SPSS生存分析过程

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SPSS Survival(生存分析)菜单

SPSS Survival 菜单包括Life Tables 过程、Kaplan-Meier 过程、Cox Regression 过程、Cox w/Time-Dep Cov 过程。这里只介绍Life Tables 过程和Kaplan-Meier 过程。

Life Tables 过程

Life Tables 过程用于:

1、估计某生存时间的生存率。

2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。

3、对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不同水平之间进行两两比较。

一、建立数据文件

定义两个列变量:时间变量:取名“ time ”,label 标上“ survival time(week) 。” 生存状态变量:取名“ status ”,并赋值:0=“删失”,

1=“死亡”。二、操作过程从菜单选择

1、Analyze==>Survival ==>Life Tables

2、Time 框:选入time

3、Display Time Intervals 框:在by 前面的框内填入生存时间上限,本例填入20(此区间必须包括生存时间的最大值) ;在by 后面的框内填入生存时间的组距,本例填入5,以保证结果列出“15-”的组段。

4、 S tatus 框:选入 status ;击 define events 钮,在 single value 框右边的空 格中输入1

5、 单击Option 按钮,弹出对话框: Life Table(s)输出寿命表,系统默认 Plots:选Survival (累积生存函数曲线) 击 Continue

6、单击0K 钮 附:界面说明

, 4 Time :

O 5

Di epliy Tira s 0

20 Iz 5 SIatus: aar

Factor:

By Factor:

2pti on^ .-

图1

寿命表主对话框

【Time 】框 选入生存时间变量

【Display Time Intervals 】框 欲输出生存时间范围及组距。 在by 前面的框内填入生存时间上限,本例填入

200 (此区间必须包括生

□K Fiste

Cancel Hslj Lire Tables

存时间的最大值);在by后面的框内填入生存时间的组距,本例填入20,以保证结果列出“ 100”的组段。

【Status】框

选入生存状态变量,并定义终结事件的标记值。

选入变量“ Status”后,【Define Event】钮被激活变黑,击该按钮,弹出定义终结事件标记值的对话框(图1)。对二分类变量,一般以死亡、复发、恶化等表示终结事件。本例以死亡为终结事件,其标记值为1,故在Single value框内填入1。击Continue钮。若生存状态变量取值为一连续型变量,如反应变量为收缩压,则在下面的Range of values框中输入140 through 400,此处上限输入400是我随便输入的一个上限,目的是为了定义高血压患者,实际上恐怕没有人的血压能达到400,这样才能保证包括所有的

高血压病例,具体情况具体分析。

图2 定义终结事件标记值的对话框【Factor】框

定义第1层因素,即分组因素。

【By Factor】框

定义第2层因素,即分层因素。

【Options】选项

击Options按钮,弹出选项对话框。(图3)

图3 寿命表选项对话框

Life Table(s):输出寿命表,系统默认。Plot:统计图

Survival :累积生存函数曲线

Cox回归分析—非常详细的SPSS操作介绍

患者生存状态的影响因素分析 ——生存资料的COX回归分析1、问题与数据 某研究者拟观察某新药的抗肿瘤效果,将70名肺癌患者随机分为两组,分别采用该新药和常规药物进行治疗,观察两组肺癌患者的生存情况,共随访2年。研究以死亡为结局,两种治疗方式为主要研究因素,同时考虑调整年龄和性别的影响,比较两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异。变量的赋值和部分原始数据见表1和表2。 表1. 某恶性肿瘤的影响因素与赋值 表2. 两组患者的生存情况 group gender age time survival 0 1 0 22 1 0 1 1 10 1 0 1 1 64 1 0 1 1 12 1 0 1 0 17 1 1 0 0 19 1 1 1 1 4 1 1 0 1 1 2 0 1 0 0 5 0 1 1 1 27 0 2、对数据结构的分析 该研究以死亡为结局,治疗方式为主要研究因素,每个研究对象都有生存时

间(随访开始到死亡、失访或随访结束的时间),同时考虑调整年龄和性别的影响。欲了解两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异,可以用Cox比例风险模型(Cox proportional-hazards model,也称为Cox回归)进行分析。 实际上,Cox回归的结局不一定是死亡,也可以是发病、妊娠、再入院等。其共同特点是,不仅考察结局是否发生,还考察结局发生的时间。 在进行Cox回归分析前,如果样本不多而变量较多,建议先通过单变量分析(KM法绘制生存曲线、Logrank检验等)考察所有自变量与因变量之间的关系,筛掉一些可能无意义的变量,再进行多因素分析,这样可以保证结果更加可靠。即使样本足够大,也不建议把所有的变量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各个变量之间的相互关系,确定自变量进入方程的形式,这样才能有效的进行分析。 单因素分析后,应当考虑应该将哪些自变量纳入Cox回归模型。一般情况下,建议纳入的变量有:1)单因素分析差异有统计学意义的变量(此时,最好将P值放宽一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)单因素分析时,没有发现差异有统计学意义,但是临床上认为与因变量关系密切的自变量。 3、SPSS分析方法 (1)数据录入SPSS

spss之生存分析2张文彤

第十四章活着--Survival菜单详解(下) (医学统计之星:董伟) 上次更新日期: 13.1 Life Tables过程 13.1.1 界面说明 13.1.2 结果解释 13.2 Kaplan-Meier过程 13.2.1 界面说明 13.2.2 结果解释 13.3 Cox Regression过程 13.3.1 界面说明 13.3.2 结果解释 13.4 Cox w/Time-Dep Cov过程 13.4.1 界面说明 13.4.2 结果解释 §13.3 Cox Regression过程 上面给大家介绍的是两种生存分析方法,但它们只能研究一至两个因素对生存时间的影响,当对生存时间的影响因素有多个时,它们就无能为力了,下面我给大家介绍Cox Regression过程,这是一种专门用于生存时间的多变量分析的统计方法。 Cox Regression过程主要用于: 1、用以描述多个变量对生存时间的影响。此时可控制一个或几个因素,考察其他因素对生存时间的影响,及各因素之间的交互作用。 例13.3 40名肺癌患者的生存资料(详见胡克震主编的《医学随访统计方法》 生存时间状态生活能力评分年龄诊断到研究时间鳞癌小细胞癌腺癌疗法癌症类别4111706451001 1.00 1261606391001 1.00 11817065111001 1.00 0,1,0为小细胞癌;0,0,1为腺癌。表中的最后一个变量是我加上去的癌症类别,1为鳞癌;2为小细胞癌;3为腺癌;4为其它癌。实践表明结果与用亚变量计算一样。 13.3.1 界面说明

图9 Cox回归主对话框 【Time】框、【Status】框前文已经介绍过了,这里我就不再废话唠叨的了。Block 1 of 1右边的Next钮被激活。这个按钮用于确定不同自变量进入回归方程的方法,详见Method框的内容。用同一种方法进入回归方程的自变量在同一个Covariates框内。 【Covariates】框 选入自/协变量,即选入你认为可能对生存时间有影响的变量。 【Method】框 选择自变量进入Cox回归方程的方法,SPSS提供下面几种方法:?Enter: Covariates框内的全部变量均进入回归模型。 ?Forward: Conditional: 基于条件参数估计的向前法。 ?Forward: LR: 基于偏最大似然估计的向前法。 ?Forward: Wald: 基于Wald统计量的向前法。 ?Backward: Conditional: 基于条件参数估计的后退法。 ?Backward: LR: 基于偏最大似然估计的后退法。 ?Backward: Wald: 基于Wald统计量的后退法。 【Strata】框 定义分层因素,将生存时间按分层因素分别进行Cox回归。 【Categorical】选项 用于告诉系统,Covariates框内的变量中哪些是分类变量或字符型变量。系统默认字符型变量为分类变量,数字型变量为连续型变量。 选入自变量后,categorical钮被激活。按categorical钮,进入确定分类变量的对话框。见图10。

SPSS生存分析报告过程

SPSS Survival(生存分析)菜单 SPSS Survival菜单包括Life Tables过程、Kaplan-Meier过程、Cox Regression过程、Cox w/Time-Dep Cov过程。这里只介绍Life Tables 过程和Kaplan-Meier过程。 Life Tables过程 Life Tables过程用于: 1、估计某生存时间的生存率。 2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。 3、对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不同水平之间进行两两比较。 一、建立数据文件 定义两个列变量: 时间变量:取名“time”,label标上“survival time(week)”。 生存状态变量:取名“status”,并赋值:0=“删失”,1=“死亡”。 二、操作过程 从菜单选择 1、Analyze==>Survival ==>Life Tables 2、Time框:选入time 3、Display Time Intervals框:在by前面的框内填入生存时间上限,本例填入20(此区间必须包括生存时间的最大值);在by后面的框内填入生存时间的组距,本例填入5,以保证结果列出“15-”的组段。

4、Status框:选入status;击define events钮,在single value框右边的空格中输入1 5、单击Option按钮,弹出对话框: Life Table(s) 输出寿命表,系统默认 Plots: 选Survival(累积生存函数曲线) 击Continue 6、单击OK钮 附:界面说明 图1 寿命表主对话框 【Time】框 选入生存时间变量。 【Display Time Intervals】框

生存分析的cox回归模型案例——spss

生存分析的cox回归模型案例——spss

————————————————————————————————作者: ————————————————————————————————日期: ?

一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。 2、生存时间(Survivaltime) 指从某一起点到事件发生所经过的时间。生存是一个广义的概念,不仅仅指医学中的存活,也可以是机器出故障前的正常运行时间,或者下岗工人再就业前的待业时间等等。有的时候甚至不是通用意义上的时间,比如汽车在出故障前的行驶里程,也可以作为生存时间来考虑。 3、删失(Sensoring) 指由于所关心的事件没有被观测到或者无法观测到,以至于生存时间无法记录的情况。常由两种情况导致:(1)失访;(2)在研究终止时,所关心的事件还未发生。 4、生存函数(Survival distributionfunction) 又叫累积生存率,表达式为S(t)=P(T>t),其中T为生存时间,该函数的意义是生存时间大于时间点t的概率。t=0时S(t)=1,随着t的增加S(t)递减(严格的说是不增),1-S(t)为累积分布函数,表示生存时间T不超过t的概率。? 二、生存分析的方法 1、生存分析的主要目的是估计生存函数,常用的方法有Kaplan-Meier法和寿命表法。对于分组数据,在不考虑其他混杂因素的情况下,可以用这两种方法对生存函数进行组间比较。 2、如果考虑其他影响生存时间分布的因素,可以使用Cox回归模型(也叫比例风险模型),利用数学模型拟合生存分布与影响因子之间的关系,评价影响因子对生存函数分布的影响程度。这里的前体是影响因素的作用不随时间改变,如果不满足这个条件,则应使用含有时间依存协变量的Cox回归模型。 下面用一个例子来说明SPSS中Cox回归模型的操作方法。 例题 要研究胰腺癌术中放疗对患者生存时间的影响,收集了下面所示的数据:

生存分析的co回归模型案例spss完整版

生存分析的c o回归模 型案例s p s s HEN system office room 【HEN16H-HENS2AHENS8Q8-HENH1688】

一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。 2、生存时间(Survival time) 指从某一起点到事件发生所经过的时间。生存是一个广义的概念,不仅仅指医学中的存活,也可以是机器出故障前的正常运行时间,或者下岗工人再就业前的待业时间等等。有的时候甚至不是通用意义上的时间,比如汽车在出故障前的行驶里程,也可以作为生存时间来考虑。 3、删失(Sensoring) 指由于所关心的事件没有被观测到或者无法观测到,以至于生存时间无法记录的情况。常由两种情况导致:(1)失访;(2)在研究终止时,所关心的事件还未发生。 4、生存函数(Survival distribution function) 又叫累积生存率,表达式为S(t)=P(T>t),其中T为生存时间,该函数的意义是生存时间大于时间点t的概率。t=0时S(t)=1,随着t的增加S(t)递减(严格的说是不增),1-S(t)为累积分布函数,表示生存时间T不超过t的概率。 二、生存分析的方法 1、生存分析的主要目的是估计生存函数,常用的方法有Kaplan-Meier法和寿命表法。对于分组数据,在不考虑其他混杂因素的情况下,可以用这两种方法对生存函数进行组间比较。 2、如果考虑其他影响生存时间分布的因素,可以使用Cox回归模型(也叫比例风险模型),利用数学模型拟合生存分布与影响因子之间的关系,评价影响因子对生存函数分布的影响程度。这里的前体是影响因素的作用不随时间改变,如果不满足这个条件,则应使用含有时间依存协变量的Cox回归模型。 下面用一个例子来说明SPSS中Cox回归模型的操作方法。 例题 要研究胰腺癌术中放疗对患者生存时间的影响,收集了下面所示的数据: 操作步骤: SPSS变量视图 菜单选择: 点击进入Cox主对话框,如下,将time选入“时间”框,将代表删失的censor变量选入“状态”框,其余分析变量选入“协变量”框。其余默认就行。 点击“状态”框下方的“定义事件”,将事件发生的标志设为值0,即0代表事件发生。 在主对话框中点击“分类”按钮,进入如下的对话框,将所有分类变量选入右边框中。 在主对话框中点击“绘图”按钮,进入如下的对话框,选择绘图的类型,这里只选择“生存函数”。由于我们关心的主要变量是trt(是否放疗),所以将trt选入“单线”框中,绘制生存曲线。 在主对话框中点击“选项”按钮,进入如下的对话框,设置如下,输出RR的95%置信区间。回到主界面,点击“确定”输出结果。 结果输出

SPSS生存分析过程

SPSS Survival(生存分析)菜单 SPSS Survival 菜单包括Life Tables 过程、Kaplan-Meier 过程、Cox Regression 过程、Cox w/Time-Dep Cov 过程。这里只介绍Life Tables 过程和Kaplan-Meier 过程。 Life Tables 过程 Life Tables 过程用于: 1、估计某生存时间的生存率。 2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。 3、对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不同水平之间进行两两比较。 一、建立数据文件 定义两个列变量:时间变量:取名“ time”,label 标上“ survival time(week) 。” 生存状态变量:取名“ status”并赋值:0= “删失” ,1= “死亡”。二、操作过程从菜单选择 1 、Analyze==>Survival ==>Life Tables 2、Time 框:选入time 3、Display Time Intervals 框:在by 前面的框内填入生存时间上限,本例 填入20(此区间必须包括生存时间的最大值) ;在by 后面的框内填入生存时间的组距,本例填入5,以保证结果列出“1 5- ”的组段。

4、 StatUS 框:选入 StatUs ;击 define events 钮,在 SingIe value 框右边的空 格中输入1 5、 单击OPtiOn 按钮,弹出对话框: Life TabIe(S)输出寿命表,系统默认 Plots:选SUrViVaI (累积生存函数曲线) 击 COntinUe 6、单击OK 钮 附:界面说明 J Lire Tabled ____ I Tim?: 口加 Status : ^d(∪ Factor: Ey FaCtor: JPti OlkE .一 图1 寿命表主对话框 【Time 】框 选入生存时间变量 【DiSPIay Time InterVaIS 】框 欲输出生存时间范围及组距。 DiSPlay Time Interval≡ 0 20

SPSS生存分析过程

SPSSSurvival(生存分析)菜单SPSS Survival菜单包括LifeTables过程、Kaplan-Meier过程、Cox Regression过程、Cox w/Time-Dep Cov过程。这里只介绍Life Tables过程与Kaplan-Meier过程。 LifeTables过程 LifeTables过程用于: 1、估计某生存时间得生存率。 2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。 3、对某一研究因素不同水平得生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平得生存时间分布进行比较,包括从总体上比较与不同水平之间进行两两比较。 一、建立数据文件 定义两个列变量: 时间变量:取名“time”,label标上“survivaltime(week)”。 生存状态变量:取名“status”,并赋值:0=“删失”,1=“死亡”。 二、操作过程 从菜单选择 1、Analyze==>Survival==>LifeTables 2、Time框:选入time 3、Display Time Intervals框:在by前面得框内填入生存时间上限,本例填入20(此区间必须包括生存时间得最大值);在by后面得框内填

入生存时间得组距,本例填入5,以保证结果列出“15-”得组段。 4、Status框:选入status;击define events钮,在single value框右边得空格中输入1 5、单击Option按钮,弹出对话框: ●Life Table(s)输出寿命表,系统默认 ● Plots:选Survival(累积生存函数曲线) 击Continue 6、单击OK钮 附:界面说明 图1 寿命表主对话框 【Time】框 选入生存时间变量。

生存分析的cox回归模型案例spss

一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。 2、生存时间(Survival time) 指从某一起点到事件发生所经过的时间。生存是一个广义的概念,不仅仅指医学中的存活,也可以是机器出故障前的正常运行时间,或者下岗工人再就业前的待业时间等等。有的时候甚至不是通用意义上的时间,比如汽车在出故障前的行驶里程,也可以作为生存时间来考虑。 3、删失(Sensoring) 指由于所关心的事件没有被观测到或者无法观测到,以至于生存时间无法记录的情况。常由两种情况导致:(1)失访;(2)在研究终止时,所关心的事件还未发生。 4、生存函数(Survival distribution function) 又叫累积生存率,表达式为S(t)=P(T>t),其中T为生存时间,该函数的意义是生存时间大于时间点t的概率。t=0时S(t)=1,随着t的增加S(t)递减(严格的说是不增),1-S(t)为累积分布函数,表示生存时间T不超过t的概率。 二、生存分析的方法 1、生存分析的主要目的是估计生存函数,常用的方法有Kaplan-Meier法和寿命表法。对于分组数据,在不考虑其他混杂因素的情况下,可以用这两种方法对生存函数进行组间比较。 2、如果考虑其他影响生存时间分布的因素,可以使用Cox回归模型(也叫比例风险模型),利用数学模型拟合生存分布与影响因子之间的关系,评价影响因子对生存函数分布的影响程度。这里的前体是影响因素的作用不随时间改变,如果不满足这个条件,则应使用含有时间依存协变量的Cox回归模型。 下面用一个例子来说明SPSS中Cox回归模型的操作方法。 例题 要研究胰腺癌术中放疗对患者生存时间的影响,收集了下面所示的数据:

医学统计学SPSS生存分析实例

将生存时间按从小到大顺序排列如下: 表1 BCG治疗组生存情况 *死亡=1;删失=0

23.0 26.9 1 1 2 1 *死亡=1;删失=0 按上述二表将数据输入SPSS软件,其中数据编号为i,列(1)即时间为t,列(3)即生存结局为status,表1为group1,表2为group2。 选择Analyze中的Survival里的Kaplan-Meier分析,将Time,Status,Factor依次选定,option 和Compare Factor依次设定完成后,得到输出结果,结果分析如下: Survival Table中: 1为BCG治疗组患者生存率(Estimate)及其标准误(Std. Error)的计算结果。2为药物与BCG结合治疗组患者生存率(Estimate)及其标准误(Std. Error)的计算结果。 Overall Comparisons Chi-Square df Sig.

Test of equality of survival distributions for the different levels of group. 两组生存率的log-rank 检验 H 0:两种疗法患者生存率相同 H 1:两种疗法患者的生存率不同 α=0.05 采用SPSS 软件对两组生存率进行检验,得到上面Overall Comparisons 表,其中第一行为LogRank 检验结果。即X 2=0.057,P=0.811。按α =0.05水准,不拒绝H 0,还不能认为用BCG 疗法和用药物与BCG 结合疗法治疗黑色素瘤患者的生存率有差别。 生存曲线如上图所示,其中生存时间为横轴,生存率为纵轴。

医学统计学SPSS生存分析实例

医学统计学S P S S生存分 析实例 The Standardization Office was revised on the afternoon of December 13, 2020

将生存时间按从小到大顺序排列如下: 表1 BCG治疗组生存情况 按上述二表将数据输入SPSS软件,其中数据编号为i,列(1)即时间为t,列(3)即生存结局为status,表1为group1,表2为group2。 选择Analyze中的Survival里的Kaplan-Meier分析,将Time,Status,Factor 依次选定,option和Compare Factor依次设定完成后,得到输出结果,结果分析如下: Survival Table中: 1为BCG治疗组患者生存率(Estimate)及其标准误(Std. Error)的计算结果。

2为药物与BCG结合治疗组患者生存率(Estimate)及其标准误(Std. Error)的计算结果。 Overall Comparisons Test of equality of survival distributions for the different levels of group. 两组生存率的log-rank检验 H :两种疗法患者生存率相同 :两种疗法患者的生存率不同 H 1 α= 采用SPSS软件对两组生存率进行检验,得到上面Overall Comparisons表,其中第 ,还不能认为用BCG疗一行为LogRank检验结果。即X2=,P=。按α=水准,不拒绝H 法和用药物与BCG结合疗法治疗黑色素瘤患者的生存率有差别。 生存曲线如上图所示,其中生存时间为横轴,生存率为纵轴。

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