彩色马铃薯二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因的克隆及生物信息学分析
三角梅二氢黄酮醇-4-还原酶基因的克隆及表达特异性分析

三角梅二氢黄酮醇-4-还原酶基因的克隆及表达特异性分析孙蓉;刘桃;潘凯越;刘姗;刁毅;曾道萍【期刊名称】《福建农业学报》【年(卷),期】2024(39)1【摘要】【目的】克隆分析三角梅(Bougainvillea spectabilis)二氢黄酮醇-4-还原酶(Dihydroflavonol-4-reductase,DFR)基因(BsDFR),探讨其在三角梅苞片呈色中的作用。
【方法】基于三角梅转录组数据,利用PCR技术克隆BsDFR基因,并通过生物信息学工具分析其分子特性;通过分子对接技术预测BsDFR底物特异性;采用实时荧光定量PCR分析该基因在不同颜色三角梅中的表达量差异。
【结果】三角梅BsDFR基因(GenBank ID:ON417750)编码区全长987 bp,编码328个氨基酸。
BsDFR理论相对分子质量为36.48 kDa,等电点pI为6.33;具有DFR特有的NADPH及底物特异结合位点,属于Asn型DFR;不具有跨膜结构及信号肽,定位于细胞质中;二级结构中α螺旋占比最多,三级结构预测显示为二聚体蛋白。
底物对接模拟预测BsDFR对二氢山柰酚(Dihydrokaempferol,DHK)、二氢槲皮素(Dihydroquercetin, DHQ)和二氢杨梅素(Dihydromyricetin, DHM)3种底物均具有催化活性,与结构分析相吻合。
进化树分析其与石竹目(Centrospermae)植物聚为一类。
qRT-PCR分析发现其在橙色系三角梅中含量较高,进一步推测其主要底物为DHK,催化生成橙色系花青素(天竺葵素)的前体物质——无色天竺葵素苷元。
【结论】BsDFR基因是一个典型的植物二氢黄酮醇-4-还原酶基因,主要与橙色系三角梅苞片色素合成有关。
【总页数】7页(P33-39)【作者】孙蓉;刘桃;潘凯越;刘姗;刁毅;曾道萍【作者单位】攀枝花学院生物与化学工程学院【正文语种】中文【中图分类】Q781;Q786【相关文献】1.杨树二氢黄酮醇-4-还原酶基因(DFR)的克隆及反义表达对儿茶素合成的影响2.鹤望兰二氢黄酮醇-4-还原酶基因SrDFR的克隆及表达分析3.葡萄风信子二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)的克隆与表达分析4.茶树二氢黄酮醇4-还原酶基因的克隆、表达及功能分析5.凤丹牡丹二氢黄酮醇-4-还原酶基因克隆及表达特性分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
花生二氢黄酮醇还原酶基因(DFR)的克隆及表达分析

花生二氢黄酮醇还原酶基因(DFR)的克隆及表达分析郭凤丹;夏晗;袁美;王兴军【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2011(19)5【摘要】二氢黄酮醇还原酶(dihydroflavonol 4-reductase,DFR)是植物花青素合成过程中的关键酶,催化二氢黄酮醇生成无色花青素.本研究利用花生(Arachis hypogaea L.)未成熟种子cDNA文库,通过大规模EST测序,从花生中克隆了DFR 基因的全长cDNA序列.序列分析表明,花生DFR蛋白氨基酸序列与其他植物来源的DFR有很高的同源性.利用花生cDNA芯片和半定量RT-PCR方法对花生DFR 基因表达模式的研究发现,DFR基因在果针中表达水平最高,其次是花,在根和叶中有微量表达;不同种皮颜色花生品种的种子中表达差异明显,随种皮颜色的加深,DFR 基因表达增强,在中花9号黑色种子中表达量最高.对茎叶紫色花生种质材料的研究表明,在紫色组织中DFR基因表达较强.结果表明DFR表达量与花青素积累量呈正相关,说明DFR催化反应是花青素合成途径的关键步骤.%Dihydroflavonol 4-reductase (DFR) is a key enzyme converting dihydroflavonols to leucoanthocyanidins in the biosynthesis of anthocyanins. EST sequencing was carried out using a cDNA library of peanut(A rachls hypogaea L.) immature seed and full length cDNA of peanut DFR was cloned. Sequence alignment showed that DFR was highly conserved among different plant species. Peanut cDNA microarray and semi-quantitative RT-PCR were used to analysis the expression of DFR in different tissues. Results indicated that the expression level was highest in gynophores and followed by flowers,while the expression in roots and leavies was low. DFR gene expression was also analysed in seeds from different cultivars, which suggested that it expressed higher in cultivars with dark-color seed coat, the expression was the highest in ZH9 seeds with black seed coat. We also analysed the expression level of DFR in a peanut mutation with purple leaves and stems, which demonstrated that DFR was highly expressed in the purple tissues. These results demonstrate that the expression level of DFR gene is positively correlation to the accumulation of anthocyanins, which indicates that DFR catalytic reaction is the key step in the biosynthesis of anthocyanins.【总页数】7页(P816-822)【作者】郭凤丹;夏晗;袁美;王兴军【作者单位】山东师范大学生命科学院,济南,250014;山东省农业科学院高新技术研究中心,济南,250100;山东省农业科学院高新技术研究中心,济南,250100;山东省花生研究所,青岛,266100;山东师范大学生命科学院,济南,250014;山东省农业科学院高新技术研究中心,济南,250100【正文语种】中文【相关文献】1.杨树二氢黄酮醇-4-还原酶基因(DFR)的克隆及反义表达对儿茶素合成的影响 [J], 左涛;赵树堂;卢孟柱;孙爱东;王延伟;贺伟2.苦荞和甜荞二氢黄酮醇4-还原酶基因(dfr)的克隆及序列分析 [J], 祝婷;李成磊;吴琦;蒙华;陈惠;邵继荣3.红花石榴二氢黄酮醇还原酶(DFR)基因cDNA片段克隆及序列分析 [J], 招雪晴;苑兆和;陶吉寒;尹艳雷;冯立娟4.葡萄风信子二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)的克隆与表达分析 [J], 焦淑珍;刘雅莉;娄倩;姜玲5.彩色马铃薯二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因的克隆及生物信息学分析 [J], 肖继坪;王琼;郭华春因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
二氢黄酮醇4-还原酶基因

学生:焦淑珍 导师:刘雅莉 2012--12--29
1 二氢黄酮醇4-还原酶基因的结构和作用机制
二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol 4-reductase,DFR)属 于NADPH 依赖性短链还原酶家族,为单基因编码。最近鉴定了葡萄 (Vitis vinifera)DFR 的晶体结构,发现其是由3 个亚基组成的复合物, 具有专门的NADPH 结合域。DFR 是花青素生物合成途径的关键酶, 分别 催化二氢堪非醇(dihydrokaempferol,DHK)、二氢栎皮黄酮 (dihydroquercetin,DHQ) 和二氢杨梅黄酮(dihydromyricetin,DHM) 生成无色花葵素(leucopelargonidin)、无色花青素(leucocyanidin) 和无色翠雀素(leucodelphinidin),然后这些无色花青素在花色素苷合 成酶(anthocyanin synthase,ANS)和类黄酮3-O-糖基转移酶 (flavonoid 3-Oglucosyltransferase,3GT)的作用下合成各种花青素。 由于DFR 对底物的特异性和表达水平的不同,使植物呈现出各异的花色和 果色
葡萄 DFR 基因的启动子含有 G-box 类元件 bZIP 和 Myb 类转录 因子的结合位点,同时葡萄的启动子和 uidA -葡糖苷酶融合构成融合 体,共同调节 DFR 基因的表达 3 种调控因子共同作用使葡萄 DFR 基 因在根,茎和叶等几乎所用组织中都有表达。
将葡萄 DFR 基因的启动子与 GUS 基因融合后转化红色苹果细 胞悬浮体系,能够检测到 GUS 和 uidA 基因的表达,同时 DFR 基 因的表达量增加。
2 DFR基因的分离
DFR属于NADPH依赖性的短链DFR还原酶超家族 ,最早于1985年由O Reilly等从玉米(Zeamays)和金鱼草(Antirrhinum m “s)中分离出 来 。随后,Beld等 在1989年又以部分金鱼草DFR表型突变基因为探 针分离了矮牵牛(Petunia hybrida)DFR基因。至今,通过同源克隆等 方法,已经在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、兰花(Bromheadia finlay—soniana)、山茶(Camellia sinensis)、番茄 (Lycopersiconesculentum)和水稻(Oryza sativa)等植物中分离了 DFR基因。2003年Nakatsuka等分析了亚洲百合品种DFR基因的时空表 达模式,表明DFR基因仅在花色素苷着色器官中表达,并且控制花器 官的显色模式。
马铃薯花色苷及其生物合成的主要关键酶基因的克隆与表达分析

马铃薯花色苷及其生物合成的主要关键酶基因的克隆与表达分析马铃薯(Solanum tuberosum)是仅次于小麦、玉米和水稻的第四大粮食作物。
其块茎是繁殖器官,也是产品器官。
块茎有不同颜色,如白色、红色和紫色。
花色苷是有色块茎颜色的决定因子,作为天然色素,花色苷可应用于食品、医药和化妆品等行业。
同时,它被证明具有抗癌、抗氧化和预防心血管疾病的作用。
因此,近年来有关花色苷的生化与分子生物学研究,引起了全世界科学家的广泛关注和浓厚兴趣。
花色苷的生物合成途径是被最为广泛而深入研究的植物次生代谢途径,特别在主要模式植物中,已经有了清楚的认识。
一些花色苷生物合成途径中的关键酶基因,已经从马铃薯栽培种(S.tuberosum L.)中克隆到,如CHS基因、F3H 基因、DFR基因和F3’5’H基因,而在马铃薯野生种(S.pinnatisectum)中,还未见到花色苷生物合成酶基因克隆及其表达研究的报道。
本研究以野生种为材料,克隆了CHS、F3H、DFR和3GT四个基因,分析了这四个基因的表达情况,通过转基因对3GT基因进行了功能验证;以马铃薯栽培种(S.tuberosum cv.Chieftain)为材料,研究了CHS、F3H、F3’5’H、DFR 和3GT五个基因的组织表达和诱导表达。
研究的主要结果如下:1.马铃薯花色苷的种类、含量和稳定性及影响其生物合成的因素用1%(v/v)盐酸甲醇溶液分别从红色和紫色马铃薯中提取色素,用正已烷除杂,再经薄层层析(TLC)纯化后,在紫外-可见分光光度计下扫描。
根据提取液特性、Rf值和紫外-可见光谱特点,参考已有相关资料,初步判断马铃薯紫色色素主要为锦葵素的衍生物,而红色色素主要为天竺葵素衍生物。
紫色马铃薯的花色苷含量是红色马铃薯花色苷含量的2.9倍。
光、热和pH值对花色苷的稳定性有显著影响,但紫色马铃薯花色苷的稳定性好于红色马铃薯花色苷。
愈伤组织来源于马铃薯品种Chieftain,在红色愈伤组织中,低浓度的2,4-D有利于花色苷的积累,高浓度的2,4-D促进愈伤组织的生长而不利于花色苷的积累;高浓度的6-BA能促进红色愈伤组织中花色苷的积累和诱导白色愈伤组织合成花色苷,但抑制生长;卡那霉素能使白色愈伤组织变红并积累花色苷,随着卡那霉素浓度的提高,愈伤组织生长受到严重抑制并最终变褐死亡;提高蔗糖浓度能促进马铃薯愈伤组织花色苷的产生和积累而抑制生长。
观赏植物DFR基因的研究进展

观赏植物DFR基因的研究进展作者:符红艳于晓英廖祯妮来源:《天津农业科学》2012年第06期摘要:从二氢黄酮醇4-还原酶基因结构、基因的进化、基因的表达特性及其在基因工程方面的研究进展进行了概述和总结。
关键词:DFR;基因结构;表达特性;基因进化;基因工程中图分类号:S188 文献标识码:A DOI编码:10.3969/j.issn.1006-6500.2012.06.0041 DFR基因在观赏植物的呈色及花色素苷合成途径中的作用色彩是观赏植物表现出来的一个重要特性,花、叶、果实等这些观赏器官的颜色都决定着观赏植物的观赏价值和商业价值。
在高等植物中,花色和果色主要由类黄酮、类胡萝卜素和甜菜色素三大色素所决定[1]。
而类黄酮中的花色素苷则是影响花色的主要色素,赋予花和果实除绿色之外的其他颜色,如红色、粉红色、紫罗兰色和蓝色等,特定条件下还出现黑色[2]。
二氢黄酮醇4-还原酶(Dihydroflavonol 4-Reductase,DFR)在不同花色形成过程中发挥了关键作用,它是把二氢黄酮醇转变为花色素反应的第一个酶[3]。
类黄酮类色素的生物合成已经较为清楚[3-4](图1)。
由苯丙氨酸到花青素的合成可以分为3个阶段:第一阶段由苯丙氨酸到香豆酰CoA,这是许多次生代谢都共有的;第二阶段是由香豆酰CoA到二氢黄酮醇,这是类黄酮代谢的关键反应,它合成花青素和其它黄酮物质;第三阶段是各种花色素苷的合成。
在花色素苷合成的途径中,DFR对花色素苷的最终形成起决定性作用。
DFR是花色素苷生物合成中的关键性最初是在紫罗兰的一个突变体中发现的[5]。
其反应需要NADPH参与。
DFR依赖DHK、DHQ和DHM 3种底物,它们在结构上非常相似,只在B苯环上的轻基数目上不同。
DFR能利用这3种底物,是因为F3′H和F3′5′H两种轻化酶的活性。
F3′H能使DHK 转化成DHQ。
F3′5′H则可以让DHK转化为DHM,还可以使DHQ转化为DHM[6]。
二氢黄酮醇-4-还原酶(DFR)基因在烟草中的过量表达

课 题 投入 了极 大 的关注 。 花 色素 主要 由 3 不 而 种
烟草 ( i tn bcm) 科 (oaaee Nc i at au 为茄 oa a Sl ca) n 烟 草属 ( ioaac ) 草本 植 物 , 我 国南 Nct nco 1 i a生 在 北 均 有 种植 , 我 国一 种 重要 的经 济 作 物 , 是 也 是 我 国 国民经济 收入 的一个 重要 支撑 。 研究 采 本 用 植 物转基 因技 术 , 将从 野生 型 烟草 中分 离和 克 隆得到 的  ̄Or, flm 基因, 通过根癌农 杆菌方 法 转入到 栽培 品种 烟草 中 , 到 阳性抗性 植株后 , 得 收获种 子并 进行 播种 , 后对 得 到 的转 基 因烟 草 最 植 株 中二 氢 黄 酮醇 一 一还 原 酶 ( F 进 行分 析 4 D R)
i t e . i hwe ei o da c r a c i eo e - x r s in i a s e i n s s x e td no rd wh c r g o c o d n n ew t t v r e p e s t n g ncl e e p ce . hh o nr i a we
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在影 响植 物 花色 的各 种 因素 中 , 色素具 有 花 非常 重要 的作 用 。近 年来 , 界各 国的学 者对 花 世
二氢 黄酮 醇一 一 4 还原酶 ( F 基 因在烟草 中的过量表达 D R)
植物二氢黄酮醇—4—还原酶基因的研究进展

植物二氢黄酮醇—4—还原酶基因的研究进展作者:焦淑珍张正言王林徐盼李琴琴贾秋娥来源:《南方农业·下旬》2016年第07期摘要二氢黄酮醇-4-还原酶(DFR)是花青素生物合成途径中的关键酶,在花色的修饰中起重要作用,目前,已从多种植物中分离得到。
从DFR基因的结构和作用机制、底物特异性、时空表达模式及花色修饰等方面进行了概括和总结,为DFR基因的进一步研究和利用提供理论依据。
关键词二氢黄酮醇-4-还原酶;花青素;基因工程;调控机制中图分类号:Q943.2 文献标志码:B DOI:10.19415/ki.1673-890x.2016.21.110花色是评定观赏植物品质最重要的因素之一,对于花卉商品性和价值性起着决定性的作用。
花色主要由类黄酮,类胡萝卜素,甜菜色素三种类型的色素组成[1,2]。
类黄酮中的花青素是影响花色的主要色素,赋予花和果实从橘色到蓝色的所有颜色,如红色、粉色、蓝色和紫罗兰色等[3-5]。
二氢黄酮醇4-还原酶(Dihydroflavonol 4-Reductase,DFR)是花青素代谢生化合成中的关键酶,是决定植物花色和果色从无色到有色的重要控制点,决定植物的花、果实、叶片等器官的着色[6]。
因此,研究DFR基因的作用机理对于花色形成分子机制有重大意义。
1 DFR基因的结构和作用机制二氢黄酮醇4–还原酶(DFR)是花色素苷生物合成途径中的关键节点基因,属于NADPH 依赖性短链还原酶家族或者是DFR亚家族,是单基因编码。
这个亚家族的成员由肉桂酸、氧化还原酶为代表。
它们都含有一个高度保守的NADPH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸盐)结合位点“VTGASGFVGSWLVMRLLEHGY”和一个由“TVNVEEKQKPVYDETCWSDVDFCRRV”组成的底物特异性结合区。
此区域中第134位氨基酸和第145位的氨基酸会直接决定底物的特异性,并且在不同植物中相对保守[7]。
DFR用NADPH作为辅因子催化二氢黄酮醇减少,从而生成相应的白花色素,这些无色花色素是花青素和原花青素的前体物。
管花肉苁蓉花中二氢黄酮醇4-还原酶的克隆、表达分析和酶活性鉴定

管花肉苁蓉花中二氢黄酮醇4-还原酶的克隆、表达分析和酶活性鉴定管花肉苁蓉(Impatiens balsamina L.)是一种常见的观赏植物,具有丰富的药用价值。
研究发现,管花肉苁蓉中的二氢黄酮醇4(dihydrokaempferol, DHK)具有多种生物活性,如抗炎、抗氧化和抗癌等,因此吸引了广泛的关注。
然而,关于管花肉苁蓉中DHK的代谢途径和生物合成机制的了解仍然有限。
为了探究DHK的代谢途径以及生物合成过程中的关键酶,本研究对管花肉苁蓉中二氢黄酮醇4-还原酶(dihydrokaempferol reductase, DHKRR)进行了克隆、表达分析和酶活性鉴定。
首先,我们从植物组织中提取了总RNA,并进行了cDNA合成。
根据已知的其他植物物种的DHKRR的序列信息,设计了一对管花肉苁蓉DHKRR基因特异性引物。
通过RT-PCR方法,成功克隆了管花肉苁蓉DHKRR的全长cDNA序列。
随后,我们将管花肉苁蓉DHKRR的cDNA序列亚克隆到表达载体中,构建了原核表达系统。
经过大肠杆菌的转化、诱导表达和蛋白纯化等步骤,获得了管花肉苁蓉DHKRR的重组蛋白。
为了进一步确定管花肉苁蓉DHKRR的酶活性,我们使用管花肉苁蓉中富含DHK的提取物作为底物,通过测定底物的消耗速率来评价管花肉苁蓉DHKRR的催化活性。
实验结果显示,管花肉苁蓉DHKRR对DHK具有高度的选择性,并呈现出明显的酶活性。
此外,我们还对管花肉苁蓉DHKRR的酶动力学性质进行了研究,发现该酶对底物的亲和力较强,催化效率较高。
总结起来,我们通过克隆、表达分析和酶活性鉴定的研究揭示了管花肉苁蓉中DHK的还原酶的分子特性。
这一研究为进一步解析管花肉苁蓉中DHK的代谢途径和生物合成机制提供了重要的基础。
此外,管花肉苁蓉中DHKRR的酶活性也为其在药物开发和生物工程应用中的潜在价值提供了理论依据。
相信以后会有更多的研究关注于管花肉苁蓉中DHKRR的功能及其在植物生理、药物及农业上的应用前景通过本研究,我们成功克隆了管花肉苁蓉DHKRR的全长cDNA序列,并构建了原核表达系统获得了重组蛋白。
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彩色马铃薯二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因的克隆及生物信息学分析肖继坪王琼郭华春云南农业大学薯类作物研究所,昆明,650201花色素苷是影响花色的主要色素,二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因是花色素苷合成的关键酶基因。
本研究以云南地方彩色马铃薯品种‘剑川红’和‘转心乌’,外引品种‘黑美人’为实验材料,通过RT-PCR方法从其块茎表皮中克隆到DFR基因的完整cDNA序列,并进行了生物信息学分析。
分析结果显示供试的三个彩色马铃薯的DFR基因编码381个氨基酸,具有完整的开放式阅读框(ORF),DFR与NADPH的结合位点、底物特异性选择结合位点高度保守。
同源比对表明,三个彩色马铃薯品种的核苷酸相似性为99.24%,氨基酸同源性为98.78%,与茄科的烟草、矮牵牛等的同源性均在86%以上。
三个彩色马铃薯品种DFR都不具有信号肽,无明显跨膜区域,可能为亲水蛋白,定位于细胞质的可能性最高。
α-螺旋和无规则卷曲是DFR的主要二级结构元件,DFR属于NADB-Rossmann superfamily。
彩色马铃薯;二氢黄酮醇4-还原酶(DFR);cDNA克隆;序列分析Cloning and Bioinformatical Analysis of Dihydroflavonol 4-reductase Gene from Pigmented PotatoXiao JipingWang QiongGuo Huachun 10.3969/mpb.009.000728本研究由国家现代农业产业技术体系(CARS-10)和云南省科技攻关项目(2009BB010)共同资助提取质彩色马铃分子植物育种彩色马铃j分子植物育种@@1.Brown C.R., 2005, Antioxidants in potato, American Journal of Potato Research, 82(2): 163-172@@2.Bongue-Bartelsman M., O'Neill S.D., Tong Y., and Yoder J.I., 1994, Characterization of the gene encoding dihydroflavonol 4-reductase in tomato, Gene, 138:153-157@@3.Chen D.Z., Zhou J.Y., and Li P., 2010, Bioinformatics analysis of dihydroflavonol 4-reductase, Shengwu Jishu Tongbao (Biotechnology Bulletin), 12:206-212(陈大志,周嘉裕,李萍,2010,二氢黄酮醇4-还原酶的生物信息学分析,生物技术通报,12: 206-212)@@4.De Jong W.S., De Jong D.M., De Jong H., Kalazich J., and Bodis M., 2003, An allele of dihydroflavonol 4-reductase associated with the ability to produce red anthocyanin pigments in potato (Solanum tuberosum L.), Theor. Appl. 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