PTEN与p53在鼻咽癌中的表达及意义_郑大勇

基因表达谱测序

基因表达谱测序背景介绍基因表达谱分析利用HiSeq 2000高通量测序平台对mRNA进行测序，获得10M读长为49nt的原始reads，每一个reads可以对应到相应的转录本，从而研究基因的表达差异情况。与转录组测序相比，基因表达谱分析要求的读长更短，测序通量更小，仅可用于基因表达差异的研究。该方法具有定量准、可重复性高、检测阈值宽、成本低等特点，能很好的替代以往的数字化表达谱分析。技术路线

生物信息学分析送样要求样品要求 1. 所需Total RNA 的量均不少于 20μg/文库，Total RNA 可以保存在DEPC 处理过的水中、75%的乙醇、异丙醇中，具体以什么方式保存请注明。 2. 如提供实验材料为动物组织材料，样品质量需大于2g ； 3. 如提供实验材料为植物样品，样品质量需大于4g ； 4. 如提供实验材料为培养细胞，请提供1×107培养好的细胞； 5. 如提供实验材料为血液样品，请提供≥2ml 的样品。我们强烈建议在送样的同时客户做好备份，以备后续实验之用。样品纯度要求 1. OD 260/OD 280在1.8- 2.0之间，RNA 无降解、28S 和18S 核糖体RNA 条带非常亮且清晰（其

大小决定于用于抽提RNA的物种类型），28S的密度大约是18S的2倍；Agilent 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN≥8。 2. 无蛋白质、基因组DNA污染，如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。请提供至少一种样品的凝胶电泳或者Agilent 2100检测仪检测图片，并注明其浓度、体积、OD260/OD280、溶剂名称、制备时间、物种来源以及特别备注。最终以我方定量、质检为准。样品采集为了保证提取RNA的完整性，确保后续实验的顺利进行，请务必确保样品的新鲜，对于如何确保样品的新鲜针对不同的样品获取材料的方法如下： 1. 动物组织：从活体上迅速的取下组织（切成黄豆粒大小的块状），每切成一个黄豆粒大小的块状立即放入液氮中，重复上述操作，直至足够提取总RNA的量；准备一个50ml的离心管，做相应的标记（样品名称、编号、客户姓名、时间），最好既在管盖上做好标记，也在管壁上做好相应的标记，先放入液氮中预冷2-3min，拿出离心管（离心管的下部分还是保持在液氮中），打开离心管的盖子，将液氮中黄豆粒大小的块状收集进离心管中。 2. 植物组织：（1）如所采集的是果实、麦穗等体积偏大的样品，收集样品请参照1.动物组织取样方法；（2）如采集的是叶片等体积偏小的样品，请尽量采集嫩叶、幼芽等，每采集一片叶片立即放入液氮中，直至足够提取总RNA的量，后续操作请参照动物组织的采集。（3）如是植物的花，在采集花骨朵的时候请尽量不要采集到花萼、叶片等，每采集一个花骨朵请立即放入液氮中，直至足够提取总RNA的量；后续操作请参照动物组织的采集。3. 如提供实验材料为菌丝体，请取500μl的菌液于1.5ml离心管中，离心去上清，剩余菌丝体放入液氮或干冰中，请提供不少于5管的菌丝体。样品运输从液氮中取出准备好的样品，请立即放入干冰中，并用干冰掩埋好样品。请填写完整订单，放入自封袋中与样品一起邮寄。为防止RNA的降解，请确保干冰的量足够运送到目的地。我们强烈建议在寄送RNA样品时将RNA保存在75%的乙醇或异丙醇中。如是特殊样品，关于送样量和保存问题请与我们联系沟通，以便双方共同协商解决。提供结果根据客户需求，提供不同深度的信息分析结果。

全基因组表达谱分析方法(DGE)

全基因组表达谱分析方法（DGE）----基于新一代测序技术的技术路线该方法首先从每个mRNA的3’端酶切得到一段21bp的TAG片段（特异性标记该基因）；然后通过高通量测序，得到大量的TAG序列，不同的TAG序列的数量就代表了相应基因的表达量；通过生物信息学分析得到TAG代表的基因、基因表达水平、以及样品间基因表达差异等信息。技术路线如下： 1、样品准备： a) 提供浓度≥300ng/ul、总量≥6ug、OD260/280为1.8~2.2的总RNA样品； 2、样品制备（见图1-1）： a) 类似SAGE技术，通过特异性酶切的方法从每个mRNA的3’末端得到一段21bp 的特异性片段，用来标记该基因，称为TAG； b) 在TAG片段两端连接上用于测序的接头引物； 3、上机测序： a) 通过高通量测序每个样品可以得到至少250万条TAG序列； 4、基本信息分析： a) 对原始数据进行基本处理，得到高质量的TAG序列； b) 通过统计每个TAG序列的数量，得到该TAG标记的基因的表达量； c) 对TAG进行注释，建立TAG和基因的对应关系； d) 基因在正义链和反义链上表达量间的关系； e) 其它统计分析； 5、高级信息分析： a) 基因在样品间差异表达分析； b) 库容量饱和度分析；

c) 其它分析；测序优势利用高通量测序进行表达谱研究的优势很明显，具体如下： 1．数字化信号：直接测定每个基因的特异性表达标签序列，通过计数表达标签序列的数目来确定该基因的表达量，大大提高了定量分析的准确度。整体表达差异分布符合正态分布，不会因为不同批次实验引起不必要的误差。 2．可重复性高：不同批次的表达谱度量准确，能够更准确的进行表达差异分析。 3．高灵敏度：对于表达差异不大的基因能够灵敏的检测其表达差异；能够检测出低丰度的表达基因。 4．全基因组分析，高性价比：由于该技术不用事先设计探针，而是直接测序的方式，因此无需了解物种基因信息，可以直接对任何物种进行包括未知基因在内的全基因组表达谱分析，因此性价比很高。 5．高通量测序：已有数据表明，当测序通量达到200万个表达标签时，即可得到样本中接近全部表达基因的表达量数据，而目前每个样本分析可以得到300 万~600万个表达标签。

鼻咽癌转移到骨常见的治疗方案

鼻咽癌是头颈部常见的一种恶性肿瘤，其好发于40~50岁人群，男性发病率约为女性的2~3倍。我国是鼻咽癌的高发国家，而且由于其早期症状不典型，不少患者发现病情的时候已经出现了转移，如常见的骨转移，一旦出现骨转移，很多患者往往不知道该怎么办，那么鼻咽癌骨转移应该怎么治疗呢？鼻咽癌骨转移在鼻咽癌患者中发生率算是比较大的，而且一般来说它的转移部位多以脊椎骨、盆骨和肋骨为最多见，其次为肩胛骨、肱骨、股骨、颅骨等。大多数病例为全身多发性骨转移，单发性转移较少见。一般来说当鼻咽癌发生骨转移说明病情到晚期了，是很难完全治愈的。主要就是限制、抑制肿瘤的进展、改善生存质量、提高生存时限。鼻咽癌骨转移一般是不建议手术治疗，放化疗和中医药治疗就成为很多患者的选择，可能很多患者在放化疗之后症状会有所缓解，患者生活质量会有所提高，但是放化疗往往“敌我不分”，在杀伤肿瘤细胞的同时对正常细胞也会造成伤害，导致治疗的不能顺利进行，因此在放化疗的时候一定要配合中医药进行治疗，能起到增效减毒的作用，帮助患者更好的治疗疾病。鼻咽癌骨转移中医治疗也是比较常见的，中医治疗具有很强的整体观念，注重的是整体的调理，不仅能控制原发癌肿，还能控制转移病灶，全面抑制癌细胞，控制病情，改善生存质量，延长生存期方面有很明显的效果。使很多被判死刑的患者获得了较长的生存期。临床上，在中医治癌领域，独树一帜的“三联平衡疗法”具有不错的患者口碑，治疗效果不仅得到了患者及家属的认可；更是誉享国际，得到了国内外诸多知名肿瘤专家的称赞。该疗法是由出身于袁氏中医世家，第八代传人，拥有三十余载临床抗癌实战经验的袁希福教授，创立的中医药疗法。该疗法还具有不手术、不放化疗、不住院、无痛苦、无风险、无毒副反应，花费少，在家治疗，饮食起居，家庭护理，功能锻炼均方便，环境熟悉，可以与周围邻居交流走动，心理无压力，若有问题可以直接与医生通电话联系。通过一则真实的案例一起来了解一下杨城子（化名），鼻咽癌低分化鳞癌合并淋巴结及双肺转移，男，57岁，安徽省和县人。2009年10月份出现涕中带血，2010年8月病情加重，10月份在南京军区总医院检查确诊为鼻咽癌，后做化疗6个疗程，做放疗33个疗程，2011年6月在301医院发现肺部转移，经放化疗治疗后于2011年7月18日来诊，郑州希福中医肿瘤医院以“三联平衡疗法”中药治疗，8月3日，头晕、乏力、畏寒等症状减轻，身体一般情况改善;持续服药至今，病人以往症状均明显改善，复查左肺转移灶消退，病人要求继续服药以巩固疗效。鼻咽癌骨转移病情是非常严重的，所以建议治疗鼻咽癌骨转移要到正规的医院进行诊治，针对患者具体的病情，体质来给予有针对性的治疗方案，如是患者体质差的，则最好是选择中医中药来治疗，这样才能更好的抑制病情。

(完整版)小鼠表达谱芯片及服务

小鼠表达谱芯片及服务热点推荐芯片名称：Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K HOT！芯片介绍：安捷伦基于G3平台最新设计的小鼠表达谱芯片。涵盖39,430 条Entrez Gene RNAs 外，及16,251条lincRNA。除了检测蛋白编码RNA表达量变化，还能检测非编码lincRNA 的表达量变化。探针设计参照的数据库为：RefSeq Build 37；Ensembl Release 55；Unigene Build 176；GenBank (April 2009)；RIKEN 3。lincRNA探针是Agilent和John Rinn 实验室（麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所）共同设计的。 Agilent 小鼠表达谱芯片服务芯片名称：Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K NEW！芯片介绍：安捷伦基于G3平台最新设计的小鼠表达谱芯片。涵盖39,430 条Entrez Gene RNAs 外，及16,251条lincRNA。除了检测蛋白编码RNA表达量变化，还能检测非编码lincRNA 的表达量变化。探针设计参照的数据库为：RefSeq Build 37；Ensembl Release 55；Unigene Build 176；GenBank (April 2009)；RIKEN 3。lincRNA探针是Agilent和John Rinn 实验室（麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所）共同设计的。芯片推荐：Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray（4×44K）芯片介绍：Agilent小鼠全基因组表达谱芯片，真正代表小鼠基因组中所有已知基因及其产生的转录本，代表了超过41,174 个小鼠基因和转录本。设计该产品所用的序列信息源于UCSC、NIA、RefSeq、Ensembl、Unigene和RIKEN等数据库，而且绝大多数探针经过Agilent专利的实验验证程序的检验和优化。 Affymetrix 小鼠表达谱芯片服务芯片名称：GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array 详细介绍：涵盖了39,000个转录本，代表34,000个的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq，The sequence clusters 在UniGene database (Build 107, June 2002)创建，并通过了Whitehead Institute for Genome Research (MGSC, April 2002)小鼠基因组进行了分析比较。芯片推荐：Affymetrix GeneChip HT MG-430 PM Array Plate 芯片介绍：该款芯片信息与Affymetrix 小鼠基因组430 2.0芯片相同。涵盖了39,000个转录本，代表34,000个的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq，The sequence clusters 在UniGene database (Build 107, June 2002)创建，并通过了Whitehead Institute for Genome Research (MGSC, April 2002)小鼠基因组进行了分析比较。 Phalanx小鼠表达谱芯片及服务芯片名称：Phalanx MOA V5 Mouse OneArray? 芯片介绍：源自台湾工业研究院专利生产技术，依据美国食品药品管理局（FDA）制定的生物芯片质量评估标准MAQC计划规范，总探针数27,294个，基因探针数26,423个，参考数据库：RefSeq release 42；Ensemble release 59。 Illumina小鼠表达谱芯片服务芯片推荐：Illumina Mouse WG-6 expression beadchips

基因表达谱芯片的数据分析

基因表达谱芯片的数据分析(2012-03-13 15:25:58)转载▼ 标签：杂谈分类：生物信息摘要基因芯片数据分析的目的就是从看似杂乱无序的数据中找出它固有的规律, 本文根据数据分析的目的, 从差异基因表达分析、聚类分析、判别分析以及其它分析等角度对芯片数据分析进行综述, 并对每一种方法的优缺点进行评述, 为正确选用基因芯片数据分析方法提供参考. 关键词: 基因芯片; 数据分析; 差异基因表达; 聚类分析; 判别分析吴斌, 沈自尹. 基因表达谱芯片的数据分析. 世界华人消化杂志2006;14(1):68-74 https://www.360docs.net/doc/d015341030.html,/1009-3079/14/68.asp 0 引言基因芯片数据分析就是对从基因芯片高密度杂交点阵图中提取的杂交点荧光强度信号进行的定量分析, 通过有效数据的筛选和相关基因表达谱的聚类, 最终整合杂交点的生物学信息, 发现基因的表达谱与功能可能存在的联系. 然而每次实验都产生海量数据, 如何解读芯片上成千上万个基因点的杂交信息, 将无机的信息数据与有机的生命活动联系起来, 阐释生命特征和规律以及基因的功能, 是生物信息学研究的重要课题[1]. 基因芯片的数据分析方法从机器学习的角度可分为监督分析和非监督分析, 假如分类还没有形成, 非监督分析和聚类方法是恰当的分析方法; 假如分类已经存在, 则监督分析和判别方法就比非监督分析和聚类方法更有效率。根据研究目的的不同[2,3], 我们对基因芯片数据分析方法分类如下: (1)差异基因表达分析: 基因芯片可用于监测基因在不同组织样品中的表达差异, 例如在正常细胞和肿瘤细胞中; (2)聚类分析: 分析基因或样本之间的相互关系, 使用的统计方法主要是聚类分析; (3)判别分析: 以某些在不同样品中表达差异显著的基因作为模版, 通过判别分析就可建立有效的疾病诊断方法. 1 差异基因表达分析(difference expression, DE) 对于使用参照实验设计进行的重复实验, 可以对2样本的基因表达数据进行差异基因表达分

鼻咽癌护理常规、

鼻咽癌护理常规【定义】鼻咽癌原发于鼻咽粘膜上皮，恶性程度高，易呈浸润性生长及早期转移的特点。鼻咽癌在我国是常见的恶性肿瘤之一，为耳鼻咽喉科最常见的恶性肿瘤。观察要点 1.生命体征及有无头痛、呕吐。 2.皮肤粘膜（有无压疮、皮肤感染、放射野皮肤有无破溃等） 3.观察鼻腔分泌物的量、性质及有无出血情况。 4.化疗期间观察有无药物外渗及静脉血管情况，化疗药物的副作用及血常规。 5.放疗的反应及局部皮肤情况，患者的体重变化及营养状况 6.观察有无并发症（鼻出血、中耳炎、耳鸣、张嘴受限等）【护理措施】 1.做好心理护理，帮助患者树立信心，解除思想顾虑为患者提供安静舒适的环境，保证患者得到足够的休息。 2.加强营养护理，给予高蛋白、高维生素、低脂肪饮食，多吃水果、蔬菜、多喝水，提高放化疗耐受力。评估吞咽功能，确定能否进食，防止误吸、窒息。 3.保持床单位清洁、干燥、平整，保持皮肤清洁干燥，预防压疮。 4.放 5.常规。对白细胞低的患者做好隔离保护措施，每日紫外线消毒。 6.化疗患者注意保护血管，预防化疗药物刺激产生静脉炎，避免药物外渗，严防毒副放映和并发症的发生。 7.病室保持适宜的温湿度，缓解因放疗引起的鼻腔干燥、鼻塞、鼻腔分泌物增多现象，保持口腔清洁，避免口腔感染，保持鼻咽清洁，每日用生理盐水冲洗鼻腔1-2次。 8.如患者有出血，给予半卧位，安静休息，安慰患者，解除紧张情绪。嘱患者勿捏鼻、挖鼻和用力捏鼻涕，少量出血时可鼻部置冰袋止血。 9.保持病房安静整洁，每日开窗通风，每周紫外线空气消毒。【健康教育】 1.心理指导关心体贴患者，多与患者及家属沟通，满足患者的心理 2.饮食指导宜均衡多吃蔬菜、水果，少吃或不吃咸鱼、咸菜、熏肉、腊味等含有亚硝胺的食物，不宜进食辛燥刺激食品，不宜饮酒。 3.药物指导向患者讲解药物的作用及不良反应，告知患者应注意的事项。每日用盐水冲洗鼻腔1~2次。 4.放疗知识指导向患者讲解放疗期间常见的反应，指导患者正如保护放射野皮肤，告知其避免用手搔抓皮肤，避免使用刺激性的肥皂等擦洗皮肤，以免破溃影响治疗。 5.向化疗患者讲解化疗的不良反应及护理措施，消除其恐惧感，指导患者正确面对化疗。 6.活动指导嘱病人防止感冒，适量活动，注意增减衣物，保持室内空气新鲜，提供安静舒适的睡眠环境。 7.出院指导指导患者出院后遵医嘱服药，定期复诊，适当运动，有情况随时来医院就诊。

鼻咽癌复发最佳治疗方案

鼻咽癌是一种发生于鼻咽腔或上咽喉部的癌症，是非常常见的一种癌症，因此在生活中大家也要警惕，减少鼻咽癌的发生。临床上鼻咽癌之所以难治，就在于鼻咽癌的复发性，一旦出现复发，会比上次要难治，对于患者来说，选择一个恰当的治疗方案是比较重要的，下面一起来看一下。鼻咽癌复发临床治疗比原发性鼻咽癌治疗要困难，患者经过一次治疗后体质难免有所下降，因此再考虑复发性鼻咽癌的治疗方法时应慎重考虑。理论上，复发性鼻咽癌的治疗方法临床还是优选手术治疗，但大多数鼻咽癌复发患者同时伴有病灶的转移，手术切除往往不理想，还会再次复发，多是采用放化疗和中医药治疗。鼻咽癌复发的治疗方法中的放化疗是常规治疗手段，放化疗常用于复发性鼻咽癌体质较弱无法耐受二次手术切除的患者，可有效控制局部症状，提高肿瘤局部控制率，但由于放化疗本身具有较强烈的毒副反应，身体素质差的复发性鼻咽癌患者或会产生耐药性或无法耐受而导致病情加重，人体免疫力受到严重创伤，因此临床对于复发性鼻咽癌的放化疗方案应谨慎执行，若患者出现身体上的不适或无法耐受等情况应及时更改放化疗方案或终止放化疗方案，以尽可能避免病情加重，造成过度治疗现象。中医治疗也是鼻咽癌复发常见的治疗方案，中医药治疗不只是局限在缩小肿块、消灭肿瘤细胞本身，更是从调整人体脏腑功能相协调的全身情况来考虑。通过调节人体的阴阳气血和脏腑经络的生理功能，去除了肿瘤发生的土壤环境，从而改善症状，提高生存质量，提高机体免疲功能，达到抑制肿瘤发展、缓解病情、延长生存期的目的。相对于放化疗的毒副作用，中医药治疗鼻咽癌复发比较温和，采用天然的中草药，痛苦小、风险低、无毒副反应，而且可以在家治疗，饮食起居，家庭护理，功能锻炼均方便，环境熟悉，可以与周围邻居交流走动，这种家庭化、人性化的环境有利于康复，患者易于接受。近些年，随着中医药的不断发展，中医药在治疗癌症上也取得了不错的成效，帮助了不少患者减少了痛苦，延长了生命。如临床上，以安全，无毒副作用，费用低，无痛苦，疗效显著受到患者和家属的好评的中医三联平衡疗法。该疗法治疗注重从患者整体入手，采用天然中草药，通过对不同病人，病因病机的辩证治疗，起到“培元固本”“化痰散结”“排毒减毒”的功效，从而减轻病人痛苦，延长病人生命的效果。总之，鼻咽癌复发选择哪种方案，这也需要患者自身情况，选择合适的治疗方案，放化疗虽然是常见的治疗方案，但是副作用较大，使用的时候一定要联合中医药治疗，能起到增效减毒的作用，对于复发的鼻咽癌患者来说，中医药治疗，全面调理，控制病情，改善症状，延长患者的生存期。

鼻咽癌病人的护理

---------------------------------------------------------------最新资料推荐------------------------------------------------------ 鼻咽癌病人的护理眼耳科业务学习讲稿首页科室眼耳鼻喉科题目鼻咽癌病人的护理主讲时间 2019.10. 掌握内容： 1.治疗要点。 2.预防护理。 3 出院指导。签名掌握内容： 1.治疗要点。 2.预防护理。 3 出院指导。签名：一、概念：鼻咽癌是指发生于鼻咽腔顶部和侧壁的恶性肿瘤。是我国高发恶性肿瘤之一，发病率为耳鼻咽喉恶性肿瘤之首。常见临床症状为鼻塞、涕中带血、耳闷堵感、听力下降、复视及头痛等。鼻咽癌大多对放射治疗具有中度敏感性，放射治疗是鼻咽癌的首选治疗方法。但是对较高分化癌，病程较晚以及放疗后复发的病例，手术切除和化学药物治疗亦属于不可缺少的手段。二、病因及发病机制 1、发病原因鼻咽癌的病因不明，推测 1 / 9

遗传因素和生活的传统习惯因素在鼻咽癌发生上可能起着重要作用。遗传因素：根据细胞染色体及人类组织相容性抗原 HLA 等的研究，鼻咽癌的明显民族聚集现象，推想鼻咽癌可能是一种多基因遗传因素有关的疾病。环境因素：环境因素也是诱发鼻咽癌的一种原因，饮食过多的咸鱼，腊味和腌制含亚硝胺类化合物的食品，这些食物有诱发鼻咽癌的作用，饮水中镍，铅含量高，而锌，铜和镉含量相对低，大米中镍含量高，而钼，铬，铅和镉含量低，这些微量元素的改变也可能与鼻咽癌的发生有关，在广东，调查发现鼻咽癌高发区的大米和水中的微量元素镍含量较低发区为高，在鼻咽癌患者的头发中，镍含量亦高，动物实验表明，镍能促进亚硝胺诱发鼻咽癌。 EB 病毒：从鼻咽癌的组织中分离出带 EB 病毒的类淋巴母细胞株，找到了EB 病毒颗粒，鼻咽癌体内存在 EB 病毒高滴度的抗体，病情严重者滴度高，随着病情恢复，抗体滴度下降，说明 EB 病毒与鼻咽癌关系密切。 2、发病机制致瘤因素引起鼻咽腔黏膜细胞的无限增殖，恶性变，并发生远处转移。遗传等因素我们无法控制，这是我们大家都知道的，但是我们可以通过来改变我们的饮食习惯中不合理的部分，也是可以在一定程

寻找差异表达的基因

基因表达谱数据基因表达谱可以用一个矩阵来表示，每一行代表一个基因，每一列代表一个样本（如图1）。所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt ”文件中存储，第一列为基因的entrez geneid ，第2~61列是疾病样本的表达，第62~76列是正常样本的表达。图1 基因表达谱的矩阵表示寻找差异表达的基因：原理介绍：差异表达分析是目前比较常用的识别疾病相关miRNA 以及基因的方法，目前也有很多差异表达分析的方法，但比较简单也比较常用的是Fold change 方法。它的优点是计算简单直观，缺点是没有考虑到差异表达的统计显著性；通常以2倍差异为阈值，判断基因是否差异表达。Fold change 的计算公式如下： normal Disease x x c Fold = _ 即用疾病样本的表达均值除以正常样本的表达均值。差异表达分析的目的：识别两个条件下表达差异显著的基因，即一个基因在两个条件中的表达水平，在排除各种偏差后，其差异具有统计学意义。我们利用一种比较常见的T 检验（T-test ）方法来寻找差异表达的miRNA 。T 检验的主要原理为：对每一个miRNA 计算一个T 统计量来衡量疾病与正常情况下miRNA 表达的差异，然后根据t 分布计算显著性p 值来衡量这种差异的显著性，T 统计量计算公式如下： n s n s x x t normal Disease normal Disease miRNA //22+-= 对于得到的显著性p 值，我们需要进行多重检验校正（FDR ），比较常用的是BH 方法（Benjamini and Hochberg, 1995）。

鼻咽癌放疗患者的护理

鼻咽癌放疗患者的护理发表时间：2012-09-19T11:39:02.250Z 来源：《医药前沿》2012年第7期供稿作者：王敏[导读] 在护理鼻咽癌放疗患者的过程中，应以患者为中心，以人为本，实施的护理到位，可极大地减少放射治疗的并发症王敏 ( 贵州省兴义市人民医院肿瘤科贵州兴义 5 6 2 4 0 0 ) 【中图分类号】R473.73 【文献标识码】B 【文章编号】2095-1752（2012）07-0278-01鼻咽癌是我国常见的恶性肿瘤之一，为耳鼻咽喉科最常见的恶性肿瘤，占头颈部恶性肿瘤的78.08%，占上呼吸道癌肿的92.99%。鼻咽癌原发于鼻咽粘膜上皮，具有原发部位隐蔽，不易被早期发现，病理分化差，恶性程度高，易呈浸润性生长及早期转移的特点。早期发现、早期诊断对本病的治疗具有更为重要的意义。目前，以放射治疗为主的综合治疗方法是鼻咽癌的首选治疗手段（因为鼻咽癌多为低分化鳞癌，对射线敏感，而放疗后5 年生存率较高，因此放射治疗为首选）。但由于放射治疗在有效杀死癌细胞的同时也会损伤周围的正常组织，出现很多并发症。因此，在放射治疗的同时要注重不良反应的治疗及护理，才能使放疗期顺利完成。 1 资料与方法 1.1 临床资料本组患者50 例（2009 年1 月-2011 年12 月收治），其中男性35 例，女性15 例，年龄20-73 岁。症状：鼻塞45 例，头痛41 例，鼻衄29 例，淋巴结肿大40 例。癌症分型：I-II 期10 例，III-IV 期40 例。 1.2 治疗方法 50 例患者均采用调强放疗，其中首次放疗48 例，复发2 例。均分段放疗，第一阶段25 次（周一至周五每天一次，周末休息），第二阶段10 次，总量6000-7000cGy。 2 护理 2.1 放疗前护理 2.1.1 心理护理肿瘤患者大多思想压力重，鼻咽癌系头颈部肿瘤，在放疗过程中面部常会出现色素沉着，皮肤破溃，患者易悲观绝望，护理人员要有高度的同情心和责任感，及时了解患者的心理状态关心和体贴患者，认真细致地做好心理疏导工作，鼓励患者树立生存的信念，在取得患者配合的同时，向其介绍放疗的方法、过程及放疗中可能出现的不良反应，减轻患者紧张和恐惧感。 2.1.2 口腔护理在放疗前仔细检查口腔牙齿，龋齿在放疗前修补，不能修补的牙齿和残根予放疗前10-14 天内拔除，并于晨起和餐前、餐后用生理盐水漱口，用软毛牙刷刷牙。 2.1.3 饮食护理肿瘤为消耗性疾病，患者全身营养较差，应为患者创造良好的饮食环境，指导其进食高热量、高维生素、高蛋白、低盐、易消化的半流质饮食，且少量多餐，禁烟酒，忌辛辣刺激性食物。 2.2 放疗期间护理 2.2.1 基础护理重视晨晚间护理的落实，协助家属做好生活护理，保持病室环境整洁、舒适、安静、地面干燥。 2.2.2 保持鼻腔清洁，减轻鼻咽粘膜反应放疗前30 分钟用生理盐水进行两侧鼻孔轮换清洗，以清除坏死组织及分泌物。 2.2.3 皮肤护理保持照射野皮肤清洁，忌用肥皂、碘酒、酒精、热水及粗毛巾擦洗，禁用手剥去干燥脱落的皮屑，忌在放疗区皮肤上涂含金属额药膏，禁贴含氧化锌的胶布，穿宽松棉质内衣，防止皮肤受摩擦刺激而破溃感染。放疗区皮肤如有痒感，不能搔抓，可用VB12液（生理盐水100m l，地塞米松10m g，庆大霉素8 万u，V B125m g）涂擦，有保湿、止痒、修复受损表皮的作用。 2.2.4 眼部护理指导患者注意眼部卫生，不用手揉搓，如出现痒、痛，可用氯霉素类眼药水或红霉素眼膏点眼，一日多次。 2.2.5 功能锻炼指导患者在放疗期间做张口运动，可防止咀嚼肌及周围组织纤维化，导致张口受限。 2.2.6 预防不良反应放疗前后禁食1h，放疗后静卧30 分钟-60分钟，每日饮水3000-4000m l，促进毒素排泄。密切观察血象变化，定期查血常规，当体温＞ 38℃或WB C ≤ 3.0×109/ L 时暂停放疗，给予升白细胞药物，并限制探视和陪护；当WBC ≤ 1.0×109/L 时，应采取保护性隔离措施，病室用O3 消毒2 次/ 日，1h/ 次。 2.2.7 咽部疼痛的护理疼痛或口腔黏膜反应（放射性口腔炎）重，影响进食，用V B12 液（生理盐水500m l，地塞米松10-20m g，庆大霉素16-24 万u，VB125-10mg，利多卡因100-200mg，根据疼痛及口腔黏膜溃疡情况调整药量）漱口，有止痛、消炎、修复口腔黏膜、促进溃疡愈合的作用。 2.3 放疗后的护理放疗后1 年内继续坚持张口锻炼，进行上下排牙齿的相互咬合撞击，锻炼咀嚼肌及颞颌关节，能有效地防治张口困难。放疗后3 年内不能拔牙，以防放射性颌骨骨髓炎的发生。防止感冒，避免因感冒诱发头颈部急性蜂窝组织炎。间断鼻腔冲洗，防止鼻腔粘连的发生。嘱患者出院后定期来院复诊。 3 小结在护理鼻咽癌放疗患者的过程中，应以患者为中心，以人为本，实施的护理到位，可极大地减少放射治疗的并发症。对于放疗后的并发症，护理人员通过对疾病的认识，与患者建立良好的关系，根据患者的情况实行有效的健康教育，使患者保持良好的心境，有利于治疗的顺利进行，在常规护理的基础上加以护理干预，采取多种方式分阶段性实行个性化护理，可减轻鼻咽癌患者放疗后并发症的临床症状，减轻患者痛苦，提高了患者满意度。

转录组RNAseq术语解释

RNA-Seq名词解释 1.index 测序的标签，用于测定混合样本，通过每个样本添加的不同标签进行数据区分，鉴别测序样品。 2.碱基质量值（Quality Score或Q-score）是碱基识别（Base Calling）出错的概率的整数映射。碱基质量值越高表明碱基识别越可靠，碱基测错的可能性越小。 3.Q30 碱基质量值为Q30代表碱基的精确度在99.9%。 4.FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped）每1百万个map上的reads中map到外显子的每1K个碱基上的fragment个数。计算公式为公式中，cDNA Fragments 表示比对到某一转录本上的片段数目，即双端Reads数目；Mapped Reads(Millions)表示Mapped Reads总数，以10为单位；Transcript Length(kb)：转录本长度，以kb个碱基为单位。 5.FC（Fold Change）即差异表达倍数。 6.FDR（False Discovery Rate）即错误发现率，定义为在多重假设检验过程中，错误拒绝(拒绝真的原(零)假设)的个数占所有被拒绝的原假设个数的比例的期望值。通过控制FDR来决定P值的阈值。 7.P值（P-value）即概率，反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值，一般以P<0.05 为显著，P<0.01为非常显著，其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05或0.01。 8.可变剪接（Alternative splicing）

1表达谱芯片

康成生物全基因组表达谱芯片技术服务康成生物为您提供全基因组表达谱芯片技术服务，您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作, 并提供完整的实验报告。根据您的需要您可选择不同厂家提供的全基因组表达谱芯片，包括Phalanx , Agilent和NimbleGen。 Phala nx 全基因组表达谱芯片华联生物科技开发的标准规格的高密度基因组芯片(Phalanx Whole Genome Microarray)在开发过程中透过台湾工业技术研究院与英国 Sanger Institute等国外权威研究机构合作，从设计到生产再到实验的各个步骤中均执行严格标准，采用创新技术，广泛吸收现有芯片的优点，使得其生产的高密度基因组芯片获得了优异的国际品质。康成生物为您提供华联生物高密度基因组芯片及全程技术服务。 Phalanx Slide TM专利片基处理技术华联生物的高密度基因组芯片，探针设计采用台湾工业技术研究院特有探针设计软件平台( Integrated Massive Probes Optimal Recognition Tool ，IMPORT )。在芯片的制作过程中，华联生物应用表面化学专利技术( PhalanxSlide TM Technology )对片基表面进行处理，使得片基与寡核苷酸探针的亲和活力更高，背景噪音更低，点阵的均一性更强。高速的PhalanxArray探针布放技术华联生物在点样过程中，采用非接触式基因探针布放技术，并以方阵基因探针高速布放技术(PhalanxArray Technology)之优势，大量生产。PhalanxArray 同时使用196个排列整齐的PhalanxJets，在一张芯片上布放39，200个均一的探针。PhalanxArray能够布放多达1，000，000张高密度芯片，布放效率和产量是目前市场上一般芯片布放系统的100倍。先进的PhalanxJet TM专利点样技术华联生物开发出独特的PhalanxJet TM系统，结合其先进的非接触式基因探针布放技术和专利的片基处理技术，保证了探针布放的高重复性。尤其重要的是，PhalanxJet TM系统可以最大限度的避免探针布放中可能的探针交叉污染。每个单独的PhalanxJet TM包含200个独立的点样针，分别对应不同的探针，在布放时彼此独立，不会相互干扰。严谨的检测探针和控制探针设计华联生物的的高密度基因组芯片，寡核苷酸探针均经过严格筛选，能特异性检测数据库中的基因，灵敏度高，特异性强。人类基因组表达谱芯片，探针信息主要基于数据库UniGene V.175版，同时整合了各大重要数据库信息。小鼠基因组表达谱芯片，探针信息基于数据库MEEBO (Mouse Exonic Evidence Based Oligonucleotide) 。华联生物的高密度基因组芯片，实验控制探针设计严谨，包括GAM，OGAM，CGAMs，IHCs，ITQC，ETQC等等，并且还采用了多家公司已经设计好的芯片检测探针，如SpotReport Oligo Array 验证系统，Stratagene 的Alien Oligo Array 验证系统，以及Ambion 公司的ArrayControl Sense Oligo Spots系统等等，从而全面检测样品质量，杂交反应效果，标记反应效果等。使得芯片质量与实验效果得到双重保障。生物芯片质量评估标准MAQC规范依据美国食品药物管理局(FDA)与国际上主要生物芯片企业协商制定的生物芯片质量评估标准MAQC计划规范，华联全基因组表达谱芯片各项指标，

转录组测序

真核mRNA测序是基于HiSeq平台，对真核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA进行测序，既可研究已知基因，亦能发掘新基因，全面快速地获得mRNA序列和丰度信息。真核mRNA测序方法可以分为：有参考转录组、无参考转录组以及数字基因表达谱（DGE）三大类。技术参数案例解析［案例一］ mRNA和small RNA转录组揭示新合成异源六倍体小麦杂种优势的动态部分同源调控诺禾致源携手中国农业科学院作物科学研究所，利用转录组测序技术，对杂交亲本、新合成异源六倍体小麦的幼苗、穗和种子进行了mRNA和smallRNA测序及信息分析，发现新合成异源六倍体小麦绝大部分基因表现为12类基因表达模式，包括加性表达，少部分的基因表现为非加性，基因的非加性表现出非常强的发育时期特异性，与生长势密切相关；miRNA的丰度随着倍性的增加逐渐下降，新合成异源六倍体小麦中非加性表达的 miRNA也同样表现出亲本显性表达，miRNA的表达敏感性与生长势和适应性密切相关。该研究揭示了不同倍性非对等杂种优势的分子基础。［案例二］磷酸三（2,3-二氯丙基）酯（TDCPP）对四膜虫生长繁殖的抑制作用与核糖体相关诺禾携手华中农业大学,利用转录组测序和信息分析技术,研究了TDCPP处理组和对照组差异基因表达,并对差异表达基因进行KEGG通路分析,发现核糖体基因通路显著富集, 同时伴随胞浆和粗面内质网上核糖体数量减少体积增大。这些探索表明四膜虫可以作为TDCPP反应的生物指标，为后续研究TDCPP作用其他生物的毒理机制提供了新视角。［案例三］转录组揭示寄主植物与宿主之间进行RNA交换的机制参考文献菟丝子被称作勒死草，会用被称作吸根的专用器官穿透宿主组织与其建立联系，可以吸取宿主的水份与营养物质，也能吸取RNA(mRNA)分子。本研究分别选取菟丝子和拟南芥及番茄的共生体茎上的三段组织进行转录组学的研究，发现寄生植物与寄主之间mRNA的转移量很大且是一种双向转移的模式；两种宿主相比，更多的拟南芥RNA被转移到菟丝子植物之中，而且菟丝子与拟南芥之间较自由的交换，可表明调节菟丝子吸根选择性的机制可能是宿主特异性的，从而揭示了寄主与宿主之间进行RNA转移的遗传机制。 [1] Li A, Liu D, Wu J, et al . mRNA and small RNA transcriptomes reveal insights into dynamic homoeolog regulation of allopolyploid heterosis in nascent hexaploid wheat [J]. The Plant Cell, 2014: tpc. 114.124388.[2] Jing Li, John P , Giesy, Liqin Yu, et al . Effects of Tris (1,3-dichloro-2-propyl) Phosphate (TDCPP) in Tetrahymena Thermophila: Targeting the Ribosome. Scientific Reports. 2015, 5:10562. [3] Kim G, LeBlanc M L, et al . Genomic-scale exchange of mRNA between a parasitic plant and its hosts [J]. Science, 2014, 345(6198): 808-811. 图1 非加性表达miRNA与亲本显性表达miRNA的等级聚类分析和两者的关联图2 显著富集的KEGG通路图3 菟丝子与拟南芥、番茄转移RNA和非转移RNA的表达和富集分析样品要求文库类型测序策略数据量类型分析内容项目周期真核有参转录组测序真核无参转录组测序 6 Gb、8 Gb、10 Gb、12 Gb clean data 6 M clean reads 3 Gb clean data 项目数据至少12 Gb clean data 数字基因表达谱（DGE） HiSeq PE150 HiSeq PE150 HiSeq SE50HiSeq PE125普通转录组文库；链特异性转录组文库 40天50天30天 35天（有参）45天（无参） RNA样品总量≥1.5 μg； RNA样品浓度≥50 ng/μL 参考基因组比对新转录本预测可变剪切分析SNP/InDel分析基因表达水平分析RNA-seq整体质量评估转录因子注释GO/KEGG富集分析蛋白互作网络分析基因共表达网络构建可视化结果展示参考转录组拼接转录本/Unigene长度统计基因功能注释NR，NT，Swiss Prot GO，KEGG，KOG Protein Family CDS预测分析SNP/SSR分析

早期鼻咽癌的治疗方法

早期鼻咽癌的治疗方法鼻咽癌的治疗方法的选择是根据鼻咽癌本身的生物学行为来决定的，鼻咽癌一旦得了以后生长比较迅速，因为鼻咽癌常常都是低分化或者分化差的癌，这类肿瘤第一生长快，第二细胞的恶性程度高，而对射线比较敏感。目前对于鼻咽癌的治疗手段首选是放射治疗，早期的鼻咽癌单纯放射治疗的五年生存率可以达到80%。随着一些新的技术手段的应用，对于中晚期的鼻咽癌，用适形调强的放疗，这是放射治疗一个新的技术，还有做同步放化疗，在放疗的同时应用化疗使放射的敏感性提高，这样使得一些中晚期的鼻咽癌患者也得到有效的根治。鼻咽癌治疗之后的五年生存率在十年前大概是在56%左右，现在经过新的技术的引进还有一些新的药物的使用，鼻咽癌的疗效五年生存率达到70%以上。哪些鼻咽癌患者适合进行手术？鼻咽癌经过放疗可以使患者长期生存，早期可以达到根治的效果，但是它跟全身任何肿瘤一样有局部复发的可能。临床上叫鼻咽癌放疗失败后再处理，在以前没有更好的手术技巧和手术手段选择的情况下，都是采用继续做放疗，一程放疗之后肿瘤复发再继续做二程、三程的放化疗。射线累计对于人体的影响是不可修复的，所以放射的治疗剂量也是有限的，而且超剂量的放疗，放射对人引起的损害甚至可以致人死亡。我们国家早在上世纪60年代初外科进行过一些干预，放疗失败以后或者放疗以后复发的病人在没有办法的情况下，经过选择做了一部分外科手术发现治疗效果很好，以后随着科学技术的发展，比如抗生素的应用、先进医疗器械的采用、手术方法的改进，这样我们扩大了手术适应症的范围，经过选择以后有相当一批放疗以后复发的病人经过手术治疗达到根治的效果。鼻咽部属于人的面部中间，手术会不会留下疤痕？鼻咽癌手术会不会对人的容貌产生大的影响？通过目前手术方式的改进，鼻咽癌治疗有不同的手术方式，对于早期的病变可以采取比较小的手术，甚至可以只在口腔里面做。这样的话，病人手术以后对他没有任何影响。还有一些鼻咽内窥镜的应用，使得比较早期比较局限的鼻咽癌不用开刀只在内窥镜里面切掉或者用

基因表达谱芯片数据分析及其Bioconductor实现

基因表达谱芯片数据分析及其Bioconductor实现 1.表达谱芯片及其应用表达谱DNA芯片（DNA microarrays for gene expression profiles）是指将大量DNA片段或寡核昔酸固定在玻璃、硅、塑料等硬质载体上制备成基因芯片，待测样品中的mRNA被提取后，通过逆转录获得cDNA,并在此过程中标记荧光，然后与包含上千个基因的DNA芯片进行杂交反应30min~20h后，将芯片上未发生结合反应的片段洗去，再对玻片进行激光共聚焦扫描，测定芯片上个点的荧光强度，从而推算出待测样品中各种基因的表达水平。用于硏究基因表达的芯片可以有两种：①cDNA芯片；② 寡核昔酸芯片。 cDNA芯片技术及载有较长片段的寡核昔酸芯片采用双色荧光系统：U前常用Cy3—dUTP （绿色）标记对照组mRNA, Cy5—dUTP （红色）标记样品组mRNAUl。用不同波长的荧光扫描芯片，将扫描所得每一点荧光信号值自动输入计?算机并进行信息处理，给出每个点在不同波长下的荧光强度值及其比值（ratio值），同时计算机还给出直观的显色图。在样品中呈高表达的基因其杂交点呈红色，相反，在对照组中高表达的基因其杂交点呈绿色，在两组中表达水平相当的显黄色，这些信号就代表了样品中基因的转录表达情况⑵。基因芯片因具有高效率，高通量、高精度以及能平行对照研究等特点，被迅速应用于动、植物和人类基因的研究领域，如病原微生物毒力相关基因的。基因表达谱可直接检测mRNA的种类及丰度，可以同时分析上万个基因的表达变化，来揭示基因之间表达变化的相互关系。表达谱芯片可用于研究：①同一个体在同一时间里，不同基因的表达差异。芯片上固定的已知序列的cDNA或寡聚核昔酸最多可以达到30 000多个序列，与人类全基因组基因数相当，所以基因芯片一次反应儿乎就能够分析整个人的基因⑶。②同一个体在不同时间里，相同基因的表达差异。 ③不同个体的相同基因表达上的差异。利用基因芯片可以分析多个样本，同时筛选不同样本（如肿瘤组织、癌前病变和正常组织）之间差异表达的基因，这样可以避免了芯片间的变异造成的误差⑷。张辛燕⑸ 等将512个人癌基因和抑癌基因的cDNA用点样仪点在特制玻片上制成表达谱芯片，对正常人卵巢组织及卵巢癌组织基因表达的差异性进行比较研究，结果发现在卵巢癌组织中下调的基因有23个，上调的基因有15个，初步筛选出了卵巢癌相关基因。Lowe⑹等利用胰腺癌、问充质细胞癌等组织的cDNA制备基因芯片，筛选到胰腺癌细胞中高表达的基因，为医疗诊断、病理研究及新药设计奠定基础。 2.表达谱芯片的数据处理技术