高性能计算机和曙光集群系统

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高性能计算机和曙光GHPC1000集群系统.

高性能计算机和曙光GHPC1000集群系统.

系统整体配置
节点:
计算节点1(A620r-T): 43×2=86台 GPU显卡:GTX295
计算节点2(A620r-T): 16×2=32台 GPU显卡:C1060
IO节点(A620-H):1台
存储:
DS6310EE 容量:
1台 16TB
网络:
计算网:
Infiniband 36口IB交换机
集成ES1000图形控制器 32MB显存
600W 电源
可选IPMI管理卡
说明:均为Low Profile扩展卡。 可选1+1冗余电源
核心架构图
DS6310EE/DS6312EE
• SAS-SAS磁盘阵列,单控/双控; • 处理器:Intel IOP 341,主频1.2GHz • 接口 :每控制器 4个SAS 4×主机端口,1个SAS 4×扩展接口 • 驱动器接口 :SAS ,支持SAS/SATA硬盘 • Raid级别:0、1、1E、5、6、50、60 • 热插拔控制器;DS6310EE单控,DS6312EE冗余双控; 每控制器512
内存:16GB DDR2-667 硬盘:1×146GB SAS 热插拔 HBA:1×12Gb/s SAS 4x HBA卡 网络:2×千兆 IB:20Gb IB HCA
磁盘阵列
曙光DS6310EE盘阵(16T):
企业级存储系统,热插拔Raid控 制器
性能:4个SAS 4x主机通道 扩展性:最大扩展至80个驱动器 可靠性:Cache镜像及掉电保护 容量:16块1TB SATA磁盘
详见配置表
系统整体拓扑图
计算结点1:A620r-T
曙光GPU计算节点A620r-T:43台
GPU处理单元:1×Nvidia GTX295 GPU卡

高性能计算(HPC)概况及应用介绍

高性能计算(HPC)概况及应用介绍

【一】高性能计算概述
计算机发展时间线:
➢ 第二代计算机,1959-1964,大量 采用晶体管和印刷电路板,体积 不断减小,功能不断增强,并出 现大量应用软件;
➢ 第三代计算机,1964-1972,大量 使用集成电路,以IBM360系列为代 表;
【一】高性能计算概述
计算机发展时间线:
➢ 第四代计算机,1972-至今,基于大规模集成电路及超大规模集成电路。1976年, Cray-1,第一台商用高性能计算机问世,集成了20万个晶体管,每秒可进行1.5 亿次浮点运算。
1、能耗分析 相同节点浸没液冷服务器方案功耗比风冷服务器方案低80%,其节能效果明显。 通过计算,其PUE值也明显低于风冷服务器方案。 浸没式液冷服务器PUE=1.046 风冷服务器PUE=1.361 2、占地面积分析 以上表格所指面积为投影面积,由此可见,同等节点服务器部署,浸没液冷服务 器方案比风冷服务器方案节约用地约85%。
2013年5月14日,安吉丽娜·朱莉在自 己写的文章《我的医疗选择》中称自己通 过基因检测确定带遗传缺陷基因BRCA1,医 生估测她患乳腺癌和卵巢癌的几率颇高, 分别为87%和50%,朱莉选择双侧乳腺切除 术保留乳房,降低患癌风险。2015年3月24 日,安吉丽娜·朱莉宣布,由于担心罹患卵 巢癌,她已经切除了卵巢和输卵管。
【三】高性能计算应用与展望
高性能计算之气象学研究:
气候环境研究是高性能计算领域的 传统应用,世界上第一台电子计算机 ENIAC就曾被用来进行天气预报,由于 气象相关预报往往关系到农业、工业、 军事、交通等众多核心关键业务,同时 预报天气所需要的计算能力非常高,因 此世界上最先进的高性能计算机通常都 被用来运行大规模的数值计算与气候模 拟应用。

我国巨型机研发概述

我国巨型机研发概述

我国巨型机发展史简述巨型机(巨型计算机,supercomputer)是一种超大型电子计算机。

我国对高性能计算机的研制,经过20多年的努力以取得丰硕成果。

以国防大学计算机学院牵头研制的“银河”系列巨型机,以中科院计算所国家智能计算机研究开发中心和曙光公司牵头研制的“曙光”系列巨型机,以国家计算机工程技术研究中心牵头研制的“神威”系列巨型机,以中国联想公司牵头研制的“深腾”系列巨型机,以深圳大学和清华大学牵头研制的“深超”系列巨型机的出现,使我国成为继美国、日本之后,第3个具备研制10万亿次/s巨型机能力的国家。

1“银河”系列巨型机银河—Ⅰ1983年11月我国第一台被命名为“银河”的亿次巨型电子计算机,历经5年,在国防科技大学诞生了。

它的研制成功,向全世界宣布:中国成了继美、日等国之后,能够独立设计和制造巨型机的国家。

银河—Ⅱ1992年11月19日,由国防科技大学研制的“银河—Ⅱ”10亿次巨型计算机在长沙通过国家鉴定。

填补了我国面向大型科学工程计算和大规模数据处理的并行巨型计算机的空白。

银河—Ⅲ1997年6月19日,由国防科技大学研制的“银河—Ⅲ”并行巨型计算机在京通过国家鉴定。

该机采用分布式共享存储结构,面向大型科学与工程计算和大规模数据处理,基本字长64位,峰值性能为130亿次。

该机有多项技术居国内领先,综合技术达到当前国际先进水平。

2“曙光”系列巨型机1990年3月,国家科委正式批准建立国家智能计算机研究开发中心。

智能中心成立后,经过短暂的几年工作,即陆续向市场推出了"曙光"并行机系列产品,为促进我国高档计算机产业化做出了重大贡献。

曙光1号1993年10月,曙光成功地推出了第一台SMP 结构计算机——"曙光1号"。

这是作为"863计划"智能计算机专家组的一员,曙光公司创史人李国杰率领五位年轻人每天工作16个小时,苦战10个月研制出的高性能计算机。

回顾中国超级计算机研发历程 美国人总是震惊

回顾中国超级计算机研发历程 美国人总是震惊

“天河二号”获全球超级计算机500强三连冠2014年06月24日09:51:47 新华信息化新华网华盛顿6月23日电(记者林小春)国际TOP500组织23日公布了最新的全球超级计算机500强排行榜,中国的“天河二号”超级计算机以比第二名美国“泰坦”超级计算机快近一倍的速度,连续第三次获得冠军。

TOP500榜单每半年发布一次。

自去年6月以来,“天河二号”就以每秒33.86千万亿次的浮点运算速度稳居榜首。

除了芯片技术外,这一系统大多由中国自主研发。

美国能源部下属橡树岭国家实验室的“泰坦”则连续3次屈居亚军,其浮点运算速度为每秒17.59千万亿次。

第三名至第五名分别是美国劳伦斯-利弗莫尔国家实验室的“红杉”、日本理化研究所的“京”和美国阿尔贡国家实验室的“米拉”,这一排名与上一期榜单无异。

与上一期相比,前十名的唯一变化是第十名,新入选的是隶属于美国政府的“克雷”XC30超级计算机,其运算速度不到“天河二号”的十分之一。

国际TOP500组织在一份声明中说,从榜单看,“超级计算机的整体性能提升速度已降至历史最低点”。

例如,在1994年至2008年间,榜单最后一名的计算性能平均每年提升90%,而过去5年每年只提升了55%。

从整个榜单来看,美国进入前500强的超级计算机从上一期的265个下降至本期的233个,但优势依然明显。

第二名中国大陆则从63个增至76个。

日本和英国分别以30台并列第三。

超级计算机是国家科研的重要基础工具,在地质、气象、石油勘探等领域的研究中发挥关键作用,也是汽车、航空、化工、制药等行业的重要科研工具。

TOP500榜是对全球已安装的超级计算机“排座次”的最知名排行榜。

从1993年起,由国际TOP500组织以实测计算速度为基准每年发布两次。

广州跻身国家级超级计算中心行列天河二号超级计算机在穗全面运行2014年06月29日19:52:28 新华网新华网广州6月29日电(记者陈冀)国家超级计算广州中心应用推广大会6月29日在广州召开,科学技术部副部长曹健林向广州超级计算中心授予了“国家超级计算广州中心”和“中国(广州)计算科学服务中心”牌匾,这标志着广州跻身国家级超级计算中心行列。

如何配置超级计算机集群

如何配置超级计算机集群

如何配置超级计算机集群超级计算机集群是一种由多个高性能计算机组成的并行计算系统,能够同时处理大规模的数据和复杂的计算任务。

配置超级计算机集群需要考虑硬件、网络架构、软件和管理等多个方面。

在本文中,我们将介绍如何配置一个高效可靠的超级计算机集群。

首先,超级计算机集群的硬件配置是非常重要的。

关键的硬件包括服务器、存储设备和网络设备。

服务器的选择应基于计算需求和预算限制。

在挑选服务器时,需要考虑处理器速度、内存容量和硬盘容量。

对于大规模的计算任务,可以考虑选择多个高性能处理器和大容量内存的服务器。

此外,存储设备的选择也非常重要,可以使用硬盘阵列或闪存盘等高速存储设备来提高计算效率。

对于超级计算机集群的网络架构,建议使用高速的以太网或InfiniBand网络,以实现快速的数据传输和通信。

其次,超级计算机集群的软件配置也至关重要。

首先,操作系统的选择非常重要。

大多数超级计算机集群使用Linux操作系统,因为Linux具有良好的性能和稳定性。

其次,需要安装并配置集群管理软件,如Slurm或OpenPBS,以便有效地管理和调度计算任务。

此外,还可以安装并配置分布式文件系统,如Lustre或GPFS,以提供高性能的文件存储和共享。

另外一个重要的方面是集群的管理。

这包括集群的部署、监控和维护。

部署集群时,需要进行硬件和软件的安装、配置和测试。

在集群运行期间,需要进行实时监控和故障排除,以确保集群正常运行。

同时,还需要定期进行维护工作,如更新操作系统和软件、优化配置和性能调整等。

此外,还需要设置合适的权限和安全措施,以保护集群的安全和数据的保密性。

最后,为了充分利用超级计算机集群的计算能力,还需要进行任务调度和并行编程的优化。

任务调度是指通过合理的资源分配和任务安排,提高集群的整体效率。

通常,可以使用集群管理软件提供的调度器来实现任务调度。

而并行编程的优化则是通过将程序划分为多个并行任务,利用集群的多个节点和多个处理器来加速计算过程。

关于超级计算机

关于超级计算机

超级计算机超级计算机通常是指由数百数千甚至更多的处理器(机)组成的、能计算普通PC机和服务器不能完成的大型复杂课题的计算机。

为了帮助大家更好的理解超级计算机的运算速度我们把普通计算机的运算速度比做成人的走路速度,那么超级计算机就达到了火箭的速度。

在这样的运算速度前提下,人们可以通过数值模拟来预测和解释以前无法实验的自然现象。

中国超级计算机“天河一号”超级计算机技术超级计算机技术已不再是一个新鲜的话题,美国IBM、日本NEC、中国曙光都已推出自己的超级计算机,但比较而言,以美国两院院士、“世界超级涡轮式刀片计算机之父”陈世卿博士为首的专家团队回归祖国后研发出的超级计算机仍然具有绝对的优势。

新一代的超级计算机采用涡轮式设计,每个刀片就是一个服务器,能实现协同工作,并可根据应用需要随时增减。

单个机柜的运算能力可达460.8千亿次/秒,理论上协作式高性能超级计算机的浮点运算速度为100万亿次/秒,实际高性能运算速度测试的效率高达84.35%,是名列世界最高效率的超级计算机之一。

通过先进的架构和设计,它实现了存储和运算的分开,确保用户数据、资料在软件系统更新或CPU升级时不受任何影响,保障了存储信息的安全,真正实现了保持长时、高效、可靠的运算并易于升级和维护的优势。

目前(2010年10月)世界最快超级计算机为天津国家超级计算机中心的天河-1A,速度为每秒2.5千万亿次,据悉该计算机采用了逾7000个英伟达生产的图形芯片由日本政府出资、富士通制造的巨型计算机“K Computer”目前落户于日本理化研究所,并成功从中国手中夺回运算速度排行榜第一的宝座。

日本的超级计算机首次重返第一。

“K Computer”当前运算速度为每秒8000万亿次,而到2012年完全建成时,其运算速度将达到每秒一万万亿次。

“K Computer”比现居第二的中国超级计算机速度快出约3倍,甚至比排名第2至第6的计算机运算速度总和还要快。

曙光HPC业务介绍

曙光HPC业务介绍

曙光HPC业务介绍曙光HPC业务介绍1.1.1曙光是HPC市场的领导者曙光公司为⾼性能计算⾏业领先品牌,是专业的⾼性能计算机及⾼性能计算解决⽅案提供商,拥有曙光4000、曙光5000、曙光“星云”等超级计算机的研制和运维经验,在⾼性能计算各应⽤领域和⾏业拥有众多的成功案例。

1.1.1.1中国⾼性能计算机TOP100排⾏榜中国⾼性能计算机TOP100排⾏榜由中国软件⾏业协会数学软件分会、国家863⾼性能计算机评测中⼼和中国计算机学会⾼性能计算专业委员会联合公开发布,⾃2002年起,中国⾼性能计算TOP100排⾏榜每年公开发布。

现发布地址为/doc/9b99b150b80d6c85ec3a87c24028915f804d84bb.html /、各⼤公共媒体以及每年的“全国⾼性能计算学术年会”。

该评测及排⾏榜发布得到国家863“⾼效能计算机及⽹格服务环境”重⼤专项课题,《⾼效能计算机系统测评技术研究》( No.2006AA01A105)的资助。

2009-2015最近的连续7年,曙光均领先其他国内和国际⼚商,占据TOP100数量份额第⼀。

图:2009-2015年中国⾼性能计算TOP100数量份额统计(数据来源:/doc/9b99b150b80d6c85ec3a87c24028915f804d84bb.html /)图:2009年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀图:2010年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀图:2011年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀图:2012年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀图:2013年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀图:2014年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀图:2015年中国⾼性能计算机TOP100曙光获得年度总份额第⼀1.1.1.2全球⾼性能计算机TOP500排⾏榜TOP500计划是针对全球已知最强⼤的计算机系统做出排名与详细介绍。

巨型计算机发展情况

巨型计算机发展情况

我国巨型计算机系列发展情况简介巨型计算机的研制水平、生产能力和应用程度,标志着一个国家科学技术的水平和工业发展的程度,象征着一个国家的综合实力。

特别是关系到国家安全的尖端科学领域,巨型计算机的战略地位显得尤为突出。

目前能生产巨型计算机的国家为:美国、日本、俄罗斯、法国、英国、德国、中国等几个国家。

银河系列巨型计算机是中国人民解放军国防科技大学计算机研究所研制的巨型计算机。

目前在国际上达到了先进水平,突破和掌握了更高量级计算机的关键技术,具备了研制更高性能巨型计算机的能力,标志着我国高性能巨型机研制技术取得新突破。

必将对我国国民经济建设、国防建设和科学事业的发展,产生巨大的推动力。

当前,一些发达国家正在进行准备研制万亿次甚至更高速度的巨型计算机,届时精确描绘自然界某些复杂现象的瞬时图象将会呈现在人们面前。

第一代银河─Ⅰ巨型计算机1983年12月银河—Ⅰ巨型计算机在长沙国防科技大学研制成功。

它的诞生标志着我国已跨入了国际计算机领域的先进行列,银河—Ⅰ巨型计算机的运行速度达每秒钟1亿次。

它的研制成功证明了我国已具备了研制高性能、大规模并行巨型机的能力,是我国高技术领域取得的一次重大成果。

第二代银河—Ⅱ巨型计算机1992年11月19日银河—Ⅱ巨型计算机在长沙国防科技大学研制成功。

它的运行速度每秒钟达10亿次。

第三代银河—Ⅲ巨型计算机1997年6月19日银河—Ⅲ巨型计算机在北京通过了国家技术鉴定。

它的研制成功,使我国在这个领域跨入了世界先进行列。

银河—Ⅲ巨型计算机采用了目前国际最新的可扩展多功能处理机并行体系结构,成功设计了由硬件支持的全系统共享访存机制,实现了全局共享分布存储结构。

银河—Ⅲ巨型计算机的整体性能优异,系统软件高效,网络计算环境强大,可靠性设计独特,工程设计优良,运算速度为每秒钟130亿次,综合处理能力是银河—Ⅱ的10倍以上,而体积仅为银河—Ⅱ巨型机的六分之一。

每秒运算4000亿次预报一个月天气仅用15分钟我国研制出超级服务器北京2001年2月17日电:最高运算速度达每秒4032亿次、内存总量达168GB……经过辛勤努力,中国科学院计算机技术研究所近日成功研制出“曙光3000”超级服务器,是继“曙光1000”和“曙光2000”之后我国高性能计算机领域中的又一里程碑,是我国迄今性能最高的国产超级服务器。

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– SISD(Single-Instruction Single-Data) – SIMD(Single-Instruction Multi-Data) – MISD(Multi-Instruction Single-Data) – MIMD(Multi-Instruction Multi-Data)
• Cluster
– 每个节点都是一个完整的计算 机
– 各个节点通过高性能网络相互 连接
– 网络接口和I/O总线松耦合连 接
– 每个节点有完整的操作系统 – 曙光2000、 3000、4000,
ASCI Blue Mountain
UMA: NUMA:
访存模型
NORMA:
多处理机(单地址空间共享存储器) UMA: Uniform Memory Access NUMA: Nonuniform Memory Access
高性能计算机系统架构
➢ 并行向量机 ➢ SMP ➢ DSM(NUMA) ➢ MPP,节点可以是单处理器的节点,也可以是SMP,
DSM ➢ Cluster ➢ Constellation
高性能计算机的制造厂商
➢ Cray ➢ SGI ➢ IBM
➢ 曙光 ➢ 银河 ➢ 神威
并行计算机系统类型
➢ Flynn分类:
现代高性能计算机都属于MIMD。MIMD从结构上和访 存方式上,又可以分为:
– 结构模型:PVP, SMP, MPP, DSM, COW – 访存模型:UMA, NUMA, COMA, CC-NUMA, NORMA结构模型对称多处理机系统(SMP)
• SMP
– 对称式共享存储:任意处理器 可直接访问任意内存地址,且 访问延迟、带宽、机率都是等 价的; 系统是对称的;
– 与SMP的主要区别:DSM在物理上有 分布在各个节点的局部内存从而形 成一个共享的存储器;
– 微处理器: 16-128个,几百到千亿 次;
– 代表: SGI Origin 2000, Cray T3D;
大规模并行计算机系统(MPP)
• MPP
– 物理和逻辑上均是分布内存 – 能扩展至成百上千个处理器(
为什么要做高性能计算 ——应用需求
为什么要做高性能计算
➢ 人类对计算及性能的要求是无止境的
✓ 从系统的角度:集成系统资源,以满足不断增长的对 性能和功能的要求
✓ 从应用的角度:适当分解应用,以实现更大规模或更 细致的计算
➢ 问题: 科学和工程问题的数值模拟与仿真
✓ 计算密集 ✓ 数据密集 ✓ 网络密集 ✓ 三种混合
其发展历程可以简单的分为两个时代
➢ 专用时代
包括向量机,MPP系统,SGI NUMA 系统,SUN大型SMP系统,也包括我国的神 威,银河,曙光1000等。 之所以称为“专用”,并不是说它们只能运行某种应用,是指它们的组成部 件是专门设计的,它们的CPU板,内存板,I/O板,操作系统,甚至I/O系统, 都是不能在其它系统中使用的。由于技术上桌面系统与高端系统的巨大差异, 和用户群窄小。
高性能计算机和曙光机群系统
提纲
➢ 什么是高性能计算 ➢ 什么是高性能计算机 ➢ 集群系统
什么是高性能计算?
➢ 高性能计算
✓ HPC:High Performance Compute
➢ 高性能计算---并行计算
✓ 并行计算(Parallel Computing) ✓ 高端计算(High-end Parallel
– 微处理器: 一般少于64个; – 处理器不能太多, 总线和交叉
开关的一旦作成难于扩展; – 例子: IBM R50, SGI Power
Challenge, SUN Enterprise, 曙光一号;
分布式共享存储系统(DSM)
• DSM
– 分布共享存储: 内存模块物理上局 部于各个处理器内部,但逻辑上(用 户)是共享存储的; 这种结构也称 为基于Cache目录的非一致内存访 问(CC-NUMA)结构;局部与远程内存 访问的延迟和带宽不一致,3-10倍 高性能并行程序设计注意;
多计算机(多地址空间非共享存储器) NORMA: No-Remote Memory Access
➢ 普及时代
高性能计算机价格下降,应用门槛降低,应用开始普及。两个技术趋势起到 重要作用。 商品化趋势使得大量生产的商品部件接近了高性能计算机专有部件 标准化趋势使得这些部件之间能够集成一个系统中,其中X86处理器、以太网、 内存部件、Linux都起到决定性作用。 机群系统是高性能计算机的一种,它的技术基础和工业基础都是商品化和标 准化。
✓ SISD, SIMD, MIMD, MISD
➢ 结构模型:
✓ PVP, SMP, MPP, DSM, COW
➢ 访存模型:
✓ UMA, NUMA, COMA, CC-NUMA, NORMA
并行计算机分类
Flynn分类
Flynn(1972)提出指令流、数据流和多倍性概念,把不同的计算机分 为四大类:
Computing) ✓ 高性能计算(High Performance
Computing) ✓ 超级计算(Super Computing)
什么是高性能计算?
➢ 计算科学与传统的两种科学,即理论科学和实 验科学,并立被认为是人类认识自然的三大支 柱,他们彼此相辅相成地推动科学发展与社会 进步。在许多情况下,或者是理论模型复杂甚 至理论尚未建立,或者实验费用昂贵甚至无法 进行时,计算就成了求解问题的唯一或主要的 手段。
微处理器或向量处理器) – 采用高通信带宽和低延迟的互
联网络 (专门设计和定制的) – 一种异步的MIMD机器;程序系
由多个进程组成,每个都有其 私有地址空间,进程间采用传 递消息相互作用; – 代表:CRAY T3E(2048), ASCI Red(3072), IBM SP2, 曙光 1000
机群系统(Cluster)
提纲
➢ 高性能市场概要 ➢ 曙光和高性能计算机 ➢ 什么是高性能计算 ➢ 什么是高性能计算机 ➢ 集群系统
什么是高性能计算机?
由多个计算单元组成,运算速度快、存储容量大、 可靠性高的计算机系统。
也称为:巨型计算机、超级 计算机
目前任何高性能计算和超级 计算都离不开使用并行技术, 所以高性能计算机肯定是并 行计算机。
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