考染与银染讲课稿
双向电泳中4种常用染色方法的比较

取、 等电聚焦、 白质转移、D P G 蛋 S S— A E电泳以及染色等
环节 , 个环节 又包括 若 干步骤 。由此可 见 2一 E技 每一 D
术是一个受多种因素控制的技术 , 中任何一种因素没 其
有理 想地控 制好都 有 可能 引起 整 个 实验 的失 败 , 且 这 而 种失 败往往 要等 到 2一 E图谱染 色 显影 之后才 能 看 到。 D 因此 , 2一 E中 , 得到 一张理 想 的 图谱 果 进 行 了对 比 , 筛 选 出适 合 以期 本 实验室 条件 的染色方 法 。
1 材 料 与方 法
11 试 验材料 . 本 实验 所用 的研 究 材料 为 杂交 水 稻威 优 96 1。本实 验染色 所涉及 的试 剂 : 硝酸 银 ( 上海 试 剂一
的质谱分析提供有益的帮助, 除了控制好每一个步骤外 ,
摘
要: 采用 S S— A E电泳技术 , D PG 比较分析 了双向 电泳 中常 用4种染 色方 法的优、 点。结果表 明: 缺 常规银 染法灵敏
度低 ; 的双胺硝酸银银 柒法与质谱 分析不兼容 ; 染方法 一银 染复合染 色法的灵敏度稍低 于双胺硝酸银银 染法, 它的 改进 考 但 质谱 兼容性最高; 改进后的银 染方法灵敏度 高、 背景 清晰、 与质谱 兼容。因此后两种 方法较广泛适用于蛋 白质组学研究。
技术具 有高分 辨率 、 重 复 性 、 量分 析 和制 备 等性 能 , 高 微
它与质谱分析是 当今蛋 白质组学研究 中必不可少的工
具 。2 D 一 E技术所 涉及 的环节 较 多 , 一般 包 括 蛋 白质 提
及实验条件的差异, 同一染色方法往往在不同的实验室
考染与银染资料

常用的蛋白质染色试剂分为已考马斯亮蓝为代表的有机试剂染色、银染、荧光染色及同位素显色。
其中考马斯亮蓝染色法的应用较为广泛,现将其与其他的蛋白质染色方法(主要是银染法)作一比较,帮助大家更好地去选择合适的蛋白质染色方法。
蛋白质的染色常用的有4类:有机试剂染色、银染、荧光染色及同位素显色。
其中有机试剂染色以考马斯亮蓝染色法(Coomasie brilliant blue ,CBB)为代表,在蛋白质分析中常用,但对低丰度蛋白质的显现较差;银染灵敏度虽高,却常与质谱不兼容;荧光染色以SYPRO试剂为主,蛋白质检测灵敏度高,能兼容质谱,但由于需要配备特殊的检测仪器及试剂的昂贵,未被作为常规方法使用;而同位素显色则存在安全性和操作局限性等问题。
因此,筛选简便、节约、检测灵敏度高、质谱兼容的蛋白质着色法是蛋白质组研究所需。
由于考马斯亮蓝染色法的广泛运用,近年来就考马斯亮蓝染色法在提高其灵敏性方面研究者们作了许多改进,方法众多,评价不一。
我们在作双向凝胶电泳时,将常用的几种考马斯亮蓝染色法及银染进行了比较,并就其染色影响因素作岀分析。
试剂固相pH 梯度干胶条(IPG strip pH3-10NL , IPG strip pH5-8 , 17cm )、urea、CHAPS、TBP、DTT、Bio-Lyte裂解,静置30分钟,15500X g离心30分钟,取上清,进行蛋白质定量。
单向定量电泳取蛋白质分子量标准物,第一次按1 : 2稀释后,以后按1 : 3倍比例逐级稀释,经4级稀释后,取15卩l 上样液上样,性半乳糖苷酶上样量依次分别为1川、0.24 tig 0.062 tig、0.0156 0.004 心作12g/L SDS-聚丙烯酰胺凝胶单向电泳,同时电泳4份胶,显色以确定染色灵敏度。
双向电泳取3001样品液沿水化盘中槽的边缘自左向右线性加入,将17cm IPG胶条胶面朝下置于槽中,静置45分钟后覆盖矿物油,在20 C溶胀11〜16小时。
蛋白质银染原理与方法

蛋白质银染原理与方法2009-04-28 16:38:24 来源:未知【大中小】评论: 条-摘要:蛋白质条带的银染是基于蛋白质中各种基团(如琉基、碳基等)与银的结合,检测极限是2~5.0ng/蛋白条带。
原理:蛋白质条带的银染是基于蛋白质中各种基团(如琉基、碳基等)与银的结合,检测极限是2~5.0ng/蛋白条带。
①SDS-PAGE电泳。
注意:银染检测蛋白质的水平是在100ng左右,与CommassieBlue染色比较,银染加样量要少。
否则难以得到清晰的电泳分辨率。
②电泳结束后,戴手套将PAGE胶转移到干净的玻璃培养皿或TIP头盒盖中。
加入25ml FixingSolution(固定液),室温振荡保温30min。
胶需要完全淹没在固定液中。
③彻底弃去固定液,加入25mlIncubationSolution(保育液),室温振荡保温30min。
胶需要完全淹没在保育液中。
④彻底弃去IncubationSolution(保育液),用50ml去离子水洗3次,每次5min。
⑤准备:取2.5ml 10XSilvering Solution, 加入22.5mL水,混匀后使用。
⑥弃去洗涤的水,加入25mlSilvering Solution (银染液)。
室温振荡保温20min。
⑦彻底弃去银染液,加入25mLDevelopingSolution(显色液),室温振荡保温1~10min。
注意观察目的条带。
如果目的条带出现了,可以考虑终止显色。
显色时间不要过长,否则本底较深。
⑧彻底弃去显色液,加入25mLStopping Solution(终止液),室温振荡保温10min。
⑨彻底弃去StoppingSolution(终止液),用50mL去离子水洗3次,每次5min。
弃去洗涤的水,加入25mL PreservingSolution(保护液),室温振荡保温20min。
银染PAGE 胶可以拍照保存,也可以室温玻璃纸干燥。
今天第一次银染,结果出来啥也没有,凝胶就像一块海带一样。
人教版九年级上册美术《第4课 蜡染与扎染》(一等奖课件) (2)

当然了,同 学们没办 法做那么 复杂的图 案,老师 就跟大家 一起做出 颗爱心送 给家人, 好不好!
一起做个游戏,开始 今天的活动吧! 分小组合作
• 棉布方巾、旧报纸或一次性桌布、皮筋 若干、扎染粉、一次性手套、塑料滴管 或塑料瓶。
*扎染过程中注意:不要将扎染颜料沾染 到桌上或是衣服上。
*扎染作品的清洗工作,要在扎染颜料完 全干透后再进行。
1.说一说要用这块布做什么东西? 可以做围巾送亲人、朋友)
2.我们要继续传承和发扬传统的手工艺。
• 同学们还能想到其他的对称 图案吗,抓紧动手试试吧!
2.通过学习与实践,激发对民间扎染的热爱, 增强继承、保护传统手工业及工艺文化的使 命感和责任感。
3观察颜色混合产生的间色,有意识的制作混 色效果
一、教学重点: 扎染制作的方法和步骤
二、教学难点: 纹样的设计与制作技巧
扎染
扎染,又称绞缬。是一种古老的采用结扎染色的工 艺,该工艺始于秦汉,兴于魏晋南北朝,风盛唐代, 至北宋仁宗皇帝,因扎染服装奢侈费工,下令禁绝, 使中原扎染工艺几乎一度失传。明清时期,洱海白 族地区的染织技艺达到很高的水平,到了民国,居 家扎染已十分普遍 。现今,这种传统工艺得到了许 多艺术家和印染工作者的重视,使古老的扎染工艺 重新焕发青春。
*扎染的棉布方巾需要提前清洗过。扎染 时方巾半干会更容易产生混色效果。
• 将准备好 的方巾对 折,画出 一半的心 形;
• 沿所画线 条把方巾 收起。
• 用皮筋沿 线捆扎紧;
• 扎好后滴 上喜欢的 颜色;
• 密封好静 置6-8小 时。
结论1:扎捆过程中扎紧的力度,间隔的疏密 程度直接影响到扎染的染色效果。 结论2:染色的水分多少、时间的长短、染料 的浓淡等都会直接影响到扎染的效果。
蜡染与扎染说课稿

《我学做“蜡染”》是上海教育出版社《美术》第六册第三单元“感受民间艺术”中的第二课。
本课是在学习了上节课“扎染”以后介绍的另一种民间染布工艺——蜡染。
通过学生的自身的体验,初步懂得民间蜡染的基本工艺,尝试用油画棒在生宣纸上描绘形象,加以染色的制作方法。
根据“油水分离”的原理,感受民间蜡染制作工艺的特点。
通过作品欣赏,感受民间蜡染艺术,体验蜡染制作的乐趣,培养学生对各种绘画的兴趣。
小学三年级学生对于此课,以纸蜡染的方式让学生制作尝试,大大降低了民间布艺蜡染的制作难度和节省制作时间。
简单的绘制方式,良好的视觉效果可以很大程度地提高儿童的学习兴趣。
由于前一课“扎染”作为铺垫,学生对于宣纸的使用也不再显得陌生,较容易的使学生掌握好上蜡的技巧。
同时,教学中教师要注意有意识引导学生将各种活动讨论的重点放在图形的设计、色彩的配合和蜡绘效果的协调上。
如:浅色的图案配深底色,深色的图案配浅底色或色彩略亮鲜艳的底色。
二、教学设计基于以上对教材和学生的情况分析,对本课的教学进行如下的思考和设计。
1)创设情境,激发学习热情。
在课的导入阶段,采用了教师变小魔术的方式,学生的注意力一下子集中起来了,激起他们学习的欲望,概括出蜡具有排水性的`特点。
并非常自然地过渡到民间蜡染工艺的欣赏和介绍,使学生听来饶有兴趣。
2)实践体验,引导学生思考。
由于有前面一课的的技能积累,新授部分直接放手让学生自己尝试制作。
可多让学生动手试一试,想一想,培养他们独立思考的能力。
第一次完成作品以后对制作过程中出现的上蜡、染色问题进行交流,此时教师再加以引导,将取得事半功倍的效果。
3)观察比较,促进生生交流。
此课中,我设计多处地方让学生以小组的方式进行讨论,促进学生之间的互动。
同时通过蜡染作品的观察比较,了解传统与现代蜡染图案的不同,概括出传统蜡染图案以对称型、线型纹样为主。
现代蜡染图案造型简洁、夸张,线条较为粗,用点、线、面来表现对象的特点。
最后让学生欣赏富有童趣的纸蜡染作品,使他们对自己的创作更充满信心。
人教版九年级上册初中美术《第4课 蜡染与扎染》教案

人教版九年级上册初中美术《第4课蜡染与扎染》教案一、教学目标:知识与技能:1. 了解蜡染和扎染的历史渊源、制作原理和基本方法。
2. 能够描述蜡染和扎染的制作过程和方法。
过程与方法:1. 通过观察、分析和实践,使学生掌握蜡染和扎染的制作过程和方法。
2. 能够运用所学技巧制作简单的蜡染和扎染作品。
情感、态度和价值观:1. 培养学生对于传统文化的热爱和尊重。
2. 提高学生的审美能力和创造精神。
二、教学重点与难点:教学重点:1. 掌握蜡染和扎染的制作方法和基本步骤。
2. 理解蜡染和扎染的历史渊源和文化内涵。
教学难点:1. 如何引导学生通过观察和实践,掌握蜡染和扎染制作方法的要点和难点。
2. 培养学生的创造力和审美能力。
三、学情分析:学生对于手工艺制作具有较高的兴趣,他们喜欢参与实践性的活动。
同时,学生对于传统文化和手工艺品的认识和了解程度有所不同。
因此,在教学过程中,需要提供足够的实践机会,引导学生通过观察和实践,深入理解蜡染和扎染的制作过程和技巧。
此外,教师应根据学生的不同程度和兴趣,提供差异化的指导和辅导,激发他们的创造力和想象力。
四、教学过程:导入教师:大家好!今天我们要学习的是九年级上册第二单元《情趣浓郁能工巧匠》,第4课《蜡染与扎染》。
请问,你们知道蜡染和扎染是什么吗?对这两种工艺你们有什么了解?学生:(思考一会儿)蜡染和扎染应该是一种手工艺制作吧,通过染料和特殊的技法制作出漂亮的花纹。
教师:很好!蜡染和扎染确实是一种手工艺制作,它们在我们的传统文化中有着重要的地位。
接下来,我会给大家介绍一些蜡染和扎染的知识。
呈现与讨论教师:首先,我将通过图片和视频来展示一些蜡染和扎染的作品,让我们一起欣赏一下。
(教师展示蜡染和扎染的图片和视频)教师:你们看到了吗?这些作品色彩鲜艳,图案精美。
蜡染和扎染是一种将染料添加到织物上的技术,通过特定的方法使染料只渗透到某些部分,创造出独特的花纹和图案。
你们觉得它们有什么特点和区别呢?学生:蜡染和扎染都是手工制作的,但是蜡染是通过涂蜡的方式保护织物上的某些部分不被染料渗透,而扎染是通过绑扎织物的方式限制染料的渗透。
银染中每步的原理

银染中每步的原理
银染是一种将金属银沉积在物体表面的染色方法,主要用于改变物体的颜色和增加其抗氧化能力。
其原理主要包括以下几个步骤:
1. 表面处理:首先需要对物体表面进行适当的处理,以去除表面的杂质和氧化物,以便银能够更好地沉积在物体表面。
常用的表面处理方法有机械打磨、电化学抛光等。
2. 银溶液制备:制备含有银离子的溶液,通常使用银盐(如硝酸银)和适当的酸性溶液配制而成。
溶液的酸性有助于提供适当的环境,使银离子可以稳定存在,同时可调节酸碱度来控制银沉积的速率和均匀性。
3. 沉积过程:将待染物体放入银溶液中,并加上适当的电压,通过电解作用将银离子还原成金属银,并沉积在物体表面,形成一层均匀的银膜。
电压的选取要根据染色效果和物体材质等因素进行调节。
4. 清洗和后处理:将染色后的物体从银溶液中取出,经过适当的清洗,以去除残留的银离子和其它杂质。
清洗后,还可以进行一些后处理步骤,如漂白、封闭等,以增加染色层的光亮度和耐久性。
总的来说,银染的原理是通过电解作用,将银离子沉积在物体表面,形成一层均匀的银膜。
这一过程的关键是控制电解条件和后处理步骤,以确保银染效果的稳
定和持久。
二年级上册美术说课稿-第2课染色游戏:美丽的染纸-人教版(2023秋)

4.创作实践:运用所学染纸技巧,完成一幅美丽的染纸作品。
二、核心素养目标
本节课旨在培养学生以下核心素养:
1.美术表现:通过学习染纸技巧,提高学生对色彩的感知能力和美术表现力,激发创造力和想象力。
2.文化理解:了解染纸艺术的历史背景和文化内涵,增强对民间美术的尊重和传承意识。
五、教学反思
在今天的教学过程中,我注意到学生们对染纸艺术表现出了极大的兴趣。他们认真观察了我的示范,也积极地参与到实践活动中。我感到很高兴,因为这样的课程能够让学生们亲近传统艺术,同时锻炼他们的动手能力和创造力。
在讲授染纸技巧时,我发现平涂和渐变这两种技巧学生掌握得相对较快,但晕染部分对学生来说挑战较大。这让我意识到,需要在今后的教学中更加细致地讲解和示范晕染技巧,让学生更好地理解染料与水的关系,以及如何控制颜色过渡。
2.教学难点
(1)染纸技巧的掌握:对于二年级学生来说,染纸技巧的掌握具有一定的难度,特别是晕染技巧的运用。
-难点解析:学生可能难以掌握染料与水的比例,导致晕染效果不佳。
(2)色彩搭配:学生在创作过程中可能会面临色彩搭配点解析:学生需要了解基本的色彩搭配原则,如冷暖对比、互补色搭配等。
3.成果展示:每个小组将向全班展示他们的讨论成果和染纸作品。
(四)学生小组讨论(用时10分钟)
1.讨论主题:学生将围绕“染纸在生活中的应用”这一主题展开讨论。他们将被鼓励提出自己的观点和想法,并与其他小组成员进行交流。
2.引导与启发:在讨论过程中,我将作为一个引导者,帮助学生发现问题、分析问题并解决问题。我会提出一些开放性的问题来启发他们的思考。
此外,从学生们的成果展示来看,虽然大部分学生能够完成基本的染纸作品,但在色彩搭配和图案设计方面还有很大的提升空间。针对这一点,我计划在下一节课中增加一些关于色彩搭配和图案设计的基础知识,帮助学生提高作品的整体美感。
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常用的蛋白质染色试剂分为已考马斯亮蓝为代表的有机试剂染色、银染、荧光染色及同位素显色。
其中考马斯亮蓝染色法的应用较为广泛,现将其与其他的蛋白质染色方法(主要是银染法)作一比较,帮助大家更好地去选择合适的蛋白质染色方法。
蛋白质的染色常用的有4类:有机试剂染色、银染、荧光染色及同位素显色。
其中有机试剂染色以考马斯亮蓝染色法(Coomasie brilliant blue,CBB)为代表,在蛋白质分析中常用,但对低丰度蛋白质的显现较差;银染灵敏度虽高,却常与质谱不兼容;荧光染色以SYPRO试剂为主,蛋白质检测灵敏度高,能兼容质谱,但由于需要配备特殊的检测仪器及试剂的昂贵,未被作为常规方法使用;而同位素显色则存在安全性和操作局限性等问题。
因此,筛选简便、节约、检测灵敏度高、质谱兼容的蛋白质着色法是蛋白质组研究所需。
由于考马斯亮蓝染色法的广泛运用,近年来就考马斯亮蓝染色法在提高其灵敏性方面研究者们作了许多改进,方法众多,评价不一。
我们在作双向凝胶电泳时,将常用的几种考马斯亮蓝染色法及银染进行了比较,并就其染色影响因素作出分析。
试剂固相pH梯度干胶条(IPG strip pH3-10NL,IPG strip pH5-8,17cm)、urea、CHAPS、TBP、DTT、Bio-Lyte 3/10 Ampholyte、IAM、SDS、Tris、丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺、甘氨酸、CBB-G250均为BIO-RAD公司产品。
硫酸铵及磷酸均购自成都科龙试剂厂。
AgNO3为Sigma公司出品。
Protein molecular weight marker #SW0431为MBI公司出品。
甲醛、Na2S2O3与Na2CO3分别为成都天华科技股份有限公司、重庆北碚化学试剂厂和天津市塘沽鹏达化工厂产品。
仪器IPGphor等电聚焦仪、proTEANⅡ垂直电泳仪、Power PAC1000电泳仪、加样溶胀槽、GS-800 Calibrated Densitometer扫描仪、PDQuest凝胶图像分析软件均为BIO-RAD公司产品。
细胞总蛋白质的提取取4份经常规培养的急性早幼粒白血病细胞株(NB4)1×107细胞各重悬于350 μl蛋白质裂解缓冲液中(8mol/L Urea,2g/L CHAPS,2mmol/L TBP,2ml/L Carrier Ampholyte,痕量溴酚兰),置冰浴中超声裂解,静置30分钟,15500×g离心30分钟,取上清,进行蛋白质定量。
单向定量电泳取蛋白质分子量标准物,第一次按1∶2稀释后,以后按1∶3倍比例逐级稀释,经4级稀释后,取15μl上样液上样,β-半乳糖苷酶上样量依次分别为1μg、0.24μg、0.062μg、0.0156μg、0.004μg。
作12g/L SDS-聚丙烯酰胺凝胶单向电泳,同时电泳4份胶,显色以确定染色灵敏度。
双向电泳取300μl样品液沿水化盘中槽的边缘自左向右线性加入,将17cm IPG胶条胶面朝下置于槽中,静置45分钟后覆盖矿物油,在20℃溶胀11~16小时。
溶胀后的胶条置于等电聚焦盘中,在Protean IEF Cell中进行等电聚焦,温度设置为20℃,电压模式设置为:快速升压,250 V,0.5小时;500 V,0.5小时;10000V,60000 Vh(伏特×小时)。
取IEF后的IPG 胶条,先后分别置于含DTT平衡液1(6mol/L urea,2g/L SDS,0.05mol/L Tris pH 8.8,200ml/L gylcecol,2g/L)及含碘乙酰胺平衡液2(同平衡液1,但其中DTT 换为2.5g/L 碘乙酰胺)中轻微摇荡各10分钟。
将平衡好的IPG 胶条置于预先灌制的12g/L SDS-聚丙烯酰胺凝胶上,封固,在15℃低温水循环条件下,15 mA/gel电泳15分钟,然后以25mA/gel恒流电泳。
显色取出SDS-聚丙烯酰胺凝胶,经超纯水清洗2次,每次1分钟,4块胶分别按4种不同的染色方法显色。
下列每步操作皆在摇床上进行。
4种染色法成份组成及操作如下:①传统考马斯亮蓝染色法:清洗后的凝胶经固定液(45.4%甲醇、4.6%乙酸)固定1小时,随后用染色液(45.4%甲醇、4.6%乙酸、0.1% CBB G250)着色过,再经洗脱液(5%甲醇、7.5%乙酸)过脱色至背景清晰。
②胶体考马斯亮蓝染色法(colloidal Coomassie brilliant blue,cCBB)染色法:凝胶先经超纯水漂洗后,再用colloidal Coomassie blue G250染色液(1.6%磷酸、8%硫酸铵、0.02% CBB G250、20%乙醇)着色过,洗脱液为超纯水,换液3~4次直至背景清晰。
③改良考马斯亮蓝染色法(modified Coomassie brilliant blue,mCBB)染色法[6];操作方法同胶体考马斯亮蓝染色法,只是染色液组成不同(0.12% CBB G250、10%硫酸铵、10%磷酸、20%乙醇),着色1小时即可。
④银染(silver staining):凝胶漂洗后先被固定液(50%甲醇+ 5%乙酸)固定1小时,随后分别用50%甲醇和超纯水清洗各10分钟,0.02 mg/L Na2S2O3 致敏1分钟,超纯水清洗2次,每次1分钟,再用预冷的0.15% AgNO3着色20分钟,超纯水再次清洗2次,每次1分钟,2% Na2CO3 + 0.04% 甲醛显色20~30秒,当溶液变黄以后除去,换新鲜的溶液后继续显色直至显色适度后,以5%乙酸终止显色。
成像、分析、质谱鉴定脱色后,凝胶经GS-800 Calibrated Densitometer扫描成像,用PDQuest软件进行分析。
切取蛋白质点,胰酶消化,行质谱鉴定。
结果4种染色法的蛋白质检测灵敏性分析β-半乳糖苷酶的上样量依次分别为1、0.24、0.062、0.0156和0.004μg。
经传统考马斯亮蓝染色后的条带在62ng水平隐隐可见;而胶体考马斯亮蓝染色法的灵敏度稍高,62ng条带明显可见;改良考马斯亮蓝染色法的效果更好些,在15.6ng水平可见条带的显示;而银染法灵敏度最高,在15.6ng水平可见清晰条带的显现,同时在4ng可见隐约条带。
4种染色法的比较显示,灵敏度最高的是银染法,可达纳克级水平,其次为改良考马斯亮蓝染色法,10纳克级蛋白质能被检测。
而胶体考马斯亮蓝染色法和经典考马斯亮蓝染色法稍差,检测水平仅达几十纳克。
4种染色法的双向电泳蛋白质点显示比较来自NB4细胞的全蛋白经pH 3-10NL的等电点梯度分离,SDS-PAGE 二维垂直电泳后被3种考染法着色成像的显示可以看出传统考马斯亮蓝染色法的蛋白质点显现最少,胶体考马斯亮蓝染色法的蛋白质点显现较多,而改良考马斯亮蓝染色法的蛋白质点显现更多。
凝胶背景以后二者为更清晰。
经PDQuest软件进行分析,3幅图的蛋白质点显现数分别为483、679、890。
NB4细胞的全蛋白经pH 5-8 IPG分离,分别经改良考马斯亮蓝染色法与银染法着色成像的蛋白点显示,二者上样量一致,蛋白点的显现数量相当,但银染的蛋白点明显显示着色重。
这与单向电泳的效果相同。
4种染色法的可操作性比较在比较其蛋白质检测灵敏性的同时,对染色法的操作简便性、安全性以及蛋白质经质谱鉴定的成功率也作了对比。
比较显示,考马斯亮蓝染方法简便,但耗时较长,经改进后可以做到无毒操作,质谱兼容性较高。
银染步骤繁多,但耗时短;操作过程中有甲醇、甲醛等毒性物的接触,质谱兼容性低。
即使我们选择的银染法被文献报道为质谱兼容的,但仍然表现为低的蛋白鉴定率,不及考马斯亮蓝染。
讨论凝胶染色方法对蛋白质分辨率的影响提高双向凝胶电泳的分辨率是蛋白质组学研究尚待解决的课题及技术发展方向,影响蛋白质分辨率的因素较多,其中凝胶染色方法对蛋白质分辨率的影响不可忽视,它影响了实验的显像结果,直接干预了后续的质谱鉴定。
目前,在蛋白质组学领域中广泛应用的是考马斯亮蓝染色法和银染法两种。
考马斯亮蓝(Coomassie brilliant blue,CBB G-250)的化学名称为二甲花青亮蓝,偏酸性,与蛋白质的碱性基团结合,颜色由棕黄色转为深兰色。
考马斯亮蓝染色法可以达到微克级检测水平,着色程度与蛋白量的线性动力学相关范围广,适合定量分析。
该法由于较低的成本、使用方便及与下游的质谱鉴定技术的良好相容性,而得到了非常广泛的使用。
然而微克级的检测水平使它漏检了相当多的低丰度蛋白质,日益成为蛋白质组学的瓶颈,因此大量提高染色灵敏度的研究及各种染色液的配方和方法应运而生,经文献报道的方法众多,评价不一。
我们的试验选择了3种常用的考马斯亮蓝染色法进行比较,测得传统考马斯亮蓝染色法的灵敏度可达几百纳克,胶体考马斯亮蓝染色法能检测到几十纳克蛋白,改良考马斯亮蓝染色法则可达几纳克蛋白水平。
考马斯亮蓝染色法经过改进能获得高的蛋白质检测灵敏度,甚至可与银染媲美。
银染法是利用银离子与氨基酸共价结合,还原剂的加入使与胶内蛋白质结合的银离子形成金属银而显色。
文献报道检测限度可低于1 ng的蛋白质,其灵敏度比传统考马斯亮蓝染色法高约100倍,被广泛应用于蛋白质组学研究,但银染步骤复杂,繁琐,且着色线性动力学的覆盖范围窄,导致蛋白质差异显示的不准确性,同时由于游离银离子及相关试剂的存在,给后续分析及鉴定带来一定的实际困难。
我们的实验只采用了一种银染法,结果显示银染法的灵敏性高于所有考马斯亮蓝染色法,4 ng的蛋白质条带也能显现,但蛋白质鉴定成功率低。
蛋白质检测灵敏度的影响因素蛋白质着色显示的灵敏性既取决于染色试剂,如上述分析,又与染色过程中涉及的有机溶剂及离子有关。
在考马斯亮蓝染色法和银染法中都存在如甲醇、乙醇、乙酸、甲醛等有机溶剂的使用。
甲醇和乙醇在染色里起固定作用,把蛋白质固定在凝胶中或阻滞它们在凝胶中扩散。
同时也去除电泳过程中遗留的干扰染色过程的物质,如去垢剂、还原剂和缓冲液等成分。
乙酸的作用既是辅助固定蛋白质同时又维持染液的酸性度,以利于考马斯亮蓝与蛋白质结合。
他们的存在有利于获得背景清晰、信噪比高的图像。
由于3种有机溶剂的相似作用,我们在胶体考马斯亮蓝染色法及改良考马斯亮蓝染色法里,保留乙醇作为唯一的固定清洁剂,用磷酸替代乙酸发挥酸化作用,结果显示两种考马斯亮蓝染色法获得的图像背景比传统考马斯亮蓝染色法的要清晰,条带也锐利。
在胶体考马斯亮蓝染色法中,酸性的乙醇介质中加入硫酸铵,使得着色剂形成胶体染色颗粒,胶本身可不被显著着色,蛋白染色灵敏度得以提高。
而在改良考马斯亮蓝染色法中,在高酸、高离子环境下,蛋白质的葡糖胺和天冬酰胺酸质子化,更利于与染色剂发生结合。