中药色谱指纹图谱相似度评价系统
中药色谱指纹图谱相似度评价系统操作规范
2数据库功能：
数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功能（图11），便于用户信息管理。
图9
图10
图11
3谱图处理：
（1）数据剪切
采用数据剪切功能用户可以选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配（图12）。
图12
（2）色谱峰匹配
色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：
图28多点校正设定
图29多点校正后自动匹配结果
5对照图谱生成
图30
图31
图32
图33
图34
附常用色谱工作站格式文件的导出：
色谱工作站
1.打开色谱工作站；
2.进入数据处理（>>）；
3.调入要输出的色谱文件（>> …）；
4.进入数据输出窗口（>> >> …），进入方式如下图所示：
在弹出窗口中指定导出路径及文件名，确定。可导出格式文件。
用户通过“打印报告”功能将分析结果打印出来。打印报告中包括报表信息输入（图19）和分析报告两部分（图20和21）。其中分析报告包括原始指纹图谱，匹配后图谱和相似度评价结果。
图19
图20
图21
5帮助
为方便用户使用，本系统提供简洁完整的联机帮助。
6工具栏按钮简介：
工具栏按钮如图所示(图22)。
其中大部分按钮的功能在前面已经介绍过，不再赘述。这里将重点介绍“数据恢复”，“图谱间距”，“单谱显示”和x与y轴放大功能。
四卸载
在控制面板中，采用添加/删除程序卸载本程序。
五应用实例
为方便用户快速掌握本系统，我们以一例子加以介绍。
例：对获取的色谱指纹图谱建立对照图谱，进行相似度评价，并打印报告。
相似系统理论用于中药色谱指纹图谱的相似度评价
似度时， 不能保证 % & 3 ’ )" 对所 有的样 品 或 色 谱 峰 都适用。因此 3 ’ 的有些值大于 " ， 有些值小于 "， 经 求和平均计算之后， 部分差异就会被抵消。 ! ! 为了客观地评 价 中 药 色 谱 指 纹 图 谱 的 相 似 度， 我们对程度相似度的计算公式进行了改进。在改进 的程度相似 度 的 计 算 公 式 中， 以 &’ 2 (’ 表 示 相 似 要 说明两者的相似程 素的相似程度， 比值越接近于 " ， 度越高； 以 " ’ & ’ 2 ( ’ 表示 相 似 要 素 的 差 异。 为 了 解 决差异被抵消的问 题， 我们采用差异的绝对值进行 计算。将相似要素 的 差 异 取 绝 对 值 之 后 求 和， 即用
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" , 5 &’ 2 5 (’
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其中 5 &’ 为 " 色谱图中 & ’ 峰的峰面积或 峰高， 5 (’ 为 # 色谱图中对应的色谱峰 ( ’ 的峰面积或峰高。
（!）
!" 实验研究
! ! #" 香丹注射液的实验研究 ! ! # ! #" 仪器与试剂 ! ! 高效 液 相 色 谱 （ -./0 ） 系 统： 岛 津 /01"% "234 高压泵， 岛 津 (.215"% "34 二 极 管 阵 列 检 测 器， 岛 津 0/"((134 工作 站； 柱 温 箱： 601"%% （ 天津市金洲 科学仪器有限公司） 。 ! ! 试剂： 甲醇 （ 色谱纯） ， 冰醋酸 （ 分析纯 ） ， 二次重 蒸水。 ! ! # ! !" 样品 ! ! 香丹注射液 （ 上海通用药业股份有限公司第三 %#"%""* ， %#"%""+ ， 公 司 ）"% 批，批 号 为 %#"%)! ， %#"%"!, ， %#"%+! ， %#"%*+ ， %#"%"", ， %#"%"#% ， %#"%"%+ 和 %#"%""! 。 ! ! # ! $" 色谱条件 ! ! 色谱条件参照文 献 ［#］ ， 并 进 行 了 方 法 学 考 察。 色谱 柱： "77+89% 0 ") 柱（ !( &9 : $- + 99 8- ’- ，( ， 柱温 #% ; 。 流 动 相： "， " <（ 体 积 分 数， 以下 !9） 同此） 冰 醋 酸 水 溶 液； #， " < 冰 醋 酸 甲 醇 溶 液； 采用 梯度洗脱 （ 程 序 为： "% < # , "%% < # （ % . (( 98) ） ， "%% < # , "% < # （ (( . +% 98) ） ， "% < # （ +% . *% 98) ） ） ； 流速为 "- % 9/ = 98) 。检 测波长 为 !)% )9 。 进样量为 !% ! / 。 ! ! # ! %" 供试品溶液的制备 ! ! 精 密 量 取 香 丹 注 射 液 %- (% 9/ 于 "% 9/ 量 瓶
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A
附录1：常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出
本软件系统的相似度运确实是按照峰的积分面积进行的。建议用户从色谱工作站导出AIA（*.cdf）数据文件之前，先对需要导出的数据进行积分处理，如此能够确保导出的AIA（*.cdf）数据文件包含积分数据信息。
Agilent色谱工作站
1.打开Agilent色谱工作站；
附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见咨询题及解答
简介
1．版本介绍：
本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版要紧用于科学研究工作，具有生成对比图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对比图谱的功能。
2．系统运行环境要求：
(1).最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕辨论率800×600。
为了使用户尽快找到色谱峰的峰位置，进行匹配点的设置，能够点击“谱图处理”中的“显示色谱峰”（详见“3谱图处理中（5）显示色谱峰”，图20），如此所有样本图谱的所有色谱峰全部显示出来。
样本图谱数量较多时，有些峰面积较大峰的设置较为不变；或者所有样本图谱匹配点设置完毕，但又觉得某些样本图谱匹配点的设置不够理想，这时能够采纳“单谱显示”模式（详见工具栏中“单谱显示”按钮），逐个图谱进行设置和修正。
差不多流程图如下（图29）：
图29
1样本图谱数据导入（AIA格式（*.cdf）,图30和31）
图31
图32
2设参照图谱（图33）
图34
3自动匹配
图35自动匹配结果
4多点校正
图36多点校正设定
图37多点校正后自动匹配结果(图谱)
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）图2图3图4 系统主界面系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开 绘图区文件信息区（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）图2图3图4 系统主界面系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开绘图区文件信息区（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版系统帮助A
2数据库功能:
数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10)和参照图谱建档功能（图11）,便于用户信息管理。
图9
图10
图11
3谱图处理:
（1）数据剪切
数据剪切功能可使用户选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配。
点击“谱图处理”中的“数据剪切”功能,系统会提示用户是否需要恢复原始数据，点击确定后进入“数据剪切”功能对话框，如图（12):
图2
图３
图４系统主界面
系统主界面中(图4),文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如(S1))及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号(如(Ｓ1２)）。
1文件打开
（１)打开文件(全谱导入)(图５):
图5
本系统支持三种格式文件的导入:AＩA(即*．cdｆ)文件,文本文件(*.txｔ)和Scp(*.Ｓcp)格式文件的导入(图５）。建议采用通用的AIA(*.ｃｄf）格式文件导入。注意ＡＩA（＊.cdf)文件中应包含样本图谱的峰面积信息，在色谱工作站导出AＩA(*．cdf)文件前应现进行积分。否则导出的AIA(*．cｄf)文件可能因不包含峰面积信息而无法导入。为了方便用户的使用，附录中给出了主要色谱工作站的（AGIＬＥＮT,WATＥRS，和ＳHIＭAＤZU）AIA(＊.ｃdf）数据格式的文件导出介绍。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A.．
———————————————————————————————— 作者：
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ﻩ
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范
(版本 2004A)
ＳOPof Simｉlａriｔy evaluａtｉoｎsysｔem foｒｃhromaｔoｇraｐhic fｉnｇｅrpｒinｔof TＣＭ（Version 20０4 A）
中药指纹图谱相似度评价方法的比较
中药指纹图谱相似度评价方法的比较一、本文概述中药指纹图谱作为一种全面、综合地反映中药内在质量的技术手段，已经在中药质量控制、真伪鉴别以及新药研发等领域得到了广泛应用。
指纹图谱相似度评价则是评估中药指纹图谱质量、稳定性的重要指标，其评价方法的优劣直接关系到中药质量评价的准确性。
本文旨在对现有的中药指纹图谱相似度评价方法进行比较分析，探讨各种方法的优缺点，以期为提高中药质量控制水平提供理论支持和实践指导。
本文将首先介绍中药指纹图谱相似度评价的基本概念和研究意义，然后重点阐述几种常用的相似度评价方法，包括夹角余弦法、相关系数法、谱峰匹配法等。
在此基础上，本文将通过对比分析这些方法的计算原理、适用范围、优缺点等方面，为读者提供一个全面、深入的相似度评价方法比较视角。
本文将展望中药指纹图谱相似度评价方法的未来发展趋势，以期为推动中药现代化、国际化进程提供有益参考。
二、中药指纹图谱相似度评价方法概述中药指纹图谱相似度评价是中药质量控制领域的一个重要研究方向，旨在通过科学、客观的方法来评估中药的内在质量。
随着现代分析技术的不断发展，越来越多的相似度评价方法被应用于中药指纹图谱的研究中。
这些方法大致可以分为以下几类：谱图直观比较法：这是最简单直接的相似度评价方法，通过直接观察指纹图谱的峰形、峰位和峰强度等信息，对中药样品进行直观的比较和判断。
这种方法简单易行，但主观性较强，容易受到观察者的经验和技能影响。
相似度计算法：这类方法通过数学公式或算法，对中药指纹图谱进行量化分析，从而得出样品间的相似度。
常用的相似度计算法包括相关系数法、夹角余弦法、欧氏距离法等。
这些方法具有客观性强、结果可重复等优点，但也需要选择合适的计算参数和阈值。
模式识别法：模式识别技术，如人工神经网络、聚类分析、主成分分析等，也被广泛应用于中药指纹图谱的相似度评价中。
这些方法能够通过学习和训练，自动识别指纹图谱中的特征信息，并对中药样品进行分类和识别。
中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版系统帮助A
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 2004 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM（Version 2004 A）目录一、软件系统的功能简介：二、附录1：附常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出三、附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见问题及解答一．简介1．版本介绍：本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。
研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。
检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕分辨率1024×768二．安装方法点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击下一步至安装结束。
图 1三．功能本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。
安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。
点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
若用户不想在启动界面等待三秒钟，可以直接点击启动界面（图3），这样可以快速进入系统主界面（图4）图2图3图4 系统主界面系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名绘图区文件信息区称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1 文件打开（1）打开文件（全谱导入）（图5）：图5本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。
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中药色谱指纹图谱相似度评价系统国家药典委员会翟为民背景国家食品药品监督管理局于2000年先后下达“关于加强中药注册管理有关事宜的通知”（国药管注［2000］157号）和关于印发《中药注射剂色谱指纹图谱研究的技术要号）和“关于印发《中药注射剂色谱指纹图谱研究的技术要求》的通知”（国药管注［2000］348号）文件。
国家药典委员会负责组织实施“已批准生产的中药注射剂质量标准的提高完善及指纹图谱工作”及牵头组织“已批准多家生产的中药注射剂，其指纹图谱联合起草工作”。
国家药典委员会从2000年12月起开始组织实施，进行了可行性调研、规范性技术文件起草与研究、同布进行了科技部立项。
从中药注射剂的指纹图谱研究质量标准提高逐步从中药注射剂的指纹图谱研究、质量标准提高，逐步成熟、扩展，到2010版药典，部分提取物和中成药标准中都收载了指纹图谱项目，为发挥着积极的作用。
1、论证1论证首先进行调研，多次召开研讨会，代表涉及科研院所、中央和省级药品检验所及企业科技人员。
形成共识：央和省级药品检验所及企业科技人员形成共识：①重点-色谱指纹图谱；②理论上可行。
②理论上可行③通过实践，检验可行性，不断完善。
2、修订《中药注射剂指纹图谱研究技术要求》（国药谱管注［2000］348号）①优化、方法验证，细化参数、明确要求。
②解决手工计算“共有峰”、“非共有峰”面积工作中大量的人为因素，改变“只见树木不见森林”的局面，力求量的人为因素改变“只见树木不见森林”的局面力求反映整体质量特性。
二规范性技术文件起草与研究工作二、规范性技术文件起草与研究工作1、修订修订稿就原料药材、半成品、成品的样品收集、制备、参照物的选择，指纹图谱试验条件，对实验室的要求，对仪器的要求，试验方法和试验条件的建立及验证，色谱条件的优选，指纹图谱的建立和验证、识别、计算和复核，标准书写格式指纹图谱的建立和验证识别计算和复核标准书写格式等进行了详尽的细化规定，起草稿经广泛征求意见，先后进行了多次修改得以完成。
以《中药注射剂色谱指纹图谱试验研究操作规程指南》（试行）的名义发布，作为局颁“技术要求”的补充。
2、计算机辅助中药指纹图谱相似度计算软件的研究开发对于成药而言，如何控制批与批之间质量的稳定，这就要求需采用某种手段能定量地表征各样品间的相似程度(或差异性)而不是真伪鉴别，从整体性考虑，采用指纹图谱，在批间稳定等方面能够发挥积极作用。
也就需要建立一套能整体反应各样品指纹图谱之间相似程度的计也就需要建立套能整体反应各样品指纹图谱之间相似程度的计算方法，但原版“技术要求”采用共有峰和非共峰之比值的人工计算方法，该方法仅考虑了人为选定的几个特征峰的相似性，即将一个完整的事物割裂开进行比对，是不全面的，未能将中药内在成分的整体特性表达出来，因此，要创建一套能定量比对整体上反映中药内含成分指纹图谱相似程度的工具上反映中药内含成分指纹图谱相似程度的工具。
•国家药典委员会组织沈阳药科大学、浙江国家药典委员会组织沈阳药科大学浙江大学、中南大学、清华大学、北京大学医学部医药科技开发中心、西北大学、中国学部药科技发中北大学中国药品生物制品检定所、第二军医大学八家单位，于2004年集中测试修改定型《计算机辅助中药指纹图谱相似度计算软件》。
•软件的开发过程与中药注射剂指纹图谱的科研工作直保持了同步。
这种同步的应科研工作一直保持了同步。
这种同步的应用也给软件的测试使用创造了条件。
•开发初期设计思路是将色谱数据导入MATLAB 开发初期设计思路是将色谱数据导入的专业数据处理的软件中进行相似度的计算。
后考虑到知识产权保护的问题，采用自主编程，将指纹图谱数据导入，数据库管理，计算方法选择，谱图处理等功能综合考虑，设计开发而成。
计开发而成软件基本算法与版本一、算法选择简介二、修订改版工作三、2.0版的介绍•一、首要问题是选择算法•课题组同步进行了《指南》的制定与算法的评价与选择，通过大量计量化学方面的研讨与对比验证，选择了夹角余弦法。
研讨与对比验证选择了夹角余弦法中药指纹图谱是表征中药复杂成分与其质量关系的重要手段中药指纹图谱是表征中药复杂成分与其质量关系的重要手段。
在表征过程中程中，，相似度评价起着关键作用相似度评价起着关键作用。
目前常用的相似度评价方法主要有峰重叠率评价方法比较与算法选择简介法（Nei Nei系数法系数法））,相关系数法相关系数法,,距离系数法距离系数法,,向量夹角余弦法与峰重叠率和共有峰强度结合法有峰强度结合法（（改进的改进的Nei Nei系数法系数法））。
指纹图谱波动对各种评价方法的影响:.1.00 A B C 750.800.850.90095r i t yD E550.600.650.700.S i m i l a 0.000.050.100.150.200.450.500.F l u c t u a t i n g I n t e n s i t yA.夹角余弦法B.相关系数法C.距离系数法D. Nei 系数法E.改进的Nei 系数法由于药材的产地来源储藏条件和加工工艺的不同以及仪器设备的稳定性等原结果表明：A 方法受指纹图谱波动的影响最小由于药材的产地、来源、储藏条件和加工工艺的不同，以及仪器设备的稳定性等原因使得指纹图谱产生一定的波动。
举例：向痛必定粉针制剂高效液相色谱指纹图谱中随机地加入一定强度的波动，以考查波动对相似度评价方法的影响。
结果如上图。
小峰的缺失的影响：091.0AB 0.70.80.9C D Ei m i l a r i t y040.50.6S 0.30.40~5%0~3%The scope of lost peaks in fingerprint0~1%A.夹角余弦法B.相关系数法C.距离系数法D. Nei 系数法E.改进的Nei 系数法在药材加工和提取过程中，药材中的某些成分往往会有一定的损失，导致结果表明：A 方法受小峰缺失的影响最小在药材加工和提取过程中，药材中的某些成分往往会有定的损失，导致指纹图谱出现峰的缺失。
假设峰的缺失主要为峰面积较小的峰，以5％作为阈值，将缺失峰分成0～1％，0～3％和0～5％三组进行考察。
大峰的缺失的影响1.0 AB C 大峰的缺失的影响：0.80.9a r i t yD E0.60.7S i m i l 01230.40.5o f la r g e r p e a k s lo s t in f in g e r p r in tN u m b e r o la p lo t in f A.夹角余弦法B.相关系数法C.距离系数法D. Nei 系数法E.改进的Nei 系数法结果表明结果表明：A 方法受大峰缺失的反映较“灵敏”在药材加工和提取过程中，指纹图谱中大峰的缺失并不常见。
而对于同属不同种的药材，大峰的差异是有可能的。
考察了大峰缺失的影响举例。
数据标准化处理的影响：数据标准化处理一般会影响各种方法的相似度评价结果。
若处理前后样本的相似度评价结果的大小（等级）顺序变化较小，说明标准化处理对样本的亲疏远近关系影响较小反之影响较大采用相关系数进行检验Influence of data autoscaling on different methods较小，反之影响较大。
采用Spearman 相关系数进行检验。
g for evaluating similarity距离系数相关系数夹角余弦Spearman 系数 0.827 1 0.927( = 0.01, 2-tailed, r s =0.735)0.842 0.795 0.790数据标准化对表中三种评价方法所得结果影响较小关于对照模式的计算x …•平均矢量（重心）= j (x 1j ,x 2j ,…,x nj )/m •中位数矢量=median((x 1j ,x 2j ,…,x nj ))两种对照模式•批样品中不存在离群(outlier)样本时，一般推荐使用平均矢量（重心）作为对照模式矢量•样品中存在离群样本时，推荐使用具有稳健(robust)性质的中位数矢量来作为共有模式矢量，这种情况可能在计算原料药材样本时的共有模式出现。
出现•采用具有稳健性质的中位数矢量来作为对照模式，就不会因为原料药材样本中出现了一个离群样本就不会因为原料药材样本中出现了个离群样本时而影响整个药材的对照模式。
值得指出的是如果不存在离群样本时两种方•值得指出的是，如果不存在离群样本时，两种方法所得结果应该基本一致。
一、2004年版软件与算法简介•版本:研究版（2004A）•研究版（2004 A）•检验版（2004 B）研究版（2004 A ）检验版（2004 B ）应用范围科学研究指纹图谱的检验工作功能具有生成对照图谱功能不具有生成对照图谱功能研究版（2004A 2004B 18结论2004 A ）的功能较多，且函盖了检验版（2004 B ）具有的功能•2004版以后，根据使用情况，验证并确认保持核算法不变保持核心算法不变。
•根据使用中收集的反馈意见，补充必要的需求，按照软件编制规范，彻底梳理并重需求按照软件编制规范彻底梳理并重新编写了全部代码，在人机交互方面进一步完善，并且为了适应管理需要增加了相步完善并且为了适应管需要增加了相应的功能。
进行了不同范围的测试，形成了2.0版。
业已获得软件著作权证书。
2.0版介绍20版介绍•运行环境硬件•1、硬件：•最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，屏幕分辨率硬盘剩余最小空间100M屏幕分辨率800×600。
•2、软件环境：2软件环境•支持的操作系统：windows 98，windows 2000、windows 2003、windows XP。
windows7（32位）（64位）•下载： fp chp org cn •安装：•操作流程•生成对照图谱•检验主界面•文件列表区：显示打开的图谱文件列表。
•文件详细信息区：显示选中文件信息。
•绘图区：绘制图谱，标注色谱峰。
•状态栏：显示工作状态、当前用户、登录时间等信息。
•快捷工具栏：常用按钮：•鼠标有提示•工作状态切换•注意提示：•全谱导入（单、多个多个）：*.cdf*.txt *.SCP *.XSCP*SCP*XSCP•可打开三种格式的报表：式的报表*.rdf*.qrp.XQRP*.XQRP导出文件（图谱）图谱*.txt*S *.Scp导出图像*bmp *.bmp*.wmf参照图谱信息删除选定的图谱•（可多选）•删除所有图谱•多一项确认，再•删除单个或多个图谱。
多项确认，再清除。
•也可以选定列表中的文件，直接按DEL键。
视图菜单图谱间距调整图谱间距•放大图谱、缩小图谱、原始大小•快捷工具栏或者菜单中选择、鼠标单谱显示多谱显示显示或隐藏色谱峰菜单、右键，显示或隐藏。