制药工程毕业论文范文

毕业设计（论文）

题 目 基于VolSurf 参数的苯基哌嗪类化合物的QSAR 研究

基于VolSurf 参数的氨基喹啉衍生物的QSAR 研究

姓 名 夏 晶 晶

学 号 3120516011

专业班级 制药工程122班

指导教师 桂香

分 院 生物与化学工程分院

宁波理工学院

完成日期 2011年 5月27日

摘要

在多巴胺D3受体配体领域中，近10年取得了许多进展。大量的多巴胺D3受体配体被开发应用，包括多巴胺受体激动剂和拮抗剂。新型的多巴胺D3受体选择性拮抗剂可用作精神分裂症等精神病的治疗，而多巴胺D3受体激动剂或部分激动剂则可用于药物成瘾或帕金森综合症的辅助治疗。

本文首先对130个苯基哌嗪类化合物的结构进行搭建并优化，然后用VolSurf 软件计算结构参数，使用偏最小二乘分析方法建立QSAR模型，得到较好的结果（r2=0.73，q2=0.58）。参数分析表明：疏水基团和亲水基团均对苯基哌嗪类化合物的活性有影响，疏水基团对化合物活性的影响比亲水基团对化合物的影响要大；疏水性区域与亲水性区域与化合物分子的质量中心不平衡性越小，分子活性越高；小的分子极化率对活性有利；两亲矩越大，化合物的活性越高；同时，小的分子体积和表面积也对活性有利。

关键词：多巴胺D3受体；苯基哌嗪；VolSurf；定量构效关系（QSAR）；偏最小二乘分析（PLS）

I

Abstract

In the Dopamine D3 receptor ligands’ field, much progress has been made at the last 10 years. A large number of dopamine D3 receptor ligands have been developed and applied, including dopamine agonists and antagonists. The new dopamine D3 receptor antagonist is used for the treatment of schizophrenia and other mental illness. While the dopamine D3 receptor agonists or partial agonists can be used in drug addiction or Parkinson's disease in the adjuvant therapy.

In this article, the structures of 130 Phenylpiperazine compounds were built and its parameters were calculated by VolSurf software. Then the QSAR models were built by PLS analysis, and good results (r2=0.73，q2=0.58) were obtained. Parametric analysis showed that hydrophobic groups and hydrophilic groups both effected on the activity of Phenylpiperazine compounds. The hydrophobic group of compounds was more important than the hydrophilic group. The smaller the imbalance of the

hydrophobic and hydrophilic regional center and the mass of molecules was, the higher the molecular activity was. The smaller molecular polarizability was beneficial to the activity. The longer amphiphilic moment and the smaller molecular volume and surface area were the favorable factors to the activity.

Keywords:Dopamine D3 receptor; Phenylpiperazine; VolSurf; Quantitative Structure-Activity Relationships (QSAR); Partial Least

Squares (PLS)

目录

第一章文献综述 (1)

1.1研究容与方向 (1)

1.1.1研究背景与意义 (1)

1.1.2 多巴胺(DA)与多巴胺受体配体 (1)

1.1.3计算机辅助药物设

计 (3)

1.2 研究方法 (4)

1.2.1 分子模型设计和理论计算方法 (4)

1.2.2 分子动力学模拟退火 (5)

1.2.3 定量构效关系（QSAR） (5)

1.2.4 统计分析方法 (6)

1.3 VolSurf参数和计算 (7)

1.3.1 VolSurf软件 (7)

1.3.2V o l S u r f参数 (8)

1.4 本论文的基本思路和应解决的问题 (9)

第二章苯基哌嗪类化合物的QSAR研究 (11)

2.1实验数据 (11)

2.2 分子构建与优化 (16)

2.3 分子动力学模拟退火 (16)

2.4 VolSurf计算 (16)

2.4.1模型A的构建 (17)

2.4.2 模型A的分析 (17)

2.4.3模型B的构建 (19)

2.4.3模型B的分析 (19)

总结和展望 (25)

参考文献 (26)

致谢 (27)