结构生物学的主要技术手段概述
结构生物学_2版(梁毅主编)课件PPT模板3篇
结构生物学_2版(梁毅主编)课件PPT模板第一篇：结构生物学概述结构生物学是一门利用X射线、核磁共振等技术结合生物学和化学等领域的知识来研究生物大分子结构、功能和相互作用的学科。
它是现代生物科学中一门重要的研究领域，对于揭示生命分子中微观结构与功能之间的关系有重要意义。
结构生物学主要分为两个方面，即静态结构学和动态结构学。
静态结构学主要研究生物分子静态的三维结构，如蛋白质、核酸和多糖等的结构分析；动态结构学则主要研究生物分子在不同时间、空间尺度上的结构变化和相互作用，包括结构分析、动力学和互作关系等。
结构生物学在许多领域都有应用，如药物开发、生物工程、医学诊断和治疗等。
药物开发是结构生物学的一个重要领域，研究药物和生物分子之间的相互作用，以及设计新药物的结构、性质和机理等。
生物工程中，结构生物学可以帮助研究生物分子的构建和功能，如合成新的酶、蛋白质、多糖和药物等。
医学诊断和治疗中，结构生物学可以帮助诊断和治疗疾病，如癌症、病毒感染、免疫疾病等。
结构生物学是生命科学向前推进的重要一环，它使我们对分子生物学的了解更加深入，为我们更好地探究生命之谜提供了有力的支持。
第二篇：基础结构生物学基础结构生物学是结构生物学的基础，它主要研究生物大分子的基本结构和相互作用，如蛋白质、核酸和多糖等。
其中，蛋白质是基础结构生物学中最重要的研究对象之一，因为它们在生命过程中发挥着非常重要和复杂的作用。
基础结构生物学主要研究生物分子的结构、构象和相互作用，以揭示生命分子中微观结构与功能之间的关系。
其中，X射线晶体学、核磁共振和电子显微镜是结构生物学中应用广泛的技术。
通过这些技术，我们可以确定生物分子的三维结构，如蛋白质的立体结构、构象和折叠、催化机制等。
蛋白质是生物大分子中最重要的一种，因此，在基础结构生物学中主要研究蛋白质的结构和功能。
蛋白质结构与功能之间的关系是非常复杂的，可以通过研究其结构和动力学来揭示。
蛋白质的三级结构包括原型结构、中间状态和转化结构，这些结构的确定对于研究蛋白质的生物学功能具有重要的意义。
某工业大学生物工程学院《细胞生物学》考试试卷(45)
某工业大学生物工程学院《细胞生物学》课程试卷（含答案）__________学年第___学期考试类型：（闭卷）考试考试时间：90 分钟年级专业_____________学号_____________ 姓名_____________1、判断题（50分，每题5分）1. 肠上皮细胞微绒毛的轴心成分是微丝，具有收缩的功能。
（）[上海交通大学2007研]答案：错误解析：肠上皮细胞微绒毛的轴心有微丝平行、高度相互配合排列成微丝束。
微丝束对微绒毛的形态起提振作用。
由于有微丝束内不含骨骼肌肌球蛋白、原肌球蛋白和α辅肌动蛋白，因此无收缩功能。
2. 组成生物膜的磷脂都有一个极性的头和两个非极性的尾。
（）答案：错误解析：线粒体膜中的心磷脂有4个非极性的尾。
3. mRNA最先与核糖体的大亚基结合形成起始复合物。
（）答案：错误解析：mRNA最先与核糖体的小亚基结合形成起始复合物。
4. 恶性肿瘤的迅速增长是由于细胞周期的时间变短，细胞分裂加快。
（）答案：错误解析：恶性肿瘤的迅速增长是因为肿瘤细失去了最高分裂次数，没有接触抑制现象，从而转录使得细胞分裂的速度加快。
5. 细胞凋亡与细胞坏死的一个共同特征是细胞膨胀，体积显著增大，趋于解体。
（）答案：错误解析：细胞坏死过程中，细胞膨胀，细胞体积增大，最终胞膜破裂，细胞体内容共价散逸。
而细胞凋亡过程中，细胞核即便和细胞质都发生固缩，最终已经形成凋亡小体。
6. 线粒体基质中的tRNA是由细胞核基因编码在细胞核中转录后，从核孔复合体运送到细胞质，再通过线粒体内外肽接触点位置一次性跨越两层膜运送到线粒体基质中。
（）[南开大学2008研]答案：错误解析：线粒体基质中的tRNA是由索引线粒体自身的基因编码。
7. 磷脂极性头部是带正电荷的，因此它可以直接与带负电荷的氨基酸残基直接相互作用。
（）答案：错误解析：背部磷脂极性头部是带负电荷的，它可以直接与带正电荷的氨基酸残基直接相互作用，与带负电荷的氨基酸残基作用人带时，需通过Ca2＋、Mg2＋等阳离子为中介。
生命科学领域中的结构生物学技术
生命科学领域中的结构生物学技术随着科技的发展和人们对生命结构的深入研究，结构生物学成为世界各国生命科学研究中的重要一环。
结构生物学是一门研究生物大分子（主要是蛋白质和核酸）的空间结构和功能的学科，其研究手段主要为X射线晶体学、NMR和电子显微镜等技术手段。
结构生物学技术的应用范围广，可以涉及各个生命科学领域。
常见的应用领域有新药研究开发、生物学基础研究、基因治疗、疾病诊断与治疗等。
下面我们将结构生物学技术在这些领域中的应用进行介绍。
一、新药研究开发结构生物学技术在新药研究开发领域中具有重要的作用，主要是通过了解药物与蛋白相互作用的结构来推断药物的特性、设计出更优化的药物分子，或分析某些蛋白结构域的结构与功能，来研究不同的药物分子作用于该结构域的机制。
通过X射线晶体学技术和大规模基因测序技术的结合，科学家们可以对人体中的潜在药物靶点进行筛选和评估。
这使得早期新药研发过程中更容易发现将会被广泛接受的化合物。
瑞士罗氏公司就是一家应用结构生物学技术进行药物研发的公司。
其可以通过晶体学对蛋白质结构进行解析并设计对应的治疗药物。
二、生物学基础研究生物学基础研究是生命科学领域最为基础的科学研究，它的任务是深入探讨生物分子的结构与功能，并为相关领域的研究提供重要的支撑和指导。
在结构生物学领域，通过对蛋白质和核酸等生物分子进行结构研究，我们可以了解到这些分子与生物体内其他分子之间的相互作用和影响，从而为分子生物学的研究提供有力的支持。
例如调控基因表达的gRNA-CAS9技术，利用细菌而非在复杂的宿主细胞中完成的DNA编辑技术。
然而，对于许多基因型或表型，目前一个大问题是获得从gRNA-CAS9复杂制备到微细元件涂敷的高质量晶体的X射线晶体结构。
三、基因治疗基因治疗是一个新兴领域，它的基本原理是通过转移正常基因到患有某种疾病的细胞或组织中，从而恢复其正常功能，实现治疗效果。
结构生物学技术在基因治疗领域中起着关键的作用。
结构生物学技术的原理和应用
结构生物学技术的原理和应用结构生物学技术是一种通过对分子结构的分析和解析，来深入研究生物分子结构、功能和相互作用的技术。
其主要原理是通过采用一定的技术手段，如X射线晶体学、核磁共振等，对生物分子进行分离、纯化、结晶、成像等处理，从而得到分子结构的有关信息，从而揭示其功能和相互作用的原理。
结构生物学技术是一种高级的科学研究，不仅需要高水平的科学研究人员，还需要先进的仪器设备和科学技术手段实现。
一、结构生物学技术的原理结构生物学技术主要依赖于两种主要技术手段：（1）X射线晶体学X射线晶体学是一种通过制备生物分子的晶体和对其进行X射线衍射，从而推导出分子结构的技术。
这种技术的原理是，当一束X射线通过晶体时，晶体中的原子结构会对X射线的传播产生干涉效应，从而形成一系列的衍射图样，这些数据可以通过各种图像分析技术进行处理，推导出分子结构信息。
（2）核磁共振技术核磁共振技术是借助于核磁共振现象，对生物分子进行研究的一种技术。
功用原理是通过在外加磁场下，使处于磁场中的核自旋发生共振，利用电磁感应产生的信号，对核自旋周围的环境进行分析，并推导出分子的结构信息。
二、结构生物学技术的应用结构生物学技术在生命科学研究中有着广泛的应用，下面主要介绍其在三个方面的应用：（1）药物研发药物研发是综合性的一种任务，需要从分子层面理解药物和受体之间的相互作用，这就涉及到分子结构的解析和理解。
结构生物学技术可以帮助寻找分子间的关键结合点，并从中研究分子的功能机理，为药物的研发和设计提供依据。
（2）蛋白质工程蛋白质工程是一种针对生物分子进行修饰和改变的技术，旨在得到具有更强的生物活性的分子或新型的分子，再生物制造、医药等领域具有广泛的应用前景。
结构生物学技术可以帮助研究蛋白质的结构、功能机理，探究蛋白质分子的结构变化，在研究蛋白质的重构、修饰和改变方面具有广泛的应用。
（3）癌症治疗癌症是当代医学的一个重大挑战，治疗癌症需要对肿瘤细胞进行有针对性的干预，这就需要了解细胞和病毒的分子结构和相互作用。
结构生物学课程大纲
三维重构:是电子显微图像含有振幅和相位的信息，二者可通过数字图像处理的傅立叶变换方法提取出来.
三大方法：X 射线衍射技术，核磁共振，电镜三维重建技术。
特别是多分子的复合体和膜蛋白结构的突破 结构基因组计划在全球兴起 雷啊……
还有频率域，频率域的核磁图谱成单峰状。 proton NMR 质子 NMR： 每一种原子核都可以吸收或释放不同频率的 Rf （无线电波） 。按某种标准测量化学位移（ppm） 。一个原子的化学位移依赖于原子核的 电子环境。 3 P6
理论层次：定性⇒ 定量
方法学： 描述、归纳⇒ 演绎、推理
对象： 宏观现象⇒ 微观本质
By Jason Wan
结构生物学概论目录哈 第一章结构生物学的研究现状与发展趋势 结构生物学诞生的背景；结构生物学时代的到来；结构生物学是生命科学的前沿和主流；结构生物学主要研究手段 简介；结构基因组学简介；结构生物学研究的新进展。 第二章结构生物学的研究方法 核磁共振;电子晶体学和电子显微学三维重构;X 射线晶体学 第三章蛋白质分离纯化及其晶体生长 1. 蛋白质的表达与纯化 [主要内容]：蛋白质在大肠杆菌、昆虫细胞和酵母中表达的原理、 方法和关键技术；蛋白质的纯化方法和纯度鉴定。 2. 蛋白质的结晶和晶体生长 [主要内容]：蛋白质结晶的原理、技术和方法、对材料的要求、晶 体生长的理化条件、晶体的鉴定。 第四章蛋白质晶体结构的解析 3. 衍射数据的收集 [主要内容]：晶体的收集与冷冻处理；X 射线源的选择；衍射线记 录装置及其使用方法；衍射数据收集的全自动化。 4. 蛋白质结晶结构的解析 [主要内容]：蛋白质晶体空间群(Space group); 相位(Phase)的测 定；电子密度图的解释；结构模型的修正与精化。
生命科学中的结构生物学技术研究
生命科学中的结构生物学技术研究生命科学是一个多元化的领域，涉及广泛的研究内容和方法。
其中，结构生物学技术是生命科学领域中一个重要的技术分支。
它通过对生物大分子结构进行高分辨率的解析，揭示生物大分子的结构及其相互作用，为生命科学的研究提供了重要的工具和手段。
一、结构生物学的内涵和研究对象结构生物学是研究生物系统中分子结构的一门科学。
它包括基于物理和化学的方法，以及各种分析方法和图像技术。
研究的对象是各种生物大分子，包括蛋白质、核酸、糖等。
它通过对生物大分子的高分辨率结构解析，揭示了分子内部结构、功能及其相互作用的特征和机制，为生命科学研究提供了很多有价值的信息。
二、结构生物学的研究方法1、X射线晶体学X射线晶体学是结构生物学领域中应用最广泛的技术。
它通过测量蛋白质或其他生物大分子晶体的X射线衍射数据，以确定晶体中所有原子的位置和氨基酸残基的排列方式，从而揭示分子的高分辨率结构。
这种技术主要适合于规模较大的分子，比如蛋白质和病毒。
2、核磁共振技术核磁共振技术是一种利用核磁共振现象和磁场对分子进行结构解析的技术。
它可以对分子的三维结构进行高度精确的测定，并可检测分子内部的动态性质。
这种技术主要用于较小的分子，比如核酸，以及不能结晶的蛋白质分子。
3、电镜技术电镜技术是一种将生物分子样品置于电子束中进行成像的技术。
它能提供关于生物分子的形状和大小的高分辨率信息。
这种技术主要用于高分子复合物和细胞级别的生物大分子结构解析。
三、结构生物学在药物研发中的应用药物的研发是结构生物学中的一个重要应用领域。
药物的治疗效果往往是通过和生物大分子相互作用来实现的。
因此，药物的研发需要了解生物大分子的结构和其与药物之间的相互作用，才能设计出具有高效的药物分子。
结构生物学提供了一些重要的技术手段来解析生物大分子与药物之间的相互作用，从而为药物研发提供了有力的支持。
四、结构生物学在基因工程中的应用基因工程是一种通过改变生物分子的基因序列以及表达覆膜，来实现新功能的技术方法。
生命科学中的结构生物学技术
生命科学中的结构生物学技术随着科技的不断发展，人们对于生命系统的认识也越来越深入。
结构生物学作为生命科学领域中的一个前沿领域，旨在揭示生物分子或者其组装的结构，以及它们与功能、机理、调控之间的关系。
而结构生物学技术，需要通过多种技术手段，从多个角度解析生命体系中的分子结构，从而进一步深入研究生命的本质。
三维结构决定生物的功能、机理和调控生命科学的研究一直以来都是通过分子或者其组装进行分析的。
分子内部的互作关系以及分子与宿主的保持平衡的关系都是由分子的结构所决定的。
在这样的背景下，结构生物学就应运而生。
结构生物学不仅仅可以通过结构解析，揭示出分子内部的二面角、距离和方向等结构特征，还可以更直观地描绘出分子之间的相互作用的形态、密度和动态性等。
通过这样的研究，人们可以进一步了解生物分子与生命的特性之间的相互关系。
成像技术推动解析生命分子的边界不断拓宽随着技术的进步，结构生物学技术也在不断发展中。
X射线衍射技术是传统的结构解析技术，也是目前最为常用的技术之一。
此外，如核磁共振成像技术、电子显微成像技术和原子力显微镜成像技术也逐渐成为了现代结构生物学研究中的重要组成部分。
这些技术的不断完善和提高，为人们提供了更加完整和准确的分子结构信息，也推进了生命分子结构的解析边界不断的拓宽，使得生命分子的结构研究越来越深入和精细。
凝聚态物理学和生命科学的结合，为“液相分子”研究提供了新思路生命体系中的大多数分子很难获得单分子级别的结构。
这是由于生命体系的中的分子常常是以一种高度精细的环境中活动的，它们与其周围物质的相互作用会对其行为和结构产生多种影响。
此时，凝聚态物理学和生命科学的结合便可为液相生命分子结构的研究提供更为深入的思路。
生命体系中的分子往往都是液相分子，液相物理就是研究液相分子运动、相互作用的学科。
让生命科学中的研究者去学习液相物理，获得液相物理的知识和技术，便可为液相分子的结构研究提供新的思路和方法。
结构生物学研究中的关键技术
结构生物学研究中的关键技术结构生物学是研究生物体内大分子结构的科学，包括蛋白质、核酸、多糖等大分子和它们之间的相互作用。
结构生物学的出现为我们深入理解生命学提供了一个关键的工具。
而在结构生物学的研究中，关键技术是不可缺少的，它们使得我们能够更加深入的了解生命学中的许多过程，帮助我们解开生命学之谜。
一、X射线衍射技术X射线衍射技术是解决结构生物学中最重要的难题之一的技术。
它是通过将蛋白晶体置于X射线束的路径中进行照射，利用晶体对X射线的衍射来确定晶体内的原子位置。
通过X射线衍射技术，我们可以得到生物大分子的三维结构信息，获得大量蛋白质三维结构的数据。
现代药物设计和生物技术的进展都离不开X射线衍射技术。
二、核磁共振技术核磁共振技术作为一种非常重要的结构生物学技术，利用核磁共振现象来解析大分子结构。
核磁共振技术可以用于研究蛋白质的结构、动力学和相互作用。
通过核磁共振技术，可以确定大分子的三维构象，并揭示其与其他生物大分子的相互作用和反应动力学。
通过分析这些信息，我们可以更深入地了解生命物质在生物过程中所发挥的作用。
三、电子显微技术电子显微技术是研究大分子结构的重要技术，在结构生物学中有着重要的应用。
电子显微技术可以用于测量生物大分子的纤维结构、薄片结构和表面形貌等。
近年来，随着技术的不断发展，通过电子显微技术，我们可以研究到分子之间的相互关系以及分子间的相互作用。
四、计算机辅助设计技术计算机辅助设计技术是一种重要的辅助结构生物学的技术。
随着科技的发展，计算机已经成为设计大分子结构的工具。
现在，我们可以使用无数计算机程序，通过结合实验数据和计算模型，来进行高精度的模拟和计算。
这种技术可以帮助我们设计分子之间的相互作用模型，以及预测蛋白质等大分子的3D结构。
它在大分子结构的研究和开发中使用广泛，并为新药物的设计和研制提供了有力的支持。
五、光学显微技术光学显微技术是一种在生物科学研究中运用最广的技术之一。
利用高清晰度的光学显微镜，可以观察到非常小的生物体的结构和生命活动。
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结构生物学的主要技术手段概述
XXX
（XXXXX大学生命科学与技术学院，XXX省XXX市100000）
摘要：作为以极其复杂的生命系统为研究对象的实验科学，结构生物学每一次飞跃性的发展都离不开实验技术和手段的突破。
而现今结构生物学研究的主要三大方法为：x射线晶体衍射法、核磁共振波谱法和冷冻电镜法。
本文通过查阅相关资料对这三种方法的原理和发展过程进行了概述，并将三者的优缺点进行对比，且进一步讨论了三者的真实性问题。
关键词：结构生物学x射线晶体衍射法核磁共振波谱法冷冻电镜法
根据定义，结构生物学一门是以生物大分子三维结构（Tertiary structure）（包括构架和形态）的确定作为手段，研究生物大分子的结构功能关系，探讨生物大分子在生命活动过程中的作用机制和原理的学科。
结构生物学是一门分子生物学、生物化学和生物物理学的交叉分支1。
由于结构生物学能够从分子和原子水平上解释生物大分子的构象和相互作用的方式，而所有的生命活动都是通过各种生物大分子的相互作用来实现；因此，对于生物学家们来说，这是一个非常有吸引力的领域，对于人们更加深刻地认识生命过程的机制十分有力，因而如今已成为生命科学的前沿和带头学科。
然而正如几乎所有的生物学分支一样，作为以极其复杂的生命系统为研究对象的实验科学，结构生物学每一次飞跃性的发展都离不开实验技术和手段的突破。
作为一门交叉学科，物理学、化学和分子生物学的进步也都推动着结构生物学的发展。
而通常来说，解析所研究的生物大分子的结构是结构生物学研究的基础和根本，因而没有哪一个学科能像它一样，如此深刻又紧密地受到生物大分子结构解析相关技术的直接牵制与影响。
没有这些技术，就没有结构生物学。
1.x射线晶体学
1895年德国物理学家伦琴发现X 射线；1912 年，由劳厄为首的物理学家们发现X射线可以被矿物晶体所衍射。
之后的一百年里，在科学家们的努力下，X 射线衍射方法成功地应用于测定无机和有机物晶体的原子结构。
晶体学由此极大地推动了结构化学、固体物理、材料科学(包括金属及半导体材料等)、结构生物学、药物研发等重要现代科学领域的快速发展2。
由于所有的原子都含有电子，并且X射线的波长范围为0.001－10纳米，其波长与成键原子之间的距离（约数十纳米）相当，因此我们可以利用电子对X 射线的散射作用，获得晶体中电子密度的分布情况，再从中分析获得关于原子位置和化学键的信息，即晶体结构。
X射线可用于研究各类分子的结构，但是，到目前为止还不能用X射线对单个的分子成像，因为没有X射线透镜可以聚焦X 射线，而且X射线对单个分子的衍射能力非常弱，无法被探测。
而晶体（一般为单晶）中含有数量巨大的方位相同的分子，X射线对这些分子的衍射叠加在一起就能够产生足以被探测的信号。
因此，X射线晶体学可以对各类晶体结构进行研究。
基本流程：获得晶体——衍射数据收集——数据分析——晶体结构解析——
建立和改进分子模型3。
2.核磁共振波谱法（NMR）
具有核磁性质的原子核(或称磁性核或自旋核)，在高强磁场的作用下，吸收射频辐射，引起核自旋能级的跃迁所产生的波谱，叫核磁共振波谱。
利用核磁共振波谱进行分析的方法，叫做核磁共振波谱法（NMR）。
简单来说，由于所处的化学环境不同，原子发生能级跃迁时所产生的波谱也不一样。
因此我们在知道了一维结构的基础上，能够根据从中得到的诸如耦合信息和距离信息来解析蛋白质的空间结构。
1984 年，Wuthrich 等建立了磁共振解析蛋白质结构的草案。
基本程序如下：( 1 ) 蛋白质水溶液的制备。
蛋白质浓度在1 mmol/L 左右，并且保持均一和稳定。
(2)用磁共振谱仪采集蛋白质样品的两维氢谱。
(3)按顺序归属每个氢原子的化学位移数值。
(4)收集NOE 距离约束的数据。
(5)通过距离几何来计算蛋白质的三维结构。
(6)通过能量最低化来优化蛋白质结构4。
3.冷冻电镜
透射电镜(transmission electron microscopy，TEM)可以观测到分子水平的生物样品。
TEM 图片代表所观测的样品在不同朝向上的投影，这些投影可以通过特定的算法对样品进行三维重建。
但是早期由于生物样品本身所具有的特殊性，限制了冷冻电镜技术的发展：第一，生物样品中含水量较高，而透射电镜要求样品处于高真空的状态下；第二，高能量的电子会对样品造成损坏；第三，生物样品主要组成是碳、氢、氧等轻元素，对电子的反射及散射与水背景相比效果相近，获得的电镜图像衬度反差很小。
因此，早期电镜三维重建技术的发展主要集中在解决这些基本问题上。
1974 年Ken Taylor 和Robert Glaeser 发现冷冻样品可以保持蛋白质的高分辨信息。
这个工作标志着冷冻电镜应用于生物物理学领域的开始。
随后，Dubochet 等人发展了一套切实可行的玻璃态样品的冷冻方法。
自2013年以来，冷冻电镜取得了革命性的进步，其中最主要的原因之一是电子直接探测器(direct electron-detector device，DDD)的发展5。
DDD可以直接探测电子信号，而不像电荷耦合器件(charge-coupled device，CCD)需要利用光电效应记录数字信号，从而大大提高了信号的转换效率，提高了信噪比。
4.对比与优缺点
1)有效性
与其他结构解析方法相比，x射线晶体衍射分辨率高，且适用于各种大小的蛋白质分子。
用于X射线晶体学研究的晶体通常边长小于一个毫米。
而与之互补的核磁共振波谱学技术，不需要其研究对象形成晶体，能够直接检测溶液中的蛋白质结构状态，也具有独特的优势。
我们知道，蛋白质三维空间构象不是静止的，而是在不同的构象之间进行转换，蛋白质的动态特征往往与生物学功能联系非常紧密。
而NMR技术则是目前惟一能够提供高分辨率动态信息的实验手段。
不过，该方法仅适用于分子量较小的蛋白质、核糖核酸(RNA)或者它们的结构域，无法解决复杂蛋白质和蛋白复合体的结构问题。
冷冻电镜近年来变得十分火热，该方法不需要蛋白质分子形成晶体结构并且仅需要相对较少量的生物样品，通过快速冷冻可以获得生物大分子的天然状态。
近年来，硬件和软件的发展使得单颗粒冷冻电镜可以得到近原子分辨率的生物大
分子结构，极大地提高了冷冻电镜的应用范围。
另外图像采集以及数据处理的效率较之前都有了很大的提高，越来越多的高分辨大分子结构通过该技术被解析出来。
图1：各种晶体结构解析方法的性能比较6
2)真实性
结构生物学解出的结构与生命体中真实存在的生物大分子结构之间是否存在差异？理论上确实存在，但无人能够明确说明差异的大小，只是随着技术的发展，人们的认识也在越来越接近真实。
现在技术的基础上，差异往往不会影响对于生物学功能的解读与分析。
也就是说，即便存在这个差异，结构生物学获得的认知仍然是足够精确的。
在目前结构生物学的三大方法中，X射线晶体学得出的是晶体内所有不对称单位内生物大分子的平均结构，也就是说，根据晶体衍射的原理，我们看到的是分子间相同的、被放大了的性质，而看不到不同的地方。
这种平均结构本身存在方法上的平均化问题，无法逾越；另一方面，晶体堆积的力量会导致蛋白质等生物大分子在晶格内处于一种轻微承力受压的状态，这也使其结构与自由的溶液状态有所不同。
但是这些差异主要发生在蛋白质表面灵活性较高的部位，而非其稳固、保守的区域，因此，只要在功能分析时加以注意，是不会有影响的。
NMR方法则与X射线晶体学方法恰恰相反，得到的是自由的溶液状态结构，且有多个状态，基本上能够较好地还原生物大分子的工作状态，且能够得到更多
动态的信息，但也依赖于算法的优化和科学家们的解读。
冷冻电镜的方法与晶体学方法有异曲同工之处，同样是获得平均结构，因而同样有灵活性较大区域被平均化的问题。
此外，冷冻电镜方法和目前主流的晶体学方法都要对样品进行冷冻（100K以下）。
有研究指出，这样的低温环境也会对结构有轻微的影响。
参考文献：
1维基百科-结构生物学词条
https:///wiki/%E7%BB%93%E6%9E%84%E7%94%9F%E7%89%A9%E5%AD%A6
2苏晓东,曹駸. 蛋白质晶体的魅力——国际晶体学年漫谈结构(晶体)生物学[J]. 物
理,2014,(08):535-542.
3维基百科-x射线晶体学词条
https:///wiki/X%E5%B0%84%E7%BA%BF%E6%99%B6%E4%BD%93%E5%AD%A6 4Kurt Wüthrich,傅青山,江亚军. 蛋白质磁共振——从结构生物学到结构基因组学[J]. 生命科学,2010,(03):207-211.
5朱亚南,张书文,毛有东. 冷冻电镜在分子生物物理学中的技术革命[J]. 物
理,2017,(02):76-83.
6Dror, Ron O., et al. "Biomolecular simulation: a computational microscope for molecular biology." [J].Annual review of biophysics 41 (2012): 429-452.。