唾液DNA提纯试剂盒说明书(最终版)

Just-a-Tube?唾液DNA提纯试剂盒说明书

室温保存,RNase A保存在4 oC。

试剂盒组成及贮存

Just-a-Tube?唾液DNA提纯试剂盒可从Charm-Protect唾液收集和储存液中提纯gDNA,其组成如下表所示。所有的组分除了RNase A 需要保存在4 oC之外,其余组分室温保存即可。可进行50, 250 或者5次gDNA的提纯。

产品介绍

利用Just-a-Tube?唾液DNA提纯试剂盒可以简单,迅速地从Charm-Protect唾液收集和储存瓶的唾液储存液中分离到高质量的DNA。DNA样品的纯化仅在一个小管中进行。在这个过程中不需要膜或磁珠结合来DNA。昌美生物科技有限公司将固体表面可逆结合技术(SSRB)应用到Just-a-Tube系统中,离心管底侧涂有可与唾液裂解液中DNA选择性高效结合的结合剂。在结合缓冲液作用下,结合剂可特异性结合gDNA,而蛋白和其它的成分保留在溶液中。未结合的物质经涮洗后予以去除。纯化的gDNA经10 mM Tris 洗脱液或去离子水洗脱。纯化的gDNA可直接用于下游反应,如限制性酶切反应,SNP分析,PCR,序列分析,全基因组扩增(W GA)和DNA甲基化分析等。

所需的额外材料

*96-100 %乙醇,

*异丙醇,

*1.5 ml 或2.0 ml离心管,

*武汉昌美生物技术有限公司生产的唾液收集和保存瓶中的Charm-Protect唾液DNA保存液,

*移液器和吸头,

*可离1.5ml或2ml离心管的离心机,

*涡旋振荡器,

*水浴锅或恒温金属浴,

常规防范

1.该试剂盒仅用于实验。

2.实验操作时穿实验服,戴一次性手套和眼镜。避免摄取和吸入试剂,避免与试剂盒中试剂进行皮肤接触,一旦接触,用手彻底冲洗。

3.提纯核酸DNA时,避免核酸酶的污染,使用无菌新吸头避免交叉污染。

实验之前的准备工作

1.从唾液裂解液中提纯gDNA之前,需要根据提纯的样品数目制备新鲜的工作结合缓冲液。工作结合缓冲液由结合缓

冲液(KB6)与100%异丙醇以1:4体积均匀混合得到,如配制500 μl 工作结合缓冲液:将100 μl 结合缓冲液(KB6)与400 μl异丙醇混合均匀。制备的工作结合缓冲液的体积根据:(1)待提纯的样品数目;(2) 预期的损失,在悬浮过程中,一般会损失10% 。制备的工作结合缓冲液(KB6), 每100 μl 细胞裂解液加100 μl含异丙醇的工作结合缓冲液(1:1比例)。剩余的结合缓冲液当天予以丢弃。

2.QT-275-M 试剂盒, 加22 ml 100 %乙醇到Washing Buffer I (WB1)中,充分混匀。QT-275-L 试剂盒, 加110 ml 100 %

乙醇到Washing Buffer I (W B1),充分混匀。QT-275-S 试剂盒, 加2.2 ml 100 %乙醇到Washing Buffer I (WB1),充分混匀。(在瓶上做好标记表示已加乙醇!)。室温保存,加乙醇的WB1在六个月之内使用。

3.QT-275-M试剂盒,加72 ml 100 % 乙醇到Washing Buffer II(WB2)中,充分混匀。QT-875-L试剂盒,加360 ml 100 %

乙醇到Washing Buffer II (WB2),充分混匀。QT-875-S试剂盒,加7.2 ml 100 % 乙醇到Washing Buffer II (W B2),充分混匀。(在瓶上做好标记表示已加乙醇!)。室温保存,加乙醇的WB2在六个月之内使用。

4.该试剂盒可从100 μl直到1000 μl唾液保存液中提纯gDNA。如果有需要,4 ml 唾液保存液也可以在一次提纯过程

中被提取。在进行gDNA提纯实验之前,为了避免gDNA降解,请遵守标准的Charm-Protect唾液DNA保存液收集和储存程序.

操作程序

制备裂解液

下列程序是从1 ml唾液保存液中提纯gDNA。可根据唾液保存液实际体积作相应调整。

1.取20 μl RNase A(RA2)到1.5 ml 或2.0 ml 离心管中。

2.将储存在Charm-Protect唾液收集瓶中的唾液样品与唾液保存液颠倒和震荡7-8次。静置3-5分钟。

3.从唾液收集瓶中吸取1 ml 唾液保存混合物到预先加了RNase A的离心管中,吸头吹打8-9次,或将离心管盖子盖上后颠倒离心管7-8次,混合均匀。(当吸取唾液混合液时,注意不要吸到收集瓶底颗粒状沉淀。)

4.将离心管置于65 oC水浴锅或金属浴中温育10分钟。期间颠倒混合离心管,也可将样品50 oC温育过夜。

5.将离心管以最大转速(13000 rpm或16000 g)离心2分钟来去除颗粒物质,如食物颗粒,未经消化的死细胞和纤维碎片。

结合程序

1.转移900 ul 澄清的唾液裂解液到一个结合管(BT3)中,注意不要吸到离心管底的碎片沉淀。注意:为避免吸到管底的碎片沉淀,吸的时候可以留150-250 μl溶液在离心管中。

2. 加900 μl 含有异丙醇的工作结合缓冲液(KB6)到结合管(BT3)中,充分混匀。(注意:将工作结合缓冲液与唾液裂解液彻底混匀这一步非常重要)

3. 将结合管(BT3)在室温下以最大转速(13000 rpm或16000 g)离心3分钟来结合DNA。(注意:在离心过程中,离心管盖朝向转子方向放置,离心后DNA大部分聚集在背对管盖的管底一侧。)

4.打开盖子,用吸头吸走结合管底中央的液体,注意在吸的过程中,吸头不要碰到管壁,因为DNA吸附在管壁上。

5、可选择操作。如果处理超过1 ml 的唾液保存混合液,重复步骤1-3直到所有的唾液混合物都被利用。(注意:加了

澄清的唾液裂解液到结合管之后,再次加唾液裂解液时,需将唾液裂解液用吸头吹打5-7次,在加入工作的结合缓冲液(KB6)之前至少温育2分钟。)

清洗程序

1.向每管中加500 l 含乙醇的Washing Buffer I (W B1)。震荡管子4-5次混匀。室温温育1分钟.

2.在室温以最大转速(≥13000 rpm或16000 g)离心结合管1分钟。在离心过程中,离心管盖朝向转子方向放置)。

3.用吸头吸走结合管(BT3)管底中央的Washing Buffer (W B1),注意在吸的过程中,吸头不要碰到管壁,因为DNA

吸附在管壁上。

4.加800 μl 含乙醇的Washing Buffer II(WB2)到结合管(BT3)中。震荡管子4-5次或盖上盖子后颠倒离心管7-8次

混匀。

5.在室温以最大转速(≥13000 rpm或16000 g)离心结合管1分钟。在离心过程中,离心管盖朝向转子方向放置。

6.用吸头去除结合管(BT3)中Washing Buffer(WB2)。

7.重复步骤4-6,即用Washing Buffer(WB2)洗两次。

8.洗完最后一遍之后,为彻底清除Washing Buffer, 在移除大部分液体后,可以再次短暂离心结合管(BT3),用200 μl

吸头吸走管底中间最后一滴液体,将结合管(BT3)在实验室通风橱晾8-10分钟来去除残余的液体。也可以将管子置于62 o C水浴锅或金属浴中晾干3-5分钟。

gDNA的洗脱

吸附在结合管壁的gDNA至少可以保存六个月。如果gDNA需要洗脱,可进行下面的程序。

1.加20 μL-100 μL 洗脱缓冲液(EB2)到每个结合管管壁(如果需要高浓度的DNA,加20 μL洗脱缓冲液(EB2),选

择1或2来洗脱gDNA。)

2.选择1(涡旋洗脱): 盖上离心管的盖子,涡旋离心管30 秒,以最大转速短暂离心将所有的液体收集到离心管底部。

选择2(震荡洗脱):盖上离心管的盖子,震荡离心管2分钟。选择3(移液枪洗脱):上下吹打溶液8-10次,盖上离心管的盖子,将管子在室温放置2分钟。

3.洗脱的gDNA可直接应用于下游反应。或在4 oC 短期储存或者–20 oC 长期储存。

电泳及下游的应用

提纯的gDNA可用琼脂糖凝胶电泳进行质检,也可用分光光度计或荧光标记法测量产量。结合管中纯化的gDNA可直接用于下游反应,如限制性酶切反应,SNP分析,PCR,STR分析,DNA序列分析,全基因组扩增(WGA)及其它分子实验操作。

常见问题及解决方案

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