结核分枝杆菌GeneXpert核酸扩增检测操作步骤(精品文档).docx

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赛沛 genexpert 原理

赛沛 genexpert 原理

赛沛 genexpert 原理以赛沛 Genexpert 是一种用于快速检测病原体的分子诊断技术。

它采用核酸扩增技术,能够在短时间内检测出病原体的存在,对于临床诊断和疾病控制具有重要意义。

Genexpert 技术原理是基于聚合酶链式反应(PCR)的扩增技术。

PCR 是一种体外快速扩增DNA的方法,将目标DNA片段经过多轮循环扩增后,可以得到数量可观的目标DNA。

Genexpert 利用PCR 技术扩增病原体的核酸,然后通过荧光探针实时检测扩增产物。

Genexpert 的扩增过程主要分为三个步骤:变性、引物结合和延伸。

首先,将样本中的病原体核酸变性,使其变为单链。

然后,引物与目标核酸的特异性序列结合,形成DNA-RNA 复合物。

最后,DNA 聚合酶以引物为模板,延伸目标核酸链,合成新的DNA 链。

这个过程将在循环中重复多次,每一轮都会使目标核酸的数量成倍增加。

Genexpert 的关键之处在于荧光探针的设计和检测系统的优化。

在扩增过程中,荧光探针会与目标DNA 片段结合,形成荧光信号。

这个信号会被检测系统实时监测,通过荧光信号的强度可以确定扩增产物的数量。

通过监测荧光信号的变化,可以确定样本中是否存在病原体。

Genexpert 技术的优点在于其快速、准确和高灵敏度。

相比传统的病原体检测方法,Genexpert 可以在短时间内完成检测,节省了时间和人力资源。

此外,Genexpert 还可以进行多种病原体的同时检测,提高了检测效率。

它的灵敏度高,能够检测到低浓度的病原体,有助于早期诊断和治疗。

Genexpert 技术在临床应用中有着广泛的用途。

它可以用于检测各种感染性疾病,如结核病、性病、呼吸道感染等。

此外,Genexpert 还可以用于判断病原体的耐药性,为临床治疗提供重要参考。

它还可以用于疫情监测和疾病防控,及时掌握病原体的传播情况,采取相应的措施。

总结起来,以赛沛Genexpert 是一种基于PCR 技术的分子诊断技术,能够快速、准确地检测病原体的存在。

GeneXpert_MTB

GeneXpert_MTB

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一)粪便 \=5A@应用优势 由于儿童结核病诊断过程中痰液或胃液抽吸物 样本获得较困难%目前其在儿童结核病诊断中的敏 感度较低-+.%其次%儿童体液量较少%胸腔积液)脑脊 液)肺泡灌洗液)胃液等样本量采集量不足&且儿童 配合度低%采集标本质量差-G.%这就使得儿童结核病 的诊断更加困难( J<A:<N0等--.指出%含 )DE 的痰可被吞咽%特 别是在睡眠期间%抗酸杆菌也已被证明可在消化过 程中存活%并可在粪便中检测到%因此%粪便 \=5A@ 检测用于诊断肺结核是可行的%而 C19等-'&.研究成 果中指出 \=5A@检测粪便标本在儿童和青少年结核 病的 治 疗 管 理 中 有 重 要 的 诊 断 价 值(同 时 针 对 \=5A@检测 敏 感 度 低 的 特 点%随 着 新 一 代 测 序 技 术 [565\=5A@)DE$H#T ^2@A0"简称4\=5A@^2@A05#出 现%补 充 了 \=5A@检 测 敏 感 度 低 的 问 题-''.%\=5A@ ^2@A0较 \=5A@增加了#"'&G'和#",''&区域探针% 提高了 )DE的检出率( 二)粪便 \=5A@检测样本处理方法 不同的粪便样本处理方法可能会影响结果的敏 感度及特异度%从而影响最终的诊断结果%因此%标 本的处理方法至关重要%目前国际及国内尚无统一 的粪便处理方法%已知用于 \=5A@检测的粪便处理 方法如下!

结核xpert操作方法

结核xpert操作方法

结核xpert操作方法结核某pert是一种用于检测结核病的诊断工具,它使用了核酸扩增技术,可以快速、准确地检测出结核分枝杆菌(MTB)的存在。

下面是结核某pert的操作方法。

1.准备工作在操作结核某pert之前,需要准备以下材料和设备:结核某pert试剂盒、结核某pert设备、标准化处理区域、医疗废弃物容器等。

2.样本采集可以采集的样本包括痰液、脑脊液、胸腹水、气管刷检样本等。

使用无菌容器采集样本,并确保样本完整、无污染。

在操作前和操作后,应对样本进行正确的标识和处理。

3.样本预处理将采集的样本转移到结核某pert试剂盒中,并按照试剂盒上的说明准备样本。

在准备样本时,应遵循试剂盒说明书中的操作步骤。

4. 结核某pert设备的设置将结核某pert设备连接到电源,并根据设备的说明将其设置为正确的操作模式。

确保设备的正确性和稳定性,并记录设备的使用信息。

5. 结核某pert试剂盒的操作将制备好的样本安置到结核某pert试剂盒中,按照试剂盒说明书中的操作步骤进行操作。

在试剂盒中加入开盖液,并将样本与试剂充分混合。

6. 结核某pert设备的运行将试剂盒安置到结核某pert设备中,按照设备的说明进行操作。

启动设备并运行测试程序,等待相关的运行指示。

7.结果判读在测试完成后,结核某pert设备会自动显示结果。

结果分为阳性、阴性和无效三种。

阳性表示样本中存在结核分枝杆菌(MTB),阴性表示样本中不存在MTB,无效表示测试过程中发生了某种错误。

8.结果报告根据结核某pert设备显示的结果,生成测试报告。

测试报告应详细记录样本信息、操作过程和结果。

同时,还需要将测试结果与患者的病情进行关联,为医生提供参考。

9.结果跟踪和管理记录结核某pert的使用情况,包括每次使用的设备信息、样本信息和测试结果。

及时处理测试过程中出现的问题,并采取相应的措施加以解决。

总结:结核某pert操作方法涉及到样本采集、样本预处理、结核某pert设备的设置和运行、结果判读、结果报告以及结果跟踪和管理等步骤。

结核分支杆菌(TB)核酸检测标准操作规程

结核分支杆菌(TB)核酸检测标准操作规程

结核分支杆菌(TB)核酸检测标准操作规程1.目的:规范结核分支杆菌(TB)核酸检测操作流程,保证检测结果的准确性。

2.应用范围:PCR实验室。

3.职责:3.1 文件编写:PCR实验室技术员。

3.2 文件审核:PCR实验室负责人。

3.3 文件审批:实验室主任。

3.4 执行:PCR实验室所有工作人员。

4. 参考文献:4.1《中山大学达安基因股份有限公司结核分支杆菌核酸扩增(PCR)荧光检测试剂盒说明书》4.2《中山大学达安基因股份有限公司DA7600核酸序列检测系统用户手册》5. 内容:5.1 检测方法:PCR-荧光探针法。

5.2 实验原理:用一对结核分支杆菌(TB)特异性引物和一条结核分支杆菌(TB)特异性荧光探针,配以PCR反应液、耐热DNA聚合酶(Taq酶)、四种核苷酸单体(dNTPs)等成分,通过PCR体外扩增法,即高温变性、低温退火、适温延伸进行DNA扩增,并对PCR全过程进行实时监测,从而检测结核分支杆菌核酸。

主要用于TB感染的辅助诊断及其疗效监测的标准。

5.3 性能参数:5.3.1 检测下限:5.0×102基因拷贝/ml。

5.3.2 线性范围:5.0×102~5.0×108基因拷贝/ml。

5.4 标本采集:由合作单位按照以下要求进行采集。

5.4.1 标本类型:痰液、肺及支气管灌洗液、尿液等。

5.4.1.1 痰液:清晨从肺深部咳出痰液,取1~3 ml置于无菌玻璃管内,密封送检;婴幼儿用密闭容器与无菌吸痰器相连,吸取痰液,密封送检。

5.4.1.2 肺及支气管灌洗液:收集灌洗液1~3 ml置于无菌玻璃管内,密封送检;5.4.1.3 尿液:用无菌5ml玻璃管收集中段尿1~3ml,密封送检。

5.4.2 标本保存:标本采集后保存于2~8℃。

5.4.3 运送条件:标本运送采用冰壶。

5.5 设备和试剂:5.5.1 设备: DA7600荧光定量PCR仪、低速水平离心机、生物安全柜、台式高速离心机、移液器、混匀器、恒温水浴箱/干式恒温器、冰箱(4℃、-20℃)、移动/固定紫外灯、冷冻离心机。

041 结核分枝杆菌核酸扩增检测标准操作-检验科作业指导书

041 结核分枝杆菌核酸扩增检测标准操作-检验科作业指导书
【检验方法】
1.标本及质控品的处理
痰液中加入4倍体积的4%NIaOH,摇匀,室温下放置30分钟左右液化,取0.5m1至1.5m1离心管中,再加入0.5m14%№OH室温放置10分钟后15,000rpm离心5分钟。去上清,沉淀加无菌生理盐水lm打匀,15,000rpm离心5分钟;再重复洗涤—次。(血液标本直接用淋巴细胞分离液分离沉淀白细胞)沉淀直接加50u1DNA提取液充分混匀,(提取液内含不溶于水的物质,取样时需用加样器充分混匀后吸取。如出现因吸头嘴部太细不能吸取或取样后堵塞吸头的现象,可先用洁净无污染的剪刀将吸头嘴部剪去一截。)沸水浴1O分钟(误差不超过1分钟),转至4℃静置6-8小时以保证充分裂解。10,000rpm离心5分钟,取上清液2u1做PCR反应。另取阴性质控品、阳性质控品各50u1加等量DNA提取液打匀,沸水浴10分钟后同上处理。
反应结束后保存检测数据文件。根据分析后图像调节baseline的start值(2~4),stop值(7~9)以
*****检验科作业指导书
*****检验科
作业指导书
结核分枝杆菌核酸扩增
检测标准操作
文件编号:
版本:
生效日期:
页码: 第2页共2页
及Threshold值,最后到Reporter窗口下记录仪器自动分析计算出的Ct值。
试验灰度区:如果27≤Ct值< 30,则为试验灰度区,需重复试验一次,若重复试验结果Ct值<30判为阳性,否则判为阴性;
【注意事项】
1.试验前请仔细阅读本说明书;
2.试验室管理应严格按照PCR基因扩增试验室的管理规范,试验人员必须进行专业培训,试验过程严格分区进行(试剂准备区、标本制备区、扩增和产物分析区),所用消耗品应灭菌后一次性使用,试验操作的每个阶段使用专用的仪器和设备,各区各阶段用品不能交叉使用;

GeneXpert 检测在肺结核病的临床诊断及治疗中的应用价值分析

GeneXpert 检测在肺结核病的临床诊断及治疗中的应用价值分析

GeneXpert 检测在肺结核病的临床诊断及治疗中的应用价值分析刘畅【摘要】目的:探讨GeneXpert检测方法在临床诊断及肺结核病治疗中的应用效果。

方法:收集已经确诊及治疗的80例肺结核病住院患者的痰标本,对其进行痰涂片法、罗氏固体培养法、比例法药敏和GeneXpert检测,观察其特异性以及敏感度。

结果:GeneXpert检测与罗氏固体培养金标准之间具有较好的一致性,同时比例法药敏与GeneXpert检测也具有较好的一致性。

结论:与常规检测方法相比,GeneXpert检测能够快速有效对早期结核病进行诊断,同时可以为利福平耐药情况提供数据支持,值得临床上推广使用。

【期刊名称】《医学理论与实践》【年(卷),期】2016(029)024【总页数】3页(P3392-3393,3394)【关键词】GeneXpert检测;结核病;罗氏固体培养法;比例法药敏【作者】刘畅【作者单位】云南省第二人民医院检验科,云南省昆明市 650021【正文语种】中文【中图分类】R446结核病通常是指结核分枝杆菌通过侵犯肺部等器官后导致产生结核疾病的统称。

肺结核为结核分枝杆菌引起的肺部感染性疾病,其传播途径主要为呼吸道,潜伏期4~8周,患者发病后常常会出现乏力、咳嗽、咯血等症状。

目前临床上普遍采用痰涂片抗酸染色、固体培养法等方式来诊断结核病,由于此类检测标本中含菌量低,并且诊断方式时间长,阳性率低,因此会极大地影响结核病患者治疗[1]。

此外随着结核菌耐药问题日趋严重,如何采用快速有效的方式诊断结核病一直是人们重点研究的问题[2]。

最新研究发现GeneXpert等新技术检测结核病在临床诊断及治疗上具有重要意义,其可以有效降低患者诊断所需时间,增加阳性诊断率[3]。

本文选取80例确诊及治疗的肺结核病患者的痰标本,对标本进行罗氏固体培养法、痰涂片法、比例法药敏和GeneXpert MTB/RIF检测,现将结果报道如下。

1.1 一般资料收集2016年1-8月在本市结核病定点医院经细菌学、病理学、分子生物学及影像学等确诊及治疗的80例住院肺结核病患者的痰标本作为观察对象,对其临床资料进行回顾性分析。

结核xpert操作方法

结核xpert操作方法

结核xpert操作方法结核xpert是一种用于检测结核病的快速和准确的诊断工具。

它采用了分子生物学技术,可以检测结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)的DNA。

结核xpert可用于疑似结核病患者的诊断和治疗监测,对于结核病的控制和预防具有重要意义。

以下是结核xpert操作的一般步骤:1.样本收集:从痰液中收集样本,以确保能够检测到结核分枝杆菌的存在。

痰液样本应该是早晨在患者清洁口腔后的第一次咳嗽产生的,这样可以最大程度地提高结核分枝杆菌的检出率。

2. 样本处理:将收集到的样本加入到结核xpert试剂盒中,并进行必要的处理步骤,如离心和稀释。

这些处理步骤旨在提高结核分枝杆菌的浓度和纯度,从而提高检测的灵敏度和准确性。

3. DNA提取:使用结核xpert试剂盒中提供的化学试剂对样本进行DNA提取。

结核分枝杆菌的DNA是进行后续PCR扩增反应的关键物质。

4. PCR扩增反应:将提取的DNA加入到结核xpert试剂盒中的扩增反应体系中,并进行PCR扩增反应。

PCR反应是一种用于扩增目标DNA的技术,通过特定的引物和酶使得目标序列按照模板DNA进行复制,从而大量增加了目标DNA的数量。

5. 结果分析:结核xpert设备会自动分析PCR扩增反应产生的结果,并给出结核分枝杆菌的检测结果。

结果以阳性、阴性或无效进行分类。

阳性表示样本中存在结核分枝杆菌的DNA,阴性表示样本中不存在结核分枝杆菌的DNA,无效表示检测过程中出现了问题,无法得出准确的结果。

1. 快速:结核xpert可以在2小时内提供结核分枝杆菌的检测结果,远远快于传统的痰涂片检测方法,节省了患者等待时间和诊断周期。

2. 准确:结核xpert的敏感性和特异性都很高,可以准确识别结核分枝杆菌的存在,大大降低了误诊和漏诊的风险。

3. 简便:结核xpert的操作相对简单,只需对样本进行处理和处理,并将试剂盒放入设备中进行PCR扩增反应,设备会自动分析结果,无需其他复杂的实验步骤。

结核杆菌检测操作规程

结核杆菌检测操作规程

结核杆菌检测操作规程结核病是由结核杆菌引起的一种慢性传染病,具有传染性强、病程长和病死率高的特点,对人类的健康和生活产生严重影响。

为了及时发现和控制结核病的传播,结核杆菌的检测工作显得尤为重要。

以下是结核杆菌检测的操作规程。

1. 前期准备储备所需的仪器、耗材和试剂,并按照相关规定对仪器进行校准和质量检验。

保证仪器和试剂的正常运行。

2. 样本采集对患者进行结核杆菌检测前,需首先进行样本采集。

常用的样本有痰液、胸腔积液、尿液等。

采集时要求患者在出现咳嗽或咳痰的状态下进行。

在指导下让患者深呼吸并咳出初晨的新鲜痰液样本。

注意避免污染和交叉感染。

3. 样本处理将采集到的样本置于无菌容器中,然后加入相应量的稀释液进行均匀搅拌,使细菌悬浮在液体中。

然后进行离心,将沉积物留下,并取上清液进行后续处理。

4. 结核杆菌涂片制备取适量上清液,用振荡器进行震荡混合。

然后取一定量的悬浮液,涂于洁净的玻璃片上,并晾干。

晾干后,进行固定处理,例如炙烤法或乙醇固定法。

5. 酸杀菌将制备好的涂片放入含有酸性染料(例如硫酸PhenyEther)的盘子中,在介质中进行酸杀菌。

酸杀菌的时间和温度需根据具体实验要求进行调整。

6. 染色将酸杀菌后的涂片置于染色剂中,进行染色。

常用的染色方法有神经酸菌染色法、Ziehl-Neelsen染色法和艾路伦森染色法等。

根据实验目的和要求选择相应的染色方法。

7. 结果观察和分析将染色好的涂片镜检,观察样本中是否有结核杆菌存在。

根据结核杆菌的形态和染色特点来判断结果,如酸菌色素变化、杆菌长度等。

同时结合临床病史和临床症状进行综合判断,确定是否存在结核杆菌感染。

8. 数据记录和报告将结果进行记录,并按照规定形式编写检测报告。

报告内容应包括患者基本信息、样本来源、实验方法、结果判定等。

确保数据的准确性和报告的完整性。

9. 结果分析和解读根据结核杆菌检测的结果,结合其他临床检查资料,进行结果分析和解读。

根据实际情况,进行结核病的进一步诊断和治疗。

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结核分枝杆菌GeneXpert核酸扩增检测操作步骤
1、准备工作:
1.开机
①依次开启:UBS电源、仪器电源、打印机电源、笔记本电脑电源;
②等待笔记本电脑进入系统,出现四个用户图案时,选择用户Cepheid,输入密码:
cphd,等待约一分钟后系统弹出登录窗口,依次输入用户名和密码;
③等待Gene-Xpert操作软件的启动与自检过程,自检过程中软件出现“数据库管理”
提示窗,点选“否”;再在“存档”提示窗点选“否”,待模块进展显示“可用”。

④仪器预热15分钟后再进行检测。

2.耗材准备
①标本处理液、②Cartridge反应盒、③前处理管(带有盖子的试管)、
⑤待检标本。

④塑料滴管(每个标本准备2支)、
3.样品预处理
①前处理管标号或粘贴条形码,再吸取2ml标本处理液在前处理管中,加入1ml标本;
②旋紧盖子,旋涡仪振荡10秒或剧烈摇动10-20次,室温静置10分钟,再旋涡仪振荡
10秒或剧烈摇动10-20次,室温静置5分钟,观察无可见块状痰标本存在。

4.试剂盒
①拆开Cartridge反应盒包装,小心取出,不要接触到正面的二维码、上面胶盖和后面有
尖端区域,避免污染,可在侧面编号或粘贴条码。

②小心上拔开启Cartridge反应盒蓝色上盖的前部,取处理后的样品2ml,沿样品加入口
的内壁缓缓加入反应盒内(避免吸到未液化的粘液部分,吸液量可以略超过两毫升,把尖端残液保留不注入,以免产生气泡)。

二、测定操作:
1 .在GeneXpert Dx系统窗口的工具栏点击『创建测试』;
2.在“扫描患者ID条形码”弹窗,选“手动输入患者条形码”,再输入患者的姓名;
3.在“扫描样品ID条形码”弹窗选“手动输入”,再在弹窗内输入痰检的实验室编号;
4.在“扫描检测盒条形码”弹窗内,用扫码方法(或手动)输入测试盒上的条码,成功后
软件自动指定待运行板块((注意:为了保障每个模块有均等的运行机会,软件会选择运
行次数最少的模块;但手工可以选择不同的模块)。

此时板块顶部绿色指示灯亮起并开始
闪烁,点击“开始测试”。

⑤打开指定的测定板块(顶部指示灯闪动),将Cartridge反应盒放入其中,关紧板块前门,
检测开始,系统内有测定完成时间倒计时显示,等待检测结束(时间约2h)。

三、打印报告
1.在系统窗口的工具栏点击“查看结果”,点击页面下端的“报告”,在对话框中勾选需要打印的结果,点击“生成报告文件”,点“保存”;
2.确认打印机有纸,点“预览PFD”,再选弹出报告,点“打印”,弹出窗再选“当前页”,点OK之后打印出报告单。

4、关机
1.取出检测完成的Cartridge反应盒
2.退出笔记本电脑系统,选择关机按钮,关闭电脑;
3.依次关断:检测设备电源、打印机电源;
4.按下UPS电源OFF开关,等待电源输出关闭,之后关闭排插上的电源开关。

五、质量控制措施
(一)样本与保存:
1.每份样品需收集痰液至少 1 mL痰液,不应使用含明显的食物颗粒的样本和血痰。

2.标本保存:
①原始痰标本或已处理过(去污染/浓缩)的痰标本:2–8°C冷藏,最长保存10天;
②在必要的情况下,标本可在室温下(环境温度最高为35°C)最长保存3天,然后再
置于2–8°C进行冷藏,前后累计天数最长仍为10天。

3.已加入样品处理剂的标本保存:
①原始痰标本或已处理过(去污染/浓缩)的痰标本:如果可在2-8°C冷藏,12小时
内完成处理;如果不具备该冷藏条件,需在5小时内完成处理;
②已加人样品的试剂盒的保存(如:遭遇突然停电):从加入样品后至测试开始时间
在4小时之内,试剂盒可以直接上机测试;如果超过4个小时,则需要换一个新的试剂盒重新加样再测试。

(二)试剂盒与加样
1.试剂盒保存于2-28° C,干燥环境中,避免阳光直射。

2.开启后,始终保持试剂盒处于直立状态,避免震动、倾斜或坠落!用手取试剂盒时,仅
能接触试剂盒的左右两侧,不能接触盒盖、前面的二维码,或者后面的反应管。

•不要在盒盖上进行标记或者妨碍识别试剂盒已有的二维码
•可以在试剂盒的左右两侧手写标记样品编号或粘贴样品编号标签
3.用移液管吸取过程中需小心操作,避免产生气溶胶和气泡,不要把制备样品中的固体颗
粒加入到试剂盒里,在试剂盒操作说明建议的15分钟(10+5)处理步骤后,如果样本
仍然很粘稠,那么不要直接加入试剂匣,建议额外等待10分钟直至样本完全液化,然
后再使用一支新的移液管取样至试剂匣。

样本的总体积需要在2-4毫升之间。

4.如果发生以下情况,试剂盒不可使用:
①检测日期超过试剂盒标注的有效期;②外部潮湿;
③盖子有破损或者(意外)开启;④加入处理的样品之后,试剂盒坠落或震荡;
⑤位于试剂盒后面的PCR反应管破损;⑥已使用过的试剂盒,扫描之后不能重复使用;
⑦试剂盒的包装(指10只试剂盒的袋装)打开长达6周以上。

(3)实验室环境:
温度保持在15-25℃,并确保机器处于干燥的环境中,避免阳光直射,避免灰尘。

(四)GeneXpert仪器维护指引
项目方法维护频率
每月一次
清洁机器表面酒精擦拭
酒精擦拭(注意:不要清
洁I-CORE反应管插缝!)
清洁试剂盒仓室每月一次
清洁柱塞杆酒精擦拭每月一次
清洁风扇处空气过滤片更换风扇处空气过滤片取下过滤片,吹掉灰尘
更换新的空气过滤片
每月一次
每年或定期更换(必要时)
每年或每2千个测试(以校准机器Cepheid维修中心
先到者为准)
(五)相关事务:核对报告、及时登记、工作区整理、清洁与消毒、规范处理废弃物。

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