浅析功能基因组学和蛋白质组学的概念及应用
基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用
基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用基因组学和蛋白质组学是现代医学领域的两个重要分支。
随着研究的深入和技术的进步，两者的结合已经成为疾病诊断和治疗领域的重要趋势。
本文将探讨基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用。
一、基因组学在疾病诊断中的应用基因组学是研究基因组DNA序列及其功能的学科。
人类基因组的测序已经完成，这为研究基因与疾病之间的关系提供了基础。
基因突变会导致蛋白质的异常表达，从而引起疾病的发生。
随着高通量测序技术的发展，人们可以对数千个基因进行快速测序，大大提高了疾病的诊断效率。
例如，在肿瘤学中，基因组学已经成为一种诊断方法。
通过对肿瘤细胞和正常细胞的基因组测序和比较，可以发现肿瘤中存在的突变和变异。
这些数据可以帮助医生辨认出不同类型的肿瘤，并且可以针对不同的肿瘤类型进行个性化治疗。
此外，基因组学还应用于遗传疾病的诊断。
许多遗传疾病是由基因突变引起的。
通过基因组测序，可以确定这些突变，并且为治疗和预防提供一定的指导。
二、蛋白质组学在疾病诊断中的应用蛋白质组学是研究蛋白质组成和功能的学科。
蛋白质是细胞内最重要的组成部分，其功能包括催化代谢过程、维持细胞结构和参与信号传递等。
蛋白质组学的发展为研究疾病提供了全新的视角。
在医学领域，蛋白质组学主要应用于疾病诊断、治疗和预防。
例如，蛋白质组学已经被应用于肿瘤学中。
通过分析癌细胞与正常细胞的蛋白质组成差异，可以发现癌细胞的特异性标志物。
这些标志物可以被用作肿瘤的早期诊断和治疗的监测。
同样地，蛋白质组学还应用于心血管疾病和神经系统疾病的诊断。
通过分析血液和脑脊液中特定蛋白质的含量，可以发现特定疾病的标志物，并且可以为疾病的诊断和预测提供一定的帮助。
三、基因组学和蛋白质组学的结合在疾病诊断中的应用尽管基因组学和蛋白质组学都可以为疾病诊断提供重要的信息，但是两者之间的联系常常被忽视。
事实上，基因突变通常会导致蛋白质的失调。
因此，将基因组学和蛋白质组学相结合可以更好地了解疾病的发生机制，从而提高疾病的诊断和治疗效果。
基因组学和蛋白质组学在微生物研究中的应用
基因组学和蛋白质组学在微生物研究中的应用在微生物学领域，基因组学和蛋白质组学是两个非常重要的分支，它们通过研究微生物的基因组和蛋白质组，揭示微生物的遗传信息以及代谢机制等内容，为微生物研究提供了非常有力的工具。
本文将详细探讨基因组学和蛋白质组学在微生物研究中的应用。
一、基因组学在微生物研究中的应用1. 基因组学在微生物分类学中的应用基因组学的发展使得微生物分类学可以更准确地进行物种分类和系统发育分析。
通过对微生物基因组的解析，可以比较全面地了解微生物的基因组结构、基因类型、基因数量、基因分布、基因簇等信息，从而对微生物进行分类和演化分析，这对于微生物学领域的研究具有非常重要的意义。
2. 基因组学在微生物代谢途径和生物合成研究中的应用微生物代谢途径和生物合成研究是基础生物学和微生物学领域的重要内容。
基因组学技术可以通过对微生物基因组进行系统全面的研究，深入挖掘微生物的代谢途径和生物合成机制，如此可以提高微生物资源的开发和应用。
3. 基因组学在微生物基因工程中的应用基因组学技术可以被应用到微生物基因工程中，进而促进微生物的代谢途径调控、重建以及生物合成工程的设计。
这些都是基因组学在微生物研究方面的重要应用，也为微生物资源的改良和开发提供了核心技术支撑。
二、蛋白质组学在微生物研究中的应用1. 蛋白质组学在微生物代谢途径和生物合成研究中的应用蛋白质组学技术为微生物的代谢途径和生物合成的研究提供了强有力的工具。
通过分析微生物的蛋白质组，可以揭示其重要的功能性蛋白质和酶的信息，加深对微生物代谢途径和生物合成机制的了解。
同时，结合基因组学和蛋白质组学技术，可以进行蛋白质水平的代谢途径重建以及生物合成的控制研究，从而为微生物资源的开发和应用提供重要途径。
2. 蛋白质组学在微生物蛋白质分泌路和附着过程中的应用通过蛋白质组学技术，可以对微生物的蛋白质分泌和附着过程进行深入的研究。
蛋白质组学技术能够对微生物蛋白质分泌中的酶、分泌途径和分泌因子等因素进行分析，从而加深对微生物的分泌机制的理解。
浅析功能基因组学和蛋白质组学的概念及应用
【摘要】基因组相对较稳定,而且各种细胞或生物体的基因组结构有许多基本相似的特征；蛋白质组是动态的,随内外界刺激而变化。
对蛋白质组的研究可以使我们更容易接近对生命过程的认识。
蛋白质组学是在细胞的整体蛋白质水平上进行研究、从蛋白质整体活动的角度来认识生命活动规律的一门新学科，简要介绍功能基因组学和蛋白质组学的科学背景、概念及其应用。
【关键词】基因组；功能基因组学；蛋白质组学;一、基因组及基因组学的概念基因组（genome）一词系由德国汉堡大学H．威克勒教授于1920年首创，用以表示真核生物从其亲代所继承的单套染色体，或称染色体组.更准确地说，基因组是指生物的整套染色体所含有的全部DNA序列。
由于在真核细胞的线粒体和植物的叶绿体中也发现存在遗传物质，因此又将线粒体或叶绿体所携带的遗传物质称为线粒体基因组或叶绿体基因组.原核生物基因组则包括细胞内的染色体和质粒DNA。
此外非独立生命形态的病毒颗粒也携带遗传物质，称为病毒基因组。
所有生命都具有指令其生长与发育，维持其结构与功能所必需的遗传信息，本书中将生物所具有的携带遗传信息的遗传物质总和称为基因组。
[1]基因组学(genomic)一词系由T．罗德里克(T．Roderick)于1986年首创，用于概括涉及基因组作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学学科分支，并已用来命名一个学术刊物Genomics.基因组学是伴随人类基因组计划的实施而形成的一个全新的生命科学领域。
[1］基因组学与传统遗传学其他学科的差别在于，基因组学是在全基因组范围研究基因的结构、组成、功能及其进化，因而涉及大范围高通量收集和分析有关基因组DNA的序列组成，染色体分子水平的结构特征,全基因组的基因数目、功能和分类，基因组水平的基因表达与调控以及不同物种之间基因组的进化关系。
基因组学的研究方法、技术和路线有许多不同于传统遗传学的特点，各相关领域的研究仍处于迅速发展和不断完善的过程中.基因组学的主要工具和方法包括：生物信息学，遗传分析,基因表达测量和基因功能鉴定。
基因组学和蛋白质组学的研究和应用
基因组学和蛋白质组学的研究和应用1. 引言基因组学和蛋白质组学是现代生物学领域的两个重要分支，它们分别研究生物体的基因组成和蛋白质组成。
近年来，随着科学技术的飞速发展，基因组学和蛋白质组学在生物学、医学、农业等领域发挥着越来越重要的作用。
本文将介绍基因组学和蛋白质组学的基本概念、研究方法及其在各个领域的应用。
2. 基因组学2.1 基本概念基因组学（Genomics）是研究生物体基因组成、结构和功能的科学。
基因组是指一个生物体所有遗传信息的总和，包括DNA序列、基因以及非编码DNA等。
基因组学研究旨在揭示生物体的遗传特性、基因表达调控、基因与疾病的关系等。
2.2 研究方法基因组学研究方法主要包括基因组测序、基因表达谱分析、基因组变异分析等。
1.基因组测序：目前常用的基因组测序技术有Sanger测序和下一代测序（NGS）技术。
Sanger测序适用于对个别基因或片段进行精确测序，而NGS技术则可以对整个基因组进行大规模、高通量的测序，从而获得大量的基因组信息。
2.基因表达谱分析：通过检测基因在特定生物过程中的表达水平，可以了解基因在生物体中的功能。
常用的表达谱分析方法包括microRNA测序、RNA-seq等。
3.基因组变异分析：通过对基因组变异（如单核苷酸多态性、插入和缺失等）进行检测和分析，可以研究基因与疾病、进化等的关系。
常用的变异分析方法包括SNP测序、外显子测序等。
2.3 应用领域基因组学在生物学、医学、农业等领域具有广泛的应用前景。
1.生物学：基因组学可以帮助研究者揭示生物体的遗传特性、基因表达调控等，从而深入了解生物体的生命过程。
2.医学：基因组学在疾病诊断、治疗和预防方面具有重要作用。
通过基因组学方法，可以发现与疾病相关的基因变异，为疾病的早期诊断和个体化治疗提供依据。
3.农业：基因组学在植物和动物育种方面具有广泛应用。
通过研究生物体的基因组，可以培育出具有优良性状的新品种，提高农业产量和效益。
基因组学与蛋白质组学
基因组学与蛋白质组学在科学研究领域中，基因组学和蛋白质组学是两个重要且密切相关的学科。
基因组学研究基因组中的所有基因，而蛋白质组学则研究细胞或生物体内所有蛋白质的组成和功能。
本文将从基因组学和蛋白质组学的原理和技术入手，分别介绍它们的研究对象和方法，并探讨二者之间的关系与应用。
一、基因组学基因组学是研究基因组的学科，基因组是指一个生物体内的所有基因的总和。
基因是遗传信息的基本单位，负责编码蛋白质和调控生物体的生理功能。
通过基因组学的研究，我们可以了解到一个生物体的基因组组成、结构和功能等信息。
1.1 基因组的分类基因组可以分为原核生物基因组和真核生物基因组。
原核生物基因组比较简单，一般只有一个染色体，如细菌和古细菌。
真核生物基因组相对复杂，由多个染色体组成，如人类和动物。
此外，还有一个概念是人类基因组。
人类基因组是指人类体内的所有基因的总和，它是真核生物基因组的一种。
1.2 基因组研究的方法基因组学的研究方法主要包括基因测序和基因表达分析。
基因测序是确定一个生物体基因组DNA序列的过程。
早期的基因测序技术采用Sanger测序法，但随着高通量测序技术的发展，如第二代测序技术（NGS），基因测序的速度和效率大大提高。
基因表达分析是研究基因在特定条件下的表达水平和模式。
常用的方法有微阵列芯片和RNA测序。
1.3 基因组学的应用基因组学的研究对于理解生命的发展和信号传递、疾病的诊断和治疗等方面具有重要意义。
在生命科学领域，通过对基因组的研究，可以了解基因之间的相互作用和调控关系，从而深入了解生命的本质。
此外，基因组学也可以帮助研究人类进化和种群遗传学问题。
在医学方面，基因组学为疾病的诊断和治疗提供了新的思路和方法。
通过比较基因组，可以快速准确地诊断某些遗传性疾病，并开发个性化治疗方案。
二、蛋白质组学蛋白质组学是研究蛋白质组的学科，蛋白质组是指细胞或生物体内所有蛋白质的总和。
蛋白质是细胞内的重要功能分子，不仅可以作为酶催化化学反应，还可以作为结构蛋白和信号传递分子等。
功能基因组学和蛋白质组学研究
功能基因组学和蛋白质组学研究随着基因组学的发展，生物学的一个新的分支——功能基因组学逐渐受到注目。
它致力于阐明基因组的完整结构和功能，通过系统生物学的研究手段（如基因表达谱、蛋白质组学）来探究基因组和蛋白质组之间的相互作用关系，以期为基因及其调控研究提供新的思路和方法。
一、功能基因组学的概念及一些典型研究方法和手段功能基因组学是指研究基因和其调控因素与表型之间的关系，扩展了以往基因组学的观测范围。
典型的研究方法常包括以下几种：1. 基因表达谱（Gene expression profiling）：也称转录组学，是指针对某些生命体系的基因转录进行定量分析的技术。
通过对转录组的探索，可以揭示不同发育阶段、不同组织、不同生长条件下的基因表达量差异，从而了解基因的功能和调节。
2. DNA变异分析（DNA variant analysis）：DNA变异分析是指DNA序列的不同之处地图分析，为了描述基因-表型关联特征及遗传精度提供更好的信息。
通过DNA变异的分子标记对基因组中具有多态性的位点进行分型，从而揭示不同变异与表型间的关系。
3. 蛋白质组学（Proteomics）：研究生物体中所有蛋白质以及蛋白质的结构、功能和调控，是一种准确地描述细胞各种阶段的蛋白质状态。
4. DNA甲基化分析（DNA methylation analysis）：分析DNA甲基化，是研究生命体系寄主基因组的关键过程。
DNA甲基化是指DNA上的化学修饰，它通过一种常规的传递方式传递给后代，同时影响基因的表达和调控。
二、蛋白质组学在生物领域中的应用随着基因表达谱研究的深入，蛋白质质谱技术的逐渐成熟，蛋白质组学的应用范围逐渐扩展。
在生物领域中，蛋白质组学的重要应用可归纳为以下几个方面：1. 生物网络的分析：蛋白质本身的互作和间接作用构成了复杂的网络，通过分析网络可以检测尤其重要的蛋白质，了解重要蛋白质所参与的信号通路。
2. 生命过程的分析：不断进化的生命过程中，每个生命体系都具有独特的蛋白质组束缚。
基因组学和蛋白质组学在生命科学中的应用
基因组学和蛋白质组学在生命科学中的应用生命科学的不断发展，使得科学家们可以探索更深层次的生命现象。
其中，基因组学和蛋白质组学是现代生命科学中不可或缺的两个领域。
本文将从基因组学和蛋白质组学的定义、技术和应用三个方面进行阐述。
一、基因组学和蛋白质组学的定义基因组学是研究基因组的结构和功能的科学，它主要涉及DNA的序列、基因组大小、基因组组成以及基因之间的相互作用。
基因组学的研究不仅能帮助我们深入了解个体间的差异，还能对疾病的病因和治疗等方面提供重要的指导。
蛋白质组学是一门研究生物体特定条件下所有蛋白质种类、数量和相互作用的科学。
与基因组学相比，蛋白质组学研究的是生命体系中直接表达出来的分子基础，即蛋白质。
蛋白质组学不仅能够帮助我们在疾病诊断和治疗方面提供指导，还能为药物研发提供有力的支持。
二、基因组学和蛋白质组学的技术随着科技的飞速发展，基因组学和蛋白质组学的研究方法也不断更新。
其中，最具代表性的应该是下一代测序技术和质谱技术。
下一代测序技术又称第二代测序技术，是一种高通量测序技术，其开创性地将测序时间和成本大大减小。
下一代测序技术在基因组学和转录组学等领域广泛应用，可以将获取的大量DNA或RNA序列根据启发式算法进行拼接，最终得到基因组或转录组的完整序列。
下一代测序技术不仅可以加速DNA或RNA序列的分析，而且可以更加深入地探究DNA或RNA序列间的相互作用和调节机制。
质谱技术是蛋白质组学中比较重要的分析技术，通过获取蛋白质和蛋白质复合物的质量信息，可以建立蛋白质相互作用网络图和半定量蛋白质定量结构。
质谱技术在蛋白质组学中的应用非常广泛，可以通过蛋白质组学分析来研究蛋白质的表达模式、结构和功能等相关问题。
三、基因组学和蛋白质组学的应用基因组学和蛋白质组学的应用范围的广度和深度都非常令人瞩目。
基因组学在精准医学、疾病预防和治疗等领域具有重要的应用前景。
例如，基因组学的研究可以为个体化抗癌治疗提供重要依据。
基因组学和蛋白质组学的研究及应用
基因组学和蛋白质组学的研究及应用近年来，基因组学和蛋白质组学的研究在生命科学领域已经成为热门话题。
这两个学科在生命科学的研究中发挥着至关重要的作用。
下面将对基因组学和蛋白质组学的研究和应用进行详细阐述。
一、基因组学基因组学是研究整个基因组（一个生物个体所有基因的集合）结构、功能和演化的学科。
基因组学主要包括基因组测序、功能基因组学、比较基因组学等方面。
随着生物信息学的发展，高通量基因测序技术的诞生使人类对基因组学的研究能够快速地推进。
基因组学的研究有很多的应用。
首先可以用于研究人类的遗传疾病。
通过对人类基因组的测序和分析，可以发现与疾病相关的基因。
例如，一些癌症的发生与基因的突变有关，通过测序和分析基因组可以发现哪些基因发生了突变，从而为治疗提供方便。
其次，基因组学还可以用于物种演化和分级的研究。
对于某些较为原始的生物种类，没有详细的分类学树，而通过对其基因组的比较和分析，可以为其分类提供帮助。
最后，基因组学也可以用于农业领域。
通过研究诸如作物的基因组，可以选育出抗病、高产和优质的品种。
二、蛋白质组学蛋白质组学是研究生物体内蛋白质表达、组成、结构、功能及相互作用等方面的学科。
蛋白质是生物体内最重要的分子之一，它参与了生物体内的几乎所有生命活动。
蛋白质组学主要的性质是以全局性的研究为基础，它一方面可以用于发掘新的功能基序，另一方面则可以寻找蛋白质相互作用的关系网络。
在蛋白质组学的研究中，最重要的技术是串联质谱（MS/MS）技术。
它是一种高通量蛋白质预测和鉴定技术，能够鉴定大量的物种蛋白质以及它们之间的相互作用。
同样，蛋白质组学的研究也有许多重要的应用。
例如，蛋白质组学可以用于研究癌症的发生和发展。
通过检测肿瘤组织和正常组织中蛋白质的变化，可以找到有关癌症发生和发展的规律。
此外，蛋白质组学还可以用于研究药物的研发。
药物分子往往作用于蛋白质，而蛋白质组学可以帮助药物研发人员确定特定蛋白质的结构、功能及相互作用。
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【摘要】基因组相对较稳定，而且各种细胞或生物体的基因组结构有许多基本相似的特征；蛋白质组是动态的，随内外界刺激而变化。
对蛋白质组的研究可以使我们更容易接近对生命过程的认识。
蛋白质组学是在细胞的整体蛋白质水平上进行研究、从蛋白质整体活动的角度来认识生命活动规律的一门新学科，简要介绍功能基因组学和蛋白质组学的科学背景、概念及其应用。
【关键词】基因组；功能基因组学；蛋白质组学；一、基因组及基因组学的概念基因组(genome)一词系由德国汉堡大学H．威克勒教授于1920年首创，用以表示真核生物从其亲代所继承的单套染色体，或称染色体组。
更准确地说，基因组是指生物的整套染色体所含有的全部DNA序列。
由于在真核细胞的线粒体和植物的叶绿体中也发现存在遗传物质，因此又将线粒体或叶绿体所携带的遗传物质称为线粒体基因组或叶绿体基因组。
原核生物基因组则包括细胞内的染色体和质粒DNA。
此外非独立生命形态的病毒颗粒也携带遗传物质，称为病毒基因组。
所有生命都具有指令其生长与发育，维持其结构与功能所必需的遗传信息，本书中将生物所具有的携带遗传信息的遗传物质总和称为基因组。
[1]基因组学(genomic)一词系由T．罗德里克(T．Roderick)于1986年首创，用于概括涉及基因组作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学学科分支，并已用来命名一个学术刊物Genomics。
基因组学是伴随人类基因组计划的实施而形成的一个全新的生命科学领域。
[1]基因组学与传统遗传学其他学科的差别在于，基因组学是在全基因组范围研究基因的结构、组成、功能及其进化，因而涉及大范围高通量收集和分析有关基因组DNA的序列组成，染色体分子水平的结构特征，全基因组的基因数目、功能和分类，基因组水平的基因表达与调控以及不同物种之间基因组的进化关系。
基因组学的研究方法、技术和路线有许多不同于传统遗传学的特点，各相关领域的研究仍处于迅速发展和不断完善的过程中。
基因组学的主要工具和方法包括：生物信息学，遗传分析，基因表达测量和基因功能鉴定。
二、功能基因组学的概念及应用2001年，人类基因组计划公布了人类基因组草图，为基因组学研究揭开新的一页。
基因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的精确结构、相互关系及表达调控的科学。
基因组学、转录组学、蛋白质组学与代谢组学等一同构成系统生物学的组学（omics）生物技术基础。
基因组研究应该包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学（structural genomics）和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functional genomics)，又被称为后基因组（postg enome）研究，成为系统生物学的重要方法。
（一）功能基因组学的概念功能基因组学是指在全基因组序列测定的基础上，从整体水平研究基因及其产物在不同时间、空间、条件的结构与功能关系及活动规律。
新药开发的关键是药物发现。
目前多数以药物作用靶点为基础的药物发现流程是：基因组-作用新靶点-筛选-先导物-药物。
[2]结构基因组学是继人类基因组之后又一个国际性大科学热点，主要目的是试图在生物体的整体水平上（如全基因组、全细胞或完整的生物体）测定出（以实验为主、包括理论预测）全部蛋白质分子、蛋白质－蛋白质、蛋白质－核酸、蛋白质－多糖、蛋白质－蛋白质－核酸－多糖、蛋白质与其他生物分子复合体的精细三维结构，以获得一幅完整的、能够在细胞中定位以及在各种生物学代谢途径、生理途径、信号传导途径中全部蛋白质在原子水平的三维结构全息图。
在此基础上，使人们有可能在基因组学、蛋白质组学、分子细胞生物学以致生物体整体水平上理解生命的原理。
对疾病机理的阐明、对疾病的防治有重要应用意义。
（二）功能基因组学的应用基因组DNA测序是人类对自身基因组认识的第一步。
随着测序的完成，功能基因组学研究成为研究的主流，它从基因组信息与外界环境相互作用的高度，阐明基因组的功能。
功能基因组学的研究内容：人类基因组 DNA 序列变异性研究、基因组表达调控的研究、模式生物体的研究和生物信息学的研究等。
(1)基因组表达及调控的研究。
在全细胞的水平，识别所有基因组表达产物mRNA和蛋白质，以及两者的相互作用，阐明基因组表达在发育过程和不同环境压力下的时、空的整体调控网络。
(2)人类基因信息的识别和鉴定。
要提取基因组功能信息，识别和鉴定基因序列是必不可少的基础工作。
基因识别需采用生物信息学、计算生物学技术和生物学实验手段，并将理论方法和实验结合起来。
基于理论的方法主要从已经掌握的大量核酸序列数据入手，发展序列比较、基因组比较及基因预测理论方法。
识别基因的生物学手段主要基于以下的原理和思路：根据可表达序列标签(STS)；对染色体特异性Cosmid进行直接的cDNA选择；根据CpG岛；差异显示及相关原理；外显子捕获及相关原理；基因芯片技术；基因组扫描；突变检测体系等。
（3）基因功能信息的提取和鉴定。
包括：人类基因突变体的系统鉴定；基因表达谱的绘制；“基因改变-功能改变”的鉴定；蛋白质水平、修饰状态和相互作用的检测。
（4）在测序和基因多样性分析。
人类基因组计划得到的基因组序列虽然具有代表性，但是每个人的基因组并非完全一样，基因组序列存在着差异。
基因组的差异反映在表型上就形成个体的差异，如黑人与白人的差异，高个与矮个的差异，健康人与遗传病人的差异，等等。
出现最多基因多态性就是单核苷酸多态性(SN Ps)。
（5）比较基因组学。
将人类基因组与模式生物基因组进行比较，这一方面有助于根据同源性方法分析人类基因的功能，另一方面有助于发现人类和其他生物的本质差异，探索遗传语言的奥秘。
三、蛋白质组及蛋白质组学（一）蛋白质组及蛋白质组学的概念蛋白质是生命功能的主要体现者，多数疾病体现在蛋白质水平，基因表达和蛋白表达之间并不总是呈现良好的相关性[3]。
蛋白质组是从整体水平研究胞内蛋白质组成及其活动规律。
蛋白质组学以蛋白质组为研究对象，从蛋白质整体水平上认识生命活动的规律。
同基因组比，蛋白质组在时间、空间上具有多样性，变化性大，研究的切入点多。
蛋白质组学（基于2DE，灵敏、多功能地研究蛋白水平的变化）可以分析非转录水平控制的细胞过程，寻找靶点和优化化合物（抗菌活性、抗菌谱、生物利用度、药代动力学等指标），补充DNA芯片等技术的不足。
蛋白质组(Proteome)这一概念是由澳大利亚学者Wilkins和Williams等人[4]于1994年提出，并首次公开发表在1995年7月的Electrophoresis杂志上，指的是由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质。
蛋白质组与基因组相对应，也是一个整体的概念，是基因组表达的全部蛋白。
但两者又有根本的不同之处。
基因组是静态的，一个有机体从它的发生、发展到衰老、死亡，不同细胞、组织和器官的基因组是基本稳定不变的。
但基因组内各个基因表达的条件和表达的程度则随时间、地点和环境条件而不同，因而它们表达的模式，即表达产物的种类和数量随时间、地点和环境条件也是不同的。
所以，蛋白质组是一个动态的概念。
它不仅在同一个有机体的不同组织和不同细胞中不同；在同一机体的不同发育阶段，直至最后消亡的全过程中也在不断变化；机体处于不同生理状态下不同；在不同外界环境下也不同。
实际研究中能够取得的蛋白质组分子实体通常只是总蛋白质组的一部分。
可见既是整体又是动态的蛋白质组的研究任务有多么繁重了。
随着蛋白质组的提出，蛋白质组学(Proteomics)[5]也自然而然地孕育产生。
但目前，蛋白质组学仍无明确的定义。
一般认为它是研究蛋白质组或应用大规模蛋白质分离和识别技术研究蛋白质组的一门学科，是对基因组所表达的整套蛋白质的分析。
现阶段，蛋白质组学研究的内容不仅包括对各种蛋白质的识别和定量化，还包括确定它们的细胞内外的定位、修饰、相互反应、活性，和最终确定它们的功能。
并对由此获取的数据进行数据库构建，以及不可或缺的推动这一学科进步的蛋白质组分析技术研究。
由于对全部蛋白质的研究是非常困难的，所以中国的科学工作者提出了一种全新的研究策略：功能蛋白质组学[6]。
它是位于对个别蛋白质的传统蛋白质研究和以全部蛋白质为研究对象的蛋白质组研究之间的层次，研究特定时间、特定环境和试验条件下基因组所表达的蛋白质。
蛋白质组信息可以从生物信息学途径获得。
一半是基因重复或功能结构域混合，尤其是参与脂肪酸代谢、基因表达调控、特殊富甘氨酸的PPE、PE。
1/6与发表的其他生物蛋白无相似性。
MTB基因组中有4个大的MCE操纵子mce，编码巨噬细胞集落因子有4个拷贝，均位于同一个operon（编码8个组织方式完全一致的基因，mce之前的两个编码膜整合蛋白，之后的5个编码带疏水信号肽的蛋白，说明该蛋白可能是分泌或者是定位在细胞的表面），其蛋白可能介导宿主与致病菌的初始相互作用；有一簇基因可能编码与ESAT-6样蛋白分泌有关的结构成分；与脂肪酸代谢所需基因紧密连锁的MMPL编码大的膜蛋白，可能参与脂类运输；与游离生存的细菌比，MTB的运输蛋白库明显较少，与其胞内生活方式一致。
[7] （二）蛋白质组学在其他研究方面的应用1、蛋白质组学在细菌研究中的应用蛋白质组学方法已广泛用于研究细菌在外界环境变化时其表达蛋白的变化情况。
如对霍乱弧菌以及大肠杆菌在不同酸碱条件下蛋白表达的变化的研究，表明这些病原菌会随环境的改变而调节蛋白表达以使其达到最大的致病能力。
蛋白质组学可以与基因组学互补，它能识别某些基因的预测产物，尤其是膜蛋白，这些膜蛋白往往是疫苗的有效成分，如Deb N.Chakravarti 等研究了Hp疫苗的相关组分，加速了疫苗的开发。
蛋白组学研究也应用在细胞周期研究中，细菌在繁殖周期的每个阶段合成大量蛋白，表明周期性的蛋白表达有助于细菌充分利用能源，保持合适的细菌数量，对机体产生一定的作用。
这种对细菌细胞周期调控蛋白表达和降解的研究有助于抗感染措施的制定。
对细菌某些特异抗原的识别可以为一些疾病提供诊断标记。
2、蛋白质组学在真核生物研究中的应用蛋白质组学研究已广泛应用于真核生物的研究中。
Michel Perrot等用2DE 及质谱、免疫杂交、微量测序等方法分离和鉴定了酿酒酵母的401种蛋白，309种以前曾报道过，剩余的92种是新发现的，从而拓展了酵母参考图谱，为研究细胞功能、酵母翻译因子靶点提供了条件[8]。
3、蛋白质组学在植物研究中的应用植物蛋白质组学虽然刚刚起步，但它的发展将对植物界有很大的冲击。
H型硫氧还蛋白能减少靶蛋白的二硫键，促使种子发芽。
为了更好地了解硫氧还蛋白在种子中的作用，应先了解其作用的靶蛋白。
Hiroyuki Yano等运用蛋白组学方法分离了20多种靶蛋白，并鉴定了其中的5种，其中3种是变态反应原，2种与落叶及种子成熟有关4、蛋白质组学与肿瘤研究肿瘤涉及到控制正常细胞增殖机制的破坏。