基因检测报告 (2)
上海澳斯泰医学检验所基因检测报告
患者姓名：
样品编号：
送检单位：
委托人：
联系电话：
委托日期：2014年11月21日
接收日期：2014年11月24日
报告日期：2014年11月26日
样本提供者信息
样本编号：
病理号：
病区：
床号：19
科室：胸外科
姓名：
性别：女
出生日期：1950年7月22日
临床诊断：
样本种类：新鲜组织
样品数量：1
检测项目内容
检测项目1：肿瘤个体化治疗疗效相关融合基因检测
1. 检测内容：EML4-ALK融合基因
2. 检测方法：实时定量逆转录聚合酶链反应(QRT-PCR)
3. 主要材料：ABI荧光定量试剂盒源奇生物肿瘤相关融合基因检测试剂盒
4. 主要设备：ABI 7300荧光定量PCR仪
检测项目2：肿瘤个体化治疗疗效相关基因突变检测
1. 检测内容：EGFR基因突变
2. 检测方法：DNA 测序法、ARMS法
3. 主要材料：ABI PCR测序试剂盒，源奇生物荧光+测序相关基因检测试剂盒
4. 主要设备：ABI 3730XL DNA测序仪、ABI 7300荧光PCR仪
检测项目及结果
实验员: 报告人：复核人：报告时间：2014年11月26日
注：此检测结果只对本次送检样本负责。
由于肿瘤疾病的发生和发展是动态过程，因此若是样品采集一定间隔时间后（3个月以上）的跟踪检测或者进行治疗方案的评估，建议遵医嘱。
注：以上分析仅用于评估个体化用药的适用程度，具体的治疗方案须由临床主治医生决定。
如有任何疑问，请联系相关负责人。
检测结果附图及解读
一、肿瘤相关融合基因检测结果
ABL-内参
EML4-ALK 融合基因
阳性对照
阴性对照
标本
二、EGFR基因突变检测结果EGFR Exon19 基因
EGFR Exon20 基因
阳性对照
标本阴性对照
阳性对照
阴性对照
EGFR Exon21 基因
EGFR 790 基因
内参 基因
阳性对照
标本
阴性对照
阳性对照
标本
阴性对照
附：参考资料
1. EGFR信号通路及通路上各靶标基因突变简介
表皮生长因子受体（EpidermalGrowthFactorReceptor，EGFR）主要位于细胞膜上，属受体酪氨酸激酶家族。EGFR被配体激活后启动胞内该通路上的信号传导，经过细胞质中衔接蛋白、酶的级联反应，调节转录因子激活基因的转录，指导细胞迁移、黏附、增殖、分化和凋亡[1]。EGFR下游的信号转导通路主要有两条（如下图）：一条是Ras/Raf/MEK/ERK-MAPK通路，而另一条是PI3K/Akt/mTOR通路[2]。研究表明，在许多实体肿瘤中存在EGFR信号转导通路上的基因发生体细胞突变及表达异常，从而导致肿瘤细胞无限制的扩增和迁移。因此，近年以EGFR和EGFR 信号通路中关键的组分为靶标的分子靶标检测及靶向治疗成为国际肿瘤界个体化治疗关注的焦点。
参考文献
1. Cunningham D et al. N.Engl J Med. 2004;351:337–45.
2. Stintzing S et al. Dtsch Arztebl Int. 2009;106:202–6.
EGFR基因
目前，针对EGFR所开发的分子靶向药物主要分两类:1）小分子酪氨酸激酶抑制剂(TKI)，如吉非替尼（Gefitinib，也称为易瑞沙/Iressa，阿斯利康）和厄罗替尼（Erlotinib，也称为特罗凯/Tarceva，罗氏制药)，抑制EGFR胞内区酪氨酸激酶活性；2）单克隆抗体(mAb)，如西妥昔（Cetuximab，也称为爱必妥/Erbitux，默克公司）和帕尼单抗（Panitumumab，也称为维克替比/Vectibix，安进公司)，与EGFR胞外区结合，阻断依赖于配体的EGFR活化。上述药物通过不同途径阻断EGFR介导的细胞内信号通路，从而抑制肿瘤生长、转移和血管生成，并促进肿瘤细胞凋亡，提高放化疗敏感性。EGFR酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKI），吉非替尼和厄罗替尼已被FDA批准用于治疗晚期非小细胞肺癌（NSCLC）。这些靶向药物已应用于晚期和不适宜传统化疗方案的NSCLC患者的临床治疗。但是，临床运用结果表明这些靶向药物仅对部分患者有效。进一步的研究发现EGFR基因外显子19和21的突变（体细胞突变）是患者对此类靶向药物有效的必要前提[1]。2004年，美国哈佛医学院的研究人员Lynch等率先报道，肺癌细胞中有EGFR酪氨酸激酶基因编码区外显子19缺失或外显子21突变的患者，靶向药物易瑞沙的有效率高达80％以上[2]。临床研究表明，EGFR突变分布与临床上EGFR-TKI治疗的优势人群相一致，主要见于女性、腺癌、非吸烟者及亚裔患者[3]。然而，一部分对EGFR-TKI 治疗有效的患者最终都会对EGFR-TKI产生耐药性。进一步临床研究还表明，EGFR 基因外显子20的体细胞突变是EGFR-TKI继发耐药的主要机制之一[4]。外显子20的突变类型主要是第790位密码子出现C—>T的转换，引起EGFR蛋白中该位点的氨基酸由苏氨酸转变为甲硫氨酸(T790M)。这一突变仅见于药物治疗后复发者，突变使得非小细胞肺癌患者对吉非替尼和厄罗替尼产生抗性。美国国家癌症综合网络(NCCN)2009年版的临床指南[5]中明确指出：EGFR突变，尤其是外显子19缺失突变与肿瘤对TKIs如吉非替尼的敏感度有重要关系。所以EGFR的活化突变能够被用来为这些患者选择最好的治疗方法。
参考文献
1.Pao W et al.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.2004;101:13306-11.
2.Lynch TJ et al.N.Engl.J.Med.2004;350:2129-39.
3.Kimura H et al.Clin Cancer Res2006;12:3915-21.
4.Maheswaran S et al.N Engl J Med.2008;359:366-77.
5.NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology for NSCLC.V2.2009.
2.EML4-ALK 融合基因及耐药
棘皮动物微管相关蛋白样(EML4)编码蛋白N-末端部分融合至间变淋巴瘤激酶(ALK)的细胞内酪氨酸激酶结构域，重排为EML4-ALK，导致异常酪氨酸激酶表达。2007年Soda 等首次在非小细胞肺癌患者术后标本中检测到EML4-ALK重排融合。Shaw等研究表明，在限定筛选条件的人群中，EML4-ALK融合比例增高，如不吸烟或仅少量吸烟且无EGFR突变者，EML4-ALK阳性率高达33%，这也是迄今报道EML4-ALK检出率最高人群。这项研究的结果提示，上述这些EGFR-TKIs治疗优势而不敏感人群实质上蕴藏着新的分子事件。
2010年ASCO会议上报道的I期临床研究结果显示，82例存在EML4-ALK融合的NSCLC患者接受crizotinib治疗(250 mg，bid)，90%出现肿瘤缩小，57%的患者获得客观缓解。2011年ASCO会议上，Shaw等更新了I期研究的生存数据：82例接受crizotinib治疗的患者，1年生存率为77%，2年生存率为64%，中位OS尚未达到。鉴于这种不俗的疗效和轻微的不良反应，EML4-ALK融合的发现与治疗突破被评为2011年临床肿瘤界十大进展之一，而美国FDA于2011年8月26日批准crizotinib上市，用于治疗ALK融合的NSCLC 患者。2012年NCCN更新之一即为：对于非鳞NSCLC患者，一线治疗时建议检测EML4-ALK，若为阳性，推荐接受crizotinib治疗。A8081005研究针对化疗失败并检测到EML4-ALK融合的NSCLC患者，已于2012年4月份结束招募，全球共随机818例，阳性率为20.8%(818/3927)。2012年的ASCO年会上报道了最新的有效性及安全性数据：中为治疗周期25周，ORR为53%，12周的DCR为85%，中位PFS 8.5个月。常见的不良反应为视觉异常(50%)，恶心(46%)，呕吐(39%)，腹泻(35%，多为1~2级)。有146例患者在PD后仍继续crizotinib治疗，多为单器官病灶的进展。53%的患者PD后crizotinib治疗超过2周，中位PD后治疗时间为10周，大多数患者有较好的体力状况。进展后仍给予靶向药物并加强局部病灶治疗是“个体化治疗”的表现，患者仍可从中获益。
参考文献：
Takeuchi K et al. Nat Med. 2012 Feb 12;18(3):378-81
Toyokawa G et al. Lung Cancer. 2013 Jun 17
Watanabe N et al. Acta Oncol. 2013 Jun 11