基于基因表达谱的癌症标志物验证方法研究及知识库开发

目录

摘要...............................................................................................I ABSTRACT.......................................................................................II

第1章绪论 (1)

1.1课题背景与研究意义 (1)

1.2课题研究现状及分析 (2)

1.2.1癌症标志物验证研究现状 (2)

1.2.2基于知识库的生物标志物研究现状 (5)

1.2.3研究现状分析总结 (7)

1.3本文主要研究内容 (7)

1.3.1课题来源 (7)

1.3.2本文研究内容 (8)

1.4本文的组织结构 (9)

第2章癌症标志物验证方法研究 (10)

2.1引言 (10)

2.2统计推断与生存分析基础 (10)

2.2.1统计推断与最小P值 (10)

2.2.2生存数据与生存曲线 (11)

2.3最小P值法与Log-Rank检验 (12)

2.3.1风险组划分的阈值 (12)

2.3.2最小P值的校正 (14)

2.4半参数Cox比例风险模型 (15)

2.5癌症标志物的验证实验 (16)

2.5.1基因表达谱数据集 (16)

2.5.2生存分析实验过程及结果分析 (17)

2.6本章小结 (21)

第3章癌症标志物知识库开发 (22)

3.1引言 (22)

-III-

3.2癌症标志物知识库表示及存储设计 (23)

3.2.1知识的内容 (23)

3.2.2知识的存储设计 (25)

3.3基于Web页面标注的信息提取模式 (28)

3.3.1Web页面组织结构分析及信息提取过程 (28)

3.3.2Web页面的信息抽取模式生成 (30)

3.4癌症标志物的半自动化信息抽取 (32)

3.4.1Web页面的实体属性标注及XPath路径提取 (32)

3.4.2基于爬虫的网页信息提取及结果 (34)

3.5本章小结 (34)

第4章癌症标志物验证及知识库系统 (36)

4.1引言 (36)

4.2系统设计与实现 (36)

4.2.1技术选型 (36)

4.2.2系统架构 (37)

4.3数据处理流程 (38)

4.3.1数据提交与选择 (38)

4.3.2生存分析验证 (39)

4.3.3知识可视化 (39)

4.4本章小结 (41)

结论 (42)

参考文献 (44)

攻读硕士学位期间发表的论文及其他成果 (48)

哈尔滨工业大学学位论文原创性声明和使用权限 (49)

致谢 (50)

个人简历 (51)

-IV-