分子生物学小问题整理
分子生物学问答题
分子生物学问答题1、请定义DNA重组技术和基因工程技术答：DNA重组技术：目的是将不同的DNA片段（如某个基因或基因的一部分）按照人们的设计定向连接起来，然后在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达，产生影响受体细胞的新的遗传性状。
基因工程技术：是除了包含DNA 重组技术外还包括其他可能是生物细胞基因结构得到改造的体系，基因工程是指技术重组DNA技术的产业化设计与应用，包括上游技术和下游技术两大组成部分。
上游技术指的是基因重组、克隆和表达的设计与构建（即重组DNA技术）；而下游技术则涉及到基因工程菌或细胞的大规模培养以及基因产物的分离纯化过程。
2、什么是核小体？简述其形成过程。
答：核小体是染色质的基本结构单位，由~200bpDNA和组蛋白八聚体组成。
形成过程：核小体是由H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成的八聚体和由大约200bp的DNA组成的。
形成核小体时八聚体在中间，DNA分子盘绕在外组成真核细胞染色体的一种重复珠状结构。
3、简述DNA的一、二、三级结构特征。
答：1，DNA的一级结构，就是指4种核苷酸的连接及排列顺序，表示了该DNA分子的化学成分；2，DNA的二级结构是指两条多核苷酸连反向平行盘绕所形成的双螺旋结构；3，DNA的高级结构是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。
4、原核生物DNA与真核生物有哪些不同的特征？答：原核生物的DNA通常没有重复序列，真核生物却有大量的重复序列；原核生物的大部分序列是编码序列，真核生物却又大量的非编码序列；真核生物DNA末端有端粒结构；真核生物DNA 有核蛋白包裹；真核生物DNA有内含子序列；原核生物DNA转录翻译可同时进行，真核必须运送到细胞核外。
5、DNA复制通常采取哪些方式。
答：一，线性DNA双链的复制：1，将线性复制子转变为环状或者多聚分子；2，在DNA末端形成发卡式结构，使分子没有游离末端；3，在某种蛋白质的介入下（如末端蛋白，terminal protein），在真正的末端上启动复制。
分子生物学问题汇总
Section A 细胞与大分子简述复杂大分子的生物学功能及与人类健康的关系。
Section C 核酸的性质1.DNA的超螺旋结构的特点有哪些？A 发生在闭环双链DNA分子上B DNA双链轴线高卷曲，与简单的环状相比，连接数发生变化C 当DNA扭曲方向与双螺旋方向相同时，DNA变得紧绷，为正超螺旋，反之变得松弛为负超螺旋。
自然界几乎所有DNA分子超螺旋都为负的，因为能量最低。
2.简述核酸的性质。
A 核酸的稳定性：由于核酸中碱基对的疏水效应以及电荷偶极作用而趋于稳定B 酸效应：在强酸和高温条件下，核酸完全水解，而在稀酸条件下，DNA的核苷键被选择性地断裂生成脱嘌呤核酸C 碱效应：当PH超出生理范围时（7-8），碱基的互变异构态发生变化D 化学变性：一些化学物质如尿素，甲酰胺能破坏DNA和RNA二级结构中的而使核酸变性。
E 粘性：DNA的粘性是由其形态决定的，DNA分子细长，称为高轴比，可被机械力和超声波剪切而粘性下降。
F 浮力密度：1.7g/cm^3,因此可利用高浓度分子质量的盐溶液进行纯化和分析G 紫外线吸收：核酸中的芳香族碱基在269nm 处有最大光吸收H 减色性，热变性，复性。
思考题：提取细菌的质粒依据是核酸的哪些性质？质粒是抗性基因，，在基因组或者质粒DNA中用碱提取法。
Sectio C 课前提问1.在 1.5mL的离心管中有500μL，取出10 μL稀释至1000 μL后进行检测，测得A260=0.15。
问（1）：试管中的DNA浓度是多少？问（2）：如果测得A280=0.078, .A260/A280=？说明什么问题？(1)稀释前的浓度：0.15/20=0.0075稀释后的浓度：0.0075/100=0.75ug/ml（2）0.15/0.078=1.92〉1.8，说明DNA中混有RNA样品。
2.解释以下两幅图（native:非变性的；denatured:变性的）图一表示dsDNA和RNA的热变性，中间的Tm值表示解链温度。
分子生物学问答题
1．何为增强子？减数增强子增强转录的特点？答：增强子：远距离调节启动子以增强子转录速率的DNA序列，其增强作用与序列的方向无关，与其在基因上下游位置无关，强烈的细胞类型依赖性。
特点：1.具有远距离效应；常在上游-200bp处，即使相距几十kb也能发挥作用；2.无方向性；无论在基因上游，下游或内部都可发挥增强作用；3.顺式调节;只调节处于同一染色体上的靶基因，对其他染色体的基因无作用；4，无物种和基因特异;对同源或异源基因都有效；5，具有组织特异性；在不同的组织细胞中，相同的增强子可以呈现不同作用强度；6有相位性；增强子的活性与其在DNA双链结构中的空间方向性有关；7，有得增强子含有许多可与转录因子结合的基序，可以不同的组合方式调控基因表达，它们是基因差别表达的主要原因。
2．何为弱化作用？以trp操纵子为例子说明转录弱化作用的基本特点答：弱化作用：RNApd在DNA模板的前导肽编码序列处停顿，依赖于转录和翻译的紧密偶联，使翻译可以在mRNA边转录边进行。
trp操纵子启动子下游有一段140bp的引导序列，终止信号位子100--140bp之间，可形成发夹结构，但取决于RNA pol与茎环之间的相对位置，引导序列50-60bp有两个trp密码子，当细胞中，trp水平较低时，核糖体会在这里停留，拉开与RNA pol之间的距离，阻止终止信号形成发夹结构，转录正常；当细胞中足够多的trp存在时，核糖体紧跟RNA pol，在转录达迈140bp位置时，终止信号形成发夹结构，pol脱离模板，转录停止。
3．DNA损伤修复类型有什么？1直接修复：E coli细胞中有光修复系统，可见光能激活细胞中的光复活酶，分解因紫外线照射而产生的胸腺嘧啶二聚体。
2.烷基转移酶：直接从突变的O6-烷基鸟嘌呤上去除烷基转移到自身，该蛋白失活。
3.切除修复：通过切除损伤部位，剩下的空隙由DNA-pol I催化dNTP聚合而填补，最后由DNA连接酶结合裂隙。
(完整word版)分子生物学简答题
课后思考题1. 试述乳糖操纵子的结构及调控原理？乳糖操纵子开放转录需要什么条件？（1）乳糖操纵子的结构：含Z、Y、A3个结构基因,分别编码乳糖代谢的3个酶；一个操纵序列O，一个启动序列P，一个CAP结合位点共同构成乳糖操纵子的调控区.乳糖操纵子的上游还有一个调节基因I。
(2）阻遏蛋白的负性调节：I基因的表达产物为一种阻遏蛋白，在没有乳糖存在时，阻遏蛋白与O序列结合，阻碍RNA聚合酶与P序列结合，抑制转录启动，乳糖操作子处于阻遏状态；当有乳糖存在时，乳糖转变为半乳糖，后者结合阻遏蛋白，使构象变化，阻遏蛋白与O序列解离，在CAP蛋白协作下发生转录。
（3）CAP的正性调节：分解代谢基因激活蛋白（CAP）分子内存在DNA和cAMP结合位点.当没有葡萄糖时，cAMP浓度较高，cAMP与CAP结合，cAMP-CAP结合于CAP结合位点，提高RNA转录活性;当有葡萄糖时,cAMP浓度降低,cAMP与CAP结合受阻，乳糖操纵子表达下降。
(4）协调调节:乳糖操纵子阻遏蛋白的负性调节和CAP的正性调节机制协调合作，CAP不能激活被阻遏蛋白封闭基因的表达，但如果没有CAP存在来加强转录活性，即使阻遏蛋白从操纵序列上解离仍无转录活性。
因此，乳糖操纵子开放转录需要的条件是:1）诱导物乳糖存在，解除阻遏蛋白的负调节。
2）葡萄糖缺乏，CAP蛋白活化，启动正调节。
2.试述原核生物和真核生物基因表达调控特点的异同.（1）相同点：转录起始是基因表达调控的关键环节。
(2）不同点：1)原核生物基因表达调控主要包括转录和翻译水平；真核基因表达调控包括染色质活化、转录、转录后加工、翻译、翻译后加工多个层次.2)原核基因表达调控主要为负调节；真核生物基因表达调控主要为正调节。
3）原核转录起始不需要转录因子，RNA聚合酶直接结合启动子，由σ因子决定基因表达的特异性；真核转录起始需要基础、特异两类转录因子，依赖DNA—蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用，调控转录激活。
分子生物学问答题O
分子生物学问答题1什么是中心法则？答：是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质的转录和翻译的过程，以及遗传信息从DNA 传递给DNA的复制过程。
这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。
在某些病毒中的RNA自我复制和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程是对中心法则的补充。
2什么是分子生物学？答：广义——在分子水平研究生命的现象与规律的学科。
狭义——核酸化学（DNA，RNA）。
在分子水平上研究生命现象的科学。
研究生物大分子(核酸、蛋白质)的结构、功能和生物合成等方面来阐明各种生命现象的本质。
3试举出20世纪三例分子生物学发展中的重大发现答：1950 Chargaff提出Chargaff法则：A+G=T+C1953 Waston&Crick提出：DNA双螺旋模型1954 Crick提出：中心法则1958 Meselson等提出：DNA的半保留复制1961 Brener等提出三联体密码假说1961 Jacob&Monod提出操纵子模型1972 Berg第一次实现体外DNA的重组第二章1、简述DNA复制的基本法则及复制过程中涉及的酶和蛋白质（以E.coli为例）。
答：1）○1DNA的半保留复制：DNA复制是产生的新链中一条单链来自母链（模板链），另一条是新合成的（新生链有一半的母链被保留下来）即半保留复制；○2DNA复制的半不连续性：DNA复制时其中一条单链（3’—5’）先复制，是连续的，即先导链，另一条链的复制滞后一步且是先合成一段段的冈崎片段，通过连接酶形成完整子代单链。
2）酶和蛋白质：DNApol包括DNApolI、DNApolII、DNApolIII三类TopI，解旋酶、SSB、RNA聚合酶、引发酶、DNA连接酶。
2、基因有哪些存在形式、真核生物DNA序列有哪些种类？答：1）割裂基因，重叠基因，跳跃基因，假基因，重组基因等；2）高度重复序列，中度重复序列，单拷贝序列。
分子生物学问答题
答：RNA编辑是某些RNA，特别是mRNA前体的一种加工方式，如插入、删除或取代一些核苷酸残基，导致DNA所编码的遗传信息的改变，因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。（介导RNA编辑的机制有两种：位点特异性脱氨基作用和引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除）
答：pribnow box是原核生物中中央大约位于转录起始位点上游10bp处的TATA区，所以又称作-10区。它的保守序列是TATAAT。
13、简述mRNA常以多顺反子的形式存在。真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在；2，原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的，真核生物转录的mRNA前体则需经转录后加工，加工为成熟的mRNA与蛋白质结合生成信息体后才开始工作；3，原核生物mRNA半寿期很短，一般为几分钟，最长只有数小时。真核生物mRNA的半寿期较长，如胚胎中的mRNA可达数日；4，原核与真核生物mRNA的结构特点也不同，原核生物的mRNA的5’端无帽子结构，3’端没有或只有较短的poly A结构。
分子生物学问答题
1、请定义DNA重组技术和基因工程技术
答：DNA重组技术：目的是将不同的DNA片段（如某个基因或基因的一部分）按照人们的设计定向连接起来，然后在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达，产生影响受体细胞的新的遗传性状。基因工程技术：是除了包含DNA重组技术外还包括其他可能是生物细胞基因结构得到改造的体系，基因工程是指技术重组DNA技术的产业化设计与应用，包括上游技术和下游技术两大组成部分。上游技术指的是基因重组、克隆和表达的设计与构建（即重组DNA技术）；而下游技术则涉及到基因工程菌或细胞的大规模培养以及基因产物的分离纯化过程。
答：1，DNA的一级结构，就是指4种核苷酸的连接及排列顺序，表示了该DNA分子的化学成分；2，DNA的二级结构是指两条多核苷酸连反向平行盘绕所形成的双螺旋结构；3，DNA的高级结构是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。
医学分子生物学简答题
四、简答题1.碱基对间在生化和信息方面有什么区别?2.在何种情况下有可能预测某一给定的核苷酸链中“G”的百分含量?3.真核基因组的哪些参数影响 Cot1／2值?4.请问哪些条件可促使 DNA复性(退火?5.为什么 DNA双螺旋中维持特定的沟很重要?6.大肠杆菌染色体的分子量大约是2.5×109Da1，核苷酸的平均分子量是330Da，两个邻近核苷酸对之间的距离是0.34mn；双螺旋每一转的高度(即螺距是3.4nm，请问：(l该分子有多长?(2该 DNA有多少转?7.曾经有一段时间认为，DNA无论来源如何，都是4个核甘酸的规则重复排列(如， ATCG．ATCG．ATCG．ATCG…，所以 DNA缺乏作为遗传物质的特异性。
第一个直接推翻该四核苷酸定理的证据是什么?8.为什么在 DNA中通常只发现 A—T和 C—G碱基配对?9.列出最先证实是 DNA(或RNA而不是蛋白质是遗传物质的一些证据。
10.为什么只有 DNA适合作为遗传物质?ll.什么是连锁群?举一个属于连锁基因座的例子。
12.什么是顺反子?用“互补”和“等位基因”说明“基因”这个概念。
13.对于所有具有催化能力的内含子，金属离子很重要。
请举例说明金属离子是如何作用的。
14.列出真核生物mRNA与原核生物mRNA的区别。
15.列出各种tRNA所有相同的反应及个别 tRNA的特有反应。
16.在体内，rRNA和 tRNA都具有代谢的稳定性，而 mRNA的寿命却很短,原因何在?17.为什么真核生物核糖体RNA基因具有很多拷贝?18.为什么说信使RNA的命名源自对真核基因表达的研究，比说源自对原核基因表达的研究更为恰当?19.说明为什么mRNA仅占细胞RNA总量的一小部分(3％一5％。
20.为何rRNA和tRNA分子比 mRNA稳定?21.起始tRNA具有哪两种与其他 tRNA不同的特性?22.区别rRNA和mRNA在翻译中的作用。
23.氨基酸分子如何与正确的tRNA分子连接?24.简要说明证明信使的存在及其本质为RNA的证据。
分子生物学简答题
1．为什么在 DNA中通常只发现 AT和 CG碱基配对？答：1）CA配对过于庞大而不能存在于双螺旋中；GT 碱基对太小，核苷酸间的空间空隙太大无法形成氢键。
2）A和 T通常形成两个氢键，而 C和 G可形成三个氢键。
正常情况下，可形成两个氢键的碱基不与可形成三个氢键的碱基配对。
2．被加工的假基因与其他假基因有哪些不同？它是如何产生的？答：已加工过的假基因具有明显的 RNA加工反应的印迹。
如缺少内含子，有些在 3 ‘端已经经过加工。
推测已加工过的假基因是在基因转录成前体 mRNA、RNA加工后，又经反转录形成 DNA，再将反转录出的 DNA重新整合进基因组。
3.请描述 C值矛盾，并举一个例子说明。
答：C 值矛盾是真核生物单倍体组 DNA总量与编码基因信息 DNA总量差异大。
对高等真核生物而言，生物体基因组的大小与其复杂性没有直接关系。
亲缘关系相近的生物 DNA含量可能差异很大。
如一些两栖动物比其它两栖动物的 DNA相差 100 倍。
4．描述滚环复制过程及其特征。
答：仅是特定环状 DNA分子的复制方式。
（1）复制过程： 1）环状双链 DNA的+链被内切酶切开； 2）以链为模板，DNA聚合酶以+链的 3'端作为引物合成新的+链，原来的+链 DNA分子的 5' 端与链分离； 3）+链的 3'端继续延长； 4）引发酶以离开的+链为模板合成 RNA引物，DNA聚合酶以+链为模板合成新的链； 5）通常滚环复制的产物是一多聚物，其中大量单位基因组头尾相连。
（2）复制过程的特征： 1）复制是单方向不对称的； 2）产物是单链 DNA，但可通过互补链的合成转变为双链； 3）子代 DNA分子可能是共价连接的连环分子； 4）连环分子随后被切成与单个基因组相对应的片段。
5.RecA蛋白是怎样调节 SOS 反应的？答： RecA蛋白识别损伤 DNA的单链区，与单链 DNA结合后，Rec A的蛋白活性被激活，将 LexA切割成没有阻遏和与 DNA操纵区结合的两个区，导致 SOS反应（包括 RecA）的高效表达。
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第一章1.蛋白质氨基酸构成氨基羧基H原子R2.碱性赖精组酸性天谷Asp Glu3.肽键是有刚性的酰胺键部分双键防止肽键自由旋转4.N-末端正电荷C-末端负电荷5.多肽肽键连接起来的聚合物6.一级结构氨基酸顺序7.二级结构多肽中的区域通过折叠产生8.三级结构由不同二级结构组成9.四级结构几条多肽链组成的蛋白质形状10.二级结构a螺旋b折叠helix and sheet11.疏水相互作用非极性分子远离水分子而互相聚集在一起第二章1.核酸长的小分子聚合物2.核苷酸含氮碱基糖三磷酸3.一环嘧啶2N4.二环嘌呤4N5.大小沟major minor 蛋白质大多结合在大沟6.一圈3.4nm 10bp 宽度大约2nm7.变性260nm 单链DNA吸收很多光复性了解一下8. 1.DNA链中的碱基序列可以用来保存生产蛋白质的氨基酸序列信息9. 2.提供了作为遗传物质需要的稳定性10.3.对某些类型的损伤进行修复11.4.一定的脆弱性第三章1.原核生物转录2.起始：闭合启动子复合体开放启动子复合体取得立足点启动子清空3.延伸：局部分开两条链，RNA聚合酶创造了一个开口转录泡4.终止内在型重视和ρ依赖型终止结合到RNA上形成发夹5.对基因的表达进行调控何时该表达什么蛋白特殊时期特殊表达。
6.操纵子：被协同调控的基因组织起来的结构包含一个启动子和操纵基因（operator）7.乳糖操纵子：没有乳糖时乳糖会与lac阻遏蛋白结合别构调控8.正调控CAP能感应葡萄糖水平低->激活lac基因的转录不与葡萄糖直接结合与CAMP 这样的小分子结合而发挥作用成反比（CAMP和葡萄糖）9.乳糖诱导物诱导了转录10.色氨酸操纵子trp阻遏蛋白辅阻遏物11.衰减作用：确保转录被彻底阻遏12.边转录边翻译偶联转录-翻译第四章1.RNA聚合酶I rRNA2.III tRNA 5S rRNA U6 RNA3. II SRNA MRNA1.通用转录因子与RNA聚合酶II在启动子位置形成的组合称为RNA前起始复合体2.TF II D 8-10 subunits 其中一个TATA结合蛋白（TBP）必须作为组织中心3.TAF IIs TBP相关因子取名就不能取得有意思一点一看就不是合格的程序员可读性极差不是必须的4.原核生物DNA结合基序HTH5.真核生物DNA结合基序同源异型域三个a螺旋6.Zinc fingers a+b+zn2+7.亮氨酸拉链识别不同的DNA序列异源二聚化作用8.HLH9.Trp阻遏蛋白两个蛋白的二聚体10.激活蛋白也通过改变基因中DNA的高级包装情况来促进转录第五章1.真核生物mRNA 的修饰7-甲基鸟嘌呤核苷the CTD第六章看问题第七章1. 组蛋白尾对组蛋白发挥调控作用是十分重要的，因为它上面的一些氨基酸残基可以发生改变乙酰基甲基磷酸等基团可以共价连接上去2.赖氨酸乙酰化正电->中3.甲基化激活转录也可阻遏转录4.染色质重塑蛋白能对组蛋白密码发生相应响应4.小RNA调控Mrna稳定性RISC的蛋白复合体这一复合体选用小RNA两条链中的一条并用它来与目标mRNA结合极度匹配切片不是很匹配干涉翻译5.miRNa 源自于细胞基因转录出的RNA长链中切割出来的问题1.问题1：生物学家知道染色体早在他们知道遗传物质是DNA之前就携带了遗传物质。
你为什么认为花了这么长时间才发现DNA的重要性？1）。
染色体由DNA和蛋白质组成。
所以结构上DNA和蛋白质组分都可能是遗传物质;2）DNA的结构仍然是未知的，因此很难让人们容易地接受DNA作为遗传物质;3）人们还没有找到一种好的或适当的方法来验证DNA或蛋白质是否是遗传物质。
2.问题2：许多生物学家认为，在早期的生命形式中，DNA和蛋白质非常少。
什么分子可以代替？为什么这些功能很好的候选人？答：RNA可能已经出现了。
因为1）像DNA一样，RNA可以在早期生活中用作遗传物质，如病毒;2）使用RNA还可以使病毒的早期生命直接从遗传物质中制备蛋白质，而不必像转录一样协调中间步骤。
3）RNA的相对不稳定性在其作为遗传物质的拷贝的作用中非常重要，因为这些拷贝需要被降解以使细胞具有动态生理学;4）RNA可折叠成各种复杂的三维形状，与肽类似。
这意味着RNA可以起到酶的作用，可以具有远远超出其遗传物质作用的其他功能。
核糖体是制造蛋白质的高度结构化复合物，主要由RNA组成。
3.问题3：James Watson和Francis Crick发现DNA的结构被认为是生物学史上最重要的发现之一。
你为什么认为这可能是这种情况？答：因为1）这意味着DNA分子的结构已被证明2）它也提示DNA的复制机制，揭示生命的奥秘。
3）它被认为是分子生物学诞生的象征4.问题4：“基因”的概念并不简单，我们才刚刚开始发现基因是或可能是什么。
你目前对什么是基因的理解？答：1）基因是DNA分子的一个片段。
2）大多数基因含有制造一种多肽的信息，其中一些含有制造多肽或RNA的信息。
3）基因是控制生物学特性的遗传物质的功能单位，结构单位和突变单位。
4）该单元片段中的许多核苷酸不是任意排列，而是排列成具有代码序列的含义。
5.问：DNA复制如此复杂的一些约束条件是什么？6.答案：DNA复制是复杂的，因为没有步骤可以在没有蛋白质帮助的情况下快速或自发地发生。
一些所需的蛋白质含有内在的限制，例如DNA聚合酶只能在5'-3'方向合成新的DNA，DNA聚合酶由10个亚基组成，每个亚基具有独特的功能，DNA聚合酶也具有校对功能-3'-5'和5'-3'外切酶活性，等等。
7.问题：真核细胞在DNA复制过程中面临的问题是什么，原核生物不需要处理？答：1）真核生物基因组比原核生物基因组大得多;2）由于真核生物DNA与组蛋白相关，真核复制叉比原核叉更慢地移动;3）真核生物复制在细胞的生命周期内是协调的，并且所有的DNA只在S期复制一次。
4）真核生物复制必须处理引物问题染色体的末端。
8.问题：滞后股是否比领先股更真实地合成？为什么或者为什么不？答案是肯定的，滞后股的合成速度比领先股慢得多。
原因如下：首先，与连续合成的前导链不同，滞后链不是合成为一条长链，而是由DNA聚合酶III 跳回叉中引起的小片段合成，合成一段时间，然后再跳回来。
其次，如果没有引物合成的引物，DNA聚合酶III不能合成DNA。
在引导链合成中，除复制起点外很少需要引物。
然而，在滞后链合成中，每个冈崎片段必须以新引物开始。
因此，首先必须为每个（1-2）kb的滞后链合成（1kb = 1000bp）添加引物。
并且在DNA复制完成之前，RNA引物必须被DNA聚合酶I替换为具有5'3'外切核酸酶活性的DNA。
最后，RNA引物降解和DNA聚合酶I合成DNA后滞后链中的空位将被连接酶密封。
所有这些步骤都需要时间。
9.问题：为什么真核基因在它们的调控DNA区域可能有许多不同的元件是重要的？答：这是因为真核生物有更多的基因，需要更复杂的基因表达调控。
真核生物启动子包含核心启动子元件，TATA盒，启动子，TF II B识别元件（BRE）和下游启动子元件（DPE）以及上游启动子元件，多种保守序列，包括GC盒和CCAAT盒。
然而，真核生物启动子几乎从未包含刚刚列出的所有元素。
不同的启动子包含这些元素的不同组合，从而提供了一种多样性，允许将数以万计的单个基因彼此清晰地区分开来。
10.问题：众所周知，许多增强子可以将数百或数千个碱基对从其正常位置移开并仍能正常工作。
为什么或者为什么不？答：这是因为DNA可以环绕，这使得增强子和附着的特定转录因子与预先起始复合物接触。
因此，虽然增强子位于远离启动子的位置，但它仍然可以正常工作。
11.问题：蛋白质如何识别特定的DNA碱基序列？你会期望什么样的氨基酸对于识别和结合最重要？答：它依赖于DNA的大沟中的结合，其中A，G，T，C的四个碱基是完全可区分的。
然而，如果在小沟中结合，G与C无法区分，且A与T不可区分，这导致蛋白质不能识别特定的DNA碱基序列。
预期可与DNA碱基化学基团相互作用的蛋白质的氨基酸对于识别和结合最重要。
12.问题：您是否期望与RNA结合的蛋白质具有与结合DNA的蛋白质相似的结构？为什么或者为什么不？答：不，我不认为结合RNA的蛋白质具有与结合DNA的蛋白质相似的结构。
这是因为与DNA的单一双链结构不同，即使在分子内，RNA也具有双链和单链结构。
事实上，RNA结合蛋白通过识别它们的序列和结构而显示出对其靶RNA的高度特异性识别。
到目前为止，包括RNA识别基序，双链RNA结合基序，锌指基序在内的三类RNA 结合结构域被广泛研究和记录。
然而，所有这三类RNA结合结构域都与那些与DNA 结合的结构不同。
RRM是75-85个氨基酸的小蛋白质结构域，其形成针对两个α-螺旋的四链β-折叠。
dsRBM是通过α-螺旋和β1-β2环结合dsRNA的70-75个氨基酸结构域。
锌指基序不是与DNA结合的CCCH型结构域，而是通过分子间氢键和Watson-Crick RNA边缘之间的相互作用与单链RNA结合的CCHH型结构域。
13.问题：修复DNA损伤的一个重要部分是识别损伤的存在，特别是它是什么样的损伤。
细胞用于识别各种损伤的一些机制是什么？答：对于每种类型的DNA损伤，细胞已经发展出修复损伤或消除破坏性化合物的特定方法。
酶光解酶通过破坏它们之间的共价键特异性识别和修复嘧啶二聚体。
O6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶从DNA结构上的鸟嘌呤碱基裂解甲基和乙基加合物。
MMR 酶能够将新合成的链识别为具有未甲基化的GATC序列的链。
大肠杆菌中的NER开始当蛋白质UvrA和UvrB在损伤部位与DNA结合时。
BER开始时，称为DNA糖基化酶的蛋白质结合受损的碱基，并通过切断与脱氧核糖连接的键将其去除。
在NHEJ 中，蛋白质Ku和DNA-PK识别并结合到DNA的每个断裂末端。
14.问题：你认为细胞总是转录DNA损伤修复基因吗？你认为这些基因在某些条件下表达更强烈吗？为什么或者为什么不？答：是的，我认为细胞总是转录DNA损伤修复基因，以确保DNA损伤可以及时修复。
否则，生活会陷入困境。
虽然小的突变率驱动进化，但高的突变率使得不可能忠实地将遗传信息从代代传递到代。
即使在一个有机体的生命周期内，这种突变也是灾难性的。
此外，我还认为DNA损伤修复基因在生活不利条件下表达更强烈。
由于这些条件下的DNA损伤率高于正常条件下的DNA损伤率，因此需要更多的蛋白质来修复它，尤其是那些仅适用于一次修复的蛋白质。
15.问题：对于细胞来说，哪种DNA损伤最难检测和修复？答：有两种DNA损伤对细胞来说是最难检测和修复的，例如易位和转位特别不可能逆转16.问：错配修复和核苷酸切除修复有什么区别？答：错配修复和核苷酸切除修复有三个区别。