胡萝卜品种鉴定的RAPD分子标记技术研究

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RAPD分子标记技术概述及应用

RAPD分子标记技术概述及应用
发 生改 变 。经 琼脂 糖凝 胶 电泳分 离后 通 过 E B染 色
培育及遗传育种工作 的物质基础 。利用 R P A D技术
能 够检 测植 物 物种 的遗 传 多样性 ,研究 物种 间的亲 缘关 系 ,为植 物种植 资 源 的保存 、鉴定 提供 了有力 的工具 ,同时 大大 降低 了种 质 资源 收集 和保 存所 需
曩用技术
文章编号 :6 4 9 4 (00 0 — 0 8 0 1 7— 16 2 1 )9 09 — 2
R P A D分 标 记技 术概 述 及庄 用
刘 晓 宇
( 原 市科 兴 中小 企 业科 技 服 务 中心 , 山西 太 原 太 0 00 ) 306
鬻3 要: | 瓶  ̄ R P 于标记技苯 AD龠 桷碌 理和铰 靛 毫 点 ,使 它成 为 目前 植物 育
种研 究工 作采用 最多 的手段 。 1 R D技 术原 理 AP 随 机 扩 增 多 态 性 D A ( adm A l e N R n o mpi d i f P lm rhcD A .是 以 P R为 基础 .以随机 的短 o op i N ) y C 核 苷 酸序 列 为引 物 ,以实验 材 料 基 因组 D A为 模 N 板 ,进 行 P R反应 ,找 出扩 增 片 段 的 多态 性 。 由 C
样性 指 数偏 低 ,因此需 要采 取相 应 的措 施 ,对 不 同 金莲 花种 质资 源进行 合理保 护 。 32 构建 遗传 图谱 .
于不 同植 物基 因组分 析 ,且 不需 预先 知道 待扩增 基 因的核 苷酸顺 序 ,试 验 费用 较低 。R P A D技 术 的多 态 性位 点是无 限 的 ,灵 敏 度高 ,能够 检测 出 品种 间
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DNA分子标记技术的研究与应用

DNA分子标记技术的研究与应用

DNA分子标记技术的研究与应用一、本文概述本文旨在对DNA分子标记技术的研究与应用进行全面的概述。

DNA分子标记技术作为现代分子生物学领域的一项重要工具,已经在生物学研究、遗传育种、疾病诊断等多个领域展现出广泛的应用前景。

本文首先介绍了DNA分子标记技术的基本概念、发展历程以及主要类型,包括限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)和单核苷酸多态性(SNP)等。

接着,文章详细阐述了这些技术在不同领域中的具体应用,包括基因克隆、基因定位、遗传图谱构建、物种亲缘关系分析、基因表达和调控研究等。

本文还讨论了DNA分子标记技术在实践应用中面临的挑战和未来发展趋势,如高通量测序技术的结合、大数据分析的利用以及生物信息学的进一步发展等。

通过本文的综述,旨在为相关领域的研究人员和技术人员提供一个全面、深入的了解DNA分子标记技术的平台,以促进该技术的进一步发展和应用。

二、DNA分子标记技术的基本原理与类型DNA分子标记技术是一种直接以DNA多态性为基础的遗传标记技术,其基本原理在于利用DNA分子在基因组中存在的丰富的多态性,通过特定的技术手段将这些多态性转化为可识别的遗传信息,从而实现对生物个体或群体的遗传差异进行精确分析。

这种技术以其高度的准确性、稳定性和多态性,在生物学研究、遗传育种、种质鉴定、基因定位、分子育种、疾病诊断等领域中得到了广泛应用。

基于DNA-DNA杂交的分子标记技术:这类技术主要包括限制性片段长度多态性(RFLP)和DNA指纹技术。

它们通过比较不同个体或群体间DNA片段的杂交信号差异,揭示出基因组中的多态性。

这类标记具有稳定性高、共显性遗传等特点,但操作复杂、成本较高。

基于PCR的分子标记技术:随着聚合酶链式反应(PCR)技术的出现和发展,基于PCR的分子标记技术应运而生。

这类技术包括随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)和序列特征化扩增区域(SCAR)等。

RAPD检查方法及意义

RAPD检查方法及意义

RAPD检查方法及意义
RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)即随机扩增多态性DNA,是一种利用特定引物与无结构DNA作用,从而扩增出其特異或通用性DNA片段的技术。

它可以扩增出庞大的片段,也可以扩增出裂解服从于经典的单倍体型的微不足道的片段。

RAPD技术借助于PCR(聚合酶链反应)技术,可以仅用少量的DNA,用非特异性引物进行扩增,从而得到很多特定碱基序列,并测定这些片段在不同样本间的差异,有利于生物遗传信息学的研究。

RAPD技术的最大特点之一是能检测大范围内的遗传多态性,可以检测不同的DNA序列,RAPD技术使用的引物一般无特异性,也可以利用这些引物检测基因组中的不同位置的片段,从而在基因组结构与遗传多态性的研究方面,具有很大的潜力。

RAPD技术主要用在生物学的分子标记技术、基因组学、植物种质资源分子识别等方面,在动物育种,植物育种以及遗传改良,在动物种群族群结构研究中。

这种技术可以为鉴定和追踪遗传变异提供快速和高效的证据,为改善品种而进行的育种遗传改良和变异研究提供依据。

RAPD分子标记技术

RAPD分子标记技术

人工冬虫夏草
天然冬虫夏草
种质资源和道地药材研究中的应用
道地药材是建立在优良种质资源的基础之上。 因此,有必要对种质资源进行分类研究,确定种 质资源的特点,以便进行更好的利用、保护和种 质创新。郭宝林等研究人员选择了来自丹参主要 产地的44个丹参样本(包括9个居群样本),并对其 进行了RAPD分析,结果显示,可以将山东和河 南出产的丹参认为是丹参的道地药材。
龙胆
三花龙胆
条叶龙胆
中药材真伪鉴别的研究
RAPD分子标记技术可以对外观、性状 相似且显微组织特征性不强、化学成分复杂、 用传统形态的标记方法无法准确鉴定的品种 进行鉴定,应用RAPD分子标记技术将阳春 砂与海南砂、绿壳砂、缩砂等常见的姜科近 缘伪充品相鉴别,结果表明,它们之间呈现 明显的指纹差异,而不同产地阳春砂的 RAPD指纹则基本一致。
药材原植物遗传多样性的研究
RAPD技术通过比较物种间DNA分子遗传多 样性的差异来对不同物种进行鉴别,探讨物 种的亲缘关系和进化趋势。张春平等研究人 员采用RAPD技术对7个野生金荞麦居群(共 87个个体)进行遗传多样性分析,结果表明: 金荞种内具有较高的遗传多样性,遗传变异 主要存在于居群内部,这种遗传多样性与地 理关系表现出明显的相关性。周红涛等研究 人员通过研究发现,野生芍药与药用栽培芍 药群体间的遗传距离最远,差异显著。
③ 退火温度低,一般为36℃,这样的温度能保证核 苷酸引物与模板的稳定结合,同时允许适当的错误配 对,以扩大引物在基因组DNA中配对的随机性,使 RAPD 有较高的检出率;
④ RAPD 技术简便易行、省时省力,不需要RFLP 分 析的预备性工作:如克隆的制备、同位素标记、 Southern 印记反应及分子杂交。RAPD 易于程序化, 利用一套随机引物可得到大量的分子标记,并可借助 于计算机系统进行分析;

分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展

分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展

分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展摘要:本文综述了分子标记技术及其应用于瓜类蔬菜种质资源亲缘关系和遗传多样性分析、分子标记辅助选择、品种纯度鉴定、遗传图谱构建及基因定位等方面的研究进展,对目前分子标记技术应用于瓜类蔬菜育种中存在的问题进行了探讨,并对其应用前景做了展望,以期为今后瓜类蔬菜高效分子育种技术的建立提供参考。

关键词:瓜类蔬菜;分子标记技术;辅助育种;研究进展瓜类蔬菜在我国蔬菜生产中占有重要地位。

分子标记是以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平上遗传多态性的直接反映[1]。

分子标记技术的出现,使植物育种的“间接选择”成为可能,大大提高了遗传分析的准确性和选育品种的有效性[2]。

近年来,随着分子生物学的迅猛发展,分子标记技术在蔬菜育种中的作用越来越受到重视[3]。

本文综述了几种常见的分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展,以期为瓜类蔬菜高效分子育种体系的建立提供参考。

1分子标记技术种类Botein等(1980)最早利用限制性长度片段多态性(Retrictionfragmentlengthpolymorphim,RFLP)作为遗传标记构建了遗传连锁图谱,开创了直接利用DNA多态性发展遗传标记的新阶段[4]。

DNA分子标记技术简单、快速、易于自动化[9],与传统的遗传标记相比具有许多特殊优点,如不受环境、季节限制,不受个体发育阶段影响,不存在基因表达与否的问题等[5~8]。

现已发展出十几种DNA标记技术,概括起来主要包括以下3种类型:①基于杂交的分子标记技术,如RFLP。

②基于PCR扩增的分子标记技术,它又分为两类。

一是仅基于PCR的扩增方法。

它包括使用随机引物(Arbitraryprimer)进行扩增的随机扩增多态性DNA技术(RandomamplifiedpolymorphicDNA,RAPD),和采用特定引物或引物对扩增的标记技术,主要有序列特异性扩增区(Sequencecharacterizedamplifiedregion,SCAR)、微卫星DNA (MicroatelliteDNA),又称简单重复序列(Simpleequencerepeat,SSR)和ISSR(Interimpleequencerepeat)等。

我国蔬菜作物基因组研究与分子育种

我国蔬菜作物基因组研究与分子育种

中国农业科技导报,2010,12(2):24-27Journal of Agricultural Science and Technol ogy 收稿日期:2010201215;修回日期:2010203210 基金项目:“十一五”国家科技支撑计划项目(2006BAD01A07)资助。

 作者简介:杜永臣,研究员,博士,博士生导师,主要从事番茄遗传育种和抗逆生物学研究。

E 2mail:yongchen .du@mail .caas .net .cn 编者注:本文为首届中国(博鳌)农业科技创新论坛大会报告,经作者整理而成。

我国蔬菜作物基因组研究与分子育种杜永臣, 王晓武, 黄三文(中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081)摘 要:我国是世界蔬菜生产大国,也是蔬菜种子销量大国,蔬菜的育种与推广非常重要。

分析了我国蔬菜育种的优势和面临的挑战,综述了蔬菜基因组学和分子育种方面的研究进展,对“十二五”期间蔬菜研究的发展进行了展望。

关键词:蔬菜;基因组学;分子育种do i:10.3969/j .issn .100820864.2010.02.05中图分类号:S63.603.6 文献标识码:A 文章编号:100820864(2010)022*******Veget able Crops Genom i cs Research and M olecul arBreed i n g i n Ch i n aDU Yong 2chen,WANG Xiao 2wu,HUANG San 2wen(I nstitute of Vegetables and Fl owers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China )Abstract:China is the largest vegetable p r oducing country in the world and als o has big vegetable seed sales volu me .Vegetable cr op s breeding and p r omoti on are very i m portant .This paper analyzes the advantages of vegetable cr op s breeding in China and the challenges facing us;expounds the research p r ogressmade in vegetable cr op s genom ics and molecular breeding;p r os pects the devel opment of vegetables research during the t w elfth “Five Years Plan ”peri od .Key words:vegetable;genom ics;molecular breeding 我国是世界蔬菜生产大国,2009年全国蔬菜生产播种面积比2008年略有增加,达到1820亿h m 2,增加1.8%,总产量约6亿t 。

如何利用遗传标记技术进行植物品种鉴定和选育

如何利用遗传标记技术进行植物品种鉴定和选育遗传标记技术在植物品种鉴定和选育中的应用人工选择和培育植物品种是提高农作物产量和质量的重要手段之一,而遗传标记技术则为植物品种鉴定和选育提供了一种更为准确和高效的方法。

本文将介绍遗传标记技术的原理、常见的鉴定和选育方法,并探讨其在农业生产中的应用前景。

一、遗传标记技术的原理遗传标记技术是一种基于遗传物质中特定DNA序列的变异来进行鉴定和选择的方法。

其原理基于不同个体间的遗传差异,通过检测DNA中的特定位点,从而确定个体之间的遗传关系,并进一步对个体进行鉴定和选育。

遗传标记可分为分子标记和形态标记两种类型,分子标记以DNA序列上的遗传变异为依据,形态标记则以植物个体的形态特征为依据。

本文主要介绍基于分子标记的遗传标记技术。

二、植物品种鉴定中的遗传标记技术1. RAPD分子标记技术RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)是一种常用的分子标记技术,它通过PCR扩增特定位点上的DNA片段,从而区分不同个体之间的遗传差异。

该技术简便易行,无需事先了解待分析物种的基因组信息,因此在植物品种鉴定中得到广泛应用。

2. SSR分子标记技术SSR(Simple Sequence Repeat)是一种以重复单元为基础的分子标记技术,它通过PCR扩增具有特定重复序列的DNA片段,从而实现对植物品种进行鉴定。

相比于RAPD技术,SSR技术具有更高的位点稳定性和遗传信息丰富性,因此在植物品种鉴定和亲本筛选中被广泛应用。

三、植物品种选育中的遗传标记技术1. QTL定位QTL(Quantitative Trait Locus)即数量性状基因座,是影响植物数量性状的基因所在的特定位点。

通过遗传标记技术,可以对数量性状与遗传标记之间的关系进行研究,进而定位QTL,从而为植物品种的选育提供依据。

QTL定位技术在提高农作物产量、抗病虫害性等方面具有重要应用价值。

rapd分子标记及其在寄生虫学研究中的应用

rapd分子标记及其在寄生虫学研究中的应用
rapd分子标记是一种生物技术,主要用来检测和识别生物的遗传多样性。

在近几十年里,随着科学技术的发展,rapd分子标记在寄生虫学研究中得到了广泛应用。

Rapd分子标记通过用一系列短片段对基因组进行多次扩增,
从而获得特定基因型的杂合体细胞。

这种技术可以快速检测和识别生物的遗传多样性。

这不仅大大提高了研究成果的可靠性,而且可以将研究中用到的技术和结果更好地与其他研究融合起来,使研究更加系统化。

在寄生虫学中,rapd分子标记的应用可以帮助研究人员更准确地研究寄生虫的种群遗传结构和进化史,以及它们在有害因素下的变异。

这一技术也可以用来探究其他领域中寄生虫形态、发育、生理等方面的研究。

比如,研究人员可以使用RAPD
来识别特定种群中的基因座,以研究其在有害环境和其他环
境中的特殊行为。

此外,rapd分子标记技术还可以用来研究植物寄生虫的形态学特征,从而有助于辨认和识别新虫种。

RAPD可以提供一种定
性的指纹,可以较为准确地判断样品是否存在多个虫种,从而有助于植物害虫的监测和防治。

综上所述,rapd分子标记技术在寄生虫学研究中有着非常重要的作用。

它不仅可以提高研究的准确度和完整性,而且可以帮助研究者准确地识别和辨认寄生虫的特征,加深对其特征的了解,从而有助于植物保护。

RAPD分子标记方法及在蔬菜研究中的应用

RAPD分子标记方法及在蔬菜研究中的应用
古瑜;王春国;孙德岭;宋文芹;常彩涛;柳妮莎
【期刊名称】《天津农学院学报》
【年(卷),期】2003(010)003
【摘要】总结了RAPD(random amplified polymorphic DNA)标记技术的原理、特点及在使用过程中的注意事项.综述了目前蔬菜研究、生产在品种(杂种)鉴定、分子标记辅助育种、亲缘关系和遗传多样性方面的研究,以及在遗传图谱构建等方面
的应用情况及其前景.
【总页数】5页(P47-51)
【作者】古瑜;王春国;孙德岭;宋文芹;常彩涛;柳妮莎
【作者单位】天津市蔬菜研究所,天津,300382;南开大学,生命科学学院,天
津,300071;南开大学,生命科学学院,天津,300071;天津市蔬菜研究所,天津,300382;南开大学,生命科学学院,天津,300071;天津市蔬菜研究所,天津,300382;天津市水上公园,天津,300190
【正文语种】中文
【中图分类】Q343.17;S63
【相关文献】
1.RAPD分子标记技术在甜高梁基因组研究中的应用 [J], 李南珠;李玥莹
2.RAPD分子标记技术及其在十字花科蔬菜研究中的应用 [J], 胡学军;邱正明;李金泉
3.RAPD分子标记技术在高粱抗丝黑穗病研究中的初步应用 [J], 李玥莹;李南珠;刘月;陶思源;徐昕
4.RAPD分子标记技术在蔬菜研究中的应用 [J], 邓俭英;刘忠;康德贤;方锋学
5.RAPD分子标记及其在油茶遗传育种研究中的应用(综述) [J], 邹锋;谭晓风;袁德义;袁军
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RAPD分子标记技术


3.DNA扩增

将盛放以上各组分的离心管放在DNA扩增仪上 按反应程序设定进行DNA扩增,经过35—45个 循环,将ng级的模板DNA扩增到mg级。
4.扩增产物的分离检测和记录

扩增结束后,采用1.5%的琼脂糖凝胶电泳对扩 增产物进行分离,电极缓冲液采用1×TAE (0.04M Tris-乙酸、0.001M EDTA) 电压 → 80—100V。电泳结束后,凝胶放入 0.5%EB染 → 色20—30min,然后放在中等波长紫外光下观 察记录、照相。
RAPD
Template DNA
> 2,000 bases
Primers too far apart, so amplification won’t happen
RAPD
Template DNA
100 - 1,500 bases
Primers are just the right distance apart, so fragment is amplified
4mM MgCl2 4mM MgCl2 2mM MgCl2 1.2 U Taq 0.6 U Taq 1.2 U Taq 5 pM OPA-16 10 pM OPA-16 10 pM OPA-16
M
2 3 4
5
6
7
8
9 10
M
Which variable has the greatest impact on fragment patterns?
该技术利用大量的各不相同的碱基顺序随机排列的寡rapd标记简介和原理1?rapd所使用的引物各不相同但对任一特定引物它在基因组dna序列上有其特定的结合位点这些特异的结合位点在基因组某些区域内的分布如符合pcr扩增反应的条件即引物在模板的两条链上有互补位置且引物3端相距在一定的长度范围内就可以扩增出dna片段
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242湖南农业大学学报(自然科学版)2007年8月Analysis of heavy2ion2induced D NA strand
brea ks in pla smid p UC18
GU O H ui2jun1,L IU L u2xiang1,L I Jia2ca i2,ZHA O Kui3,SUI L i3,ZHAO L in2shu1,ZHAO Shi2rong1 (11The National K ey Facility for Cro p G ene Res ources and G enetic Improvement,institute of Crop Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing100081,China;21Institute of H igh Energy Physics,Chinese Academy of Sciences,Beijing100093,China;31Depar tment of Nuclear Physics,China Institute of Atomic Energy,Beijing 102413,China)
Abstract:Plasmid DNA was irradiated or i mplanted by mixed part icle fiel d(CR)or lit hium2ion2beam to detect st rand breaks1The pri mary result s showed that mi xed particle fiel d coul d i nduce si ngle and double st rand breaks wit h positive linear2dose2effect s;most of sequence changes induced by CR were point mut ant1Lit hium2ion2beam could i nduce strand breaks also,but it was only at dose of20G y1
胡萝卜品种鉴定的RAPD分子标记技术研究
赵 彦,陈源闽3,廉 勇,王 勇,张艳萍,李敬起
(内蒙古农牧业科学院蔬菜研究所,内蒙古呼和浩特 010031)
摘 要:分别以15个胡萝卜品种的混合DNA(由各品种15个单株的DNA等量混合)为模板筛
选RAPD特异性引物,分析比较品种的特异性谱带,结果表明,从40条随机引物中筛选出S139,S140共2条随机引物可以通过特异性分子标记位点反映品种间的差异,通过RAPD分子标记引物的筛选、标记程序的完善、确定品种特异性标记谱带,可以进行胡萝卜品种的鉴定.。

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