20种氨基酸遗传密码子表
密码子表及对应氨基酸英文缩写

Valine/Val/V 缬氨酸
Alanine/Ala/A 丙氨酸
Glycine/Gly/G 甘氨酸
U UUU U UUC UUA UUG CUU C First Base A CUC CUA CUG AUU AUC AUA AUG GUU G GUC GUA GUG
Phenylalanine/Phe/F 苯丙氨酸 Leucine/Leu/L 亮氨酸
C UCU UCC UCA UCG CCU CCC CCA CCG ACU
G UGU UGC UGA UGG CGU CGC CGA CGG AGU AGC AGA AGG GGU GGC GGA GGG
Cysteine/Cys/C 半胱氨酸 stop codon Tryptophan/Trp/W 色氨酸
U C A G U C A G Third Base U C A G U C A G
Second Base A UAU
Serine/Ser/S 丝氨酸
UAC UAA UAG CAU CAC CAA CAG AAU AAC AAA AAG GAU GAC GAA GAG
Tyrosine/Tyr/Y 酪氨酸 stop codon stop codon Histidine/His/H 组氨酸 Glutamine/Gln/Q 谷氨酰胺 Asparagine/Asn/N 天冬酰胺 Lysine/Lys/K 赖氨酸 Aspartic acid/Asp/D 天冬氨酸 Glutamic acid/Glu/E 谷氨酸
Leucine/Leu/L 亮氨酸
Proline/Pro/P 脯氨酸
Arginine/Arg/R 精氨酸
Isoleucine/Ile/I 异亮氨酸 Methionine/Met/M 甲硫氨酸(Start)
遗传密码表以及氨基酸详表

遗传密码表以及氨基酸详
表
Prepared on 24 November 2020
密码子反表
除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]
以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
•
(Ala/A)
•
(Arg/R)
•
(Asn/N)
•
(Asp/D)
•
(Cys/C)
•
(Glu/E)
•
(Gln/Q)
•
(Gly/G)
•
(His/H)
•
(Ile/I)
•
(Leu/L)
•
(Lys/K)
•(Met/M)
•
(Phe/F)
•
(Pro/P)
•
(Ser/S)
•
(Thr/T)
•
(Trp/W)
•
(Tyr/Y)
•
(Val/V)
•
(Sec/U)
•
(Pyl/O)
主要化学性质[]
以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]
以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
20种氨基酸遗传密码子表

氨基酸简写和密码子表

缬氨酸V
丙氨酸A
天冬氨酸D
甘氨酸G
C
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
A
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
G
谷氨酸E
甘氨酸G
A
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
G
氨基酸简写和密码子表
第一个
核苷酸5′
第二个核苷酸
第三个
核苷酸3
U
C
A
G
U
苯丙氨酸F
丝氨酸S
酪氨酸Y
半胱氨酸C
U
苯丙氨酸F
丝氨酸S
酪氨酸Y
半胱氨酸C
C
亮氨酸L
丝氨酸S
终止密码子
终止密码子
A
亮氨酸L
丝氨酸S
终止密码子
色氨酸W
G
C
亮氨酸L
脯氨酸P
组氨酸H
精氨酸R
U
亮氨酸L
脯氨酸P
组氨酸H
精氨酸R
C
亮氨酸L
脯氨酸P
谷氨酰胺Q
精氨酸R
A
亮氨酸L
脯氨酸P
谷氨酰胺Q
精氨酸R
G
A
异亮氨酸I
苏氨酸T
天冬酰胺N
丝氨酸S
U
异亮氨酸I
苏氨酸T
天冬酰胺N
丝氨酸S
C
异亮氨酸I
苏氨酸T
赖氨酸K
精氨酸R
A
甲硫氨酸M
苏氨酸T
赖氨酸K
精氨酸R
G
G
缬氨酸V
丙氨酸A
天冬氨酸D
甘氨酸G
氨基酸简写和密码子表
第一个
核苷酸5′
氨基酸密码子对照表

双螺旋 DNA 的断裂和愈合
misc_RNA 不能用其他 RNA 关键词 (prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5'clip,3'clip,5'UTR,3'UTR,exon,CDS,
sig_peptide,transit__ __peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,
小的细胞质 RNA;几个小的细胞质RNA分子中的任何一个存在于真核生物的 细胞质和(有时)核中
sig_peptide 信号肽编码序列;被分泌的蛋白质的N-末端结构域的编码序列;此结构域涉 及新生多肽与膜的结合;前导序列
SnRNA
小的核 RNA;很多小的 RNA 种类中的任何一个都被局限于核中;几个 snRNA 参与剪接或其它 RNA 加工反应
Promoter 参与 RNA 聚合酶的结合以启动转录的 DNA 分子区域
protein_bin 核酸上非-共价的蛋白质结合位点
d
RBS
核糖体结合位点
repeat_regi 含有重复单位的基因组区域 on repeat_unit 单个重复元件
rep_origin 复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点
J_segment 免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和 T-细胞受体 α,β 和 γ 链
LTR
长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒
中
mat_peptide 成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物 的编码序列;位置不包括终止密码子(与相应的 CDS 不同)
序列;通过测定 STS 系列的次序即可作出图谱的基因组区域
氨基酸密码子对照表

gene
鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称
iDNA
间插DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的DNA
intron
被转录的DNA区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其除去
J_segment
免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和T-细胞受体α,β和γ链
LTR
长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列,类型典型地见于逆转录病毒中
Conflict
在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同
D-loop
置换环;线粒体DNA内的一个区域,其中RNA的短的序列与DNA的一条链配对,代替了这一区域的原始配对DNA链;也用于说明在RecA蛋白质催化的反应中,侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域
D-segment
免疫球蛋白重链的多变区,和T-细胞受体的β链
misc_difference
特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同关键词(conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)表述
misc_feature
不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征
Enhancer
顺式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处(上游或下游)起作用
Exon
编码剪接mRNA部分的基因组区域;可以含有5'UTR,所有CDS,和3'UTR
GC_signal
GC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域,可以以多重拷贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGG
遗传密码表以及氨基酸详表

遗传密码表以及氨基酸详表Company Document number:WTUT-WT88Y-W8BBGB-BWYTT-19998密码子反表除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
•(Ala/A)•(Arg/R)•(Asn/N)•(Asp/D)•(Cys/C)•(Glu/E)•(Gln/Q)•(Gly/G)•(His/H)•(Ile/I)•(Leu/L)•(Lys/K)•(Met/M)•(Phe/F)•(Pro/P)•(Ser/S)•(Thr/T)•(Trp/W)•(Tyr/Y)•(Val/V)•(Sec/U)•(Pyl/O)主要化学性质[]以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
氨基酸密码子对照表

芳香族类
脯氨酸
Proline
P或Pro
115.117
-N-(CH 2 ) 3 -CH-
|_________|
亚氨基酸
丝氨酸
Serine
S或Ser
105.078
HO-CH 2 -
羟基类
苏氨酸
Threonine
T或Thr
119.105
CH 3 -CH(OH)-
羟基类
色氨酸
Tryptophan
Promoter
参与RNA聚合酶的结合以启动转录的DNA分子区域
protein_bind
核酸上非-共价的蛋白质结合位点
RBS
核糖体结合位点
repeat_region
含有重复单位的基因组区域
repeat_unit
单个重复元件
rep_origin
复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点
RRNA
成熟的核糖体RNA;将氨基酸装配成蛋白质的核糖核蛋白颗粒(核糖体)中的RNA成份
133.089
HOOC-CH 2 -
酸性氨基酸类
半胱氨酸
Cysteine
C或Cys
121.145
HS-CH 2 -
含硫类
谷氨酰胺
Glutamine
Q或Gln
146.131
H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
酰胺类
谷氨酸
Glutamic acid
E或Glu
147.116
HOOC-(CH 2 ) 2 -
misc_structure
不能用其他Structure关键词(stem_loop和D-loop)表述的任何二级或三级结构或构象
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遗 传 密 码 子 表
第一位 5'端 第二位(中间) U 苯丙氨酸 Phe F 苯丙氨酸 Phe F U 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L C 亮氨酸 Leu L 亮氨酸 Leu L 异亮氨酸 Ile I 异亮氨酸 Ile I A 异亮氨酸 Ile I 甲硫氨酸 Met M 缬氨酸 Val V 缬氨酸 Val V G 缬氨酸 Val V 缬氨酸 Val V 丙氨酸 Ala A 丙氨酸 Ala A 谷氨酸 Glu E 谷氨酸 Glu E 甘氨酸 Gly G 甘氨酸 Gly G A G 苏氨酸 Thr T 苏氨酸 Thr T 丙氨酸 Ala A 丙氨酸冬氨酸 Asp D 精氨酸 Arg R 精氨酸 Arg R 甘氨酸 Gly G 甘氨酸 Gly G A G U C 脯氨酸 Pro P 脯氨酸 Pro P 苏氨酸 Thr T 苏氨酸 Thr T 谷氨酰胺 Gln Q 谷氨酰胺 Gln Q 天冬酰胺 Asn N 天冬酰胺 Asn N 精氨酸 Arg R 精氨酸 Arg R 丝氨酸 Ser S 丝氨酸 Ser S A G U C 丝氨酸 Ser S 丝氨酸 Ser S 脯氨酸 Pro P 脯氨酸 Pro P 终止 stop @ 终止 stop @ 组氨酸 His H 组氨酸 His H 终止 stop @ 色氨酸 Trp W 精氨酸 Arg R 精氨酸 Arg R A G U C C 丝氨酸 Ser S 丝氨酸 Ser S A 酪氨酸 Tyr Y 酪氨酸 Tyr Y G 半胱氨酸 Cys C 半胱氨酸 Cys C 第三位 3'端 U C