腺病毒载体的构建-体外连接法快速高效构建表达

腺病毒载体的构建-体外连接法快速高效构建表达
腺病毒载体的构建-体外连接法快速高效构建表达

体外连接法快速高效构建表达β-半乳糖苷酶的重组腺病毒载体

作者:王家宁, 王传成郭凌郧, 黄永章

[摘要] 目的: 采用体外连接法构建和制备重组腺病毒Adeno-X-LacZ,为构建具有治疗价值的重组腺病毒载体奠定基础。方法: PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切pShuttle2-LacZ穿梭质粒,回收4.6 kb 的LacZ基因表达盒,与经过相同酶切的Adeno-X病毒DNA连接,连接产物用SwaⅠ酶切,最终产物转化DH5α。重组质粒用PCR法和PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切鉴定。pAdeno-X-LacZ用PacⅠ线性化后,用脂质体介导其转染至AD293细胞内包装扩增出重组腺病毒颗粒,采用CsCl 密度梯度离心法纯化重组腺病毒Adeno-X-LacZ。采用X-gal染色观察Adeno-X-LacZ在AD293细胞内包装和HVSMC表达情况。结果: PCR扩增可见312 bp特异性条带,PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切重组质粒后释放出4.6 kb LacZ基因表达盒。X-gal染色证实了在AD293细胞内成功扩增包装出重组腺病毒Adeno-X-LacZ和LacZ基因在HVSMC中得到有效表达。结论: 体外连接法是一种快速、简便、高效的构建重组腺病毒质粒的方法,本研究为构建具有治疗价值的重组腺病毒奠定了基础,Adeno-X-LacZ为研究腺病毒介导的基因转移提供了一良好的对照载体。

[关键词] 体外连接;腺病毒;β-半乳糖苷酶;PI-SceⅠ;I-CeuⅠ

Abstract: Objective To construct recombinant adenoviral v ector expressing β-galactosidase by in vitro ligation and provide a basis for construction of recombinant adenovirus vector expressing therapeutic gene of interest.Methods pShuttle2-LacZ was digested with PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰand 4.6 Kb fragment of LacZ gene expression cassette was recovered .This fragment was ligated to predigested Adeno-X viral DNA with PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ. The ligated product was digested with Swa Ⅰ.The resultant DNA was transformed into E. Coli. DH5α.The correct recombinant plasmid, pAdeno-X-LacZ ,was identified by PCR and PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰdigestion. The Pac I-digested, linearized pAdeno-X-LacZ was transfected into AD293 cells by Lipofectamine. Recombinant adenovirus , Adeno-X-LacZ, was purified with CsCl density gradient ultracentrifugation. HVSMC was infected with Adeno-X-LacZ. X-gal staining was performed to monitor the expression of β-galactosidase gene. Results There was a specific band of 312bp when pAdeno-X-LacZ was amplified by PCR. PI-SceⅠ/I-CeuⅠdigestion of pAdeno-X-LacZ released 4.6Kb of LacZ gene fragment. X-gal staining confirmed Adeno-X-LacZ was packaged successfully within AD293 cells and the expression of β-galactosidase gene in HVSMC. Conclusion In vitro ligation is a simple, rapid and efficient method for constructing recombinant adenoviral vector. This study provides a basis for construction of recombinant adenoviral vector carrying therapeutic gene of interest, Adeno-X-LacZ is also a useful control vector for the research of gene transfer mediated by recombinant adenovirus.

K ey words: In vitro ligation; Adenovirus; β-galactosidase; PI-Sce Ⅰ; I-Ceu Ⅰ

重组腺病毒载体具有转染效率高,感染细胞范围广,病毒滴度高,可感染细胞周期中静止期和分裂期细胞,同时可高效介导基因的体内外转移。因而腺病毒载体是目前后基因组时代基因功能研究和基因治疗研究普遍运用的载体[1-6]。但腺病毒载体的构建是一项费时费力具有挑战性的工作。过去细胞内同源重组方法构建和制备携带目的基因的重组腺病毒,由于同源重组率低和需要对重组体进行多轮费时费力的筛选鉴定,限制了重组腺病毒载体在研究中的应用[7-8]。细菌内同源重组法构建和制备重组腺病毒,由于操作相对复杂以及需要两种特殊的大肠杆菌(BJ5183, XL10-gold),使得构建重组腺病毒的效率相对低下[9-13]。本研究介绍体外连接方法构建和制备表达β-半乳糖苷酶的重组腺病毒载体,为构建重组腺病毒载体建立一新的技术平台,为构建携带目的基因的重组腺病毒载体奠定基础。

1 材料和方法

1.1 主要材料BD Adeno-X Expression system(购自BD Biosciences Clontech公司)包括Adeno-X Viral DNA(PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ已消化),pShuttle2穿梭质粒(含有多克隆位点及PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切位点),pShuttle2-LacZ,PI-Sce Ⅰ和I-Ceu Ⅰ内切酶,Adeno-X扩增引物(Forward primer:5’-TAGTGTGGCGGAAGTGTGATGTTGC-3’; Reverse primer: 5’-TCGACCATAGGGGATCGGGAGATC-3’)。X-gal(Sigma公司产品),Lipofectamine 2000(Invitrogen公司产品),λDNA/HindⅢ marker(华美生物工程公司产品),DH5α为本研究所保存,SwaⅠ(New England Biolabs公司产品)。LigaFast Rapid DNA ligation sysrem(Promega 公司产品)。AD293细胞(Stratagene公司)。

1.2 主要仪器高速冷冻离心机(Hettich,Universal 32R,德国),超速冷冻离心机(Hitach,CP80MX,日本),紫外/可见光分光光度计(Cecil,CE2041,英国),倒置相差显微镜(Nikon,TE2000-U,日本),二氧化碳培养箱(Binder,德国),超净工作台(苏净集团安泰公司),超低温冰箱(-80 ℃,Sanyo,日本),凝胶图像分析系统(Touching 995 gel document system,天呈科技公司)。

1.3 构建策略见图1。

1.4 携带LacZ基因的重组腺病毒质粒pAdeno-X-LacZ的构建pShuttle2-LacZ用PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切后进行低熔点琼脂糖凝胶电泳,回收4.6 kb含LacZ基因的表达盒。将回收片段与预先用PI-Sce Ⅰ/I-Ceu酶切的Adeno-X Viral DNA采用快速连接体系连接。将连接产物用Swa Ⅰ酶切,以去除腺病毒骨架质粒自身环化和酶切不完全所引起不携带LacZ基因片段的质粒。将Swa Ⅰ酶切后的产物用酚/氯仿抽提,纯化连接产物。将纯化后的连接产物转化感受态

DH5α,将其铺于含氨苄青霉素(100 μg/ml)的LB平板上37 ℃倒置培养24 h。挑选菌落扩增,采用碱裂解法小量抽提质粒,用PCR方法和PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切鉴定重组质粒是否携带有LacZ基因表达盒。若携带有LacZ基因表达盒的重组腺病毒质粒采用PCR扩增后则出现一特异性312 bp片段,采用PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ双酶切后会出现一4.6 kb的片段。

1.5 Lipofectamine 2000介导pAdeno-X-LacZ转染AD293细胞取20 μg pAdeno-X-LacZ用Pac 酶切37 ℃过夜,采用酚/氯仿抽提酶切片段,乙醇沉淀,高压三蒸水溶解,加50 μl Lipofectamine 2000脂质体,室温30 min,置4 ℃保存备用。AD293细胞培养于25 cm2塑料培养瓶,待60%融合时,进行转染。弃培养液,用PBS洗1次,加4 ml 10%FCS.DMEM培养液,加入预先准备好的DNA/脂质体复合物至培养瓶中,每3 d换培养液1次,观察细胞病变情况,至AD293细胞80%出现病变时收集细胞,37 ℃/-80 ℃反复冻融3次,12 000 g离心10 min,收集上清。

1.6 重组腺病毒的扩增、纯化及滴度测定[14]取原代重组腺病毒上清,反复感染AD293细胞,37 ℃ 5% CO2培养箱中培养,镜下观察到出现95%~100%病变时,收集细胞,以5 000 g 离心,弃上清,沉淀重悬于适量PBS中,在37 ℃/-80 ℃反复冻融3次,以12 000 g离心收集上清,按照文献方法对重组腺病毒上清进行CsCl密度梯度离心纯化[14],并将纯化后的腺病毒在透析液中(10 mmol/L Tris?HCl,1 mmol/L MgCl2,10%甘油)4 ℃透析2次,每次

24 h。将透析后的病毒分装于1.5 ml离心管中,并进行滴度测定。取纯化后的病毒100 μl,10%SDS 20 μl,PBS 880 μl,混匀,测定病毒基因组DNA的OD260和OD280,据此计算病毒的颗粒数和纯度,1OD260=1012 pfu/ml,pfu/ml=OD260×dilution×1012,OD260/OD280>1.3表示病毒纯度较高。

1.7 人血管平滑肌细胞(Human vascular smooth muscle cells, HVSMC)培养组织贴块法培养,方法参考文献[15]。

1.8 Adeno-X-LacZ重组腺病毒感染AD293细胞和HVSMC为观察原代Adeno-X-LacZ上清感染AD293细胞后的病毒扩增情况,病毒上清感染AD293细胞48 h后进行X-gal染色,为观察Adeno-X-LacZ在HVSMC中的表达,HVSMC待生长至80%融合时,按100∶1感染复数(multiplicity of infection,Moi)感染HVSMC。感染后置于37 ℃,5%CO2培养箱中培养48 h,进行X-gal染色。

1.9 X-gal染色[16]Adeno-X-LacZ感染的细胞培养48 h后,弃去培养液,用PBS洗1次,加入0.05%戊二醛室温固定10 min,PBS洗3次,第二次保留10 min,加入含1 mg/ml X-gal染色液(2 mM MgCl2,35 mM K3[Fe(CN)6],35 mM K4[Fe(CN)6], 0.02%NP40, 0.01%脱氧胆酸)。置37 ℃ CO2培养箱中孵育2 h观察结果。

2 结果

2.1 pAdeno-X-LacZ的PCR鉴定结果BD Adeno Expression system试剂盒中提供的前向引物与腺病毒骨架DNA Adeno-X viral DNA的序列退火,而反向引物则与携带LacZ基因表达盒的序列退火。因而不含LacZ基因表达盒的腺病毒质粒,由于缺乏与反向引物退火所需要的表达盒序列,PCR扩增不出预期的312 bp的片段(图2)。

2.2 pAdeno-X-LacZ的PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切鉴定结果(图4)将提取的重组质粒经过PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ双酶切后,出现了一4.6 kb的LacZ基因表达盒片段,进一步证明成功地构建了pAdeno-X-LacZ重组质粒。

2.3 Adeno-X-LacZ重组腺病毒上清感染AD293细胞的X-gal染色(图5)为了证明原代提取的病毒能感染AD293细胞,在原代病毒上清感染AD293细胞后第48 h进行X-gal染色,结果显示所有的AD293细胞均被蓝染,说明Adeno-X-LacZ在AD293细胞中得到了大量扩增并有效表达。

2.4 Adeno-X-LacZ病毒滴度的测定结果重组腺病毒经包装、扩增、纯化后经紫外分光光度计测定,病毒滴度为

3.8×1012 pfu/ml,OD260/OD280=1.426>1.3,说明病毒滴度较高,可满足在体基因治疗的需要,且纯度较高。

2.5 Adeno-X-LacZ感染HVSMC后的X-gal染色(图6)为了证明Adeno-X-LacZ在HVSMC 中的表达情况,在以100 Moi感染HVSMC 48 h后进行细胞固定和X-gal染色,结果显示所有的HVSMC均被蓝染,说明Adeno-X-LacZ的感染效率较高,且LacZ基因在HVSMC中得到了高效表达。

3 讨论腺病毒是双股DNA病毒。用于基因转移的腺病毒载体是缺乏E1区和E3区基因的复制缺陷性人血清型5型腺病毒。腺病毒基因组DNA全长为36 kb。由于基因组片段太大,难以找到特异有用的限制性内切酶酶切位点供体外连接使用。所以长期以来腺病毒载体的构建采用同源重组法包括细胞内同源重组和细菌内同源重组[7-13]。细胞内同源重组法是将腺病毒骨架质粒和携带目的基因的穿梭质粒共转染293细胞,这一方法要求两种质粒同时转移至同一293细胞中,并在该细胞中发生同源重组[7-8]。由于两种质粒转染同一293细胞的可能性很小,发生同源重组的几率就更小。另外细胞内同源重组法需要对病毒蚀斑进行多轮筛选,延长了实验周期。采用细菌内同源重组法构建重组腺病毒,需要两种特殊的大肠杆菌BJ5183和XL10-gold。由于BJ5183具有很强的重组酶活性,可使共转染的腺病毒骨架质粒和穿梭质粒发生同源重组,但为了提高重组质粒的稳定性,需将其转化至内切酶缺陷和重组酶缺陷的大肠杆菌XL10-gold中扩增,因而增加了操作的复杂性[9-13]。本研究采用Clontech公司提供的腺病毒体外连接体系成功构建了重组腺病毒质粒pAdeno-X-LacZ。采用体外连接法构建重组腺病毒质粒具有以下优点:①方法简便:该体系包括一个小的穿梭质粒pShuttle2,用于克隆目的基因。本研究使用的pShuttle2-LacZ重组穿梭质粒,是将LacZ基因片段克隆于pShuttle2的Xba Ⅰ-Not Ⅰ位点。穿梭质粒含有极罕见的两种内切酶酶切位点PI-SceⅠ和I-CeuⅠ,分别位于表达盒的两端。构建重组腺病毒时,只需将插入了外源基因的穿梭质粒用PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ双酶切后与经过同样酶切的腺病毒骨架质粒DNA连接。将连接产物用SwaⅠ酶切将可以去除自身连接和未线性化的腺病毒DNA。将最终产物转化DH5α,对提取的质粒用PCR方法和PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切方法鉴定重组质粒的正确与否。本研究采用PCR扩增后可见312 bp条带,PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切后出现4.6 kb的条带,说明pAdeno-X-LacZ的正确性。②节省时间:采用该体系构建的重组腺病毒质粒只需经Pac Ⅰ酶切后转染293细胞,在4~7 d内获得重组腺病毒。传

统的细胞内同源重组法构建重组腺病毒由于所需时间较长,而293细胞在培养一周后开始脱落,为防止293细胞脱落和病毒蚀斑融合,需进行低熔点琼脂糖覆盖(Agarose Overlay procedure)。而采用体外连接法构建重组腺病毒在细胞尚未脱落之前,即可获得均一的重组腺病毒,而无需进行琼脂糖覆盖。③无需蚀斑筛选:该体系最大限度地减少了非重组腺病毒的产生和避免了费时费力的病毒蚀斑的筛选。因非线性化的腺病毒DNA和再连接的腺病毒DNA

可用Swa Ⅰ酶切去除,大大降低了连接产物转化大肠杆菌后的背景。由于转染293细胞的重

组腺病毒质粒已事先用PCR和酶切鉴定,故由293产生的重组腺病毒仅是含有目的基因的重组腺病毒,不会出现不含目的基因的重组腺病毒,因而无需蚀斑筛选。本研究采用体外连接法成功地构建了pAdeno-X-LacZ,将其转染AD293细胞后产生了重组腺病毒Adeno-X-LacZ。将其感染HVSMC后LacZ基因得到了高效表达。本研究为构建和制备重组腺病毒建立了一新的技术平台,为构建携带目的基因的重组腺病毒奠定了基础,同时也为腺病毒载体介导的基因转移的研究提供了一良好的对照载体。

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表达载体的构建方法及步骤

表达载体的构建方法及步骤 令狐采学 一、载体的选择及如何阅读质粒图谱 目前,载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA 是一种新的非病毒转基因载体。 一个合格质粒的组成要素: (1)复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA 分子中只有一个复制起始点。而 真核生物DNA 分子有多个复制起始位点。 (2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ (3)多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段 (4)P/E 启动子/增强子 (5)Terms 终止信号 (6)加poly(A)信号可以起到稳定mRNA 作用 选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。如果构建的目 的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。 载体选择主要考虑下述3点: 【1】构建DNA 重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。 【2】.载体的类型:

(1)克隆载体的克隆能力-据克隆片段大小(大选大,小选小)。如<10kb 选质粒。 (2)表达载体据受体细胞类型-原核/真核/穿梭,E.coli/哺乳类细胞表达载体。 (3)对原核表达载体应该注意:选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4个困难和阅读框错位;表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。 【3】载体MCS 中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因与载体易于链接,不能产生阅读框架错位。 综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5点要求: (1)选分子量小的质粒,即小载体(1-1.5kb)→不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载 体); (2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般10个以上的拷贝,而严谨型质粒<10个。 (3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地; (4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr(试一试)。 (5)满足自己的实验需求,是否需要包装病毒,是否需要加入荧光标记,是否需要加入标签蛋白,是否需要真核抗性(如Puro、G418)等等。 无论选用哪种载体,首先都要获得载体分子,然后采用适当的限制酶将载体DNA 进行切割,获得线性载体分子,以便于与

基因表达载体构建教学设计

“基因表达载体的构建”教学设计

专题1 1.2基因工程的基本操作程序之基因表达载体的构建 一、目的基因和运载体的连接 二、利用标记基因筛选含目的基因的受体细胞 三、目的基因和启动子的相对位置关系 附件1: 附件2:

【教学反思】 基因表达载体的构建是基因工程的关键步骤,空间想象难度大,科学理论和技术实践密切联系,思维跨度也大。福州屏东中学学生程度一般,正因如此,处理不好会提高学习难度,令学生视高科技为畏途,导致教学流于形式。本节课用微课和模型成功地化解了难点。 一方面基于学生课前微课的“先学”,学生对表达载体的构建有个整体的认识,然后以此为支架在课堂上填充和拓展内容,当学生在课堂上遇到相关问题时,能尽快到达“最近发展区”,获得进一步的发展,使学生逐渐对细节有更丰富更具体的理解,这种先整体后局部的处理符合学生的认知规律。基于微课的先学后教模式实质上是利用微课为学生创设一个情境,使学生带着思考和疑惑走进课堂,节省课堂的热身时间,从而使高效率大容量的课堂教学目标得以实现。 另一方面高二学生具有抽象思维,但是仍然需要感性知识,形象知识作为支持,所以教师精心设计纸质模型,基于教材原有的学习完“DNA重组的基本工具”后的纸圈模拟活动,再设计了双酶切的活动,化微观为直观,一系列问题的发生都源自学生自己亲手构建的模型,从模型中发现问题,进而逐步由浅入深。学生像科学家一样思考问题、解决问题,获得成功的体验。由于是带着问题的探究模拟活动,使学生的课堂参与是形式之上思维的积极参与。学生获得的体验是:基因工程这么高深的原理原来我也能想得到。学生的纸质模型立体、科学、易操作,但不好展示,而教师利用不同颜色的磁贴,随着课程的逐步推进,简洁明了地逐步在黑板上呈现,让整个环节衔接自然,师生互动流畅。直观的教学手段——模型构建,减轻了学生掌握这些知识的阻力,激发了学习积极性,使学生在轻松愉快的氛围中突破了重难点,强化了学生交流合作意识。 总之,作为教师,应该想学生之所难,积极探索有效途径,一堂成功的课不是展示教师的才智、形象、语言,更要通过学生的成功来反映。

腺病毒载体的构建-体外连接法快速高效构建表达

体外连接法快速高效构建表达β-半乳糖苷酶的重组腺病毒载体 作者:王家宁, 王传成郭凌郧, 黄永章 [摘要] 目的: 采用体外连接法构建和制备重组腺病毒Adeno-X-LacZ,为构建具有治疗价值的重组腺病毒载体奠定基础。方法: PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切pShuttle2-LacZ穿梭质粒,回收4.6 kb 的LacZ基因表达盒,与经过相同酶切的Adeno-X病毒DNA连接,连接产物用SwaⅠ酶切,最终产物转化DH5α。重组质粒用PCR法和PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切鉴定。pAdeno-X-LacZ用PacⅠ线性化后,用脂质体介导其转染至AD293细胞内包装扩增出重组腺病毒颗粒,采用CsCl 密度梯度离心法纯化重组腺病毒Adeno-X-LacZ。采用X-gal染色观察Adeno-X-LacZ在AD293细胞内包装和HVSMC表达情况。结果: PCR扩增可见312 bp特异性条带,PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ酶切重组质粒后释放出4.6 kb LacZ基因表达盒。X-gal染色证实了在AD293细胞内成功扩增包装出重组腺病毒Adeno-X-LacZ和LacZ基因在HVSMC中得到有效表达。结论: 体外连接法是一种快速、简便、高效的构建重组腺病毒质粒的方法,本研究为构建具有治疗价值的重组腺病毒奠定了基础,Adeno-X-LacZ为研究腺病毒介导的基因转移提供了一良好的对照载体。 [关键词] 体外连接;腺病毒;β-半乳糖苷酶;PI-SceⅠ;I-CeuⅠ Abstract: Objective To construct recombinant adenoviral v ector expressing β-galactosidase by in vitro ligation and provide a basis for construction of recombinant adenovirus vector expressing therapeutic gene of interest.Methods pShuttle2-LacZ was digested with PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰand 4.6 Kb fragment of LacZ gene expression cassette was recovered .This fragment was ligated to predigested Adeno-X viral DNA with PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰ. The ligated product was digested with Swa Ⅰ.The resultant DNA was transformed into E. Coli. DH5α.The correct recombinant plasmid, pAdeno-X-LacZ ,was identified by PCR and PI-Sce Ⅰ/I-Ceu Ⅰdigestion. The Pac I-digested, linearized pAdeno-X-LacZ was transfected into AD293 cells by Lipofectamine. Recombinant adenovirus , Adeno-X-LacZ, was purified with CsCl density gradient ultracentrifugation. HVSMC was infected with Adeno-X-LacZ. X-gal staining was performed to monitor the expression of β-galactosidase gene. Results There was a specific band of 312bp when pAdeno-X-LacZ was amplified by PCR. PI-SceⅠ/I-CeuⅠdigestion of pAdeno-X-LacZ released 4.6Kb of LacZ gene fragment. X-gal staining confirmed Adeno-X-LacZ was packaged successfully within AD293 cells and the expression of β-galactosidase gene in HVSMC. Conclusion In vitro ligation is a simple, rapid and efficient method for constructing recombinant adenoviral vector. This study provides a basis for construction of recombinant adenoviral vector carrying therapeutic gene of interest, Adeno-X-LacZ is also a useful control vector for the research of gene transfer mediated by recombinant adenovirus. K ey words: In vitro ligation; Adenovirus; β-galactosidase; PI-Sce Ⅰ; I-Ceu Ⅰ

载体构建流程

载体构建SOP流程: GenBank查询目的基因序列→根据ORF序列利用引物设计软件设计引物→表达目的基因的组织或细胞总RNA提取→RT-PCR获取目的基因→酶切目的基因和载体→分别纯化酶切的目的基因和载体并建立连接反应→转化→初步筛选阳性克隆→阳性克隆测序→测序正确的质粒保种并重提质粒 I.获取目的基因/序列片段 一.获取序列信息 通过GENBANK数据和生物信息的方法设计目的基因或目的片段引物(shRNA、miRNA)。 PCR引物的设计原则: ①引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。 ②产物不能形成二级结构。 ③引物长度一般在15~30碱基之间。 ④G+C含量在40%~60%之间。 ⑤碱基要随机分布。 ⑥引物自身不能有连续4个碱基的互补。 ⑦引物之间不能有连续4个碱基的互补。 ⑧引物5′端可以修饰。 ⑨引物3′端不可修饰。

⑩避免在引物的3’端使用碱基A。 在实际设计引物中由于ORF两末端序列本身的限制,不能完全按照上述理想的设计原则,但也切记引物不能过长或过短。过长的引物不容易打开其二级结构,与模板结合缓慢,也容易形成引物二聚体,通常不超过35bp(不包括酶切位点和保护碱基)。过短的引物特异性差,扩出其它不相关片段,最终很难得到目的片段,通常不短于18bp(不包括酶切位点和保护碱基)。要将目的基因定向克隆至相应载体,需要在上下游引物两端设计不同的酶切位点,由于酶切位点位于线性末端时酶对其识别切割能力大大降低,需依据NEB目录添加相应保护碱基,酶切时可相应增加时间。 二.制备模板 1.分离高质量RNA:成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。现在实验室通常使用Trizol试剂法提取总RNA,可以从多种组织和细胞中提取高质量的非降解RNA。Trizol试剂法可以从最少100个细胞或1mg组织中提取RNA。在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂以增加cDNA合成的长度和产量。RNase抑制剂要在第一链合成反应中,在缓冲液和还原剂(如DTT)存在的条件下加入,因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性,从而释放结合的可

基因的克隆、表达载体构建与功能验证

基因的克隆、表达载体构建及功能验证(一般性方法) 一、基因克隆 ★事前三问 a.克隆这个基因干什么?它有什么功能? b.这个基因在哪种材料中扩增? c.材料需要怎么处理? ◎实验前准备工作 a.设计引物,准备材料, b.购置试剂:Taq酶、反转录试剂盒、凝胶回收试剂盒、质粒提取试剂盒、连接试 剂盒 c.实验试剂及用具:枪头、离心管、培养皿、滤纸灭菌;Amp+ 、Kan+等抗生素准 备 ※基本流程 提取和纯化RNA—cDNA第一条链合成—PCR—凝胶电泳—胶回收—连接—转化—涂平板—挑单菌落—摇菌—提质粒—测序 1.总RNA的提取、纯化及cDNA第一链合成 1.1叶片、根总RNA的提取 Trizol是一种高效的总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解植物细胞,抑制细胞释放出的核酸酶,所提取的RNA完整性好且纯度高,以利于下一步的实验。 1)实验前准备 预先配制0.1%的DEPC水(ddH2O中含0.1%DEPC,V/V,37 ℃过夜处理12 h),高温灭菌后,用DEPC水配制75%乙醇,研钵、量筒、试剂瓶等需200℃灭菌至少4 h,所用枪头和枪盒均去RNA酶处理(直接购买)。 2)Trizol 法(小麦)叶片或根的总RNA实验步骤如下: (1)提前在1.5 ml离心管中加入1 mlTrizol,然后将200 mg样品液氮中研磨成白色粉末,

移入管内,用力摇15 s,在15-30℃温育5 min,使核酸蛋白复合物完全分离。 (2)4℃,12000g离心10min,取上清,离心得到的沉淀中包括细胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。 (3)吸取上清液加0.2 ml氯仿,盖好盖,用力摇15 s,15~30 ℃温育2~3 min。(4)在≤12000g,4℃离心10 min,样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层,RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60%。 (5)将上层水相转移到新的1.5 ml离心管中,加2倍体积的无水乙醇沉淀RNA,室温静止30 min。 (6)在≤12000g,4℃离心10 min,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。 (7)用≥1 ml的75%乙醇洗RNA,涡旋振荡样品,在≤7500g,4℃离心5 min,弃上清。(8)室温放置干燥或真空抽干RNA沉淀,大约晾5-10分钟,加无RNase的水100μl用枪头吸几次,55~60℃温育10 min使RNA溶解。 (9)配制以下体系: 10×DNase buffer 5 μl DNase I (RNase-free)(40 μg/μl) 1 μl RNasin Inhibitor(40 μg/μl) 1 μl Total RNA 70 μg 加去RNase水至总体积为50 μl (10)37 ℃水浴1h,加DEPC处理的水至总体积为100 μl,加入等体积氯仿抽提一次。(11)取上清,加入10 μl的3 mol/L NaAC溶液,200 μl的无水乙醇,-80 ℃沉淀30 min。 (12)2~8 ℃,12000g离心10 min,弃清液,干燥后取50μl无RNase的水溶解RNA。3)RNA的质量及纯度检测 (1)电泳检测取2ul RNA 与1 ul 10×Loading buffer上样缓冲液混合均匀在1% 的琼脂糖凝胶上电泳,在紫外灯下观察RNA 条带并记录实验结果。 (2)分光光度计RNA纯度检测 取1ul RNA液,以DEPC水为空白对照,测定A260/ A280 比值,估测RNA质 量。 4)cDNA第一条链的合成 按照以下体系将提取的总RNA反转录成第一链cDNA: 1)在Eppendorf管中配制下列混合液:

几种新型植物基因表达载体的构建方法

几种新型植物基因表达载体的构建方法 摘要:利用基因工程技术手段研究基因功能过程中,构建基因表达载体处于转基因植物的主导地位,采用合适的构建方法会使实验效果事半功倍。植物基因表达载体的构建方法除了传统构建法、Gateway 技术、三段T-DNA 法、一步克隆法等,还有近年来出现的几种新型的载体构建方法:基于竞争性连接原理快速构建小片段基因表达载体;Micro RNA 前体PCR 置换法适用于构建小分子RNA 表达载体;重组融合PCR 法特别适用于插入片段中含有较多限制性酶切位点的载体构建;利用In-Fusion 试剂盒可以将任何目的片段插入一个线性化载体的某个区域;构建多片段复杂载体可采用不依赖序列和连接的克隆方法(Sequence and ligation-independent cloning, SLIC) 法;Gibson 等温拼接法。本文将在总结分析前人工作的基础上,分析这6种新方法的特点,期望通过这几种新的方法给植物基因工程表达载体的构建提供新的思路。 关键词: Micro RNA 前体PCR 置换法,In-Fusion 试剂盒法,重组融合PCR 法,Gibson 等温拼接法,Golden Gate 拼接法 基因克隆、载体构建是植物功能基因组研究中的常规步骤[ 1 ]。而载体构建是基因工程和分子生物学研究中常用的基础技术。随着植物基因工程技术的发展,适合于不同研究目的各种载体系统应运而生,其中在转基因植物中最常用的是质粒载体。传统的载体构建方法在进行构建多片段拼接的复杂载体时,需要精心选择酶切位点[ 2 ],有时还需要构建多个中间载体,操作比较麻烦,费时费力,因此寻找简单、高效、快捷的载体构建方法具有重要的现实意义。从1969 年Arber 等发现了限制性内切酶,载体的构建方法逐步发展,从传统构建方法到

重组腺病毒构建的标准操作规程

重组腺病毒构建的标准操作规程(编号:048) 1、目的及适用范围 该SOP用于规范真核细胞表达重组蛋白的操作。 2、主要仪器及试剂 电转仪、Adeasy-1系统(穿梭载体pshuttle-cmv,pAdtrack-CMV)、骨架病毒(pAdeasy-1)、重组菌(BJ5183感受态)、包装细胞(293A)、Taq酶。限制性内切酶、碱裂解法提取质粒溶液I、II、III、酚、氯仿 3、操作步骤 3.1目的基因的克隆:引物设计时要GOI中有没有Pme I/EcoRI和PacI酶切位点。 3.1.1通过限制酶切分析/PCR/基因测序确认GOI克隆到穿梭载体,翻译方向跟启动子方向相同。 3.1.2如果采用pShuttle 或pAdTrack,必须提供启动子和多聚腺苷酸信号。所有的穿梭载体必须包括一个Kozak 信号序列。 3.1.3因为在转化和转染前,用Pme I/EcoRI和PacI酶,所以要避免GOI中有这些酶的酶切位点。如果有PacI酶酶切位点,建议通过点突变除去。 3.1.4如果表达多个基因,避免头对头的方向,采用头尾相接的方式。 3.1.5建议在穿梭载体中,通过瞬时转染检测GOI的表达。 3.2制备电转 BJ5183 感受态细胞:BJ5183为链霉素抗性,固体和液体LB加终浓度为30μg/mL 的链霉素培养。划线培养、挑单菌落摇床培养,转接到200-300mL液体培养基中,37℃摇床培养至A550约0.8,转移到无菌离心管中冰浴10~30min,4℃3000rpm离心10min,用50mL灭菌的超纯水配制的10%甘油重悬,重复两次离心重悬,4℃3000rpm离心10min,用10mLWB重悬,4℃3000rpm离心10min最后用0.5mL重悬。分装20μL/管,-80℃冻存。 3.3用卡那抗性培养基培养2mL含有GOI穿梭质粒的细菌培养过夜。提取质粒DNA。推荐使用碱裂解法提取质粒,保证穿梭质粒的完整性可以提高在BJ5183细菌中重组的效率。 3.4 用Pme I或EcoRI线性化穿梭质粒:必须保证酶切完全。0.1μg-0.5μgDNA用300U的酶100μL 体系。电泳检测酶切是否完全。 3.5乙醇沉淀法回收纯化线性化的穿梭载体。 3.6 冰上操作:向20μLBJ5183感受态细胞中加入pAdeasy-1腺病毒骨架质粒和线性化的穿梭质粒,混匀,总体积不超过30μL。 3.7 将感受态和DNA混合物转移到用冰预冷的电转杯中,电击转化。电击完成后加入预热的LB 101

载体构建的基本步骤

载体构建 一.原理 依赖于限制性核酸内切酶,DNA连接酶和其他修饰酶的作用,分别对目的基因和载体DNA进行适当切割和修饰后,将二者连接在一起,再导入宿主细胞,实现目的基因在宿主细胞内的正确表达。 二.操作步骤 1.摇菌 取装有液体培养基的3ml试管两支(依情况而定),每管加40-100μl菌种,过夜摇。2.提质粒 依照提质粒试剂盒中的说明书操作(根据情况最后一步洗脱时可以多洗1-2次)。 3.酶切 按下表加入试剂。 反应所需试剂体积(单位:ul) 质粒10 所需内切酶反应缓冲液 2 所需限制性内切核酸酶 1 H2O 7 将加好的EP管置于37℃保温1-2h。(依照提酶切的具体步骤操作;为了达到最佳酶切的效果,最好根据所选用的酶确定所需要的反应温度) 4.电泳检测 将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,检测酶切是否成功。 5.连接 如果电泳检测酶切成功的话,则仔细将所需的片段切割下来,将胶体回收(依照胶回收试剂盒说明书操作);之后将回收的片段和载体连接,连接体系如下: 双蒸水5μL 10×T4 DNA连接缓冲液1μL 载体2μL 酶切后的目的基因1μL T4DNA连接酶1μL 总体积10μL 置于温箱,12-16℃,保温8-16h 6.转化 依照转化具体操作步骤做感受态,将上述连接产物进行转化实验,涂板培养,37℃,12-16h。 7.单克隆检测 (1)挑单克隆

先将AMP从冰箱中取出,待融化后,在3ml装有LB液体培养基的试管中加入3μL的AMP,用枪头混匀;取1.5 mlEP管5支(依情况可以多挑几管),给每支管中加500μL上述培养液,然后用接种环(或黄枪头)挑单克隆,挑完后用枪吹打;之后,将挑好的菌摇4-5小时,至混浊即可。 (2)单克隆检测 以每管摇好的菌液为模板,以原有的引物进行PCR,然后将PCR产物跑电泳,观察电泳图像中那几管的条带正确,将正确条带相对应管的菌液再抽取100μL,加到3ml(有LB液体培养液,AMP+)试管中,过夜摇;第二天重摇,将摇好的菌取1ml于1.5mlEP管中送测序,并保种。 注:①挑单克隆时,一定要挑单一圆润的菌落,有卫星斑的不挑。 ②别忘记往培养基中加AMP。 ③用接种环挑菌后,要在酒精灯上反复灼烧,然后再进行下一次挑菌。 三.注意事项 1.连接产物可短时间在-20℃保存,使用时可以取出进行后续实验; 2.在细胞转化时,冰浴和热激要严格控制好时间; 3.连接反应是DNA重组过程中的关键步骤,其成败的重要参数之一就是温度,因此要控制好连接温度。 4.进行黏末端连接时,会产生一定数量的载体自身环化分子,导致转化菌中过高的假阳性克隆背景。针对这一问题,常采用牛小肠碱性磷酸酶(CIP)去掉载体的5’-磷酸以抑制DNA 片段的自身环化。 参考: 1.刘进元,常智杰,赵广荣,等.分子生物学实验指导[M].北京:清华大学出版社,2002 2.周俊宜.分子生物学基本技能和策略[M].北京:科学出版社,2003:117-120 3.李海英,杨峰山,邵淑丽,等.现代分子生物学与基因工程[M].北京:化学工业出版社,2008:138-142 4.朱旭芬.基因工程实验指导[M].北京:高等教育出版社,2006:134-139

叶绿体表达载体--如何构建载体

如何构建载体 1 启动子的选用和改造 外源基因表达量不足往往是得不到理想的转基因植物的重要原因。由于启动子在决定基因表达方面起关键作用,因此,选择合适的植物启动子和改进其活性是增强外源基因表达首先要考虑的问题。 目前在植物表达载体中广泛应用的启动子是组成型启动子,例如,绝大多数双子叶转基因植物均使用CaMV35S启动子,单子叶转基因植物主要使用来自玉米的Ubiquitin启动子和来自水稻的Actinl启动子。在这些组成型表达启动子的控制下,外源基因在转基因植物的所有部位和所有的发育阶段都会表达。然而,外源基因在受体植物内持续、高效的表达不但造成浪费,往往还会引起植物的形态发生改变,影响植物的生长发育。为了使外源基因在植物体内有效发挥作用,同时又可减少对植物的不利影响,目前人们对特异表达启动子的研究和应用越来越重视。已发现的特异性启动子主要包括器官特异性启动子和诱导特异性启动子。例如,种子特异性启动子、果实特异性启动子、叶肉细胞特异性启动子、根特异性启动子、损伤诱导特异性启动子、化学诱导特异性启动子、光诱导特异性启动子、热激诱导特异性启动子等。这些特异性启动子的克隆和应用为在植物中特异性地表达外源基因奠定了基础。例如,瑞士CIBA-GEIGY公司使用PR-IA启动子控制转基因烟草中Bt毒蛋白基因的表达,由于该启动子可受水杨酸及其衍生物诱导,通过喷酒廉价、无公害的化学物质,诱导抗虫基因在虫害重发生季节表达,显然是一个十分有效的途径。 在植物转基因研究中,使用天然的启动子往往不能取得令人满意的结果,尤其是在进行特异表达和诱导表达时,表达水平大多不够理想。对现有启动子进行改造,构建复合式启动子将是十分重要的途径。例如,Ni等人将章鱼碱合成酶基因启动子的转录激活区与甘露碱合成酶基因启动子构成了复合启动子,GUS表达结果表示:改造后的启动子活性比35S启动子明显提高。吴瑞等人将操作诱导型的PI-II基因启动子与水稻Actinl基因内含子1进行组合,新型启动子的表达活性提高了近10倍(专利)。在植物基因工程研究中,这些人工组建的启动子发挥了重要作用。 2 增强翻译效率 为了增强外源基因的翻译效率,构建载体时一般要对基因进行修饰,主要考虑三方面内容: 2.1添加5`-3`-非翻译序列 许多实验已经发现,真核基因的5`-3`-非翻译序列(UTR)对基因的正常表达是非常必要的,该区段的缺失常会导致mRNA的稳定性和翻译水平显著下降。例如,在烟草花叶病毒(TMV)的126kDa 蛋白基因翻译起始位点上游,有一个由68bp核苷酸组成的Ω元件,这一元件为核糖体提供了新的结合位点,能使Gus基因的翻译活性提高数十倍。目前已有许多载体中外源基因的5`-端添加了Ω翻译增强序列。Ingelbrecht等曾对多种基因的 3`-端序列进行过研究,发现章鱼碱合成酶基因的3`-端序列能使NPTII基因的瞬间表达提高20倍以上。另外,不同基因的3`-端序列增进基因表达的效率有所不同,例如,rbcS3`-端序列对基因表达的促进作用比查尔酮合酶基因的3`-端序列高60倍。 2.2 优化起始密码周边序列 虽然起始密码子在生物界是通用的,然而,从不同生物来源的基因各有其特殊的起始密码周边序列。例如,植物起始密码子周边序列的典型特征是AACCAUGC,动物起始密码子周边序列为CACCAUG,原核生物的则与二者差别较大。Kozak详细研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子周边序列为ACCATGG时转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中。例如,有一个细菌的几丁质酶基因,原来的起始密码周边序列为UUUAUGG,当被修饰为ACCAUGG,其在烟草中的表达水平提高了8倍。因此,利用非植物来源的基因构建表达载体时,应根据植物起始密码子周边序列的特征加以修饰改造。 2.3对基因编码区加以改造

腺病毒载体构建重组扩增纯化委托技术服务合同书(完整版)

合同编号:YT-FS-4484-56 腺病毒载体构建重组扩增纯化委托技术服务合同书 (完整版) Clarify Each Clause Under The Cooperation Framework, And Formulate It According To The Agreement Reached By The Parties Through Consensus, Which Is Legally Binding On The Parties. 互惠互利共同繁荣 Mutual Benefit And Common Prosperity

腺病毒载体构建重组扩增纯化委托技术服务合同书(完整版) 备注:该合同书文本主要阐明合作框架下每个条款,并根据当事人一致协商达成协议,同时也明确各方的权利和义务,对当事人具有法律约束力而制定。文档可根据实际情况进行修改和使用。 服务方(甲方):_____ 地址:______ 邮编:______ 电话:______ 传真:______ e-mail:_____ 开户银行:_____ 帐号:______ 委托方(乙方):_____ 地址:______ 邮编:______ 电话:______ 传真:______

甲乙双方根据《中华人民共和国合同法》等法律法规,在平等互利的原则下,经协商一致,订立本合同,以兹双方共同遵照执行。 第一条病毒名称 甲方接受乙方的委托,为其载体构建、重组、扩增和纯化_____腺病毒,腺病毒滴度_____pfu/ml。 第二条费用及价格(人民币) 1.病毒的载体构建、重组、扩增和纯化所需的原料由甲方自行购买; 2.合同总价_____元,(大写)_____。 第三条乙方责任 1.乙方所购买的甲方腺病毒产品及其一切复制品、衍生产品将只供乙方或乙方所能控制的实验组中进行实验研究,在任何情况下决不用于人类,决不用于以谋利(直接或间接)为目的的生物制药以及临床分析等方面。 2.未征得甲方授权或同意,乙方不能以任何名义将购买的腺病毒产品及其一切复制品、衍生产品转移、

腺病毒载体构建重组扩增纯化委托技术服务合同书样本

编号:JS-20213689 甲 方:______________________________ 乙 方:______________________________ 日 期:_________年________月_______日 腺病毒载体构建重组扩增纯化委托技 术服务合同书样本 Promises resulting from either express or an implied agreement can be enforced.

[标签:titlecontent] 服务方(甲方):_________ 地址:_________ 邮编:_________ 电话:_________ 传真:_________ e-mail:_________ 开户银行:_________ 帐号:_________ 委托方(乙方):_________ 地址:_________ 邮编:_________ 电话:_________ 传真:_________ 甲乙双方根据《中华人民共和国合同法》等法律法规,在平等互利的原则下,经协商一致,订立本合同,以兹双方共同遵照执行。 第一条病毒名称

甲方接受乙方的委托,为其载体构建、重组、扩增和纯化_________腺病毒,腺病毒滴度_________pfu/ml。 第二条费用及价格(人民币) 1.病毒的载体构建、重组、扩增和纯化所需的原料由甲方自行购买; 2.合同总价_________元,(大写)_________。 第三条乙方责任 1.乙方所购买的甲方腺病毒产品及其一切复制品、衍生产品将只供乙方或乙方所能控制的实验组中进行实验研究,在任何情况下决不用于人类,决不用于以谋利(直接或间接)为目的的生物制药以及临床分析等方面。 2.未征得甲方授权或同意,乙方不能以任何名义将购买的腺病毒产品及其一切复制品、衍生产品转移、出售或租借给他人使用。 3.保证乙方应用甲方腺病毒产品及其一切复制品、衍生产品进行的研究符合现行的法律法规,不得应用甲方腺病毒产品进行有损于人类安全或其它非法目的的研究。 4.所有在研究过程中经本产品及其一切复制、衍生产品处理过之动物、植物、蛋类以及乳制品等均应妥善处理,决不可食用或出售。 5.乙方及乙方的课题组在发表文章中注明该重组腺病毒购自甲方,并将已发表文章复印一份给甲方。 6.甲方的腺病毒产品是由人5型腺病毒改造而来,在特殊情况下仍可能具有一定的致病性,乙方必须遵守国家安全使用腺病毒原则。

植物细菌诱导型表达载体的构建

收稿日期:2006-11-01 基金项目:广东省科技攻关项目(2002A2070402,2006B20101011);广东省自然科学基金资助项目(5011730). 作者简介:曾骥(1983— ),男,湖南湘潭人,湛江师范学院助理研究员,从事植物基因工程研究.3通讯作者 2006年12月第27卷第6期湛江师范学院学报JOURNA L OF ZH AN J I ANG NORM A L C O LLEGE Dec 1,2006Vol 127 No 16 植物细菌诱导型表达载体的构建 曾 骥1,黄真池23,刘 媛2,黄永莲2 (1.湛江师范学院自然科学与技术研究中心,广东湛江524048;2.湛江师范学院生命科学与技术学院,广东,湛江524048) 摘 要:根据G enBank 中细菌诱导型启动子的碱基序列设计一对引物,通过PCR 扩增出启动子PPP3 (AF469483,220bp ).经分子操作将启动子和质粒pUC18连接后转化E .coli DH5 α,经蓝白筛选和PCR 检测筛选阳性菌落,测序结果与G enebank 中的碱基序列完全相同.对扩增到的PPP3片段和含目的基因(hrap 或p flp )的pBI121质 粒进行双酶切,分别回收PPP3片段和含目的基因的pBI121大片段,连接后转化E .coli DH5 α,通过卡那霉素抗性筛选和PCR 检测,表明细菌诱导型启动子和目的基因已正确连接.用重组质粒转化农杆菌,经卡那霉素抗性筛选和PCR 检测,证明植物细菌诱导型表达载体构建成功. 关键词:细菌诱导型启动子;hrap ;p flp ;植物细菌诱导型表达载体 中图分类号:Q946 文献标识码:A 文章编号:1006-4702(2006)06-0071-04 目前,世界上已经报道的植物细菌性病害有500多种,对农林业生产造成了巨大损失[1] .传统育种方法虽然能利用作物本身或亲缘种的抗性基因选育抗病品种,但存在着可利用的抗性品种资源少,选育时间长,耗资大等缺点;施用化学药剂来防治细菌病害并非完全有效,而且污染环境.近年来植物基因工程技术的不断发展以及对植物和病原物相互作用的深入了解使得将外源抗性基因导入植物来提高抗病性成为一条有效途径.通过转基因技术可以打破传统育种中的种间不亲和现象,消除杂交障碍,极大地拓宽了抗性基因的来源和应用.目前利用基因工程技术提高作物抗病性的研究主要集中在阻碍病原菌间的信号交流,通过RNA 干涉抑制病原菌关键致病基因的表达,转入无毒基因或无毒基因簇,利用强启动子或转录因子促进抗病相关 基因的表达等来提高植物抗病力[2-5].但实践证明,抗性基因的高效表达虽然提高了植物的抗病力,但由于 外源基因在植物体内的持久的高水平表达,植株会因能量过多耗损、而生长缓慢、畸变,甚至死亡[1,4-6].为了 避免这些不足,在转基因中使用诱导型启动子是理想的基因工程策略. 病原微生物侵染植物后,通常会引起植物体内活性氧的爆发,进而诱发超敏反应.超敏反应是一种快速 的局部组织坏死,从而阻止病原物的传播、扩散[7-9].据一系列文献报道,从甜椒中克隆到的p flp 基因能改变 植物细胞中活性氧的水平,hrap 基因能协助一些超敏反应激发子增强超敏反应,而两种基因同时表达可以 大大提高植物的抗病力[10-11].彭建令等[12-13]报道从烟草中克隆到3个细菌诱导型启动子PPP1、PPP2、PPP3, 这些启动子受亲和性病原细菌(青枯菌)、水杨酸、超敏反应激发子harpin 等的诱导.本研究试图构建诱导型启动子和p flp 基因或hrap 基因相连的植物表达载体,期望在转基因植物的生长过程中,病原微生物侵染可作为诱导信号,作用于诱导型启动子引发p flp 基因或hrap 基因的表达从而增强抗病能力.1 材料和方法 1.1 材料

慢病毒载体包装构建过程

慢病毒载体包装构建过程 原理:慢病毒载体可以将外源基因或外源的shRNA有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达目的序列的效果。在感染能力方面可有效地感染神经元细胞、肝细胞、心肌细胞、肿瘤细胞、内皮细胞、干细胞等多种类型的细胞,从而达到良好的的基因治疗效果。对于一些较难转染的细胞,如原代细胞、干细胞、不分化的细胞等,使用慢病毒载体,能大大提高目的基因或目的shRNA的转导效率,且目的基因或目的shRNA整合到宿主细胞基因组的几率大大增加,能够比较方便快捷地实现目的基因或目的shRNA的长期、稳定表达。 概念:慢病毒载体是指以人类免疫缺陷病毒-1 (H IV-1) 来源的一种病毒载体,慢病毒载体包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息,是慢病毒载体系统的主要组成部分。携带有外源基因的慢病毒载体在慢病毒包装质粒、细胞系的辅助下,经过病毒包装成为有感染力的病毒颗粒,通过感染细胞或活体组织,实现外源基因在细胞或活体组织中表达。 辅助成分:慢病毒载体辅助成分包括:慢病毒包装质粒和可产生病毒颗粒的细胞系。 慢病毒载体包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息。慢病毒包装质粒可提供所有的转录并包装RNA 到重组的假病毒载体所需要的所有辅助蛋白。为产生高滴度的病毒颗粒,需要利用表达载体和包装质粒同时共转染细胞,在细胞中进行病毒的包装,包装好的假病毒颗粒分泌到细胞外的培养基中,离心取得上清液后,可以直接用于宿主细胞的感染,目的基因进入到宿主细胞之后,经过反转录,整合到基因组,从而高水平的表达效应分子。 基本原理:慢病毒载体系统由两部分组成,即包装成分和载体成分。

包装成分:由HIV-1基因组去除了包装、逆转录和整合所需的顺式作用序列而构建,能够反式提供产生病毒颗粒所必需的蛋白。包装成分通常被分开构建到两个质粒上,一个质粒表达Gag和Pol蛋白,另一个质粒表达Env蛋白,其目的也是降低恢复成野生型病毒的可能。将包装成分与载体成分的3个质粒共转染细胞(如人肾293T细胞),即可在细胞上清中收获只有一次性感染能力而无复制能力的、携带目的基因的HIV-1载体颗粒。 载体成分:与包装成分互补,即含有包装、逆转录和整合所需的HIV顺式作用序列,同时具有异源启动子控制下的多克隆位点及在此位点插入的目的基因。 为降低两种成分同源重组恢复成野生型病毒的可能,需尽量减少二者的同源性,如将包装成分上5′LTR换成巨细胞病毒(CMV)立即早期启动子、3′LTR换成SV40 polyA等。 一、实验流程(1和2为并列步骤) 1.慢病毒过表达质粒载体的构建 设计上下游特异性扩增引物,同时引入酶切位点,PCR(采用高保真KOD酶,3K内突变率为0%)从模板中(CDNA质粒或者文库)调取目的基因CDS区(coding sequence)连入T载体。将CDS区从T载体上切下,装入慢病毒过表达质粒载体。 2.慢病毒干扰质粒载体的构建 合成siRNA对应的DNA颈环结构,退火后连入慢病毒干扰质粒载体 3. 慢病毒载体的包装与浓缩纯化 制备慢病毒穿梭质粒及其辅助包装原件载体质粒,三种质粒载体分别进行高纯度无内毒素抽提,共转染293T细胞,转染后6 h 更换为完全培养基,培养24和48h后,分别收集富含

7腺病毒载体疫苗可直接使用.docx

腺病毒载体疫苗 什么是腺病毒载体疫苗 腺病毒载体疫苗是指以腺病毒作为载体,将保护性抗原基因重组到腺病毒基因组中,使用能表达保护性抗原基因的重组腺病毒制成的疫苗。 腺病毒载体疫苗特点 研究发现,携带各种抗原的腺病毒载体能刺激机体产生很强的体液免疫或细胞免疫。此外,由于腺病毒载体能感染呼吸道和肠道细胞,可以方便地通过黏膜进行免疫,并能诱导机体产生黏膜和系统免疫应答。 腺病毒载体疫苗的临床研究 1、腺病毒载体诱导的天然免疫反应 腺病毒载体本身的病原相关分子模式与细胞表面模式识别受体结合,促进炎性细胞因子的分泌和未成熟树突状细胞分化为专职抗原呈递细胞,激活宿主的天然免疫系统。研究表明,通过静脉给小鼠注射大剂量的表达β-半乳糖苷酶的重组腺病毒,6h即可检测到IL-6、IL-1和TNF-α的分泌,脾脏边缘也有树突状细胞和巨噬细胞聚集,在恒河猴中也观察到类似现象。 2、腺病毒载体疫苗能迅速刺激机体产生高水平的体液免疫 很多疫苗是通过刺激机体产生中和抗体来发挥保护机体预防疾病作用的。腺病毒载体疫苗能有效产生针对相应靶抗原的高水平抗体。如携带狂犬病毒糖蛋白的复制缺陷型或复制型的5 型重组腺病毒载体疫苗,都能诱导高水平中和抗体,保护动物抵抗致死剂量狂犬病毒的攻击。 3、腺病毒载体疫苗能刺激机体产生很强的细胞免疫 特异性T细胞免疫在对抗寄生虫病、病毒性疾病及肿瘤治疗中都具有重要作用。大量的临床前和临床研究发现,腺病毒载体疫苗能刺激机体产生很强的针对外源基因的特异性T 细胞反应。有研究报道,携带恶性疟原虫抗原ME.TRAP的腺病毒载体疫苗能刺激小鼠产生很强的CD8+T细胞免疫反应,最高能达到92%的保护率。 4、腺病毒载体疫苗可方便地通过黏膜进行免疫 能通过黏膜免疫诱导局部或全身体液免疫反应是腺病毒载体疫苗的一个重要特点。黏膜免疫与全身免疫相比有许多不同,注射免疫诱导的全身免疫虽然可以清除其感染,但通常不能保护黏膜表面;而经黏膜接种疫苗可以非侵入性地诱导机体产生黏膜和系统免疫应答,从而可以保护机体免受通过黏膜表面和其他途径的感染。研究发现,在多种动物模型中,口服或滴鼻接种肺炎球菌、委内瑞拉马脑炎病毒、狂犬病毒、乙肝病毒的重组腺病毒载体疫苗,都能刺激机体产生很强的体液免疫和局部的黏膜反应,并保护机体免受相应病原的侵害。

表达载体的构建方法及步骤

表达载体的构建方法及步骤 一、载体的选择及如何阅读质粒图谱 目前,载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA 是一种新的非病毒转基因载体。一个合格质粒的组成要素: (1)复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA 分子中只有一个复制起始点。而 真核生物DNA 分子有多个复制起始位点。 (2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ (3)多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段 (4)P/E 启动子/增强子 (5)Terms 终止信号 (6)加poly(A)信号可以起到稳定mRNA 作用 选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。如果构建的目 的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。 载体选择主要考虑下述3点: 【1】构建DNA 重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。【2】.载体的类型: (1)克隆载体的克隆能力-据克隆片段大小(大选大,小选小)。如<10kb 选质粒。(2)表达载体据受体细胞类型-原核/真核/穿梭,E.coli/哺乳类细胞表达载体。

(3)对原核表达载体应该注意:选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4个困难和阅读框错位;表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。【3】载体MCS 中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因与载体易于链接,不能产生阅读框架错位。 综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5点要求: (1)选分子量小的质粒,即小载体(1-1.5kb)→不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载 体); (2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般10个以上的拷贝,而严谨型质粒<10个。 (3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地; (4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr(试一试)。(5)满足自己的实验需求,是否需要包装病毒,是否需要加入荧光标记,是否需要加入标签蛋白,是否需要真核抗性(如Puro、G418)等等。 无论选用哪种载体,首先都要获得载体分子,然后采用适当的限制酶将载体DNA 进行切割,获得线性载体分子,以便于与目的基因片段进行连接。 如何阅读质粒图谱 第一步:首先看Ori 的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒) 第二步:再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。 (1)Ampr 水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。 (2)tetr 可以阻止四环素进入细胞。 (3)camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 (4)neor(kanr)氨基糖苷磷酸转移酶使G418(长那霉素衍生物)失活

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