COX回归与logistic回归区别

COX回归与logistic回归区别
COX回归与logistic回归区别

COX回归与logistic回归区别

logistic回归,与线性回归并成为两大回归,应用范围一点不亚于线性回归,甚至有青出于蓝之势。因为logistic回归太好用了,而且太有实际意义了。解释起来直接就可以说,如果具有某个危险因素,发病风险增加2.3倍,听起来多么地让人通俗易懂。线性回归相比之下其实际意义就弱了。logistic回归与线性回归恰好相反,因变量一定要是分类变量,不可能是连续变量。分类变量既可以是二分类,也可以是多分类,多分类中既可以是有序,也可以是无序。二分类logistic回归有时候根据研究目的又分为条件logistic回归和非条件logistic 回归。条件logistic回归用于配对资料的分析,非条件logistic回归用于非配对资料的分析,也就是直接随机抽样的资料。无序多分类logistic回归有时候也成为多项logit模型,有序logistic回归有时也称为累积比数logit模型。

cox回归,cox回归的因变量就有些特殊,因为他的因变量必须同时有2个,一个代表状态,必须是分类变量,一个代表时间,应该是连续变量。只有同时具有这两个变量,才能用cox回归分析。cox回归主要用于生存资料的分析,生存资料至少有两个结局变量,一是死亡状态,是活着还是死亡?二是死亡时间,如果死亡,什么时间死亡?如果活着,从开始观察到结束时有多久了?所以有了这两个变量,就可以考虑用cox回归分析。

1.都可以用来筛选影响因素;

2.都有OR值或者RR值;

3.应变量不一样:Cox回归的应变量是生存时间*Cencor(结局),而logistic 回归应变量是分类资料,比如二分类;

4.条件logsitic回归分析与cox回归分析有相似的地方,sas程序相同,SPSS 里面条件logistic回归分析就是借用Cox比例风险模块进行分析!

logistic回归是cox回归的一个特例.

当全部个体都有结局时,两者的结果(β)是一样的.

cox回归可以考察生存函数,而logistic不可以。补充一点,在spss里,配对logistic回归的模型,是在cox回归里完成的。

Logistic回归分析简介

Logistic回归分析简介 Logistic回归:实际上属于判别分析,因拥有很差的判别效率而不常用。1.应用范围: ①适用于流行病学资料的危险因素分析 ②实验室中药物的剂量-反应关系 ③临床试验评价 ④疾病的预后因素分析 2.Logistic回归的分类: ①按因变量的资料类型分: 二分类 多分类 其中二分较为常用 ②按研究方法分: 条件Logistic回归 非条件Logistic回归 两者针对的资料类型不一样,后者针对成组研究,前者针对配对或配伍 研究。 3.Logistic回归的应用条件是: ①独立性。各观测对象间是相互独立的; ②LogitP与自变量是线性关系; ③样本量。经验值是病例对照各50例以上或为自变量的5-10倍(以10倍 为宜),不过随着统计技术和软件的发展,样本量较小或不能进行似然

估计的情况下可采用精确logistic回归分析,此时要求分析变量不能太多,且变量分类不能太多; ④当队列资料进行logistic回归分析时,观察时间应该相同,否则需考虑观 察时间的影响(建议用Poisson回归)。 4.拟和logistic回归方程的步骤: ①对每一个变量进行量化,并进行单因素分析; ②数据的离散化,对于连续性变量在分析过程中常常需要进行离散变成等 级资料。可采用的方法有依据经验进行离散,或是按照四分、五分位数 法来确定等级,也可采用聚类方法将计量资料聚为二类或多类,变为离 散变量。 ③对性质相近的一些自变量进行部分多因素分析,并探讨各自变量(等级 变量,数值变量)纳入模型时的适宜尺度,及对自变量进行必要的变量 变换; ④在单变量分析和相关自变量分析的基础上,对P≤α(常取0.2,0.15或 0.3)的变量,以及专业上认为重要的变量进行多因素的逐步筛选;模型 程序每拟合一个模型将给出多个指标值,供用户判断模型优劣和筛选变 量。可以采用双向筛选技术:a进入变量的筛选用score统计量或G统计 量或LRS(似然比统计量),用户确定P值临界值如:0.05、0.1或0.2,选 择统计量显著且最大的变量进入模型;b剔除变量的选择用Z统计量(Wald 统计量),用户确定其P值显著性水平,当变量不显者,从模型中予以剔 除。这样,选入和剔除反复循环,直至无变量选入,也无变量删除为止,选入或剔除的显著界值的确定要依具体的问题和变量的多寡而定,一般

SPSS—二元Logistic回归结果分析报告

SPSS—二元Logistic回归结果分析 2011-12-02 16:48 身心疲惫,睡意连连,头不断往下掉,拿出耳机,听下歌曲,缓解我这严重的睡意吧!今天来分析二元Logistic回归的结果 分析结果如下: 1:在“案例处理汇总”中可以看出:选定的案例489个,未选定的案例361个,这个结果是根据设定的validate = 1得到的,在“因变量编码”中可以看出“违约”的两种结果“是”或者“否” 分别用值“1“和“0”代替,在“分类变量编码”中教育水平分为5类,如果选中“为完成高中,高中,大专,大学等,其中的任何一个,那么就取值为 1,未选中的为0,如果四个都未被选中,那么就是”研究生“ 频率分别代表了处在某个教育水平的个数,总和应该为489个

1:在“分类表”中可以看出:预测有360个是“否”(未违约)有129个是“是”(违约) 2:在“方程中的变量”表中可以看出:最初是对“常数项”记性赋值,B为 -1.026,标准误差为:0.103 那么wald =( B/S.E)2=(-1.026/0.103)2 = 99.2248, 跟表中的“100.029几乎接近,是因为我对数据进行的向下舍入的关系,所以数据会稍微偏小, B和Exp(B) 是对数关系,将B进行对数抓换后,可以得到:Exp(B) = e^-1.026 = 0.358, 其中自由度为1, sig为0.000,非常显著

1:从“不在方程中的变量”可以看出,最初模型,只有“常数项”被纳入了模型,其它变量都不在最初模型 表中分别给出了,得分,df , Sig三个值, 而其中得分(Score)计算公式如下: (公式中(Xi- Xˉ) 少了一个平方) 下面来举例说明这个计算过程:(“年龄”自变量的得分为例) 从“分类表”中可以看出:有129人违约,违约记为“1”则违约总和为 129,选定案例总和为489 那么: yˉ = 129/489 = 0.16 xˉ = 16951 / 489 = 34.2 所以:∑(Xi-xˉ)2 = 30074.9979

cox回归分析

生存分析之COX回归分析 1、生存分析,就是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析得一种统计方法; 2、生存时间,就是从规定得观察起点到某一特定终点事件出现得时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间; 3、完全数据,观测起点到终点事件所经历得时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡得时间; 4、删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定得终点事件以外得原因而终止观察,不能确定具体生存时间得一类数据; 5、生存概率,表示某时段开始存活得个体到该时段结束仍存活得概率,p=活满某时段得人数/该时段期初有效人口数; 6、生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段得生存概率得累积概率,S(tk)=p1、p2、pk=S(tk-1)、pk; 7、生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点得生存率连在一起得曲线图; 8、中位生存期,又称半数生存期,表示50%得个体存活得时间; 9、PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存得影响不随时间得改变而改变,就是COX回归模型建立得前提条件。 Cox回归分析及其SPSS操作方法概述 前面我们已经讲过生存分析及KM法得内容,详细可以回复数字26-28查瞧。但有对统计不太熟悉得“微粉”还不太明白生存分析与一般统计得区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局就是否出现,还会关心结局出现得时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4、5后死亡,如果只瞧第5年时得结局,两者就是一样得(均死亡),但就是实际我们认为后者得治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局与结局出现得时间,而一般分析只考虑结局。另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般得分析中这种病例无法使用,而中间失访得病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例得状态,失访前得资料可以用于分析。 我们先回顾一下生存分析得KM法与寿命表法(回复数字26与27可以查瞧KM法得详细内容),其共同点就是只能分析一种因素与生存率得关系,Log-Rank法也就是比较一个因素两种水平间得生存差别,如果生存 率得影响因素有很多,我们怎么避免其它混杂因素得影响呢?我们可以使用回归分析方法,但如果使用logistic回归,也就是只能观察影响因素与结局得关联,没有考虑结局发生得时间因素。Cox回归可以解决这个问题。Cox回归一般模型假设为 其中h(t,X)就是在时刻t得风险函数又可称瞬时死亡率,h(0,t)就是基线风险率,其它与logistic回归模型相同。βj大于0则x j越大,病人死亡风险越大,βj小于0则x j越大,病人死亡风险越小,βj等于0则x j 越与死亡率没有影响。Exp(β)为危险比(HR)或相对危险度(RR)。 下面以一个例子说明在SPSS中作Cox回归如何操作。

cox回归结果解析

筛选变量的方法:第一步,结合临床,临床认为有关的变量均筛选出来。第二步.应用双变量的相关分析,把显著相关的变量筛选出来,保留临床意义更大的那个。第三步,应用Kaplan-Meier法对每个危险因素的两个暴露水平做生存曲线,若曲线存在交叉,则不能应用Cox生存分析(Cox生存分析也称比例风险回归,它包含一个假定,即在随访期间暴露于预后因素与非暴露的风险比例维持恒定),这类变量需应用更复杂的非比例风险回归模型,这里将不详述了。第四步,单因素分析。可应用COX生存分析的第0步结果作为单因素分析的结果。可在SPSS的Cox回归里选择任何一种前进法,在Option中选择at each step,取因子筛选第0步的Score检验结果作为单因子Cox回归分析的结果。也有文章的单因素分析对于离散型变量应用卡方检验和连续型变量应用t检验,等级资料应用双变量相关分析。 最后,将进行Cox回归分析。应用SPSS中analysis-survival-cox regression.在time一栏中选择生存时间;在state一栏中选择数据状态(在数据编码中已经介绍),在激活的define event一栏中设定single value为1。这里要强调几个小问题:1,SPSS可以支持研究者做两个或以上的变量的共同效应,需在主对话框中同时选中需研究的变量两个或两个以上,这样协变量框中的>a*b>才会被激活。2,分类变量,在这里被称为哑变量,需单击categorical,然后将分类变量选入对话框。 最后得到的结果,B为协变量的系数,Exp(B)为相对危险度。可得到比例风险模型:h(t,x)=h0(t)exp(Σβ ixi)公式1-1 预后指数也称预后得分,PI(prognostic index)= (Σβ ixi) PI=0代表危险率处于平均水平,PI<0,代表危险率低于平均水平;PI>0,代表危险率高于平均水平。由公式1-1可以求得全部病人的预后指数。将所有的预后指数做等级变换,例如分组的界点PI=-1,0,1,以PI为分类变量做COX回归,并估计生存率,便获得预后指数分类生存率,若样本量很大,或代表性比较好,可用内插法分别估计不同预后指数水平的人群的k年生存率,以及中数生存期,编制成参照表,便可用于临床,根据每个病人的PI值,预测其存活k年的概率,以及期望的生存年数。最后一段摘自方积乾主编的第二版《医学统计学与电脑试验》。如果我们能够象国外一样做大规模多中心前瞻的研究,我一定要做到最后一步。 其实这个问题关键还是在你自己,就是你为何要定义分类变量?如果变量是连续变量或者是具有等级关系的,那么一般是不定义为分类变量的,比如年龄,身高,体重等等。如果变量的数值之间没有等级关系,比如组别,我们用1表示A组,2表示B性,3表现C组,这个在分析的时候是需要定义为分类变量的,因为这个数值的大小是没有意义的。所以关键怎么选择,还是需要看楼主这几个变量所代表的具体意义。 COX回归时如果需要分析的自变量中为有序多分类,为保证结果的准确性,应将其指定为亚变量进行分析(严格的讲,两分类变量也应进行指定,但不指定时的分析结果是等价的),所以您定义为categorical后的计算结果是可信的 the final multivariate Cox regression model, xx was identified as an independent prognostic factor with an adjusted hazard ratio of 1.60 (95% confidence interval 1.07–2.41)‖,而有的文章则是这样描述―Cox regression indicated that ING4 expression is an independent prognostic factor for overall 5-year survival (Relative risk = 2.50, 95% confidence interval = 1.09–5.74, P = 0.031)‖请问这两种描述有什么区别?hazard ratio与relative risk又有什么不同?谢谢大家!

logistic回归分析案例

1. 数据制备(栅格数据) (1) 宝塔区基底图层.tif (2) 居民点扩增.tif 、坡度.tif 、坡向.tif 等要素数据。 在 environment settings ------ p rocessing extent ------ snap raster (选中基底图层),保证栅格数据 像元无偏移,且行列的数量一致。 化:Raster to ASCII Inyul r aiLtvl- 匚” k 『号樹 ± 如葡让也\1非*订kilt :f 10. 2 'iiStati EeiT-SlaT 14t L J. KT 2.通过CLUE-S 莫型中的fileconvert 模块,获得logistic 回归分析的数据集。 (1) 将上一步骤中的因变量 y 和影响因素x 的.txt 文档后缀改为.asc 格式,并将文件 放在CLUE-S 模型所在的文件夹中。 (2) 打开FileCo nvert V2软件,按下图勾选,填写"file list "内容,点击start con version , 3 田F1 曰 It:. (3)栅格数据转为 ASCII 码,生成txt 文档。 匚onversion Tools Ejicel From GPS From KML From Raster 气 Raster to ASCII y Raster to Fist 声.Raster to Point

生成stat .txt文档。 祥Fi le 荃 flFfijie? I1id J?1Ji w ■■ 1 ? 9><4 P t414 Tl ?J19 12词 ■M*£LD|i4I# ■ Q电兀列心£i k1lf\ 15?1 *■4JE RI7 <1- I 4 話M3 IS r擠uSstalB-^aG 齬£ 淨珀bCMir 二i缶 pad... ■ 枝jfcsurrT^cM.a^t 炉 MBlOrtTIdH■: 护 xVcomr-.iic / rll asc 播Tann砂£]T (2)logistic回归分析 按图设置参数因变量、自变量;由于x3属于分类变量,点击分类按钮,按图设置参数。 >M!L4M|昨T祜lt?M? 曲唱-Hl'F1 wB-j' MtF M|T ffl¥ g: ZTStiRiiri SHilfi VTU '_'■ rt 舖C r TI薔色Z4d* ■i aa ■;? 1 iTdlfAflWVK4Wt4「利 E 呻■■} 1■ IdfcWM^U.一尉仇■臂H xlAftL lAMDf Jfit 1Q1?7r -iwns ■B-13磁MT 13 J 工 '-恫fl T l£j v-IIHH M4Q J0W PW回沐神to 型 rwa: wm 1 H teiiy- 卩厲 4a13 4 ■ira 401?wa 70i-221 ?d'131fefl 加ifUnm 片nu t013*Ozmwkt他 w p1W址?囲血|淞:幽 11013 1 Qm Sft?t 121JJ V s? 014*」; 11 H?iKa; H013 5 *旳 ti a IM■ KK MS V;941 ti Q144T f 7W filwvjcfic OH

Cox回归分析—非常详细的SPSS操作介绍

患者生存状态的影响因素分析 ——生存资料的COX回归分析1、问题与数据 某研究者拟观察某新药的抗肿瘤效果,将70名肺癌患者随机分为两组,分别采用该新药和常规药物进行治疗,观察两组肺癌患者的生存情况,共随访2年。研究以死亡为结局,两种治疗方式为主要研究因素,同时考虑调整年龄和性别的影响,比较两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异。变量的赋值和部分原始数据见表1和表2。 表1. 某恶性肿瘤的影响因素与赋值 表2. 两组患者的生存情况 group gender age time survival 0 1 0 22 1 0 1 1 10 1 0 1 1 64 1 0 1 1 12 1 0 1 0 17 1 1 0 0 19 1 1 1 1 4 1 1 0 1 1 2 0 1 0 0 5 0 1 1 1 27 0 2、对数据结构的分析 该研究以死亡为结局,治疗方式为主要研究因素,每个研究对象都有生存时

间(随访开始到死亡、失访或随访结束的时间),同时考虑调整年龄和性别的影响。欲了解两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异,可以用Cox比例风险模型(Cox proportional-hazards model,也称为Cox回归)进行分析。 实际上,Cox回归的结局不一定是死亡,也可以是发病、妊娠、再入院等。其共同特点是,不仅考察结局是否发生,还考察结局发生的时间。 在进行Cox回归分析前,如果样本不多而变量较多,建议先通过单变量分析(KM法绘制生存曲线、Logrank检验等)考察所有自变量与因变量之间的关系,筛掉一些可能无意义的变量,再进行多因素分析,这样可以保证结果更加可靠。即使样本足够大,也不建议把所有的变量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各个变量之间的相互关系,确定自变量进入方程的形式,这样才能有效的进行分析。 单因素分析后,应当考虑应该将哪些自变量纳入Cox回归模型。一般情况下,建议纳入的变量有:1)单因素分析差异有统计学意义的变量(此时,最好将P值放宽一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)单因素分析时,没有发现差异有统计学意义,但是临床上认为与因变量关系密切的自变量。 3、SPSS分析方法 (1)数据录入SPSS

生存分析的cox回归模型案例

一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。 2、生存时间(Survival time) 指从某一起点到事件发生所经过的时间。生存是一个广义的概念,不仅仅指医学中的存活,也可以是机器出故障前的正常运行时间,或者下岗工人再就业前的待业时间等等。有的时候甚至不是通用意义上的时间,比如汽车在出故障前的行驶里程,也可以作为生存时间来考虑。 3、删失(Sensoring) 指由于所关心的事件没有被观测到或者无法观测到,以至于生存时间无法记录的情况。常由两种情况导致:(1)失访;(2)在研究终止时,所关心的事件还未发生。 4、生存函数(Survival distribution function) 又叫累积生存率,表达式为S(t)=P(T>t),其中T为生存时间,该函数的意义是生存时间大于时间点t的概率。t=0时S(t)=1,随着t的增加S(t)递减(严格的说是不增),1-S(t)为累积分布函数,表示生存时间T不超过t的概率。 二、生存分析的方法 1、生存分析的主要目的是估计生存函数,常用的方法有Kaplan-Meier法和寿命表法。对于分组数据,在不考虑其他混杂因素的情况下,可以用这两种方法对生存函数进行组间比较。 2、如果考虑其他影响生存时间分布的因素,可以使用Cox回归模型(也叫比例风险模型),利用数学模型拟合生存分布与影响因子之间的关系,评价影响因子对生存函数分布的影响程度。这里的前体是影响因素的作用不随时间改变,如果不满足这个条件,则应使用含有时间依存协变量的Cox回归模型。 下面用一个例子来说明SPSS中Cox回归模型的操作方法。 例题 要研究胰腺癌术中放疗对患者生存时间的影响,收集了下面所示的数据:

图文举例详细讲解Logistic曲线的回归分析

Logistic曲线的回归分析 例某一品种玉米高度与时间(生长周期,每个生长周期为2-3天,与气温有关)的数据如 表1.所示。用转化为线性方程的方法估计其logistic曲线预测模型。设最大值k为300(cm)。 表1.玉米高度与时间(生长周期)的关系 时间(生长周期)高度/cm时间(生长周期)高度/cm时间(生长周期)高度/cm 10.671212.752297.4620.851316.5523112.7 31.281420.124135.141.751527.3525153.652.271632.5526160.362.751737.55271 67.173.691844.7528174.984.711953.3829177.996.362071.6130180.2 107.732183.8931180.8119.91 3.1基本绘图操作 在Excel中输入时间x与高度y的数据。 选择插入->图表 图87 点击图表,选择“标准类型”中的xy散点图,并点击子图表类型的第一个。

图88 点击下一步,得到如图89。 图89

点击下一步。 图90 分别点击标题、网格线、图例进行修改,然后点击下一步。 图91 点击完成。 图92 右击绘图区,修改绘图区格式,双击做表格,修改坐标轴刻度,最后的散点图。

图93 观察散点图,其呈S型曲线,符合logistic曲线。采用转化为线性方程的方法求解模型。 3.2Logistic曲线方程及线性化 Logistic曲线方程为: y 1 k at me(12) (1)将数据线性化及成图 转化为线性方程为: y'aat 01 (13 ) 其中,y'ln(k/y1),a 0lnm,a1a 具体操作为: 向excel表格中输入y’数据。

(整理)多项分类Logistic回归分析的功能与意义1.

多项分类Logistic回归分析的功能与意义 我们经常会遇到因变量有多个取值而且无大小顺序的情况,比如职业、婚姻情况等等,这时一般的线性回归分析无法准确地刻画变量之间的因果关系,需要用其它回归分析方法来进行拟合模型。SPSS的多项分类Logistic回归便是一种简便的处理该类因变量问题的分析方法。 例子:下表给出了对山东省某中学20名视力低下学生视力监测的结果数据。试用多项分类Logistic回归分析方法分析视力低下程度(由轻到重共3级)与年龄、性别(1代表男性,2代表女性)之间的关系。

“年龄”使之进入“协变量”列表框。

还是以教程“blankloan.sav"数据为例,研究银行客户贷款是否违约(拖欠)的问题,数据如下所示: 上面的数据是大约700个申请贷款的客户,我们需要进行随机抽样,来进行二元Logistic 回归分析,上图中的“0”表示没有拖欠贷款,“1”表示拖欠贷款,接下来,步骤如下: 1:设置随机抽样的随机种子,如下图所示:

选择“设置起点”选择“固定值”即可,本人感觉200万的容量已经足够了,就采用的默认值,点击确定,返回原界面、 2:进行“转换”—计算变量“生成一个变量(validate),进入如下界面: 在数字表达式中,输入公式:rv.bernoulli(0.7),这个表达式的意思为:返回概率为0.7的bernoulli分布随机值 如果在0.7的概率下能够成功,那么就为1,失败的话,就为"0" 为了保持数据分析的有效性,对于样本中“违约”变量取缺失值的部分,validate变量也取缺失值,所以,需要设置一个“选择条件” 点击“如果”按钮,进入如下界面:

Logistic回归分析报告结果解读分析

L o g i s t i c回归分析报告结果解读分析 Company number:【0089WT-8898YT-W8CCB-BUUT-202108】

Logistic回归分析报告结果解读分析Logistic回归常用于分析二分类因变量(如存活和死亡、患病和未患病等)与多个自变量的关系。比较常用的情形是分析危险因素与是否发生某疾病相关联。例如,若探讨胃癌的危险因素,可以选择两组人群,一组是胃癌组,一组是非胃癌组,两组人群有不同的临床表现和生活方式等,因变量就为有或无胃癌,即“是”或“否”,为二分类变量,自变量包括年龄、性别、饮食习惯、是否幽门螺杆菌感染等。自变量既可以是连续变量,也可以为分类变量。通过Logistic回归分析,就可以大致了解胃癌的危险因素。 Logistic回归与多元线性回归有很多相同之处,但最大的区别就在于他们的因变量不同。多元线性回归的因变量为连续变量;Logistic回归的因变量为二分类变量或多分类变量,但二分类变量更常用,也更加容易解释。 回归的用法 一般而言,Logistic回归有两大用途,首先是寻找危险因素,如上文的例子,找出与胃癌相关的危险因素;其次是用于预测,我们可以根据建立的Logistic回归模型,预测在不同的自变量情况下,发生某病或某种情况的概率(包括风险评分的建立)。 2.用Logistic回归估计危险度 所谓相对危险度(risk ratio,RR)是用来描述某一因素不同状态发生疾病(或其它结局)危险程度的 比值。Logistic回归给出的OR(odds ratio)值与相对危险度类似,常用来表示相对于某一人群,另一人群发生终点事件的风险超出或减少的程度。如不同性别的胃癌发生危险不同,通过Logistic回归可以求出危险度的具体数值,例如,这样就表示,男性发生胃癌的风险是女性的倍。这里要注意估计的方向问题,以女性作为参照,男性患胃癌

生存分析及COX回归

第十二章生存分析及COX回归 在临床医学中, 对病人治疗效果的考查. 一方面可以看治疗结局的好坏,另一方面还可以通过治疗时间的长短来衡量。例如某种疾病治愈的时间, 某癌症病人手术后的存活时间等, 把这类与时间有关的资料统称为生存资料。生存资料一般通过随访收集,从某标准时刻(发病、手术或出院等)开始,按某种相等或不等时间间隔,对观察对象定期观察预定项目所得的资料,它的结局是死亡,治愈、复发、阳性等。但在临床上,往往由于各种原因:(1)因迁移原因失去联系;(2)死于其他原因而造成失访;(3)预定终止结果迟迟不发生,致使在一定时期内,一部分病例得不到确切的生存期,但它们提供了其生存期长于观察期的信息,这种数据称为删失数据,也称截尾数据或终检值(censored data),包含终检值的数据即为不完全数据。处理这类数据的统计分析方法称为生存分析。它包括三个方面的内容1)生存过程的描述,主要是生存率的估计;2)生存过程的比较;3)影响因素的分析。 §12.1 生存率的估计 生存率估计常用的有两种方法乘积极限法和寿命表法。 1乘积极限法 又称Kaplan-Meier 法适用于小样本资料。基本思想:将生存时间由小到大依次排列,在每个死亡点上,计算其期初人数、死亡人数、死亡概率、生存概率和生存率。 CHISS实现:点击重复测量→生存分析→乘积极限法 应用举例: 例12-1某疗法治疗白血病后的存活月数为: 2+,13,7+,11+,6,1,11,3,17,7。试估计其生存率。带“+”为存活终检值。 解步骤:1 进入数据模块此数据库已建立在CHISS\data文件夹中,文件名为:a9_0生存分析.DBF。打开数据库 点击数据→文件→打开数据库表 找到文件名为:a9_0生存分析.DBF →确认 2 进入统计模块进行统计计算 点击重复测量→生存分析→乘积极限法 时间变量: time 终检值指标:censor→确认 3 进入结果模块查看结果 点击结果 乘积限估计法生存分析, 数据来自文件: C:\CHISS\Data\a9_0生存分析.DBF 数据过滤条件:

如何用SPSS做logistic回归分析

如何用spss17.0进行二元和多元logistic回归分析 一、二元logistic回归分析 二元logistic回归分析的前提为因变量是可以转化为0、1的二分变量,如:死亡或者生存,男性或者女性,有或无,Yes或No,是或否的情况。 下面以医学中不同类型脑梗塞与年龄和性别之间的相互关系来进行二元logistic回归分析。 (一)数据准备和SPSS选项设置 第一步,原始数据的转化:如图1-1所示,其中脑梗塞可以分为ICAS、ECAS和NCAS三种,但现在我们仅考虑性别和年龄与ICAS的关系,因此将分组数据ICAS、ECAS和NCAS转化为1、0分类,是ICAS赋值为1,否赋值为0。年龄为数值变量,可直接输入到spss中,而性别需要转化为(1、0)分类变量输入到spss当中,假设男性为1,女性为0,但在后续分析中系统会将1,0置换(下面还会介绍),因此为方便期间我们这里先将男女赋值置换,即男性为“0”,女性为“1”。 图1-1 第二步:打开“二值Logistic 回归分析”对话框: 沿着主菜单的“分析(Analyze)→回归(Regression)→二元logistic (Binary Logistic)”的路径(图1-2)打开二值Logistic 回归分析选项框(图1-3)。

如图1-3左侧对话框中有许多变量,但在单因素方差分析中与ICAS 显著相关的为性别、年龄、有无高血压,有无糖尿病等(P<0.05),因此我们这里选择以性别和年龄为例进行分析。

在图1-3中,因为我们要分析性别和年龄与ICAS的相关程度,因此将ICAS选入因变量(Dependent)中,而将性别和年龄选入协变量(Covariates)框中,在协变量下方的“方法(Method)”一栏中,共有七个选项。采用第一种方法,即系统默认的强迫回归方法(进入“Enter”)。 接下来我们将对分类(Categorical),保存(Save),选项(Options)按照如图1-4、1-5、1-6中所示进行设置。在“分类”对话框中,因为性别为二分类变量,因此将其选入分类协变量中,参考类别为在分析中是以最小数值“0(第一个)”作为参考,还是将最大数值“1(最后一个)”作为参考,这里我们选择第一个“0”作为参考。在“存放”选项框中是指将不将数据输出到编辑显示区中。在“选项”对话框中要勾选如图几项,其中“exp(B)的CI(X)”一定要勾选,这个就是输出的OR和CI值,后面的95%为系统默认,不需要更改。

生存分析的cox回归模型案例——spss

生存分析的cox回归模型案例——spss

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一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。 2、生存时间(Survivaltime) 指从某一起点到事件发生所经过的时间。生存是一个广义的概念,不仅仅指医学中的存活,也可以是机器出故障前的正常运行时间,或者下岗工人再就业前的待业时间等等。有的时候甚至不是通用意义上的时间,比如汽车在出故障前的行驶里程,也可以作为生存时间来考虑。 3、删失(Sensoring) 指由于所关心的事件没有被观测到或者无法观测到,以至于生存时间无法记录的情况。常由两种情况导致:(1)失访;(2)在研究终止时,所关心的事件还未发生。 4、生存函数(Survival distributionfunction) 又叫累积生存率,表达式为S(t)=P(T>t),其中T为生存时间,该函数的意义是生存时间大于时间点t的概率。t=0时S(t)=1,随着t的增加S(t)递减(严格的说是不增),1-S(t)为累积分布函数,表示生存时间T不超过t的概率。? 二、生存分析的方法 1、生存分析的主要目的是估计生存函数,常用的方法有Kaplan-Meier法和寿命表法。对于分组数据,在不考虑其他混杂因素的情况下,可以用这两种方法对生存函数进行组间比较。 2、如果考虑其他影响生存时间分布的因素,可以使用Cox回归模型(也叫比例风险模型),利用数学模型拟合生存分布与影响因子之间的关系,评价影响因子对生存函数分布的影响程度。这里的前体是影响因素的作用不随时间改变,如果不满足这个条件,则应使用含有时间依存协变量的Cox回归模型。 下面用一个例子来说明SPSS中Cox回归模型的操作方法。 例题 要研究胰腺癌术中放疗对患者生存时间的影响,收集了下面所示的数据:

图文举例详细讲解Logistic曲线的回归分析

Logistic 曲线的回归分析 例 某一品种玉米高度与时间(生长周期,每个生长周期为2-3天,与气温有关)的数据如表1.所示。用转化为线性方程的方法估计其logistic 曲线预测模型。设最大值k 为300(cm )。 表1. 玉米高度与时间(生长周期)的关系 时间(生长周期) 高度/cm 时间(生长周期) 高度 /cm 时间(生长周期) 高度/cm 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 0.67 0.85 1.28 1.75 2.27 2.75 3.69 4.71 6.36 7.73 9.91 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 12.75 16.55 20.1 27.35 32.55 37.55 44.75 53.38 71.61 83.89 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 97.46 112.7 135.1 153.6 160.3 167.1 174.9 177.9 180.2 180.8 3.1 基本绘图操作 在Excel 中输入时间x 与高度y 的数据。 选择插入->图表 图87 点击图表,选择“标准类型”中的xy 散点图,并点击子图表类型的第一个。

图88 点击下一步,得到如图89。 图89

点击下一步。 图90 分别点击标题、网格线、图例进行修改,然后点击下一步。 图91 点击完成。 图92 右击绘图区,修改绘图区格式,双击做表格,修改坐标轴刻度,最后的散点图。

图93 观察散点图,其呈S 型曲线,符合logistic 曲线。采用转化为线性方程的方法求解模型。 3.2 Logistic 曲线方程及线性化 Logistic 曲线方程为: 1at k y me -= + (12) (1) 将数据线性化及成图 转化为线性方程为: 01'y a a t =+ (13) 其中,'ln(/1)y k y =-,0ln a m =,1a a =- 具体操作为: 向excel 表格中输入y ’数据。

cox回归分析

生存分析之COX回归分析 1.生存分析,是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析的一种统计方法; 2.生存时间,是从规定的观察起点到某一特定终点事件出现的时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间; 3.完全数据,观测起点到终点事件所经历的时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡的时间; 4.删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定的终点事件以外的原因而终止观察,不能确定具体生存时间的一类数据; 5.生存概率,表示某时段开始存活的个体到该时段结束仍存活的概率,p=活满某时段的人数/该时段期初有效人口数; 6.生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段的生存概率的累积概率,S(tk)=p1.p2.pk=S(tk-1).pk; 7.生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点的生存率连在一起的曲线图; 8.中位生存期,又称半数生存期,表示50%的个体存活的时间; 9.PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存的影响不随时间的改变而改变,是COX回归模型建立的前提条件。 1. Cox回归分析及其SPSS操作方法概述 前面我们已经讲过生存分析及KM法的内容,详细可以回复数字26-28查看。但有对统计不太熟悉的“微粉”还不太明白生存分析与一般统计的区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局是否出现,还会关心结局出现的时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4.5后死亡,如果只看第5年时的结局,两者是一样的(均死亡),但是实际我们认为后者的治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局和结局出现的时间,而一般分析只考虑结局。另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般的分析中这种病例无法使用,而中间失访的病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例的状态,失访前的资料可以用于分析。 我们先回顾一下生存分析的KM法和寿命表法(回复数字26和27可以查看KM法的详细内容),其共同点是只能分析一种因素与生存率的关系,Log-Rank法也是比较一个因素两种水平间的生存差别,如果生存率的影响因素有很多,我们怎么避免其它混杂因素的影响呢?我们可以使用回归分析方法,但如果使用logistic回归,也是只能观察影响因素与结局的关联,没有考虑结局发生的时间因素。Cox回归可以解决这个问题。Cox回归一般模型假设为 其中h(t,X)是在时刻t的风险函数又可称瞬时死亡率,h(0,t)是基线风险率,其它与logistic回归模型相同。βj大于0则x j越大,病人死亡风险越大,βj小于0则x j越大,病人死亡风险越小,βj等于0则x j越与死亡率没有影响。Exp(β)为危险比(HR)或相对危险度(RR)。 下面以一个例子说明在SPSS中作Cox回归如何操作。

SPSS学习笔记之——二项Logistic回归分析

SPSS学习笔记之——二项Logistic回归分析 一、概述 Logistic回归主要用于因变量为分类变量(如疾病的缓解、不缓解,评比中的好、中、差等)的回归分析,自变量可以为分类变量,也可以为连续变量。他可以从多个自变量中选出对因变量有影响的自变量,并可以给出预测公式用于预测。 因变量为二分类的称为二项logistic回归,因变量为多分类的称为多元logistic回归。 下面学习一下Odds、OR、RR的概念: 在病例对照研究中,可以画出下列的四格表: ------------------------------------------------------ 暴露因素病例对照 ----------------------------------------------------- 暴露 a b 非暴露 c d ----------------------------------------------- Odds:称为比值、比数,是指某事件发生的可能性(概率)与不发生的可能性(概率)之比。在病例对照研究中病例组的暴露比值为: odds1 = (a/(a+c))/(c(a+c)) = a/c, 对照组的暴露比值为: odds2 = (b/(b+d))/(d/(b+d)) = b/d OR:比值比,为:病例组的暴露比值(odds1)/对照组的暴露比值(odds2) = ad/bc 换一种角度,暴露组的疾病发生比值: odds1 = (a/(a+b))/(b(a+b)) = a/b 非暴露组的疾病发生比值: odds2 = (c/(c+d))/(d/(c+d)) = c/d OR = odds1/odds2 = ad/bc 与之前的结果一致。 OR的含义与相对危险度相同,指暴露组的疾病危险性为非暴露组的多少倍。OR>1说明疾病的危险度因暴露而增加,暴露与疾病之间为“正”关联;OR<1说明疾病的危险度因暴露而减少,暴露与疾病之间为“负”关联。还应计算OR的置信区间,若区间跨1,一般说明该因素无意义。 关联强度大致如下: ------------------------------------------------------ OR值联系强度 ------------------------------------------------------ 0.9-1.0 1.0-1.1 无 0.7-0.8 1.2-1.4 弱(前者为负关联,后者为正关联) 0.4-0.6 1.5-2.9 中等(同上) 0.1-0.3 3.0-9.0 强(同上) <0.1 10.0以上很强(同上) ------------------------------------------------------

Logistic回归分析报告结果解读分析

Logistic 回归分析报告结果解读分析 Logistic 回归常用于分析二分类因变量(如存活和死亡、患病和未患病等)与多个自变量的关系。比较常用的情形是分析危险因素与是否发生某疾病相关联。例如,若探讨胃癌的危险因素,可以选择两组人群,一组是胃癌组,一组是非胃癌组,两组人群有不同的临床表现和生活方式等,因变量就为有或无胃癌,即“是” 或“否”,为二分类变量,自变量包括年龄、性别、饮食习惯、是否幽门螺杆菌感染等。自变量既可以是连续变量,也可以为分类变量。通过Logistic 回归分析,就可以大致了解胃癌的危险因素。 Logistic 回归与多元线性回归有很多相同之处,但最大的区别就在于他们的因变量不同。多元线性回归的因变量为连续变量;Logistic 回归的因变量为二分类变量或多分类变量,但二分类变量更常用,也更加容易解释。 1. Logistic 回归的用法 一般而言,Logistic回归有两大用途,首先是寻找危险因素,如上文的例子,找出与胃癌相关的危险因素;其次是用于预测,我们可以根据建立的Logistic 回归模型,预测在不同的自变量情况下,发生某病或某种情况的概率(包括风险评分的建立)。 2. 用Logistic回归估计危险度 所谓相对危险度(risk ratio,RR)是用来描述某一因素不同状态发生疾病(或其它结局)危险程度的 比值。Logistic回归给出的OR(odds ratio)值与相对危险度类似,常用来表示相对于某一人群,另一人群发生终点事件的风险超出或减少的程度。如不同性别的胃癌发生危险不同,通过Logistic回归可以求出危险度的具体数值,例如1.7,

二分类Logistic回归的详细SPSS操作

SPSS操作:二分类Logistic回归 作者:张耀文 1、问题与数据 某呼吸内科医生拟探讨吸烟与肺癌发生之间的关系,开展了一项成组设计的病例对照研究。选择该科室内肺癌患者为病例组,选择医院内其它科室的非肺癌患者为对照组。通过查阅病历、问卷调查的方式收集了病例组和对照组的以下信息:性别、年龄、BMI、COPD病史和是否吸烟。变量的赋值和部分原始数据见表1和表2。该医生应该如何分析? 表1. 肺癌危险因素分析研究的变量与赋值 表2. 部分原始数据 ID gender age BMI COPD smoke cancer 1 0 34 0 1 1 0 2 1 32 0 1 0 1 3 0 27 0 1 1 1 4 1 28 0 1 1 0 5 1 29 0 1 0 0 6 0 60 0 2 0 0 7 1 29 0 0 1 1 8 1 29 1 1 1 1 9 1 37 0 1 0 0 10 0 17 0 0 0 0 11 0 20 0 0 1 1 12 1 35 0 0 0 0 13 0 17 1 0 1 1

………………… 2、对数据结构的分析 该设计中,因变量为二分类,自变量(病例对照研究中称为暴露因素)有二分类变量(性别、BMI和是否吸烟)、连续变量(年龄)和有序多分类变量(COPD 病史)。要探讨二分类因变量与自变量之间的关系,应采用二分类Logistic回归模型进行分析。 在进行二分类Logistic回归(包括其它Logistic回归)分析前,如果样本不多而变量较多,建议先通过单变量分析(t检验、卡方检验等)考察所有自变量与因变量之间的关系,筛掉一些可能无意义的变量,再进行多因素分析,这样可以保证结果更加可靠。即使样本足够大,也不建议直接把所有的变量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各个变量之间的相互关系,确定自变量进入方程的形式,这样才能有效的进行分析。 本例中单变量分析的结果见表3(常作为研究报告或论文中的表1)。 表3. 病例组和对照组暴露因素的单因素比较 病例组(n=85)对照组(n=259) χ2 /t统计量P 性别,男(%)56 (65.9) 126 (48.6) 7.629 <0.01 年龄(岁),x± s40.3 ±14.0 38.6 ±12.4 1.081 0.28 BMI,n (%) 正常48 (56.5) 137 (52.9) 0.329 0.57 超重或肥胖37 (43.5) 122 (47.1) COPD病史,n (%) 无21 (24.7) 114 (44.0) 14.123 <0.01 轻中度24 (28.2) 75 (29.0) 重度40 (47.1) 70 (27.0) 是否吸烟,n(%) 否18 (21.2) 106 (40.9) 10.829 <0.01 是67 (78.8) 153 (59.1) 单因素分析中,病例组和对照组之间的差异有统计学意义的自变量包括:性别、COPD病史和是否吸烟。 此时,应当考虑应该将哪些自变量纳入Logistic回归模型。一般情况下,建议纳入的变量有:1)单因素分析差异有统计学意义的变量(此时,最好将P值放宽一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)单因素分析时,

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