基于迭代渐进多序列比对算法研究

张敏;方伟武;张俊华;迟忠先

【期刊名称】《计算机工程》

【年(卷),期】2005(031)017

【摘要】提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA.采用公共多序列比对数据库BAliBASE中142组蛋白质序列作为比对测试数据,并与ClustalW进行比较.比对结果的统计分析表明,IPMSA算法的比对准确率高于ClustalW.

【总页数】3页(32-33,61)

【关键词】迭代渐进多序列比对;渐进比对算法;迭代策略;准确率

【作者】张敏;方伟武;张俊华;迟忠先

【作者单位】大连理工大学计算机系,大连,116024;大连大学信息工程学院,大连,116622;中国科学院数学与系统科学研究院应用数学研究所,北京,100080;中国科学院数学与系统科学研究院应用数学研究所,北京,100080;大连理工大学计算机系,大连,116024

【正文语种】中文

【中图分类】TP301

【相关文献】

1.一种新的迭代渐进多序列比对算法 [J], 张敏; 方伟武; 张俊华; 迟忠先

2.多序列渐进式比对算法研究与比较 [J], 谷俊峰; 王希诚; 赵金城

3.基于遗传算法和模拟退火算法的DNA多序列比对算法研究 [J], 龚道雄; 阮晓钢

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