基因中常见的名词解释
基因工程名词解释
名词解释【基因工程】：在体外对不同生物的遗传物质（基因）进行剪切、重组、连接，然后插入到载体分子中（细菌质粒、病毒或噬菌体DNA），转入微生物，植物或动物细胞内进行无性繁殖，并表达出基因产物。
【限制性核酸内切酶】:是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列（4-8bp）,并由此处切割DNA双链结构的核酸内切酶。
【识别序列】：限制性核酸内切酶在双链DNA上能够识别的特殊核苷酸序列被称为识别序列。
【酶切位点】：DNA在限制性核酸内切酶的作用下，使多聚核苷酸链上磷酸二酯键点开的位置被称为切割位点。
【粘性末端】：是指含有几个核苷酸单链的末端，可通过这种末端的碱基互补，使不同的 DNA片段发生退火。
【平末端】：限制酶在它识别序列的中心轴线处切开时产生的平齐的末端。
【同裂酶】：一些来源不同的但能识别位点的序列相同的限制性内切酶。
【同尾酶】：一些来源不同且识别序列不同，但能产生相同粘性末端的限制性内切酶。
【DNA的甲基化程度】:DNA被甲基化酶甲基化，识别序列中的核苷酸一旦被甲基化，就会影响内切酶的切割效率。
【位点偏爱】：对不同位置的同一个识别序列表现出不同的切割效率的现象【内切酶的star活性】：某种限制性核酸内切酶在特定条件下，可在不是原来的识别序列处切割DNA，这种现象称为star活性。
【末端转移酶】：一种能将脱氧核苷酸三磷酸（dNTP）加到某DNA片段上3’-OH基上的酶。
【DNA连接酶】：借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA双链,DNA片段紧靠在一起的3’-OH末端与5’-PO4末端之间形成磷酸二酯键，使两末端连接【DNA聚合酶】：以DNA为复制模板，使DNA由5'端点开始复制到3'端的酶。
【反转录酶】：与DNA聚合酶作用方式相似：5’→3’聚合，模版是mRNA,合成DNA【碱性磷酸酶】：能够催化核酸分子脱掉5’磷酸基团，从而使DNA（或RNA)片段的5’-P 末端转换成5’-OH末端。
基因名词解释
▪1The copy number[拷贝数]：在一个细菌细胞中通常能够找到的某个质粒的分子数.▪2Plasmid incompatibility {质粒的不相容性}：在没有选择压力的情况下，两种质粒不能共存于同一个宿主细胞内。
▪3Prophage [前噬菌体]：噬菌体DNA整合到染色体上的一种形式。
▪4Lysogen[溶源菌]：携带有前噬菌体的细菌。
5the cos sites [柯斯位点]:λ噬菌体DNA分子两5’末端互补的由12个核苷酸组成的单链粘性末端序列。
6Klenow fragment：E.coli DNA聚合酶I经部分水解生成的，位于其C末端的，保留了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性，但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活8性的片段。
▪7Isoschizomers (同裂酶): (1)来源于不同物种，但能识别相同DNA序列的限制性内切酶，切割位点可以相同也可以不同。
▪8Neoschizomers (异功酶, 新裂酶): 来源于不同物种，能识别相同DNA序列，但切割方式不同的限制性内切酶。
▪9Star activity (星号活性)：在极端条件，如pH值升高或低离子强度，限制性内切酶能够切割那些与定义识别序列相似但不完全相同的序列的能力。
▪10Restriction map (限制性图谱): 描述染色体上各种不同限制性内切酶识别位点之间距离和顺序的图谱。
▪11Linkers (接头)：指用化学方法合成的一段平末端的双链寡核苷酸短片段，具有一个或数个限制性内切酶识别位点。
▪12Adapters (衔接体)：是一类人工合成的一头具某种限制性内切酶粘性末端，另一头为平末端的双链寡核苷酸短片段。
当它的平末端与平末端的外源DNA片段连接之后，使后者成为具粘性末端的新的DNA分子，易于重组连接。
▪13 transformation (转化)：①细菌捕获外源DNA而获得新的遗传信息的过程。
分子生物学基因的名词解释
分子生物学基因的名词解释分子生物学是研究生物体内分子组成、结构、功能及其相互作用的科学领域。
基因是生物体内控制遗传特征传递的基本单位。
本文将对分子生物学和基因相关的一些重要名词进行解释，以帮助读者更好地理解这一领域。
DNA (Deoxyribonucleic Acid, 脱氧核糖核酸)DNA是构成基因的重要分子，它携带了生物体遗传信息的编码。
DNA由四种核苷酸分子构成，即腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、鸟嘌呤（G）和胞嘧啶（C）。
这四种核苷酸按照特定的顺序组合成DNA的双螺旋结构，每三个核苷酸称为一个密码子，可以编码一种氨基酸。
基因 (Gene)基因是DNA上的一段特定序列，这段序列编码着构建生物体功能和形态的遗传信息。
基因通过转录和翻译的过程，将这些遗传信息转化为蛋白质的氨基酸序列。
基因是生物进化和遗传传递的基本单位，它们决定了生物个体的性状和特征。
RNA (Ribonucleic Acid, 核糖核酸)RNA是一种类似DNA的核酸分子，它在细胞中起着不同的功能。
与DNA不同，RNA是由单链构成的，其中胸腺嘧啶（T）被尿嘧啶（U）取代。
主要的RNA类型包括信使RNA (mRNA)，核糖体RNA (rRNA) 和转运RNA (tRNA)。
mRNA通过将DNA信息转录成RNA分子，在蛋白质合成中起到携带编码信息的作用；rRNA在核糖体中组装成蛋白质合成所需的核糖体亚单位；tRNA将氨基酸运输到核糖体上以组装成蛋白质。
转录 (Transcription)转录是DNA信息到RNA的复制过程，它是从DNA模板合成mRNA的过程。
转录是一个复杂而精细的过程，通过RNA聚合酶酶附着在DNA的启动子上，并沿着DNA链合成相应的mRNA分子。
转录过程中，遵循碱基互补匹配规则，腺嘌呤（A）和胸腺嘧啶（T）配对，胞嘧啶（C）和鸟嘌呤（G）配对。
翻译 (Translation)翻译是mRNA上的信息被转化为蛋白质的过程。
基因工程考试名词解释
30、增强子（Enhancer）： 增强子是一段DNA序列，其中含有多个能被反式作用因子识别与结合的顺式作用元件。
31、酶（Enzymes） ： 酶是由活细胞合成的，对其特异底物起高效催化作用的蛋白质，是机体内催化各种代谢反应最主要的催化剂。
32、真核细胞（Eukaryote）： 单细胞或多细胞生物，具有复杂的细胞结构，可通过内部的细胞结构，多染色体和单个核而鉴定。
92、核糖体（ribosome）： rRNA与核蛋白体蛋白共同构成核蛋白体或称为核糖体。
94、RNA酶（RNase）： 将RNA降解成更小的RNA片段或核糖核苷酸的一类酶。
95、第二信使（second messenger）： 通常将Ca2+、DAG、IP3、Cer、cAMP、cGMP等这类在细胞内传递信息的小分子化合物称为第二信使。
21、感受态细胞（Competent cells）： 大肠杆菌悬浮在Cacl2溶液中，并置于低温（0-50℃）环境下一段时间，钙离子使细胞膜的结构发生变化，通透性增加，从而具有摄取外源DNA的能力，这种细胞称为感受态细胞。
26、DNase： 将DNA降解为更小的DNA片段或脱氧核糖核酸的酶。
27、电泳（Electrophoresis）： 通过蛋白质在电场中泳动而达到分离各种蛋白质的技术，称为电泳。
29、末端标记（End labeling） 在DNA或RNA的5'-或3'-加上标记性群体（放射性或非放射性）。较典型的有用激酶标记5'-末端，或用DNA聚合酶或末端转移酶标记3'-末端。
8、碱性磷酸酶(Alkaline phosphatase)： 能去除DNA/RNA 5'端的磷酸根的一种酶。制备载体时，用碱性磷酸酶处理后，可防止载体自身连接，提高重组效率。
基因工程技术名词解释
基因工程技术名词解释
基因工程技术是应用分子生物学和细胞生物学的原理和方法进行基因操作，修改生物基因的技术。
常见的基因工程技术名词及其解释如下：
1. 基因克隆：将目标基因从DNA中分离出来，重组到质粒等载体上，使其能够在宿主细胞中自我复制和表达。
2. 基因剪切：利用限制性内切酶进行DNA分子特定的切割，实现目标序列的切除或粘贴。
3. 基因敲除：将目标基因进行替换或删除，通过对细胞的遗传物质进行“删改”。
4. 基因表达：在某种特定的生物体系中使目标基因得以表达并产生蛋白质等特定的作用。
5. 基因转染：将确切的DNA片段转移至另一个生物体细胞内，并让它表达新的蛋白质或修改已有的蛋白质功能。
6. 基因突变：通过人工方式创造或使一段DNA序列产生突变，并观察这种遗传变异对链上蛋白质表现的影响。
7. 基因编辑：通过人为方式改变或删除一个个体或生物各自遗传基因序列的方法，在人体细胞治疗、紫外线损伤等领域具有潜在应用价值。
这些技术广泛应用于生物学、医学和农业领域，使我们可以更精准地控制和修改生物的基因，以满足不同领域的需求。
基因组学名词解释
1、C值:一个单倍体基因组中DNA的总量. C值悖理2、假基因:来源于功能基因但已失去活性的DNA 顺序.3、遗传图 :采用遗传学分析方法将基因或其它DNA顺序标定在染色体上构建连锁图。
遗传图距单位为厘摩(cM), 每单位厘摩定义为1%交换率。
4、物理图（Physical mapping）:采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。
5、重叠群:一群相互重叠的克隆或DNA顺序,可以是草图顺序或精确顺序(finished), 包括连续的(内部无间隙)或不连续的(内部含间隙)DNA顺序,未锚定到染色体上.6、序列间隙：指测序时遗漏的序列，这些序列仍然保留在尚未挑选到的克隆中。
7、物理间隙：指构建基因组文库时被丢失的DNA序列，已从已有的克隆群体中永久性消失8、全基因组鸟枪法测序：将基因组打成小片段后将其克隆到质粒载体中，然后随机挑取克隆对插入片段测序，并以获得的测序序列构建重叠群。
在此基础上进一步搭建序列支架，最后以分子标记为向导将序列支架锚定到基因组整合图上。
9、支架(scaffold):一组已锚定在染色体上的重叠群, 内部含间隙或不含间隙.10、作图测序: 按照大分子DNA克隆绘制的物理图分别在单个大分子DNA 克隆内部进行测序与序列组装,然后将彼此相连的大分子克隆按排列次序搭建支架,最后以分子标记为向导将搭建好的支架逐个锚定到基因组整合图上.11、开放阅读框 ORF：指由一系列指令氨基酸的密码子组成，包括一个起始密码子（ATG），还有一个终止密码子（TAA，TAG，TGA）12、基因敲除：将一段无关的DNA片段用来取代某一特定的基因。
13、同源性(homology):基因(序列同源性) 指起源于同一祖先但顺序已经发生变异的基因成员, 分布在不同物种间的同源基因又称直系基因. 同一物种的同源基因则称水平基因, 水平基因由重复后趋异产生.14、一致性(identity):指同源DNA顺序的同一碱基位置的相同的碱基成员, 或者蛋白质的同一氨基酸位置的相同氨基酸成员, 可用百分比表示.15、相似性(similarity):指同源蛋白质的氨基酸顺序中一致性氨基酸和可取代氨基酸所占的比例. 可取代氨基酸系指具有相同性质如极性氨基酸或非极性氨基酸的成员, 它们之间的代换不影响蛋白质(或酶)的生物学功能.16、异染色质:深色区分布在细胞核的周缘，称为异染色质组成型异染色质：持久性结构，不含任何基因，总是保持致密的组成状态。
基因工程名词解释
基因工程名词解释1.基因工程：指将一种或多种生物体（供体）的基因或基因组提取出来，或者人工合成的基因，按照人们的愿望进行严密的设计，经过体外加工重组，转移到另一种生物体（受体）的细胞内，使之能在受体细胞遗传并获得新的遗传性状的技术。
2.复制子：DNA复制时从一个DNA复制起点开始最终由这个起点起始的复制叉完成的片段。
DNA中发生复制的独立单位称为复制子。
3.半保留复制：即DNA复制时亲代DNA的两条链解开，每条链作为新链的模板，从而形成两个子代DNA分子，每一个子代DNA分子包含一条亲代链和一条新合成的链。
4.一个单位的限制性核酸内切酶：在合适的温度和缓冲液中，在50ul反应体系中，1h完全降解1ug底物DNA所需要的酶量。
5.星号活性：指限制性内切酶的识别位点测定时，当改变测定条件时，有些酶的识别位点也随之改变，可能切割一些与特异识别序列相类似序列的现象。
6.一个韦氏单位：指在37度，20分钟内催化1nmol 32P从磷酸根置换到y，B-32P-ATP所需要的酶量。
7.载体：指基因工程中携带外源基因进入受体细胞的“运载工具”。
8.质粒的不亲和性：也称不相容性，是指在没有选择压力的情况下，两种不同质粒不能够在同一个宿主细胞系中稳定地共存的现象。
9.多克隆位点(MCS)：指载体上人工合成的含有紧密排列的多种限制性和酸内切酶酶切位点的DNA片段。
10.阅读框架：指RNA或DNA中，一组连续且不重复的3核苷酸密码子11.T-DNA：能转移到植物细胞内的DNA片段质粒拷贝数：是指生长在标准的培养基下每个细菌细胞中所含有的质粒DNA分子的数目。
12.探针：是指经放射性或非放射性等物质标记的已知或特定的DNA或RNA序列。
13.DNA的变性：通过加热或变性作用可使DNA双螺旋的氢键断裂，双链解离，形成单链DNA。
14.DNA复性：解除变性条件之后，变性的单链可以重新结合起来，形成双链。
15.平台效应：是指PCR循环的后期，合成的产物到达0.3~1pmol的水平，由于产物积累，使原来以指数增加的速率变成平坦曲线，扩曾产物不在循环次数而明显上升。
遗传学名词解释
1.主缢痕（初级缢痕；着丝粒区）：染色较浅、向内凹陷成狭小区段的部位。
2.次缢痕（副缢痕）：除主缢痕外着色较浅的染色体缢缩区，不能弯曲，与核仁形成有关。
常在短臂出现，位置相对稳定。
3.随体：从次缢痕到臂末端的圆形或略呈长形的突出体。
4.端粒：真核生物染色体臂末端特化的着色较深部位。
由端粒DNA和端粒蛋白组成，高度保守。
作用：维持染色体稳定性5.Homologous chromosomes(同源染色体/P21): Chromosomes that pair (synapse联会) in meiosis and have the same genetic loci（基因座）and structure.6.Haploid(单倍体): a cell or organism(生物体) containing the set of chromosomes normally found in gametes(配子).7.Diploid(二倍体): a cell or organism with two complete sets of homologous chromosomes.8.染色体的核型(karyotype)：一个物种的一组染色体所具有的特定的染色体的大小、形态和数目。
9.分离定律Segregation：一对等位基因在杂合子中，各自保持其独立性，在配子形成时，彼此分开，随机地进入不同的配子.10.自由组合定律Principle of Independent Assortment：支配两对（或两对以上）不同性状的等位基因，在配子形成时，各等位基因独立分配，不同对的基因自由组合。
11. 完全显性：杂合子和显性纯合子的表型相同。
即AA与Aa表现相同。
12.不完全显性：杂合子的表型介于显性纯合子和隐性纯合子之间，又称半显性(semi-dominance)。
13.共显性：指一对等位基因之间，没有显、隐性的区别，在杂合时两种基因的作用都完全表现出来。
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基因组拼接中常见的名词解释
Read：高通量测序平台产生的序列就称为reads。
Contig：拼接软件基于reads之间的overlap区，拼接获得的序列称为Contig （重叠群）。
Scaffold：基因组de novo测序，通过reads拼接获得Contigs后，往往还需要构建454 Paired-end库或Illumina Mate-pair库，以获得一定大小片段（如3Kb、6Kb、10Kb、20Kb）两端的序列。
基于这些序列，可以确定一些Contig之间的顺序关系，这些先后顺序已知的Contigs组成Scaffold。
Contig N50：Reads拼接后会获得一些不同长度的Contigs。
将所有的Contig 长度相加，能获得一个Contig总长度。
然后将所有的Contigs按照从长到短进行排序，如获得Contig 1，Contig 2，Contig 3...………Contig 25。
将Contig按照这个顺序依次相加，当相加的长度达到Contig总长度的一半时，最后一个加上的Contig长度即为Contig N50。
举例：Contig 1+Contig 2+ Contig 3 +Contig 4=Contig总长度*1/2时，Contig 4的长度即为Contig N50。
Contig N50可以作为基因组拼接的结果好坏的一个判断标准。
Scaffold N50：Scaffold N50与Contig N50的定义类似。
Contigs拼接组装获得一些不同长度的Scaffolds。
将所有的Scaffold长度相加，能获得一个Scaffold 总长度。
然后将所有的Scaffolds按照从长到短进行排序，如获得Scaffold 1，Scaffold 2，Scaffold 3...………Scaffold 25。
将Scaffold按照这个顺序依次相加，当相加的长度达到Scaffold总长度的一半时，最后一个加上的Scaffold长度即为Scaffold N50。
举例：Scaffold 1+Scaffold 2+ Scaffold 3 +Scaffold 4 +Scaffold 5=Scaffold总长度*1/2时，Scaffold 5的长度即为Scaffold N50。
Scaffold N50可以作为基因组拼接的结果好坏的一个判断标准。
测序深度和覆盖度：
测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。
假设一个基因大小为2M，测序深度为10X，那么获得的总数据量为20M。
覆盖度是指测序获得的序列占整个基因组的比例。
由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在，测序最终拼接组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域，这部分没有获得的区域就称为Gap。
例如一个细菌基因组测序，覆盖度是98%，那么还有2%的序列区域是没有通过测序获得的。