主成分分析的计算步骤

合集下载

主成分分析步骤

主成分分析步骤

主成分分析步骤1.了解数据:首先,在进行主成分分析之前,我们需要对研究的全部数据进行充分了解和分析,了解数据内包含的变量和观测范围,包括变量的类型和样本量(数据表覆盖的观测次数)。

在确定了数据内容及相关参数之后,可以进行下一步工作。

2.准备数据:主成分分析需要对数据进行统计处理,以去除数据间的相关性。

我们需要使用描述统计和回归分析来检验数据与主成分之间的相关性,并量化这种相关性。

3.标准化数据:一旦数据集准备完毕,就要将每个变量标准化--具体地说,就是计算每个变量的平均值和标准差,并将每个变量减去其平均值,然后除以其标准差,使每个变量平均为0,标准差为1,构成标准化数据集。

4.分解协方差矩阵:在执行主成分分析之前,要求将数据集的所有变量的协方差矩阵进行分解,把它分解成各个主成分的特征值和特征向量。

特征向量是由基本主成分变量组成的一整组变量,特征值是这些变量之间的协方差。

5.计算对角化矩阵:对分解后的协方差矩阵进行对角化处理,得到最后的对角化矩阵。

该矩阵可用于显示主成分的方差分布和重要性。

6.计算新的特征向量:利用得到的对角化矩阵,可以计算出一组新的特征向量,被称为新主成分变量,即原始变量的映射。

7.提取主成分:对新生成的特征向量按照特征值的大小进行排序,以便确定我们可以提取出来的主成分的数量。

从新特征向量中抽取出较大特征值对应的特征向量,这些特征向量往往与原始变量之间存在较强的相关性。

8.数据转换:拥有了新生成的特征向量之后,就可以对数据集中的变量进行转换,即从原始变量转换成主成分变量。

完成这个转换后,可以利用统计分析法来探究新变量与数据集中其他变量之间的相关性,从而获得研究结果。

主成分分析方程怎么写

主成分分析方程怎么写

主成分分析方程怎么写假设我们有一个包含N个样本和D个特征的数据矩阵X,可以表示为X=[x1, x2, ..., xD],其中每个样本xi都是一个D维的向量。

我们的目标是将这个高维数据转换为一个低维表示,以方便后续的分析和可视化。

首先,我们需要对数据进行中心化处理,即将每个特征减去其在整个数据集上的平均值。

这可以通过以下公式来实现:X' = X - mean(X)接下来,我们计算数据的协方差矩阵C,其定义如下:C=(1/N)*X'*X'^T其中,X'^T表示X'的转置,N表示样本的数量。

协方差矩阵是一个对称正定矩阵,其元素c_ij表示第i个特征与第j个特征之间的协方差。

然后,我们对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。

假设特征值为λ_1,λ_2,...,λD,对应的特征向量为v_1,v_2,...,vD。

特征值表示协方差矩阵在对应特征向量方向上的方差,特征向量表示数据在该方向上的投影。

特征值和特征向量满足以下关系:C*v_i=λ_i*v_i(i=1,2,...,D)最后,我们选择前K个最大的特征值对应的特征向量,组成一个投影矩阵W。

这些特征向量构成了数据的主成分,对应于协方差矩阵C的最大方差方向。

我们可以将原始数据矩阵X投影到低维空间,得到降维后的数据矩阵Y。

Y=X'*W其中,Y的维度为N*K,每一行对应一个样本在K个主成分上的投影。

由于我们选择的是方差最大的特征向量,因此Y的每个特征都具有最大的方差。

总结一下,主成分分析的数学公式为:1. 中心化处理:X' = X - mean(X)2.计算协方差矩阵:C=(1/N)*X'*X'^T3.特征值分解:C*v_i=λ_i*v_i(i=1,2,...,D)4.选择前K个最大的特征值:W=[v_1,v_2,...,vK]5.数据投影:Y=X'*W。

主成分分析法的步骤和原理[技巧]

主成分分析法的步骤和原理[技巧]

主成分分析法的步骤和原理[技巧](一)主成分分析法的基本思想主成分分析(Principal Component Analysis)是利用降维的思想,将多个变量转化为少数几个综合变量(即主成分),其中每个主成分都是原始变量的线性组合,各主成分之间互不相关,从而这些主成分能够反映始变量的绝大部分信息,[2]且所含的信息互不重叠。

采用这种方法可以克服单一的财务指标不能真实反映公司的财务情况的缺点,引进多方面的财务指标,但又将复杂因素归结为几个主成分,使得复杂问题得以简化,同时得到更为科学、准确的财务信息。

(二)主成分分析法代数模型假设用p个变量来描述研究对象,分别用X,X…X来表示,这p个变量12p t构成的p维随机向量为X=(X,X…X)。

设随机向量X的均值为μ,协方差矩12p阵为Σ。

假设 X 是以 n 个标量随机变量组成的列向量,并且μk 是其第k个元素的期望值,即,μk= E(xk),协方差矩阵然后被定义为:Σ=E{(X-E[X])(X-E[X])}=(如图对X进行线性变化,考虑原始变量的线性组合:Z1=μ11X1+μ12X2+…μ1pXpZ2=μ21X1+μ22X2+…μ2pXp…… …… ……Zp=μp1X1+μp2X2+…μppXp主成分是不相关的线性组合Z,Z……Z,并且Z是X1,X2…Xp的线性组12p1 合中方差最大者,Z是与Z不相关的线性组合中方差最大者,…,Zp是与Z,211Z ……Z都不相关的线性组合中方差最大者。

2p-1(三)主成分分析法基本步骤第一步:设估计样本数为n,选取的财务指标数为p,则由估计样本的原始数据可得矩阵X=(x),其中x表示第i家上市公司的第j项财务指标数据。

ijm×pij 第二步:为了消除各项财务指标之间在量纲化和数量级上的差别,对指标数据进行标准化,得到标准化矩阵(系统自动生成)。

第三步:根据标准化数据矩阵建立协方差矩阵R,是反映标准化后的数据之间相关关系密切程度的统计指标,值越大,说明有必要对数据进行主成分分析。

(完整版)主成分分析法的步骤和原理

(完整版)主成分分析法的步骤和原理

(一)主成分分析法的基本思想主成分分析(Principal Component Analysis )是利用降维的思想,将多个变量转化为少数几个综合变量(即主成分),其中每个主成分都是原始变量的线性组合,各主成分之间互不相关,从而这些主成分能够反映始变量的绝大部分信息,且所含的信息互不重叠。

[2]采用这种方法可以克服单一的财务指标不能真实反映公司的财务情况的缺点,引进多方面的财务指标,但又将复杂因素归结为几个主成分,使得复杂问题得以简化,同时得到更为科学、准确的财务信息。

(二)主成分分析法代数模型假设用p 个变量来描述研究对象,分别用X 1,X 2…X p 来表示,这p 个变量构成的p 维随机向量为X=(X 1,X 2…X p )t 。

设随机向量X 的均值为μ,协方差矩阵为Σ。

对X 进行线性变化,考虑原始变量的线性组合: Z 1=μ11X 1+μ12X 2+…μ1p X pZ 2=μ21X 1+μ22X 2+…μ2p X p…… …… ……Z p =μp1X 1+μp2X 2+…μpp X p主成分是不相关的线性组合Z 1,Z 2……Z p ,并且Z 1是X 1,X 2…X p 的线性组合中方差最大者,Z 2是与Z 1不相关的线性组合中方差最大者,…,Z p 是与Z 1,Z 2 ……Z p-1都不相关的线性组合中方差最大者。

(三)主成分分析法基本步骤第一步:设估计样本数为n ,选取的财务指标数为p ,则由估计样本的原始数据可得矩阵X=(x ij )m ×p ,其中x ij 表示第i 家上市公司的第j 项财务指标数据。

第二步:为了消除各项财务指标之间在量纲化和数量级上的差别,对指标数据进行标准化,得到标准化矩阵(系统自动生成)。

第三步:根据标准化数据矩阵建立协方差矩阵R ,是反映标准化后的数据之间相关关系密切程度的统计指标,值越大,说明有必要对数据进行主成分分析。

其中,R ij (i ,j=1,2,…,p )为原始变量X i 与X j 的相关系数。

主成分分析(PCA)详解(附带详细公式推导)

主成分分析(PCA)详解(附带详细公式推导)

主成分分析(PCA)详解(附带详细公式推导)1.假设有一个m维的数据集X,其中每个数据点有n个样本。

需要将其降维到k维,且k<m。

2. 首先需进行数据的中心化,即对每个维度的数据减去该维度的均值,即X' = X - mean(X)。

3.然后计算协方差矩阵C=(1/n)*X'*X'^T,其中X'^T表示X'的转置。

4.对协方差矩阵C进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。

5.接下来,将特征值按从大到小的顺序排列,选取前k个最大的特征值及其对应的特征向量。

6. 最后,将选取的k个特征向量组成一个投影矩阵W =[e1,e2,...,ek],其中ei表示第i个特征向量。

7.对中心化的数据集进行降维,Y=W*X',其中Y即为降维后的数据。

上述推导过程中,协方差矩阵C的特征值代表了数据的方差,特征向量则代表了数据的主成分。

选取最大的k个特征值和对应的特征向量,即实现了数据的降维。

PCA的应用包括但不限于以下几个方面:1.数据可视化:PCA能够将高维度的数据映射到二维或三维空间,从而方便数据的可视化展示。

2.数据预处理:PCA能够降低数据的维度,从而减少噪声和冗余信息,提升后续模型的精度和效率。

3.特征提取:PCA能够提取数据中最重要的特征,从而辅助后续建模和特征工程。

4.噪声过滤:PCA能够降低数据的维度,从而过滤掉一些无关的噪声信息。

需要注意的是,PCA只能应用于线性数据,并且假设数据的方差和协方差是固定的。

同时,PCA对于数据中非线性关系的捕捉能力较弱,因此在处理非线性数据时,需考虑使用其他非线性降维方法,如核主成分分析(Kernel PCA)等。

综上所述,PCA是一种常用的多变量数据降维技术,在数据分析和机器学习领域有着广泛的应用。

通过线性变换,PCA将高维度的数据投影到低维空间中,从而减少数据的维度,并保留了数据中的主要信息。

(完整word版)主成分分析的计算步骤

(完整word版)主成分分析的计算步骤

主成分分析的计算步骤样本观测数据矩阵为:⎪⎪⎪⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛=np n n p p x x x x x x x x x X 212222111211 第一步:对原始数据进行标准化处理)var(*j jij ij x x x x -= ),,2,1;,,2,1(p j n i ==其中 ∑==ni ij j x n x 11 21)(11)var(j ni ij j x x n x --=∑= ),,2,1(p j =第二步:计算样本相关系数矩阵⎥⎥⎥⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎢⎢⎢⎣⎡=pp p p p p r r r r r r r r r R 212222111211 为方便,假定原始数据标准化后仍用X 表示,则经标准化处理后的数据的相关系数为:tj nt ti ij x x n r ∑=-=111 ),,2,1,(p j i =第三步:用雅克比方法求相关系数矩阵R 的特征值(p λλλ 21,)和相应的特征向量()p i a a a a ip i i i 2,1,,,21==。

第四步:选择重要的主成分,并写出主成分表达式主成分分析可以得到p 个主成分,但是,由于各个主成分的方差是递减的,包含的信息量也是递减的,所以实际分析时,一般不是选取p 个主成分,而是根据各个主成分累计贡献率的大小选取前k 个主成分,这里贡献率就是指某个主成分的方差占全部方差的比重,实际也就是某个特征值占全部特征值合计的比重。

即贡献率=∑=p i ii1λλ 贡献率越大,说明该主成分所包含的原始变量的信息越强。

主成分个数k 的选取,主要根据主成分的累积贡献率来决定,即一般要求累计贡献率达到85%以上,这样才能保证综合变量能包括原始变量的绝大多数信息。

另外,在实际应用中,选择了重要的主成分后,还要注意主成分实际含义解释。

主成分分析中一个很关键的问题是如何给主成分赋予新的意义,给出合理的解释。

一般而言,这个解释是根据主成分表达式的系数结合定性分析来进行的。

主成分分析综合得分计算公式

主成分分析综合得分计算公式

主成分分析综合得分计算公式
主成分分析综合得分计算公式为:Vi=xi/(x1+x2+........),主成分分析也称主分量分析,旨在利用降维的思想,把多指标转化为少数几个综合指标(即主成分),其中每个主成分都能够反映原始变量的大部分信息,且所含信息互不重复。

公式就是用数学符号表示各个量之间的一定关系(如定律或定理)的式子。

具有普遍性,适合于同类关系的所有问题。

在数理逻辑中,公式是表达命题的形式语法对象,除了这个命题可能依赖于这个公式的自由变量的值之外。

代谢组学数据处理方法_主成分分析

代谢组学数据处理方法_主成分分析

代谢组学数据处理方法_主成分分析主成分分析的基本原理是寻找数据的主要变化方向,即主成分。

主成分是样本点在高维空间中的映射,其具有最大的方差。

通过将数据映射到主成分上,可以减少数据的维度,并捕捉到数据主要的变化模式。

主成分分析的结果可以用于数据的可视化和进一步的统计分析。

主成分分析的步骤如下:1.数据预处理:包括数据清洗、归一化和去除异常值等,以确保数据的准确性和可靠性。

2.计算协方差矩阵:协方差矩阵反映了不同变量之间的相关性。

通过计算协方差矩阵,可以获得变量之间相关性的度量。

3.计算特征值和特征向量:通过对协方差矩阵进行特征值分解,可以得到特征值和对应的特征向量。

特征值表示对应特征向量的重要程度,特征向量表示主成分的方向。

4.选择主成分:按照特征值的大小选择前k个主成分,其中k为需要降低的维度。

通常选择前几个特征值之和占总特征值之和的90%以上作为阈值。

5.计算得分:通过将数据映射到选择的主成分上,计算每个样本在主成分上的得分。

得分表示样本在主成分上的投影位置。

6.数据可视化:将数据样本的得分绘制在二维或三维图中,可以直观地展示数据在主成分上的分布情况。

7.解释主成分:通过分析主成分的特征向量,可以解释主要的变异模式和相关因素。

主成分分析在代谢组学数据处理中的应用广泛。

首先,主成分分析可以降低数据的维度,减少变量的数量,从而减少数据的复杂性。

其次,主成分分析可以挖掘数据中的主要信息和变化模式,有助于发现组间和组内的差异。

此外,主成分分析还可以用于数据的可视化,将高维数据映射到二维或三维图中,更直观地观察和解读数据。

总结起来,主成分分析是代谢组学数据处理中常用的方法之一,通过降维和可视化,可以更好地理解和解释复杂的代谢组学数据。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

主成分分析的计算步骤
样本观测数据矩阵为:
⎪⎪⎪⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛=np n n p p x x x x x x x x x X 21
2222111211 第一步:对原始数据进行标准化处理
)var(*j j
ij ij x x x x -= ),,2,1;,,2,1(p j n i ==
其中 ∑==n
i ij j x n x 1
1 21
)(11)var(j n
i ij j x x n x --=∑= ),,2,1(p j =
第二步:计算样本相关系数矩阵
⎥⎥⎥⎥⎥⎦
⎤⎢⎢⎢⎢⎢⎣⎡=pp p p p p r r r r r r r r r R 212222111211 为方便,假定原始数据标准化后仍用X 表示,则经标准化处理后的数据的相关系数为:
tj n
t ti ij x x n r ∑=-=1
11 ),,2,1,(p j i =
第三步:用雅克比方法求相关系数矩阵R 的特征值(p λλλ 21,)和相应的特征向量()p i a a a a ip i i i 2,1,,,21==。

第四步:选择重要的主成分,并写出主成分表达式
主成分分析可以得到p 个主成分,但是,由于各个主成分的方差是递减的,包含的信息量也是递减的,所以实际分析时,一般不是选取p 个主成分,而是根据各个主成分累计贡献率的大小选取前k 个主成分,这里贡献率就是指某个主成分的方差占全部方差的比重,
实际也就是某个特征值占全部特征值合计的比重。


贡献率=∑=p i i
i

λ 贡献率越大,说明该主成分所包含的原始变量的信息越强。

主成分个数k 的选取,主要根据主成分的累积贡献率来决定,即一般要求累计贡献率达到85%以上,这样才能保证综合变量能包括原始变量的绝大多数信息。

另外,在实际应用中,选择了重要的主成分后,还要注意主成分实际含义解释。

主成分分析中一个很关键的问题是如何给主成分赋予新的意义,给出合理的解释。

一般而言,这个解释是根据主成分表达式的系数结合定性分析来进行的。

主成分是原来变量的线性组合,在这个线性组合中个变量的系数有大有小,有正有负,有的大小相当,因而不能简单地认为这个主成分是某个原变量的属性的作用,线性组合中各变量系数的绝对值大者表明该主成分主要综合了绝对值大的变量,有几个变量系数大小相当时,应认为这一主成分是这几个变量的总和,这几个变量综合在一起应赋予怎样的实际意义,这要结合具体实际问题和专业,给出恰当的解释,进而才能达到深刻分析的目的。

第五步:计算主成分得分
根据标准化的原始数据,按照各个样品,分别代入主成分表达式,就可以得到各主成分下的各个样品的新数据,即为主成分得分。

具体形式可如下。

⎪⎪⎪⎪⎪⎭
⎫ ⎝⎛nk n n k k F F F F F F F F F 212222111211 第六步:依据主成分得分的数据,则可以进行进一步的统计分析
其中,常见的应用有主成份回归,变量子集合的选择,综合评价等。

相关文档
最新文档