伪狂犬病毒实时荧光定量PCR方法的建立

合集下载

猪伪狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

猪伪狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

猪伪狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用徐凯文;廖帆;雷磊;谭磊【期刊名称】《养猪》【年(卷),期】2022()6【摘要】当前猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)仍是猪场常见的病原之一,给我国生猪养殖业造成了巨大的经济损失。

为建立一种基于SYBR Green的PRV实时荧光定量PCR检测方法,以PRV-gE基因序列为靶标,构建pUCmT-gE重组质粒(并作为阳性质粒),针对该基因设计特异性引物,并评估该方法的灵敏性、特异性和可重复性等指标。

结果表明,该方法检测下限为4.545拷贝/μL,而普通PCR 检测下限为4.545×10^(2)拷贝/μL;在90.0℃出现单一的溶解峰,并与PCV2(圆环病毒2型)、PPV(细小病毒)、PRRSV(蓝耳病病毒)、PEDV(流行性腹泻病毒)和TGEV(传染性胃肠炎病毒)等不产生交叉反应。

此外,该方法对15份疑似感染伪狂犬病的临床样品检出率为20%(3/15),高于常规PCR检出率(13.33%,2/15)。

因此,该方法较传统PCR具有更高灵敏性,更适合用于PRV的临床早期诊断。

【总页数】4页(P97-100)【作者】徐凯文;廖帆;雷磊;谭磊【作者单位】湖南农业大学动物医学院【正文语种】中文【中图分类】S858.285.3【相关文献】1.Taq Man实时荧光定量PCR检测猪伪狂犬病病毒方法的建立与初步应用2.猪捷申病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立和初步应用3.实时荧光定量PCR检测伪狂犬病病毒方法的建立与初步应用4.同时检测猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪伪狂犬病病毒和猪细环病病毒1型和2型的多重SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR方法的建立5.伪狂犬病病毒TaqMan双重实时荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

猪伪狂犬病PCR诊断方法的建立

猪伪狂犬病PCR诊断方法的建立
( 金陡科技学院动物科学 系 。 江苏南京 2 0 3 ) 1 0 8
中 圈分 类 号 :8 2 69 1 ¥ 5 .8 ¥ 5 . 5 . ,8 8 2
文献标识码 : A
文 章 一 号 :0 75 3 (0 60 —0 30 1 0.0 8 2 0 )20 8.3

要: 根据 伪 狂 犬病病 毒 ( R g 基 因的 P V) B 重要 的病毒贮 存 宿 主和传 染 源 。随 着规 模化 和集 约
Ab tr c : e a t cg rte p io fe t f l u rc , a ta au o t S h s n r r i a d g e n ta sa a t Th n i ia et os n ef cs o i o ie sr g l s r o , C ia d a fut n r e e - q we eSU idwih t eANDM n r t de t h a d GST Sa b ev to a g t. a n o s r a in t r es Th eh d o a cu p eiia eWa em t o fc lim r cpt t S u e om a el e c o o e 。t eme h do wr su e ots h o c rr to ft el e ir — s dt k i rmir s m s h t o fLo y wa s d t e tt ec n eta in o h v rm c o v i s ma r t i fmie a d t ea t elv lo o l o en o c n h ci e e fANDM n T r e t d Th e u t h we h tt e p v a d GS we et se . er s l s o d t a h s

猪伪狂犬病病毒PCR检测方法的初步建立

猪伪狂犬病病毒PCR检测方法的初步建立
维普资讯
实 验 动 物 与 比较 医 学 L b rtrAn ln o aav dc e aoa y i d mp rt e o maa C i Meii n
Ap 2 0 . () r 0 82 2 8

猪伪狂 犬病病毒 P R检测 C
方法 的初 步 建 立
伪 狂 犬 病 是 由伪 狂 犬 病 病 毒 ( u o a i s PS d r b e e Vi s r 引起 的 以发热 、奇痒 及脑 脊 髓 炎 为主 r ,P V) u 要症 状 的一 种重 要传 染病 ,可 发生 于多种 家 畜及野 生动 物【。P V属 疱 疹病 毒 科 a疱 疹 病 毒 。猪 是本 1 r 1 病 的主 要宿 主和 带 毒 者 ,通 常 引起 妊 娠 母猪流 产 、 木 乃伊 胎 、死 胎和 产 弱 仔 :初 生 仔 猪 出现 神 经 症 状 ,感 染 率和 死 亡 率 可 达 1 0 :成 年 猪 感 染 后 % 0 多 耐 过 ,不 发 病 呈 隐 性 感 染 , 造 成 长 期 带 毒 排 毒 ,成 为最 危险 的传 染源 。 实验用 猪 也 一直 受 该 1 病毒 的影 响,故 建立 P R方法 检 测 实验用猪 P V是 C r 提 高和 保 证 实验 用 猪 质 量 的 手段 之 一 。
1 模板 制备 . 5
直 接取 病 毒培 养物 20p或 超速 离心 后病 毒悬 5 1 .
液 5 l 0u ,用上 海华 舜 生物 工程有 限公 司的病 毒 / 液 体样 品 R / NA抽提 试剂 盒提 取 D NA D NA,具体过程
按说 明书操 作 。
维普资讯
孥春 华 ,胡 建 华 2 张婉 华 ,刊、 萍 风 ,高 骏 ,王 英 ,蒋凤 英

实时荧光定量PCR具体实验步骤

实时荧光定量PCR具体实验步骤

实时荧光定量PCR具体实验步骤
实时荧光定量(Real Time quantitative PCR)是检测RNA或DNA的一种常用技术,通过检测特定目标的增加(或减少),可以用来测定RNA 或DNA的表达水平,或者基因等的转录水平。

下面我们就对实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的实验步骤进行具体介绍。

1.搭建实验
第一步是搭建实验,即准备实验所需的干燥试剂,第二步是准备RNA 样本,第三步是准备标准曲线,最后是根据实验需要准备实验板和实验试管。

2、RNA样品提取
在实验中,会使用到多种RNAs,一般情况下使用TRIzol或Phenol 抽提方法进行RNA抽提,不同的细胞、组织中RNA的杂质含量不一样,因此需要根据实验需求进行适当调整抽提浓度。

3、RT-qPCR反转录
在RT-qPCR反转录之前,首先要准备反转录试剂,一般采用qPCR反转录试剂盒,这种试剂盒含有足够的反转录荧光探针以及反转录引物,它可以有效帮助反转录过程。

反转录过程通过复制DNA片段的过程完成,最终转录出的cDNA存在细胞核中。

4、qPCR扩增实验
qPCR扩增实验是在反转录完成后进行,一般来说,这个步骤可以采用qPCR扩增试剂盒,该试剂盒中包含所需的扩增物质如DNA聚合酶、前驱核苷酸、dNTPs,检测细胞核中的cDNA。

狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立和阳性对照的制备

狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立和阳性对照的制备

±堡塞墼塑些匿瘟壹堂壅查塑!至!!旦箜丝鲞筮!塑S堕!堂』妞垦丛!啦!:墅苎堂!坚:!生:丝!堕!:!狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立和阳性对照的制备王云龙,赵瑞红,李智涛,李玉林。

王国强,沈飞【摘要】目的建立狂犬病病毒实时荧光定量PCR检测方法,制备狂犬病病毒(rabiesvirus,RV)的假病毒颗粒阳性对照。

方法在RV的N基因保守区设计引物和探针,建立反转录实时荧光定量PCR检测方法,克隆得到噬菌体MS2的装配蛋白和壳蛋白基因(MS2),将其重组到质粒pET.28b(+)中,再将RV的N基因片段重组到MS2下游,经原核表达得到RV假病毒颗粒。

结果实时荧光定量PCR检测Rv重组质粒最低检测限为15拷贝,Ill,重组表达质粒经原核表达可形成耐RNase的RV病毒样颗粒。

结论建立了反转录实时荧光定量PCR检测BV核酸的方法,成功构建了可耐受心蛳且无传染性的RV阳性对照。

【主题词】聚合酶链反应;狂犬病病毒;假病毒颗粒EstablishmentofafluorescentquantitativePCRdetectionmethodforrabiesvirusandpreparationofRNApesitivecontrolsWANGYun-/ong’,zHAoRui-hong,uZhi-tao.12Yu-“n,WANGGuo-qiang。

sHE^F甑.。

Collegeof£咖Science,s,HenanNormalUniversity,Xinxiang453007,ChinaCorrespondingauthor:WAGNYun-bng,E-ma//:6面伽“@126.姗【Abstract】ObjectiveEstablishthefluorescentquantitativeRnPCRdetectionmethodforrabiesvirus(Rv)andconstructRNase.resistantvirus-likeparticles酗positivecontrols.MethodsAnalyzethedatabaseinGenBank,theprobeandtheprimerBweredesignedintheconservativeregionofNgeneofrabiesvirusandthemethodofreal·timefluorescentquantitativePCRwasobtained;OnthebasisofMS2phage,withthetechnologyofgenerecombination.preparetheRN脚.resistantvirus-likeparticlesforRVpositivecontrols;ResultsRNase-resistantvires-likeparticleswereobtainedafterprokaryoticexpressioninE.coli.11ledesignedprimersandprobewereconfirmedtobeveryspecificandCOllServative,andbesensitivetoconcentrationof15copies/m.ConclusionEstabhshedthemethodofdetectingrabiesvirusbyreversetranscfipdonreal-timequantitativePCR,obtainedtheRNase-resistantand110infectivityvirus-likeparticles∞positivecontrohofrabiesvirus.【Keywords】Polymerasechainreaction;BabiesVirus;Virus-LikeParticles狂犬病是由狂犬病病毒引起的一种人畜共患急性传染病,一旦发病,病死率几乎为100%,对攻击咬伤人或动物的狂犬病病毒可疑带毒者能否做出快速、准确的诊断,对保证人和动物的安全非常重要。

PCR快速检测伪狂犬病病毒野毒感染

PCR快速检测伪狂犬病病毒野毒感染

PCR快速检测伪狂犬病病毒野毒感染周斌;苏鑫铭;张素芳;贾赟;曹瑞兵;陈溥言【期刊名称】《中国病毒学》【年(卷),期】2004(019)006【摘要】根据已发表的伪狂犬病病毒(PrV)gE、gI基因的序列,设计并合成了一对引物,以PrV容A株细胞培养毒为模板,筛选最佳反应条件和试剂工作浓度,建立了区分PrV野毒株和疫苗弱毒的鉴别PCR方法.该方法能从PrV容A株(RA)、上海株(SH)、鲁A株(LA)中扩增出一条848bp的片段,但Bartha-K61株没有扩增出该片段.测序结果表明PCR扩增产物和方法的特异性.对正常细胞与其它6种引起猪病毒性疫病相关病毒进行检测,结果均为阴性,没有出现交叉反应.对PrV容A株细胞毒提取物DNA进行检测,其最低检出量为5pg.PCR对感染野毒的发病猪不同组织器官检测发现,淋巴结检出率最高,依次为脾、脑(海马角)、肺、肾、肝等.对2003~2004年期间江苏、浙江、安徽、福建、上海等省市的37个大中型猪场送检的172份病料进行PCR检测病料阳性率为20.34%(35/172),猪场阳性率为40.54%(15/37).实验结果表明所建立的PCR技术可用于伪狂犬病野毒感染的快速鉴定和流行病学调查.【总页数】4页(P612-615)【作者】周斌;苏鑫铭;张素芳;贾赟;曹瑞兵;陈溥言【作者单位】南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095;南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095;南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095;南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095;南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095;南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095【正文语种】中文【中图分类】R373.9【相关文献】1.鉴别伪狂犬病病毒野毒与疫苗毒荧光定量PCR方法的建立 [J], 赵丽;崔保安;陈红英;魏战勇;郑兰兰;吕晓丽;贾艳艳;赵绪永2.鉴别猪伪狂犬病病毒野毒与疫苗毒双重PCR检测方法的建立 [J], 赵丽;卢婷婷;李存法;陈忠杰;连瑞丽3.鉴别猪伪狂犬病病毒gE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法的建立和应用 [J], 赵雪丽;闫若潜;吴志明;曹伟伟;王淑娟;谢彩华;马震原;周兵强;王东方4.伪狂犬病病毒野毒感染快速检测方法的比较 [J], 杨红杰;李雪明;于红欣;邹战明;杨倩;周双海5.猪伪狂犬病病毒野毒LNA探针real-time PCR检测方法的建立 [J], 李艳;李春玲;楚品品;雷雯;勾红潮;蒋智勇;蔡汝健;宋帅;卞志标;杨东霞因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

伪狂犬病病毒野毒荧光定量PCR检测方法的建立

伪狂犬病病毒野毒荧光定量PCR检测方法的建立

meh d wa o 1 x 0 . x 1 1 o iswi e lwe t ee tb eDNA m i o 4 c p e . i rp d a d t o sf m . 1 2 t 10 0 0 c p e t t r 0 o h h o s tc a l d l t f o is T s a i n i h s n i v P e tc u d b u n o r t c u r e r s l . t s e i c t b ee t g 1 l t i so e s ie q CR t s o l er n i o e h u o a q i t e u t Is p cf i t n eh s i y y d tc i wi sr n f n 3 d a p e d r be i s sio a e u a o ao y wa o f me ih n n o i v mp i c t n f r s n s u o a i sv r e s ltd i o r lb r tr sc n r d i wh c o a y p s i e a l a o wi e u n i n t i f i o
Ab c:A crigt esq e cso eeo su oa i i s(R , n a f r r n n 曲m t cod t eu n e f Egn f ed rbe vr P V)o e io mes doe n oh g p s e pr p i a
T q n p o e we e d sg e n y t e ie o i e e t t g t e wi tan fp e d r b e i sfo t e a ma r b r e in d a d s n s d f rd f r n i i l sr i so s u o a i sv r m h z an h d u r h i d s mp e y u i ih C ce f l a lsb s g L g t y l 8 e l i CR c i e Th e e t b e l e rr n e o i o e P e n w4 0 r a— me P t ma h n e d tca l i a a g ft sn v l CR n h q

猪伪狂犬病病毒PCR-LFD检测方法的建立及应用

猪伪狂犬病病毒PCR-LFD检测方法的建立及应用

动物医学进展,2018,39(11):35G40P r o g r e s s i nV e t e r i n a r y Me d i c i n e 猪伪狂犬病病毒P C R GL F D 检测方法的建立及应用㊀收稿日期:2018G01G24㊀基金项目:天津市科技计划支撑项目(18Y F Z C N C 01110);天津市农业科技成果转化与推广项目(201601070);天津市生猪产业技术体系项目(I T T P R S 2017003);中国农业科学院重大平台推进计划(Y 2017P T 50)㊀作者简介:张㊀莉(1979-),女,河北邢台人,副研究员,硕士,主要从事畜禽疾病研究.∗通讯作者张㊀莉,任卫科,李秀丽,路㊀超,王利丽,郑㊀丽,池晶晶,田向学,韩㊀伟,鄢明华∗(1.农业部兽用药物与诊断技术天津科学观测实验站,天津300381;2.天津市畜牧兽医研究所,天津300381)㊀㊀摘㊀要:旨在将P C R 技术与可视化的横向流动试纸条(l a t e r a l f l o wd i p s t i c k ,L F D )相结合,建立猪伪狂犬病病毒野毒株的P C R GL F D 快速检测技术.依据猪伪狂犬病病毒g E 基因保守区域设计2条特异性引物和对应的特异性探针,其中下游引物和探针分别标记了荧光素(F I T C )和生物素(B i o t i n ).通过对P C R 退火温度㊁引物浓度㊁探针杂交温度的筛选,确定P C R GL F D 方法的最佳反应条件,并对其敏感性㊁特异性和重复性进行检测.结果显示,所建立的检测方法能够特异性的检测出猪伪狂犬病病毒野毒株,与猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株㊁6种对照病毒和3种对照细菌均无交叉反应,其最低检测限为100TC ID 50/100μL .该方法对同批次和不同批次猪伪狂犬病病毒D N A 分别进行5次重复检测,结果完全一致.该方法对50份临床样品进行检测,P C R GL F D 方法和病毒分离培养法检测出16份阳性样品,常规P C R 检测出14份阳性样品,P C R GL F D 方法的敏感性高于P C R ,但两者间差异不显著P >0.05.以上结果表明,所建立的方法具有良好的特异性㊁敏感性和重复性,且不需要琼脂糖凝胶电泳可直接判读结果,适合养殖场㊁基层实验室的现场检测.㊀㊀关键词:猪伪狂犬病病毒;聚合酶链反应;横向流动试纸条中图分类号:S 852.65文献标识码:A文章编号:1007G5038(2018)11G0035G06㊀㊀猪伪狂犬病(P s e u d o r a b i e s ,P R )是由疱疹病毒科㊁αG疱疹病毒亚科的伪狂犬病病毒(P s e u d o r a b i e sv i u r s e ,P R V )引起的多种动物的一种高度接触性传染病[1].猪是自然宿主.该病可导致怀孕母猪的流产㊁死胎㊁木乃伊胎和种猪不育等症状;哺乳仔猪常出现神经症状和死亡;成年猪一般呈亚临床或隐性感染,成为病毒的贮存宿主,长期排毒,但是自2011年后,我国多地区猪场中出现伪狂犬病病毒变异毒株,一些成年猪也出现神经症状和高病死率等情况[2G3].猪伪狂犬病流行状况的变化给养猪业带来了巨大损失,因此,特异㊁敏感㊁快速的诊断方法对该病的防控至关重要.目前,伪狂犬病的诊断方法有很多种,其中g E GE L I S A 方法和g B GE L I S A 常用于猪群的免疫抗体监测和预警,P C R 方法和荧光定量P C R 则是病原学诊断的主要方法[4].P C R GL F D 技术是将P C R 技术㊁核酸探针杂交技术与横向流动试纸条(l a t e r a lf l o wd i p s t i c k ,L F D )三项技术相结合,应用试纸条直接检测P C R 扩增产物的技术.此项技术已在结核分支杆菌[5]㊁甲型H 1N 1病毒[6]㊁乙型肝炎病毒[7]㊁转基因黑曲霉[8]㊁口蹄疫病毒[9]等方面有了成功应用的报道.本研究根据猪伪狂犬病病毒的g E 基因设计一套引物和探针,建立了猪伪狂犬病病毒的P C R GL F D 特异性检测方法,为伪狂犬病的诊断提供了一种更为便捷的病原检测方法.1㊀材料与方法1.1㊀材料1.1.1㊀供试病毒株和菌株㊀猪伪狂犬病病毒(P R V )S C 株,由中国农业科学院哈尔滨兽医研究所猪烈性传染病创新团队赠送;猪圆环病毒2型(P C V G2)㊁猪繁殖与呼吸综合征病毒(P R R S V )㊁猪细小病毒(P P V )㊁猪流感病毒(S I V )㊁猪伪狂犬病病毒(P R V )R 13028株㊁猪伪狂犬病病毒(P R V )R 13139株㊁猪肺炎支原体(M P )㊁副猪嗜血杆菌(H ps )均由天津市畜牧兽医研究所实验室保存;猪链球菌2型(S S 2)㊁猪伪狂犬病病毒(P R V )M i n A 株购自国家兽医微生物菌种保藏管理中心;猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(P R V g E 基因缺失株)㊁日本脑炎病毒(J E V )㊁猪瘟病毒(C S F V )疫苗株为市售疫苗.1.1.2㊀主要试剂㊀r T a q DN A 聚合酶㊁d N T P ㊁2X G C b u f f e r I ㊁D N A M a r k e rD L2000,宝生物工程(大连)有限公司产品;核酸提取试剂盒,金瑞鸿捷生物科技有限公司产品;横向流动试纸条,杭州忧思达生物技术有限公司产品.1.2㊀方法1.2.1㊀引物设计与合成㊀根据G e n B a n k 数据库中猪伪狂犬病病毒g E 基因(G e n B a n k :A Y 173124)中的一段保守核苷酸序列,采用P r i m e rP r e i m e r 5.0软件设计特异性P C R 引物和探针,由宝生物工程(大连)有限公司合成(表1).表1㊀引物序列T a b l e 1㊀P r i m e r s e qu e n c e s 项目I t e m引物名称P r i m e r n a m e s序列(5ᶄG3ᶄ)S e qu e n c e s (5ᶄG3ᶄ)5ᶄ标记5ᶄL a b e l 扩增片段/b pA m p l i f i c a t i o n f r a gm e n t P C R P R V g E 247(上游)C C G G C C C A T C T G G T G A A C G T337P r i m e r sP R V g E 623(下游)C C C A C C G C C A C A A A G A A C A C GF I T CP C RP r o b eP r v GT Gb i oG A C C T G G T G C T G G G C C G C G C C T B i o t i n1.2.2㊀P C R GL F D 方法的建立㊀1.2.2.1㊀P C R 反应条件优化㊀P C R 反应体系为20μL :10μL2ˑG Cb u f f e r I ,0.5μLr T a q D N A 聚合酶(8U /μL ),2μL d N T P s (2.5mm o l /L ),1μL P R V g E 247(10μm o l /L ),1μL P R V g E 623(10μm o l /L ),5.0μL 模板D N A ,0.5μL 超纯水.P C R 反应程序为:95ħ5m i n ;94ħ30s ,53ħ至60ħ30s ,72ħ30s ,进行30个循环;72ħ延伸5m i n ,4ħ5m i n.1.2.2.2㊀退火温度的优化㊀固定其他条件不变,设定53㊁54㊁55㊁56㊁57㊁58㊁59㊁60ħ共8个温度梯度,分别进行扩增,同时设立空白水对照.P C R 反应结束,取8μLP C R 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在凝胶成像仪上观察并记录结果.1.2.2.3㊀引物浓度的优化㊀经上述筛选出最佳退火温度后,固定反应体系其他试剂的添加量,对引物浓度用量设定为0.5μL ㊁1μL ㊁1.5μL ㊁2μL ,并设立空白水对照.反应结束,用琼脂糖凝胶电泳检测结果.1.2.2.4㊀探针杂交反应条件优化㊀P C R 反应结束后,开盖加入1μLP r v GT Gb i o (10μm o l /L ),增加一步杂交反应,94ħ30s ,54ħ至60ħ30s ,4ħ5m i n .复性温度选择54㊁55㊁56㊁57㊁58㊁59㊁60ħ分别进行杂交,摸索最佳反应条件.1.2.2.5㊀L F D 试纸条检测P C R 产物㊀杂交反应结束后,取P C R 产物10μL 加入到100μL 缓冲液,混合均匀;将L F D 试纸条插入缓冲液3m i n ;取出将试纸条水平放置,5m i n ~10m i n 内读取结果.判定标准:质控线和检测线显现棕红色条带,为阳性;只有质控线显现棕红色条带,为阴性;只出现检测线为无效.1.2.3㊀特异性试验㊀用已优化的P C R 反应体系检测伪狂犬病病毒(P R V )S C 株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13028株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13193株㊁伪狂犬病病毒(P R V )M i n A 株㊁猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(P R V g E 基因缺失株)㊁猪瘟病毒(C S F V )㊁猪圆环病毒2型(P C V G2)㊁猪猪繁殖与呼吸综合征病毒(P R R S V )㊁猪细小病毒(P P V )㊁日本脑炎病毒(J E V )㊁猪流感病毒(S I V )㊁猪肺炎支原体(M P )㊁副猪嗜血杆菌(H ps )㊁猪链球菌2型(S S 2).探针杂交后,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 分别检测扩增产物,确定所建立方法的特异性.1.2.4㊀敏感性试验㊀将已知T C I D 50的伪狂犬病病毒稀释为105~101个T C I D 50,按常规方法提取D N A ,分别取5μL 作为模板,其他反应条件不变进行P C R扩增.探针杂交后,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 分别检测扩增产物,确定所建立方法的敏感性.1.2.5㊀琼脂糖凝胶电泳法和L F D 试纸条灵敏度比较㊀以伪狂犬病病毒S C 株D N A 为模板,按照优化后的P C R 条件进行扩增,反应结束后,测定P C R 扩增产物的核酸含量,并用纯水做10倍㊁100倍㊁1000倍稀释.分别取出20μL 稀释产物,加入1μL 核酸探针,探针杂交反应后,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 试纸条分别检测扩增产物,比较两种方法的差异.1.2.6㊀重复性试验㊀采用同一批次和不同批次提取的猪伪狂犬病病毒D N A 作为模板分别进行5次P C R 扩增,用琼脂糖凝胶电泳法和L F D 法检测扩增产物,确定所建立P C R GL F D 方法的重复性.1.3㊀临床样品的检测从养殖场采集50份病料样品,用病毒分离培养法和P C R GL F D 方法同时进行检测,比较两种方法的符合率.63动物医学进展㊀2018年㊀第39卷㊀第11期(总第305期)2㊀结果2.1㊀退火温度的优化选择53ħ~60ħ8个复性温度进行扩增,结果显示56ħ和55ħ均能扩增出特异的目的条带,而且56ħ亮度最强,因此,最终确定56ħ为最适反应温度(图1).1~8.60ħ㊁59ħ㊁58ħ㊁57ħ㊁56ħ㊁55ħ㊁54ħ㊁53ħ;9.阴性对照;M.D N A 标准D L20001G8.60ħ,59ħ,58ħ,57ħ,56ħ,55ħ,54ħ,53ħ;9.N e g a t i v ec o n Gt r o l ;M.D N A M a r k e rD L2000图1㊀复性温度优化F i g .1㊀O p t i m i z a t i o no f t h e a n n e a l i n g t e m pe r a t u r e 2.2㊀引物浓度的优化固定P C R 体系中其他试剂的添加量,将引物浓度用量设定为0.5㊁1㊁1.5㊁2μL 分别进行P C R 扩增,结果显示,加入0.5μL 引物时,扩增条带稍浅;加入1㊁1.5㊁2μL 引物时,扩增条带均清晰,无明显引物二聚体,因此,1μL 为最佳引物添加量(图2).1.2μL 引物(阳性对照);2.2μL 引物(阴性对照);3.1.5μL 引物(阳性对照);4.1.5μL 引物(阴性对照);5.1μL 引物(阳性对照);6.1μL引物(阴性对照);7.0.5μL 引物(阳性对照);8.0.5μL 引物(阴性对照);M.D N A 标准D L20001.2μL p r i m e r (p o s t i v e c o n t r o l );2.2μL p r i m e r (n e g n a t i v ec o n t r o l );3.1.5μL p r i m e r (p o s t i v e c o n t r o l );4.1.5μL (n e g n a t i v ec o n t r o l );5.1μL p r i m e r (p o s t i v ec o n t r o l );6.1μL (n e g n a t i v ec o n t r o l );7.0.5μL p r i m e r (p o s t i v ec o n t r o l );8.0.5μL (n e g n a t i v ec o n t r o );M.D N A M a r k e rD L2000图2㊀引物浓度优化F i g .2㊀O pt i m i z a t i o no f t h e p r i m e r c o n c e n t r a t i o n 2.3㊀探针杂交反应条件优化P C R 反应液中加入标记B i o t i n 的探针,复性温度选择54㊁55㊁56㊁57㊁58㊁59㊁60ħ分别进行杂交,然后用L F D 试纸条检测,结果54㊁59㊁60ħ试纸条检测线未出现阳性条带,55㊁56㊁57ħ时检测线有明显阳性带,但55ħ和56ħ的检测线较浅,57ħ检测线最为明显,因此认为94ħ30s ,57ħ30s ,4ħ5m i n为最佳的探针杂交反应程序(图3).1~7.54ħ㊁55ħ㊁56ħ㊁57ħ㊁58ħ㊁59ħ㊁60ħ;8.阴性对照1G7.54ħ,55ħ,56ħ,57ħ,58ħ,59ħ,60ħ;8.N e gn a t i v e c o n t r o l 图3㊀探针杂交温度筛选试验结果F i g .3㊀T e m p e r a t u r e s c r e e n i n g te s t r e s u l t s of p r o b eh yb r i d i z a t i o n r e ac t i o n 2.4㊀特异性试验本试验建立的猪伪狂犬病病毒P C R GL F D 检测方法检测伪狂犬病病毒(P R V )S C 株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13028株㊁伪狂犬病病毒(P R V )R 13193株㊁伪狂犬病病毒(P R V )M i n A 株㊁猪伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(P R V g E 基因缺失株)㊁猪瘟病毒(C S F V )㊁猪圆环病毒2型(P C V G2)㊁猪繁殖与呼吸综合征病毒(P R R S )㊁猪细小病毒(P P V )㊁日本乙型脑炎病毒(J E V )㊁猪流感病毒(S I V )㊁猪肺炎支原体(M P )㊁副猪嗜血杆菌(H p s )㊁猪链球菌2型(S S 2).从图4可见所建立的P C R GL F D 方法只能检测到伪狂犬病病毒S C 株㊁R 13028株㊁R 13139株㊁M i n A 株,伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株和其他对照菌毒株均为阴性,采用琼脂糖凝胶电泳和试纸条方法观察的检测结果完全一致.2.5㊀敏感性试验从图5可见,所建立的P C R 方法的最低检测病毒滴度为102T C I D 50/100μL ,且采用琼脂糖凝胶电泳和试纸条方法的检测结果完全一致.2.6㊀琼脂糖凝胶电泳法和L F D 试纸条灵敏度比较用核酸蛋白测定仪测定伪狂犬病病毒P C R 扩增产物的核酸含量为482.5n g /μL ,将其稀释10倍㊁100倍㊁1000倍后,用琼脂糖凝胶电泳和L F D 试纸73张㊀莉等:猪伪狂犬病病毒P C R GL F D 检测方法的建立及应用条分别检测,结果见图6.从图中可看出当P C R 产物稀释100倍后,已很难通过琼脂糖凝胶电泳观察到阳性结果,但是L F D 试纸条仍可见较为清晰的红色检测线.说明L F D 试纸条的灵敏度是琼脂糖凝胶电泳的10倍.A.琼脂糖凝胶电泳检测;B .L F D 试纸条检测;1.伪狂犬病病毒S C 株;2.伪狂犬病病毒M i n A 株;3.伪狂犬病病毒R 13028株;4.伪狂犬病病毒R 13139株;5.伪狂犬病病毒B a r t h a GK 61株(g E );6.猪圆环病毒2型;7.猪瘟病毒;8.日本乙型脑炎病毒;9.细小病毒;10.猪繁殖与呼吸综合征病毒;11.猪流感病毒;12.猪肺炎支原体;13.副猪嗜血杆菌;14.猪链球菌2型;15.空白对照;M.D N A 标准D L2000A.A g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ;B .L F Ds t r i p s ;1.P R VS Cs t r a i n ;2.P R V M i n As t r a i n ;3.P R V R 13028s t r a i n ;4.P R V R 13139;5.P R VB a r t h a GK 61s t r a i n (g E G);6.P C V G2;7.C S F V ;8.J E V ;9.P P V ;10.P R R S V ;11.S I V ;12.M P ;13.H p s ;14.S S 2;15.N e gn a t i v e c o n t r o l ;M.D N A M a r k e rD L2000图4㊀P C R 特异性试验F i g .4㊀S p e c i f i c i t y te s t of P CR A.琼脂糖凝胶电泳检测;B .L F D 试纸条检测;1.阴性对照;2~6.101T C I D 50~105T C I D 50;M.D N A 标准D L2000A.A g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ;B .L F Ds t r i p s ;1.N e g n a t i v e c o n t r o l ;2G6.101T C I D 50G105T C I D 50;M.D N A M a r k e rD L2000图5㊀P C R GL F D 方法敏感性试验F i g .5㊀S e n s i t i v i t y te s t of P C R GL F D m e t h od A.琼脂糖凝胶电泳检测;B .L F D 试纸条检测;1.阴性对照;2~4.103,102,10稀释的P C R 产物;5.原倍P C R 产物;M.D N A 标准D L2000A.A g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s ;B .L F Ds t r i p s ;1.N e g n a t i v e c o n t r o l ;2G4.P C R p r o d u c t s d i l u t e d 103,102,10t i m e s ;5.T h e o r i gi n a l t i m eP C R p r o Gc u c t s ;M.D L2000D N A M a r k e r图6㊀琼脂糖凝胶电泳法与L F D 试纸条法灵敏度比较试验F i g .6㊀T h e s e n s i t i v i t y c o m p a r i s o no f a g a r g e l e l e c t r o p h o r e s i s a n dL F Ds t r i p s a n a l ys i s 83动物医学进展㊀2018年㊀第39卷㊀第11期(总第305期)2.7㊀重复性试验取同一次和不同时间提取的猪伪狂犬病病毒D N A各5份,将其作为模板进行5次P C R扩增,用L F D试纸条和琼脂糖凝胶电泳法检测扩增产物,两种方法结果完全一致,说明所建立的P C RGL F D方法具有良好的重复性.2.8㊀临床样品的检测对养殖场送检的50份病料样品用P C R㊁病毒分离培养法和P C RGL F D方法同时进行检测,结果P C R检测到14份阳性,而病毒分离培养法和P C RGL F D方法为16份,P C RGL F D方法的敏感性要高于常规P C R方法.从表2可见P C RGL F D方法与病毒分离培养法的符合率为100%,与常规P C R方法的阳性符合率为100%,阴性符合率为94.4%.用S P S S17.0软件对结果进行评估,P C RGL F D方法与P C R的χ2为0.1904,P>0.05,两种方法无显著差别.表2㊀两种方法检测结果比较T a b l e2㊀C o m p a r i s o n r e s u l t s o f t w om e t h o d s检测方法D e t e c t i o nm e t h o d s P C RGL F D P C R病毒分离培养法V i r u s i s o l a t i o nm e t h o d 阳性数P o s t i v e s a m p l e s161416阴性数N e g a t i v e s a m p l e s343634阳性符合率/%P o s t i v e c o i n c i d e n c e r a t e100100100阴性符合率/%N e g a t i v e c o i n c i d e n c e r a t e10094.41003㊀讨论猪伪狂犬病是危害养猪业发展的重要传染病之一.对猪伪狂犬病病毒进行快速㊁及时㊁准确的诊断,是有效防控该病的重要前提.伪狂犬病病毒g E 基因是其主要毒力决定因子,为病毒复制的非必需基因,也是世界动物卫生组织(O I E)所规定基因缺失疫苗的缺失基因.以g E序列作为靶序列建立的诊断技术,能够区分基因缺失疫苗接种与野毒感染[3].王香玲等[10]根据猪伪狂犬病病毒g E基因序列保守区段,设计一对特异性引物,通过优化反应条件,建立了可区分猪伪狂犬病病毒野毒株与基因缺失疫苗株的P C R检测方法,该方法的敏感性为1.1p g,有较高的特异性.张志等[11]建立了能够特异性检测P R V野毒株的套式P C R方法,该方法检测极限可达10个病毒拷贝/μL.田云等[12]建立检测伪狂犬病病毒野毒的荧光定量P C R方法,该方法的灵敏度可达4拷贝.常规P C R方法检测成本低,但需要琼脂糖凝胶电泳观察结果,且有时会出现假阳性结果.荧光定量P C R虽然敏感性高于P C R,可实时观看检测结果,但是需要昂贵的设备和试剂成本,不适用于基层实验室和规模化猪场使用.本研究建立了一种基于猪伪狂犬病病毒g E基因的P C RGL F D检测方法,该方法是将P C R技术与L F D试纸相结合的一种可视化检测方法,在引物设计时将一条引物标记了异硫氰酸荧光素(F I T C),在P C R反应后,体系中加入了一条标记生物素(B i oGt i n)的探针,只有目的基因的P C R扩增产物才能与探针结合.采用试纸条对P C R扩增产物进行检测,杂交形成的复合体带有B i o t i n和F I T C两种标记,用试纸条检测时检测线和质控线均出现棕红色条带.阴性P C R产物㊁假阳性P C R和引物二聚体不具有双重标记,不能与检测线结合,检测线不显色.该方法在P C R扩增后15m i n内即可目测判定结果,与传统凝胶电泳法相比更快速,且避免使用溴化乙锭(E B)等核酸染料造成的环境污染[8].为了避免P C R结果出现假阳性,本研究在P C R扩增完成以后,增加了特异性探针杂交反应,进一步提高了该方法的特异性.试验结果表明,该方法可特异性检测猪伪狂犬病病毒野毒株,与缺失g E基因的B a r t h aGK61株和其他9种猪病病原无交叉反应.此外,对比L F D试纸条法和琼脂糖凝胶电泳法对P C R扩增产物检测结果的灵敏度发现, P C RGL F D方法的最低检测限度为100T C I D50/100μL,其敏感性比应用琼脂糖凝胶电泳方法高10倍.针对2011年以来流行的猪伪狂犬病病毒变异株分子特征发生变化的特点,在试验中分别对伪狂犬病病毒经典强毒双城株(S C株)和闽A株(M i n A 株),新分离的猪伪狂犬病变异强毒R13139和R13028株,以及猪伪狂犬病病毒缺失g E基因的疫苗株B a r t h aGK61进行了检测,结果仅B a r t h aGK61株检测结果为阴性,其他4株P R V检测结果均为阳性,表明建立的方法适用于P R V经典强毒和变异的强毒株的检测.以上结果表明,本研究建立的伪狂犬病病毒P C RGL F D检测方法具有敏感㊁快速㊁特异等特点,且操作简便㊁无需电泳可直接观察结果,可用于实验93张㊀莉等:猪伪狂犬病病毒P C RGL F D检测方法的建立及应用室㊁养殖场和基层兽医部门对伪狂犬病的诊断和监测预警,具有广阔的应用前景.参考文献:[1]㊀A nTQ,P e n g JM,T i a nZ J,e t a l.P s e u d o r a b i e s v i r u s v a r i a n t i nB a r t h aGK61Gv a c c i n a t e d p i g s,C h i n a,2012[J].E m e r g I n f e c tD i s,2013,19(11):1749G1755.[2]㊀Y eC,Z h a n g QZ,T i a nZ J,e t a l.G e n o m i c c h a r a c t e r i z a t i o n o f eGm e r g e n t p s e u d o r a b i e s v i r u s i nC h i n ar e v e a l sm a r k e ds e q u e n c ed i ve r g e n c e:E v i d e n c ef o r t h ee x i s t e n c eo f t w om a j o rg e n o t y p e s[J].V i r o l o g y,2015(483):32G43.[3]㊀W uR,B a i CY,S u n J Z,e t a l.E m e r g e n c e o f v i r u l e n t p s e u d o r aGb i e s v i r u s i n f ec t i o n i n N o r t h e r nC h i n a[J].JV e tS c i,2013,14(3):363G365.[4]㊀赵㊀丽,崔保安,陈红英,等.T a q M a n实时荧光定量P C R检测猪伪狂犬病病毒方法的建立与初步应用[J].中国预防兽医学报,2009,2(31):137G140.[5]㊀F a n g R D,L iX,H uL,e ta l.C r o s sGp r i m i n g a m p l i f i c a t i o nf o r r a p i dd e t e c t i o n o f M y c o b a c t e r i u mt u b e r c u l o s i s i n s p u t u ms p e c iGm e n s.[J].J C l i n M i c r o,2009,47(3):845G847.[6]㊀W uL T,C u r r a n M a r t i nD,E l l i sJ o a n n aS,e ta l.N u c l e i ca c i dd i p s t i c k te s tf o r m o l e c u l a rd i ag n o s i so f p a n d e m i c H1n1[J].JC l i n M i c r o,2010,48(10):3608G3613.[7]㊀杨㊀贤,黄㊀欢,殷竹君,等.高灵敏可视化核酸试纸条法快速检测H B V D N A[J].现代生物医学进展,2011(7):87G91.[8]㊀张裕君,贺㊀艳,赵卫东,等.P C R核酸试纸条法检测转基因黑霉菌[J].食品研究与开发,2013,20(34):62G64.[9]㊀龚真莉,蒋㊀韬,祁淑芸,等.口蹄疫病毒核酸试纸条检测方法的建立[J].中国畜牧兽医,2015,42(9):2292G2297.[10]㊀王香玲,沈诗源,焦连国,等.猪伪狂犬病病毒P C R检测方法的建立及应用[J].中国兽药杂志,2014,48(11):5G9.[11]㊀张㊀志,樊雅婷,吴发兴,等.猪伪狂犬病病毒野毒株套式P C R 检测方法的建立和应用[J].中国动物检疫,2015,32(5):73G77.[12]㊀田㊀云,孙彦伟,任裕其,等.伪狂犬病病毒野毒荧光定量P C R 检测方法的建立[J].广东畜牧兽医科技,2012,37(1):31G34.D e v e l o p m e n t a n dA p p l i c a t i o no fP C RGL F D M e t h o d f o rD e t e c t i o no fP s e u d o r a b i e sV i r u sZ H A N GL i1,2,R E N W e iGk e1,2,L IX i uGl i1,2,L U C h a o1,2,WA N GL iGl i1,2,Z H E N GL i1,2,C H I J i n gGj i n g1,2,T I A N X i a n gGx u e1,2,H A N W e i1,2,Y A N M i n gGh u a1,2(1.T i a n j i nS c i e n t i f i cO b s e r v a t i o nE x p e r i m e n t S t a t i o n f o rV e t e r i n a r y M e d i c i n e a n dD i a g n o s i sT e c h n o l o g y,T h eM i n i s t r y o fA g r i c u l t u r e o f t h eP e o p l e̓sR e p u b l i c o f C h i n a,T i a n j i n,300381,C h i n a;2.T i a n j i nI n s t i t u t e o f A n i m a l S c i e n c e a n dV e t e r i n a r y M e d i c i n e,T i a n j i n,300381,C h i n a)A b s t r a c t:T h e e x p e r i m e n tw a s a i m e d t oe s t a b l i s ha r a p i dP C RGL F D m e t h o d f o r t h ed e t e c t i o no f p s e u d o r aGb i e s v i r u sw i l dGt y p e s t r a i n s b a s e d o n t h e P C R m e t h o d a n d v i s u a l i z a t i o nb y a l a t e r a l f l o wd i p s t i c k(L F D).I n t h i s s t u d y,t w os p e c t i f i cP C R p r i m e r s a n do n en u c l e i c a c i d p r o b ew e r ed e s i g n e db a s e do n t h e c o n s e r v a t i v e r e g i o n s o f g E g e n eo f p s e u d o r a b i e sv i r u s,d o w n s t r e a m p r i m e ra n dn u c l e i ca c i d p r o b e w e r er e s p e c t i v e l y l a b l e db y f l u o r e s c e i ni s o t h i o c y a n a t e(F I T C)a n db i o t i n.T h eo p t i m u m r e a c t i o nc o n d i t i o n so fP C RGL F D m e t h o dw e r e d e t e r m i n e db y s c r e e n i n g t h e a n n e a l i n g t e m p e r a t u r e o f P C R,t h e c o n c e n t r a t i o no f p r i m e r s a n d t h eh y b r i d i z a t i o n t e m p e r a t u r e o f t h e p r o b e,w h i l e i t s s p e c i f i c i t y,s e n s i t i v i t y a n d r e p r o d u c i l b i l i t y w e r e t e s t e d.T h e r e s u l t s s h o w e do n l yp s e u d o r a b i e s v i r u sw i l dGt y p e s t r a i n sw e r e p o s i t i v e,a n dn o c r o s sGr e a c t i o nw e r e o bGs e r v e dw i t ht h eP R VB a r t h aGK61s t r a i na n do t h e rs i xc o n t r o lv i r u ss t r a i n sa n dt h r e ec o n t r o lb a c t e r i a l s t r a i n s.T h e s e n s i t i v i t y o f t h ea s s a y w a s100TC I D50/100μL.T h i s m e t h o dh a df i v er e p e a t e dt e s t sf o r t h e s a m eb a t c ha n dd i f f e r e n t b a t c ho f p s e u d o r a b i e sv i r u sD N A,a n d t h e r e s u l t sw e r e i d e n t i c a l.F o r t h e50s u sGp e c t e d s a m p l e s,16p o s i t i v e s a m p l e sw e r e i d e n t i f i e d b y P R V i s o l a t i o n a n d t h e P C RGL F Ds t r i p m e t h o d,w h i l e 14p o s i t v e s a m p l e sw e r e i d e n t i f i e db y r e g u l a rP C R.T h eP C RGL F D m e t h o dh a dh i g h e r s e n s i t i v i t y t h a nt h e P C R,b u t P>0.05,t h a tw a sn o t i ns i g n i f i c a n t l e v e l.T h ea b o v e r e s u l t s i n d i c a t e dt h a t t h em e t h o do fP C RGL F Df o rd e t e c t i n gp s e u d o r a b i e sh a s g o o ds p e c i f i c i t y,s e n s i t i v i t y a n dr e p e a t a b i l i t y,a n d i td o e sn o t r e q u i r ea g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s t o r e a d t h e r e s u l t s,w h i c h i s s u i t ab l e f o r f i e l d t e s t i n g o f f a r ma n db a s i cGl e v e l l aGb o r a t o r y.K e y w o r d s:P s e u d o r a b i e s v i r u s;P C R;L F Ds t r i p04动物医学进展㊀2018年㊀第39卷㊀第11期(总第305期)。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
敏 感和特异 的检测伪狂 犬病毒 的实时荧光定量 P C R方法。该方法可检 测到相 当于 1 0 c o p i e s / L的病毒 D NA,比常规 P C R检 测
方法高约 1 0 0 倍 ,敏感性较强 ;该方法检验猪瘟病毒、猪繁 殖与呼吸综合征病毒 和猪 圆环病毒 2型呈现 阴性 结果,特异性强 ;变 异 系数 小于 1 %, 具有 良好 的重复性 。 本研 究廷立的实时荧光 定量 P C R方法为临床上 对伪狂 犬病毒 的检 测和 定量 奠定了坚实基础 。 关键词 :伪狂 犬病毒 ;
DETECTI ON OF PS EUD oRABI ES VI RU S
T I AN Qi n g , Z HE NG Ha o , T ONG Wu , L I U F e i , L I ANG C h a o , C A O Y a n - y u n , Z HE NG X u — c h e n ,
t o P R T h e d i s t r i b u t i o n s wi t h a c o e 衔c i e n t o f v a r i a t i o n t o b e l e s s t h a n l % s h o we d t h a t t h e a s s a y h a d g o o d r e p r o d u c i b i l i t y . T h e r e f o r e . t h e q P CR a s s a y wa s a v a l u a b l e t o o l or f r a p i d d e t e c t i o n a n d q u a n t i i f c a t i o n o f P R V. Ke y wo r d s :P s e u d o r a b i e s v i us r ; 妇 g e n e : r e a 1 t i me P CR
中 国 动 物 传 染病 学 报
2 0 1 5 , 2 3 ( 3 ) : 1 - 6
C h i n e s e J o u ma l o f A n i ma l I n f e c t i o u s Di s e a s e s

研究论 文 ・
伪狂犬病 毒实B - , t 荧光定量 P C R 方法 的建立
TONG Gu a ng — z h i , LI Gu o — x i n
( S h a n g h a i V e t e r i n a r y Re s e a r c h I n s t i t u t e C A AS , S h a n g h a i 2 0 0 2 4 1 , C h i n a )
d e s i g n e d a c c o r d i n g t o t h e s e q u e n c e s o f t h e g e n e o f P s e u d o r a b i e s v i us r ( P R V ) . T h i s q P C R a s s a y a l l o we d f o r r a p i d , s e n s i t i v e a n d
s p e c i ic f d e t e c t i o n o f P R V DNA. T h e d e t e c t i o n l i mi t wa s a s l o w a s 1 0 c o p i e s / x i L v i r a l DNA. wh i c h wa s 1 0 0 t i me s mo r e s e n s i t i v e t h a n
A b s t r a c t :R e a l — t i me f l u o r e s c e n c e q u a n t i t a t i v e P C R( q P CR ) a s s a y wa s d e v e l o p e d u s i n g a p a i r o f p r i me r s a n d a T a q Ma n p r o b e t h a t w e r e
中图分 类号 :¥ 8 5 2 . 6 5 9 . 5
基 因;荧光定量 P C R
文献标志码 :A 文章编号 :1 6 7 4 — 6 4 2 2( 2 0 1 5)0 3 — 0 0 0 1 . 0 6
DE VE L oP ME NT oF R EAL — T I ME F L UR ES CE NCE QU ANT I T A T ⅣE P C R F oR
田 青 ,郑 浩 ,童 武 ,刘 飞 ,梁 超 ,曹艳云 ,郑旭晨 ,童光志 ,李国新
( 中 国农业 科学 院上 海兽 医研 究所 ,上 海 2 0 0 2 4 1 )
摘 要: 根 据伪狂犬病毒 ( P s e u d o r a b i e s v i r u s ,R V) 基 因保 守序列 ,设计合成一套特异 引物和 T a q Ma n探针 ,建立 了一种n t i o n a l P C R . T h e r e wa s n o c r o s s — r e a c t i v i t y wi t h o t h e r r e l a t e d v i us r e s , s u c h a s C l a s s i c a l s w i n e f e v e r v i us( r C S F V) , P o r c i n e r e p r o d u c t i v e a n d r e s p i r a t o r y s y n d r o me v i us r ( P ’ RS V) a n d P o r c i n e c i r c o v i us r t y p e 2( P C V2 ) , i n d i c a t i n g t h a t t h e a s s a y wa s h i g h l y s p e c i i f c
相关文档
最新文档