基因克隆-256页PPT
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基因的克隆方法ppt课件

1)直接从基因组中扩增过程: (1)提取基因组DNA作模板 (2)根据目的基因序列设计引物 (3)PCR扩增及产物鉴定
31
提取基因组DNA
PCR引物设计
PCR扩增
基因序列分析
此法适合扩增原 核生物基因。
真核生物基因组含有内含子32 !
2)从mRNA中扩增: RT-PCR
(1)提取基因组 total RNA (2)反转录合成总cDNA作模板 (3)根据目的基因序列设计引物 (4)PCR扩增及序列分析
工作量大。 无法定量研究。 扩出的条带往往是3`端比较短的UTR区的一
段序列,提供的信息较少。
19
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示 mRNA的组成。
所需的mRNA量少。 各样本mRNA的差异可同时进加标签的基因克隆 方法野生株构建基因组 基因苗构建基因组文 库基因苗
阳性克隆
获得阳性克隆 目的基因
基因序列分析,24 确定为基因
转座子标签法
转座子又称转座因子或者跳跃因子,实 际上也是DNA片段,它可以在生物的染色 体组中移动,从染色体的一个位点跳到另 一个位点,或从一条染色体跳到另一条染 色体上,引起基因功能的改变。
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
TTTTTTTTTT
G
3`
15
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
TTTTTTTTTT
G
3`
AATTTTTTTT ACTTTTTTTT AGTTTTTTTT TATTTTTTTT
TCTTTTTTTT TGTTTTTTTT CATTTTTTTT CCTTTTTTTT CGTTTTTTTT GATTTTTTTT
31
提取基因组DNA
PCR引物设计
PCR扩增
基因序列分析
此法适合扩增原 核生物基因。
真核生物基因组含有内含子32 !
2)从mRNA中扩增: RT-PCR
(1)提取基因组 total RNA (2)反转录合成总cDNA作模板 (3)根据目的基因序列设计引物 (4)PCR扩增及序列分析
工作量大。 无法定量研究。 扩出的条带往往是3`端比较短的UTR区的一
段序列,提供的信息较少。
19
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示 mRNA的组成。
所需的mRNA量少。 各样本mRNA的差异可同时进加标签的基因克隆 方法野生株构建基因组 基因苗构建基因组文 库基因苗
阳性克隆
获得阳性克隆 目的基因
基因序列分析,24 确定为基因
转座子标签法
转座子又称转座因子或者跳跃因子,实 际上也是DNA片段,它可以在生物的染色 体组中移动,从染色体的一个位点跳到另 一个位点,或从一条染色体跳到另一条染 色体上,引起基因功能的改变。
mRNA
5` RP
A T C G
AAAAAAAA
A C
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基因克隆操作过程PPT课件

Takara网站提供的同尾酶信息
.
12
2011-10-23
基因克隆操作过程
12
5'
TGATCA
ACTAGT
5'
BclI
5'
GGATCC
CCTAGG
BamHI
GGATCC
CCTAGG
5'
5'
T
5' GATCA
ACTAG 5'
T
5'
a)获得连接方 向不同的两种 5' 产物;
退火
T GATCC ACTAG G
5'
GCATGCCCCCC G
C GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
PstI
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
PstI
CTGCAGGGGGGCATGC
C
C
3' CCCCCCGTACG
G 3' GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG 3' G
退火
5'
GCATGCCCCCC G
C GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
.
12
2011-10-23
基因克隆操作过程
12
5'
TGATCA
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5'
BclI
5'
GGATCC
CCTAGG
BamHI
GGATCC
CCTAGG
5'
5'
T
5' GATCA
ACTAG 5'
T
5'
a)获得连接方 向不同的两种 5' 产物;
退火
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5'
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
PstI
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
PstI
CTGCAGGGGGGCATGC
C
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3' CCCCCCGTACG
G 3' GGGGGGACGTC
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退火
5'
GCATGCCCCCC G
C GGGGGGACGTC
CTGCAGGGGGG C
G CCCCCCGTACG
5'
Klenow
T4-DNA ligase
5'
GCATGCCCCCCTGCAG
CGTACGGGGGGACGTC
基因的克隆与表达PPT课件

2.真核表达系统:使外源基因在真核细 胞中表达的体系。
.
32
二.原核生物基因结构和表达特点
.
33
1. 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
2. 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
.
34
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
• PCR过程中,普通的Taq酶可在产 物的3’端多加一个A
.
17
五、基因克隆的工作流程
(一)目的基因的获得
1、直接分离3、构建cDNA4、PCR5、人工合成
6、差异显示
.
18
1、直接物的基因组DNA切割成一定大 小的片段,并与合适的载体重组后 导入宿主细胞,进行克隆。这些存 在于所有重组
11
三、受体细胞
1、定义:外源DNA导入的细胞,是 重组体扩增的场所。
2、要求:易于接纳外源DNA
无特异的内源性核酸内切酶
载体复制、扩增不受阻
与载体有互补性
.
12
四、体外重组的策略
1、粘末端连接 1)全同源粘末端连接 • 最方便简单 • 高背景-载体自身环化 • 双向插入
.
13
2)定向克隆:使外源基因定向插入到载体 中的克隆策略
基因的克隆与表达
.
1
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
.
2
基因克 隆 Gene Cloning
.
3
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
.
32
二.原核生物基因结构和表达特点
.
33
1. 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
2. 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
.
34
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
• PCR过程中,普通的Taq酶可在产 物的3’端多加一个A
.
17
五、基因克隆的工作流程
(一)目的基因的获得
1、直接分离3、构建cDNA4、PCR5、人工合成
6、差异显示
.
18
1、直接物的基因组DNA切割成一定大 小的片段,并与合适的载体重组后 导入宿主细胞,进行克隆。这些存 在于所有重组
11
三、受体细胞
1、定义:外源DNA导入的细胞,是 重组体扩增的场所。
2、要求:易于接纳外源DNA
无特异的内源性核酸内切酶
载体复制、扩增不受阻
与载体有互补性
.
12
四、体外重组的策略
1、粘末端连接 1)全同源粘末端连接 • 最方便简单 • 高背景-载体自身环化 • 双向插入
.
13
2)定向克隆:使外源基因定向插入到载体 中的克隆策略
基因的克隆与表达
.
1
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
.
2
基因克 隆 Gene Cloning
.
3
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
第六基因克隆张幻灯片(共65张PPT)

E.coli + 0.1M CaCl2
0-4℃
Low-osmosis makes cell expanding
competent cells (E.coli)
Recombinant DNA + 42 ℃
Heat makes cell more expanding and membrane more permeable
those
转化步骤后,转进重组质粒的细胞是较少的。 因此需要挑选出含有重组子的细胞。
31
第三十一页,共65页。
1. Direct selection
直接筛选
• Antibotic resistance
抗菌素抗性
• Marker rescue selection
• In situ hybridization
重新筛选插入的片断困难
11
第十一页,共65页。
A1 A
2
vector
B
2 A
vector
1 B
平齐末端连接时,插入的方向是
随机的,称为双向插入。会给后续的 工作造成很多麻烦。
12
第十二页,共65页。
单酶切粘末端连接
EcoRI
EcoRI
13
第十三页,共65页。
14
第十四页,共65页。
单酶切粘末端连接的特点
氯化钙法 :利用氯化钙和热休克使受体菌成为
感受态细胞,促进外源 DNA的进入。
24
第二十四页,共65页。
宿主细胞与重组DNA在00C的低渗氯化钙溶 液中孵育,快速转入420C造成热休克。经此处 理后的细胞“容易”接受外源的DNA,一般叫
做感受态细胞。
25
第二十五页,共65页。
0-4℃
Low-osmosis makes cell expanding
competent cells (E.coli)
Recombinant DNA + 42 ℃
Heat makes cell more expanding and membrane more permeable
those
转化步骤后,转进重组质粒的细胞是较少的。 因此需要挑选出含有重组子的细胞。
31
第三十一页,共65页。
1. Direct selection
直接筛选
• Antibotic resistance
抗菌素抗性
• Marker rescue selection
• In situ hybridization
重新筛选插入的片断困难
11
第十一页,共65页。
A1 A
2
vector
B
2 A
vector
1 B
平齐末端连接时,插入的方向是
随机的,称为双向插入。会给后续的 工作造成很多麻烦。
12
第十二页,共65页。
单酶切粘末端连接
EcoRI
EcoRI
13
第十三页,共65页。
14
第十四页,共65页。
单酶切粘末端连接的特点
氯化钙法 :利用氯化钙和热休克使受体菌成为
感受态细胞,促进外源 DNA的进入。
24
第二十四页,共65页。
宿主细胞与重组DNA在00C的低渗氯化钙溶 液中孵育,快速转入420C造成热休克。经此处 理后的细胞“容易”接受外源的DNA,一般叫
做感受态细胞。
25
第二十五页,共65页。
基因克隆简介ppt课件

5’3’-
5’3’-
GAATTC CTTAAG
G AATTC CTTAA G
-3’ -5’
-3’ -5’
14
(4)粘性末端的意义 ①连接便利
i)不同的DNA双链: 只要粘性末端碱基互补就可以连接。 这比连接两个平齐末端容易的多。
ii)同一个DNA分子内连接: 通过两个相同的粘性末端可以连接成环 形分子。
pBR322质粒
pBR322质粒是由三个不同来源的部分组成的:第 一部分来源于pSF2124质粒的氨苄青霉素抗性基 因(ampr);
第二部分来源于pSC101质粒的四环素抗性基因 (tetr);
第三部分则来源于ColE1的派生质粒pMB1的DNA
复制起点(ori)。
27
PstI
ScaI
Ampr
HindIII BamHI
④ lacZ的a肽互补 1)a-肽( lacZ’ ):
b-半乳糖苷酶N端的一段氨基酸片断 (11-41氨基酸),该段基因序列连接到 pUC载体上。
受体菌基因组的b-半乳糖苷酶基因的 缺失a肽(氨基端有缺失),不能形成 活性酶,不能分解Xgal
37
⑤ 载体lacZ’与a互补
pUC质粒载体上的lacZ’ 编码a肽与这个 缺失突变的b-半乳糖苷酶“互补”,又 能分解Xgal。产生蓝色物质。
15
16
2. DNA 连接酶 3.1 DNA连接酶(ligase)的发现
从细菌DNA环化现象推测,必定存在一种能 把两条DNA双链连接到一起的酶。
DNA复制一定有断口。 17
3.2 DNA ligase的特点
1. 两种DNA连接酶
(1)大肠杆菌连接酶 只能连接粘性末端。
(2)T4噬菌体的连接酶 不但能连接粘性末端, 还能连接齐平末端。
基因克隆PPT课件

(1)构建 由 pBR 质 粒 与 M13 噬 菌 体 构 建 成 的 双 链 DNA质粒载体,长2674bp,1983年构建。
.
14
主要特点:氨苄青霉素抗性基因、lac Z基因、
复制起始点(ori)
.
15
(2)筛选原理及方法
含 有 来 自 大 肠 杆 菌 的 lacZ 操 纵 子 的 DNA 片 段 (lacZ基因),编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个片 段。此片段能与宿主细胞所编码的缺陷型β-半乳糖 苷酶实现基因内互补(α互补),形成完整的β-半乳 糖苷酶。该酶能分解X-gal,形成蓝色菌落。
基因工程及体外表达体系 (2).载体
心血管病研究所 王佐
.
1
一、概述
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果 将其导入宿主细胞,没有有效的方法将导 入了外源DNA的细胞和未导入外源DNA的 细胞区分开来。
外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细 胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段 扩增的目的。
.
2
.
35
YAC载体序列包括着丝粒序列(CEN1)、端粒序列(TEL 使
线形DNA的完全复制和保护染色体末端免于核酸酶的降解)、
自主复制序列(ARS1 主导染色体DNA的自主复制)、氨苄青
霉素抗性基因(Amp)、源于E.coli的复制起始区(ori)。
.
36
由于酵母细胞内真正必需的DNA片段主要 限于几百碱基对,因而就可以用酵母染色体 复 制 子 ARS 元 件 构 建 新 型 的 克 隆 载 体 。
.
21
λ噬菌体载体在细菌中以溶菌状态生长。它有两种 形式:插入载体和替代载体。
DNA与λ噬菌体载体组成重组DNA分子后,还不能直接 转染宿主细胞,必须首先包装成有活性的成熟噬菌体颗粒 后才具有转染宿主细胞的能力,重组DNA分子能否被噬菌 体包装蛋白、头部所识别而被包装,除必须含有cos位点 外,就是对重组DNA分子长度有严格的限制,必须不能大 于野生型基因组长度的105%或小于75%,否则均不能被 包装成有活性的噬菌体颗粒,因此噬菌体载体大致允许插 入外源基因的长度范围为15~25kb。
.
14
主要特点:氨苄青霉素抗性基因、lac Z基因、
复制起始点(ori)
.
15
(2)筛选原理及方法
含 有 来 自 大 肠 杆 菌 的 lacZ 操 纵 子 的 DNA 片 段 (lacZ基因),编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个片 段。此片段能与宿主细胞所编码的缺陷型β-半乳糖 苷酶实现基因内互补(α互补),形成完整的β-半乳 糖苷酶。该酶能分解X-gal,形成蓝色菌落。
基因工程及体外表达体系 (2).载体
心血管病研究所 王佐
.
1
一、概述
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果 将其导入宿主细胞,没有有效的方法将导 入了外源DNA的细胞和未导入外源DNA的 细胞区分开来。
外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细 胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段 扩增的目的。
.
2
.
35
YAC载体序列包括着丝粒序列(CEN1)、端粒序列(TEL 使
线形DNA的完全复制和保护染色体末端免于核酸酶的降解)、
自主复制序列(ARS1 主导染色体DNA的自主复制)、氨苄青
霉素抗性基因(Amp)、源于E.coli的复制起始区(ori)。
.
36
由于酵母细胞内真正必需的DNA片段主要 限于几百碱基对,因而就可以用酵母染色体 复 制 子 ARS 元 件 构 建 新 型 的 克 隆 载 体 。
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21
λ噬菌体载体在细菌中以溶菌状态生长。它有两种 形式:插入载体和替代载体。
DNA与λ噬菌体载体组成重组DNA分子后,还不能直接 转染宿主细胞,必须首先包装成有活性的成熟噬菌体颗粒 后才具有转染宿主细胞的能力,重组DNA分子能否被噬菌 体包装蛋白、头部所识别而被包装,除必须含有cos位点 外,就是对重组DNA分子长度有严格的限制,必须不能大 于野生型基因组长度的105%或小于75%,否则均不能被 包装成有活性的噬菌体颗粒,因此噬菌体载体大致允许插 入外源基因的长度范围为15~25kb。
基因克隆的基本理论及实验技术ppt课件

CTG GAC 连接酶 CTGATT GACTAA
ATT TAA
GAATTC CTTGGA
内切酶和连接酶是基因克隆实验中两种 重要的工具酶,它们如同分子生物学家剪刀
和针线,可以任意地将感兴趣的基因片段进
行切割和连接,实现DNA序列的重组。
质粒(plasmid)和载体(vector)有什么区别?
质粒是指细菌细胞质中的小型环状DNA分子,是
2686 bp
P(LAC) O RI
A pa LI (1121)
A pa LI (178)
P(BLA)
A pa LI (2367)
ALPHA
E co RI (397) A va I (413) X m aI (413) Sm a I (415)
EcoR I
Hind III
PCR扩增
AP r
pU C 19
co coli
DNA连接酶
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的,最初是在大
肠杆菌细胞中发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助
ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5’-PO4与另一DNA 链的3’-OH生成磷酸二酯键将两条紧邻DNA链连接起来。
G CTTGG 连接酶
AATTC A
质粒的重要特征
(1) 是染色质外的环形双链DNA分子; (2)能自主复制,是能独立复制的复制子;
(3)质粒对宿主生存并不是必需的;
(4)质粒上常带有耐抗生素基因; (5)质粒DNA上有多个酶切位点。
限制性核酸内切酶
限制性核酸内切酶(restriction endonuclease):是从细菌中分离 出来的一种识别并切割特异的双链DNA序列的内切核酸酶。 目前已从多种细菌中分离出超过400种,识别各自不同的核苷 酸顺序。
基因克隆常用的方法PPT演示文稿

12
图3真核生物12种mRNA的序列特点
13
根据这12种mRNA序列可合成12种相应的反转录引物,即 M’N’TTTTTTTT……,用其分别进行反转录,即可将所有mRNA分类合成 12种cDNA(于12个试管内),然后再用随机引物,以这12种cDNA分别做 模板进行PCR扩增(见图1和图4),那么与表型相关的mRNA就很容易被 发现并克隆出来。但不论AP-PCR还是DD-PCR,都适用于2种种源近似生 物或不同发育阶段的同一个体之间的比较。因而,其PCR的模板必须是 来自2个生物或同一生物的不同发育阶段的mRNA。DD-PCR的优点是快 速、方便,可以检测表达量极低的mRNA,但其技术条件要求较高,所 扩增的mRNA的质量不能有差异,即mRNA不应降解。目前这一方法已广 泛应用于生物表型相关基因的克隆及比较研究。
2
目前,以Genbank的应用最频繁。这些基因库是相互联 系的,在Genbank注册的基因序列,也可能在Swissport注册。 要克隆某个基因可首先通过Internet查询一下该基因或相 关库中拿出来,根据整 个基因序列设计特异的引物,通过PCR从基因组中克隆该基 因,也可以通过RT-PCR克隆cDNA。值得注意的是,由于物 种和分离株之间的差异,为了保证PCR扩增的准确性,有必 要采用两步扩增法,即nested PCR。
基因克隆的几种常用方法
根据已知序列克隆基因 未知序列的基因打靶 根据已知探针克隆基因 用特异抗体克隆基因 特异基因的功能克隆
1
1、根据已知序列克隆基因
对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最为简便的一种。获取基因 序列多从文献中查取,即将别人报道的基因序列直接作为自己克隆的依据。 目前,世界上主要的基因库有: (1)EMBL,为设在欧洲分子生物学实验室的基因库,
图3真核生物12种mRNA的序列特点
13
根据这12种mRNA序列可合成12种相应的反转录引物,即 M’N’TTTTTTTT……,用其分别进行反转录,即可将所有mRNA分类合成 12种cDNA(于12个试管内),然后再用随机引物,以这12种cDNA分别做 模板进行PCR扩增(见图1和图4),那么与表型相关的mRNA就很容易被 发现并克隆出来。但不论AP-PCR还是DD-PCR,都适用于2种种源近似生 物或不同发育阶段的同一个体之间的比较。因而,其PCR的模板必须是 来自2个生物或同一生物的不同发育阶段的mRNA。DD-PCR的优点是快 速、方便,可以检测表达量极低的mRNA,但其技术条件要求较高,所 扩增的mRNA的质量不能有差异,即mRNA不应降解。目前这一方法已广 泛应用于生物表型相关基因的克隆及比较研究。
2
目前,以Genbank的应用最频繁。这些基因库是相互联 系的,在Genbank注册的基因序列,也可能在Swissport注册。 要克隆某个基因可首先通过Internet查询一下该基因或相 关库中拿出来,根据整 个基因序列设计特异的引物,通过PCR从基因组中克隆该基 因,也可以通过RT-PCR克隆cDNA。值得注意的是,由于物 种和分离株之间的差异,为了保证PCR扩增的准确性,有必 要采用两步扩增法,即nested PCR。
基因克隆的几种常用方法
根据已知序列克隆基因 未知序列的基因打靶 根据已知探针克隆基因 用特异抗体克隆基因 特异基因的功能克隆
1
1、根据已知序列克隆基因
对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最为简便的一种。获取基因 序列多从文献中查取,即将别人报道的基因序列直接作为自己克隆的依据。 目前,世界上主要的基因库有: (1)EMBL,为设在欧洲分子生物学实验室的基因库,
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构成:质粒复制起始点、一个或多个限制性 内切酶位点、抗药性基因、λ噬菌体的cos位 点。粘粒载体大小为4~6kb。
粘粒克隆外源DNA的步骤:
外源DNA与粘粒载体用同一种内切酶酶切; 连接酶连接,外源DNA插入到两个线状粘粒之间; 离体包装,组成成熟的噬菌体颗粒。该过程对DNA分子长 度有严格的限制,过长或过短均不能被包装,所以虽然粘 粒只有几千个碱基,但要求插入的外源基因却必须是大片 段(25~45kb)。 体外包装好的颗粒感染宿主菌,重组载体由于缺乏噬菌体 其他部分基因,故不能像噬菌体一样复制,只能像质粒一 样扩增。
克隆载体与表达载体
克隆载体:主要用来获得大量纯化的目的DNA 片段(目的基因),以便进一步研究其结构和 功能;本章主要以克隆载体为例讲解。 表达载体:主要用来产生插入基因和mRNA, 进而合成相关蛋白质。
二、质粒载体
1 概念
Plasmid : 细 菌 染 色 体 外小型双链环状DNA,对 细菌的某些代谢活动和抗 药性的表型具有一定的作 用。
宿主细胞,常见的有大肠杆菌、酵母等。
2载体的特征:
能自主复制; 具备筛选标记; 适当大小的分子量和适当限制性内切酶 酶切位点; 在细胞中拷贝数高 除上述特征外,表达载体还应配备有与 宿主细胞相适应的启动子、前导顺序、 加尾信号、增强子等调控DNA元件。
3 载体的分类
按来源分:质粒、噬菌体、病毒载体等; 按用途和功能分:克隆载体和表达载体。
外源基因插入载体后,lacZ被破坏,不能分解 X-gal,菌落呈白色。——“蓝白斑”筛选法。
7质粒载体的主要用途
保存和扩缺点:所能接受的DNA片段容量小;转化效率低。
三、λ噬菌体载体
λ噬菌体的基因组是约50kb的线性双链 DNA分子,两端各有12个核苷酸的5’突 出,碱基互补(cos位点,又称粘端)。 λ噬菌体感染宿主菌后,其粘端通过碱基 配对而结合,形成环状DNA分子。
1λ噬菌体在细菌内的生长方式:
裂菌性生长(lytic pathway):在宿主菌中大 量复制并组装成子代噬菌体颗粒,导致宿主菌 裂解。 溶菌性生长(lysogenic pathway):整合到 宿主菌DNA分子中,随宿主菌DNA复制并转到 子代细菌中。
2λ噬菌体结构
野生型的λ噬菌体基因组庞大而复杂,有约48.5kb,约占基因组总长 度30%的中间部分的基因对噬菌体生长是非必需的,可以直接插入外源 基因或切除该区域而由外源基因代替而不影响噬菌体的生存。
主要特点:氨苄青霉素抗性基因、lac Z基因、 复制起始点(ori)
(2)筛选原理及方法
含 有 来 自 大 肠 杆 菌 的 lacZ 操 纵 子 的 DNA 片 段 (lacZ基因),编码β-半乳糖苷酶氨基端的一个片 段。此片段能与宿主细胞所编码的缺陷型β-半乳糖 苷酶实现基因内互补(α互补),形成完整的β-半乳 糖苷酶。该酶能分解X-gal,形成蓝色菌落。
Autonomously replicating DNA molecules
(have an origin of replication)
Selectable marker, such as drug resistance Insertion site for foreign DNA
(often a genetically engineered multiple cloning region with sites for several restriction enzymes)
λ噬菌体载体在细菌中以溶菌状态生长。它有两种 形式:插入载体和替代载体。
DNA与λ噬菌体载体组成重组DNA分子后,还不能直接 转染宿主细胞,必须首先包装成有活性的成熟噬菌体颗粒 后才具有转染宿主细胞的能力,重组DNA分子能否被噬菌 体包装蛋白、头部所识别而被包装,除必须含有cos位点 外,就是对重组DNA分子长度有严格的限制,必须不能大 于野生型基因组长度的105%或小于75%,否则均不能被 包装成有活性的噬菌体颗粒,因此噬菌体载体大致允许插 入外源基因的长度范围为15~25kb。
multiple cloning sites
人工合成的DNA序列,含有密 集排列的多种限制性内切酶识别 序列,以利于不同来源的外源 DNA片段插入载体。
Hale Waihona Puke pBR系列载体4 pBR质粒载体筛选的原理
5 pBR质粒载体的筛选方法——双抗生素对照筛选法
6 pUC系列载体
(1)构建 由 pBR 质 粒 与 M13 噬 菌 体 构 建 成 的 双 链 DNA质粒载体,长2674bp,1983年构建。
一、概述
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果 将其导入宿主细胞,没有有效的方法将导 入了外源DNA的细胞和未导入外源DNA的 细胞区分开来。 外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细 胞的繁殖而复制,达不到使外源DNA片段 扩增的目的。
1载体(vector)
携带靶DNA片段(外源DNA片段) 进入宿主细胞进行扩增和表达的工具。
2 严紧型质粒与松驰型质粒的区别
严紧型质粒
松驰型质粒
质粒复制所需的酶
每个细胞中所含的质 粒数 质粒复制与细菌复制 的关系 在基因克隆中的应用 前景
DNA聚合酶 Ⅲ
1~5个
密切
小
DNA聚合酶Ⅰ
10~200个以上 能在没有蛋白质合成 的情况下继续复制
大
3 Specificity of Plasmid Vectors
此载体中央部分两端有三个酶切位点。可插 入片段的行真核基因组文 库构建时,其容量仍然受到一定的限 制。最大插入片段不能超过23kb。
四、粘粒载体
1978年构建,由质粒和噬菌体的cos粘 性末端构建而成。插入片段29~45kb。 可根据载体携带的抗药性标记筛选阳性 克隆细胞株。
3 插入载体
经人工改造而成,具有单一的 EcoRⅠ 酶 切 位 点 , 该 酶 切 位 点 位 于 lacZ基因内,使用蓝白斑筛选法。插入 片 段 长 度 约 几 个 k 替代载体
λ噬菌体基因组中央部分约有14kb主要 编码抑制性因子,非裂菌性生长所必需, 作为载体这部分可被外源DNA所替代。