第九章：药物蛋白质组学
第九章 药物对免疫系统的毒性作用 大纲 2015.12.4
第九章药物对免疫系统的毒性作用主讲教师：莫雪梅2015年12月4日第一节免疫反应生物学➢免疫系统：机体为适应外界环境变化，抵御病原体和外来物质侵袭而进化形成的复杂防御体系；●免疫系统基本功能：1）免疫防御功能：阻止和清除入侵病原体及其毒素，即抗感染免疫作用；2）免疫监视功能：具有识别、杀伤并及时清除体内突变细胞，防止肿瘤发生的功能；3）免疫耐受：免疫活性细胞接触抗原性物质时所表现的一种特异性无应答状态；4）免疫调节功能：使免疫应答以最恰当的形式维持在最适当的水平；免疫系统组成⏹免疫系统：由免疫器官、免疫细胞以及免疫分子组成，散布于全身各处；免疫系统组成（一）免疫器官➢中枢免疫器官：骨髓、胸腺；骨髓：B细胞发育成熟；胸腺：T细胞发育成熟；➢外周免疫器官：淋巴结、脾（二）免疫细胞➢分类：●淋巴细胞：T细胞、B细胞、NK细胞（自然杀伤细胞）等；●免疫辅佐细胞：单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞（DC）(提呈抗原)等；（三）免疫分子⏹免疫球蛋白；⏹补体；⏹细胞因子；(一) 免疫器官(一) 免疫器官⏹中枢免疫器官是免疫细胞产生、分化成熟的场所；而外周免疫器官是淋巴细胞分布定居和产生免疫应答的场所;➢中枢免疫器官：骨髓、胸腺；➢外周免疫器官：淋巴结、脾中枢免疫器官－骨髓⏹（1）骨髓：存在于长骨（如肱骨）的骨髓腔，扁平骨（如胸骨、肋骨）和不规则骨（如脊椎骨）的松质骨间网眼中的一种海绵状组织；⏹成年人骨髓分两种：红骨髓和黄骨髓；红骨髓含多能造血干细胞，能制造红细胞、血小板和白细胞；骨髓不但是造血器官，还是重要免疫器官；骨髓移植(造血干细胞移植)中枢免疫器官－胸腺⏹胸腺（thymus）：机体重要淋巴器官，与免疫紧密相关，分泌胸腺激素及激素类物质，位于胸腔前纵隔；⏹主要功能是产生T淋巴细胞；造血干细胞经血流迁入胸腺，可增殖分化发育为成熟的T细胞。
T细胞循血流再迁移到周围淋巴结的弥散淋巴组织中，此处称胸腺依赖区；外周免疫器官－淋巴结⏹淋巴结：哺乳类特有周围淋巴器官，由淋巴细胞集合而成；呈豆形，位于淋巴管行进途中，遍布全身，是产生免疫应答重要器官之一；外周免疫器官－脾⏹脾：最大周围淋巴样器官，有造血、滤血、清除衰老血细胞及参与免疫反应等功能；因其含血量丰富，能够紧急向其他器官补充血液，有¡°人体血库¡±之称；⏹正常情况，脾只产生淋巴细胞及单核细胞，但在病态及大失血后可制造各种血细胞。
【北师大】细胞生物学-----第9章蛋白质分选与膜泡运输
信号假说
① ER转运蛋白质合成的起始。通过ER转运的蛋白合成仍然起 始于胞质溶胶中的游离核糖体。核糖体是蛋白质合成的基本 装置，它并不决定合成蛋白质的去向，合成的蛋白质何去何 从，是由mRNA决定的，也就是说是由密码决定的。
②信号序列与SRP结合。SRP的信号识别位点识别新生肽的信号 序列并与之结合; 同时,SRP上的翻译暂停结构域同核糖体的 A位点作用, 暂时停止核糖体的蛋白质合成。
蛋白质氨基末端的信号序列除了作为信号被SRP识别外, 还具有起始穿膜转移的作用。
可切除（信号肽酶作用位点）
2.内部信号序列(internal signal sequence)
不位于N-末端,但具信号序列的作用,故称为内含信号序列 。
可作为蛋白质共翻译转移的信号被SRP识别,同时它也是起 始转移信号。
③SRP受体(SPR receptor),是膜的整合蛋白,为异二聚体蛋白, 存在于内质网上,可与SRP特异结合。
④停止转移序列(stop transfer sequence),肽链上的一段特 殊序列,与内质网膜的亲合力很高,能阻止肽链继续进入内质 网腔,使其成为跨膜蛋白质。
⑤转位因子(translocator),由3-4个Sec61蛋白复合体构成的 一个类似炸面圈的结构,每个Sec61蛋白由三条肽链组成。
因停止转移信号的作用而形成单次跨膜的蛋白,那么该蛋白
在结构上只有一个停止转移信号序列,没有内含转移信号， 但在N-端有一个信号序列作为转移起始信号。
该蛋白在N-末端信号序列的作用下进行共翻译转运,当停止转移信号进入通道后,与 通道内的结合位点相互作用,使通道转运蛋白失活,从而停止蛋白质的转运。由于N末端的信号序列是可切除的,信号序列被切除后形成单次跨膜蛋白。
分子生物学第九章--分子生物学研究方法电子教案精选全文
可编辑修改精选全文完整版•第九章分子生物学研究方法1．课程教学内容(1)核酸技术1—基本操作(2)核酸技术2—克隆技术(3)核酸技术3—测序(4)基因表达和表达分析基因定点诱变(5)蛋白质与核酸的相互作用(6)其他（热点）技术2．课程重点、难点基因克隆技术、杂交技术、测序技术、蛋白质与核酸的相互作用检测技术3．课程教学要求掌握基因克隆技术、杂交技术、测序技术、蛋白质与核酸的相互作用检测等各种技术的原理。
本章内容•核酸的凝胶电泳•DNA分子的酶切割•核酸的分子杂交•基因扩增•基因的克隆和表达•细菌的转化•DNA核苷酸序列分析•蛋白质的分离与纯化•研究DNA与蛋白质相互作用的方法一、核酸的凝胶电泳基本原理：当一种分子被放置在电场当中时，它们会以一定的速度移向适当的电极。
电泳的迁移率：电泳分子在电场作用下的迁移速度，它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷成正比。
由于在电泳中使用了一种无反应活性的稳定的支持介质，如琼脂糖和丙烯酰胺，从而降低了对流运动，故电泳的迁移率又同分子的摩擦系数成反比。
在生理条件下，核酸分子的糖-磷酸骨架中的磷酸基团，是呈离子化状态的。
从这个意义上讲，DNA和RNA的多核苷酸链可叫做多聚阴离子，因此，当核酸分子放置在电场中时，它就会向正极移动。
在一定的电场强度下，DNA分子的这种迁移率，取决于核酸分子本身大小和构型。
分子量较小的DNA 分子，比分子量较大的分子，具有较紧密的构型，所以其电泳迁移率也就比同等分子量的松散型的开环DNA分子或线性DNA分子要快些。
Gel matrix (胶支持物) is an inserted, jello-like porous material that supports and allows macromolecules to move through.Agarose (琼脂糖):(1) a much less resolving power than polyacrylamide,(2)but can separate DNA molecules of up to tens of kbDNA can be visualized by staining the gel with fluorescent dyes, such as ethidium bromide (EB 溴化乙锭)Polyacrylamide (聚丙稀酰胺):(1)has high resolving capability, and can resolve DNA that differfrom each other as little as a single base pair/nucleotide.(2)but can only separate DNA over a narrow size range (1 to a fewhundred bp).Pulsed-field gel electrophoresis (脉冲电泳)(1)The electric field is applied in pulses that are orientedorthogonally (直角地) to each other.(2)Separate DNA molecules according to their molecule weight, as wellas to their shape and topological properties.(3)Can effectively separate DNA molecules over 30-50 kb and up toseveral Mb in length.二、DNA分子的酶切割Restriction endonucleases (限制性内切酶) cleave DNA molecules at particular sitesRestriction endonucleases (RE) are the nucleases that cleave DNA at particular sites by the recognition of specific sequences.RE used in molecular biology typically recognize (识别) short (4-8bp) target sequences that are usually palindromic (回文结构), and cut (切割) at a defined sequence within those sequences. e.g. EcoRIThe random occurrence of the hexameric (六核苷酸的) sequence: 1/4096 (4-6=1/46)(1) Restriction enzymes differ in the recognition specificity: target sites are different.(2) Restriction enzymes differ in the length they recognized, and thus the frequencies differ.(3) Restriction enzymes differ in the nature of the DNA ends they generate: blunt/flush ends (平末端), sticky/staggered ends (粘性末端).(4) Restriction enzymes differ in the cleavage activity.三、核酸的分子杂交原理：带有互补的特定核苷酸序列的单链DNA或RNA，当它们混合在一起时，其相应的同源区段将会退火形成双链的结构。
第9章 药物蛋白质组学
20世纪中期以来, 随着DNA 双螺旋结构的提出和 蛋白质空间结构的X射线解析, 开始了分子生物学 时代。 20 世纪90年代初期, 美国生物学家提出并实施了 人类基因组计划( human genome project, HGP), 预计在15年内投入30亿美元, 希望在分子水平上 破译人类所有的遗传信息. 2003年4月14日,美国人类基因组研究项目首席科 学家Collins F 博士在华盛顿隆重宣布: 人类基 因组序列图绘制成功。
生命现象的主要体现者是蛋白质, 而蛋白质有其自身的特定活动规律,仅仅从 基因的角度来研究是远远不够的, 必须研究由基因转录和翻译出蛋白质的过 程,才能真正揭示生命现象的本质和规律。
后基因组时代
在后基因组时代, 研究的重心已从揭示生命 的所有遗传信息转移到在整体水平上对生物 功能的研究。
转向的第一个标志——产生了功能基因组学 的新学科。 另一个标志——产生了一门在整体水平上研 究细胞内全部蛋白质组成及其活动规律的新 兴学科—蛋白质组学。
二、蛋白质学的分类
1、表达蛋白质组学
是研究差异样品间蛋白质表达量的变化
。
2、结构蛋白质组学
又称细胞图谱蛋白质组学，
针对某一特定细胞器中全部蛋白质或蛋白 质复合体的结构进行分析，确定它们在细 胞质中的定位，了解蛋白质之间的相互关 系。
3、功能蛋白质组学
对蛋白质间、蛋白质与DNA/RNA 间 的相互作用及蛋白质翻译后修饰的研 究。
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第二节 药物蛋白质组学及应用
一、概述
二、药物蛋白质学应用
三、蛋白质组学在药物不良反应研究中的应用 四、蛋白质组学在中药研究中的应用 五、蛋白质组学研究的展望
生物制药复习题
第一章绪论1、生物药物广泛应用于医学各领域，按功能用途可分为三类，分别是（）、（）、（)2、生物技术制药发展历程经历了飞速发展的四个十年，分别是（）、（）、（）、（）。
3、生物技术所含的主要技术范畴有（）、（）、（）、（）、（）、（）、（）、（）和（）。
4、下列哪个产品不是用生物技术生产的（）A 青霉素B 淀粉酶C 乙醇D 氯化钠5、我国科学家承担了人类基因组计划（）的测序工作A 10%B 5%C 1%D 7%6、生物技术7、生物技术药物8、生物技术制药第二章基因工程制药1、基因工程药物制造的主要步骤是：（）、（）、（）、（）、（）、（）。
2、目的基因获得的主要方法是（）、（）、（）、（）。
3、基因表达的微生物宿主细胞分为2大类。
第一类为（），目前常用的主要有（）；第二类为（），常用的主要有（）。
4、基因工程药物的分离纯化一般不应超过5个步骤，包括（）、（）、（）、（）和（）。
5、在基因工程药物分离纯化过程中，基因重组蛋白的分离比较困难，可用（）、（）、（）、（）的方法，达到初步分离的目的。
6、人工化学合成DNA新形成的核苷酸链的合成方向是（），合成的DNA 5’末端是（），3’末端是（）。
7、凝胶过滤法是依赖（）来分离蛋白组分A、分子大小B、带电状态C、分子质量D、解离状态8、可用于医药目的的蛋白质和多肽药物都是由相应的（）合成的A RNAB 基因C 氨基酸D 激素9、用反转录法获得目的基因，首先必须获得（） P13cDNA文库法A tRNAB cDNAC rRNAD mRNA10、那一类细菌不属于原核细胞（）A 大肠杆菌B 枯草芽孢杆菌C 酵母D 链霉菌11、基因工程菌的生长代谢与（）无关A 碳源B RNA聚合酶C 核糖体 D产物的分子量12、基因工程菌的高密度发酵过程中，目前普遍采用（）作为发酵培养基的碳源A 葡萄糖B 蔗糖C 甘油 D甘露醇13、下列那种色谱方法是依据分子筛作用来纯化基因工程药物（）A 离子交换色谱B 亲和色谱C 凝胶色谱 D气相色谱简答:1、基因工程制药的概念？2、什么是载体？载体主要有哪几种？3、质粒载体的三种构型是什么？质粒载体的性质？用于克隆表达质粒载体的三个要素是什么？4、目的基因常用的制备方法有哪四种？这四种方法的基本步骤是什么？5、影响目的基因与载体之间的连接效率的主要因素是什么？6、重组DNA导入宿主细胞常用的四种方法是什么？7、什么是重组子？重组子删选与鉴定的5种方法是什么？8、重组蛋白的四种主要的分离技术？重组蛋白四种主要的纯化技术？9、分离纯化工艺应遵循的原则？10、基因工程药物的改造目的及改造思路是什么？11、定点突变的三种类型？12、基因工程的质量控制要点？13、蛋白质含量测定的5种方法？14、什么是蛋白质的等电点？等电聚焦法的原理？15、大肠杆菌表达系统的优缺点。
生物化学第九章蛋白质分解代谢
CH3 CHNH2 COOH
丙氨酸
COOH CH2 CHNH2 COOH
天冬氨酸
COOH + (CH2)2
C=O COOH α-酮戊二酸
COOH
+
(CH2)2
C=O
COOH
α-酮戊二酸
ALT AST
CH3 C=O COOH
丙酮酸
COOH
+ (CH2)2 CHNH2 COOH 谷氨酸
COOH CH2 C=O COOH
O H 酪胺
O H β-羟酪胺
（二） 氨的生成
未被吸收的氨基酸 渗入肠道的尿素
肠道细菌 脱氨基作用
尿素酶
氨 (ammonia)
• 降低肠道pH，NH3转变为NH4+以铵盐形式排出，可减少氨的吸收，这是酸性灌肠的依据。
（三）其它有害物质的生成
酪氨酸 半胱氨酸 色氨酸
苯酚 硫化氢 吲哚
第三节 氨基酸的一般代谢
生糖氨基酸
生酮氨基酸
生糖兼生酮 氨基酸
分类 生糖氨基酸 生糖兼生酮氨基酸 生酮氨基酸
生糖和生酮氨基酸种类
氨基酸 甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、精氨酸、脯氨酸、谷氨 酸、谷氨酰胺、苏氨酸、缬氨酸、组氨酸、甲硫氨 酸、半胱氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺
苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、异酸脱氢酶
NAD+ NADH+H+ （NADP+ NADPH+H+）
+H2O -H2O
3.谷氨酸脱氢酶的特点： ⑴活性高、分布广，（肌肉中活性很低） ⑵催化的反应可逆，逆过程可合成谷氨酸
4.氧化脱氨基作用的局限性： 仅谷氨酸经此脱氨
（三）联合脱氨基作用
2024-药物分析第九章
血浆的制备： 采集的静脉血液置含有抗凝剂的试管中，混
合后，以2500～3000r/min离心5～10min使 与血球别离，所得淡黄色上清液即为血浆。
抗凝剂—最常用的是肝素，其它抗凝剂EDTA、 枸橼酸盐、草酸盐等
血清的制备 采集的静脉血液置试管中，于37℃或室温放 置30min～1h。血液凝固后，用细竹棒或玻璃 棒 轻轻剥去试管壁上的血饼，再在2500～3000 r/min离心5～10min，上层淡黄色液体即为血 清
之间的关系； ③样品易于获取，便于处理、分析。 样品的贮存和稳定性
一、样品的采集
生 物
脏器组织
样 品
体液
血液、尿液、唾液、毛发、乳汁、 精液、脑脊液、泪液、胆汁、
胃液、胰液、淋巴液、粪便等
血液(血浆、血清)—表达药物浓度和治疗作用之间的关系 ——最常用的生物样本
〔一〕血样 因血液中药物浓度可以较好地表达药物浓度
被测定的药物和代谢物的浓度或活性极低； 样品复杂，干扰物多，大多需要别离和净化； 样品量少，不易重新获得； 在毒物学检测中要求能很快地提供结果； 分析方法具有类型多样化和综合性。
分析方法的新要求
药物服用的剂量越来越小、体液中药物浓度越来越低，对体内药物分析方法提出 了新的要求： 1. 检测方法的高灵敏度——最低检测量10-9-10-7g或10-15-10-12g 2. 别离方法的高选择性、高专属性。为满足各项要求，最常用的分析方法有 ①光谱法——比色法、紫外分光光度法、荧光分光法、原子吸收分光光度法 ②色谱法——TLC、GC、HPLC〔柱切换、手性药物〕、HPCE〔high-performance capillary electrophoresis高效毛细管电泳法 〕 ③免疫分析法——RIA放射免疫法、EIA酶免疫法、化学发光酶免疫、荧光免疫分析 ④联用技术——GC-MS、LC-MS
《动物生物化学》第九章蛋白质的生物合成试卷
8、核糖体循环：在翻译起始复合体形成的基础上，活化氨基酸在核蛋白体上反复翻 译 mRNA 上的密码并缩合生成多肽的循环反应过程。
院系 动物科技学 院
年级
专业 动物医学
姓名
学号
考试课程 动物生物化 学
《动物生物化学》第九章蛋白质的生物合成
题号
一
得分
二
三 四 五 六 七 八 总分
一、 名词解释
1、翻译（translation）是指以 mRNA 为“模板”、以各种氨基酸为原料合成蛋白质的过程。 2、S-D 序列：在翻译起始密码子 AUG 的上游，相距约 8—13 个核苷酸处，有一段由 4-9 个核 苷酸组成的富含嘌呤的序列。这一序列以 AGGA 为核心，因其发现者是 Shine-Dalgarno 而得 名 。 mRNA 上的 S-D 序列又称为核蛋白体结合位点 3、开放阅读框：从起始密码子开始，是 DNA 序列中具有编码蛋白质潜能，一段无终止密码 子打断的碱基序列。
合成的多肽链一级结构改变。
18、氯霉素能与核糖体 50S 亚基结合，抑制 转肽 酶活性，从而抑制蛋白质合成。
19、促进蛋白折叠功能的两种酶是 蛋白二硫键异构酶 和 肽-脯氨酰顺反异构酶。
20、结合蛋白是在 细胞内质网 及 高尔基体 中完成结合辅基等加工修饰的。
三、单项选择题
1．哺乳动物核糖体大亚基的沉降常数是：（ D ）
A．40S B．70S C．80S D．60S
2．多肽链的氨基酸序列取决于：（ A ）
A．mRNA
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第六章 常用分子生物学技术
核酸分子杂交：核酸探针
印迹杂交：Southern blot、Northern
blot、Western blot；原位杂交（荧光 原位杂交）；生物芯片（基因芯片、
蛋白质芯片）
第六章 常用分子生物学技术
聚合酶链式反应 (PCR)：
PCR原理、体系、步骤；RT-PCR、多重PCR
Present only in (a)
Sample (a) Sample (b) Stronger in (b) than (a) or (c) Sample (c)
Present in (a) and (c) not (b)
荧光差异显示双向电泳 (2D-DIGE)
关 键 问 题： 如何鉴定双向电泳分离出来的蛋白质？
药物作用靶点（drug target）：具有重要生理 或病理功能，能够与药物分子相结合并产生药理 作用的(生物大)分子及其特有的结构位点。
Current number of drug targets ~500
Nuclear receptors 2% Ion channels 5% Unknown 7% Hormones & factors Enzymes 11% 28%
质谱分析技术路线：
电离
质量分选
离子源
形成带电离子
质量分析器
根据m/z分选离子
离子检测器
检测离子
样品
固体 液体 蒸汽
质谱分析的基本步骤: 1. 样品离子化 2. 根据质荷比(m/z)不同分离离 子 3. 检测每种质量离子的数目 4. 收集、处理数据得到质谱图
数据处理
质谱
离子源——基质辅助激光解析电离 (MALDI)
质量分析器——飞行时间 (TOF)
MALDI-TOF MS （基质辅助激光解析电离飞行时间质谱）
图1. 一个典型的质谱图 （横坐标为质荷比，即相对分子质量，纵坐标 为各个肽段的相对含量，每个峰的数字代表了这 个峰对应的肽段的质量）
肽质量指纹谱（PMF）
凝胶 数据库
? 蛋白质
胰酶消化 质谱
3235.2256 1234.5396
、实时荧光定量PCR；PCR技术应用 RNA 干 扰 技 术 ： siRNA 、 RNA 干 扰 、 机制、应用 基因敲除技术：基因敲除
第十章
外源基因表达与基因工程药物
基因工程（DNA重组、分子克隆）技术 分子克隆程序：分、切、连、转、筛、表 目的基因获取途径 载体（种类、特征）、质粒、多克隆位点 、工具酶、感受态细胞、转化、转导 阳性重组体筛选 基因工程生产重组药物一般流程
质 谱 分 析
质谱：是将被测物用一定的方法离子化，然后 按产生的带电离子的质荷比（质量/电荷，m/z ）进行分离并检测，最后根据各离子谱峰的强 度解析被测物的相对分子质量和结构信息的一 种分析技术。用于测量分析生物样本（蛋白质 、核酸）称为生物质谱。
12 units 12 units
8
9
10 11 12 13 14 15 16
基因失活性治疗
第二篇 药学分子生物学应用
第九章 药物蛋白质组学
(Phamacoproteomics)
一、概述（概念、分类、主要技术） 二、药物蛋白质组学及应用
一、蛋白质组学(proteomics)
蛋白质组 (Proteome)： 一种细胞、某一特 定组织或个体所表达的全部蛋白质。 蛋白质组学 (Proteomics)： 从整体水平研究蛋白质组成 、表达水平、翻译后修饰、 相互作用的学科。
siRNA药物
根据 RNA 干扰原理设计出来的小干扰 RNA ， 通过诱导同源mRNA降解，有效阻断基因表达， 起到治疗疾病效果。 VEGF 可 促 进 湿 性 老 年 性 黄 斑 变 性 （ wetAMD）眼中新血管的生长，使血液渗漏进人眼 内，从而导致视力丧失。 OPKO公司开发出 Bevasiranib（siRNA药物） ，抑制VEGF表达，治疗AMD。
New Targets Expected from Human Genome Project
药物作用靶点发现的方法
考试题型
1、名词解释：3分/题，10题
2、填空题：1分/空，20空
3、论述题：10分/题，3题 4、案例分析题：20分/题，1题
第一章 基因与基因组
基因、基因组、基因组学 病毒、原核生物、真核生物基因组特点 重叠基因、操纵子、断裂基因、基因家 族；顺式作用元件、反式作用因子、启 动子 人类基因组计划
反义药物特点:
新的化学物质（核酸）； 新的药物受体（ DNA或mRN）。
第一个反义药物：福米韦生 (fomivirsen) 1998年，美国FDA批准，由21个硫代脱氧核苷酸 组 成 。 通 过 抑 制 人 类 巨 细 胞 病 毒 （ CMV ） mRNA发挥抗病毒作用。
DNA 2%
Receptors 45%
Proteins/peptides ~ 95%
新的药物作用靶点
Number of Drug Targets 12,000 10,000 8,000 6,000 4,000 2,000 0 Approx. 500 5,000–10,000
Cumulative Number of Targets Known Today
转录组学（transcriptomics）
在整体水平研究细胞中基因转录情况及其调控 规律的学科。
研究方法：基因芯片技术、SAGE （基因表达系列分析）、 MPSS（大规模平行信号测序系统）、 RNA测序
第二节 转录组学在药学中的应用
一、药靶候选基因的鉴定 二、反义药物和siRNA药物 反义药物：通过与靶DNA 或 mRNA 互补 杂交，阻止或抑制靶基因表达，发挥治疗 作用的药物。 包括：反义DNA、 反义RNA、 核酶
1
2
3
多肽 已测得质 谱数据或理论 质谱 数据
783.9147 375.2561
比较: 是否相同 ??
蛋 白 质 芯 片
酵母双杂交
二、药物蛋白质组学及应用
构建分子药理筛选模型 ：分子细胞、组织器官 、整体动物水平 药物靶点的发现、 验证和优化 药物作用机制研究 药物毒理机制研究 耐药机制研究
二、蛋白质组学分类
1. 表达蛋白质组学：比较正常样品与
病理样品、药物治疗前后样品的蛋白 质表达或修饰差异。
2. 结构蛋白质组学：分析蛋白质或复
合体结构、定位
3. 功能蛋白质组学：研究蛋白质功能
基因组-转录组-蛋白质组
DNA (Genome) RNA (Transcriptome) Proteins (Proteome)
药学分子生物学
张 徐
江苏大学 医学院 分子生物学及检验教研室
xuzhang@
第二篇 药学分子生物学应用
第八章 药物转录组学
(pharmacotranscriptomics)
一、转录组与转录组学
二、转录组学在药学中的应用
转录组（transcriptome）
广义：指在某一生理条件下、一种细胞、组织 、器官或生物体所能转录出来的所有RNA的总 和，包括mRNA和非编码RNA。 狭义：指所有mRNA的集合。
第七章 药物基因组学
定义、目标、研究方法
单核苷酸多态性(SNP)、单体型、检测技术
遗传变异与药物应答 基因分型指导合理用药
药物基因组学与新药研发、个性化用药
第八章 药物转录组学
反义药物
siRNA药物与基因失活性治疗
第九章 药物蛋白质组学
主要研究技术
药物蛋白质组学的应用
?
DNA sequencing Whole genome Microarray 2D-PAGE MS/MS
四、蛋白质组学主要研究技术
1、蛋白质分离 双向凝胶电泳技术 2、蛋白质鉴定 生物质谱 3、蛋白质-蛋白质相互作用 蛋白质芯片、酵母双杂交
双向凝胶电泳技术
双向凝胶电泳技术
双向凝胶电泳技术
双向凝胶电泳图像分析