水信息学概述

水信息学概述
水信息学概述

科技信息综述

水信息学概述

李树平

提要 水信息学是一门崭新的学科,它是信息技术与传统水环境科技相结合的产物,其研究和应用领域广泛,内容丰富。从计算模型、决策支持系统、人工智能、地理信息系统和软件工程5个方面简要阐述了信息技术对水环境科技所带来的巨大作用。

关键词 水信息学 信息 科学技术 水环境

0 引言

地球上的水在太阳能的作用下,不断蒸发而形成水汽,上升到高空,随大气运动而散布到各处。这种水汽如遇适当条件与环境,则凝结而成降水,下落到地面。到达地面的雨水,除部分为植物截留并蒸发外,一部分沿地面流动成为地面径流,一部分渗入地下沿含水层流动成为地下径流,最后,它们之中的大部分都流归大海。然后又重新蒸发,继续凝结形成降水,运转流动,往复不停。这种过程,称为自然界的水分循环。良好的水分循环为地球上的生物提供了赖以生存的水环境。但是以往,在认为“水是用之不尽、取之不竭”的观念下,人类对水过分索取和无休止的开发利用,加上其它环境问题,使得水环境出现了不利于生物生存的恶劣情况。例如降水中的酸雨、湖泊的富营养化、河流的水质恶化、近海的赤潮现象等。幸运的是,现在已从这些惨痛的教训中意识到了保护和改善环境,尤其是水环境的重要性。为了保障社会、经济和环境的可持续发展,对水环境已从局部治理发展为区域治理、从单项治理发展为综合整治,即对区域规划、资源利用、能源改造和有害物质净化处理等多种因素进行综合考虑,以便求得整体上的最优整治方案。在区域水环境治理过程中,需要运用系统工程的理论和方法及电子计算机技术,从整个河流、湖泊、海洋和给水排水系统的范围出发,将区域规划、水资源的有效利用和污水治理等诸因素进行综合的系统分析,建立各种模拟试验的数学模式,寻求水污染控制的设计和管理的最优化方案。

在水的研究和利用中,存在着许多彼此独立而又相互联系的科学和工程学科,例如水力学、冰川学、水文学、湖沼学、海洋学、水利工程学、给水排水工程学等。几乎在所有这些与水相关的科学和工程技术中,还存在着许多经验方程式,有些是理论性的,有些是由试验数据拟合的。水环境科技人员可以通过选择合适试验方法和最优量测过程,对原始量测数据进行再加工,从而最大限度地提取物理、化学、生物、地理、气象、水文、地质等方面的相关信息,用于水科学的研究和水工程的运行、调度、优化和预测。随着计算机科学、应用数学和统计学方法在水环境管理中应用的日益广泛和深入,一门崭新的水环境分支学科———水信息学(Hydroinformatics)诞生了[1]。

水信息学出现于20世纪80年代初期,直到1989年,才出现Hydroinformatics的名称。1991年M.B.Abbott教授的专著《Hyroinformatics:Informa2 tion Technology and the Aquatic Environment》的出版标志了水信息学的正式诞生。到目前为止,水信息学已在亚洲、欧洲和北美的11所大学讲授。水信息学具有自己的专门期刊《Journal of Hydroinfor2 matics》(1999年创刊,由IWA和IAHR联合出版),以及两年一次的国际学术会议“International Con2 ference on Hydroinformatics”。目前已召开了4次有关水信息学的国际学术会议,它们分别是:1994年9月19日~23日在荷兰代夫特、1996年9月9日~13日在瑞士苏黎世、1998年8月24日~26日在丹麦哥本哈根,以及2000年7月23日~27日在美国衣阿华[2,3]。

一般意义上,水信息学是研究与水环境相关数据的收集、处理、存储、传布、分析和图形显示等的学科,它通过综合数学、计算机科学和传统水环境科学

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和工程学的方法,来揭示大量复杂的水环境科技奥秘,解决水环境科技难题[2]。水信息学的研究和应用领域极为广泛,内容非常丰富,包括数据的获取和分析(例如SCADA、遥感、遥测、数据模型、数据管理和数据库技术)、先进的数值分析方法和技术(例如一维、二维和三维计算机水力、水质和水生生态模型,参数估计和过程识别)、控制技术和决策支持(例如基于模型控制、不确定性处理、决策支持系统、分布影响评价和决策、Internet和Intranet)、标准软件的开发(例如海岸和河口污染扩散的过程分析、水资源的流域管理、城市给水排水系统、计算机辅助教学软件),以及最近出现的新技术的应用(例如进化算法、神经网络、模糊逻辑、分布和扩散模型、面向对象和代理)等[3~6]。

1 计算模型

由于数值模拟具有准、快、经济,能再现大规模水力、水质现象等优点,已被广泛用于河流、湖泊、海湾(港口)等较大水域上。20世纪60年代后,由于环境问题日益受到重视,以数值计算为基础的环境水力学得到了蓬勃发展,已将处理范围从一维发展到二维计算,从守恒类物质发展到非守恒类物质的计算;模型模拟的数值分析方法从有限差分到有限元,从解决欧拉方程到拉格朗日方程[7]。

水环境中具有许多产汇流、洪水运动、泥沙输运和污染物转移等动态的过程(包括物理过程、化学过程、物理化学过程、生物过程、生物化学过程等),如果以动态分析方法来描述,这会更加接近客观实际情况,使得研究趋于定量化和精密化。例如,在给水或污水系统中,由于原水的水质、水量一般都在不断变化,再加上其它一些可变因素,致使处理系统的运行过程始终处于非稳定状态。对此如果按照传统带有若干假定条件的静态分析方法进行研究,则无法真实地描述系统的运行状态,继而无法进行令人满意的系统预测、调节和控制等。而只有客观的动态分析,建立以联立微分方程组为基础的动态数学模型来说明各个状态变量之间的关系,才能做到客观准确的描述[8]。

数学模型和计算机求解是解决庞大复杂系统/过程的定量分析问题所不可缺少的手段。这不仅能节省大量人力物力,而且由于这类问题的影响因素繁多,很难甚至无法用试验方法来模拟。例如,与给水有关的水源及与排水有关的受纳水体的水质模型、城市给水排水系统的规划模型等,由于它们的开放性、庞大性、复杂性和随机性,用缩小比例尺的实物模型的模拟试验方法显然是不现实的,并且也难以达到相当的真实性[9]。

为使这种非实物的数学模型能够尽可能真实而准确地描述真实体,必须用计算机进行模拟和求解,最后配合必要的现场和实物的测试分析加以验证,建立起能够代替真实系统的模型。

2 决策支持系统

决策就是面对实际的问题(其中常常包含某种形式的不确定性因素),为了实现一定的目标,运用科学分析的方法(主要是信息分析方法)来解决问题,确定相应行动对策的一个过程。决策的结果总是与决策者的利益密切相关,决策的准则就是要使决策者获得尽可能大的利益,或者遭受尽可能小的损失。因此决策者通过制定决策,来实施系统的控制和优化[10]。

决策支持系统(Decision Support System,DSS)是一个交互式的计算机基本的系统,是在大量实测数据信息基础上,利用数据库、模型库和方法库以及很好的人机交互部件和图形部件,帮助各级决策者实现科学决策的系统[11]

图1 决策支持系统的一般结构

由图1可以看出,决策支持系统的信息来自于实测数据源。决策支持系统包含有一些库,如数据库、模型方法库。有时模型方法库分开为模型库和方法库。决策支持系统具有信息处理器。决策支持

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系统由输出接口产生一些报告、模拟结果以及查询结果,用以支持决策的4个阶段,即情报阶段、设计阶段、选择阶段和评价阶段。

随着水环境工程和技术的复杂化、大型化与精密化,以及水资源规划、水污染控制规划等科学化和综合化,使得一个决策、方案、设计和管理水平的优劣,对经济效益产生重大影响。通过应用最优化设计的决策支持系统能够保证水环境工程质量并尽可能降低基建费用,通过最优条件控制的决策支持系统能够保证水利、给水与排水系统的安全可靠性并尽量减少运行费用。目前这方面的研究和实践越来越多。

3 人工智能

通过机器实现对人类行为的模仿,已经有很长的历史了。随着电子计算机的出现,对人类智能,尤其是认知过程的模仿和了解,进行了很多尝试。若从1956年正式提出人工智能学科算起,已有40多年的历史。人工智能或机器智能就是人所赋予机器的一种智能,即机器在一定的环境下针对一定的问题,为了一定的目的而成功地获得、处理和利用信息来解决问题的能力。在人工智能中的研究领域包括语言处理、自动定理证明、智能数据检索系统、视觉系统、问题求解、人工智能方法和程序,以及自动程序设计等[12]。

其中专家系统是人工智能应用研究的最活跃和最广泛的领域之一。一般地说,专家系统是一个智能计算机系统,其内部具有大量专家水平的某个领域知识与经验,能够利用专家的知识和解决问题的方法来解决该领域的问题。也就是说,专家系统是一个具有大量专门知识与经验的程序系统,它应用人工智能技术,根据某个领域一个或多个人类专家提供的知识和经验进行推理和判断,模拟人类专家的决策过程,以解决那些必须依靠专家决定的复杂问题。

发展专家系统的关键是表达和使用专家知识,即来自人类专家并已被证明对解决有关领域内的典型问题是有用的事实和过程。专家系统和计算机程序最本质的不同之处在于专家系统所要解决的问题一般没有算法解,并且经常要在不完全、不精确或不确定的信息基础上做出结论。专家系统可以解决的问题一般包括解释、预测、诊断、设计、规划、修理、指导和控制等。

专家系统的主要组成部分通常包括用于存储某领域专家系统的专门知识的知识库;用于存储领域或问题的初始数据和存储推理过程中得到的中间数据的综合数据库;用于记忆所采用的规则和控制策略程序,使整个专家系统能够以逻辑方式协调工作的推理机;能够向用户解释专家系统行为的解释器;以及使系统与用户进行对话的接口等。

在过去20年中,英国Surrey大学为了使水环境的管理得到加强,紧密与欧盟国家中的水环境科技人员合作,开发了许多知识库专家系统。20世纪80年代,Surrey大学把K B ES(Knowledge2Based Ex2 pert System,知识库专家系统)技术应用到英国的水工业中。第一个K B ES是作为Wallingford雨水管道软件包(Wallingford Storm Sewer Package, WASSP)的参考(advisor),称作WASSP智能前端(WASSP Intelligent Front End,WIFE)。该系统包含在排水管道修复规划专家系统(Sewerage Reha2 bilitation Planning Expert System,SERPES)中,有效地协助了城市排水管网的WASSP模拟模型的开发。SERPES通过模拟模型的建立、运行和求解来对城市排水管网进行技术经济性分析。同时在开发的另一个专家系统是给水管网控制专家系统(Water Distribution Network Control Expert System, WADN ES),其目的是通过应用K B ES技术来有效控制输配水管网的紧急反常情况(例如水泵系统出现故障等)。其后又开发了水工业专家系统环境(Water Industry Expert Systems Environment, WIESSE),并由此进一步发展成两个专家系统:一个用于预测蓄水池的藻类生长情况,另一个用于观察和维护近海结构。

4 地理信息系统

地理信息系统(G eographic Information System, GIS)是容计算机图形和数据库于一体,储存和处理空间信息的高新技术,它把地理位置和相关属性有机结合起来,能够根据实际需要准确真实、图文并茂地输出信息给用户,用以满足城市、企业管理、居民生活对空间信息的要求,并借助其独特的空间分析功能和可视化表达,进行各种辅助决策。GIS的这

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些特点使之成为与传统方法迥然不同的解决问题的先进手段。它作为现代社会必不可少的基础设施,已渗透到生产生活的每一细节[13]。

水环境管理所需的各种数据是建立在空间数据基础上的。例如,要解决居民区的供水问题,首先要知道附近的所有供水网络的分布、供水管线的粗细,以及现有管线荷载程度,是否需要敷设新的管线以及如何敷设,并解决工程中与其它管线之间的矛盾等,这些都需要有确切的空间定位图形的显示和空间定位数据的查询。

使用GIS,通过图形支持、工序处理和流量模型,用户可以有效地对雨水和污水的排放设施进行维护和分析。使用属性数据库,可以定期更新工作部署,做好数据库维护工作。通过空间数据和属性数据之间的连接,可追踪有害物质的排放和追溯上游的污染源,并及时通知将会受到污染的单位。

GIS软件可以绘制水系分布图,并且把图上各个要素和数据库连接起来,包括水库、渠道、设备等。GIS的智能型数据库使得工作规划、设备管理和流向分析自动化。还可以把现有网络模型连入GIS,同时有属性数据相连接,并绘制出结果图。在水利方面GIS的应用包括:网络压力和流向分析;渗透监测和水流失分析;工作部署和工序处理;产生和维护底图等。

5 软件工程

对于水环境科技人员,不管是工作站还是单机系统,计算机是一种能迅速处理大量数据的数值操作工具。数值操作的结果仍然是大量的数据,可是从这些数据中提取分析出有用的信息是很困难的。例如,原始数据和计算结果的简单列表是不会体现出多少直观内容的。但是,如果配合上高效的二维或三维图形界面,并具有适当的声音、动画技术,加上简要的结论,将会大大方便科技人员的工作。

另外,计算机用户并不需要知道计算机软件处理数据信息的具体算法,这部分内容常以“暗箱”方式处理,这样用户对软件中数据的输入具有操作上的风险,如果输入非法数据可能会带来灾难性后果。因此,在软件开发和使用过程中,必须注意怎样控制数据的可靠性和正确性。

以上情况应是在软件工程中考虑的内容。软件工程是指应用计算机科学、数学及管理科学等原理,以工程化的原则和方法来解决软件问题的工程。其目的是提高软件生产率、提高软件质量、降低软件成本、满足用户需求[14]。

软件工程和远程通信的发展有助于解决许多水环境管理问题,包括从水环境系统的设计到实时控制。软件工程的重要性成为许多商业软件发展的基础。例如HR Wallingford,Danish Hydraulic Institute (DHI)和Delft Hydraulics,它们都是具有能够承担国际大型工程的著名的水力实验室,都有自己的软件产品加工厂,包括对软件产品的版本控制、调试协议、α和β测试程序、分发协议、热线支持、用户组等,并根据时间和资金状况对软件系统的开发进度进行控制[15]。

为解决水力、水文和水资源管理方面的问题,用户通过对软件提出功能需求,开发人员通过软件功能分析,共同促进了水环境软件产品的发展。目前国际上流行的水环境软件产品有HP Wallingford的Hydro Works,DHI的MOUSE和M I KE11,Heastad Method Inc.的WaterCAD,SewerCAD,StormCAD 等,它们成功地达到了商业办公系统的标准,在全世界水环境软件市场占有相当大的比例。这些产品的明显特征是使用了高级图形用户界面,其数据输入设备包括视窗、图标、菜单、数字化仪等,同时图形具有随意移动和进行各种比例变化的功能。

在引进国外成熟软件系统的同时,也应该大力开发适合我国国情的水环境专业软件系统。在水环境专业领域,由于国内外设计规范、设计标准、设计方法、管理思想以及用户的要求、价格、人员的培训、软件维护等方面的不同,使得国外的软件系统在国内难以推广和应用[16]。目前我国许多高校、科研院所已经对这种情况十分重视。

在开发软件时还需要制定一整套测试软件系统的程序。例如在排水管道系统优化设计方面,出现了线性规划、非线性规划、动态规划、逆差动态规划、遗传算法等计算方法[17]。从已有文献来看,由于设计规范、设计标准等的时效性,导致这些方法在采用算例以及套用约束条件时不尽相同,使这些计算方法的比较不太充分。因此对于各种计算方法的实用性、可靠性以及计算复杂性需要制定统一的标准来

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验证,以便提高软件在科研和工程应用中的质量。

6 结束语

水信息学是信息科技与传统水环境科技相结合的产物。以上仅对计算模型、决策支持系统、人工智能、地理信息系统和软件工程进行了简要描述,其它方面例如SCADA、遥感遥测技术对数据的采集和定位,计算机网络对跨时间和跨空间资料的传递,以及与纸张的线性形式存储信息相异的超链接电子文档等也是十分重要的。水信息系统不仅包含了数据收集、存储、处理、分析和图像现实的方法,也使用了高深的模型、优化和基于知识的工具和系统。其目的是帮助更好地认识水环境运动规律,减少水环境研究和管理的费用,提高决策的正确性和有效性,使信息科技在水环境的研究和管理中发挥巨大的作用。它作为一门崭新的学科,还在不断地成长,不断地完善和发展。

当前我国水信息学的发展任重而道远。与国外相比,我国在水信息学方面投入的人力、物力和财力上还具有很大差距。我国目前还很少有人对水信息学进行系统的描述,尽管信息科技已广泛应用于河流、汇水流域的模型、水文风险分析、洪水风险评估、土壤和地下水污染的评估管理补救、水源保护等领域。另外国内成熟的水环境科技领域大型商用软件还不多见,应用中的计算机软硬件技术大多是引进国外的,或者还处于研制阶段。再者,对于水信息学的应用,还需要一大批既懂水环境专业知识,又懂信息科技知识的人才,我国这方面的人才严重短缺。

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○作者通讯处:200002上海市北京东路江西中路421号

上海市苏州河综合整治建设有限公司 电话:(021)63297006Ο2045

 收稿日期:2001Ο8Ο3

启事

《给水排水》2001年合订本已出版,每本定价92元。另有少量的1995年(58元),1999年(92元),2000年(92元)合订本(以上价格均含邮费)。需要的读者请从邮局直接汇款到我部订购。

《给水排水》编辑部

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WATER&WASTEWATER ENGINEERING Vol128No14April2002

integrated wastewater discharge standard G B8978296.In this paper the design and operation of this process are presented.

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Design of the Super Large W ater Scenery in the E ast R ail w ay Station of G u angzhou He Fang(45) Abstract:Various technical problems and design parameters to construct a super large artificial waterfall could be solved and determined best by an established real shape hydraulic model.Unfortunately the real shape model is absent because of limitations.A correlation curve between the water head before the weir and falling height was proposed according to the practical condition of the water scenery project in the East Railway Station of Guangzhou,the values of responsible parameters were given on empirical basis.

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Portable and Fire W ater Supplies in Sm all High2Rise R esidential Q u arter Yang Hui et al(57) Abstract:S ome layout options of portable and fire water systems suitable for small high2rise residential quarters are presented.By comparisons it is believed that the system with shared pump assembles of portable and fire water systems is more reasonable.

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R eform of Pumping H ouse in Dachong W aterw orks for E nergy S aving Quan Jiping et al(65) Abstract:There are two pumping houses,new and old in Dachong Waterworks.They are the biggest electricity consumers in the waterworks.Pumping assemblies in both pumping houses have been modified to increase the efficien2 cies.The technical measures such as adoption of new machine and pump impeller cutting and their effect on energy sav2 ing are reviewed.All these show that the potentials of energy saving are laid on the pumping facilities optimization in water enterprises.

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Comparison betw een PV C-U Drain with Spiral Muffle and C ast I ron Drain with Flexible Joint Fan Haiyan(68) Abstract:In this paper the characteristics and features of s piral2muffle pipe and clamp2cast iron pipe for building wastewater drainage are described and compared.It is recommended that the cast iron pipe with flexible joint will be preferred for high2rise buildings,residential houses and hotels.However for the restrooms of offices,schools and com2 mercial buildings the PVC-U pipe might be convenient.

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On the Counterclaim in Construction E ngineering Xiao Jinqiao(71) Abstract:Counterclaims in construction engineering are ordinary under the condition of so2called market economy.

As an official owner some demands relating to qualification,property and money could be put forward by them according to the private rights of themselves.This is a frontier science including social and natural sciences,deals with the reason2 able risk re2assignment between the owner and the contractor.In this paper the classification,application programs and necessary attestations for counterclaims are described in detail.

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Study on Autom atic Pressure Control in Sludge Digester Gao Y uan et al(75) Abstract:Methane leakage is observed eventually on sludge digester of concrete structure,because the aperture of the porous formed in the cement condensation is bigger than the diameter of the methane molecule.This means that the airtight of the raw concrete material is poor.In case when the existing tank is difficult to repair,holding low level of methane pressure inside the digester by automatic controller will be the best way to avoid the risk of gas leakage of the tank body.This measures has been applied with good results.

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Program Design of Autom atic Checking System for W ater Q u ality Examination Data Yang Chonghao et al(78) Abstract:This is an important prelude for the technological design of water purification process and a main measure for the quality control of a water examination laboratory.For these in the programming design we adopted the interac2 tive visual system to command the automatic checking of the full water quality examination data.

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On Problems in Design of Autom atic Sprinkling System Xie Sitao et al(85) Abstract:S ome problems in systematic design of automatic sprinkling system such as the economic flow velocity, fire water tank and pressure boost,layout of nozzles and hydraulic calculation are discussed and personal opinions are pro2 posed around the responsible stipulations in the National Design Norm of Automatic Sprinkling System(G B50084-

2001).

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I ntroduction on H ydroinform atics L i S huping(90)

Abstract:Hydroinformaics is a new field with abundant contents and wide range in scientific research and applica2 tion.It is a combination of modern informatics and traditional science and technology of aquatic environment.The tremendous advances of informatics on the science of aquatic environment are explained by five aspects as mathematic model,decision supporting system,artificial intelligence,GIS and software engineering.

生物信息学软件及使用概述

生物信息学软件及使 刘吉平 liujiping@https://www.360docs.net/doc/df6513492.html, 用概述 生 物秀-专心做生物! w w w .b b i o o .c o m

生物信息学是一门新兴的交叉学生物信息学的概念: 科,它将数学和计算机知识应用于生物学,以获取、加工、存储、分类、检索与分析生物大分子的信息,从而理解这些信息的生物学意义。 生 物秀-专心做生物! w w w .b b i o o .c o m

分析和处理实验数据和公共数据,生物信息学软件主要功能 1.2.提示、指导、替代实验操作,利用对实验数据的分析所得的结论设计下一阶段的实验 3.实验数据的自动化管理 4.寻找、预测新基因及其结构、功能 5.蛋白质高级结构及功能预测(三维建模,目前研究的焦点和难点) 生 物秀-专心做生物! w w w .b b i o o .c o m

功能1. 分析和处理实验数据和公共数据,加快研究进度,缩短科研时间 ?核酸:序列同源性比较,分子进化树构建,结构信息分析,包括基元(Motif)、酶切点、重复片断、碱基组成和分布、开放阅读框(ORF ),蛋白编码区(CDS )及外显子预测、RNA 二级结构预测、DNA 片段的拼接; ?蛋白:序列同源性比较,结构信息分析(包括Motif ,限制酶切点,内部重复序列的查找,氨基酸残基组成及其亲水性及疏水性分析),等电点及二级结构预测等等; ?本地序列与公共序列的联接,成果扩大。 生 物秀-专心做生物! w w w .b b i o o .c o m

Antheprot 5.0 Dot Plot 点阵图 Dot plot 点阵图能够揭示多个局部相似性的复杂关系 生 物秀-专心做生物! w w w .b b i o o .c o m

医学信息学基本概念与定义-医学信息学基本概念(精)

医学信息学基本概念 J C Wyatt, J L Y Liu. 文研究生周琴译导师许培扬审 摘要:本文是关于医学信息学,这门年轻的学科的术语的定义汇编。希望它对行业内的初学者与职业工作者能有所益处。 关键词:医学信息学词汇表 医学信息学主要研究与应用方法去改善对病人信息、临床知识、人口信息和其它与病人康复与公共卫生有关的信息的管理。它是一门伴随19世纪40年代数字计算机的出现而产生的年轻学科。用于医学的机械性计算起源于更早的年代,在19世纪,赫尔曼霍列瑞斯的“打卡数字处理系统”即开始用于美国人口普查,随后又被用于公共卫生与流行病学调查1。此例反应了医学信息学的多学科性,它与各个不同的领域都有相关性,包含临床医学、公共卫生学(如流行病学与卫生服务研究)、认知科学、计算和信息学。 由于医学信息学工作者的领域多样,新来者很容易混淆行业的专业术语。因此,对想更多了解医学信息学的人做一个医学信息学的基本概念的介绍是有用的。近几年,关于此学科的各种不同分支开始出现,包括公共卫生信息学、用户卫生信息学与临床信息学。对于医学信息学与它的分支学科是否是不同的学科的讨论,Shortliffe 和Ozbolt认为:“信息学的基础是一系列可重复利用与广泛应用的方法,它对所有的卫生学学科都适用,并且‘医学信息学’对于一个综合性核心学科是一个有用的概念,所有的学生都应该学习,不管这些学生的医学专业方向。”2 3以下对医学信息学的分支学科的定义反应了这一理念。 挑选医学信息学术语的标准,在挑选某术语时采用了以下一条或者多条原则: ●对流行病学家和公共卫生专家而言是新出现的词语。 ●一个有众所周知含义的术语,被用于医学信息学领域的具体方面。 ●与流行病学或公共卫生相关的概念。 ●对理解医学信息学必不可少的概念。 ●一个存在时间较长,而不是过渡性的专业术语。 ●在对此术语的意义与使用上有普遍的共识。

医学信息学概论大纲

医学信息学教学大纲 (信息管理与信息系统专业本科专业用) 课程编号: 英文名称:medical informatics 先修课程:医学信息学概论 后续课程: 课程性质:学科专业课 总学时数:72学时;理论学时:64学时;实验学时:8学时;上机学时: 课外实践:其他学时:考核性质:考试;学分:4学分; 一、课程简介 医学信息学是研究生物医学信息、数据和知识的存储、检索并有效利用,以便在卫生管理、临床控制和知识分析过程中作出决策和解决问题的科学。它是信息科学与生物医学的交叉学科,应用领域十分广泛,遍及临床医学、预防医学、基础医学和人类健康的每一个角落。本课程的教学目的是掌握当今医学信息系统的主要组成、主要功能技术、以及未来发展趋势。 二、教学组织与方法 本课程在学院教务处与基础医学院统一组织下实施教学。在教研室主任的领导下,根据教学任务成立教学小组,设组长一名,按大纲要求组织安排教学活动。本课程主要采用启发式教学方法,增加师生互动环节,以增强教学效果、提高教学质量。 三、理论教学 教学内容及学时分配

第一章绪论 【目的要求】 1.了解:医学信息学的概念 2.熟悉:医学信息学的主要研究进展,医学信息技术的种类 3.掌握:医学信息学的研究内容 【教学内容】 1.了解:医学信息学的发展历史 2.熟悉:医学信息学的研究进展 3.掌握:医学信息学的研究内容 【计划学时】4学时 第二章信息学基础 【目的要求】 1.了解:计算机软件技术的种类、计算机网络种类、信息处理包括的内容、数字媒体 的应用、信息系统的种类和发展趋势 2.熟悉:信息技术包括的内容、信息资源的特征和所遵循的原则 3.掌握:数据库组成部分,DBMS的基本功能;规划和设计数据库的方法 【教学内容】 1. 计算机及其网络 2. 信息资源与数字媒体 3.信息系统与数据库 4.知识管理与知识发现 【计划学时】8学时 第三章医院管理信息系统 【目的要求】 1.了解:什么是医院信息系统,建设医院信息系统的意义 2.熟悉:医院信息系统的功能;医院信息系统的建设原则;建设医院信息系统要注意的策略问题

生物信息学概论

2013/5/23
生物信息学概论
2013-5
提纲
1. 发展简史 2. 主要研究领域 3. 软件和工具
1. 发展简史
1946年 1946 年
美国生产出第一台全自动电子数字计算机“埃尼阿克”
1

2013/5/23
1. 发展简史
1955年 1955 年
Frederick Sanger determined the complete amino acid sequence of insulin in 1955 and earned him his first Nobel prize in Chemistry in 1958.
1. 发展简史
1965年 1965 年
The first Atlas of Protein Sequence and Structure contained sequence information on 65 proteins.
Dr. Margaret Oakley Dayhoff (1925-1983) was a pioneer in the use of computers in chemistry and biology, beginning with her PhD thesis project in 1948. Her work was multi-disciplinary, and used her knowledge of chemistry, mathematics, biology and computer science to develop an entirely new field. She is credited today as a founder of the field of Bioinformatics.
1. 发展简史
1965年 1965 年
First use of molecular sequences for evolutionary studies
One of the founding fathers of the field of molecular evolution
Zuckerkandl, E. and Pauling, L. (1965). "Molecules as documents of evolutionary history." Journal of theoretical biology 8(2): 357.
2

医学信息学模拟试卷

全国医疗卫生信息技术职业技能培训与认证考试实用医学信息学模拟试卷一、单项选择题(共30题,2分/题,合计60分)1、信息系统的组成不包括下列哪一项:()A.信源B.载体C.信宿D.信道2、下列哪一项反映了护理信息的流程,是护理信息系统的框架:() A.护理诊断 B.护理程序 C.护理计划 D.护理评价3、关于信息的正确概念是:()A.信息是数据的素材B.信息是数据的载体C.信息是对人有用的数据D.信息是一种特殊的物质4、下列哪一项表示"国际医学信息学会"()A.CMIA B.IMIA C.WHO D.ISO 5、关于"标准"的正确概念是:()A.是针对现存的潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,其宗旨是使该环境达到最佳有序度。B.是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件。其宗旨是使该环境达到最佳有序度。C.是负责为公共和常用事物的活动及结果划定和提供规则、指导原则的权威机构。D.是国际化的标准组织。6、关于数据的正确概念是:()A.数据是对人有用的信息B.数据是信息的载体C.数据是特殊的一种物质D.数据是一种特殊的能量7、在标准化遵循的原理中,下列各项中不正确的是:()A.简化统一的原理B."一致同意"的原理C.定期修改的原理D.自觉实行的原理8、关于"标准化"的正确概念是:()A.是针对现存的潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,其宗旨是使该环境达到最佳有序度B.是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件。其宗旨是使该环境达到最佳有序度C.是负责为公共和常用事物的活动及结果划定和提供规则、指导原则的权威机构D.是国际化的标准组织9、关于SNOMED的结构特点,错误的是:()A.具有11个独立的系统模块B.术语按自然层次排列,并被分配5或6位代码C.术语之间互相无法连接D.词条索引按照编码顺序排列10、卫生部2002年颁布的《医院信息系统基本功能规范》的外部接口,指下列哪一项()A.医疗保险接口B.社区卫生服务接口C.远程医疗咨询接口D.以上都是11、医嘱实现的流程为4个步骤,下列哪项是正确的() A.录入生成执行确认打印 B.录入确认生成执行打印C.录入确认打印生成执行 D.录入打印确认生成执行12、门急诊挂号子系统的初始化功能是指:() A. 挂号退号功能B. 按病人医生进行查询功能 C. 建立诊类、科室、号类等工作环境参数和字典D. 门诊病历管理功能13、卫生部2002年颁布的《医院信息系统基本功能规范》的外部接口,不包括下列哪一项() A.Internet 接口B.医疗保险接口 C.社区卫生服务接口D.远程医疗咨询接口14、在HIS体系结构中,发展方向是下列哪一种() A.完全集中式(Mainframe)B.完全分布式(PC + Network) C.多层结构 D.集中/分散式(Client/Server) 15、不同程序的功能在一个HIS 中,能被授权的用户使用,该程序集成的方式:() A. 显示集成B. 数据集成C. 功能集成D. 以上都是16、ICD的分类依据是疾病的主要特性,下列哪一特性不是分类依据:()A.病因B.病理C.检验结果D.部位17、ICD分类有3个层次,下列哪一项是"亚目"这一层次的基本特性()A.是三位数编码,包括一个字母和两位数字。B.是四位数编码,包括一个字母、三位数字和一个小数点。C.是五位数编码,包括一个字母、四位数字和一个小数点D.双重分类(星号和剑号分类系统)18、HIS必备的标准化数据字典不包括下列哪一种()A.汉英字典B.治疗、护理项目字典C.国际疾病分类编码D.医院职工编码字典19、知识表达的概念是:()A.从知识源发现、吸取、构造和组织知识,形成知识库的过程。B.知识的形式化和模式化,即知识符号化过程。C.利用计算机技术,进行知识思维求解问题过程。D.利用计算机技术,对知识进行人工移植或机器学习的过程。20、临床决策支持系统(CDSS)组成要素是:()A.医学知识B 病人数据C.具体病例建议D 以上都是21、基于知识库的护理信息系统中,"护理诊断"是采用下述哪个标准:

生物信息学概论复习题

生物信息学概论复习题 一、名词解释: 1.合成生物学 2.蛋白质组学 3.相似性,同一性,同源性 4.直系同源基因,旁系同源基因 5.序列比对 6.生物信息学 7.多序列比对 8.打分矩阵 9.蛋白质同源建模 10.分子钟 11.虚拟细胞 12.蛋白质结构比对 13.EST 14.contig 15.unigene 16.Entrez 17.一级数据库 18.二级数据库 19.系统发育 20.BLAST 21.外类群 22.有根树 23.系统生物学 24.比较蛋白质组学 二、简述题: 1.常用的序列比对软件有哪些?

2.序列比对有哪些用途? 3.蛋白质结构比对? 4.系统生物学与分子生物学的差异和联系? 5.分子进化的中性学说? 6.GO数据库的内容及用途? 7.KEGG数据库的内容及用途? 8.蛋白质组与基因组的差别? 9.蛋白质组的研究内容? 10.列举分离鉴定蛋白质技术有哪些? 11.基因组外显子的组成特征有哪些? 12.NCBI Blast程序有哪些子程序?有何区别? 13.蛋白质数据库有哪些?各自特点是什么? 14.列举可以通过NCBI进行的生物信息学分析。 15.设计引物要遵循哪些原则? 16.知道某蛋白的氨基酸序列后,如何进行各级结构的生物信息学分析? 17.系统发育树的构建步骤是什么? 18.蛋白质有哪些结构层次,如何定义? 19.蛋白质组的特点? 20.双向电泳及其工作原理? 21.构建系统树的主要方法? 22.主要的生物信息数据库有哪些? 三、论述题 1.构建进化树有几种方法?如何选择? 2.第二代测序技术与第一代测序技术相比有什么异同?优势是什么? 3.什么EST序列?得到EST数据后,如何进行生物信息学分析?

医学信息学》教学大纲

《医学信息学》教学大纲 供四年制信息管理与信息系统(医药卫生信息方向)等专业使用) (依据普通高校本科计算机专业特色教材精选) 计算机教研室修订 二00 六年七月一日 、儿、? 一、前言 本课程是信息管理与信息系统(医药卫生信息方向)专业本科学生的专业必修课。 医学信息学是一门以医学信息为主要研究对象,以医学信息的运动规律及应用方法为主要研究内容,以现代化计算机为主要工具,以解决医药工作人员在处理医学信息过程中的各种问题为主要研究目标的新兴学科。医学信息学的供体学科是计算机科学,受体学科是医学科学。 医学信息学是四年制信息管理与信息系统(医药卫生信息方向)专业方向必修专业课之一。 学习本课程要求了解计算机基础知识,先修课程为:大学计算机基础。 本课程教学大纲是《医学信息学》课程的要求编写。章节顺序与《医学信息学》王伟主编,高等教育出版社,2006 年)教材相同。

第一章医学信息学基础 [ 教学内容] 医学信息的基本概念;医学信息的相关概念;医学信息学研究;医学信 息学教育。 [ 教学要求] 1.掌握信息的含义、信息类型的划分、信息的特征与功能、信息与知识、医学信息学的研究对象和研究领域、医学信息学教育的内容。 2.熟悉信息的特征与功能、医学信息学的产生、医学信息学教育的目的。 3.了解医学信息学学科体系、医学信息学研究进展、医学信息学教育的内容、医学信息学教育机构、医学信息学教育的发展现状和趋势。 第二章医学信息标准化 [ 教学内容] 标准化概述;标准的分级、分类和编号;国外医学信息标准化进展;我

国医学信息标准化进展。 [ 教学要求] 1.掌握标准的分类、标准的代号和编号、国际着名医学信息标准、我国医学信息标准化管理。 2. 熟悉标准的分级、国外发达国家医学信息标准化的现状。 3. 了解国际医学信息标准化组织、我国标准化工作的组织与领导、我国医学信息标准的现状。 第三章医学信息有序化 [ 教学内容] 医学信息度量;医学信息有序化的理论基础;信息有序化的基本方法; 自动化整序技术。 [ 教学要求] 1.掌握信息整序的信息科学基础、信息整序的信息检索、网络信息资源。 2.熟悉文献信息计量。

《医学信息学》复习资料

《医学信息学》课程复习提纲 2016年12月 第1章医学信息概述 1、信息、知识的含义;信息的类型与特征。 信息就是对人们有用的数据,这些数据将可能影响到人们的行为与决策。 知识就是人们根据某种目的从客观世界收集得来的资料或数据中,经过大脑思维与整理、概括、提取而得到的有价值的信息。比如说,37就是数据,37度就是信息,37度体温就是知识。 信息的类型 信息的运动状态分:连续信息与离散信息,或动态信息与静态信息 信息产生的客体性质分:自然信息、生物信息与机器信息。 医学信息从信息表现形式分:医学常规数据信息、医学生理信息、医学图像信息与医学知识信息信息的特征:普遍性、寄载性、传递性、表征性、可压缩性、增殖性 2、信息、信号、数据与知识的关系。(P4-5) 消息:就是人们通过各种工具得到的文字、符号、图形、图像、语音。 信号:就是人们通过仪器设备与通信线路得到的电、光或磁的物理量。 数据:就是人们在观察某个事物或对某个对象进行的活动中所记录的事物状态(大小、速度等)的变化量 信息:接收者通过感觉器官所理解得到相关消息、信号与数据的真实含义 知识:就是人们根据某种目的从客观世界收集得来的数据或资料中,经过大脑思维与整理、概括、提取而得到的有价值的信息。 知识就是由信息加工出来的产物,就是一种具有普遍与概括性质的高层次的信息,因此它就是信息的一个特殊的子集 关系:

同一个消息、信号或数据可以包含不同的信息;同一个信息也可以载荷在不同的消息、信号或数据之中 3、医学信息的定义P5、表现形式分类。(P28 信息系统设计) 定义:就是指在医学研究、临床实践与医学管理等过程中所产生的、以及从各种载体中获取的各种形式的信息。这些信息包括文字、数据、表单、图形、影像与声音。 按医学信息表现的形式如何分类:医学常规数据信息、医学生理信息、医学图像信息、医学知识信息 4、医学信息学的主要任务? 5、简述医学信息学产生的理论基础?P8 “老三论”的名称就是? 理论基础:“老三论”上,即信息论(Informatics)、控制论(Cybernetics)与系统论(System Theory) 老三论 信息论。P9,香农 系统论。P10,贝塔朗菲 控制论。 P10,维纳 新三论 耗散结构理论。 P22,普利高津 协同学。 P22,哈肯 突变论。 P22,托姆 第2章医学信息获取及利用 6、如何理解医学信息获取?P26 医学信息的获取必须包含2层含义:一就是信息获取,二就是信息表示 (1)医学信息获取的传统理解 借助某种换能器将医学实体的非电信号转换成医学模拟电信号,再由A/D转换器将模拟电信号转换成医学数字信号的过程定义为医学信息获取。 (2)医学信息获取的广义理解 凡能够采用某种方法得到所需医学信息的过程都称为医学信息获取 7、医学信息表示的含义P26 对于医学领域中各种类型的医学信息,由于获取的方式不同,或直接采集,或使用设备获取,或通过某种算法软件自动生成,因此得到的医学信息形式也各不相同 8、医学信息获取的信息来源 P27 实体型信息源,文献型信息源,电子型信息源,网络型信息源

医学信息学复习题

1、医学信息学的定义? 答:探讨生物学的、医学的或者更广义的健康数据的采集、存储、交互和展观的过程的科学;探讨如何利用信息科技来优化这些过程的科学;以及探讨如何利用这些数据实现信息和知识层次的各种应用的科学。 2、数据、信息、知识三者的区别、关联是什么?请举例说明。 答:数据是原始符号,信息是经过分析的可用的数据,而知识是信息组成的一系列法则和公式。如如说,37是数据,37度是信息,37度体温是知识。 3、医学信息的研究范畴? 答:医学信息学的研究范畴可以概括为四个结构层次: ⑴原始健康数据,比如影像、微阵列、生理数据等。 ⑵从原始健康数据中分析出来的有组织的综合数据库,比如整合起来的基因分类和其 外在表现形态。 ⑶从数据库中抽象出来的知识库,比如词表、术语学、本体库、语义网等。 ⑷从知识库中验证出来的可直接应用的知识结晶和理论,比如协议,临床实用手册,概 论等。 4、什么是医学信息? 答:医学信息是指一切与生命健康科学有关的信息。 5、医学信息管理的定义是什么? 答:医学信息管理是指对医学信息进行搜集、加工、组织、存储、传递、访问、分析、利用、研究的过程,即对医学信息的开发管理和利用。 6、医学信息管理的内容及功能? 答:医学信息学涵盖了从分子到组织、器官、个体、群体的广阔的范围,医学信息管理也就要对这整个范围内的信息以及所涉及的所有方面(患者,医疗卫生机构,医疗卫生财务等)进行管理,并为各有关方面提供服务,大致上,医学信息管理的内容和功能可以分为:医疗记录的管理、医疗质量的管理、患者的管理、医疗卫生机构的管理、医疗卫生财务的管理、为决策者提供支持、为医学科研提供支持。 7、什么是数据挖掘? 答:数据挖掘就是从大量的、不完全的、有噪声的、模糊的、随机的数据中提取隐含在其中的,人们事先不知道的,但又潜在有用的信息和知识的过程。 8、为什么说医学影像在现代医疗活动中的作用越来越重要? 答:随着医学影像学的发展,以前很多认为是功能性疾病的,后来都发现有器质性病变,而器质性病变往往会在影像学上表现出来,所以影像在疾病的诊断上具有举足轻重的作用;另外,治疗仪器的发展,如海扶刀、γ刀、X刀、电子加速器等,可以利用影像数据生成三维治疗计划,从而进行三维适形治疗,提高治疗效果和减少治疗的副作用。所以说医学影像在现代医疗活动中的作用越来越重要了。 9、什么是PACS 系统? 答:PACS系统是Picture Archiving and Communication Systems的缩写,意为影像归档和通信系统。它是应用在医院影像科室的系统,主要的任务就是把日常产生的各种医学影像(包括核磁,CT,超声,各种X光机,各种红外仪、显微仪等设备产生的图像)通过各种接口(模拟,DICOM,网络)以数字化的方式海量保存起来,当需要的时候在一定的授权下能够很快的调回使用,同时增加一些辅助诊断管理功能。它在各种影像设备间传输数据和组织存储数据具有重要作用。 10、图像采集的方式有那几种?请简述其实现原理。 答:①DICOM采集:数字图像直接通过网络实现图像采集,传递和接受影像的双方都采

《医学信息学概论》医学信息学

《医学信息学概论》医学信息学 2、病案编号、方式(P39):病案号是根据病案管理的需求,以编码的方式制定的、有规则的患者身份标识码,人工管理病案阶段的标识码,是一种ID。(病案的唯一标志。收集患者身份证明资料及分配病案号是对每位就诊或者住院的患者做的第一步工作,也是以后获得患者身份证明子资料的唯一途径。)病案编号系统:系列编号(每次就诊给一个新号)、单一编号(在该院内始终一个编号)、系列单一编号(每次给一个号,但每次最后都将旧号归并到新号中) 病案编号的类型:直接数字、字母&数字、关系编号例如199201011092(年月日性别顺序号地区码)、社会安全编号(美国)、家庭编号、冠年编号病案编号的分派:集中分派、分散分派3、目前采用的疾病分类方法(P206):ICD-10(国际疾病分类第十次修订版) 特点:科学性、准确性、完整性、适用性、可操作性 手术操作分类方法(266):ICD-9-CM-3 4、病案管理的含义(P2):病案管理是指对病案物理性质的管理,即对病案资料的回收、整理、装订、编号、归档和提供等工作程序。 5、病案管理人员建立患者姓名索引流程(35):1、患者信息采集2、核对患者身份证明材料3、填写姓名索引卡4、患者姓名索引的保存 6、病案复印要求(51)(不可复印主观资料)死亡病例讨论记录、疑难病例讨论记录、上级医师查房记录、会诊意见、病程记录 7、PDCA(139)(戴明环——全面质量管理的基本方法) Plan(1、分析现状找出问题2、找出造成问题的原因3、找出主要原因4、措施)Do(5、具体实施) Check(6、检查执行情况) Action(7、巩固措施8、对不能标准化处理的问题新处理) 8、病床使用率(163)=报告期内实际占用总床日数同期实际开放总床日数*100%9、病案信息的作用(6)1、医疗作用2、临床研究和临床流行病学研究作用3、教学作用4、医院管理作用5、医疗付款作用10、疾病编码的查找方法(220)

医学信息学考试重点

医学信息学重点 一、填空题 1、PACS(图像存储与传输系统)是picture archiving and communication systems英文的缩写。 2、请列出至少三种常用的图像存储格式。BMP格式、PSD格式、JPEG格式。 3、医学数字图像和通信的国际标准。不同医学成像设备之间进行信息交换必须遵循DICOM (中文名:数字医学图像通信协议)标准。 4、DICOM是Digital Imaging and Communication in Medicine英文的缩写。 5、符合DICOM标准的文件后缀名是.dcm。 6、文献按文献出版形式划分:图书、期刊、特种文献。 7、电子病历(electronic medical records,HER)的定义:以患者为中心,建立一个完整的、终身的、纵向的、多媒体的、包含所有临床信息的记录。 8、计算机软件从应用角度的划分:系统软件、应用软件。 9、计算机语言分类(3类):汇编语言、机器语言、高级语言。 10、社区的含义:由一定数量的人群组成具有共同的地理环境、共同的文化背景与生活方式、共同的利益需求的区域共同体。 11、检索效果的主要评价指标(2个):查全率、查准率。 13、P ACS系统的级别分类(4类):科室内PACS系统、院内图像发布系统、整个医院PACS 系统、基于全院PACS的远程放射医学系统。 13、数据库的含义:能满足某一数据目的或某一数据处理系统需要的一种数据集合。 14、数据库管理系统含义:用于操纵和管理数据库的软件,用于进行建立、使用、维护数据库,简称DBMS。 15、布尔逻辑运算符:AND(与)、OR(或)、NOT(非)、ADJ。 16、(与6题重复)文献按文献出版形式划分:图书、期刊、特种文献。 二、名词解释 1、医院信息系统(hospital information system,HIS)利用计算机软件技术、网络通讯技 术等现代化手段,对医院及其所属部门的人流、物流、财流进行综合管理,对在医疗活动各阶段中产生的数据进行采集、存储、处理、提取、传输、汇总、加工生成各种信息,从而为医院的整体运行提供全面的、自动化的管理及各种服务的信息系统。 2、文献:用文字、图形、符号、声频、视频等技术手段记录人类知识的一种载体,或理 解为固化在一定物质载体上的知识,现在通常理解为图书、期刊等各种出版物的总和。 3、电子健康档案:是人们在健康相关活动中直接形成的具有保存备查价值的电子化历史 记录。 4、疾病监测信息系统:用于实时捕获和分析疾病数据,实现多监测信息系统的无缝连 接,监测并评估疾病发展趋势、确定公共卫生突发事件、指导疾病的预防、控制和救治的互操作信息系统。 5、处方:是指由医师在诊疗活动中为患者开具的,由药师审核、调配、核对,并作为患 者用药凭证的医疗文书。 6、医嘱:医生根据病情和治疗的需要对病人在饮食、用药、化验等方面的指示。 7、远程医疗:计算机技术、远程通信技术与医学科学相结合而产生的一个新兴的综合 应用领域,已经渗透到医学科学的各个领域。 8、数字医学:是经过数字化时代的革命性变化、以数字化技术武装与再造的新医学科 学和新医疗技术。 9、决策支持系统:是一种辅助决策者通过数据、模型和知识,以人机交互方式进行半

生物信息学(第二版)

《精要速览系列-先锋版生物信息学(第二版)》 D.R.Westhead,J.H.Parish & R.M.Twyman 科学出版社2004 A生物信息学概述 相关学习网站https://www.360docs.net/doc/df6513492.html,/inbioinformatics B数据采集 DNA,RNA和蛋白质测序 1.DNA测序原理 DNA中核苷酸的顺序是通过链式终止测序【也称为脱氧测序(dideoxy sequencing)或以发明人命名的Sanger方法】来确定。 2.DNA序列的类型 基因组DNA,是直接从基因组中得到,包括自然状态的基因 复制DNA(copy DNA, cDNA),通过反转录mRNA得到的 重组DNA,包括载体序列如质粒,修饰过的病毒和在实验室使用的其他遗传元件等 3.基因组测序策略 散弹法测序(shotgun sequence)包括随机DNA片段的生成,通过大量片段测序来覆盖整个基因组 克隆重叠群测序(clone contig)DNA片段用推理的方法亚克隆,并且进行系统的测序直到整个序列完成 4.序列质量控制 通过在DNA双链上进行多次读取完成高质量序列数据的测定 可使用如Phred等程序对最初的跟踪数据(trace data)进行碱基识别和质量判断。 载体序列和重复的DNA片段被屏蔽后,使用Phred等程序将序列拼接成重叠群 (contigs),剩下的不一致部分通过人工修饰解决 5.单遍测序 低质量的序列数据可以由单次读段(read)产生(单遍测序,single-pass sequencing)。 尽管不很准确,但单遍测序如ESTs和GSS s,可以低廉的价格快速大量的产生 6.RNA测序 因为有大量的小核苷酸(minor nucleotide)(化学改变的核苷)存在于转移RNA (tRNA)和核糖体RNA(rRNA)中,所以RNA测序不能像DNA测序那样直接进行。 需要用特殊的方法来识别被改变的核苷,包括生化实验,核磁共振谱(NRM spectroscopy)和质谱(MS)技术 7.蛋白质测序 蛋白质序列可以通过DNA序列推断得到,而RNA测序不能提供有关已改变残基或其他类型的翻译后蛋白质修饰(比如剪接或二硫键的形成) 大部分蛋白质测序是通过质谱(MS)技术进行的

医学信息学

第一章 1、医学信息学:是研究生物医学信息、数据和知识的存储、检索并有效利用,以便在卫生管理、临床控制和知识分析过程中作出决策和解决问题的科学。 2、医学信息学的研究内容:医学信息、医学信息技术、医学信息系统。 3、医学信息技术:是用于管理和处理医学信息所采用的各种技术的总称,是人们用来获取信息、传输信息、存储信息、分析和处理信息、显示信息的相关技术,其研究内容涉及科学、技术、工程、以及管理等学科。包括的技术:感测与识别技术、信息传递技术、信息处理与再生技术、信息施用技术。 4、医学信息系统:是结合生物医学和卫生健康的科学理论与方法,应用信息技术解决医疗卫生和健康问题,为临床和管理决策提供支持的系统。常见的医学信息系统有:医院信息系统(HIS)、实验室信息系统(LIS)、临床信息系统(CIS)、图像存储与传输系统(PACS)、公共卫生信息系统(PHIS)、远程医学、信息检索、决策支持系统(DSS)、电子病历(EMR)、电子健康档案(EHR)。 5、医学信息学的主要研究进展有:电子病历被持续关注、电子健康正迅速崛起、数字技术更深入临床、信息系统建设方兴未艾、新兴分支学科快速成长。 第二章 1、知识管理(KM):是以整合及协作方式来促进信息资产的创造、捕获、组织、访问、和使用过程的一门学科。应用:①知识管理在医疗卫生决策中的应用知识获取、知识评估、证据形成②知识管理在临床实践中的应用隐性知识的管理、显性知识的管理、隐性知识交流共享与显性化的管理 2、知识发现:是从数据集中识别出有效的、新颖的、潜在有用的,以及最终可理解的知识的过程。过程:选择、预处理、转换、数据挖掘、解释与评估 第三章 1、医院信息系统:是指利用计算机软硬件技术、网络通讯技术等现代化手段,对医院及其所属各部门的人流、物流、财流进行综合管理,对在医疗活动各阶段中产生的数据进行采集、存储、处理、提取、传输、汇总、加工生成各种信息,从而为医院的整体运行提供全面的、自动化的管理及各种服务的信息系统。 2、建设医院管理信息系统的意义:优化工作流程、提高运营质量、缩短诊疗周期、强化科学管理、节约诊治成本、改变决策方式 3、医院管理信息系统的功能:支持联机事务处理、支持科室级信息的汇总与分析、支持医院决策层对管理信息的需求 4、医院管理信息系统的内容:门急诊管理分系统、住院及病房管理分系统、病案管理分系统、检验信息管理分系统、检查信息管理分系统、药品管理分系统、手术与麻醉管理分系统、血库管理分系统、收费分系统、物资管理分系统、设备管理分系统、经济管理分系统、综合查询统计分系统、患者咨询服务分系统、医疗保险接口、系统工具 5、医院管理信息系统的运行维护的内容:中心机房的维护、软件维护、数据维护、数据字典维护、硬件维护、网络安全管理 第四章 1、医院信息系统(hospital information system,HIS)管理信息系统(hospital management information system,HMIS)临川信息系统(clinical information system,CIS)电子病历(electronic medical records,EMR)护理系统(nursing information system,NIS) 2、电子病历:是以患者为中心建立的一个完整的、终身的、纵向的、多媒体的、包含所有重要临床信息的记录。 3、临床信息系统:是利用信息技术、计算机技术和网络通信技术对患者信息进行采集、存

医学信息学论文

电子健康档案建设的准备阶段评估 引言 21世纪,信息技术的爆炸性发展改变着人们生活、工作的方方面面,全球的经济发展也明显转向以知识密集型产业为主。信息通过良好便捷地记录、储存、调取及分析,才能发挥其重要作用,这在健康信息管理系统的建设与应用中,显得尤为突出。 从20世纪90年代,医疗领域多种形式的电子记录发展起来,其中,电子健康档案(Electronic Health Records,EHRs)技术受到多个国家的青睐。其重要性和优点体现在,EHRs 不仅为医疗团队成员之间提供方便、有效的交流方式,而且涵盖居民生活方式、健康状况、疾病治疗记录、同行评议、医疗事故诉讼证据等全方位健康信息,是提供连续性、动态性、系统性服务的重要依据,有利于提高医疗服务效率和质量。美国把其看做“21世纪医疗建设新标准”,并加大投入力度重点建设。2009年我国的“新医改”提出以建立“居民健康档案”为重点,为发展EHRs及建立覆盖面广的信息网络平台提供了契机。 但与此同时,建立EHRs是一项复杂、浩大的工程,需要较高的设备基础、技术条件及人才资源。本文着重探讨EHRs建设准备阶段评估的重要性及评估要点,为衡量是否具有建立电子健康档案的条件及其质量是否具有较高的质量及应用基础提供依据。 1.方法 本文利用图书馆电子文献数据库资源,以Ebsco全文数据库,ISI web of knowledge,万方数据检索系统为主,以“准备性评估(Readiness Assessment)”“电子健康档案(EHRs)”“应用(implementation)”等为检索词条,并使用参考文献跟踪查阅法,搜集筛选相关文献xx篇作为本文主要信息来源。 2.结果 2.1 准备阶段评估在EHRs应用中的角色 文献显示,准备阶段评估是EHRs应用流程(如图1所示)中的第一步,是建立电子健康档案最基础的阶段。 图1. 电子健康档案(EHRs)建设流程图 准备阶段评估目的在于了解建立完善的EHRs的条件,帮助认识到现阶段条件的局限性,为建立高质量的健康档案提供基础。 2.2 准备阶段评估的主要内容 结合文献,总结归纳,为了下一步计划和开展EHRs的建设,其准备阶段评估应涵盖以下四个方面的内容: 2.2.1 组织文化(Organizational culture)评估 组织文化包括医疗系统、医护人员、相关患者及整体社会大众对EHRs的态度和认知;对患者参与修改和编辑个人信息的流程方法的认知;对建设EHRs项目的发展计划的了解;对使用EHRs各个方面的责任、时限及角色等方面的认识。

信息学概论重点整理

信息学概论 题型:(选择 10分填空 30分名词解释 4分 x 5=20分解答题 5分 x 5=25分论述题 9分计算题 6分) 知识点总结 信息的性质:(1)普遍性 (2)依附性(3)可度量性(4)可识别性 (5)可处理性 (6)可传递性(7)可共享性 信息的类型: 语法信息:主体所感知或所表述的事物运动状态和方式的形式化关系。 语义信息::主体所感知或所表述的事物运动状态和方式的逻辑含义。 语用信息:主体所感知或所表述的事物运动状态和方式相对于某种目的的效用。 信息的作用:1)信息是人类社会生存的条件 2)信息是人类认识世界的媒介 3)信息是重要的、活跃的生产力要素 4) 信息是社会、经济发展的资源 信息技术的发展对信息科学的推动:信息技术就是能够扩展人的信息器官功能的一类技术。具体来说,信息技术是指有关信息的收集、存储、组织、加工处理、传递、利用和服务过程中所涉及的相关技术。信息技术包括通信技术、计算机技术、数据库技术、信息处理技术、多媒体技术、自动控制技术、视频技术和感测技术等。(1)通讯技术(2)计算机技术(3)信息存储技术 通信系统模型 (在Y环境下,x 发生的概论P)

平均互信息量:互信息量的数学期望称 信息熵:是自信息量的数学期望 信息交流有通信、交通、传达、传报、联络之意。不仅包括人与人之间的信息交换,而且也包括动物之间的信息交换。也指人与人之间通过符号传递信息、观念、态度、感情等现象”。所以狭义的信息交流指的是社会中人与人之间的信息交流。 信息交流的模式 模式是用图形或符号对显示事件以及事件之间关系的直观和简洁的描述。 1 申农-韦弗的广义信息交流模式 优缺点:有效性、可靠性,不仅适用于电讯系统,也适用于其他几乎一切类型的信息交流但另一方面,申农-韦弗模式也存在着缺陷。突出地表现在两个方面:其一是它把信息交流描述为一种直线式的过程,;其二是将信息交流过程看作是一个单向的过程。 2 拉斯韦尔的5W模式 优缺点: 贡献 ●第一次详细、科学分解了传播过程,指出传播过程包括5要素:传 者、信息、媒介、受着、效果。 ●明确传播学的研究领域:即从5W着眼,将传播学划分为:控制(传 者)分析、内容(信息)分析、媒介(渠道)分析、受众分析、效 果分析5个领域。 ●不足 ●特别强调“传者”的重要性。 ●它的传播模式是单向的,没有考虑到传播者和受者之间的信息交流, 忽略了反馈机制。 ●该模式忽略了信息的传播过程不是在一个真空的环境中进行的,没 有考虑到周围环境对于传播过程的影响以及与相应的社会过程的联 系

医学信息学概论复习提纲答案

《医学信息学概论》课程复习提纲 2015年12月 1、信息、数据与知识的关系。第一届知识发现和数据挖掘国际学术会议召开的 时间、地点?P2-3 数据是信息的基础,信息是对人们有用的数据,知识是在信息的基础上进一步提炼而成的关于自然和社会的认识和经验的总和,指导人们从大量的数据中认识信息的某种规律。 1995年,加拿大蒙特利尔。 2、数据、信息与载体的关系。举例说明。P3-4 信息是人们通过对数据进行加工处理后所获得的对人有用的数据,数据既不是物质,也不是能量,而是信息的载体。在计算机中,所有的数字、文字、图像、声音、动画、影像等都是数据,都是可以加工成人们所需的信息的原材料。 载体是承载信息的媒体。若我们将数据比作一部货车,信息比作货物,则货车是用来运载货物的,而数据肩负着传递信息的使命,因此叫做载体。 3、常用的收集信息方法有哪9种?P10-11 阅读法、投书法、询问法、观察法、收听法、采集法、购买法、网络法、挖掘法 4、常用的信息分析原则有哪些?P11-12 1)时空性2)旁系性3)内涵性4)可拓展性5)可组合性6)类比性 5、信息系统的定义?信息系统的组成?P18 信息系统可以定义为由提供数据的对象、承载数据的载体、传递数据的信道、处理数据的规则和目的等要素组成,是具有对数据进行采集、处理、存储、传输、检索和管理等功能的一种人工或非人工的系统。 信息系统由信源、信道、信宿三个基本部分组成。 6、信息系统相关理论中的“老三论”、“新三论”的名称是?P21 老三论:一般系统论、古典信息论、控制论 新三论:耗散结构理论、协同论、突变理论 7、你是如何理解医学信息学的定义?构成医学信息学的学科框架?P26 医学信息学是一门以医学信息为主要研究对象,以医学信息的运动规律及应用方法为主要研究内容,以现代计算机为主要工具,以解决医药工作人员在处理医学信息过程中的各种问题为主要研究目标的一门新兴学科,是计算机科学、信息科学在医学、生命科学、卫生保健等领域应用的一门新兴交叉学科。 除了包含医学、信息学外,还涉及到网络通信技术、数据库技术、无线传感技术、人工智能等计算机科学的多个领域,教学内容涵盖了信息处理技术、信息标准化技术、医学图象处理与传输、医院管理信息系统、临床信息系统等多个研究领域。 8、如何理解医学信息学研究的范畴(4个层次)?如何理解医学信息的人机交 互过程? (1)原始健康数据 ⑵从原始健康数据中分析出来的有组织的综合数据库

医学信息学功课1 4

本试题满分:100 分 1. (10.0分)关于信息的正确概念是( ) A) 信息是数据的素材B) 信息是数据的载体C) 信息是对人有用的数据D) 信息是一种特殊的物质2. (10.0分)关于数据的正确概念是( ) A) 数据是对人有用的信息B) 数据是信息的载体C) 数据是特殊的一种物质D) 数据是一种特殊的能量3. (10.0分)信息系统的组成不包括下列哪一项( )A) 信源B) 载体C) 信宿D) 信道 4. (10.0分)下列哪一项表示“国际医学信息学会”( )A) CMIA B) IMIA C) WHO D) ISO 5. (10.0分)关于“标准”的正确概念是( ) A) 是针对现存或潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,其宗旨是使该环境达到最佳有序度B) 是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件其宗旨是使该环境达到最佳有序度 C) 是负责为公共和常用事物的活动及结果划定和提供规则、指导原则的权威机构D) 是国际化的标准组织6. (10.0分)关于“标准化”的正确概念是( ) A) 是针对现存或潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,其宗旨是使该环境达到最佳有序度B) 是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件其宗旨是使该环境达到最佳有序度 C) 是负责为公共和常用事物的活动及结果划定和提供规则、指导原则的权威机构D) 是国际化的标准组织7. (10.0分)在标准化遵循的原理中,下列各项中不正确的是( ) A) 简化统一的原理B) “一致同意”的原理C) 定期修改的原理D) 自觉实行的原理8. (10.0分)ICD 的分类依据是疾病的主要特性,下列哪一特性不是分类依据( )A) 病因B) 药理C) 临床表现D) 部位 9. (10.0分)ICD 分类有3个层次,下列哪一项是“亚目”这一层次的基本特性( ) A) 是三位数编码,包括一个字母和两位数字B) 是四位数编码,包括一个字母、三位数字和一个小数点C) 是五位数编码,包括一个字母、四位数字和一个小数点D) 双重分类(星号和剑号分类系统)10. (10.0分)医学信息学是一门交叉学科( ) A) 供体学科是计算机科学B) 供体科学是医学科学C) 受体学科是计算机科学D) 受体科学是医学科学 、管路敷设技术通过管线不仅可以解决吊顶层配置不规范高中资料试卷问题,而且可保障各类管路习题到位。在管路敷设过程中,要加强看护关于管路高中资料试卷连接管口处理高中资料试卷弯扁度固定盒位置保护层防腐跨接地线弯曲半径标等,要求技术交底。管线敷设技术中包含线槽、管架等多项方式,为解决高中语文电气课件中管壁薄、接口不严等问题,合理利用管线敷设技术。线缆敷设原则:在分线盒处,当不同电压回路交叉时,应采用金属隔板进行隔开处理;同一线槽内强电回路须同时切断习题电源,线缆敷设完毕,要进行检查和检测处理。、电气课件中调试对全部高中资料试卷电气设备,在安装过程中以及安装结束后进行 高中资料试卷调整试验;通电检查所有设备高中资料试卷相互作用与相互关系,根据生产工艺高中资料试卷要求,对电气设备进行空载与带负荷下高中资料试卷调控试验;对设备进行调整使其在正常工况下与过度工作下都可以正常工作;对于继电保护进行整核对定值,审核与校对图纸,编写复杂设备与装置高中资料试卷调试方案,编写重要设备高中资料试卷试验方案以及系统启动方案;对整套启动过程中高中资料试卷电气设备进行调试工作并且进行过关运行高中资料试卷技术指导。对于调试过程中高中资料试卷技术问题,作为调试人员,需要在事前掌握图纸资料、设备制造厂家出具高中资料试卷试验报告与相关技术资料,并且了解现场设备高中资料试卷布置情况与有关高中资料试卷电气系统接线等情况 ,然后根据规范与规程规定,制定设备调试高中资料试卷方案。 、电气设备调试高中资料试卷技术电力保护装置调试技术,电力保护高中资料试卷配置技术是指机组在进行继电保护高中资料试卷总体配置时,需要在最大限度内来确保机组高中资料试卷安全,并且尽可能地缩小故障高中资料试卷破坏范围,或者对某些异常高中资料试卷工况进行自动处理,尤其要避免错误高中资料试卷保护装置动作,并且拒绝动作,来避免不必要高中资料试卷突然停机。因此,电力高中资料试卷保护装置调试技术,要求电力保护装置做到准确灵活。对于差动保护装置高中资料试卷调试技术是指发电机一变压器组在发生内部故障时,需要进行外部电源高中资料试卷切除从而采用高中资料试卷主要保护装置。

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