基于生物信息学挖掘糖尿病心肌病表达谱芯片

基于生物信息学挖掘糖尿病心肌病表达谱芯片
基于生物信息学挖掘糖尿病心肌病表达谱芯片

基于生物信息学挖掘糖尿病心肌病表达谱芯片

石磊1 李万鹏2 安军钰1 刘怡1 吴鹏1 吴文宇3 曹云山2 黄晏2

【摘要】[摘要]目的基于生物信息学技术挖掘糖尿病心肌病(DC)相关差异表达基因及其功能。方法应用生物信息学方法分析基因表达谱数据集GSE4547。结果挖掘原始芯片数据,筛选到79个差异表达基因。基于基因本体论功能注释和相关通路分析,以及通过构建差异共表达基因蛋白质互作网络及模块分析后,最终获得Hk2、Col1a2、Col1a1、Col3a1、Slc2a1、Cpt1a、Slc2a4、Cd36、Ucp3、Pdk4 10 个关键基因为链脲佐菌素诱导 DC 的关键基因。结论最终获得的10个关键基因可能成为未来治疗糖尿病心肌病的潜在治疗靶点,为今后探究与DC相关基因和信号通路的功能变化提供新的视角和导向。

【期刊名称】《中国医药导报》

【年(卷),期】2019(016)024

【总页数】5

【关键词】[关键词]糖尿病心肌病;GEO数据库;差异表达基因;基因芯片;生物信息学技术

[基金项目]甘肃省卫生行业科研计划项目(GSWSKY2016-02)。

糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy,DC)是一种特殊的心脏疾病,其发生与心脏组织对胰岛素代谢作用的抵抗、代偿性高胰岛素血症和高血糖等有关,与冠状动脉疾病和高血压等其他心脏危险因素无关[1]。尽管研究已证实,多种因素可能共同促进DC的进展,但是推动这些病理过程的确切分子机制尚不完全清楚[2]。研究表明[3],DC可能是一种由多种基因和多个信号通路参与

相关文档
最新文档