重要检疫性蛾类及乳白蚁DNA条形码检测技术研究与应用

重要检疫性蛾类及乳白蚁DNA条形码检测技术研究与应用
重要检疫性蛾类及乳白蚁DNA条形码检测技术研究与应用

重要检疫性蛾类及乳白蚁DNA条形码检测技术研究与应用

外来有害生物种类的准确鉴定是口岸植物检疫工作中的重要环节。口岸检疫工作中昆虫鉴定目前主要依赖于形态学分类方法,但传统的形态鉴定有些不足,

如鉴定结果受主观影响较大、昆虫的卵或幼虫等早期形态与残缺虫体难以鉴定等,严重影响了检疫工作的准确性和疫情检出率,增加了检疫性有害生物的传入风险。蛾类,隶属于鳞翅目,大部分种类在幼虫期可以危害林木、粮、棉、蔬菜、油料、药材等各种农林植物和储藏物,常造成巨大的经济损失,对我国农林生产构成了

极大的威胁。近年来,随着国际贸易的不断发展,进口货物上特别是水果、干果、苗木等携带的蛾类种类急剧增长,全国各检验检疫口岸截获了大量的蛾类幼虫、蛹和成虫。

对我国农业生产和森林生态环境的威胁正在不断加剧。乳白蚁Coptotermes spp.作为检疫性有害生物的一个重要类群,近十多年来在进口原木中的截获率呈现快速增加的趋势,我国口岸植物检疫部门历年从进口木材中截获乳白蚁种类记录占白蚁总数的1/3以上。然而,乳白蚁的分类鉴定的难题为世界分类专家所公认,由于形态趋同、生殖器退化,可做鉴定的形态特征很少,该属在分类上比较混乱,种类鉴定难度大,同物异名和同名异物现象比较普遍。DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类鉴定和分子系统学的研究热点,该技术的发展突破了传统形态学鉴定的局限,为有害生物的分子鉴定提供了新的方法,现已广泛应

用于物种鉴定、发现新种或隐存种和遗传进化等方面研究。

本研究尝试应用该技术鉴定检疫性蛾类和乳白蚁昆虫。主要研究结果如下:1.测定了美国白蛾及星白雪灯蛾Spilosoma menthastri、白雪灯蛾Spilosoma niveus、杨雪毒蛾Stilpnotia candida、红缘灯蛾Amsacta lactinea、八点灰灯蛾Creatonotus transiens、人纹污灯蛾Spilarctia subcarnea、净污灯蛾Spilarctia alba等近似种的线粒体细胞色素氧化酶I(COⅠ)基因片段,进行了DNA条形码比较分析,并构建系统发生树。结果显示:DNA条码都为各物种所独有,不存在物种之间的共享;属内种间差异明显大于种内差异,且同一物种的不同个

体均聚成高支持率的单系群,提示该条码在美国白蛾及其近似种中有很好的识别能力,可以用于美国白蛾的物种鉴定。DNA条码也为订正净雪灯蛾和净污灯蛾为

同物异名提供了分子证据。

2.采用鳞翅目通用的COⅠ引物扩增口岸截获的所有蛾类COⅠ基因片段,测

序所得的658bp片段通过与Genbank和BOLD数据库中已发布的DNA序列进行比对分析,可以有效区分苹果异形小卷蛾Cryptophlebia leucotreta、南非石竹卷蛾Epichoristodes acerbella、梨小食心虫Grapholita molesta、苹果蠹蛾Cydia pomonella、坚果异胫小卷蛾Thaumatotibia batrachopa、酸豆黑脉斑螟Mussidia pectinicornella和谷实夜蛾Helicoverpa zea等检疫性蛾类及其近缘种类。3.为了揭示欧洲型和亚洲型舞毒蛾Lymantria dispar之间的遗传差异,测定了中国、俄罗斯、蒙古、日本和美国不同地理来源的25个舞毒蛾样品的COⅠ基因序列。经DNASTAR软件分析,舞毒蛾COⅠ基因全长1531bp,美国种群和亚洲种群有14

个稳定的碱基位点差异,碱基之间只存在转换,没有颠换、插入或缺失的位点,其中13处单碱基差异翻译成的氨基酸序列没有差异,在406bp处的单碱基差异导致了该位点氨基酸的差异。利用COⅠ基因序列构建的UPGM系统发育树表明,欧洲

型(美国种群)和亚洲型明显分为两支,日本种群和亚洲其它种群亲缘关系较远,

独成一支。

根据406bp的单碱基差异,设计MGB探针,利用等位基因分型的方法,成功区分欧洲型与亚洲型的舞毒蛾样本。本研究为舞毒蛾的遗传分化研究提供了科学依据并提出了区分舞毒蛾不同地理种群的新方法。4.为了探讨DNA条形码检测技术在苹果园蛾类昆虫鉴定中的适用性,利用DNA条形码通用引物,扩增并分析了采

自陕西7个苹果园的蛾类昆虫的COⅠ基因片段,通过序列BLAST比对分析,结果

显示,采集的蛾类昆虫隶属于卷叶蛾科Tortricidae、蛀果蛾科Carposinoidea、螟蛾科Crambidae、列蛾科Oecophoridae和麦蛾科Gelechiidae的7个属共9种。遗传距离分析显示,种间最小遗传距离与种内最大遗传距离之间无重叠;同时,基于种间和种内遗传距离构建NJ树和ME树均显示,同种昆虫在系统树上都各自在同一进化支。

表明基于DNA条形码的鉴定方法可有效区分这些苹果园中不同的蛾类害虫。

5.通过对乳白蚁线粒体基因组中16S rRNA、COⅠ、COⅡ和ITS基因序列分析和

筛选,明确了COⅡ和ITS序列基因可作为乳白蚁分类鉴定的DNA条形码。选择CO Ⅱ和ITS序列片段设计特异性引物和探针,建立了乳白蚁、大家白蚁

C.curvignahus、南亚乳白蚁C.travians和非洲乳白蚁C.sj?stedti的实时荧光

PCR分子检测方法。建立的荧光PCR检测方法,具有快速、准确、特异性强、可靠性好等特点,适用于乳白蚁不同品级样本的检测,为检疫性乳白蚁的快速准确诊断提供了新方法,对我国口岸乳白蚁的进境检疫工作的开展意义重大。

综上所述,在前人研究的基础上,总结提炼了针对植物检疫性昆虫的DNA条形码试剂盒检测技术,建立了检疫性蛾类和乳白蚁DNA条形码检测技术体系,开发了多种不同类群的植物检疫性昆虫DNA条形码试剂盒,对于提高口岸疫情检出率并解决口岸“检不出,检不快,检不准”的技术难题具有重要意义。

儿童肥胖易感基因检测

核子基因科技 https://www.360docs.net/doc/ef3344999.html, 综合性?一站式?多元化基因检测服务 主要项目:?儿童天赋基因?肿瘤基因检测?产前基因检测?亲子鉴定 儿童肥胖易感基因检测 有的孩子在青春的时候有可能会因为涨势过猛,体重要比普通的孩子超出很多,家长们也会担心孩子过度肥胖,因此还没有在弄清楚的时候就开始给孩子减肥,结果就造成了孩子的正常发育突然停止。提醒各位家长一定要分清楚青春期孩子到底是正常发育还是长胖了。 肥胖的确切含意是身体内脂肪的过度沉积,只有多余的脂肪才和高血压、脂质异常症、糖尿病等疾病有关系,而且明显增加成年后发胖的可能性。所以,区别孩子“蹿个”和肥胖这两者的关系是很重要的。 那么,如何进行区分呢? 首先可以计算体质指数(BMI )。如前所说,体质指数=体重/身高2(单位是公斤/米2),这个指标准确地反映了皮下脂肪以及全身脂肪的含量。而且,体质指数和血压、血脂以及脂蛋白呈正相关,也就是说,体质指数越高,血压、血脂以及脂蛋白也就越高。另外,青春发育期的体质指数越高,成年后就越容易发胖,也就越容易患肥胖有关的疾病,如高血压、脂质异常症、糖尿病、冠心病等等,因而寿命也越短。 肥胖儿童的体质指数会异常升高,而正常青春发育的孩子拥有正常的体质指数,所以用体质指数来鉴别肥胖和正常青春发育是很可靠的。 另外,也可以直接测量儿童皮下脂肪的厚度。 方法是让儿童直立,从锁骨的中点向下画一条垂直线,再沿着肚脐画一条水平线,找到两条线的交汇处,用左手的拇指和食指放在皮肤上,两指间距3厘米,捏起皮肤,用精密卡尺测量皮摺的厚度。这样就可以直接反映皮下脂肪的多少。脂肪多的就是肥胖,脂肪不多的则是正常青春发育。请家长注意,可别给孩子错戴上“小胖墩”的帽子。 给孩子肥胖的孩子减肥肥胖基因检测是最好的帮助

试验检测能力验证和比对试验 自测

第1题 在某次比对试验中,某机构出现z=2,该机构检测能力结果判别为 A.满意值 B.可疑值 C.离群值 D.错误值 答案:A 您的答案:C 题目分数:3 此题得分:0.0 批注: 第2题 实验室间比对传递标准应稳定可靠,比对线路可选择以下几种 A.圆环式 B.花瓣式 C.星形式 答案:A,B,C 您的答案:A,B,C 题目分数:4 此题得分:4.0 批注: 第3题 离群值的剔除方法有()等 A.格拉布斯法则 B.拉依达法则 C.狄克逊法则 答案:A,B,C 您的答案:A,B 题目分数:3 此题得分:0.0 批注: 第4题 实验室比对的目的为以下几方面()等 A.评定实验室从事特定检测或测量的能力及监视实验室的持续能力 B.识别实验室存在的问题并启动改进措施 C.增强实验室客户的信心 D.评定实验室的等级 答案:A,B,C

您的答案:A,C,D 题目分数:3 此题得分:0.0 批注: 第5题 用于实验室比对的样品一般应具有以下特性 A.变异性 B.均匀性 C.稳定性 D.离散性 答案:B,C 您的答案:B,C 题目分数:3 此题得分:3.0 批注: 第6题 重复性测量条件是指 A.相同地点 B.相同程序 C.相同人 D.相同测量系统 答案:A,B,C,D 您的答案:A,B,C,D 题目分数:3 此题得分:3.0 批注: 第7题 均匀性检验在最终包装的样品中随机选择()份;稳定性检验随机选择()份 A.≥10 B.≥3 C.≥5 D.≥12 答案:A,B 您的答案:B,C 题目分数:3 此题得分:0.0 批注:

第8题 指定值的选择方法 A.配方法 B.有证参照值 C.参照值 D.公议值 答案:A,B,C,D 您的答案:A,B,C,D 题目分数:4 此题得分:4.0 批注: 第9题 能力评定标准差可由以下几种方法确定 A.由规定值确定 B.由经验预期值确定 C.由精密度试验结果确定 D.由一轮能力验证计划所得数据确定答案:A,B,C,D 您的答案:A,B,C,D 题目分数:4 此题得分:4.0 批注: 第10题 能力评定标准差可以由以下方法确定 A.由规定值确定 B.由经验预期值确定 C.由一般模型确定 D.由精密度试验结果确定 答案:A,B,C,D 您的答案:A,B,C,D 题目分数:4 此题得分:4.0 批注: 第11题 定性检测结果不能做实验室间比对 答案:错误 您的答案:错误 题目分数:3

ALDH2基因多态性检测

ALDH2基因多态性检测 项目简介:ALDH ( aldehyde dehydrogenase gene ) 人类乙醛脱氢酶,是一种四 联体蛋白,催化乙醛和其他脂肪族醛氧化。目前已发现ALDH 有19 种同工酶,主要有ALDH1~4 四种,其中ALDH2最为重要。在肝和胃中具有很高的表达量,是乙醇代谢途径中最重要的酶之一。ALDH2基因位于人类第12号染色体,由于ALDH2 基因存在G1510A 多态性,导致氨基酸序列第487位上的谷氨酸被赖氨酸所替换( Glu487 Lys),其中具有催化活性的野生型称为G等位基因(ALDH2*1),催化能力失活的变异型称为 A 等位基因(ALDH2*2)。在亚洲的黄种人群中, ALDH2*2是频率最高且最重要的突变型。 临床用药医生应考虑的因素: ALDH2基因突变致乙醛脱氢酶活性下降引起的临床表现: 1、ALDH2与硝酸甘油治疗:硝酸甘油是治疗心绞痛的经典药物,研究发现硝酸甘油的舒血管作用是通过释放一氧化氮(NO)所介导。但临床上部分病人舌下含服硝酸甘油不能迅速有效地缓解心绞痛,使心肌严重缺血加重。近来发现, ALDH2与硝酸甘油转化为NO密

切相关。有研究表明,ALDH2*1基因型的患者硝酸甘油治疗心绞痛的疗效明显优于ALDH2*2患者,且前者迅速起效率也明显高于后者。 2、ALDH2与酒精性疾病:乙醛脱氢酶( aldehyde dehydrogenase, ALDH)和乙醇脱氢酶( alcohol dehydrogenase, ADH) 在人体内共同组成了人乙醇脱氢酶系, 负责催化人体的乙醇分解代谢。ALDH2在肝和胃中具有很高的表达量,是乙醇代谢途径中最重要的酶之一。研究发现,突变型基因ALDH2*2的存在能导致ALDH2活力的严重缺失,并与过度饮酒导致的酒精依赖、酒精性中毒、酒精性肝病、消化道癌症等疾病之间存在深刻的联系。过度的饮酒行为,不仅使ALDH2*2 携带者对酒精产生依赖,还可能引起肝癌等的酒精性肝病(alcoholic liver disease,ALD)。ALD是长期、大量饮酒所引起的肝脏病变,已成为现代社会的主要健康隐忧之一。研究显示,携带ALDH2 变异基因型者大量饮酒将显著增加患肝癌的危险性。虽然摄入人体的乙醇有90 %以上是在肝脏内完成代谢过程的,但其在摄入过程中与消化道上皮细胞的直接接触也不容忽视。在饮酒人群中,尤其是重度饮酒者,由于其上消化道长期地与大量酒精直接接触,该区域出现癌变(食道癌、口咽癌等)的几率较高。研究发现,ALDH2*2突变与饮酒人群患消化道癌的风险之间具有明显的联系。此外,ALDH2*2显性突变与胃癌的易感性也存在一定的联系。由此可见,ALDH2*2突变是增加区域性癌化几率的重要因素之一。 ALDH2基因多态性检测标本采集及出报告时间:病人抽静脉血2ml(用 EDTA-K2抗凝)送检验科分子生物诊断室,4个工作日出报告。 电话:8801063 手机:余宗涛65327 高波 64444 ALDH2基因多态性检测临床意义: 1、指导临床硝酸甘油的个体化差异用药剂量:虽然硝酸甘油是心绞痛急性发作的常规首选药物,但该药的临床疗效常因人而异。中国汉族人群中,硝酸甘油含服无效的比例高达25%以上。复旦大学、瑞金医院、华山医院等的一项研究显示:部分国人服用硝酸甘油治疗心绞痛无效的原因为线粒体乙醛脱氢酶2(ALDH2)基因发生突变。ALDH2*2携带者服用硝酸甘油无效风险大幅增加;ALDH2*2携带者在中国约占30-50%,比重大;建议患者在使用硝酸甘油前进行ALDH2基因检测,ALDH2*2携带者建议慎用或不用硝酸甘油,改用其它药物。 2、ALDH2与酒精代谢:①ALDH2异常的饮酒者与正常人群相比,其发生肝癌的风险是正常人的3倍以上;②乙肝病毒携带者,如果又正好是ALDH2异常,其饮酒发生肝癌的危险性将升高52.17倍;③持续的过量饮酒导致肾的代谢压力过大,残留的酒精附着在肾细胞上,致使大量肾细胞处于休眠状态,会导致肾功能下降。 3、ALDH2与消化系统疾病:ALDH2异常的饮酒者与正常人群相比,其发生食道癌的风险是正常人的12.95倍,出现口腔癌的风险则为11.72倍。 4、ALDH2与心血管系统疾病:ALDH2异常的冠心病患者,发生心肌梗死的相对风险也为ALDH2正常的3.42倍。 5、ALDH2与内分泌系统疾病:ALDH2异常的人发生II型糖尿病的风险是正常人的6.08倍。

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则 1. 背景 中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题,鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性,为保证中药材临床应用安全、准确、有效,有必要增加中药材DNA条形码分子鉴定法。 2. 定义及原理 DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基以不同顺序排列组成,因此一定长度DNA序列能够区分不同物种。 中药材DNA条形码分子鉴定是以ITS2为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系,其中植物类中药材选用ITS2为主体序列,psbA-trnH为辅助序列,动物类中药材采用COI为主体序列,ITS2为辅助序列,符合中药材鉴定简单、精确的特点,有明确的判断标准,能够实现对中药材及其基原物种的准确鉴定。本指导原则用于规范中药材DNA条形码分子鉴定法,为其应用提供指导。 3. 适用范围 适用于中药材(包括药材、药材粉末及部分药材饮片)及基原物种的鉴定。4. 方法流程 中药材DNA条形码分子鉴定法主要包括供试品处理、DNA提取、PCR扩增、测序、序列拼接及结果判定,以下内容详细说明各流程中的主要原理及注意事项。1)供试品处理 除特殊标明外,药材使用75%乙醇擦洗表面后晾干,称取10-100 mg备用。具体见各药材项下。 2)DNA提取 DNA的提取包括破碎细胞壁、释放DNA,DNA的分离和纯化,DNA的浓缩、沉淀与洗涤等基本步骤,目前常用试剂盒法,包括植物基因组DNA提取试剂盒和动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒。 由于植物类中药材种类繁多,可根据所研究中药材的具体情况对提取方法加

如何用PCR法检测基因的多态性

如何用PCR法检测基因的多态性 多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA 位点多态性(site polymorphism)和长度多态性(longth polymorphism)。 基因多态性的主要检测方法简述如下: 1.限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP):由DNA 的多态性,致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变, 用限制酶切割基因组时, 钠 问 亢兔扛銎 蔚某ざ染筒煌 此 降南拗菩云 纬ざ榷嗵 裕 贾孪拗破 纬ざ确⑸ 谋涞拿盖形坏悖 殖莆 嗵 晕坏恪W钤缡怯肧outhern Blot/RFLP方法检测,后来采用聚合酶链反应(PCR)与限制酶酶切相结合的方法。现在多采用PCR-RFLP法进行研究基因的限制性片段长度多态性。 2.单链构象多态性(SSCP):是一种基于单链DNA构象差别的点突变检测方法。相同长度的单链DNA如果顺序不同,甚至单个碱基不同,就会形成不同的构象。在电泳时泳动的速度不同。将PCR产物经变性后,进行单链DNA凝胶电泳时,靶DNA中若发生单个碱基替换等改变时,就会出现泳动变位(mobility shift),多用于鉴定是否存在突变及诊断未知突变。 3.PCR-ASO探针法(PCR-allele specific oligonucleotide, ASO):即等位基因特异性寡核苷酸探针法。在PCR扩增DNA片段后,直接与相应的寡核苷酸探杂交,即可明确诊断是否有突变及突变是纯合子还是杂合子。其原理是:用PCR扩增后,产物进行斑点杂交或狭缝杂交,针对每种突变分别合成一对寡核苷酸片段作为探针,其中一个具有正常序列,另一个则具有突变碱基。突变碱基及对应的正常碱基匀位于寡核苷酸片段的中央,严格控制杂交及洗脱条件,使只有与探针序列完全互补的等位基因片段才显示杂交信号,而与探针中央碱基不同的等位基因片段不显示杂交信号,如果正常和突变探针都可杂交,说明突变基因是杂合子,如只有突变探针可以杂交,说明突变基因为纯合子,若不能与含有突变序列的寡核苷探针杂交,但能与相应的正常的寡核苷探针杂交,则表示受检者不存在这种突变基因。若与已知的突变基因的寡核苷探针匀不能杂交,提示可能为一种新的突变类型。 4. PCR-SSO法:SSO技术即是顺序特异寡核苷酸法(Sequence Specific Oligonucleotide, SSO)。原理是PCR基因片段扩增后利用序列特异性寡核苷酸探针,通过杂交的方法进行扩增片段的分析鉴定。探针与PCR产物在一定条件下杂交具有高度的特异性,严格遵循碱基互补的原则。探针可用放射性同位素

点胶重复性测试

CCD测试分析报告 项目名称:制动管接头尺寸CCD测试项目负责人:章燕华 昆山佰奥智能装备股份有限公司 2016年04月15日

昆山佰奥智能装备股份有限公司 目录 1. 前言 (2) 2. 尺寸测试要求 (2) 3. 测试环境 (2) 4. 测试结果及发现 (2) 5. 结论 (4)

一. 前言 本测试报告为磁碗内点胶直径检测的实验归总,旨在测出胶水的大小。 二.测试要求 本测试采用1组CCD影像系统。光源为点光源。 三.测试环境 CCD工站: 系统配置: 相机:BASLER; 镜头:VTF0.8-110CO; 光源:VS08-HW; 镜头与产品距离(WD):110mm; 光源与产品距离(LD):110mm; 四.测试结果及发现

原图 效果图 对图像进行处理后,测出胶水的长宽(因胶水为圆形或椭圆形,故采用测量椭圆的高和宽的测量工具来测量)。

其他照片也照此方法检测。 检测结果如下: 实验次序胶水最短直径胶水最长直径1301.28344.50 2293.57363.80 3291.01364.07 4302.39348.70 5298.56350.87 6283.71368.53 7300.84351.70 8301.53360.37 9290.83377.05 单位:像素将像素换算成毫米后得出: 实验次序胶水最短直径胶水最长直径 10.8280.947 20.807 1.000 30.800 1.001 40.8310.959 50.8210.964 60.780 1.013 70.8270.967 80.8290.991 90.800 1.036 单位:毫米 五.结论 此重复性测试因产品在任意角度下的打光效果都不一致,稍微转一下就会出现新的干扰,给检测带来了很大困难,故检测结果误差稍大。

DNA条形码

DNA条形码技术研究进展 摘要: DNA条形码(DNA barcoding)是近几年国际生物学研究的重点,即通过使用短标准核酸片段,对物种进行快速、准确的识别和鉴定。该技术在动物研究中采用线粒体COI基因中650bp片段,在植物中条形码主要在叶绿体基因组上进行选择,此外还有核基因ITS等。虽然DNA条形码研究还处于起步阶段,面临巨大的挑战,但是越来越多的研究表明DNA条形码可以广泛应用于生物的分类和鉴定,是一种简便、高效、准确的物种鉴定技术。本文简略的概述了DNA条形码的主要研究方法,开发应用以及面对的困难和争议,并展望该技术在生命科学领域的发展前景。 关键词:DNA条形码,物种鉴定,分类 引言 科学准确的鉴别区分物种是进一步开展深入研究的和利用的前提和基础。自瑞典植物学分类家Carolus Linnaeus建立双名法命名体系以来,虽然已经鉴定出大约一百七十万种生物,但是地球生物种类繁多,已鉴定分类的物种斤占生物总数约15%,人类仍然没有认识鉴定的物种占大多数,尤其是深海,原始丛林中的物种。 传统生物分类法主要依据形态学特征,比较解剖学等,在形态特征显著的脊椎动物,高等植物,昆虫等生物类群中应用效果较好,对形态差异较小的微小生物则差强人意,此外许多生物的形态容易受环境及生理时期影响,会导致分类产生误差。 自上世纪五十年代DNA双螺旋结构提出以来,人类对遗传物质的认识与日俱增,特别是PCR技术、测序技术和生物信息学技术的飞速发展,推动了利用DNA 蕴藏的信息对系统发育学的快速发展,并应用至生物分类学研究。 条形码技术是现代零售业发展的需求而产生的,在零售业的商品管理与销售中发挥了无法替代的关键作用。生物分类学家从中得到启示,DNA分子一级结构上的线性核苷酸序列可以建立类似的生物条形码,应用于快速鉴别生物。基于此,加拿大Guelph大学教授Hebert等(2003a)首次提出DNA条形码(DNA barcoding)

DNA条形码技术

D N A条形码技术 -标准化文件发布号:(9456-EUATWK-MWUB-WUNN-INNUL-DDQTY-KII

DNA条形码技术 一、DNA条形码 1、定义 DNA条形码(DNA barcode)是指生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。 2、特点 理想的DNA barcoding应当符合下列标准:(1)具有足够的变异性以区分不同的物种,同时具有相对的保守性;(2)必须是一段标准的DNA区来尽可能鉴别不同的分类群;(3)目标DNA区应当包含足够的系统进化信息以定位物种在分类系统(科、属等)中的位置;(4)应该是高度保守的引物设计区以便于通用引物的设计;(5)目标DNA区应该足够的短以便于有部分降解的DNA的扩增… 。 DNA barcoding作为生物“种水平species—level”鉴定的工具引人注目。Genbank数据库中CO I序列正在快速增加。Min等分析了CO I序列及其来源基因组核苷酸含量之间的关系,结果表明849个CO I基因的5 端的DNA barcoding 序列令人惊奇地准确地代表了其来源完整线粒体基因mtDNA的重要信息,也就是说对于未测序的基因组,从DNA barcoding能快速预知完整基因组的组成。 3、优点 (1)以DNA序列为检测对象,其在个体发育过程中不会改变。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的,即经过加工,形态发生变化,而DNA序列信息不会改变,较之传统的方法,扩大了检测样本范围;同时样本部分受损也不会影响识别结果。(2)可进行非专家物种鉴定。该技术是机械重复的,只要设计一套简单的实验方案,经过简单培训的技术员即可操作。 (3)准确性高。特定的物种具有特定的DNA序列信息,而形态学鉴别特征会因趋同和变异导致物种的鉴定误差。

基因检测,让孩子用药更安全

现阶段,最能让基因检测大显身手的领域是指导用药。专家指出,大部分药物,不管何种疾病,仅能对服用人群中的半数起效。这不仅造成大量的药物浪费,更严重的是,众多患者不得不忍受不必要的副作用。而通过基因检测可以得知个体对常用药物的反应,并优化治疗方案。做到因人而异,“量体用药”。 针对常用药及常见病 如今,基因检测指导用药安全也开始在我们周围出现,中国人民解放军总医院301医院、北京iNDA检测机构都能提供类似服务。不过,这种用药指导不管对象是儿童或成人,所针对的都是目前发病率较高的疾病和市场上的常用药。 “目前我们能做的基因检测的儿童用药范围包括解热镇痛药、肠胃不适药、抗感染用药、咳嗽,哮喘等呼吸道疾病用药、小儿肥胖、糖尿病等内分泌疾病和小儿癫痫、惊厥等神经性疾病这六类。这些都是比较成熟的西药,在药理学上研究也比较到位,药瓶上都标有有效化学成分,它们在报药监局批准时,都会递交相关的代谢酶的数据。”iNDA检测机构的创始人和总裁周慧君本身是分子生物和遗传学的博士,她解释说,基因检测本身是针对药物里对疾病有效的化学成分的代谢基因的测试,代谢酶起到重要作用。 基因检测能治“未病” 中国人民解放军总医院301医院耳鼻喉科主任医师戴朴说,目前中国有350万个体携带药物性耳聋敏感基因,其中有1/10的人发病。而这完全是可以通过基因检测预防的。据复旦大学遗传学教授、中国遗传学会副理事长余龙教授介绍,他们在筛查中获得的实例是,一位父母都携带隐性疾病基因的孩子,在幼儿时就被检查出来,在疾病发作之前的多年里,已经通过副作用较低的药物干扰让这种疾病被堵住了,至今没有发病。“这意味着我们可以在病人发病之前就治未病。” ■ 对照看 医院基因检测 采样静脉血,半月内获知结果 一对年轻父母带着孩子来中国人民解放军总医院301医院耳鼻喉科门诊楼挂号,在获得医生开具的耳聋基因诊断申请单后,缴纳耳聋基因诊断费用,家长持申请单在耳鼻喉科门诊治疗室抽取手臂静脉血3—5ml,而婴孩则被送到门诊楼旁边的一个楼去抽血,后将静脉血连同听力及影像检测结果一并送到耳研所四楼聋病分子诊断中心,在聋病分子诊断中心,接受医生的进一步详细问诊,提交听力学及影像学资料进行扫描存档。 如果在当时没有完成听力及影像检查,应在其检查完成后将结果资料送达中心存档。在中心交换长期联系方式。 一般情况下,耳聋基因诊断结果会在10个工作日完成(大多数要半个月)。在结果出来后,会按事先留下的通信地址将报告寄给本人。 家用基因检测 采样唾液,足不出户几天可得结果 在提供家用基因检测服务的iNDA机构中,基因检测步骤异常简单: 1、在该机构网站上购买基因检测服务,就会收到一份宅急送快递,里面是一套无菌棉签和塑料试管,将密封袋打开,拧开试管,取出无菌棉签,用无菌棉签轻擦口腔内壁,让唾液浸湿棉签,再将收集好唾液的棉签放回试管,装回密封袋,交给宅急送寄回iNDA,几天后,就可以在iNDA 网站上查询自己的DNA测试结果了。

CYP2C19基因多态性检测

CYP2C19基因多态性检测 项目简介:CYP2C19是CYP450酶第二亚家族中的重要成员,是人体重要的药物代谢 酶,在肝脏中有很多表达。CYP2C19基因座位于染色体区10q24.2上,由9个外显子构成。CYP2C19具有很多SNP位点,最常见的是CYP2C19*2和CYP2C19*3。CYP2C19*2会导致转录蛋白的剪切突变失活,而CYP2C19*3能构成一个终止子,破坏转录蛋白的活性。据统计,CYP2C19*2和CYP2C19*3两个突变位点能解释几乎100%的东亚人和85%的高加索人种的相关弱代谢遗传缺陷,而其他两种等位基因CYP2C19*4和CYP2C19*5主要在高加索人种中分布。大量证据证实,不同人种在CYP2C19的底物的代谢能力有很大差异;2–5%高加索人是弱代谢者,而13–23%的亚洲人是弱代谢者。这是由于在亚洲人口中CYP2C19*2和CYP2C19*3等位基因的高频率造成的。通过CYP2C19基因检测,判断患者对相关药物的代谢能力,可以指导临床用方案的制定,实现个体化用药治疗。 临床上常用的经由CYP2C19酶代谢的药物: 1、治疗胃酸相关性疾病:如质子泵抑制剂:奥美拉唑(omeprazole)、兰索拉唑(lansoprazole)、泮托拉唑(pantoprazole)、 雷贝拉唑(rabeprazole)、埃索美拉唑 (Esomeprazole)。 2、治疗心血管疾病:Clopidogrel、氯吡格雷、抗凝血药物。 3、抗真菌药物:Voriconazole、伏立康唑、广谱抗真菌药物。 4、神经类药物:①S-美芬妥英mephenytoin为乙内酰脲类抗癫痫药,在体内的羟化代谢主要由单基因CYP2C19编码表达的CYP2C19酶蛋白介导,由羟化酶CYP2C19氧化生成4’-羟基美芬妥英;②地西泮diazepam,一种长效的镇静、安眠药;③丙米嗪imipramine ,抗抑郁药,N-去甲基化和2-羟化;④苯巴比妥phenobarbital,传统的抗癫痫药;⑤抗心律失常药,抗抑郁药,抗精神病药,β受体阻断剂,抗高血压药和止痛剂。 5、抗肿瘤药:环磷酰胺。 6、抗结核药:利福平。 7、孕激素:黄体酮。 8、抗疟疾药:氯胍。 9、HIV蛋白酶抑制剂。 10、抗移植排斥药物:他克莫司、兰索拉唑。 CYP2C19基因多态性检测标本采集及出报告时间:病人抽静脉血2ml(用 EDTA-K2抗凝)送检验科分子生物诊断室,4个工作日出报告。 电话:8801063 手机:余宗涛65327 高波 64444 CYP2C19基因多态性检测临床意义: 1、基因剂量效应。 2、CYP2C19基因多态性,导致了个体间酶活性的多样性。等位基因的突变使酶活性降低,对药物代谢的能力随着等位基因的不同组合而呈现出一定的规律性,表现出正常基因纯合子>正常基因与突变基因杂合子> 突变基因纯合子或杂合子的变化趋势。 3、对于不同代谢能力的个体,运用不同的药物剂量等策略是非常必要的,可达到更好的治疗效果。 4、根据CYP2C19基因型给予个性化的药物和剂量可以降低副作用发生率-安全性;提高治

中药材dna条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(版)中的应用复习课程

中药材D N A条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(2015年版)中的应用

《中药制剂分析》 课程论文 中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(2015年版)中的应用 药学(药物分析方向)2012级 指导教师:高晓霞 2015 年 11月

摘要:中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题,鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性,为保证中药材临床应用安全、准确、有效,有必要增加中药材DNA条形码分子鉴定法。如今分子生物学技术在中药材鉴定领域的应用已逐步深入。《中国药典》2010年版收载了乌梢蛇饮片、蕲蛇饮片、川贝母药材的DNA分子鉴定方法,而《中国药典》2015年版收载了“中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则”,DNA条形码分子鉴定法是利用公认的相对较短的DNA序列来进行物种假定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。这标志着中药材的分子鉴定由实验室科研层面进入国家标准的应用层面。 关键词:中药材;DNA;鉴定;指导原则 一、中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[1] 1.1定义及原理 该鉴定方法主要适用于中药材(包括药材、药材粉末及部分药材饮片)及基原物种的鉴定。DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术,是传统形态鉴别方法的有效补充。由于DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)4种碱基以不同顺序排列组成,因此一定长度DNA序列能够区分不同物种。 中药材DNA条形码分子鉴定指导原则通过对大样本量中药材进行DNA条形码分子鉴定研究,建立以ITS2为核心,psbA-trnH为辅的植物类药材DNA条形码鉴定体系和以COI为主、ITS2为辅的动物类药材DNA条形码鉴定体系。 1.2方法与步骤

基因多态性分析

人基因多态性分析 一、实验目的 1. 了解基因多态性在阐明人体对疾病、毒物的易感性与耐受性、疾病临床表现的多样性以及对药物治疗的反应性中的重要作用。 2. 了解分析基因多态性的基本原理和研究方法。 二、实验原理 基因多态性(gene polymorphism)是指在一个生物群体中,同时存在两种及以上的变异型或基因型或等位基因,也称为遗传多态性(genetic polymorphism)。人类基因多态性对于阐明人体对疾病的易感性、毒物的耐受性、药物代谢差异及遗传性疾病的分子机制有重大意义;与致病基因连锁的多态性位点可作为遗传病的诊断标记,并为分离克隆致病基因提供依据;病因未知的疾病与候选基因多态性的相关性分析,可用于辅助筛选致病易感基因。 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction—Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分析是一种常用的DNA分子标记。原理是通过PCR扩增获得目的基因。若目的基因存在等位变异(多态性),且变异正好发生在某种限制性内切酶识别位点上,使酶切位点增加或者消失,则酶切结果就会产生大小不同的片段,即片段长度多态性,再利用琼脂糖凝胶电泳分离,可呈现出多态性电泳图谱。若将患者与正常的多态性图谱比较,可确定是否变异。应用PCR-RFLP,可检测某一致病基因已知的点突变,进行直接基因诊断,也可以此为遗传标记进行连锁分析进行间接基因诊断。 三、器材与试剂 1. 器材 ⑴离心机。 ⑵DNA扩增仪。 ⑶电泳仪。 ⑷水平电泳槽。 ⑸紫外检测仪。 ⑹移液器。 2. 试剂

批内重复性试验

(二)方法学评价实验:批内重复性试验 摘要 目的:掌握重复性试验的原理、方法和操作,并熟悉和掌握分光光度计的使用方法,并测定、计算双缩脲法的SD和CV。 方法:重复性方法。标准管法测物质含量的方法。 结果:学会了重复性试验的操作,标准蛋白管的均值是0.070,测定的双缩脲法的SD的值是1.74,CV的值是4.43。 结论:能够按照正确的方法操作重复性实验,并测定出双缩脲法血清总蛋白量的SD和CV。 英文翻译 Abstract Master the principle , operation, and calculation of within batch repeatability,and Familiar with and master the use of the Spectrophotometer,Determine and calculate the standard deviation(SD) and coefficient of variation (CV) of biuret method Methods Repetitive method,Standard tube method to measure the material content. Result Learn the knowledge of the test of within batch repeatability, and calculate the standard deviation(SD) is,1.74,and coefficient of variation (CV) is 4.43. Conclusion We can use the correct way to ma ster the repeatability of test operation,and we determined and calculate the standard deviation(SD) and coefficient of variation (CV) . 关键词:重复性变异系数样本标准差 前言 批内重复性试验是指相同条件下,用同样方法、同一试剂和标准品、同一仪器、同一实验室由同一人,在尽可能短的时间对同一份样品做20次 以上重复测定,以获得批内精密度的试验方法,其结果能够反映各次测定 结果相互接近的程度,可用于客观评估某种分析方法随机误差的大小. 1.材料和方法 1.1材料60g/L蛋白标准液、待测样品、双缩脲试剂、可见光分光光度计、试管、 烧杯、比色杯、吸耳球、移液管 1.2方法(操作过程) 1.2.1 取出双缩脲试剂放置于桌上,取出24支试管,分别标记空白管1支, 标准管3支,重复测定管20支,需要24管共72ml的双缩脲试剂。

植物DNA条形码研究简介

植物DNA条形码 摘要DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统, 从而实现对物种的快速自动鉴定。尽管这一技术在理论上和具体应用上仍存在很多争论, 但DNA条形码概念自2003年由加拿大分类学家Paul Hebert首次提出后就在世界范围内受到了广泛关注。该技术在动物研究中已得到广泛的应用,所采用的标准片段是线粒体COl基因中约650 bp长的一段。然而在植物DNA条形码的研究进展相对缓慢,目前尚处于对所提议的各片段比较和评价阶段,还未获得一致的标准片段。由于植物中线粒体基因组进化速率较慢,因此条形码片段主要在叶绿体基因组上进行选择,被提议的编码基因片段主要有rpoB,rpoC1,matK,rbcL,UPA,非编码区片段有trnH-psbA,atpF-atpH,psbK-psbl,此外还有核基因ITS。 关键词DNA条形码,物种识别,ITS, matK, 形态分类学,植物DNA条形码, rbcL, trnH-psbA,DNA barcoding,DNA barcode,plant DNA barcoding 期刊或会议 生命条形码联盟(CBOL):由研究条形码的学者、专家所组成的国际性组织。2008年2月在昆明召开“中国生命条形码研究战略研讨会”。会议邀请十余名国外顶级专家以及国内植物、动物、微生物的知名学者,就DNA条形码的研究技术、策略和进展以及条形码管理发表演讲。中国科学院、国家自然科学基金委员会及科技部领导和近150名国内外专业人士参加了本次会议。2009年,为了明确中国生命条形码研究的发展战略,部署与生命条形码相关的各项工作,由中国科学院牵头,中科院动物研究所承办的“生命条码联盟(CBOL,the Consortium for the Barcode of Life)中国会议”近日召开。本次大会的主题是:建立国内的生命条形码合作平台,保持独立性并体现特色,在此基础上实现与国际进行接轨合作。大会旨在引进国际上生命条形码发展的先进理念、技术和成功经验,扩大与世界各国在生命条形码相关领域的交流与合作,进一步推进并指导我国生命条形码发展进程。 PLOS:公共科学图书馆(Public Library of Science,简称PLoS)是一个由科学家和医生组成的非营利机构,致力于把世界上科学和医学的文献作为免费资源向公众开放。2003年,PLoS作出一个非营利科学医学发布的决定,为科学家和医生提供高质量高水平的期刊,其中会发布他们最重要的作品。在这个开放资源的模式下,PLoS期刊直接在网上可以看到,免费使用,之后再发布或使用也没有任何限制,只要按创作共享注明出处授权条款的要求注明作者和来源即可。 Molecular Ecology Resources:分子生物学期刊

儿童基因检测专题

儿童天赋基因检测专题 每个孩子的诞生都是上天最好的馈赠,每个家长都对孩子充满无限的期望。科学家、文学家、工程师、飞行员……望子成龙的家长心中都有一个未完成的梦,期待孩子能够实现。家长想给孩子创造一个轻松快乐的成长空间,又怕他们输在起跑线,于是孩子的周末被绘画课、钢琴课、小提琴课、舞蹈课安排得密密麻麻。但是孩子们是怎么想的呢?如果孩子自己没兴趣,除了感觉枯燥和乏味,还可能对家长产生不满。 如果家长能发现孩子的潜在天赋,那不但孩子学得快乐,也更容易在这个领域发挥优势。 每个人都有各自的天赋,有的人逻辑思维占优势,有的人形象思维占优势;有的人博闻强记,但不善于融会贯通;有的人智力过人,但意志薄弱。如果了解孩子的天赋潜能,并能通过引导和训练,就有可能事半功倍,成为最好的自己。一.什么是基因: 基因是DNA分子上能够编码蛋白质的特定的核苷酸序列,它指导人体内重要物质蛋白质等的合成,维持着人体的正常生理功能,决定着人的生老病死。二.什么是染色体: 染色体是细胞核内两条双螺旋的DNA链。是遗传信息的主要携带者。什么是疾病易感基因? 三.什么是基因检测? 从受检者口腔粘膜的唾液中采样,使用一定的实验室技术,对身体中所携带的疾病易感基因进行测定的手段。 四.我们的基因是哪来的? 我们的基因是由六个人组成的,来自于: 2个家系:父系——母系。 4个家族:祖父、祖母、外祖父、外祖母。 6个人的基因:决定于本代基因: 祖父祖母外祖父外祖母 ∨∨ 父亲>>>本代<<<母亲 五.遗传度高的疾病有哪些? 遗传度高的疾病:有内源性疾病和外源性疾病。内源性疾病,基因起主要作

用。外源性疾病,环境起主要作用。如哮喘 六.基因有缺陷了会导致哪些疾病? 染色体缺陷——新生儿畸形、愚钝细胞分裂、增殖相关基因突变——肿瘤免疫相关基因缺陷——自身免疫病、抗感染差生化代谢过程基因缺陷——解毒功能差、易受环境因素致癌…… 结论——基因和疾病密切相关 七.什么是儿童天赋教育的递减法则? 儿童的天赋随着年龄的增大而递减,开发越早,儿童能的发挥就越好。儿童天赋基因检测可以让家长有针对性的预见孩子的天赋发展潜能,对孩子进行科学地、合理化的应材施教,让孩子赢在他生命与智慧的起跑线上,在后天教育方面以最少的资金投入,达到事半功倍的效果,省时、省钱、省事。 儿童天赋潜能基因检测是通过采集人体口腔黏膜脱落细胞,对人体细胞中的DNA、染色体进行分析,检测出对个体有利的基因突变,进而分析儿童含有的“优势基因”情况,使父母能够及时了解孩子的先天的遗传优势、天赋潜能、指导科学培养孩子能力的一种分子生物学手段。了解了孩子的优势基因在哪里,就可以有计划和针对性地对孩子进行培养。 天赋基因检测是以单碱基多态性为主要检测靶标,运用先进的基因芯片和测序等技术,通过对受检者DNA样本进行科学严谨的检测,检测与天赋相关的基因,科学评估孩子的天赋倾向,发掘孩子的天赋优势,为家长培养孩子提供科学依据,进行个性化教育培养,提高教育成功率,使孩子成为社会的有用之才,有效的为当今家长解决育儿难的大问题。 八.天赋基因检测对职业生涯和人才选用有指导意义吗?(有指导意义) 1.天赋基因检测对人们的职业生涯有指导意义。通过了解自己的天赋,运用优势智能,结合自己的专业优势,选择与自己天赋相关的职业,让自己的职场发展能快速定位,找到最适合自己的空间和方向。 2.国外一些优秀企业秘书,要求智商已达到 115分!为的是能够快速、准确地将处理过的精确信息及时、快速地提供给企业领导。这很重要,因为它决定着一个企业的生死存亡。

基因多态性的检测方法

基因多态性的检测方法 多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性(longth polymorphism)。 基因多态性的主要检测方法简述如下: 1.限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP):由DNA 的多态性,致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变,用限制酶切割基因组时,所产生的片段数目和每个片段的长度就不同,即所谓的限制性片段长度多态性,导致限制片段长度发生改变的酶切位点,又称为多态性位点。最早是用Southern Blot/RFLP方法检测,后来采用聚合酶链反应(PCR)与限制酶酶切相结合的方法。现在多采用PCR-RFLP法进行研究基因的限制性片段长度多态性。 2.单链构象多态性(SSCP):是一种基于单链DNA构象差别的点突变检测方法。相同长度的单链DNA如果顺序不同,甚至单个碱基不同,就会形成不同的构象。在电泳时泳动的速度不同。将PCR产物经变性后,进行单链DNA凝胶电泳时,靶DNA中若发生单个碱基替换等改变时,就会出现泳动变位(mobility shift),多用于鉴定是否存在突变及诊断未知突变。 3.PCR-ASO探针法(PCR-allele specific oligonucleotide, ASO):即等位基因特异性寡核苷酸探针法。在PCR扩增DNA片段后,直接与相应的寡核苷酸探杂交,即可明确诊断是否有突变及突变是纯合子还是杂合子。其原理是:用PCR扩增后,产物进行斑点杂交或狭缝杂交,针对每种突变分别合成一对寡核苷酸片段作为探针,其中一个具有正常序列,另一个则具有突变碱基。突变碱基及对应的正常碱基匀位于寡核苷酸片段的中央,严格控制杂交及洗脱条件,使只有与探针序列完全互补的等位基因片段才显示杂交信号,而与探针中央碱基不同的等位基因片段不显示杂交信号,如果正常和突变探针都可杂交,说明突变基因是杂合子,如只有突变探针可以杂交,说明突变基因为纯合子,若不能与含有突变序列的寡核苷探针杂交,但能与相应的正常的寡核苷探针杂交,则表示受检者不存在这种突变基因。若与已知的突变基因的寡核苷探针匀不能杂交,提示可能为一种新的突变类型。 4. PCR-SSO法:SSO技术即是顺序特异寡核苷酸法(Sequence Specific Oligonucleotide, SSO)。原理是PCR基因片段扩增后利用序列特异性寡核苷酸探针,通过杂交的方法进行

DNA条码

DAN条码的应用及前景 摘要:DNA条形码技术在最近几年发展迅速,本文就DNA条码技术在医学媒介生物鉴定中的应用,用该技术进行物种鉴定具有快速、简便的优点,及其DNA条码技术的背景进行了介绍。 关键词:DNA 条形码技术;背景;物种鉴定;生物多样性保护 DNA条形码技术是运用来自生物体基因组适当部分的一段短的核苷酸序列对物种进行种级水平鉴定,DNA条形码技术的核心是选择合适的DNA片断其变异速率必须足够的慢从而使种内变异最小,同时也要求充分的快来显示种间变异,同时它必须相对容易得到,人或缺失尽量的少,使序列的对比更容.理想中的DNA条码技术应符合下列标准:(1).同一物种不同个体之间作为条码的DNA序列一致,而不同物种之间具有差异;(2).应该是标准化的,即同分类群使用相同的DNA片断作为条码;(3).条码DNA片断应包含足够的系统发育信息,以便很容易将未知的或尚未“编条码”物种划入其分类等级(属,科等)中;(4).应该非常稳健,有高度保守的引物区和高可靠性的DNA扩增和测序;(5) 条码DNA片断应该足够的短,以便允

许降解的DNA 的扩增.因此,理想的DNA条码标记应具有差异的,标准化的,含有系统发育信息,极度稳健并且短的等特性,不但这样的一个理想的DNA标记尚未被发现,或许,根本存在?.用于动物和真菌的分子条形码技术的DNA片段——线粒体eoxl基因(编码细胞色素氧化酶亚基1)在陆地植物中高度保守,因此不适合作为植物的DNA条码.事实上,在植物中所有的线粒体基因进化速度都太慢,以至于不能精确的鉴别物种,因此它没有被选作植物的DNA条形码技术.核基因组在植物系统发育研究中通常使用I TS 序列,但核基因组高拷贝区复杂的一致性进化和旁系同源等性质,影响了该片断在某些类群的植物中的运用.在比较了7个主要候选质体DNA片断(at pF —at pH 间隔区,mat K基因,r b c L基因,r poB基因,r poC1基因,psbK—psbI间隔区,和t r nH—ps b A 间隔区)的性能后,CBOL推荐r b c L.mat K两个片断的联合作为植物条形码.通过对通用性、序列质量、分辨率和成本之间复杂的权衡后,这种提议可能是目前最务实的方案.[1]以2个位点r b c L—mat K为核心的条码为运用DNA序列数据鉴定物种提供了一个通用的框架,从而有助于发现陆地植物中更多的物种.选择了合适的用于分析的DNA 区段以后,必须

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