医学组学大数据平台在肿瘤精准医疗中的应用专题课件

项目名称基于肿瘤精准医疗理念的卵巢癌治疗新策略

项目名称：基于肿瘤精准医疗理念的卵巢癌治疗新策略 完成人：程文俊，姜旖，万一聪，周树林，张林，袁琳，罗成燕，徐祎，马小玲 完成单位：江苏省人民医院 项目简介： 卵巢癌的死亡率居妇科恶性肿瘤的首位，5年生存率约40%左右，严重威胁女性生命及健康。精准医疗衍生自个性化医疗，是指以个人基因组信息为基础，结合蛋白质组学、基因组学等信息，针对患者分子生物病理学特征，来为其制定个体化诊断和治疗策略，进行精准诊断，精准处理，以期大幅提高患者的生存率，降低治疗的副作用。因此，结合目前最新的研究成果，本课题组多年来围绕卵巢癌相关研究热点领域，在基础研究和临床治疗方面提出新的卵巢癌诊治管理的新模式，将能够对肿瘤进行更加科学的系统评估、治疗，降低患者的并发症，提高患者的生存率。 卵巢癌精准治疗关键技术：（1）在规范建立的“卵巢癌生物组织样本资源库”和“随访数据库”的基础上，首先从Gene Expression Omnibus数据库下载肿瘤样品和非肿瘤样品的表达谱，使用R软件筛选差异表达的基因（DEG），并采用cluster Profiler进行功能分析。用Cytoscape 软件，分子复合物检测插件和数据库STRING对DEG进行分析，以构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。然后利用“limma”软件包来筛选EOC和正常卵巢组织样品之间的差异表达基因（DEG），同时使用Cluster profiler进行功能和途径富集分析，利用搜索工具检索相互作用基因数据库来评估蛋白质间相互作用（PPI）信息和插件分子复合物检测，以筛选PPI网络中的核心模块。我们确定相关的DEG，通过强大的数据库分析得到与卵巢癌发生等相关的重要潜在基因和致病途径，有望为卵巢癌临床靶向治疗开辟新的方向。（2）建立CA125、HE4血清学联合筛查，并通过ROMA模型进行风险评估。对存在高度风险患者进行初次影像学评估或腹腔镜手术检查评估（PIV），判断肿瘤的分期。探讨BRCA基因突变状态与卵巢高级别浆液性癌患者的CT影像学指标之间的关系，并找出会影响BRCA突变型患者的肿瘤细胞减灭术的结局和生存率的CT指标，为术前评估手术风险，指导手术范围等提供影像学理论依据，建立基因-影像组学，最终为达到满意的肿瘤细胞减灭术奠定基础。（3）对于无法施行满意的卵巢癌肿瘤细胞减灭术，则需进行腹腔镜直视下组织活检或超声引导下肿瘤组织穿刺

癌症起因与病理生理学解析

癌症起因和病理生理学详解 癌症的起源 细胞分裂或细胞增殖是普遍发生在许多组织的一个生理过程。通常细胞增殖和细胞凋亡会达到平衡，而且受到严谨地调控以保证器官和组织的完整性。DNA的突变或是经遗传得到的缺陷基因导致这些有序的过程受到改变。随着细胞生长复制，如同滚雪球般持续累积新突变，最终不受管制而增殖的细胞通常会转变成良性肿瘤或恶性肿瘤。良性肿瘤不会扩散到身体其他部份，或是侵入别的组织，除非压迫到重要的器官，否则也不会影响生命。恶性肿瘤则会侵略其他器官，转移到身体其他部位而危害生命。 有些并非发生在人类的癌症可能能经由传染而引起，例如发生于狗的史狄可氏肉瘤）。有病患接受器官移植，由于移植器官中带有肿瘤，结果得到癌症。这是目前已知较类似经由传染而得的例子。 分子生物学 癌症是由一系列的基因突变造成的。每个突变对于细胞接下来的运作都可能会有所影响。 癌变意味着一连串由DNA受损而引发细胞分裂速率失控，导致癌症发生的过程。癌症是基因引起的疾病，当调控细胞生长的基因发生突变或损坏时，使得细胞失去控制，持续的生长及分裂而产生肿瘤。大部分人体内的细胞是不会持续分裂生长的，除非遭遇受损，例如肝细胞、心肌细胞。但是像是由上皮细胞组成的组织，包含肠黏膜、皮肤等，均需借由复制生长来持续更新以保持功能正常。而持续的更新这些上皮细胞构成的组织是有其必要性存在的，这样的作用可保护人体本身保持正常功能。因为上皮细胞所处的环境常接触到外界物质或机械力的损伤，如果不能够将受损细胞更新，必定会影响到其功能。但是具有持续生长能力的细胞，对癌症的产生就是最好的环境，对于要将其转变成癌细胞就会简单的多。这也是为何所有常见的癌症，多数源自于上皮细胞的原因。调控细胞生长主要有两大类基因，原致癌基因主要是一些参与促进细胞成长、进行有丝分裂的基因。肿瘤抑制基因，则是负责抑制细胞生长或是调控细胞分裂进行。一般而言，突变需要发生在调控细胞生长的重要基因上，才有机会使一个正常细胞转化成癌细胞。 原致癌基因透过不同途径促使细胞成长。有些原致癌基因可调控产生刺激细胞有丝分裂的激素，（又称作荷尔蒙，是一种在细胞间传递控制讯息的“化学信号”），受到激素刺激的细胞或组织的反应则受其细胞内的讯息传递路径决定。有的原致癌基因也负责组成细胞讯息传递系统或讯息受器，借由基因表现量的调控进而控制讯息传递系统对激素的敏感程度。此外分裂原的产生、转录与蛋白质合成都常见原致癌基因的参与。原致癌基因的突变可能影响基因表现或是功能，导致下游蛋白质的表现或活性改变。这样的情形发生时，原致癌基因就转变成为致癌基因，

肿瘤精准医疗探索

我国肿瘤精准治疗的现状和思考 精准医疗的概念来源于个体化医疗，Mirnezami等认为，精准医疗是通过基因组学、蛋白质组学等组学技术和医学前沿技术，对疾病进行精细分类及精确诊断，从而对疾病和特定患者进行个性化精准治疗的新型医学概念与医疗模式。 国较早提出如何构建精准医疗体系的夏锋和韦邦福认为，精准医疗模式以患者最大获益和社会医疗投入的高效配置为宗旨，结合现代流行病学、预防医学、临床诊断学、治疗学、分子医学、医学信息学技术、卫生经济学和医学社会学等，使传统的医疗模式走向整合化，为每个人提供量体裁衣般的疾病预防、筛查、诊断、治疗和康复计划，以最小资源投入获取最大健康保障，从而提高整体人群的健康水平。 2015年，国部分专家对精准医疗的定义达成共识：“精准医疗是集合现代科技手段与传统医学方法，科学认知人体机能和疾病本质，以最有效、最安全、最经济的医疗服务获取个体和社会健康效益最大化的新型医学畴[3]”。 综合以上观点我们认为，精准医疗是一种利用基因组学、蛋白组学等组学技术和医学前沿技术，力图从疾病的预防、检测、诊断、治疗及预后转归等层面，对疾病进行精细分类及精确诊断，进而针对患者个体特征制定并实施医疗

决策和处理方法，以期实现个体和社会健康效益最大化的新型医学概念与医疗模式。 我国之所以也要发展精准医疗，从广义上来说，这个政策最终会减少政府的医疗费用支出，使有限的资金发挥更大的作用，使得资金也能够被“精准”使用。而且，精准医疗所涉及的医疗技术均居当前最先进水平，我国应当紧跟世界科学技术的潮流。从狭义上来说，精准医疗从个人层面实现个体化医疗，对提高国民健康水平有重大意义。 一、在肿瘤方面的发展方向 肿瘤是严重威胁人类健康的疾病之一。据最新统计，全球每年肿瘤新发病例1 400万，死亡820万，全球患肿瘤病例超过2 500万[4]。近20年来，我国癌症发病率和死亡率一直呈上升趋势。2011年，我国新发癌症病例约337.2万，因癌症死亡约221.3万。全国每分钟就有6.4人被确诊为癌症，每天有9 216人成为癌症患者，每7～8人中就有1人死于癌症[5]。当前严峻的现状，促使医疗专家尽快突破传统模式，寻找新的肿瘤治疗方式。因此，精准医疗的理念提出后，肿瘤科学就成为精准医疗最重要的研究领域之一，精准肿瘤医疗的概念也应运而生。 在精准肿瘤医疗模式中，对肿瘤的精准诊断是精准治疗的重要保证。与以往通过特殊染色、光学或电子显微镜、免疫组化等方式对肿瘤进行分类、分型和分期不同的是，精准医疗时代下是利用各种基因测序方法对肿瘤进行诊断。在对肿瘤进行精准诊断的基础上，可以通过以下技术对肿瘤患者进行较好的治疗。

第十一章肿瘤的病理生理学

肿瘤 从正常细胞转化成癌细胞，再从单个或少量癌细胞发展成为具有临床意义的肿瘤，是一个漫长的过程。肿瘤的发生是环境因素与机体因素相互作用、多基因参与、经多阶段发展的结果。 第一节肿瘤发生发展概述 一、肿瘤发生的多阶段性学说 化学致癌过程是一个多阶段的过程，多阶段理论认为肿瘤的发生发展可分为启动（initiation）、促进（promotion）、进展（progression）和转移（metastasis）等阶段。 二、肿瘤的克隆源性和肿瘤异质性 克隆（clone）是指单个细胞经无性繁殖而形成具有相同基因型的细胞群体。多数研究表明人类肿瘤为单克隆起源，也存在肿瘤的多克隆起源。 肿瘤的异质性（heterogeneity）是指肿瘤发生发展过程中产生在形态、核型、免疫表型、生化产物、增殖能力、分化程度、侵袭和转移能力以及药物敏感性等方面具有各自细胞学特征的肿瘤细胞亚群。 第二节肿瘤病因学 肿瘤的病因包括环境因素（外因）和机体自身因素（内因）两大方面。环境致癌因素可分为化学致癌因素、物理致癌因素、以及生物致癌因素三大类，机体自身因素包括遗传、免疫、内分泌和代谢以及精神神经等因素。 一、化学致癌因素 化学致癌物（chemical carcinogen）引起肿瘤约占人类肿瘤病因的80％，是最主要的导致肿瘤发生的环境因素。 共同特点：①化学致癌物的致癌作用具有剂量和时间效应；②不同化学致癌物同时或先后作用于机体可出现累积、协同或拮抗等不同效应；③化学致癌物所造成的细胞遗传性损伤可通过细胞分裂遗传到子代细胞；④大多数化学致癌物本身并不直接致癌，在体内经过生物转化，所形成的衍生物具有致癌作用的，称为间接致癌物（indirect carcinogen）。 （一）化学致癌物的分类 1. 芳烷化剂（aralkylating agents）：其代表性的是多环芳烃类（polycyclic aromatic hydrocarbons，PAH)，多环芳烃类是迄今已知致癌物中数量最多、分布

肿瘤的精准医疗：概念、技术和展望

肿瘤的精准医疗：概念、技术和展望 杭渤1,2，束永前3，刘平3，魏光伟4，金健1，郝文山5，王培俊2，李斌1,2，毛建华1 摘要精准医疗是指与患者分子生物病理学特征相匹配的个体化诊断和治疗策略。肿瘤为一复杂和多样性疾病，在分子遗传上具有很大异质性，即使相同病理类型的癌症患者，对抗癌药物反应迥异，因此肿瘤学科成为精准医疗的最重要领域之一。组学大数据时代的来临和生物技术的迅速发展奠定了精准医疗的可行性。本文介绍精准和个体化医疗的概念、基础和意义，简述近年来在此领域的最新进展，以及对实施精准医疗的方法和技术进行分析和归纳，首次将其分为间接方法（生物标志物检测及诊断）和直接方法（病人源性细胞和组织在抗癌药物直接筛选的应用），最后扼要阐述精准医疗的前景和面临的挑战。 关键词：精准医疗个体化医疗分子组学生物标志物检测病人源性细胞和组织 Precision cancer medicine: Concept, technology and perspectives HANG Bo1,2, SHU Yongqian3, LIU Ping3, WEI Guangwei4, JIN Jian1, HAO Wenshan5, WANG Peijun2, LI Bin1,2, MAO Jianhua1 Abstract Precision medicine is defined as an approach to personalized diagnosis and treatment, based on the omics information of patients. Human cancer is a complex and intrinsically heterogeneous disease in which patients may exhibit similar symptoms, and appear to have the same pathological disease, for entirely different genetic reasons. Such heterogeneity results in dramatic variations in response to currently available anti- cancer drugs. Therefore, oncology is one of the best fields for the practice of precision medicine. The availability of omics- based big data, along with rapid development of biotechnology, paves a way for precision medicine. This article describes the concept, foundation and significance of precision medicine, and reviews the recent progresses in methodology development and their clinical application. Then, various current available biotechniques in precision medicine are evaluated and classified into indirect (biomarker-based detection and prediction) and direct (patient-derived cells and tissues for direct anti-cancer drug screening) categories. Finally, perspectives of precision medicine as well as its facing challenge are briefly discussed. Key words: precision medicine personalized medicine omics biomarker detection patient-derived cells and tissue 2011年，美国国家科学院在“迈向精准医疗：构建生物医学研究知识网络和新的疾病分类体系”报告中，对“精准医疗（precision medicine）”的概念和措施做了系统的论述[1]。报告探讨了一种新的疾病命名的可能性和方法，该方法基于导致疾病的潜在的分子诱因和其他因素，而不是依靠传统的病人症状和体征。报告建议通过评估患者标本中的组学（omics）信息，建立新的数据网络，以促进生物医学研究及其与临床研究相整合。美国总统奥巴马在2015年1月20日的国情咨文中正式将“精准医疗计划”作为美国新的国家研究项目发布，致力于治愈癌症和糖尿病等疾病，让每个人获得个性化的信息和医疗，从而“引领一个医学新时代”。此举措很快得到了美国政府研究机构和医学界的热烈响应[2, 3]，当然也包括来自医学界和社会的争议。 1 精准医疗与个体化医疗1.1 定义 什么是精准医疗（又称精确医学），其与通常所讲的个体化医疗（personalized medicine）又是什么关系？精准医疗就是与患者分子生物病理学特征，如基因组信息，相匹配的个体化诊断和治疗策略。个体化医疗利用诊断性工具去检测特定的生物标志物，尤其是遗传性标志物，然后结合患者的病史和其他情况，协助决定哪一种预防或治疗干预措施最适用于特定的患者。通俗地讲，个体化医疗就是考虑患者本身的个体差异，药物治疗因人而异，为理想化的治疗。而精准医疗着眼于一组病患或人群（图1），相对于个性化医疗针对个体病患的情况更为宽泛，更可行。两者有共同的内涵。也有医疗和研究机构将这两个概念放在一起，如杜克大学的“精准和个体化医疗中心”。 图1精准医疗的核心Fig. 1 Heart of precision medicine

精准医疗给了肿瘤患者一个生命奇迹

精准医疗：从此癌症不再是绝症，还肿瘤患者一个生命奇迹 “一些癌症晚期转移的患者，我没有办法治愈他们，但也许我可以将他们的生存周期从6－9个月延长到2－3年，也许这2－3年里面就有新的药物、新的方法被研发出来，能够拯救他们的生命了呢。” ——Dr. Nader Javadi（内德·贾瓦迪） 为所有肿瘤患者带来生存的希望，这就是“精准癌症医学” 先驱Dr Javadi的Hope Health Center中“希望”的意义。癌症 作为危害人类生命健康的头号杀手，其带来的致命威胁是不容 小觑的！据世界卫生组织(WHO)发表的《全球癌症报告2014》 显示，2012年全世界共新增癌症病例1400万例并有820万人死 亡，其中，中国新增307万癌症患者并造成约220万人死亡。世 界上每年有数百上千万人死于癌症，而当前全球癌症患者和死 亡病例还在令人不安地持续增加，更是使得抗癌之路愈显漫长 而崎岖。 在中国，平均每分钟有6人被确诊为癌症，而其中有6成是完全可以预防和避免的！那么在癌症患者逐年上升的情况下，我们该如何更早的知道自身是否存在患癌风险，如何在癌症早期就发现并将其扼杀在摇篮里?也许，癌症基因检测精准医疗可以帮到我们。 精准医疗：如何逆转生命，创造奇迹？ 2015年年初，美国总统奥巴马在国情咨文演讲中正式启动了精准医疗计划，该计划将在基因组层面加快对疾病的认识，并将最新最好的技术、知识和治疗方法提供给临床医生，使医生能够准确了解患者病因。如果说2014年是移动医疗的春天，那2015年便是精准医疗的春天。 虽然精准医疗这个概念早在2011年就已被美国国家研究委员提出过，但今年，在奥巴马的推动下，更是引发全球关注。精准医疗又称为个性化医疗，它是根据个体基因特征、环境以及生活习惯，为病人量身设计出最佳治疗方案，以期达到治疗效果最大化和副作用最小化的一种定制医疗模式。 如今，精准医疗主要着重于癌症的预防与治疗，以及癌症战争新策略的研究和制定上。作为全球医疗技术创新的驱动者，美国早已开始积极推行精准医疗，而且已经成绩斐然！除了为已故苹果公司CEO史蒂芬·乔布斯在胰腺癌确诊后多争取了长达8年的生存时间之外；好莱坞女星安吉丽娜·朱莉也是通过基因测序，在发现罹患乳腺癌风险偏高以后切除乳腺以预防该疾病发生；同时，精准治疗也帮助患有白血

《病理学与病理生理学》专业硕士研究生培养方案

《病理学与病理生理学》专业硕士研究生培养方案 一级学科中文名称：基础医学（1001） 一级学科英文名称：Basic Medicine 二级学科中文名称：病理学与病理生理学（100104） 二级学科英文名称：Pathology & Pathophysiology 一、学科、专业及研究方向简介 病理学和病理生理学是揭示疾病的病因、发病机制和转归的医学基础学科。病理学是运用自然科学的方法侧重从形态上观察和研究疾病，而病理生理学则注重机能和代谢方面改变的研究。本学科形成了三个稳定的研究方向：肿瘤分子病理、肿瘤治疗病理基础、肿瘤病理与病理生理。 肿瘤分子病理：运用分子生物学与病理学方法来研究恶性肿瘤与端粒酶的关系。通过对端粒酶逆转录酶mRNA在甲状腺癌、癌旁组织及甲状腺瘤组织中的表达的研究，为甲状腺肿瘤诊断标记物的筛选、靶向治疗提供依据。同时了解了端粒酶在恶性肿瘤中的表达情况及该酶在恶性肿瘤形成过程中的分子机制，对恶性肿瘤实施干预性基因治疗提供依据。 肿瘤治疗病理基础：研究主要包括抗癌药物磁性载体的研究开发（该载体具有迅速定向移动和集中在肿瘤部位、局部浓度高，疗效明显提高，而全身毒副作用降低，定位准确、简单易行。可以克服传统化疗药物的选择性表达低、毒性大等缺点）。筛选抗癌药物及生物反应调节剂来治疗肿瘤。 肿瘤病理与病理生理：通过研究肿瘤细胞的特殊生物学行为和信号转导，探讨肿瘤发生、发展的分子生物学机制。 二、培养目标 要求学生做到具有良好的道德品质和科研作风，有献身于科学的事业心、合作精神和创新精神，能积极为社会主义现代化建设事业服务；掌握病理学科坚实的基础理论和系统的专门知识，了解相关学科的进展；掌握与研究方向相关的实验理论及技术；具有较高的英语水平，能熟练地阅读本专业及相关学科的英文资料；具有独立从事科学研究工作或担负专门技术工作的能力。毕业就业，可到高等学校、科研院所、医疗机构等从事相关工作。

病理学与病理生理学硕士点简介

病理学与病理生理学学科简介 病理学与病理生理学硕士学位授权点2003年由国务院学位委员会批准成立，为学院重点学科。学科有一批治学严谨、爱岗敬业、学术造诣比较高，在省内享有一定声誉的专家、教授，其中2人分别为中华病理学会江苏分会副主任委员或委员，1人为徐州市病理学专业委员会主任委员。现学科有教师23人，其中教授 4人，副教授9人，讲师 6人，助教4人，18人具有硕士学位，3人具博士学位，2人博士在读。硕士生导师5人。在读研究生21人。 本学科有重要疾病病理学和肿瘤病理生理学两个研究方向，重要疾病病理学研究方向主要包括血管病变及其相关疾病和肿瘤病理学，利用所掌握的临床病理形态学诊断知识和标本来源丰富的优势，运用形态学、分子病理学、分子生物学和生物化学等多种研究手段开展临床病理学和实验病理学研究，从形态、功能与临床密切结合入手，进行血管病变及其相关疾病和肿瘤等重要疾病的发病机制、发生、发展及防治的基础和应用研究。肿瘤病理生理学研究方向主要从事肿瘤免疫、肿瘤发生学等方面的研究。近年来，本学科承担了省市级课题21项，获得省部级科技进步奖8项，专利1 项。在国内外学术期刊发表学术论文60余篇，其中国家级核心期刊12篇，SCI收录3篇。部分研究成果已通过省市成果鉴定，并多次获江苏省和徐州市科技进步奖。学科拥有常规病理技术实验室、分子病理实验室、组织化学与免疫组织化学实验室、细胞培养室、图像分析室和动物实验室等设备较为先进的实验室。 病理学与病理生理学硕士点集教学、科研和医疗为一体，病理学课程2次被评为江苏省二类优秀课程，病理学教研室承担着附属医院、徐州市区局级医院和周边地区医院临床病理诊断及病理会诊；医疗纠纷及不明原因死亡病人的尸检诊断任务等，平均每年完成外科病理检验1万余例，尸体剖验50余例，病理会诊600余例，是淮海经济区病理学教学、医疗和科研的中心。 为适应21世纪对人才培养的要求，硕士点全体人员决心不懈努力，开拓创新，把教学、科研和临床病理等工作不断推向新水平。

肿瘤精准医疗探索

我国肿瘤精准治疗得现状与思考 精准医疗得概念来源于个体化医疗，Mirnezami等认为，精准医疗就是通过基因组学、蛋白质组学等组学技术与医学前沿技术，对疾病进行精细分类及精确诊断，从而对疾病与特定患者进行个性化精准治疗得新型医学概念与医疗模式。 国内较早提出如何构建精准医疗体系得夏锋与韦邦福认为，精准医疗模式以患者最大获益与社会医疗投入得高效配置为宗旨，结合现代流行病学、预防医学、临床诊断学、治疗学、分子医学、医学信息学技术、卫生经济学与医学社会学等，使传统得医疗模式走向整合化，为每个人提供量体裁衣般得疾病预防、筛查、诊断、治疗与康复计划，以最小资源投入获取最大健康保障，从而提高整体人群得健康水平。 2015年，国内部分专家对精准医疗得定义达成共识：“精准医疗就是集合现代科技手段与传统医学方法，科学认知人体机能与疾病本质，以最有效、最安全、最经济得医疗服务获取个体与社会健康效益最大化得新型医学范畴[3]”。 综合以上观点我们认为，精准医疗就是一种利用基因组学、蛋白组学等组学技术与医学前沿技术，力图从疾病得预防、检测、诊断、治疗及预后转归等层面，对疾病进行精细分类及精确诊断，进而针对患者个体特征制定并实施医疗决策与处理方法，以期实现个体与社会健康效益最大化得新型医学概念与医疗模式。我国之所以也要发展精准医疗，从广义上来说，这个政策最终会减少政府得医疗费用支出，使有限得资金发挥更大得作用，使得资金也能够被“精准”使用。而

且，精准医疗所涉及得医疗技术均居当前最先进水平，我国应当紧跟世界科学技术得潮流。从狭义上来说，精准医疗从个人层面实现个体化医疗，对提高国民健康水平有重大意义。 一、在肿瘤方面得发展方向 肿瘤就是严重威胁人类健康得疾病之一。据最新统计，全球每年肿瘤新发病例1 400万，死亡820万，全球患肿瘤病例超过2 500万[4]。近20年来，我国癌症发病率与死亡率一直呈上升趋势。2011年，我国新发癌症病例约337、2万，因癌症死亡约221、3万。全国每分钟就有6、4人被确诊为癌症，每天有9 216人成为癌症患者，每7～8人中就有1人死于癌症[5]。当前严峻得现状，促使医疗专家尽快突破传统模式，寻找新得肿瘤治疗方式。因此，精准医疗得理念提出后，肿瘤科学就成为精准医疗最重要得研究领域之一，精准肿瘤医疗得概念也应运而生。 在精准肿瘤医疗模式中，对肿瘤得精准诊断就是精准治疗得重要保证。与以往通过特殊染色、光学或电子显微镜、免疫组化等方式对肿瘤进行分类、分型与分期不同得就是，精准医疗时代下就是利用各种基因测序方法对肿瘤进行诊断。在对肿瘤进行精准诊断得基础上，可以通过以下技术对肿瘤患者进行较好得治疗。1．预防性外科治疗方法： 对可导致乳腺癌与卵巢癌得Ⅰ与Ⅱ型乳腺癌易感基因、导致家系结肠腺瘤息肉病得腺瘤性息肉病基因、导致非息肉性结直肠癌（或Lynch综合征）得错配修复基因与导致多发性内分泌腺瘤得RET基因等，均可以基于精准医疗来改善手术

精准医疗面临的挑战及发展建议

一、中国精准医疗发展历程回顾 中国早在20世纪初就开始关注精准医学，2006年首先提出了精准外科的概念，得到了国内、国际的医学界认可后被引用到肿瘤放疗、妇科等医学领域。其目标是通过合理资源调配、全流程的成本调控，获得效益与耗费之比的最大化。精准医疗相比传统经验医学有了长足进步，可以通过将精密仪器、生命科学等先进的现代技术与我国优秀的传统经验整合在一起，大大减小临床实践的不确定性，从而在手术中实现“该切的片甲不留，该留的毫厘无损”，在保证精准的同时尽可能将损伤控制到最低。 图表精准医疗在我国的发展历程 资料来源：产研智库 二、中国精准医疗发展现状分析 造血干细胞移植、基因芯片诊断、免疫细胞治疗等第三类医疗技术临床应用准入审批2015年取消。在此之前，国家卫计委、科技部等多次出台政策，并组织生物医药等领域专家对精准医疗、基因测序等开展研究。在政策利好推动下，精准医疗有希望进入发展快轨。 多项政策支持 政府高层相当重视精准医学，批示国家卫计委和科技部组织专家论证，精准医学也迎来了多项政策支持。 2015年3月，第一批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床试点单位名单发布。同月，科技部召开国家首次精准医学战略专家会议，计划在2030年前，在精准医疗领域投入600亿元。其中，中央财政支付200亿元，企业和地方财政配套400亿元。

2015年4月15日，卫计委和科技部组织生物医药等领域专家，同中国科学院等部门共同研讨精准医学研究计划。 2015年5月10日，国务院发布《关于取消非行政许可审批事项的决定》，其中指出，取消第三类医疗技术临床应用准入审批，包括造血干细胞移植、基因芯片诊断、免疫细胞治疗等第三类医疗技术临床应用。 国家政策的支持将对基因测序、细胞治疗、干细胞等精准医疗相关领域构成利好。预计2015-2020年全球精准医疗市场规模增速达15%，是医药行业增速的3-4倍；2013年基因测序市场规模约45亿美元，2013年-2018年复合增长率为21.2%，而中国和印度市场2012-2017年复合增长率为20%-25%。 肿瘤检测市场先行 短期来看，个性化医疗相关技术和产品对相关公司的收入贡献有限，但随着市场的不断拓展，未来将对相关公司带来可观的增量。 目前国家卫计委允许怀12周以上的高危产妇利用基因测序技术进行无创产前筛查。以这一项检查为例，我国每年新生儿数量约1600万，按10%的市场渗透率，3500元/人次计算，市场空间约56亿元/年。随着技术的发展，成本继续下行将进一步打开市场空间。假设成本下行至1500元/人次，渗透率至50%，则市场空间有望上行至120亿元/年。 考虑到每年三四百万的癌症发病人数，基因测序的应用空间巨大。中国癌症发病率正“大幅”上升，2014年中国约有220万人死于癌症，但很多病例本是可预防的。对这类恶性疾病的治疗，一方面是加大治疗药物的研发突破，另一方面应从精准治疗角度进行治疗技术的突破。当前的肿瘤治疗正逐渐从宏观层面对“症”用药向更微观的对基因用药转变，实现“同病异治”或“异病同治”，精准治疗成为肿瘤治疗的一个趋势。 三、实现精准医疗面临的挑战 2015年，“精准医疗”随着奥巴马的宣言一跃成为年度热词。那么，精准医疗的实现目前还面临哪些关键环节的挑战呢？ 临床及生物信息整合 精准医学的基本思想应是将临床信息、患者表型与基因蛋白谱进行整合，从而为患者量身制定精准诊断、预后及治疗策略。基于大规模组学数据和临床医学信息的整合需求，临床信息和信息学是精准医学发展的重中之重。

2021年肿瘤精准医疗探索

我国肿瘤精准治疗的现状和思考 欧阳光明（2021.03.07） 482精准医疗的概念来源于个体化医疗，Mirnezami等认为，精准医疗是通过基因组学、蛋白质组学等组学技术和医学前沿技术，对疾病进行精细分类及精确诊断，从而对疾病和特定患者进行个性化精准治疗的新型医学概念与医疗模式。 国内较早提出如何构建精准医疗体系的夏锋和韦邦福认为，精准医疗模式以患者最大获益和社会医疗投入的高效配置为宗旨，结合现代流行病学、预防医学、临床诊断学、治疗学、分子医学、医学信息学技术、卫生经济学和医学社会学等，使传统的医疗模式走向整合化，为每个人提供量体裁衣般的疾病预防、筛查、诊断、治疗和康复计划，以最小资源投入获取最大健康保障，从而提高整体人群的健康水平。 2015年，国内部分专家对精准医疗的定义达成共识：“精准医疗是集合现代科技手段与传统医学方法，科学认知人体机能和疾病本质，以最有效、最安全、最经济的医疗服务获取个体和社会健康效益最大化的新型医学范畴[3]”。 综合以上观点我们认为，精准医疗是一种利用基因组学、蛋白组学等组学技术和医学前沿技术，力图从疾病的预防、检测、诊断、治

疗及预后转归等层面，对疾病进行精细分类及精确诊断，进而针对患者个体特征制定并实施医疗决策和处理方法，以期实现个体和社会健康效益最大化的新型医学概念与医疗模式。 我国之所以也要发展精准医疗，从广义上来说，这个政策最终会减少政府的医疗费用支出，使有限的资金发挥更大的作用，使得资金也能够被“精准”使用。而且，精准医疗所涉及的医疗技术均居当前最先进水平，我国应当紧跟世界科学技术的潮流。从狭义上来说，精准医疗从个人层面实现个体化医疗，对提高国民健康水平有重大意义。 一、在肿瘤方面的发展方向 肿瘤是严重威胁人类健康的疾病之一。据最新统计，全球每年肿瘤新发病例1 400万，死亡820万，全球患肿瘤病例超过2 500万[4]。近20年来，我国癌症发病率和死亡率一直呈上升趋势。2011年，我国新发癌症病例约337.2万，因癌症死亡约221.3万。全国每分钟就有6.4人被确诊为癌症，每天有9 216人成为癌症患者，每7～8人中就有1人死于癌症[5]。当前严峻的现状，促使医疗专家尽快突破传统模式，寻找新的肿瘤治疗方式。因此，精准医疗的理念提出后，肿瘤科学就成为精准医疗最重要的研究领域之一，精准肿瘤医疗的概念也应运而生。 在精准肿瘤医疗模式中，对肿瘤的精准诊断是精准治疗的重要保证。与以往通过特殊染色、光学或电子显微镜、免疫组化等方式对

病理生理学名词解释全.

病理生理学名词解释 1. 血液高凝状态：指在某些生理或病理条件下,血液凝固性增高,有利于血栓形成的一种状态。常见于妊娠后期、各种血液性疾病、肾病综合征以及恶性肿瘤等。 2. Die：是指各种原因引起凝血因子和血小板被激活，继发性纤溶亢进,并导致广 泛微血栓形成和出血为病理特征的获得性临床综合征。 3. 发热：是指在致热原作用下,体温调节中枢的调定点上移而引起的调节性体温 升高，当体温上升超过正常值05C时，称为发热。 4. 低钠血症：是指血清钠浓度低于130mmol/L。临床上按细胞外液量的变化不同 将低钠血症分为低容量性、高容量性和等容量性三类。 5. 高钠血症：是指血清钠浓度高于150mmol/L。临床上按细胞外液量的变化不同 将高钠血症分为低容量性、高容量性和等容量性三类。 6. 低渗性脱水：失钠多于失水，血清钠浓度＜135mmol/L,血浆渗透压＜ 280mmol/L, 并伴有细胞外液容量减少,称为低渗性脱水,又称为低容量性低钠血症。 7. 高渗性脱水：失水多于失钠，血清钠浓度＞145mmol/L,血浆渗透压＞ 310mmol/L, 并伴有细胞外液容量减少,称为高渗性脱水,又称为低容量性高钠血症。 8. 等渗性脱水：水和钠以等渗比例丢失,或失液后经机体调节血浆渗透压仍在正 常范围，血清钠浓度为135~145mmol/L,血浆渗透压为280~ 310 mmol/L。 9. 水中毒：当水的摄入过多,超过神经内分泌系统调节和肾脏的排水能力时,使大量水分在体内潴留,导致细胞内、外液容量扩大,并出现包括稀释性低钠血症在内的 一系列病理生理改变。 10. 水肿：过多的钠、水以与血浆相似的比例在组织间隙或体腔中积聚,称为水

《二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识》要点

《二代测寤技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识》要点 二代测序（NGS ）又称大规模平行测序，能同时对上百万甚至数十亿个DNA 分子进行测序，实现大规模、高通量测序的目标，时继Sanger测序之后的革命性进步。目前在临床肿瘤实践中,NGS主要用于驱动基因测序, 是肿瘤精准诊疗的重要环节。 NGS有明显的通量优势及发现未知基因变异的优势,但是在使用中也存在包括检测技术、数据管理、分析与报告、解读与临床咨询等方面的各种挑战。 在我国现阶段，肿瘤患者数目庞大,驱动基因诊断和检测应用需求巨大。 但在实际应用中会出现因为检测技术的准入门槛低、缺乏临床公认的NGS 指导规范，肿瘤诊疗中可能存在检测质量低下、结果准确性差，检测结果解读不专业，甚至盲目追求基因检测结果的现象。 本共识文中的"声明"是专家组讨论的各个要点，也即专家组形成的共识或推荐。 —、NGS在临床肿瘤诊断中的质量需求 声明1 :临床肿瘤诊断应用的NGS项目应符合相应的诊断技术标准.

声明2 : NGS检测项目的目的和临床益处应明确 二NGS在临床肿瘤应用的检测内容 声明3 : 如果NGS用于临床分子诊断，应明确至少哪些基因需纳入检测名单中 声明4: 可靶向作用基因的变异可能会影响临床决策,医师需要根据基因分型的检测结果来指导临床诊疗方案 声明5 : 应根据实际情况需对检测内容进行更新 声明6 : 应对每个基因变异点进行明确定义注释 声明7 : NGS项目的检测流程和生物信息学分析需针对特定平台和分析项目进行充分优化和标准化 三、NGS应用中的样本处理 声明8:为提高NGS检测肿瘤驱动基因的准确性，应提供高质量的临 床生物材料样本

肿瘤的精准医疗-概念、技术和展望

收稿日期：2015-05-08；修回日期：2015-06-08 作者信息：杭渤（通信作者），首席科学家，博士，研究方向为肿瘤生物学及其在环境毒理和临床诊断领域的应用，电子信箱：Bo_hang@https://www.360docs.net/doc/5c6740567.html, ；毛建华（通 信作者），首席科学家，博士，研究方向为肿瘤生物学及其在临床诊断和药物开发领域的应用，电子信箱：jhmao@https://www.360docs.net/doc/5c6740567.html, 引用格式：杭渤,束永前,刘平,等.肿瘤的精准医疗：概念、技术和展望[J].科技导报,2015,33(15):14-21. 肿瘤的精准医疗肿瘤的精准医疗：：概念概念、、技术和展望 杭渤1,2，束永前3，刘平3，魏光伟4，金健1，郝文山5，王培俊2，李斌1,2，毛建华1 1.美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室，伯克利，加州94720 2.南京卡迪奥密生物技术有限公司，南京211106 3.江苏省人民医院肿瘤科， 南京210029 4.山东大学医学院，济南250100 5.江苏省南京高新生物医药公共服务平台有限公司，南京210032 摘要精准医疗是指与患者分子生物病理学特征相匹配的个体化诊断和治疗策略。肿瘤为一复杂和多样性疾病，在分子遗传上具有很大异质性，即使相同病理类型的癌症患者，对抗癌药物反应迥异，因此肿瘤学科成为精准医疗的最重要领域之一。组学大数据时代的来临和生物技术的迅速发展奠定了精准医疗的可行性。本文介绍精准和个体化医疗的概念、基础和意义，简述近年来在此领域的最新进展，以及对实施精准医疗的方法和技术进行分析和归纳，首次将其分为间接方法（生物标志物检测及诊断）和直接方法（病人源性细胞和组织在抗癌药物直接筛选的应用），最后扼要阐述精准医疗的前景和面临的挑战。 关键词精准医疗；个体化医疗；分子组学；生物标志物检测；病人源性细胞和组织 中图分类号R730.5文献标志码A doi 10.3981/j.issn.1000-7857.2015.15.001 Precision cancer medicine:Concept,technology and perspectives Abstract Precision medicine is defined as an approach to personalized diagnosis and treatment,based on the omics information of patients.Human cancer is a complex and intrinsically heterogeneous disease in which patients may exhibit similar symptoms,and appear to have the same pathological disease,for entirely different genetic reasons.Such heterogeneity results in dramatic variations in response to currently available anti-cancer drugs.Therefore,oncology is one of the best fields for the practice of precision medicine.The availability of omics- based big data,along with rapid development of biotechnology, paves a way for precision medicine.This article describes the concept,foundation and significance of precision medicine,and reviews the recent progresses in methodology development and their clinical application.Then,various current available biotechniques in precision medicine are evaluated and classified into indirect (biomarker-based detection and prediction)and direct (patient-derived cells and tissues for direct anti-cancer drug screening)categories.Finally,perspectives of precision medicine as well as its facing challenge are briefly discussed.Keywords precision medicine;personalized medicine;omics;biomarker detection;patient-derived cells and tissue HANG Bo 1,2,SHU Yongqian 3 ,LIU Ping 3,WEI Guangwei 4,JIN Jian 1,HAO Wenshan 5,WANG Peijun 2, LI Bin 1,2,MAO Jianhua https://www.360docs.net/doc/5c6740567.html,wrence Berkeley National Laboratory,United States Department of Energy,Berkeley,CA 94720,USA 2.Nanjing Cardiomicx Inc,Ltd.,Nanjing 211106,China 3.Department of Oncology,Jiangsu Province Hospital,Nanjing 210029,China 4.Medical College,Shandong University,Jinan 250100,China 5.Nanjing Biopharmaceutical Innovation Platform Co.,Ltd.,Nanjing 210032,China

高职高专病理学与病理生理学教案——第五章肿瘤

黄冈职业技术学院医学部徐久元 内容提要： 笔者以张忠、王化修主编的病理学与病理生理学第八版教材为蓝本，结合40余年的病理学教学经验，编写了这本《病理学与病理生理学》教案。本教案主要供高职高专临床医学、口腔医学专业教学使用。本教案学时安排72学时，共十九章。本章为第五章肿瘤。本教案内容全面、新颖，参考了步宏、李一雷主编的病理学第九版教材及王建枝主编的病理生理学第九版教材。

第五章肿瘤

2. 炎症局部的临床表现和全身反应 （二）学习任务 1、肿瘤的概念和特性 2、肿瘤的异型性、肿瘤的命名及分类 3、肿瘤的生长与扩散 4、肿瘤对机体的影响、良恶性肿瘤的区别 5、癌前病变，非典型性增生及原位癌 6、常见肿瘤举例、肿瘤的病因和发病机理 （三）任务实施 任务一肿瘤的概念和特性 1、肿瘤的概念 肿瘤是机体在各种致瘤因素长期作用下，局部组织的细胞异常增所形成的新生物，这种新生物常表现为局部肿块。 2、肿瘤的特征 ?肿瘤的形态特征 （1）形状肿瘤的形状与肿瘤的发生部位、组织来源、生长方式和肿瘤的性质等有关。 （2）大小肿瘤的大小很不一致。小者肉眼不能察见，只有在显微镜下才能发现。 （3）颜色肿瘤一般呈灰白色，富于血液的肿瘤呈灰红色，脂肪瘤呈黄色，黑色素瘤可呈灰黑色。如肿瘤发生出血、坏死，可呈暗红色或灰黄色。（4）数目肿瘤多为单个。 （5）硬度肿瘤的硬度一般与肿瘤的成分、间质多少有关。 ?肿瘤的组织结构 肿瘤的组织结构任何肿瘤都是由实质和间质组成的。 任务二肿瘤的异型性、肿瘤的命名和分类 1、肿瘤的异型性肿瘤组织无论在细胞形态和组织结构上，都与其起源的正常

组织有不同程度的差异，这种差异称为异型性。 2、肿瘤的命名 （1）良性肿瘤的命名命名方法是：解剖部位+组织来源+瘤。 （2）恶性肿瘤的命名根据组织来源的不同，分为两大类： ①癌命名方法是：解剖部位+组织来源+癌。如胃腺癌、食管鳞状细胞癌、乳腺癌等。 ②肉瘤命名方法是：解剖部位+组织来源+肉瘤。如纤维肉瘤、脂肪肉瘤等。（3）特殊命名法 ①母细胞瘤 ②在肿瘤名称前冠以“恶性”二字。 ③以“瘤”字结尾的恶性肿瘤。 ④以“人名”或“病”命名的恶性肿瘤如白血病、霍奇金淋巴瘤等。 3、肿瘤的分类 任务三肿瘤的生长与扩散 1、肿瘤的生长分为生长速度和生长方式。 （1）肿瘤的生长速度 （2）肿瘤的生长方式主要有三种①膨胀性生长②浸润性生长③外生性生长2、肿瘤的扩散有直接蔓延和转移两种形式。 （1）直接蔓延 （2）转移转移的途径有三种：①淋巴道转移②血道转移③种植性转移 任务四肿瘤对机体的影响、良恶性肿瘤的区别 1、肿瘤对机体的影响 ?局部影响 （1）压迫和阻塞无论良性或恶性肿瘤，长到一定体积，均可压迫周围组织或器官，也可阻塞某些器官的腔道，引起相应的功能障碍。 （2）侵袭和破坏恶性肿瘤的侵袭可破坏正常的组织结构和功能，出现并发症。（3）出血和感染恶性肿瘤因瘤细胞的侵袭破坏作用或缺血性坏死而发生出