肿瘤科药物基因检测介绍
肿瘤基因检测的解读作业流程

从临床进入基因检测步骤是入口,检测结果结合临床信息进行合了解读是出口,这一入一出之间需经历检测前临床咨询部分、试验室部分、信息分析部分、临床解读部分共四个步骤。
其中第四部分临床解读部分即是依据检测结果、患者信息、医生共识综合判定,临床和遗传咨询有效衔接、充足沟通,最终出具临床解读汇报。
在做成临床解读汇报之前,首先需要将解读各个步骤进行明确,包含解读步骤步骤,解读技术细节。
这么才有可能真正做到解读规范化,使解读过程有据可依,有章可循,才能出具一份好临床解读汇报,基因检测才能愈加好服务患者和临床医生。
从大框架讲,基因检测数据解读可分为三个步骤:原始数据→分析数据、基于数据库解读→和患者个体表征/临床病例结合解读。
1、读懂原始数据将测序原始序列数据(FASTQ)去除接头及低质量序列,经BWA软件比对至GRCh37/38(NCBI版本)或hg19/hg38(UCSC版本)人类基因组参考序列上,Picard去除反复序列,使用GATK检测SNV和Indel变异,使用ANNOVAR 进行变异注释。
最终取得一份.vcf文件(图1)。
图1 从测序原始序列数据到vcf文件步骤一份vcf文件包含以下基础信息。
Chr:变异所在染色体Start:变异在染色体上起始位置End:变异在染色体上结束位置Ref:参考基因组序列Alt:检测样本基因组序列Func.refGene:变异所处参考基因功效区(exonic,intronic,UTR3,UTR5,splicing,upstream,downstream,intergenic)(此处exonic特指外显子编码氨基酸区,不包含外显子UTR区)Gene.refGene:变异所处参考基因名称(假如是基因间,则是两侧基因)GeneDetail.refGene:非外显子区处于特定转录本中具体位置(假如是基因间,则是距离两侧基因距离)ExonicFunc.refGene:外显子区变异类型(frameshift insertion,frameshiftdeletion,stopgain,stoploss,nonframeshift insertion,nonframeshiftdeletion,synonymous SNV,nonsynonymous SNV),假如这一栏是一个“.”话,就说明该变异不在外显子区AAChange.refGene:氨基酸水平改变(同一个基因可能含有多个转录本,氨基酸改变位置在不一样转录本中有可能不一样)经注释后vcf文件还会包含以下信息:CLINSIG:该变异在ClinVar数据库中临床意义(Benign,Likely benign,Uncertain significance,Likelypathogenic,Pathogenic,Drug-response)CLINDBN:该变异所引发疾病名称CLINACC:该变异登记号和版本号(VariantAccession and Versions)CLINSDB:该变异所引发疾病所在数据库名称CLINSDB:该变异所引发疾病所在数据库中IDPopFreqMax:该变异人群中最大等位基因频率1000_All:该变异在千人基因组计划数据库中人群等位基因频率1000_AFR:该变异在千人基因组计划数据库中非洲人群等位基因频率1000_AMR:该变异在千人基因组计划数据库中美国人群等位基因频率1000_EAS:该变异在千人基因组计划数据库中东亚人群等位基因频率1000_EUR:该变异在千人基因组计划数据库中欧洲人群等位基因频率1000_SAS:该变异在千人基因组计划数据库中南亚人群等位基因频率Snp138:该变异在dbSNP数据库中IDCosmic70:该变异在癌症体细胞突变数据库COSMIC中IDESP6500siv2_ALL:该变异在美国国家心肺血液研究所ESP6500数据库中人群等位基因频率ESP6500siv2_AA:该变异在美国国家心肺血液研究所ESP6500数据库中非洲裔人群等位基因频率ESP6500siv2_EA:该变异在美国国家心肺血液研究所ESP6500数据库中欧洲裔人群等位基因频率ExAC_All:该变异在ExAC数据库中人群等位基因频率ExAC_AFR:该变异在ExAC数据库中非洲人群等位基因频率ExAC_AMR:该变异在ExAC数据库中美国人群等位基因频率ExAC_EAS:该变异在ExAC数据库中东亚人群等位基因频率ExAC_FIN:该变异在ExAC数据库中芬兰人群等位基因频率ExAC_NFE:该变异在ExAC数据库中非芬兰欧洲人群等位基因频率ExAC_OTH:该变异在ExAC数据库中除已指定人群之外人群等位基因频率ExAC_SAS:该变异在ExAC数据库中南亚人群等位基因频率CG46:该变异在CG46数据库中人群等位基因频率。
肿瘤个体化治疗基因检测.doc

第一部分项目背景一、肿瘤临床转化医学背景21世纪伊始,人类基因组研究成果斐然,在循证医学的浪潮推动下,基因组学、RNA组学和反应组学等生命科学与医学领域交融,转化,率先在肿瘤个体化靶向治疗领域进入了NCCb和ASCO CSCO各种肿瘤临床治疗规范。
在一系列转化应用中,使患者明显获益,各种基于循证医学的肿瘤多中心、大样本、随机性双盲的前瞻性研究结果,共同提示基因检测用于肿瘤转化医学靶向治疗和个体化化疗,不仅是肿瘤医药学领域里程碑式的革命,也将诊断病理学科带入了分子病理、个体化治疗的新时代。
美国Kalorama In formation 公司在2007年发表了关于分子诊断的专题市场调查报告“分子诊断:全球主要市场”(Molecular Diag nostics: Major World Market )。
报告预计从2006年到2016年分子诊断市场的平均年增长率达到41.5%。
药物基因组学在这10年间将有184%勺平均年增长率,预计癌症相关基因的检测平均年增长率将达到68%据我国卫生部统计,20世纪90年代我国肿瘤发病率已上升为127例/10万人。
近年来我国每年新增肿瘤患者160〜170万人,总数估计在600万人左右,肿瘤已经成为我国的第一死亡原因。
肿瘤患者对治疗有效性的提高需求迫切,2007年我国医院肿瘤用药销售额累计约为158.7亿元人民币,同比上一年增长高达61.2%,大大高于其它医疗药品的市场增长幅度。
但抗肿瘤药物广泛应用的同时,给患者带来严重的问题:治疗的有效率不高、针对性不强、副反应较多、费用昂贵等。
基于药物基因组学临床检测的肿瘤个体化治疗为上述问题解决带来曙光,美国ASCO已公布的多个临床实验已证实,通过检测肿瘤患者肿瘤组织中的基因突变靶点及基因SNP分型、mRNA基因定量表达,为临床提供靶向及个体化化疗的依据,能显著提高治疗的有效率,降低药物毒副作用。
如:2009年1月美国ASCO消化肿瘤会议总结:选择K-ras野生基因型患者应用EGFR单抗使美国2008年节约了601亿美金,并把这一晚期患者生存期提高了11.5个月。
肿瘤个体化用药指导基因检测

2015年中国癌症统计数据揭示,预计2015年有新发浸润性 癌病例数429.2万,相当于平均每天新发12000例癌症,有281.4 万癌症死亡病例,相当于平均每天7500人死于癌症。
肿瘤治疗需解决的核心问题
设计针对性的用药方案
精准医疗时代
个体化治疗
大家有疑问的,可以询问和交流
可以互相讨论下,但要小声点
个体化用药基因检测项目
肿瘤个体化治疗以疾病靶点基因诊断信息为基础,以循证医学研究结果为依据,为患者提供接受正确治 疗方案的依据。临床研究证实,通过检测肿瘤患者生物样本中生物标志物的基因突变、基因SNP分型、基 因及其蛋白表达状态来预测药物疗效和评价预后,指导临床个体化治疗,能够提高疗效,减轻不良反应。
指导临床靶向用药,协助医生制定个体化治疗方案
适用人群:1. 靶向药物治疗患者,为肿瘤治疗提供依据
2. 原有药物疗效不佳者,可调整用药方案
服务流程:
化疗用药指导基因检测
肿瘤常见化疗药物
化疗是对抗肿瘤的主要武器,在临床治疗中约占70%。然而在肿瘤的化疗中,无论是疗效还是毒性反应 ,都存在比较大的个体差异,这种差异与个体的基因型直接相关。因此,进行化疗用药前相关基因检测,提 高化疗药物的敏感性,选用对个体毒副作用低的药物对癌症的治疗具有关键意义。
以EGFR抑制剂为例解释靶向药物的作用机制
中国上市的部分肿瘤靶向药物
非小细胞肺癌靶向治疗效果
非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的肺癌种类。目前靶向治疗已经成为非小细胞肺癌临床治疗的重要手段。易 瑞沙和特罗凯作为表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs),是目前批准用于非小细胞肺癌靶向治疗的 主要药物。大量研究和临床试验证明易瑞沙和特罗凯对EGFR基因突变的患者有效率显著优于化疗。
肿瘤个体化治疗基因检测教程课件

需要建立完善的法律框架来规范肿瘤个体化治疗基因检测 的相关活动,保护患者的权益和隐私,同时也保障技术的 正常发展。
监管体系的完善
为了确保基因检测的准确性和可靠性,需要建立完善的监 管体系,对相关机构和实验室进行严格的认证和监管。
05
肿瘤个体化治疗基因检测 案例分析
肺癌基因检测案例
患者情况
患者为52岁男性,长期吸烟史,诊断为肺腺 癌。
个体化治疗方案
针对T790M突变,采用第三代EGFR抑制剂 奥希替尼进行治疗。
基因检测结果
检测到EGFR基因突变,为T790M突变。
治疗效果
患者病情得到有效控制,肿瘤缩小,生活质 量提高。
结直肠癌基因检测案例
01
患者情况
患者为45岁女性,有家族遗传史, 诊断为结直肠癌。
肿瘤个体化治疗基因检测教 程课件
目 录
• 肿瘤个体化治疗基因检测概述 • 肿瘤个体化治疗基因检测的方法与技术 • 肿瘤个体化治疗基因检测的应用领域 • 肿瘤个体化治疗基因检测的挑战与前景 • 肿瘤个体化治疗基因检测案例分析
01
肿瘤个体化治疗基因检测 概述
定义与重要性
定义
肿瘤个体化治疗基因检测是指通过检测肿瘤组织或血液样本 中的基因变异情况,为患者提供针对性的治疗方案。
基因表达谱分析的结果有助于临床医生深入了解肿瘤的生 物学特征,为制定更加精准的治疗方案提供科学依据。
03
肿瘤个体化治疗基因检测 的应用领域
靶向治疗
靶向治疗是一种针对特定基因突变的治疗方法,通过抑制肿 瘤细胞的生长和扩散来达到治疗目的。基因检测可以检测出 与靶向治疗相关的基因突变,为患者提供更精准的治疗方案 。
个体化治疗方案
基因组学在肿瘤诊疗中的应用

基因组学在肿瘤诊疗中的应用一、基因组学概述基因组学是生物学的一个重要分支,研究基因组的结构、功能、变异等方面。
基因组是指一个组织或个体所拥有的所有DNA序列。
基因组学在人类健康领域中有着广泛应用,其中肿瘤诊疗是其中一个关注的热点。
二、基因组学在肿瘤诊疗中的应用肿瘤是一种危害人类健康的病症,而基因组学在肿瘤的研究和诊疗中发挥着关键作用。
1.基因检测基因检测是通过检查一个人的特定基因来寻找潜在疾病的遗传风险或对特定药物反应的可能。
对于肿瘤来说,基因检测可以帮助确定病人患癌症的风险,以及预测哪些治疗方案最适合患者。
基因检测可以通过分析结肠癌、乳腺癌、卵巢癌等癌症患者的基因组数据来帮助医生选择适当的治疗方案。
2.基因组学用于癌症诊断基因组学的发展已经改变了传统的肿瘤诊断方法。
传统的肿瘤诊断通常是通过组织病理学检查来进行确诊。
而基因组学则可以通过对患者的DNA序列进行分析,帮助确定肿瘤类型、疾病预后、治疗反应和预后,从而帮助医生确定最佳治疗方案。
例如,基于基因组学技术的肺癌分子亚型诊断,不仅可以迅速确认肿瘤子型,而且能明确其对治疗的敏感程度。
3.靶向治疗靶向治疗依赖于对个体化基因组分析,根据患者特有的基因变异进行定位治疗。
肿瘤细胞的DNA序列常常包含有突变的基因,如EGFR、ALK、BRAF等,对应靶向药物也随之产生。
靶向药物通过作用于癌症患者肿瘤细胞中的突变基因或靶点,而不对正常细胞产生影响。
因此,靶向治疗比传统治疗具有更高的针对性和安全性。
4.基因编辑基因编辑技术还处于发展阶段,这是基于CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat)的技术,能够精确地编辑和修改基因组。
其使用对肿瘤治疗的影响相对较低。
然而,基因控制癌症细胞分裂和生长的突变的发现为肿瘤治疗打开了许多新的途径。
三、未来展望随着基因组学技术的不断发展和应用,肿瘤诊疗的精准化程度将大大提高。
肿瘤基因检测

EGFR
ALK
ROS1
B-RAF
PD-L1
NCCN指南
EGFR是肺癌靶向治疗成功的关键
Gefitinib EGFR M+ (n=132) Gefitinib EGFR M- (n=91) Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129) Carboplatin / paclitaxel EGFR M(n=85)
蛋白水平(过表达): 细胞表面HER2蛋白受体表达大量增加 基因水平(扩增): HER2编码基因于细胞核内拷贝增加
IHC
FISH
HER-2阳性危害
1、对早期乳腺癌预后不利:
2、降低乳腺癌转移/复发患者的存活率:
HER-2阳性与靶向治疗
100 80
HER2阳性, 曲妥珠单抗 (n=191) HER2阴性 (n=1782) HER2阳性, 无曲妥珠单抗 (n=118)
存活率 (%)
60 40 20
0 0
12
24
36
48
60
确诊后时间 (月)
一项回顾性研究数据显示,与HER2阴性乳腺癌相比,HER2阳性乳腺 癌患者接受曲妥珠单抗治疗后的死亡率下降44%
Dawood S et al. J Clin Oncol 2010;28:92–98.
HER-2阳性
1、含蒽环类药物耐药:
低复发风险者(RS<18) 从化疗中的获益极微
3、胃/食管癌个性化用药基因检测
HER-2
NCCN指南-胃癌
NCCN指南-食管癌
HER-2阳性判断
4、结直肠癌个性化用药基因检测MMR/MSI来自RASB-RAF
NCCN指南
肿瘤的基因检测

靶向药物
针对特定肿瘤基因位点开发 直接作用于肿瘤组织 疗效好,副作用小
9/6/2019
6
靶向用药指导基因检测
根据NCCN肿瘤学临床实践指南建议:肿瘤 个体化用药基因检测是服用靶向药物时必 检项目
7
靶向药物
西妥昔单抗 (爱必妥) 帕尼单抗 (维克替比)
肿瘤类型
结直肠癌
伊马替尼 (格列卫)
胃肠间质瘤
索拉非尼 (多吉美)
肝癌
曲妥珠单抗 (赫赛汀)
2019/9/6
乳腺癌
检测项目
KRAS体细胞突变检测 (2,3外显子突变)
BRAF体细胞突变检测 (15外显子突变, T1799A)
PI3KCA体细胞突变检测 (9,20外显子突变)
C-Kit体细胞突变检测 (9外显子突变)
C-Kit体细胞突变检测 (11外显子突变)
9/6/2019
14
临床常用化疗药及相关基因
5-FU
DPYD MTHFR
铂类
ERCC1 XRCC1 GSTP1
伊立替康 UGT1A1
他莫西芬 CYP2D6
吉西他滨 CDA
巯嘌呤类 TPMT
9/6/2019
15
化疗用药指导基因检测列表
9/6/2019
16
化疗用药指导基因检测列表
9/6/2019
17
2、临床初诊,需要进行化疗的肿瘤患者; 3、肿瘤治疗后复发或发生转移,治疗方案无
效,需重新制定治疗方案的肿瘤患者;
9/6/2019
19
非小细胞肺癌基因检测
9/6/2019
20
结直肠癌基因检测
9/6/2019
21
胰腺癌基因检测
肿瘤学中的基因检测技术使用教程

肿瘤学中的基因检测技术使用教程肿瘤学中的基因检测技术是一项重要的工具,可以帮助医生更好地了解肿瘤的生物学特性,制定个体化的治疗方案,并预测患者的治疗效果和预后。
本篇文章将详细介绍肿瘤学中常用的基因检测技术,包括DNA测序、RNA测序、基因芯片和PCR等。
一、DNA测序DNA测序是一种通过测定DNA序列来检测肿瘤相关基因的技术。
目前广泛使用的DNA测序技术有Sanger测序和高通量测序。
1. Sanger测序Sanger测序是一种经典的DNA测序技术,其原理是通过DNA链终止的方法测定DNA序列。
在Sanger测序中,一条模板DNA被分成若干片段,然后通过DNA聚合酶扩增这些片段,并在扩增过程中加入少量的二进制缺失聚合酶,这些缺失聚合酶会随机地将一个碱基加入到扩增的片段中,导致链终止。
扩增完成后,用电泳法将DNA片段按照大小分离,并通过荧光信号检测DNA序列。
2. 高通量测序高通量测序技术(Next Generation Sequencing, NGS)已成为肿瘤学中常用的DNA测序方法。
NGS技术可以同时对数千万的DNA分子进行测序,具有高效、准确的优点。
常用的NGS平台有Illumina和Ion Torrent等。
NGS技术可以帮助检测各种肿瘤相关的基因变异,包括突变、拷贝数变异和染色体重排等。
二、RNA测序RNA测序是一种检测肿瘤中基因表达的技术。
通过RNA测序可以了解不同基因的表达水平,识别组织或肿瘤中的新基因、变异表达基因和可变剪接等。
1. mRNA测序mRNA测序是RNA测序的一种常用方法。
在此方法中,mRNA首先被转化为cDNA,然后通过PCR扩增,并在扩增过程中加入特定的序列适配器。
扩增完成后,使用NGS技术对这些cDNA进行测序,以获得基因的表达水平信息。
2. 全转录组测序全转录组测序(Whole transcriptome sequencing, WTS)是一种通过测定全部转录RNA的方法来检测基因表达。
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Subject incidences of grade 3/4 diarrhoea based on UGT1A1 genotype Green, yellow, and pink bars represent the incidences for patients harbouring UGT1A1 wild-type (*1/*1), heterozygous (*1/*6, *1/*28), and homozygous (*6/*6, *6/*28, *28/*28) genotypes, respectively. Abbreviation: RR=relative risk.
美国FDA已在伊立替康药品说明书上规定,使用伊立替康 前需检测患者是否携带有UGT1A1*28。
UGT1A1*28突变率
UGT1A1*6(G71R,211G>A)是东方人群中特有的突变等位基 因,该突变使UGT1A1活性下降70%,伊立替康所致4级中性粒细 胞减少症的发生率升高3倍。
Med Oncol (2013) 30:604
UGT1A1基因具有多态性,其表达水平高度可变,导致不同患 者间SN-38糖化反应速率相差最高达50倍。UGT1A1基因功能缺陷 可导致SN-38显著增加,从而显著增加腹泻/中性粒细胞减少发生。
UGT1A1基因具有多态性,国外研究发现最常见的是位于其启动 子区TATA盒内的TA重复次数多态性UGT1A1*28。野生型含6次TA重复 (TA6,UGT1A1*1),突变型个体含7次重复(TA7,UGT1A1*28)。
Use label-recommended dosage and administration (Moderate recommendation)
Decreased DPD activity
Start with at least a 50%
Leukocyte DPD activity reduction in starting dose
2. DPWG Guideline for capecitabine and DPYD Summary Select an alternate drug to capecitabine for DPYD poor metabolizer patients, and reduce capecitabine dose (by 50%) or select an alternate drug for DPYD intermediate metabolizers.
reduced to 30%-70% that of followed by titrationation
based on toxicity b or
pharmacokinetic test (if
Increased risk for severe or available)
——临床药学——F9——DNA序列测定—— 打印化验单——注明所检测的药物
2. 收费: 目前为自费项目,每个基因位点500元
3. 报告时间:2-3个工作日
❖ 标本要求:2~3ml静脉血,紫管真空抽血管(EDTA抗凝), 无需空腹,随时抽取,及时送检
at risk for toxicity with drug
exposure
(~3-5% of patients)
Implications for phenotypic Dosing
measures
recommendations
Normal DPD activity “Normal" risk for 5-FU toxicity
基因检测提示:患者为DPYD*2A突变杂合型,应在初始卡培他滨治疗时给予减量50%。
Cancer Res 2013 Mar;73(6):1958e68.
氟尿嘧啶(5-FU)、卡培他滨和替加氟都为嘧啶类似物, 属抗代谢类抗肿瘤药物。卡培他滨为5-FU的前体,替加氟为 5-FU的衍生物,两者在肝脏内可活化代谢为5-FU,发挥抗肿 瘤作用。
Pharmacogenomics. 2016 Jun;17(9):1005-17.
我院开展的基因检测项目
我院开展的基因检测项目
我院开展的基因检测项目
临床诊断
基因检测
基因实验室
临床医生优 化治疗方案
方案建议
➢调整剂量 ➢换药
检测报告单
药物基因检测申请单开立说明: 1. 病房:医生工作站——医嘱——其他科室检验——F9
UGT1A1*6(G71R,211G>A)是东方人群中特有的突变等位基 因,该突变使UGT1A1活性下降70%,伊立替康所致4级中性粒细 胞减少症的发生率升高3倍。
Table 3 Correlation between UGT1A1*6/*28 and severe neutropenia
亚洲人群研究的Meta分析结论如下: 1. UGT1A1*6 突变杂合型患者发生严重中性粒细胞减少的风险增加(OR=1.98),突变
肿瘤科药物基因检测 介绍
生物标记 1 TPMT 变异 2 UGT1A1 变异 3 DPYD变异
药物或代表药 巯嘌呤,硫唑嘌呤 伊立替康 卡培他滨 ,氟尿嘧啶,替加氟
今日主题
伊立替康药物基因检测
我院药物基因检测流程
伊立替康为喜树碱类抗肿瘤药物的前药,活性代谢产物SN-38作用靶点为 DNA拓扑异构酶I,抑制DNA的合成。伊立替康广泛应用于结直肠癌等实体瘤治 疗。伊立替康可导致严重的延迟性腹泻和粒细胞缺乏,导致化疗提前终止。
国外报道20%~40%的患者接受本品治疗可出现3~4度腹泻,并致化疗方案 提前中止,而国内相关研究发现汉族人用伊立替康副反应的发生率为5%左右, 明显低于西方报道的腹泻发生率。人群的遗传学背景差异可能是导致腹泻发生 率不同的主要原因。
Limonti A,et al. Cancer Treat Rev,2004,30(6):555-562
该Meta分析共纳入4855名患者,结果表明卡培他滨毒性(0-2级 vs. 3-5级)与DPYD*2A和2846T>A相关(合并OR为5.51,P=0.0013)
1. CPIC Guideline for capecitabine and DPYD Summary The CPIC Dosing Guidelines for fluoropyrimidines (i.e. 5-fluorouracil, capecitabine or tegafur) recommends an alternative drug for patients who are homozygous for DPYD non-functional variants - *2A (rs3918290), *13 (rs55886062), and rs67376798 A (on the positive chromosomal strand) - as these patients are typically DPD deficient. Consider a 50% reduction in starting dose for heterozygous patients (intermediate activity).
Genetic medicine, 2009,11(1):21-34
在接受伊立替康治疗过程中,野生型UGT1A1(6/6)基因型患 者出现严重毒性作用风险较低,UGT1A1*28杂合子(6/7)和突变 型纯合子(7/7)患者出现毒性作用的机率分别为12.5%和50%。
美国FDA已在伊立替康药品说明书上规定,使用伊立替康 前需检测患者是否携带有UGT1A1*28。
约40%低DPYD酶活性的个体携带DPYD*2A等位基因,其中有60 %的患者应用5-FU治疗后出现4级严重的粒细胞减少;而在 DPYD酶活性正常患者中,5-FU所致严重毒副反应的发生率仅为 10%。
因此,对DPYD*2A多态性进行检测可预测5-FU治疗导致致命性 毒性反应发生风险。
美国FDA在药品说明书中明确指出:使用5-Fu和卡培他滨时, 建议检测DPYD基因型。
纯合型患者发生严重中性粒细胞减少的风险增加更高(OR=4.44) 2. UGT1A1*6突变纯合型患者发生严重腹泻的风险显著增加(OR=3.51)
Subject incidences of grade 3/4 neutropenia based on UGT1A1 genotype Green, yellow, and pink bars represent the incidences for patients harbouring UGT1A1 wild-type (*1/*1), heterozygous (*1/*6, *1/*28), and homozygous (*6/*6, *6/*28, *28/*28) genotypes, respectively. Abbreviation: RR=relative risk.
Phenotype (genotype)
Wild-type High DPD activity
Diplotypes *1/*1
Heterozygous
*1/*2A; *1/*13;
Intermediate activity
*1/ c.2846A>T)
Have partial DPD deficiency,
exposure
(~0.2% of patients)
Complete DPD deficiency
Select alternate drug
Increased risk for severe or (Strong recommendation) even fatal drug toxicity when treated with 5-FU drugs