好的
限制酶数据库是 三：选择题 1、如果试图确定一个新蛋白质序列属于哪一个蛋白质家族，或该序列 可能包含何种结构域或功能位点，应使用：（） A: PROSITE数据库 B: DDBJ数据库 C: PIR数据库 D: PDB数据库 2、构建序列进化树的一般步骤不包括：（） A：建立DNA文库 B：建立数据模型 C：建立取代模型 D：建立进化树3、BLAST教案所程序中，哪个方法是不存在的？（） A：BLASTP B：BLASTN C：BLASTX D:BLASTQ 4. 以下常见的几个物种，哪一个目前还没有完成全基因组测序：（）A: 茶树 B: 玉米 C: 水稻 D: 小鼠 5、向核酸序列数据库（GenBank/EMBL/DDBJ）提交数据，应该使用下面 哪个软件：（）。 A： Blast B：Sequin C：SRS D：Swiss-Model 6、在蛋白质序列数据库中比较查询手头未知的蛋白质序列，应使用Blast中哪个具体的算法：（）。 A：BLASTX B：tBLASTN C：BLASTP D：BLASTN 7、下列中属于一级蛋白质结构数据库的是：（） A：EMBL B：DDBJ C：PDB D：SWISS-PROT 8、下面不属于SWISS-PROT蛋白质数据库的注释范畴的是：（）A: 与其它蛋白质的相似性 B: 蛋白质的二级结构 C: 由于缺乏该蛋白质而引起的疾病 D: 核酸的功能描述 9、下列属于蛋白质二级结构预测的软件程序是（） A： BLASTX B：SOPMA C：DNAstar D：GO
《普通地质学》实验教学大纲
《普通地质学》实验教学大纲 一、实习目的和要求 1．实习目的 通过实验，使学生了解肉眼观察和描述手标本的一般方法，掌握几种常见矿物、岩石、古生物的鉴定特征，学会设计地层柱状图；培养学生进行地质科学实验的兴趣，掌握地质学实验的基本方法和基本技能，加深对地质学理论知识的理解，进而提高分析地质问题和解决问题的能力。 2．实习要求： 地质学是一门实践性很强的学科。《普通地质学》是地学类专业学生的第一门专业基础课，课堂实验尤为重要，它是掌握本学科理论和方法的重要环节。作为实践性启蒙教育，普通地质学实验对今后专业课程的学习和野外实习至关重要，因而必须加强训练，提高实验教学效果。 要求观察、描述和鉴别常见矿物、岩石、古生物标本，训练设计制作地层柱状图。二、实习内容 三、实习方式 在实验室观察、描述和鉴别常见矿物、岩石、古生物标本，训练阅读地质图，设计制作地层柱状图。 四、实习时间及安排 总共14学时，根据理论课程进展情况，安排进行各实习。 五、实习成绩考核 每次实验要求写实验报告，作为平时成绩，记入总成绩。
《地质学基础》（一）实验教学大纲（水文） 一、实验的性质、目的与任务 1、实验性质 《地质学基础Ⅰ》实验是一门专业基础课实验，要求学生通过本课程实验，了解通过手标本认识矿物、岩石、古生物化石的一般方法和步骤，学会常见矿物、岩石、古生物化石的的鉴别。 2、实验的目的 培养与提高学生科学实验的能力：自学能力、动手实践能力、思维判断能力、表达书写能力、观察与判别能力。 3、实验的任务 通过对实标本的观测，使学生进一步掌握矿物、岩石手标本肉眼鉴定的基本方法和基本技能，加深对《地质学基础Ⅰ》理论知识的理解。 二、实验内容与学时分配
最新生物信息学考试复习
——古A．名词解释 1. 生物信息学：广义是指从事对基因组研究相关的生物信息的获取，加工，储存，分配，分析和解释。狭义是指综合应用信息科学，数学理论，方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据的科学。 2. 基因芯片：将大量已知或未知序列的DNA片段点在固相载体上，通过物理吸附达到固定化（cDNA芯片），也可以在固相表面直接化学合成，得到寡聚核苷酸芯片。再将待研究的样品与芯片杂交，经过计算机扫描和数据处理，进行定性定量的分析。可以反映大量基因在不同组织或同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。 3. NCBI：National Center for Biotechnology Information.是隶属于美国国立医学图书馆（NLM）的综合性数据库，提供生物信息学方面的研究和服务。 4. EMBL：European Molecular Biology Laboratory.EBI为其一部分，是综合性数据库，提供生物信息学方面的研究和服务。 5. 简并引物：PCR引物的某一碱基位置有多种可能的多种引物的混合体。 6. 序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。
7. BLAST：Basic Local Alignment Search Tool.是通过比对(alignment)在数据库中寻找和查询序列(query)相似度很高的序列的工具。 8. ORF：Open Reading Frame.由起始密码子开始，到终止密码子结束可以翻译成蛋白质的核酸序列，一个未知的基因，理论上具有6个ORF。 9. 启动子：是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必须的一段DNA序列。原核生物启动子由上游调控元件和核心启动子组成，核心启动子包括-35区（Sextama box）TTGACA，-10区（Pribnow Box）TATAAT，以及+1区。真核生物启动子包括远上游序列和启动子基本元件构成，启动子基本元件包括启动子上游元件（GC岛，CAAT盒），核心启动子（TATA Box，+1区帽子位点）组成。 10. motif：模体，基序，是序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有的一小段序列模式。 11. 分子进化树：通过比较生物大分子序列的差异的数值重建的进化树。 12. 相似性：序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相似DNA碱基或氨基酸残基序列所占的比例。 13. 同源性：两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论。
煤地质学复习重点
煤地质学 植物残骸堆积的学说（或理论）及其依据 植物残骸的堆积方式两种观点 1）原地生成说原理：造煤植物残骸堆积于植物生存的泥炭沼泽内，没有经过搬运，在原地堆积转变成为泥炭。证据：现在很多煤层底板存在大量根土岩或煤层至上的直立树干。 2）异地生成说原理：泥炭层形成的地方不是成煤植物生长地方，残体经长距离搬运后，在浅水盆地、泻湖等地堆积。证据：现代三角洲地带存在上游漂木，煤中可见树根朝上以及大量矿物质。 3）微异地生成说（或称“亚原地生成说”）泥炭沼泽内部植物残体、部分泥炭受冲刷搬运并重新堆积的现象比较常见。 什么是泥炭化作用、腐泥化作用 1）泥炭化作用：植物物质经受生物化学分解及合成的复杂的过程且最终形成泥炭的作用 2）腐泥化作用：低等植物(藻类)和浮游生物遗体在滞流还原环境和厌氧微生物参与下，经过复杂的生物化学变化形成的富含水分的有机软泥(腐泥) 的过程称为腐泥化作用 什么是凝胶化作用、丝炭化作用、残值化作用 1）凝胶化作用：指植物的主要组成部分在泥炭化过程中经过生物化学变化和物理化学变化，形成以腐植酸和沥青质为主要成分的胶体物质（凝胶和溶胶）的过程。 2）丝炭化作用：高等植物死亡后在微生物参与下不断被分解、化合、聚积，发生生物地球化学作用形成泥炭的过程 3）残值化作用：中水介质流通较畅，长期有新鲜氧供给的条件下，凝胶化作用和丝炭化作用的产物被充分分解破坏并被流水带走，稳定组分大量集中的过程称为残植化作用 比较凝胶化作用、丝炭化作用与残值化作用发生的条件 1）凝胶化作用：①较为停滞的、不太深的覆水条件下，②弱氧化至还原环境，在厌氧细菌的参与. 2）丝炭化作用：①沼泽覆水程度发生变化;②沼泽表面变得比较干燥，氧的供应较为充分;③氧化过程中有机物在微生物参与下由于失去被氧化的原子团而脱氢、脱水，碳含量相对地增加 3）残植化作用：①水介质具有流动特性—敞流沼泽②长期有新鲜氧供应,发生氧化作用③稳定组分聚集 煤化作用的阶段划分与基本特点 1.泥炭化作用阶段：从成煤原始物质的堆积，经生物化学作用直到泥炭的形成 2.煤化作用阶段：当泥炭形成后，由于沉积盆地的沉降，泥炭被埋藏于深处，在温度、压力增高等物理、化学作用下，形成褐煤、烟煤、无烟煤、变无烟煤 特点：①煤在连续地系列演化过程中，可明显地显现出增碳化(相对)趋势；②随着煤化作用进程,煤的有机分子表现为结构单一化趋势；③随着煤化作用进程,煤的有机分子结构表现为致密化和定向排列的趋势；④随着煤化作用进程,煤显微组分性质呈现为均一性趋势；⑤煤化作用是一种不可逆的反应；⑥煤化作用的发展是非线性的，表现为煤化作用的跃变，简称煤化跃变 煤化作用的演化主要是受温度的高低、经历的时间长短及压力的大小所决定的。 什么是希尔特定律它的意义表现在哪些方面 1.希尔特定律：在地层大致水平的条件下，每百米煤的挥发分降低约％，即煤的变质程度随埋藏深度的加深而增高，
普通地质学教学大纲
中国海洋大学本科生课程大纲 课程属性：公共基础/通识教育/学科基础/专业知识/工作技能，课程性质：必修、选修 一、课程介绍 1.课程描述： 普通地质学是对地质学的基本知识、基本理论的概括介绍，是面向地质学及地质类相关专业学生开设的一门专业基础课程，也是于地质学专业课程学习之前开设的一门先导性课程，每学年授课64学时(含48学时讲课与18学时实验课程)。课程包括以下基本教学内容：宇宙中的地球、矿物、岩浆作用与岩浆岩、外动力地质作用与沉积岩、变质作用和变质岩、地质年代、地震与地球内部构造、构造运动与地质构造、海底扩张与板块构造、风化作用、河流及其地质作用、冰川及其地质作用、地下水及其地质作用、海洋地质作用、湖泊及沼泽的地质作用、风的地质作用、块体运动、地球环境与资源、地球系统科学概述等。通过本课程的学习，使学生掌握地质学的基本理论、基础知识和基本技能，初步形成地质思维与地球系统科学观，为进一步进行后续课程的学习打下基础。 2.设计思路： 本课程面向低年级地质类专业开设，学生通过普通地质学的学习，掌握地质学的基础知识、基本理论以及地质工作的一般方法。课程内容包括以下教学模块：地球基本知识、地表外动力地质作用、岩石圈内动力地质作用、地质环境与人类与实验教学等五大部分。 地球基本知识主要介绍最基本的地球科学知识，包括宇宙中的地球、矿物、地质年代等内容。 地表动力地质作用介绍各种地表动力作用和产物，和主要包括外动力地质作用与 - 4 -
沉积岩、河流地质作用、海洋地质作用、湖泊地质作用、风化作用、风的地质作用、冰川地质作用和地下水地质作用等。 岩石圈动力地质作用主要介绍各种内动力地质作用和产物，包括岩浆作用和岩浆岩、变质作用和变质岩、地震活动、构造运动与地质构造、海底扩张与板块构造等。 地质环境与人类主要介绍与地质相关的环境和对人类的影响，主要包括地球资源、地质环境、人类活动与可持续发展等内容。 实验教学主要介绍和培养学生的地质基本实践技能，主要包括晶体模型、矿物、岩浆岩、沉积岩、变质岩、罗盘使用和地形图、地质图填绘以及图切剖面等实验教学内容。 3. 课程与其他课程的关系： 普通地质学课程是海洋地球科学学院地质专业主干课程之一，全院每年平均有60余名学生学习该课程。作为地质类专业的基础课程，其是结晶矿物学、岩石学和构造地质学等地质专业课程的前导课程。 二、课程目标 培养学生对地质学的兴趣，对祖国河山与大自然的热爱，逐步引导学生进入地质园地，培养学生地质学思维方法、分析和推理能力以及地质学的时空观念，使学生初步掌握地质学的基础知识和基础理论，初步学习与掌握地质工作的一般方法，学会地质基本仪器设备的使用方法，掌握分析和研究地质问题的能力，为学习后续课程和从事专业地质工作打下基础。 三、学习要求 要完成所有的课程任务，学生必须： （1）按时上课,上课认真听讲，积极参与课堂讨论，并完成课后作业和实验报告。本课程将包含较多的课后作业和地质实践技能训练等课堂活动，课堂表现和出勤率是成绩考核的组成部分。 （2）按时完成常规练习作业和实验报告。这些作业要求学生按书面形式提交，只有按时提交作业，才能掌握课程所要求的内容。延期提交作业需要提前得到任课教师 - 4 -
2019版国科大生物信息学期末考试复习题
中科院生物信息学期末考试复习题 陈润生老师部分： 1.什么是生物信息学，如何理解其含义？为什么在大规模测序研究中，生物信息学至关重要？ 答：生物信息学有三个方面的含义： 1)生物信息学是一个学科领域，包含着基因组信息的获取、处理、存储、分配、分析和 解释的所有方面，是基因组研究不可分割的部分。 2)生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头，破译隐藏在DNA序列中的遗传语 言，特别是非编码区的实质；同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质空间结构模拟和预测；其本质是识别基因信号。 3)生物信息学的研究目标是揭示“基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律”。它 是当今自然科学和技术科学领域中“基因组、“信息结构”和“复杂性”这三个重大科学问题的有机结合。 2.如何利用数据库信息发现新基因，其算法本质是什么？ 答：利用数据库资源发现新基因，根据数据源不同，可分2种不同的查找方式： 1)从大规模基因组测序得到的数据出发，经过基因识别发现新基因： （利用统计，神经网络，分维，复杂度，密码学，HMM，多序列比对等方法识别特殊序列，预测新ORF。但因为基因组中编码区少，所以关键是“数据识别”问题。）利用大规模拼接好的基因组，使用不同数据方法，进行标识查找，并将找到的可能的新基因同数据库中已有的基因对比，从而确定是否为新基因。可分为：①基于信号，如剪切位点、序列中的启动子与终止子等。②基于组分，即基因家族、特殊序列间比较，Complexity analysis，Neural Network 2)利用EST数据库发现新基因和新SNPs： （归属于同一基因的EST片断一定有overlapping，通过alignment可组装成一完整的基因，但EST片断太小，不存在数据来源，主要是拼接问题） 数据来源于大量的序列小片段，EST较短，故关键在正确拼接。方法有基因组序列比对、拼接、组装法等。经常采用SiClone策略。其主要步骤有：构建数据库；将序列纯化格式标准化；从种子库中取序列和大库序列比对；延长种子序列，至不能再延长；放入contig库①构建若干数据库：总的纯化的EST数据库，种子数据库，载体数据库，杂质、引物数据库，蛋白数据库，cDNA数据库； ②用所用种子数据库和杂质、引物数据库及载体数据库比对，去除杂质； ③用种子和纯化的EST数据库比对 ④用经过一次比对得到的长的片段和蛋白数据库、cDNA数据库比较，判断是否为已有序列，再利用该大片段与纯化的EST数据库比对，重复以上步骤，直到序列不能再延伸； ⑤判断是否为全长cDNA序列。 （利用EST数据库：原理：当测序获得一条EST序列时，它来自哪一个基因的哪个区域是未知的（随机的），所以属于同一个基因的不同EST序列之间常有交叠的区域。根据这种“交叠”现象，就能找出属于同一个基因的所有EST序列，进而将它们拼接成和完整基因相对应的全长cDNA序列。而到目前为止，公共EST数据库(dbEST)中已经收集到约800万条的人的EST序列。估计这些序列已覆盖了人类全部基因的95%以上，平均起来每个基因有10倍以上的覆盖率。）
地质学基础大纲
《地质学基础》课程教学大纲 一、课程简介 【课程编号】： 【开课对象】：四年制本科：旅游管理 【学分】：3 【总学时】48 【先修课程】：无 二、教学目标 如今了解地球科学知识的必要性，已经更紧迫地显示出来了。人类创造了前所未有的生产力，为了满足日益增长的物质需求，就向地球作了更多的索取，然而人类如稍有处置不当，便会招致大自然严厉的惩罚。只有当地球上的居民都认识地球、了解地球，才能和它友善相处，和谐协调，从而有利于人类社会的持续发展。作为地质学专业的大学生，理应首先了解地球科学知识，带头向社会传播，并将其融入自己的专业工作中去，以造福于人类。我们希望通过本课程的学习，能为地质学专业的学生打下良好的基础，使学生初步了解地球科学的基本理论，获得必要的基础知识，掌握一些基本概念，建立地球科学的思维方法，学习一些实际的技能，增强探索自然的兴趣，对于提高学生的素养起到一定的作用，激励大家了解地球，关爱地球，珍惜自然资源，爱护我们的生存环境，以造福于子孙后代。 三、教学要求及内容提要 第一章绪论 （一）教学要求 重点了解地球科学的学习目的、意义和课程的学习要求。一般了解地球科学的研究对象、研究内容、研究方法和任务。 （二）重点、难点 重点：研究对象、研究内容、研究方法和任务 第二章宇宙中的地球 第一节宇宙中的地球 （一）教学要求
使学生概略地了解人类经过漫长的探索终于证实大地是一个球体，地球不是宇宙的中心，而只是太阳系中一颗不大的行星，太阳系是拥有2000多亿颗恒星的银河系中一个不大的天体系统，银河系是数以百亿计的星系中的一个旋涡星系，地球是现在已知的、惟一适合人类生存的星球等基本知识，通过练习作业初步掌握地球上主要地形特点及其名称。 （二）重点、难点 1、重点：宇宙的特征 2、难点：理解宇宙观 第二节行星地球简史 （一）教学要求 概略地了解：宇宙应是无限的（但在自然科学中，却作为一个有限的研究对象来对待），这个宇宙产生于约137亿前的大爆炸，是现今比较流行的看法，冷的气体与宇宙尘埃组成的星云逐渐形成太阳系，是目前比较合理的假说，地球是太阳系的一员，它们有共同的起源，是自然本身演变的产物。重点掌握：将今论古、地层层序律、化石层序律、器官相关律等原理是认识地球历史的基本方法，20世纪开始，利用同位素等方法来取得地球的年龄资料。 （二）重点、难点 1、重点：宇宙应是无限的 2、难点：地层层序律、化石层序律、器官相关律等原理 第三章地球的结构 第一节地球的物质组成 （一）教学要求 地球的元素组成，矿物是天然产出的元素或化合物，具有自己的物理、化学特征，矿物内部的晶体结构是决定其外部形态及特性的主导因素，由矿物集合而成的岩石构成地球的主体。一般了解元素在地球各圈层相互作用的过程中会不断迁移和重新组合。 （二）重点、难点
生物信息学复习题及答案(陶士珩)
生物信息学复习题 一、名词解释 生物信息学, 二级数据库, FASTA序列格式, genbank序列格式, Entrez，BLAST，查询序列（query），打分矩阵（scoring matrix），空位（gap），空位罚分，E值, 低复杂度区域，点矩阵（dot matrix），多序列比对，分子钟，系统发育（phylogeny），进化树的二歧分叉结构，直系同源，旁系同源，外类群，有根树，除权配对算法（UPGMA），邻接法构树，最大简约法构树，最大似然法构树，一致树（consensus tree），bootstrap，开放阅读框（ORF），密码子偏性（codon bias），基因预测的从头分析法，结构域（domain），超家族，模体（motif），序列表谱（profile），PAM矩阵，BLOSUM，PSI-BLAST，RefSeq，PDB数据库，GenPept，折叠子，TrEMBL，MMDB，SCOP，PROSITE，Gene Ontology Consortium，表谱（profile）。 二、问答题 1）生物信息学与计算生物学有什么区别与联系 2）试述生物信息学研究的基本方法。 3）试述生物学与生物信息学的相互关系。 4）美国国家生物技术信息中心（NCBI）的主要工作是什么请列举3个以上NCBI 维护的数据库。 ￥ 5）序列的相似性与同源性有什么区别与联系 6）BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么 7）简述BLAST搜索的算法。 8）什么是物种的标记序列 9）什么是多序列比对过程的三个步骤 10）简述构建进化树的步骤。 11）简述除权配对法（UPGMA）的算法思想。 12）简述邻接法（NJ）的算法思想。 13）简述最大简约法（MP）的算法思想。 14）简述最大似然法（ML）的算法思想。 ? 15）UPGMA构树法不精确的原因是什么 16）在MEGA2软件中，提供了多种碱基替换距离模型，试列举其中2种，解释其含义。 17）试述DNA序列分析的流程及代表性分析工具。 18）如何用BLAST发现新基因 19）试述SCOP蛋白质分类方案。 20）试述SWISS-PROT中的数据来源。 21）TrEMBL哪两个部分 22）试述PSI-BLAST 搜索的5个步骤。[ 3） 三、操作与计算题 1）如何获取访问号为U49845的genbank文件解释如下genbank文件的LOCUS行提供的信息： LOCUS SCU49845 5028 bp DNA linear PLN 21-JUN-1999
煤矿地质学各种习题附答案
煤矿地质学 习题集 一、填空题 1．太阳系的八大行星为（从太阳由近而远排列） 。 2．地温梯度是深度每增加时地温升高的度数，地温分带分为 ，和。 3．地震波在地球内传播有两处极为明显的分界面，在平均地深km为第一地震分界面，又称面；平均地深km为第二地震分界面，又称面，由此将地球的内圈层划分为，和。 4．内力地质作用可分为 外力地质作用包括。 5．矿物是。 岩浆岩的六种造岩矿物是。摩氏 硬度计的十种代表矿物（由小到大）为 。 6．矿物的特征包括，，， ，，，，等，矿物的鉴定特征指 7．按照矿物解理面的完善程度，将解理分为，， ，，莫氏硬度计由一到十级的矿物分别为
。 8．常见的造岩矿物有，，， ，，，， 。 9．岩浆是 。根据的含量可将其划分为、、 和等四种基本岩浆类型。 10．岩浆岩的八种造岩矿物是 。摩氏硬度计的十种代表矿物（由小到大）为 。 11．外力地质作用包括。沉积岩根据划分为 等类型 12．砾岩、砂岩、粉砂岩和泥岩是按照___________来划分的，具体的划分规范分别是____________________________________________。 13．内源沉积岩的种类有，， ，，， ，和。 14．岩石地层单位从小到大为，，和，年代地层单位由小到大为，，，，和。 15．岩石地层分类系统的组是最基本的单位，组指 。列举出三个含煤地层的组名 16．地层对比是指， 地层对比的依据有，， ，。 17．地层对比的方法有：，， 和。 18．地质年代被划分为五个代，它们分别是，， ，，。 19．古生代可划分为纪，由老到新分别为（包括代号） 。 20．中生代和新生代共有六个纪，他们由老到新分别是，，，，，。 21．岩层的产状要素包括，和，根据岩层的倾角，可以将岩层分为，，和。 22．地层厚度包括，，，， 按照厚度，煤层可以分为，，， 。 23．褶曲要素包括，，，和，影响褶曲发育的因素有，， 24．成煤的必要条件有，，和。 宏观煤岩成分包括，，，和。 25．宏观煤岩成分可分为，，和。煤岩类型有，，和 26．煤矿中常见的地质图件有 。
南京大学精品课程《普通地质学》教学大纲及教案
普通地质学 (General Geology, Physical Geology) 目录 课程计划 (3) 主要参考文献 (4) 第一章绪论 (5) 第一节地球科学的研究对象 (5) 第二节中国的地学优势 (6) 第三节当代地质学的特点与最新进展 (7) 第四节地球科学家的任务 (7) 第五节地球科学的内容与分科 (7) 地球科学的研究方法 (8) 第二章矿物 MINERAL (9) 第一节若干基本概念 (9) 第二节矿物的物理性质 (12) 第三节矿物的鉴定 (13) 第四节常见矿物 (14) 第三章岩浆作用与火成岩 (14) 引言 (14) 第一节喷出作用与喷出岩 (Extrusion and Eruption) (15) 第二节侵入作用与侵入岩 (18) 第三节火成岩的结构与构造 (19) 第四节火成岩的主要类型 (21) 第五节岩浆的形成与地球内热 (21) 第四章外动力作用与沉积岩 (22) 第一节大气圈、水圈、生物圈、岩石圈 (23) 第二节沉积岩的特性 (24) 第三节四类沉积岩 (26) 第五章变质作用与变质岩 (28) 第一节变质作用基本特征一 (28) 第二节变质作用中原岩的变化 (30) 第三节变质作用类型及其代表性岩石 (31) 第六章地质年代 (32) 第一节相对年代的确定 (34) 第二节同位素年龄的测定 (34) 第三节地质年代表 Geology Time Scale (35) 第七章地震(Earthquake)及地球内部构造 (36) 第一节地震学 Seismology基本概念 (37) 第二节地震波与地震仪 (38) 第三节地震的分布 (39) 第四节地震预报与预防 (40) 第五节地球的内部构造 (41)
生物信息学复习题及答案
一、名词解释： 1.生物信息学：研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以互联网为媒介，数据库为载体。利用数学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析，并以生物学知识对结果进行解释。 2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。 序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。 序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“询序列（query sequence）：也称被检索序列，用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。P98 8.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法。P29 9.空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。P29 10.空位罚分：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果。P37值：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义。P95 12.低复杂度区域：BLAST搜索的过滤选项。指序列中包含的重复度高的区域，如poly（A）。 13.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。 14.多序列比对：通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同，来回答大量的生物学问题。 15.分子钟：认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。 16.系统发育分析：通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状，可以研究推断不同物种或基因之间的进化关系。 17.进化树的二歧分叉结构：指在进化树上任何一个分支节点，一个父分支都只能被分成两个子分支。 系统发育图：用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图，是引入时间概念的支序图。 18.直系同源：指由于物种形成事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，具有相似或不同的功能。（书：在缺乏任何基因复制证据的情况下，具有共同祖先和相同功能的同源基因。） 19.旁系（并系）同源：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因重复产生的一组基因，这些基因在功能上可能发生了改变。(书：由于基因重复事件产生的相似序列。) 20.外类群：是进化树中处于一组被分析物种之外的，具有相近亲缘关系的物种。 21.有根树：能够确定所有分析物种的共同祖先的进化树。
《地质学基础》实验教学大纲.doc
《地质学基础》实验教学大纲 课程编号:121104 课程类型：必修课实验学时：18 大纲主撰写人：王景平编写日期：2005. 10 课程名称：地质学基础适应专业：地理科学实验学分： 大纲审核人：袁晓兰 一、课程性质、目的和任务 地质学基础是地理教存专业的一门重要基础课程。通过该课程的教学使学生了解岩石圈的基木特征和基木技能，为地貌、土壤、水文、区域自然地理、经济地理以及环境学等后行课程的开设，打下坚实的地质和实践基础。 二、教学基本要求 通过实验实习，使学生基本掌握矿物的物理性质和肉眼鉴定方法、掌握岩石的鉴定方法。能够识别常见矿物和岩石。 三、实验项目的设置与内容提要 序号实验项目名称 实验 时数 每组 人数 实验 类型 实验 要求 实验 类别 内容提要 1矿物的形态和物理性质210验证必修专业技 术基础观察矿物的形态、颜色、条痕、光泽、透明度、硬度、解理、断口等主要物理性质，通过观察矿物的形态和物理性质，学会鉴别矿物的形态和物理性质的一般方法,掌握系统描述矿物标本的一般方法，为下一步鉴 2矿物的观察和鉴定210验证必修专业技 术基础在实验一的基础上,通过认真观察常见矿物,学会肉眼鉴定矿物的一般方法，并对所观察的矿物进行系统描述，完成实习报告的有关部分；掌握主要矿物的鉴定特征，尤其是主要造岩矿物，为鉴定岩石打下基
础。 3火成岩的观察与鉴定410验证必修专业技 术基础通过认真观察常见的火成岩标本，学会肉眼鉴定火成岩的i般方法，并对所观察的火成岩进行系统描述，完成实习报告的有关部分;掌握主要火成岩的鉴定特征，能够准确鉴定主要火成岩。 4沉积岩的观察和鉴定410验证必修专业技 术基础通过认真观察常见的沉积岩标本，学会肉眼鉴定沉积岩的一般方法，并对所观察的沉积岩进行系统描述,完成实习报告的有关部分;掌握主要沉积岩的鉴定特征，能够准确鉴定主要沉积岩；能够根据沉积岩的结构、构造等特征初步分析其成因。 5变质岩的观察和鉴定210验证必修专业技 术基础通过认真观察常见的变质岩标本，学会肉眼鉴定变质岩的一般方法，并对所观察的变质岩进行系统描述,完成实习报告的有关部分;掌握主要变质岩的鉴定特征，能够准确鉴定主要变质岩。 6地质图的判读210验证必修专业技 术基础了解地质图的基木内容，掌握分析地质图的方法和步骤;掌握V字型法则，学会编制倾斜岩层的地质剖面图；认识各类接触关系在地质图