免疫共沉淀操作步骤
蛋白质免疫共沉淀步骤

蛋白质免疫共沉淀步骤
蛋白质免疫共沉淀是一种用于检测蛋白质相互作用的实验方法,其步骤通常包括以下几个方面:
1. 样品制备,首先需要准备含有目标蛋白质的样品,可以是细
胞提取物或者纯化的蛋白质溶液。
样品需要经过适当的处理,比如
离心、裂解等,以提取目标蛋白质。
2. 抗体结合,将目标蛋白质的抗体固定在载玻片、琼脂糖珠或
磁珠等固相载体上,形成免疫复合物。
3. 共沉淀,将制备好的抗体-蛋白质复合物与样品混合,允许
它们发生特异性结合,形成免疫共沉淀复合物。
4. 洗涤,对免疫共沉淀复合物进行洗涤,以去除非特异性结合
的蛋白质和其他杂质。
5. 蛋白质溶解,将免疫共沉淀复合物溶解于适当的缓冲液中,
以便后续的分析。
6. 分析,最后,可以使用Western blot、质谱分析、酶联免疫吸附实验(ELISA)等技术对共沉淀的蛋白质进行检测和分析。
这些步骤可以帮助研究人员确定目标蛋白质与其他蛋白质的相互作用,从而揭示细胞信号传导、蛋白质复合物组装等重要生物学过程。
同时,在进行蛋白质免疫共沉淀实验时,需要严格控制实验条件,选择合适的抗体以及适当的质控措施,以确保实验结果的准确性和可重复性。
染色质免疫共沉淀(ChIP)实验具体方法及步骤

染色质免疫共沉淀(ChIP)实验具体方法及步骤在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。
IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。
目前多用精制的prorein A预先结合固化在argarose的beads上,使之与含有抗原的溶液及抗体反应后,beads上的prorein A就能吸附抗原达到精制的目的。
一、细胞的甲醛交联与超声破碎(第一天)1. 取出1平皿细胞(10 cm平皿),加入243 ul 37%甲醛,使得甲醛的终浓度为1%(培养基共有9 ml)。
2. 37℃孵育10 min。
3. 终止交联:加甘氨酸至终浓度为0.125 M。
450 ul 2.5 M甘氨酸于平皿中。
混匀后,在室温下放置5 min即可。
4. 吸尽培养基,用冰冷的PBS清洗细胞2次。
5. 细胞刮刀收集细胞于15 ml离心管中(PBS依次为5 ml,3 ml和3 ml)。
预冷后2 000 rpm 5 min收集细胞。
6. 倒去上清。
按照细胞量,加入SDS Lysis Buffer。
使得细胞终浓度为每200ul含2x106个细胞。
这样每100 ul溶液含1x106个细胞。
再加入蛋白酶抑制剂复合物。
假设MCF7长满板为5x106个细胞。
本次细胞长得约为80%。
即为4x106个细胞。
因此每管加入400 ul SDS Lysis Buffer。
将2管混在一起,共800 ul。
7. 超声破碎:VCX750,25%功率,4.5 s冲击,9 s间隙。
共14次。
二、除杂及抗体哺育(第一天)1. 超声破碎结束后,10 000 g 4℃离心10 min。
去除不溶物质。
2. 留取300ul做实验,其余保存于-80℃。
3. 300 ul中,100 ul加抗体做为实验组;100 ul不加抗体做为对照组;100 ul加入4 ul 5 M NaCl(NaCl终浓度为0.2 M),65℃处理3 h解交联,跑电泳,检测超声破碎的效果。
rna免疫共沉淀实验步骤

rna免疫共沉淀实验步骤
RNA免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation)是一种常用于研究RNA与蛋白质相互作用的实验方法。
通过该实验可以确定RNA分子与特定蛋白质的结合情况,从而揭示RNA在细胞内的功能及调控机制。
下面将介绍RNA免疫共沉淀实验的步骤。
1. 细胞培养和处理,首先,将感兴趣的细胞系培养至适当的密度,然后进行处理,如添加药物、激素或其他刺激剂,以诱导RNA 与蛋白质的相互作用。
2. 交联,将细胞用交联剂(如甲醛)进行交联,以稳定RNA与蛋白质的相互作用。
3. 细胞裂解,将交联后的细胞裂解,并用裂解缓冲液溶解细胞膜,释放细胞内的RNA与蛋白质。
4. 免疫沉淀,将特异性抗体与蛋白A/G琼脂糖磁珠或琼脂糖珠结合,形成抗体-琼脂糖复合物。
然后将裂解液与抗体-琼脂糖复合物共孵育,使特定蛋白质与其结合的RNA被抗体-琼脂糖复合物沉淀下来。
5. 洗涤,经过免疫沉淀后,对琼脂糖磁珠进行多次洗涤,以去除非特异性结合的RNA和蛋白质。
6. RNA的提取,用三氯化锑或其他方法从琼脂糖磁珠上提取RNA。
7. RNA的分析,提取的RNA可以通过RT-qPCR、Northern blotting等方法进行定量或质量分析,从而确定RNA与特定蛋白质的结合情况。
通过RNA免疫共沉淀实验,研究人员可以揭示RNA与蛋白质的相互作用,从而深入了解RNA在细胞内的功能及调控机制。
这一实验方法对于研究RNA的生物学功能和疾病机制具有重要意义。
免疫共沉淀原理及步骤

免疫共沉淀原理及步骤
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)原理:是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。
是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)步骤:
✧配制100 ml 的modified RIPA buffe:
✧称取790 mg 的Tris-Base,加到75 ml 去离子水中,加入900
mg 的NaCl,搅拌,直到全部溶解,用HCl 调节PH 值到7.4;
✧加10 ml 10% 的NP-40;
✧加2.5 ml 10% 的去氧胆酸钠,搅拌,直到溶液澄清;
✧加1 ml 100 mM 的EDTA,用量筒定容到100 ml,2~8 ℃保
存;
✧理论上,蛋白酶和磷酸酯酶抑制剂应该在使用当天同时加入(抑
蛋白酶肽,亮抑酶肽, 胃蛋白酶抑制剂各100 μl;PMSF,Na3VO4,NaF 各500 μl),但是PMSF 在水溶液中很不稳定,
30 分钟就会降解一半,所以PMSF 应该在使用前现加,其他抑
制剂成分可以在水溶液中稳定 5 天。
染色体免疫共沉淀(chip)步骤

染色体免疫共沉淀(chip)步骤
染色体免疫共沉淀(ChIP)是一种常用的实验技术,用于研究染色体上特定蛋白质与DNA的相互作用。
以下是染色体免疫共沉淀的基本步骤:
1. 交联:将细胞或组织与形成蛋白质-DNA复合物的交联剂(如甲醛)处理,使蛋白质与DNA之间形成致密的交联。
这一步骤有助于保持蛋白质与DNA的相互作用并固定其在细胞或组织中的位置。
2. 细胞破碎和核裂解:将交联后的细胞或组织进行破碎和核裂解,以释放细胞内的染色质。
这可以通过机械方法(如超声波处理)或化学方法(如利用细胞裂解缓冲液和蛋白酶进行破碎)完成。
3. 免疫共沉淀:在破碎的细胞或组织提取物中,加入特异性抗体,该抗体可以与目标蛋白质结合。
免疫抗体与目标蛋白质形成免疫复合物,并与形成蛋白质-DNA复合物的目标区结合。
4. 洗涤:通过一系列洗涤步骤,去除非特异性和非特定结合的蛋白质和核酸,以减少背景信号的干扰。
5. 解交联:通过加热或酶处理等方法,解除细胞或组织中的蛋白质-DNA交联,并将DNA释放出来。
6. DNA提取:通过加入DNA提取缓冲液和有机溶剂,从溶液中沉淀出DNA,并用适当的方法进行纯化和浓缩。
7. 分析:对提取的DNA进行进一步的分析,可使用PCR、测序等技术,以检测免疫共沉淀的蛋白质与目标DNA的相互作用。
这些步骤旨在允许研究人员从细胞或组织中获得特定蛋白质与DNA的结合信息,并进一步了解基因调控、表观遗传学等相关的生物学过程。
实际操作时,具体的步骤和条件可能会因实验目的和样本类型而有所不同。
因此,在进行染色体免疫共沉淀实验时,建议参考相关文献和实验室经验,以确保实验的准确性和
可重复性。
免疫共沉淀实验方法

免疫共沉淀实验方法免疫共沉淀实验方法是一种常用的蛋白质相互作用研究方法,通过利用抗体与目标蛋白之间的特异性结合来寻找与目标蛋白相互作用的蛋白质。
下面将详细介绍免疫共沉淀实验方法的步骤和注意事项。
步骤一:制备样品首先需要制备含有目标蛋白的样品,可以是细胞提取物、组织提取物或纯化的蛋白。
样品需要在低温下保存,并在实验前加入适量的蛋白酶抑制剂和磷酸酯酶抑制剂以保持蛋白的完整性。
步骤二:制备抗体制备抗体需要选择与目标蛋白特异性结合的抗体,可以是单克隆抗体或多克隆抗体。
抗体需要在低温下保存,并在实验前进行免疫球蛋白纯化和浓度调整。
步骤三:免疫共沉淀实验1. 将制备好的样品加入到含有抗体的蛋白A/G琼脂糖中,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置2小时或过夜。
2. 将混合物加入到预先平衡好的蛋白A/G琼脂糖中,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置2小时或过夜。
3. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
4. 重复步骤3,洗涤3次。
5. 加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
6. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
7. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
8. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
9. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
10. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
11. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
12. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
13. 将琼脂糖用离心管离心,去除上清液,加入洗涤缓冲液,轻轻摇晃混合,放置在4℃下静置10分钟。
免疫共沉淀的详细步骤及方法

免疫共沉淀的详细步骤及方法1.实验准备在进行免疫共沉淀实验前,需要准备实验所需的材料和试剂。
这些材料和试剂包括:抗体,控制抗体,细胞提取液,蛋白质提取缓冲液,蛋白质裂解缓冲液,洗涤缓冲液,沉淀缓冲液,蛋白质样品等。
2.细胞提取及蛋白质提取收集待测细胞,用适当的缓冲液洗涤细胞,并用蛋白质提取缓冲液提取细胞内的蛋白质。
可利用机械或化学方法破裂细胞膜,释放细胞内的蛋白质。
3.预清洗和前处理将蛋白质提取物进行预清洗,以去除非特异性结合物和杂质蛋白质。
预清洗通常包括四次的离心洗涤步骤,使用洗涤缓冲液。
4.抗体交联将抗体与蛋白质提取物进行交联。
将目标抗体或控制抗体与预清洗后的蛋白质提取物特异性结合,并通过化学或免疫学方法交联两者。
5.免疫沉淀实验将交联后的样品经过免疫沉淀实验。
将抗体/蛋白质复合物与蛋白质A/G琼脂糖珠或其他免疫沉淀剂结合,使复合物与琼脂糖珠发生特异性结合。
6.洗涤和收集将免疫沉淀后的琼脂糖珠用洗涤缓冲液进行洗涤,去除非特异性结合物质。
洗涤次数通常为3-5次,每次洗涤约10分钟。
7.热处理和蛋白质裂解将洗涤后的琼脂糖珠在蛋白质裂解缓冲液中进行热处理。
将琼脂糖珠加入含有蛋白酶抑制剂和变性剂的裂解缓冲液中,使蛋白质从琼脂糖珠上释放出来。
8. SDS-和Western Blot分析使用SDS-技术对裂解后的蛋白质进行分离,然后进行Western Blot 分析。
Western Blot分析是通过将蛋白质转移到膜上,并使用特定的抗体进行探测,来检测特定蛋白质。
9.数据分析根据Western Blot结果来分析免疫共沉淀实验结果。
可以通过探测特定蛋白质的存在与否,以及与其他蛋白质的互作情况来推断蛋白质间的相互作用或复合物的形成。
总结免疫共沉淀是一种广泛应用于研究蛋白质结构和功能的实验技术。
其详细步骤包括:细胞提取和蛋白质提取,预清洗和前处理,抗体交联,免疫沉淀实验,洗涤和收集,热处理和蛋白质裂解,SDS-和Western Blot 分析,以及数据分析。
免疫共沉淀操作步骤

免疫共沉淀操作步骤免疫共沉淀(immunoprecipitation)是一种常用的实验技术,用于检测特定蛋白与其他分子的相互作用。
本文将介绍免疫共沉淀的操作步骤,包括前期准备、取样、免疫共沉淀、洗涤、洗脱和分析结果等。
一、前期准备1. 准备所需试剂:PBS缓冲液(含0.1%的Tween-20)、蛋白质抽提缓冲液(含有适当的蛋白酶抑制剂)、抗体(单克隆或多克隆抗体)、控制组织或细胞苗、蛋白质A/G磁珠等。
2.对样品进行处理:收集样品,如细胞或组织,并用蛋白质抽提缓冲液裂解细胞膜或组织。
3. 确定抗原-抗体反应的条件:进行Western blot或其他实验,确定抗体和目标蛋白的最佳工作浓度和最佳条件。
二、取样1.将裂解的细胞或组织样品通过离心等手段去除细胞碎片和残留的细胞核。
2.将上清液收集到新的离心管中,并测定样品的总蛋白浓度,以便后续计算抗体的用量。
3.根据总蛋白浓度将样品分成相等的小样本,并放入不同的离心管中。
三、免疫共沉淀1.将试验管中的抗体与适量的蛋白质A/G磁珠混合,孵育一段时间,使抗体与磁珠形成固定复合物。
2.将磁珠与固定复合物加入到每个含有样品的离心管中,混匀并在冰上孵育一段时间。
3.离心管置于磁珠磁架上,使磁珠在离心管底部附着,将上清液小心地转移至新的离心管中,以减少非特异性结合的背景。
4.用PBS缓冲液洗涤磁珠至少3次,以去除非特异性结合的蛋白质。
5.转移沉淀到新的离心管中,并用PBS缓冲液洗涤磁珠至少3次,以去除残留的非特异性结合蛋白质。
四、洗涤1.将磁珠与背景低的洗涤缓冲液混合,孵育一段时间,混匀后在冰上孵育。
2.将磁珠与洗涤缓冲液加入到每个含有沉淀的离心管中,混匀并在冰上孵育一段时间。
3.离心管置于磁珠磁架上,使磁珠在离心管底部附着,将上清液小心地转移至新的离心管中。
4.用洗涤缓冲液洗涤磁珠至少3次,以去除非特异性结合的蛋白质。
五、洗脱1.将洗涤缓冲液去除,加入适量的脱附缓冲液,孵育一段时间,混匀并在冰上孵育。
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免疫共沉淀操作步骤
具体步骤:
1. 细胞用预冷的PBS液洗涤2次,最后洗涤完成后吸干PBS液。
2. 加入预冷的RIPA Buffer(1ml/107个细胞、6cm培养皿、75cm2培养瓶)。
3. 刮留细胞:用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶中上刮下,将悬液转入 1.5mlEP 管中,EP管插冰上,置于水平摇床上缓慢晃动15min。
4. 4℃,14000g离心15min。
5. 立即将上清液转移到一个新的离心管中。
6. 准备Protein A琼脂糖,用PBS液洗两遍珠子,然后用PBS液配制成50%浓度。
*为避免操作中破坏琼脂糖珠,减掉移液器枪头的尖部分。
7. 每ml总蛋白中加入100ul Protein A琼脂糖珠(50%),EP管插冰上,置于水平摇床上4℃摇晃10min。
*目的是去除非特异性杂蛋白,可降低背景。
8. 4℃,14000g 离心15min,将上清转移到一个新的离心管中。
9. 测定蛋白浓度,可选用Bradford法做蛋白标准曲线。
10. 蛋白定量,分装,-20℃保存,可保存1个月。
11. 用PBS液将总蛋白稀释至约1ug/ml。
12. 加入500ul稀释好的兔抗到总蛋白中。
13. 于摇床上4℃缓慢摇动抗原抗体混合物,可选择过夜或室温放置2h。
14. 加入100ul Protein A琼脂糖珠用以捕捉抗原抗体复合物,摇床4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或者室温孵育1h。
15. 14000rpm瞬时离心5s,去上清,收集琼脂糖珠-抗原抗体的复合物。
16. 用800ul预冷RIPA buffer冲洗3遍。
17. 用60ul 2倍上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起,轻轻敲打混匀。
18. 将上样样品煮5min。
19. 14000g离心,收集剩余琼脂糖珠。
20. 将上清电泳,电泳前应再次煮5min变性。
21. 上清也可以暂时冻-20℃,留待以后电泳。
基础成分
(1)Tris-HCl(防止蛋白变性的缓冲液成分)
(2)NaCl(防止非特异性蛋白聚集的盐分)
(3)NP-40(用H2O配置成10%储存液。
NP-40为非离子去污剂,用于提取蛋白)
(4)去氧胆酸钠(用H2O配置成10%储存液;提取蛋白用离子去污剂;避光保存)
*因为离子型去污剂能够使酶变性,导致活性丧失,准备激酶(致活酶)实验时,不要加去氧胆酸钠。