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Biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons

Biodegradation of polycyclic aromatic  hydrocarbons

Abbreviations
HCCA--2-hydroxychromene-2-carboxylate; PAH--polycyclic aromatic hydrocarbon; PCR-polymerase chain reaction; tHBPA--trans-O-hydroxybenzylidenepyruvate.
Introduction
The use of bioremediation to degrade hazardous chemicals is a practical alternative to traditional remediation treatment technologies. The effectiveness of bioremediation in the detoxification of potentially hazardous organic chemicals that contaminate soil is directly related to the chemical structure of the pollutants. Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are an important class of xenobiotics that persist in soils and sediments (Fig. 1). PAHs are lipophilic chemicals that are formed as by-products of fossil fuel combustion and residues of coal processing. They are ubiquitous as contaminants from petroleum and coal utilization and are of environmental concern because of their toxic, mutagenic and carcinogenic properties [1]. Because of their persistence in the environment and their genotoxicity, m u c h research effort has b e e n aimed at the remediation of PAH-contaminated wastes [2]. PAHs are removed from contaminated sites principally by microbial degradation. However, other possible fates of PAHs are volatilization, photooxidation, chemical oxidation, bioaccumulation, adsorption and adhesion to the soil matrix (Fig. 2) [3]. PAHs with four and five fused b e n z e n e rings are more resistant to biodegradation than PAHs with two or three rings. Their carcinogenicity and lipophilicity m e a n that the PAHs are h u m a n health and ecological risks (Fig. 1).

16种多环芳烃的结构式

16种多环芳烃的结构式

Pyrene (PYR)
C16H10
202.25
129-00-0
365.04元
1000 μg/mL
in methanol, analytical standard (Supelco)
苯并(a)蒽
Benzo(a)anthracene (BaA)
C18H12
228.29
56-55-3
1,249.56元/1g
SIGMA-ALDRICH
16种多环芳烃
中文名
英文名
结构式
分子式
分子量
CAS号
价格(元)

Naphthalene
(NAP)
C10H8
128.17
91-20-3
148.59元/0.25g
484.59元/1g
analytical standard (Fluka)
553.41元
5000 μg/L
Analytical
苯并(a)芘
Benzo(a)pyrene
(BaP)
C20H12
252.3
50-32-8
1,838.07元/1g
662.22元/0.1g
analytical standard (Cerilliant)
544.05元
5000 μg/mLinmethanol,analytical standard (Supelco)

Fluorene
(FLU)
C13H10
166.22
86-73-7
544.05元
5000 μg/mLinmethanol,analytical standard (Supelco)

Phenanthrene

雪上一支蒿的化学成分研究

雪上一支蒿的化学成分研究

具有祛风镇 痛 的 功 效, 用 于 治 疗 风 湿 疼 痛、 跌 打 损伤 等 症[3]。1974年 版 《云 南 省 药 品 标 准》 和 1977年版 《中国药典》 一部曾经收载。以雪上一 枝蒿为原料开发的药品如雪上一枝蒿总碱片、雪 上一枝蒿总 碱 注 射 剂、 骨 痛 灵 酊 以 及 搽 剂、 气 雾 剂等制剂已经用于临床[4-6],主要用于治疗风湿疼 痛、关节炎等 疾 病。 但 雪 上 一 枝 蒿 化 学 成 份 研 究 报 道 较 少, 目 前 认 为 二 萜 生 物 碱 是 其 主 要 成 分[7-9];为了进一步认识其物质基础,课题组开展 了雪上一枝蒿的化学成分研究;从雪上一枝蒿乙
中国民族民间医药 2018年 7月第 27卷第 13期 ChineseJournalofEthnomedicineandEthnopharmacy,2018,Vol27,No13 ·13·
药物研究
雪上一支蒿的化学成分研究
张新渐1 王洪云1 刘淑萍2 饶高雄2 张建英2 左爱学2
1.保山中医药高等专科学校,云南 保山 678000;2.云南中医学院中药学院,云南 昆明 650500
Keywords:Aconitumbrachypodum;Diterpenoidalkaconitum) 植物约有 350种, 主要分布于亚洲。 《中国植物志》 记载我国约有 167种,大多数分布于云南北部、四川西部和西藏 东部的高山地带[1]。目前已经有 40余种乌头属植 物当作药 物 使 用[2], 从 乌 头 属 植 物 中 开 发 了 草 乌 甲素、高乌甲素、3-乙酰乌头碱等药品应用于临 床。雪上一支蒿来源于毛茛科乌头属植物短柄乌 头 Aconitum brachypodum Diels块 根, 是 云、 贵、 川等地区广泛使用的民间用药,尤其是在云南应 用较为普遍,主产于云南北部的东川、会泽等地,

课多环芳烃污染生态毒理学

课多环芳烃污染生态毒理学

B(a)P B(a)P环氧化物 二氢二醇B(a)P 二氢二醇环氧B(a)P
前致癌物 近致癌物
终致癌物
3,4-苯并芘肺内注射构建大鼠肺肿瘤模型 的实验研究
接受3,4-苯并芘处理中的大鼠1年内总成瘤率72.22%。肺部成 瘤率为66.67%,组织病理学分类为:2只低分化鳞癌,3只肺腺癌, 未分化Hs对胎儿的影响】
PAHs可通过胎盘导致胎儿DNA损伤; 胎儿对DNA损伤的易感性更高; PAHs对胎儿有遗传毒性.
【PAHs对生殖与生育的影响】
PAHs影响新生儿体重; PAHs导致早产; PAHs导致出生缺陷; PAHs导致婴儿神经发育不良;
【致癌】
➢PAHs是发现最早且数量最多的致癌物(400多 种),占已发现致癌物的1/3.
食物、可能会放入口中的产品以及儿童用品:
烟草烟气中的PAHs含量 多环芳香烃(PAHs)最终的迁移可能是吸附到沉积物中,进行缓慢的生物降解,挥发过程和水解过程不是重要的迁移过程。
健康危害:对眼睛、皮肤有刺激作用。 烟草烟气中的PAHs含量
PAHs导致出生缺陷;
PAHs化合物 含量(微克/支) 三环以下、七环以上的PAHs母体不具致癌性,四到六环PAHs母体及其它环数PAHs的衍生物部分具有致癌性。
残留时间一般不太长,特别在阳光和微生物影响下,数小时内就被代谢和降解。
前致癌物 近致癌物
终致癌物
12月10号顺义区千亩的秸秆焚烧后场景 2 16种毒性较强的多环芳烃 全年PAHs浓度范围为2.
严禁吸烟!
年12月8号参加农工 中央主办的第八届 中国生态健康论坛
2.4 不同场所室内多环芳烃污染
办公环境中的PAHs污染主要来自户外的对流交换,而 吸烟和厨房烹调是影响客厅PAHs含量的重要因素。

美拉德反应——精选推荐

美拉德反应——精选推荐

美拉德反应又称为“非酶棕色化反应”,是法国化学家L.C.Maillard在1912年提出的。

所谓美拉德反应是广泛存在于食品工业的一种非酶褐变,是羰基化合物(还原糖类)和氨基化合物(氨基酸和蛋白质)间的反应,经过复杂的历程最终生成棕色甚至是黑色的大分子物质类黑精或称拟黑素,所以又称羰胺反应。

将它应用于食品香精生产应用之中,国外研究比较多,国内研究应用很少,该技术在肉类香精及烟草香精中有非常好的应用。

所形成的香精具天然肉类香精的逼真效果,具有调配技术无法比拟的作用。

美拉德反应技术在香精领域中的应用打破了传统的香精调配和生产工艺的范畴,是一全新的香精香料生产应用技术,值得大力研究和推广,尤其在调味品行业反应机理1912年法国化学家Maillard发现甘氨酸与葡萄糖混合加热时形成褐色的物质。

后来人们发现这类反应不仅影响食品的颜色,而且对其香味也有重要作用,并将此反应称为非酶褐变反应(nonenzimic browning)。

1953年Hodge对美拉德反应的机理提出了系统的解释,大致可以分为3阶段。

起始阶段1、席夫碱的生成(Shiff Base):氨基酸与还原糖加热,氨基与羰基缩合生成席夫碱。

2、N-取代糖基胺的生成:席夫碱经环化生成。

3、Amadori化合物生成:N-取代糖基胺经Amiadori重排形成Amadori化合物(1—氨基—1—脱氧—2—酮糖)。

中间阶段在中间阶段, Amadori化合物通过三条路线进行反应。

1、酸性条件下:经1,2—烯醇化反应,生成羰基甲呋喃醛。

2、碱性条件下:经2,3—烯醇化反应,产生还原酮类褐脱氢还原酮类。

有利于Amadori重排产物形成1deoxysome。

它是许多食品香味的前驱体。

3、Strecker聚解反应:继续进行裂解反应,形成含羰基和双羰基化合物,以进行最后阶段反应或与氨基进行Strec ker分解反应,产生Strec ker醛类。

最终阶段此阶段反应复杂,机制尚不清楚,中间阶段的产物与氨基化合物进行醛基—氨基反应,最终生成类黑精。

葎草茎叶石油醚部位化学成分

葎草茎叶石油醚部位化学成分

学报Journal of China Pharmaceutical University2022,53(2):178-184178葎草茎叶石油醚部位化学成分孙彪1,2,敖运林1,2,王德智1,2,王俊雅1,2,叶文才1,2,3,张晓琦1,2,3*(1暨南大学药学院中药及天然药物研究所,广州510632;2暨南大学广东省现代中药工程技术研究中心,广州510632;3国家药品监督管理局中成药质量评价重点实验室,广州510632)摘要研究桑科葎草(Humulus scandens)茎叶石油醚部位化学成分。

采用硅胶、Sephadex LH-20、ODS、制备型高效液相等色谱方法进行分离纯化,从桑科中药葎草(Humulus scandens)茎叶中分离得到15个化合物,应用理化数据和波谱学方法分别鉴定为杨芽黄素(1)、白杨素(2)、5-羟基-3,4',6,7-四甲氧基黄酮(3)、(2S)-5-羟基-7,8-二甲氧基二氢黄酮(4)、欧前胡素(5)、珊瑚菜内酯(6)、4-羟基-3-(3'-甲基-2'-丁烯基)苯甲酸乙酯(7)、对羟基苯丙酸(8)、反式对羟基肉桂酸乙酯(9)、对羟基苯甲醛(10)、anofinic acid(11)、5,6-去氢卡文内酯(12)、大黄素甲醚(13)、齐墩果-12-烯-3,11-二酮(14)、ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-one(15),以上化合物均为首次从该植物中分离得到。

关键词桑科;葎草;化学成分;黄酮中图分类号R284.1文献标志码A文章编号1000-5048(2022)02-0178-07doi:10.11665/j.issn.1000-5048.20220207引用本文孙彪,敖运林,王德智,等.葎草茎叶石油醚部位化学成分[J].中国药科大学学报,2022,53(2):178–184.Cite this article as:SUN Biao,AO Yunlin,WANG Dezhi,et al.Chemical constituents of petroleum ether extract from the stems and leaves of Humulus scandens[J].J China Pharm Univ,2022,53(2):178–184.Chemical constituents of petroleum ether extract from the stems and leaves of Humulus scandensSUN Biao1,2,AO Yunlin1,2,WANG Dezhi1,2,WANG Junya1,2,YE Wencai1,2,3,ZHANG Xiaoqi1,2,3*1Institute of Traditional Chinese Medicine&Natural Products,College of Pharmacy,Ji'nan University,Guangzhou510632; 2Guangdong Engineering Research Center for Modernization of TCM,Ji'nan University,Guangzhou510632;3NMPA Key Laboratory for Quality Evaluation of TCM,Guangzhou510632,ChinaAbstract To study the chemical constituents of petroleum ether extract from the stems and leaves of Humulus scandens(family of Moraceae),fifteen compounds were isolated from the stems and leaves of H.scandens by silica gel,Sephadex LH-20,ODS,and preparative HPLC chromatography.The structures were identified by physico‑chemical data and spectroscopic method as tectochrysin(1),chrysin(2),5-hydroxy-3,4',6,7-tetramethoxyfla‑vone(3),(2S)-5-hydroxy-7,8-dimethoxyflavanone(4),imperatorin(5),phellopterin(6),ethyl4-hydroxy-3-(3'-methyl-2'-butenyl)benzoate(7),p-hydroxy-phenylpropionic acid(8),ethyl p-hydroxycinnamate(9),p-hydroxy‑benzaldehyde(10),anofinic acid(11),5,6-dehydrokavain(12),physcion(13),olean-12-ene-3,11-dione(14)and ergosta-4,6,8(14),22-tetraen-3-one(15),respectively.All compounds were isolated from this plant for the first time.Key words Moraceae;Humulus scandens;chemical constitutents;flavonesThis study was supported by the National Natural Science Foundation of China(No.U1801287,No.82073712),the Science and Technology Planning Project of Guangdong Province(No.2020B1111110004)and the Science and Technology Planning Project of Guangzhou(No.20212210005)收稿日期2021-08-27*通信作者Tel:************E-mail:tzhxq01@基金项目国家自然科学基金资助项目(No.U1801287,No.82073712);广东省科技计划资助项目(No.2020B1111110004);广州市科技计划资助项目(No.20212210005)第53卷第2期孙彪,等:葎草茎叶石油醚部位化学成分葎草[Humulus scandens.(Lour.)Merr.]为桑科(Moraceae)葎草属植物,为一年生或多年生草本,广泛分布于我国除青海、新疆以外的大部分地区,另外东北亚、北美洲也有分布[1-2]。

蛋白质3D建模,酶与底物分子模拟对接 autodock

蛋白质3D建模,酶与底物分子模拟对接 autodock

摘要多环芳烃(polycylic aromatic hydrocarbons,PAHs)是一类典型的芳香烃类有机污染物,其种类繁多,常见的共有16种。

近年来多环芳烃的污染已经引起人们的高度重视,随着对PAHs 微生物降解研究的深入,已经发现大量在耗氧条件下对四环以下PAHs 有降解能力的细菌,但微生物对五环及五环以上PAHs的降解能力较低,为了提高菌群的PAHs底物范围,对其降解途径中的关键酶进行分子改造具有非常重要的意义。

萘双加氧酶(Naphthalene dioxygenase,NDO)是多环芳烃降解途径中的关键酶,。

本论文通过计算机模拟的方式研究不同来源的萘双加氧酶与多环芳烃的相互作用规律,考察影响其活性中心口袋大小的关键氨基酸,为使用定点突变等基因工程技术提高萘双加氧酶的降解效率提供参考。

本实验从数据库下载了9种来源不同的萘双加氧酶的α亚基氨基酸序列,采用3种方式进行同源建模,经过3种方法对模型进行评价,选取质量最好的一组模型与16个PAHs分子进行对接。

通过比较这些不同菌种来源的NDO与PAHs的对接结果,寻找影响其相互作用的关键氨基酸。

实验结论如下:通过同源模建及模型评价,发现工具Phyre2获得的模型质量相对较好;使用Autodock Tools(ADT)将模型与PAHs进行对接后获得了不同来源NDO与PAHs相互作用的特征曲线,PAHs环数的多少会显著影响NDO与PAHs的结合能力;通过对对接结果的统计,发现来自Rhodococcus sp.的萘双加氧酶(Q9X3R9)和PAHs的结合能最低,结合能力最强。

通过统计9种不同来源的NDO活性中心18个氨基酸的突变情况和偏移量发现,相对于实验室的JM-2序列,比较保守的氨基酸包括N205、F206、D209、H212、H217、G255、V264、D368、G208。

而这些不同来源的BDO活性中心氨基酸组成差异主要发生于V213、L257、H301、N303、T316、L364、A412七个位置,其变异性较强,结构位置不稳定,对七个氨基酸进行改造,增大NDO的活性口袋,能增强酶对高环PAHs的结合能力,为NDO的分子改造提供参考。

dld 分子量

dld 分子量

dld 分子量全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:DLD分子量是指鹰嘴豆脱氢酶(dihydrolipoamide dehydrogenase)的分子量,也称为二硫辅酶Q-氧化还原酶。

它是细胞色素bc1复合物的一个组成部分,负责在细胞内进行电子传递和能量生成的重要功能。

DLD分子量通常在约51-60kDa之间。

DLD是一种催化氧化还原反应的酶,它参与细胞内线粒体的三羟基甘氨酸羧基-乙酰辅酶A(HADH)的氧化还原过程,将NADH还原为NAD+。

DLD通过将HADH还原为其原始状态,从而将氧化剂还原为还原剂,参与线粒体内氧化磷酸化和ATP生成的过程。

在细胞内,DLD是一个非常重要的蛋白质,它不仅参与细胞内的代谢过程,还参与许多生物学过程。

研究表明,DLD在氧化应激、抗氧化反应、细胞凋亡、细胞增殖等生物学过程中都起着重要作用。

在疾病研究领域,DLD分子量与一些疾病的发生和发展有一定的关联。

在癌症和神经系统相关疾病中,DLD的活性水平和表达水平可能发生改变,进而影响细胞的代谢和功能。

研究DLD在疾病中的作用机制和调控途径具有重要的意义。

为了更深入地了解DLD分子量的生物学功能和生物化学特性,科学家们进行了大量的研究工作。

他们通过分子生物学、生物化学、免疫学和结构生物学等多个领域的方法和技术,研究DLD的结构、功能和调控机制,以及其在细胞内的生理和病理过程中的作用。

DLD分子量是一个非常重要的生物分子,在细胞内发挥着重要的作用。

通过深入研究DLD的生物学功能和调控机制,可以为人类健康和疾病治疗提供重要的科学依据,同时也有助于推动生物医学领域的发展和进步。

希望未来能够有更多的研究工作针对DLD进行深入探讨,为我们揭示其更多的生物学奥秘。

第二篇示例:DLD 分子量,全称为二氧化榔头,是一种用于测量多肽和蛋白质大小的方法。

DLD 分子量测定技术已经成为许多生物科学领域的重要方法,其在生物医学研究、药物研发和生物工程等领域的应用越来越广泛。

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Inhibitors, Agonists, Screening Libraries
Data Sheet
BIOLOGICAL ACTIVITY:
14–Deoxy–11,12–didehydroandrographolide is an analogue of Andrographolide that can be isolated from A. paniculata .
14–Deoxy–11,12–didehydroandrographolide inhibits NF–κB activation.
IC50 & Target: NF–κB [1]
In Vitro: 14–deoxy–11,12–didehydroandrographolide, a naturally occurring noncytotoxic analogue of Andrographolide, effectively reduces Ovalbumin (OVA)–induced inflammatory cell recruitment into bronchoalveolar lavage (BAL) fluid, IL–4, IL–5, IL–13, and eotaxin production, serum IgE synthesis, pulmonary eosinophilia, mucus hypersecretion, mast cell degranulation, and airway hyper–responsiveness (AHR) in a mouse asthma model, probably via inhibition of NF–κB activity [1].
In Vivo: 14–deoxy–11,12–didehydroandrographolide (1 mg/kg) dramatically reduces resistance (Rl) and restores Cdyn in OVA–challenged mice in response to methacholine [1].
PROTOCOL (Extracted from published papers and Only for reference)
Cell Assay:[1]A549 cells (3×103/well), BEAS–2B cells (5×103/well), and RBL–2H3 cells (3×103/well) are seeded in flat–bottomed 96–well plates overnight and then incubated with increasing concentrations (3–120 μM) of
14–deoxy–11,12–didehydroandrographolide or Andrographolide for 24 and 48 h at 37°C. Cell viability is analyzed using the CellTiter 96 AQ ueous cell proliferation assay. This MTS assay is based on the ability of viable cells to convert a soluble tetrazolium salt to a colored formazan product. Absorbance is recorded at 490 nm [1].
Animal Administration: 14–deoxy–11,12–didehydroandrographolide is prepared in vehicle (1% DMSO in saline) (Mice)[1].[1]Mice [1]Female BALB/c mice, 6 to 8 weeks old, are sensitized and challenged with OVA. Briefly, mice are sensitized by ip injections of 20 μg of OVA and 4 mg of Al(OH)3 suspended in 0.1 mL of saline on days 0 and 14. On days 22, 23, and 24, mice are challenged with 1% OVA aerosol for 30 min. 14–deoxy–11,12–didehydroandrographolide (0.1, 0.5, and 1 mg/kg) or vehicle (1% DMSO) in 0.1 mL of saline is given by ip injections 2 h before and 10 h after each OVA aerosol challenge. Saline aerosol is used as a negative control.
References:
[1]. Guan SP, et al. Protective role of 14–deoxy–11,12–didehydroandrographolide, a noncytotoxic analogue ofandrographolide, in allergic airway inflammation. J Nat Prod. 2011 Jun 24;74(6):1484–90.
Product Name:
14–Deoxy–11,12–didehydroandrographolide Cat. No.:
HY-N1490CAS No.:
42895-58-9Molecular Formula:
C 20H 28O 4Molecular Weight:
332.43Target:
NF–κB Pathway:
NF–κB Solubility:
10 mM in DMSO
Caution: Product has not been fully validated for medical applications. For research use only.
Tel: 609-228-6898 Fax: 609-228-5909 E-mail: tech@
Address: 1 Deer Park Dr, Suite Q, Monmouth Junction, NJ 08852, USA。

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